View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0400_high_3 (Length: 442)

Name: NF0400_high_3
Description: NF0400
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0400_high_3
NF0400_high_3
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (11-416)||(39856630-39857032)
chr4 (11-392)||(20332290-20332671)
chr4 (11-392)||(40099504-40099885)
chr4 (11-409)||(18794485-18794882)
chr4 (11-392)||(27157180-27157562)
chr4 (11-392)||(24586229-24586610)
chr4 (11-392)||(14104560-14104939)
chr4 (11-392)||(30759781-30760159)
chr4 (11-392)||(33667671-33668049)
chr4 (11-392)||(54839408-54839787)
chr4 (11-392)||(5700557-5700937)
chr4 (11-392)||(14753362-14753741)
chr4 (11-416)||(5011870-5012275)
chr4 (14-409)||(21975704-21976098)
chr4 (11-409)||(31120378-31120776)
chr4 (11-392)||(34182832-34183210)
chr4 (11-421)||(1906240-1906654)
chr4 (11-409)||(15233816-15234217)
chr4 (11-392)||(36338394-36338766)
chr4 (15-392)||(24118680-24119055)
chr4 (11-398)||(6575873-6576251)
chr4 (11-421)||(15276497-15276909)
chr4 (11-421)||(15380106-15380515)
chr4 (11-393)||(1673876-1674258)
chr4 (11-392)||(17019069-17019445)
chr4 (11-319)||(36324185-36324484)
chr4 (11-398)||(14671027-14671410)
chr4 (346-409)||(18311379-18311443)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (11-415)||(27623522-27623927)
chr6 (11-421)||(8899514-8899923)
chr6 (11-421)||(27284177-27284586)
chr6 (11-409)||(27355926-27356323)
chr6 (11-409)||(34458323-34458718)
chr6 (11-409)||(33370246-33370643)
chr6 (11-392)||(13518009-13518389)
chr6 (11-409)||(27491119-27491516)
chr6 (11-392)||(4763766-4764146)
chr6 (11-409)||(26110226-26110622)
chr6 (11-392)||(16755823-16756204)
chr6 (11-421)||(22928696-22929107)
chr6 (11-409)||(4539573-4539971)
chr6 (11-409)||(26772444-26772840)
chr6 (11-398)||(27063479-27063864)
chr6 (11-388)||(28166501-28166878)
chr6 (11-409)||(28213440-28213838)
chr6 (11-421)||(29555532-29555941)
chr6 (11-409)||(27200172-27200569)
chr6 (11-409)||(27248664-27249061)
chr6 (11-409)||(30551815-30552212)
chr6 (11-392)||(26791819-26792199)
chr6 (11-416)||(29578994-29579397)
chr6 (11-392)||(29507419-29507801)
chr6 (11-392)||(16680142-16680523)
chr6 (11-398)||(13292766-13293146)
chr6 (11-415)||(16937840-16938243)
chr6 (11-409)||(4531274-4531671)
chr6 (14-392)||(14139218-14139589)
chr6 (14-392)||(27013736-27014106)
chr6 (11-392)||(4778883-4779264)
chr6 (11-392)||(26926771-26927135)
chr6 (11-398)||(27031020-27031403)
chr6 (11-392)||(27208907-27209283)
chr6 (11-392)||(27239945-27240321)
chr6 (11-314)||(26666473-26666774)
chr6 (11-392)||(27025148-27025524)
chr6 (11-392)||(24869713-24870087)
chr6 (11-392)||(24299575-24299950)
chr6 (11-392)||(15406348-15406724)
chr6 (11-392)||(15418135-15418511)
chr6 (23-355)||(20174589-20174930)
chr6 (23-355)||(22161061-22161402)
chr6 (322-421)||(23851453-23851552)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (11-421)||(5141088-5141498)
chr7 (11-413)||(26441235-26441637)
chr7 (11-421)||(16745274-16745684)
chr7 (11-421)||(24586289-24586698)
chr7 (11-392)||(26678858-26679239)
chr7 (11-421)||(4138999-4139410)
chr7 (11-409)||(26268839-26269240)
chr7 (11-392)||(26663666-26664047)
chr7 (11-398)||(5164381-5164767)
chr7 (11-416)||(3451297-3451702)
chr7 (11-392)||(39206893-39207273)
chr7 (11-392)||(5154087-5154466)
chr7 (11-409)||(11446874-11447271)
chr7 (11-413)||(16443757-16444159)
chr7 (11-392)||(26518796-26519174)
chr7 (11-421)||(4205363-4205772)
chr7 (11-409)||(45393205-45393602)
chr7 (11-392)||(31558148-31558528)
chr7 (11-398)||(11418533-11418919)
chr7 (33-392)||(26509471-26509831)
chr7 (11-392)||(2160573-2160955)
chr7 (11-421)||(31084376-31084786)
chr7 (11-392)||(45737304-45737686)
chr7 (11-421)||(26313603-26314011)
chr7 (11-421)||(16047289-16047695)
chr7 (11-313)||(26595750-26596053)
chr7 (14-392)||(2779255-2779626)
chr7 (11-392)||(31129908-31130282)
chr7 (11-421)||(10847557-10847968)
chr7 (11-392)||(16512194-16512568)
chr7 (11-388)||(10910680-10911050)
chr7 (314-392)||(26531926-26532004)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (11-409)||(29658879-29659276)
chr3 (11-392)||(5727947-5728328)
chr3 (11-392)||(47029422-47029803)
chr3 (11-409)||(4340587-4340984)
chr3 (11-421)||(4629725-4630133)
chr3 (11-392)||(5717037-5717418)
chr3 (11-392)||(5764040-5764421)
chr3 (11-416)||(21680646-21681049)
chr3 (11-421)||(29142665-29143077)
chr3 (11-416)||(32296574-32296979)
chr3 (11-409)||(18248690-18249087)
chr3 (11-392)||(10649040-10649420)
chr3 (11-409)||(28027243-28027638)
chr3 (11-421)||(28109862-28110276)
chr3 (11-421)||(31958366-31958777)
chr3 (11-392)||(5472957-5473336)
chr3 (14-416)||(5590275-5590676)
chr3 (11-409)||(20570757-20571154)
chr3 (11-421)||(5603224-5603635)
chr3 (11-421)||(24334113-24334524)
chr3 (11-392)||(8217601-8217983)
chr3 (11-421)||(16422123-16422532)
chr3 (11-392)||(51787991-51788371)
chr3 (11-392)||(4422887-4423267)
chr3 (11-392)||(4790544-4790925)
chr3 (11-392)||(17970777-17971155)
chr3 (11-392)||(10402118-10402497)
chr3 (11-421)||(16618400-16618813)
chr3 (11-392)||(22381492-22381871)
chr3 (11-409)||(17978861-17979259)
chr3 (11-392)||(20072002-20072384)
chr3 (11-421)||(28345111-28345519)
chr3 (11-392)||(18231162-18231542)
chr3 (11-398)||(18286266-18286651)
chr3 (11-398)||(18301567-18301952)
chr3 (11-392)||(7079191-7079576)
chr3 (11-392)||(5019682-5020061)
chr3 (11-390)||(11104272-11104651)
chr3 (11-392)||(6536654-6537034)
chr3 (11-392)||(48471896-48472280)
chr3 (11-392)||(22864759-22865137)
chr3 (11-392)||(22879818-22880196)
chr3 (11-392)||(18057229-18057612)
chr3 (11-392)||(31030156-31030529)
chr3 (11-398)||(6207863-6208245)
chr3 (11-392)||(19700455-19700847)
chr3 (14-409)||(18336580-18336968)
chr3 (11-398)||(4727596-4727976)
chr3 (11-392)||(32445123-32445494)
chr3 (11-392)||(15735011-15735386)
chr3 (11-398)||(35886727-35887109)
chr3 (11-392)||(8283369-8283760)
chr3 (11-392)||(5658103-5658480)
chr3 (11-392)||(4689620-4689994)
chr3 (11-261)||(15886652-15886895)
chr3 (290-392)||(15886894-15886998)
chr3 (314-392)||(8002529-8002607)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (11-421)||(28355780-28356192)
chr8 (11-392)||(9360628-9361007)
chr8 (11-392)||(31360534-31360914)
chr8 (11-421)||(19680425-19680833)
chr8 (11-421)||(31483700-31484111)
chr8 (11-392)||(33248372-33248751)
chr8 (11-421)||(29835300-29835708)
chr8 (11-409)||(12086553-12086951)
chr8 (11-392)||(18796712-18797093)
chr8 (11-398)||(21342000-21342387)
chr8 (11-392)||(15773580-15773960)
chr8 (11-398)||(19910992-19911380)
chr8 (11-392)||(18715486-18715868)
chr8 (11-392)||(44566986-44567369)
chr8 (11-421)||(19202205-19202603)
chr8 (11-421)||(27602744-27603146)
chr8 (48-392)||(33264737-33265079)
chr8 (140-409)||(16260212-16260480)
chr8 (11-392)||(22074759-22075140)
chr8 (14-392)||(19655180-19655554)
chr8 (11-392)||(22138912-22139286)
chr8 (11-392)||(2131098-2131472)
chr8 (11-392)||(19694101-19694477)
chr8 (11-360)||(14569194-14569540)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-392)||(12042-12421)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (11-416)||(3795527-3795932)
chr5 (11-392)||(30174478-30174859)
chr5 (11-392)||(33881139-33881519)
chr5 (11-392)||(18369300-18369680)
chr5 (15-398)||(11555361-11555742)
chr5 (11-421)||(33298517-33298930)
chr5 (11-416)||(28953548-28953952)
chr5 (11-409)||(32590044-32590440)
chr5 (11-421)||(22894400-22894808)
chr5 (11-392)||(28655255-28655636)
chr5 (11-409)||(37352412-37352809)
chr5 (11-392)||(37760995-37761376)
chr5 (11-409)||(2517061-2517459)
chr5 (11-409)||(30158030-30158427)
chr5 (11-409)||(31820178-31820573)
chr5 (11-392)||(40467321-40467701)
chr5 (11-372)||(43084291-43084651)
chr5 (11-392)||(18494536-18494915)
chr5 (11-421)||(6880287-6880697)
chr5 (11-402)||(8659240-8659629)
chr5 (11-392)||(37746090-37746476)
chr5 (11-392)||(41680717-41681098)
chr5 (14-392)||(9544478-9544856)
chr5 (11-421)||(9323461-9323869)
chr5 (11-392)||(13318596-13318975)
chr5 (11-421)||(12138160-12138568)
chr5 (11-392)||(13180561-13180937)
chr5 (11-392)||(11329650-11330032)
chr5 (11-398)||(23631976-23632364)
chr5 (11-392)||(24729983-24730363)
chr5 (11-409)||(33522378-33522776)
chr5 (11-392)||(15752626-15753000)
chr5 (11-392)||(13436442-13436828)
chr5 (34-392)||(30035439-30035795)
chr5 (11-392)||(34622531-34622912)
chr5 (11-392)||(5643813-5644191)
chr5 (11-421)||(26486380-26486778)
chr5 (14-392)||(31437477-31437847)
chr5 (11-392)||(37665254-37665634)
chr5 (11-392)||(18122184-18122564)
chr5 (18-392)||(25206290-25206670)
chr5 (18-392)||(25270446-25270826)
chr5 (11-392)||(15652528-15652906)
chr5 (11-392)||(22992892-22993264)
chr5 (11-392)||(23897887-23898261)
chr5 (11-392)||(33783500-33783875)
chr5 (11-392)||(24608258-24608634)
chr5 (11-392)||(24975862-24976236)
chr5 (11-392)||(30940649-30941023)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (11-392)||(37945723-37946104)
chr2 (11-392)||(27809705-27810087)
chr2 (11-392)||(254510-254890)
chr2 (11-416)||(40239489-40239892)
chr2 (11-416)||(12710459-12710863)
chr2 (11-398)||(12661537-12661922)
chr2 (11-392)||(12592814-12593198)
chr2 (11-421)||(39896043-39896452)
chr2 (11-392)||(16167482-16167862)
chr2 (11-421)||(22922001-22922412)
chr2 (11-409)||(27782219-27782616)
chr2 (11-392)||(3788498-3788877)
chr2 (11-392)||(13930402-13930784)
chr2 (11-421)||(19410342-19410753)
chr2 (11-392)||(27122529-27122907)
chr2 (11-392)||(37931376-37931763)
chr2 (11-421)||(21671028-21671440)
chr2 (11-392)||(37383681-37384061)
chr2 (11-421)||(37679749-37680160)
chr2 (11-421)||(37695014-37695425)
chr2 (11-392)||(9343845-9344225)
chr2 (11-392)||(34867687-34868066)
chr2 (11-392)||(39045680-39046060)
chr2 (11-416)||(21697031-21697438)
chr2 (11-421)||(11629043-11629451)
chr2 (11-409)||(16823195-16823592)
chr2 (11-409)||(16897888-16898285)
chr2 (11-392)||(34160848-34161230)
chr2 (11-392)||(31882291-31882670)
chr2 (11-348)||(31868644-31868979)
chr2 (11-392)||(32055806-32056185)
chr2 (11-392)||(34297160-34297533)
chr2 (11-421)||(27396298-27396717)
chr2 (11-421)||(19450276-19450694)
chr2 (11-392)||(28888283-28888658)
chr2 (11-398)||(34268784-34269165)
chr2 (11-392)||(23122436-23122811)
chr2 (15-390)||(27428315-27428682)
chr2 (11-392)||(20843916-20844296)
chr2 (11-148)||(23117044-23117180)
chr2 (343-392)||(31887682-31887731)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (33-409)||(51644211-51644588)
chr1 (11-392)||(3647154-3647534)
chr1 (11-392)||(10968673-10969054)
chr1 (11-391)||(10951100-10951480)
chr1 (11-392)||(28591091-28591470)
chr1 (11-421)||(20334283-20334694)
chr1 (11-392)||(28155734-28156116)
chr1 (11-392)||(41787177-41787559)
chr1 (11-421)||(16201895-16202312)
chr1 (11-421)||(20466756-20467173)
chr1 (11-421)||(21891630-21892025)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-421)||(3047-3458)
scaffold0159 (11-255)||(17949-18194)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (11-392)||(9510-9889)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-409)||(15558-15962)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (11-392)||(4471-4854)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-409)||(13938-14336)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-392)||(8797-9176)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-392)||(9920-10299)
scaffold0143 (11-392)||(33303-33680)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-392)||(18591-18973)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (11-421)||(1634-2043)
scaffold0322 (11-421)||(12023-12443)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-421)||(25092-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (11-392)||(6072-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (11-398)||(24774-25156)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (238-409)||(366-537)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-184)||(1-173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (254-421)||(26243-26410)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (260-393)||(40759-40899)
scaffold0099 (11-118)||(40497-40606)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856630
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39856834  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856833 gctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39856736  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttc 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39856735 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 39856636  T
Q  411 agatga 416  Q
    ||||||    
T  39856635 agatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332671
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 20332488  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332489 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 20332588  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  20332589 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 20332671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40099885
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 40099702  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099703 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 40099802  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  40099803 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 40099885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18794882
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 18794683  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794684 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18794782  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794783 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18794882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157562
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 27157378  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157379 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27157478  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  27157479 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 27157562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586610
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 24586427  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586428 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 24586527  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  24586528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 24586610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104560
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 14104741  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14104740 gctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14104642  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  14104641 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 14104560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759781
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 30759961  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30759960 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 30759863  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  30759862 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 30759781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33668049
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 33667869  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33667870 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 33667967  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  33667968 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 33668049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839408
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 54839589  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54839588 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttt-caagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 54839491  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  54839490 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 54839408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700557
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5700739  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5700738 agctttgaaagtagaa-gaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 5700641  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  | ||||||||||||    
T  5700640 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaatt 5700557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753741
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 14753559  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14753560 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 14753657  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  14753658 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 14753741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011870
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatat 5012077  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5012076 agctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5011978  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5011977 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 5011878  T
Q  409 tcagatga 416  Q
    ||||||||    
T  5011877 tcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975704
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagc 21975900  T
Q  213 tttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 312  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21975899 tttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcac 21975801  T
Q  313 aaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21975800 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 21975704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120776
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 31120576  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31120577 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 31120675  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  31120676 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagct 31120775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183210
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34183028  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34183029 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 34183127  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  34183128 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 34183210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906240
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 304  Q
    || || ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 1906357  T
Q  305 ggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacaga 404  Q
     |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||| |||      
T  1906356 agatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatg 1906257  T
Q  405 agcttcagatgatgatg 421  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  1906256 agcttctgatgaagatg 1906240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233816
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacg 15233920  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaa 405  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  |||| ||| ||    
T  15233919 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaa 15233820  T
Q  406 gctt 409  Q
    ||||    
T  15233819 gctt 15233816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338766
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36338585  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36338586 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 36338684  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  36338685 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 36338766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118680
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 24118858  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  24118857 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 24118759  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  24118758 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 24118680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575873
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6576060  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  6576059 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6575961  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6575960 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaag 6575873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15276909
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15276794  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15276795 atttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 15276894  T
Q  407 cttcagatgatgatg 421  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15276895 cttctgatgaagatg 15276909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380515
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaattt-caagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 15380303  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15380304 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15380402  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| | |||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  15380403 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagct 15380502  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    || ||||| ||||    
T  15380503 tcggatgaagatg 15380515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673876
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     || ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgg 1673963  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattt 393  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1673962 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattt 1673876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17019069
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 17019254  T
Q  209 tagcttt-gaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||| ||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17019253 tagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 17019155  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  17019154 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 17019069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36324376  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36324377 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 36324475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14671027
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||     
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtac 14671218  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14671217 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacgga 14671119  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14671118 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaag 14671027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 409
Target Start/End: Original strand, 18311379 - 18311443
Alignment:
Q  346 ggtacattgaaca-cagtaat-cactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18311379 ggtacattgaacaacagtaatacactaca-ttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 18311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 415
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27623927
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatat 27623720  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623721 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27623820  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27623821 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27623920  T
Q  409 tcagatg 415  Q
    || ||||    
T  27623921 tctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8899923
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 8899712  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899713 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 8899811  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899812 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 8899911  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  8899912 cagatgaagatg 8899923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284586
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27284375  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27284376 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27284474  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  27284475 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagctt 27284574  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  27284575 cagatgaagatg 27284586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356323
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27356124  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356125 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27356223  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27356224 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27356323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458718
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34458520  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458521 gcttagaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 34458619  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34458620 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 34458718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370643
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaattt-caattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatat 33370444  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370445 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 33370543  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33370544 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 33370643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518389
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13518207  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518208 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 13518307  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  13518308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 13518389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27491119
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 27491318  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27491317 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 27491219  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  27491218 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagctt 27491119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763766
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4763948  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4763947 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4763849  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  4763848 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 4763766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110622
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26110424  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26110425 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26110523  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26110524 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26110622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755823
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16756006  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16756005 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16755907  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  16755906 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 16755823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929107
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 22928994  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  22928995 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagct 22929094  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  22929095 tcagatgaagatg 22929107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4539971
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4539771  T
Q  211 gctttgaaagt-agaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4539772 gctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 4539870  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4539871 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 4539970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26772840
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26772642  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772643 agctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 26772740  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26772741 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26772840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063479
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 27063666  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27063665 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27063568  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  27063567 tacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaag 27063479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166501
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 28166680  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28166679 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 28166581  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttg 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||    
T  28166580 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttg 28166501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213440
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 28213640  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28213639 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 28213541  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28213540 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 28213441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555532
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagctttt-aattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29555743  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  29555742 agctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatt 29555644  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  29555643 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaactt 29555544  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    | ||||| ||||    
T  29555543 ctgatgaagatg 29555532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200172
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27200372  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27200371 tagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27200274  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27200273 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagc 27200174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27249061
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27248861  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27248862 tagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27248959  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27248960 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagc 27249059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552212
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 30552013  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30552014 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 30552112  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30552113 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 30552212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791819
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26792001  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26792000 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatt 26791902  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  26791901 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 26791819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29578994
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatat 29579199  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29579198 agctttgaaaatagaa-gaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 29579101  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||| |||||  || |||||    
T  29579100 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagctt 29579001  T
Q  410 cagatga 416  Q
     ||||||    
T  29579000 tagatga 29578994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507419
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 29507603  T
Q  210 agctttgaaagt--agaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||  | || ||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29507602 agctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 29507504  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  29507503 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 29507419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16680142
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16680325  T
Q  210 agctttgaaagtagaag-gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16680324 aactttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggat 16680226  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  16680225 tttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 16680142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293146
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13292959  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13292960 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 13293058  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  13293059 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 13293146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 415
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938243
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatat 16938038  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16938039 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggatt 16938136  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16938137 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagct 16938236  T
Q  409 tcagatg 415  Q
    |||||||    
T  16938237 tcagatg 16938243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531274
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtata 4531474  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  4531473 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggat 4531375  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4531374 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagct 4531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139589
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 14139411  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  14139412 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 14139510  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  14139511 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 14139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013736
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 27013914  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  27013913 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 27013815  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  27013814 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 27013736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778883
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatac 4779067  T
Q  210 agcttt-gaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  4779066 agcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggat 4778968  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  4778967 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 4778883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926771
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactct---------------catttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 26926952  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26926951 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26926854  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  26926853 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 26926771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27031020
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||     
T  27031304 caggtttgcttttcaaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27031210  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27031209 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27031111  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  27031110 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaag 27031020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208907
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27209093  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27209092 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 27208994  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  27208993 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 27208907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240321
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27240135  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27240136 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 27240234  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  27240235 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 27240321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagac-aaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26666671  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666672 agctttgaaagtagaa-gaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 26666769  T
Q  310 cacaa 314  Q
    |||||    
T  26666770 cacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27025148
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||    
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgta 27025333  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27025332 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27025234  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  27025233 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaatt 27025148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869713
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24869897  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24869896 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24869798  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  24869797 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 24869713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24299950
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| |    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtaca 24299767  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    || |||||| |||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24299768 taactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24299866  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  24299867 ttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 24299950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406724
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15406539  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15406540 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15406638  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| |||||||||||    
T  15406639 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaatt 15406724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418511
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15418326  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15418327 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15418425  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| |||||||||||    
T  15418426 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaatt 15418511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174589
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  215 tgaaagtagaaggaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 312  Q
    || ||||| |  |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  313 aaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161402
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  215 tgaaagtagaaggaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 312  Q
    || ||||| |  |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  313 aaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22161402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 421
Target Start/End: Original strand, 23851453 - 23851552
Alignment:
Q  322 aaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23851453 aaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatg 23851552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141498
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 5141286  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141287 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5141385  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5141386 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 5141485  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  5141486 tcagatgaagatg 5141498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441235
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 26441439  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 gctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26441339  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26441338 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 26441239  T
Q  410 caga 413  Q
    ||||    
T  26441238 caga 26441235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745684
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16745472  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745473 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 16745571  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16745572 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16745671  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  16745672 tcagatgaagatg 16745684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586698
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 24586487  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24586488 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 24586586  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24586587 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagatt 24586686  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  24586687 cagatgaagatg 24586698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679239
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26679056  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679057 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26679156  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  26679157 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 26679239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139410
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4139197  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4139198 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4139297  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  4139298 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 4139397  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  4139398 tcagatgaagatg 4139410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269240
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgt 26269037  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26269038 acatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 26269136  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaa 405  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26269137 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 26269236  T
Q  406 gctt 409  Q
    ||||    
T  26269237 gctt 26269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26664047
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26663864  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663865 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26663964  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  26663965 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 26664047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164381
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5164569  T
Q  211 g-ctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  5164568 ggctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatt 5164470  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5164469 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 5164381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451297
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 3451504  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451503 atagctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 3451406  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3451405 ttcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 3451306  T
Q  408 ttcagatga 416  Q
    |||||||||    
T  3451305 ttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207273
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 39207091  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207092 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 39207190  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  39207191 cacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaatt 39207273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5154087
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5154268  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  5154267 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 5154169  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  5154168 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 5154087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446874
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 11447073  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11447072 tagctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 11446975  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11446974 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 11446875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444159
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggat 16444054  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  16444055 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagct 16444154  T
Q  409 tcaga 413  Q
    |||||    
T  16444155 tcaga 16444159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518796
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26518976  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26518975 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26518878  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  26518877 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 26518796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205363
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4205574  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4205573 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4205476  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4205475 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 4205376  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  4205375 tcagatgaagatg 4205363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393205
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtat 45393404  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45393403 agctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 45393305  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  45393304 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagctt 45393205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558528
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31558346  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31558347 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31558445  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  31558446 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaatt 31558528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11418919
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 11418731  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11418732 agctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11418830  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  11418831 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 11418919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 33 - 392
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509831
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaat 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  233 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaa- 331  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  332 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 26509831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160573
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 208  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 2160657  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  2160656 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 2160573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084786
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31084574  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  31084575 agctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggatt 31084673  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31084674 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 31084773  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  31084774 tcagatgaagatg 31084786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737304
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 45737488  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45737487 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 45737390  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  45737389 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaatt 45737304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26314011
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26313801  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26313802 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26313899  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| | |||||||||| |||    
T  26313900 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaactt 26313999  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  26314000 cagatgaagatg 26314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047289
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaac-ttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacata 16047499  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16047498 gctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 16047400  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttc 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  16047399 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 16047300  T
Q  411 agatgatgatg 421  Q
     ||||| ||||    
T  16047299 tgatgaagatg 16047289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatat 26595855  T
Q  210 agctttgaaagtagaag-gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595854 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 26595755  T
Q  309 tcaca 313  Q
    |||||    
T  26595754 tcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779255
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 2779433  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  2779432 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 2779334  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  2779333 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 2779255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129908
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31130089  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31130088 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31129990  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  31129989 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 31129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847557
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 10847673  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaa 405  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  10847672 gatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 10847573  T
Q  406 gcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  10847572 gcttctgatgaagatg 10847557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512568
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 16512384  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16512385 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 16512483  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16512484 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 16512568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10911050
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 10910870  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10910871 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 10910969  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttg 388  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  10910970 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttg 10911050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532004
Alignment:
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 26532004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659276
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29659077  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659078 aactttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 29659176  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29659177 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 29659276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727947
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5728130  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728129 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5728030  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  5728029 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 5727947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029422
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 47029605  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029604 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 47029505  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  47029504 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 47029422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4340984
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 4340785  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4340786 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 4340884  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4340885 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 4340984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629725
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 4629936  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629935 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 4629837  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4629836 aacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4629737  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  4629736 cagatgaagatg 4629725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5717037
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5717220  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717219 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5717120  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  5717119 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 5717037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764421
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5764238  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764239 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5764338  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  5764339 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 5764421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680646
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 21680852  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680851 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 21680753  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680752 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 21680653  T
Q  410 cagatga 416  Q
    |||||||    
T  21680652 cagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29143077
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 29142863  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142864 atagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 29142963  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29142964 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 29143063  T
Q  408 ttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||    
T  29143064 ttcagatgaagatg 29143077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296574
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32296781  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32296780 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 32296681  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||  ||||| |||    
T  32296680 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaactt 32296581  T
Q  410 cagatga 416  Q
    | |||||    
T  32296580 ctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248690
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgt 18248889  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248888 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18248790  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18248789 cacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10649040
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 10649222  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649221 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 10649123  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  10649122 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaatt 10649040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027243
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 28027440  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28027439 gctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattc 28027342  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28027341 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 28027243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110276
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 28110060  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28110061 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgg 28110160  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaa 405  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||    
T  28110161 attcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28110260  T
Q  406 gcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||    
T  28110261 gcttcagatgaagatg 28110276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958777
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31958564  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31958565 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31958664  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  31958665 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 31958764  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  31958765 tcagatgaagatg 31958777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5472957
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 5473139  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473138 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5473040  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  5473039 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 5472957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 416
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590676
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagc 5590473  T
Q  213 tttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 312  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  5590474 tttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 5590572  T
Q  313 aaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttcag 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5590573 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttag 5590672  T
Q  413 atga 416  Q
    ||||    
T  5590673 atga 5590676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571154
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 20570955  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570956 agctttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 20571054  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20571055 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 20571154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603635
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5603422  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5603423 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5603522  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  5603523 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 5603622  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  5603623 tcagatgaagatg 5603635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24334113
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 24334326  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24334325 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24334226  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  24334225 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 24334126  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  24334125 tcagatgaagatg 24334113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217601
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtat 8217785  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217784 ataactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 8217686  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8217685 tccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaatt 8217601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422123
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16422235  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16422234 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttc-cggaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16422136  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  16422135 tcagatgaagatg 16422123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51787991
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 51788173  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788172 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 51788074  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  51788073 cacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaatt 51787991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422887
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4423069  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4423068 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4422970  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  4422969 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 4422887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4790925
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4790742  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  4790743 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatt 4790841  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  4790842 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 4790925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971155
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 17970975  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17970976 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 17971073  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  17971074 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 17971155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10402118
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 10402299  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10402298 agctttgaaagtagaaa-aaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 10402201  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  10402200 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 10402118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618813
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 16618697  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaa 405  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  16618698 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 16618797  T
Q  406 gcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  16618798 gcttctgatgaagatg 16618813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22381871
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 22381689  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22381690 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22381788  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  22381789 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 22381871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979259
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 17979059  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17979060 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 17979158  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  17979159 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagct 17979258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20072002
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 20072186  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20072185 tatagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacgg 20072088  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  20072087 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaatt 20072002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28345111
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 28345321  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28345320 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28345223  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | |||||||    
T  28345222 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 28345123  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  28345122 cagatgaagatg 28345111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18231162
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18231344  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231343 agctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18231245  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  18231244 cgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 18231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286651
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18286463  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18286464 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18286561  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  18286562 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaag 18286651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18301952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18301764  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18301765 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18301862  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  18301863 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaag 18301952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079191
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttg----t 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 7079278  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  7079277 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 7079191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019682
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 5019863  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5019862 agctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 5019765  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||    
T  5019764 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaatt 5019682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104651
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat- 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11104470  T
Q  210 -agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11104471 tagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggat 11104569  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaa 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  11104570 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaa 11104651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6537034
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagac-aaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 6536852  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6536853 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6536951  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  6536952 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 6537034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471896
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagac-agaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 48472082  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  48472081 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatg 48471983  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  48471982 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 48471896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865137
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagac-aaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22864957  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22864958 gctttgaaagtagaa-gaaagcatag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22865055  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  22865056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 22865137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880196
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagac-aaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22880016  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22880017 gctttgaaagtagaa-gaaagcatag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22880114  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  22880115 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 22880196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057229
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18057314  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  18057313 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 18057229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030529
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31030348  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31030349 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31030447  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  31030448 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 31030529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207863
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtata 6208054  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6208053 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 6207954  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6207953 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 6207863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700455
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  204 ------gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 297  Q
          ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 19700550  T
Q  298 actccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19700549 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaatt 19700455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336580
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagct 18336776  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  18336775 ttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 18336677  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  18336676 aagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagctt 18336580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727596
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtata 4727785  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4727784 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4727686  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  4727685 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaag 4727596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32445123
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatata 32445304  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
     ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  32445303 actttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 32445205  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  32445204 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 32445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735386
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||     
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtac 15735203  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15735204 ataactttgaaagtaaaag-aaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15735301  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  15735302 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 15735386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886727
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 35886918  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35886917 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 35886819  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  35886818 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 35886727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283760
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||         |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  201 ttt-gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 299  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagttt-caaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 8283667  T
Q  300 tccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  8283668 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 8283760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5658103
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
     |||||||||||||||||       |||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 5658289  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5658288 ataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacg 5658190  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  5658189 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 5658103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689620
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 4689804  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||| ||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4689803 ataacttagaaagtaaaag-aaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 4689706  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  4689705 tttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 4689620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||        |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||     
T  15886751 caggtttgcttttca--------aaaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtac 15886842  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 261  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886843 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15886998
Alignment:
Q  290 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttgaaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaacttt 387  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  388 gaatt 392  Q
    |||||    
T  15886994 gaatt 15886998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002529
Alignment:
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaatt 8002529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356192
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 28355978  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355979 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 28356078  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||     
T  28356079 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaga 28356178  T
Q  408 ttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||    
T  28356179 ttcagatgaagatg 28356192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360628
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9360809  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360808 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 9360710  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  9360709 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 9360628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360534
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 31360716  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360715 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 31360617  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  31360616 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaatt 31360534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680425
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19680635  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19680634 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 19680537  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19680536 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 19680437  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  19680436 cagatgaagatg 19680425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484111
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31483898  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31483899 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31483998  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| |   ||||||    
T  31483999 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagct 31484098  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  31484099 tcagatgaagatg 31484111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248372
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33248553  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33248552 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 33248454  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  33248453 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 33248372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835300
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 29835510  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  29835509 gctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 29835411  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttc 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29835410 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttc 29835311  T
Q  411 agatgatgatg 421  Q
    |||||| ||||    
T  29835310 agatgaagatg 29835300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12086951
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 12086751  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12086752 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 12086850  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12086851 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 12086950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796712
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 18796895  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18796894 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18796796  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  18796795 tataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 18796712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342387
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 21342198  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21342199 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 21342297  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21342298 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 21342387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773580
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 15773762  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15773761 agctctgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15773663  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  15773662 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 15773580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911380
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19911290  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  19911291 ttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaag 19911380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715486
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 18715670  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18715669 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 18715572  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  18715571 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaatt 18715486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44566986
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 44567171  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44567170 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 44567073  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||||||    
T  44567072 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaatt 44566986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202603
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19202403  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19202404 gcttt-----------gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 19202491  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaa-actttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | || |||||||||| |||||||||||| |||    
T  19202492 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaactt 19202591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603146
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa---------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 27602933  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602934 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27603032  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27603033 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 27603132  T
Q  408 ttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||    
T  27603133 ttcagatgaagatg 27603146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 48 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264737
Alignment:
Q  48 tattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaa 147  Q
    |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaa 33264981  T
Q  148 ttttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaaca 246  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  33264980 ttttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaa-gaaaataga-atttcaaaca 33264883  T
Q  247 aaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtg 346  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33264882 aaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 33264783  T
Q  347 gtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||| ||| |||||||||||    
T  33264782 gtacattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaatt 33264737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 140 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260212
Alignment:
Q  140 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttt 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttt 16260382  T
Q  240 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  340 gttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 16260212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075140
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    || | ||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaactttttta-ttttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 22074956  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22074957 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22075055  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22075056 tttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaatt 22075140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655554
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatata 210  Q
    ||||||||| |||||       |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  19655280 gtttgcttt-caaaa-------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacata 19655371  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
     ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  19655372 actttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattt 19655470  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  19655471 acaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 19655554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138912
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    || |||||||||          ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  22139186 caagtttgcttt----------caaaaactttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 22139097  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22139096 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22138998  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22138997 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 22138912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131472
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||         ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  2131197 caggtttgcttttcaaag--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 2131288  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2131289 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgga 2131387  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  2131388 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 2131472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19694101
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 19694286  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19694285 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 19694187  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  19694186 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 19694101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14569194
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat- 207  Q
    ||||||||  ||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttttt 14569350  T
Q  208 ----atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 303  Q
        ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14569349 gaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 14569251  T
Q  304 cggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569250 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 14569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 12042
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatata 12223  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12222 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 12124  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  12123 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795527
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3795734  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795733 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 3795634  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  3795633 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctt 3795534  T
Q  410 cagatga 416  Q
     ||||||    
T  3795533 tagatga 3795527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174478
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 30174661  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174660 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 30174561  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  30174560 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 30174478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33881139
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33881321  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881320 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33881221  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  33881220 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 33881139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369680
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18369498  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18369499 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 18369598  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  18369599 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 18369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555361
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 11555544  T
Q  215 tgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11555543 tgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 11555445  T
Q  315 agcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  11555444 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 11555361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298517
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 33298732  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298731 atagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 33298632  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33298631 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 33298532  T
Q  407 cttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||| ||||    
T  33298531 cttcagatgaagatg 33298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28953952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 28953745  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953746 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 28953844  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28953845 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 28953944  T
Q  409 tcagatga 416  Q
    ||||||||    
T  28953945 tcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590440
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatat 32590242  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  32590243 agctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaatt 32590340  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32590341 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 32590440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894400
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22894511  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttc 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  22894510 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 22894411  T
Q  411 agatgatgatg 421  Q
     ||||| ||||    
T  22894410 tgatgaagatg 22894400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655255
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 28655339  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  28655338 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 28655255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352809
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 37352610  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37352611 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 37352709  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  37352710 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 37352809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37760995
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37761178  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37761177 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggat 37761079  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  37761078 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 37760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2517061
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 2517261  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2517260 atagctttgaaagtagaag-aaaatagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacgga 2517163  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2517162 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 2517063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30158030
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 30158229  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30158228 agctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 30158130  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  30158129 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagctt 30158030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820573
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31820376  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31820377 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 31820474  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31820475 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31820573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467701
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 40467519  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40467520 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 40467618  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  40467619 tataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 40467701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084291
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 43084453  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084452 aactttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 43084354  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43084353 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattaca 43084291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18494915
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatata 18494734  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  18494735 gctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattc 18494833  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||| |||||    
T  18494834 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaatt 18494915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880287
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatat 6880499  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6880498 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6880400  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6880399 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagat 6880300  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  6880299 tcagatgaagatg 6880287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 402
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659629
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 8659438  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659439 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 8659537  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtaca 402  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||   ||||||||||||| |||||||||    
T  8659538 cacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttc-ccgaaactttgaattcacaagtaca 8659629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746476
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgt------actcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 104  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  105 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 37746288  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37746289 tatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 37746388  T
Q  305 ggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  37746389 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 37746476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680717
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 41680901  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41680900 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggat 41680801  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  41680800 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaatt 41680717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9544856
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 9544676  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9544677 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 9544774  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  9544775 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaatt 9544856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323461
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 9323671  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9323670 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 9323573  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9323572 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaactt 9323473  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  9323472 cagatgaagatg 9323461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13318975
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13318794  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  13318795 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 13318893  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  13318894 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaatt 13318975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138160
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 12138370  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12138369 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 12138272  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| | |||||||||| |||    
T  12138271 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaactt 12138172  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  12138171 cagatgaagatg 12138160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13180937
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13180754  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  13180755 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 13180854  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  13180855 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 13180937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329650
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata- 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||     
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 11329834  T
Q  209 -tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11329833 ttagctttgaaagtagaa-gaaaatagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 11329735  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  11329734 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 11329650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23631976
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 23632066  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  23632065 tcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 23631976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24729983
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtata 24730165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24730164 tagctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24730067  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  24730066 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaatt 24729983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522378
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 33522578  T
Q  210 agctttgaaagtagaag-gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33522577 agctttgaaagtaaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 33522479  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33522478 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagct 33522379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15753000
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatata 15752820  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15752821 gctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 15752918  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  15752919 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 15753000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13436828
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgt 13436640  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaag-gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 304  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13436641 atatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 13436739  T
Q  305 ggattcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  13436740 ggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 13436828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035439
Alignment:
Q  34 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  134 aaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaat 232  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30035695 aaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaat 30035598  T
Q  233 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaat 332  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30035597 agaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 30035499  T
Q  333 tttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  30035498 tttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 30035439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622531
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34622714  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  34622713 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 34622615  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  34622614 cacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 34622531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643813
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 5643994  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5643993 agctttgaaagtaaaag-aaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5643896  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||    
T  5643895 cacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaatt 5643813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486380
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26486580  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26486579 gcttt-----------gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26486492  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26486491 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaactt 26486392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437477
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 31437655  T
Q  214 ttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  31437654 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 31437556  T
Q  314 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  31437555 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 31437477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665634
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37665451  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37665452 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 37665550  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| ||||||||    
T  37665551 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaatt 37665634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122564
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 18122381  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18122382 agctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18122480  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  18122481 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 18122564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206290
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25206373  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  25206372 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaatt 25206290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270446
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25270529  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  25270528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaatt 25270446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15652906
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||    | | | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaa-aaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 15652725  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15652726 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15652824  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  15652825 acaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 15652906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993264
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22993083  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22993084 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22993182  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |  ||||||||||||    
T  22993183 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaatt 22993264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897887
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gt 205  Q
    ||||||||||||  ||| |           |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    ||    
T  23898161 caggtttgctttcaaaact-----------ttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgt 23898073  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23898072 acatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatg 23897974  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  23897973 aatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23897887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783500
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gta 206  Q
    | ||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 33783685  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33783684 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 33783586  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  33783585 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 33783500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608258
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24608443  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||   |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24608442 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggagttt-caaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24608344  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  24608343 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 24608258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975862
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24976046  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24976045 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24975947  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  24975946 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 24975862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940649
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa---------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 30940834  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30940833 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagaattt-caaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 30940735  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  30940734 tttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 30940649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946104
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37945921  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945922 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 37946021  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  37946022 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 37946104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809705
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27809889  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809888 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27809789  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  27809788 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 27809705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 254510 - 254890
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 254707  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254708 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 254807  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  254808 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 254890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239489
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 40239695  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239694 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 40239596  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239595 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 40239496  T
Q  410 cagatga 416  Q
    |||||||    
T  40239495 cagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12710863
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 12710657  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710658 tagctttgaaagtagaag-aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 12710755  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12710756 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 12710855  T
Q  409 tcagatga 416  Q
    ||||||||    
T  12710856 tcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661537
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 12661724  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12661723 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 12661625  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  12661624 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 12661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592814
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 12593000  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592999 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 12592900  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  12592899 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 12592814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39896043
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39896254  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  39896253 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 39896155  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagtt-cttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39896154 acaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagctt 39896055  T
Q  410 cagatgatgatg 421  Q
    ||||||| ||||    
T  39896054 cagatgacgatg 39896043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167482
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16167664  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167663 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16167565  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  16167564 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 16167482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922412
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22922199  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22922200 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22922299  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  22922300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 22922399  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  22922400 tcagatgaagatg 22922412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782219
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 27782418  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782417 agctttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27782319  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27782318 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27782219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788498
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3788679  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3788678 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattt 3788580  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  3788579 ataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 3788498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930784
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 13930600  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13930601 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggat 13930700  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  13930701 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 13930784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410753
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 19410540  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19410541 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19410640  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||| | | ||||||    
T  19410641 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 19410740  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  19410741 tcagatgaagatg 19410753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122529
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 27122709  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  27122708 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 27122611  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  27122610 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 27122529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931376
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37931565  T
Q  210 agctttgaaagtagaag------gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 303  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931564 agctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 37931465  T
Q  304 cggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  37931464 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 37931376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671440
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 21671325  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||||| |||||||||||||    
T  21671326 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 21671425  T
Q  407 cttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||| ||||    
T  21671426 cttcagatgaagatg 21671440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383681
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37383863  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  37383862 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 37383764  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  37383763 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 37383681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680160
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37679947  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37679948 atagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 37680045  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||||| |||||||||||||    
T  37680046 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 37680145  T
Q  407 cttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||| ||||    
T  37680146 cttcagatgaagatg 37680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695425
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37695212  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37695213 atagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 37695310  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||||| |||||||||||||    
T  37695311 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 37695410  T
Q  407 cttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||| ||||    
T  37695411 cttcagatgaagatg 37695425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344225
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 9344043  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9344044 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 9344142  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  9344143 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 9344225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867687
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 34867868  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  34867867 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggatt 34867770  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||    
T  34867769 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaatt 34867687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39046060
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 39045878  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39045879 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 39045977  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  39045978 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaatt 39046060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697438
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21697328  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaag 406  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||| |||||||    
T  21697329 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaag 21697428  T
Q  407 cttcagatga 416  Q
    ||| ||||||    
T  21697429 ctttagatga 21697438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629451
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaaga-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 11629240  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11629241 tagctttgaaaataaaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11629338  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11629339 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 11629438  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    |||||||| ||||    
T  11629439 tcagatgaagatg 11629451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823592
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16823393  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16823394 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 16823492  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16823493 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16823592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897888
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16898087  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16898086 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 16897988  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16897987 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16897888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160848
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 34161032  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34161031 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 34160933  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  34160932 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 34160848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882291
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaataga-aaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31882472  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31882471 agctttgaaagtagaa-gaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31882374  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  31882373 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 31882291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868979
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31868842  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31868843 agctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31868940  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 348  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868941 tacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055806
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 32055987  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32055986 agctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatt 32055889  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||    
T  32055888 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaatt 32055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34297160
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34297341  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34297340 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattc 34297242  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  34297241 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaatt 34297160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396298
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt---------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 201  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||         |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  202 tt--gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 299  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 27396420  T
Q  300 tccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagt 399  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||     
T  27396419 tccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 27396320  T
Q  400 acagaagcttcagatgatgatg 421  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||    
T  27396319 acaaaagcttctgatgaagatg 27396298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450694
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-----caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 203  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  204 ---gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgact 300  Q
       ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgatt 19450573  T
Q  301 ccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagta 400  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |    
T  19450574 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19450673  T
Q  401 cagaagcttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  19450674 cagaagcttctgatgaagatg 19450694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888283
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 28888467  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28888466 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgga 28888368  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  28888367 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 28888283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269165
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 34268975  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34268976 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 34269074  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34269075 tttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaag 34269165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122811
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 23122627  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  23122628 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggat 23122726  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  23122727 ttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23122811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428682
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 211  Q
    ||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| | || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | |||     
T  27428414 tttgcttttcaaaa---------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataa 27428504  T
Q  212 ctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 311  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27428505 ctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27428603  T
Q  312 caaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaa 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27428604 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaa 27428682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843916
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 20844103  T
Q  207 tatagcttt-gaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 305  Q
     ||| |||| ||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  20844102 cataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacg 20844004  T
Q  306 gattcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  20844003 gatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaatt 20843916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23117044
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat 23117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 392
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887731
Alignment:
Q  343 ggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaatt 31887731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644211
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-gaaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  232 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  332 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 51644211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3647154
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3647336  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  3647335 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 3647236  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  3647235 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaatt 3647154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968673
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 10968856  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968855 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 10968756  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||    
T  10968755 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaatt 10968673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10951100
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatata 10951282  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10951281 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagatt 10951182  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaat 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  10951181 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaat 10951100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28591091
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 28591272  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28591271 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28591173  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  28591172 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 28591091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334694
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 20334580  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  20334581 tttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 20334680  T
Q  408 ttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||    
T  20334681 ttcagatgaagatg 20334694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155734
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 28155918  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28155917 tatagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 28155820  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  28155819 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaatt 28155734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787559
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 41787375  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  41787376 atagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgga 41787473  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  41787474 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 41787559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202312
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 301  Q
      ||| || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16202192  T
Q  302 cacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtac 401  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  |||| ||    
T  16202193 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcac 16202292  T
Q  402 agaagcttcagatgatgatg 421  Q
    || |||||| ||||| ||||    
T  16202293 aggagcttctgatgaagatg 16202312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466756
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttc-------aattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||        |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  202 ttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 301  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 20466876  T
Q  302 cacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtac 401  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |     
T  20466875 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcat 20466776  T
Q  402 agaagcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20466775 agaagcttctgatgaagatg 20466756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21892025
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||         
T  21891729 caggtttgcttttcaaaa-----aaaacttttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt----- 21891818  T
Q  209 tagctttgaaagtagaag-gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
          ||||  || ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21891819 ------tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 21891911  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21891912 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagc 21892011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3458
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 3245  T
Q  211 gctttgaaagtagaagga--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3246 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 3345  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  3346 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaact 3445  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    || ||||| ||||    
T  3446 tctgatgaagatg 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 17996  T
Q  211 gctttgaaagtagaag--gaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 255  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17995 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 9510 - 9889
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9708  T
Q  211 gctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  9709 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattt 9807  T
Q  311 acaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  9808 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 9889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15558
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||| |||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttt 15764  T
Q  203 tgtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15763 tgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 15665  T
Q  303 acggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtaca 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15664 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 15565  T
Q  403 gaagctt 409  Q
    |||||||    
T  15564 gaagctt 15558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4854
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4769  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  4770 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaatt 4854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 13938
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 14138  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14137 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 14039  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 13939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9176
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagac-aaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 8995  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8996 agctttgaaagtagaa-gaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 9093  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  | ||||||||||||    
T  9094 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaatt 9176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9920
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 10101  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  10100 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggatt 10003  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  10002 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 9920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33303
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||  |||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  209 tagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 33388  T
Q  309 tcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  33387 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 33303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18591
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 18775  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  18774 atagctttgaaagtagaa-gaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgga 18677  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  18676 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 18591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1634
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 1845  T
Q  210 agctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1844 agctttgaaagtagaa-gaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 1747  T
Q  310 cacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagct 408  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||| |||||| ||    
T  1746 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaact 1647  T
Q  409 tcagatgatgatg 421  Q
    || ||||| ||||    
T  1646 tctgatgaagatg 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12023
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg----------- 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||               
T  12343 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  200 ttttgtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatga 298  Q
    |||| || |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 12146  T
Q  299 ctccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||    
T  12145 ctccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaag 12046  T
Q  399 tacagaagcttcagatgatgatg 421  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  12045 tacagaagcttctgatgaagatg 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 25092
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 301  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactc 25212  T
Q  302 cacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtac 401  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  25211 cacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcac 25112  T
Q  402 agaagcttcagatgatgatg 421  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  25111 agaagcttctgatgaagatg 25092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 6072
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  6349 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 6258  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6257 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 6159  T
Q  307 attcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatt 392  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  6158 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25156
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||| ||||||||||       |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24873 caggttttcttttcaaaa-------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24965  T
Q  208 atagctttgaaagtagaaggaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24966 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 25064  T
Q  308 ttcacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaag 398  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  25065 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaag 25156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 238 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 366
Alignment:
Q  238 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttat 337  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  338 tggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 421
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26410
Alignment:
Q  254 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  354 gaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatttacaagtacagaagcttcagatgatgatg 421  Q
    || ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatg 26410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 393
Target Start/End: Original strand, 40759 - 40899
Alignment:
Q  260 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccaaaggcatgactcc-acggattcac-aaagctt-gaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  354 g-aacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattt 393  Q
    | ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattt 40899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40606
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  109 ctcaggtttg 118  Q
    ||||||||||    
T  40597 ctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 341 times since January 2019
Visitors: 3059