View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0401_low_4 (Length: 403)

Name: NF0401_low_4
Description: NF0401
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0401_low_4
NF0401_low_4
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (99-403)||(19820534-19820835)
chr7 (101-332)||(44270000-44270230)
chr7 (101-332)||(23078714-23078944)
chr7 (101-332)||(36413627-36413858)
chr7 (101-332)||(15878030-15878259)
chr7 (105-332)||(44958942-44959168)
chr7 (101-394)||(554457-554747)
chr7 (101-326)||(48153803-48154026)
chr7 (101-332)||(36763398-36763630)
chr7 (101-402)||(21409648-21409946)
chr7 (101-332)||(36757619-36757851)
chr7 (101-332)||(36767143-36767375)
chr7 (101-294)||(9249953-9250146)
chr7 (101-294)||(9283503-9283696)
chr7 (101-294)||(25969787-25969980)
chr7 (136-332)||(21180133-21180329)
chr7 (101-332)||(26973315-26973549)
chr7 (101-332)||(35160142-35160375)
chr7 (111-332)||(35136297-35136517)
chr7 (101-256)||(1399949-1400103)
chr7 (101-262)||(38064951-38065111)
chr7 (101-332)||(24956507-24956734)
chr7 (101-332)||(16563842-16564076)
chr7 (101-332)||(16601586-16601820)
chr7 (142-402)||(11830537-11830790)
chr7 (101-392)||(4291953-4292247)
chr7 (101-332)||(1042666-1042903)
chr7 (142-331)||(47237836-47238020)
chr7 (142-332)||(27397205-27397387)
chr7 (136-332)||(11058729-11058925)
chr7 (101-247)||(23969841-23969983)
chr7 (101-332)||(26773179-26773416)
chr7 (101-256)||(33454350-33454505)
chr7 (101-294)||(19510908-19511099)
chr7 (125-241)||(40053573-40053689)
chr7 (142-332)||(39521412-39521595)
chr7 (142-394)||(8029146-8029389)
chr7 (142-332)||(36661313-36661489)
chr7 (142-402)||(16851152-16851401)
chr7 (142-332)||(40096507-40096689)
chr7 (251-402)||(33454535-33454686)
chr7 (143-235)||(47719856-47719948)
chr7 (256-332)||(26843659-26843735)
chr7 (257-394)||(42897347-42897483)
chr7 (257-400)||(34238519-34238663)
chr7 (256-332)||(34122229-34122304)
chr7 (142-402)||(48163777-48164017)
chr7 (218-287)||(47719760-47719829)
chr7 (142-402)||(27354290-27354531)
chr7 (101-332)||(27554944-27555168)
chr7 (267-332)||(38065138-38065204)
chr7 (291-393)||(9249762-9249864)
chr7 (291-393)||(9283312-9283414)
chr7 (291-393)||(25970069-25970171)
chr7 (31-61)||(19820873-19820903)
chr7 (31-61)||(21179912-21179942)
chr7 (31-61)||(23311798-23311828)
chr7 (101-143)||(36661260-36661301)
chr7 (101-143)||(48163724-48163765)
chr7 (291-332)||(47718780-47718821)
chr7 (101-141)||(11830484-11830523)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (101-332)||(20182650-20182880)
chr8 (104-332)||(3892228-3892454)
chr8 (101-330)||(27108802-27109030)
chr8 (101-294)||(40412826-40413019)
chr8 (108-403)||(5817889-5818181)
chr8 (101-276)||(27968375-27968550)
chr8 (105-332)||(32867-33096)
chr8 (101-308)||(8170735-8170941)
chr8 (101-276)||(27886460-27886635)
chr8 (101-276)||(27945118-27945293)
chr8 (101-276)||(28025361-28025536)
chr8 (101-331)||(28737781-28738008)
chr8 (101-332)||(7411885-7412114)
chr8 (130-332)||(37372542-37372738)
chr8 (105-258)||(41098645-41098798)
chr8 (101-332)||(19436648-19436883)
chr8 (101-332)||(19572797-19573032)
chr8 (101-332)||(32877851-32878088)
chr8 (179-403)||(12579545-12579762)
chr8 (142-332)||(32760203-32760385)
chr8 (142-332)||(43770791-43770974)
chr8 (101-332)||(45216306-45216543)
chr8 (150-394)||(28875590-28875827)
chr8 (143-332)||(25022603-25022784)
chr8 (142-332)||(36484272-36484454)
chr8 (142-396)||(32638237-32638484)
chr8 (142-394)||(37669417-37669661)
chr8 (142-402)||(5540270-5540522)
chr8 (143-332)||(42949518-42949699)
chr8 (142-332)||(4246777-4246956)
chr8 (101-332)||(19947463-19947697)
chr8 (142-332)||(34900457-34900639)
chr8 (142-332)||(22200908-22201088)
chr8 (101-287)||(6028886-6029079)
chr8 (104-216)||(32425200-32425315)
chr8 (99-200)||(38388948-38389047)
chr8 (251-332)||(38389102-38389181)
chr8 (251-332)||(41098547-41098628)
chr8 (256-394)||(16384993-16385129)
chr8 (256-332)||(13422576-13422651)
chr8 (276-332)||(2871589-2871644)
chr8 (105-168)||(29355905-29355968)
chr8 (296-332)||(27886637-27886673)
chr8 (296-332)||(27945295-27945331)
chr8 (296-332)||(27968552-27968588)
chr8 (296-332)||(28025538-28025574)
chr8 (101-143)||(12579818-12579859)
chr8 (31-61)||(24100202-24100232)
chr8 (101-143)||(28875847-28875888)
chr8 (101-143)||(32760150-32760191)
chr8 (101-143)||(36484219-36484260)
chr8 (267-332)||(32425330-32425393)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (101-332)||(21251745-21251975)
chr5 (101-402)||(3701347-3701647)
chr5 (101-332)||(3934413-3934644)
chr5 (101-293)||(26691900-26692092)
chr5 (101-293)||(26961632-26961824)
chr5 (101-330)||(1921043-1921272)
chr5 (101-311)||(26716534-26716743)
chr5 (101-311)||(26986274-26986483)
chr5 (101-332)||(11907574-11907798)
chr5 (101-332)||(25749867-25750097)
chr5 (101-332)||(1795654-1795883)
chr5 (105-308)||(6242659-6242861)
chr5 (101-332)||(27938420-27938650)
chr5 (101-332)||(42365728-42365963)
chr5 (117-332)||(39796571-39796785)
chr5 (101-294)||(30777052-30777245)
chr5 (99-332)||(43357387-43357618)
chr5 (101-332)||(30284204-30284442)
chr5 (115-332)||(9654025-9654242)
chr5 (101-332)||(7629307-7629537)
chr5 (101-395)||(27085632-27085925)
chr5 (101-328)||(22738120-22738339)
chr5 (134-332)||(18001583-18001780)
chr5 (135-331)||(34032667-34032858)
chr5 (157-332)||(41233634-41233808)
chr5 (101-332)||(14836593-14836814)
chr5 (170-332)||(9728011-9728176)
chr5 (151-332)||(39689816-39689990)
chr5 (160-332)||(5612078-5612249)
chr5 (190-332)||(35746021-35746162)
chr5 (142-332)||(30918994-30919176)
chr5 (101-332)||(10657241-10657478)
chr5 (105-225)||(15066478-15066598)
chr5 (142-394)||(1638818-1639058)
chr5 (142-387)||(5985510-5985746)
chr5 (142-332)||(9793146-9793325)
chr5 (99-244)||(5722258-5722403)
chr5 (104-247)||(17137945-17138086)
chr5 (150-320)||(26794099-26794262)
chr5 (251-332)||(5722430-5722510)
chr5 (256-332)||(41392335-41392410)
chr5 (270-394)||(32707204-32707327)
chr5 (101-175)||(9729397-9729471)
chr5 (256-332)||(7977603-7977678)
chr5 (192-256)||(11694466-11694530)
chr5 (291-393)||(30776861-30776963)
chr5 (260-313)||(32625253-32625305)
chr5 (101-143)||(39690011-39690052)
chr5 (279-332)||(15066593-15066646)
chr5 (101-139)||(5985762-5985800)
chr5 (350-402)||(33830638-33830692)
chr5 (362-402)||(32625337-32625378)
chr5 (101-138)||(33830557-33830593)
chr5 (101-141)||(26794284-26794323)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (101-332)||(25701046-25701275)
chr3 (101-308)||(21005991-21006198)
chr3 (101-308)||(52684610-52684816)
chr3 (101-332)||(45056905-45057136)
chr3 (101-312)||(19878729-19878937)
chr3 (101-332)||(29916053-29916283)
chr3 (101-332)||(29965206-29965436)
chr3 (101-402)||(7899256-7899554)
chr3 (101-331)||(22289351-22289578)
chr3 (119-332)||(25322122-25322334)
chr3 (140-331)||(38888702-38888893)
chr3 (101-402)||(28968794-28969092)
chr3 (101-328)||(28548307-28548531)
chr3 (101-313)||(48333223-48333432)
chr3 (101-323)||(47642289-47642509)
chr3 (134-332)||(212810-213007)
chr3 (107-332)||(2122976-2123204)
chr3 (101-308)||(2566900-2567104)
chr3 (101-313)||(48334166-48334377)
chr3 (142-402)||(42464155-42464409)
chr3 (101-384)||(19349174-19349461)
chr3 (111-332)||(47750537-47750758)
chr3 (99-332)||(19421697-19421925)
chr3 (126-332)||(983478-983683)
chr3 (101-255)||(20509837-20509991)
chr3 (101-332)||(22311126-22311361)
chr3 (104-332)||(39664679-39664909)
chr3 (173-332)||(45347907-45348065)
chr3 (109-332)||(13352807-13353022)
chr3 (101-332)||(28882166-28882401)
chr3 (160-332)||(21157365-21157536)
chr3 (101-332)||(35390146-35390377)
chr3 (142-402)||(52121612-52121864)
chr3 (169-332)||(13748126-13748287)
chr3 (142-332)||(45532149-45532331)
chr3 (190-332)||(41741772-41741913)
chr3 (142-332)||(22610363-22610545)
chr3 (172-332)||(30787195-30787350)
chr3 (142-332)||(48123674-48123857)
chr3 (143-332)||(50286833-50287015)
chr3 (101-332)||(52504909-52505145)
chr3 (142-313)||(25936183-25936347)
chr3 (142-332)||(1678770-1678949)
chr3 (150-320)||(10224257-10224420)
chr3 (131-332)||(33241166-33241364)
chr3 (142-332)||(28705590-28705769)
chr3 (144-393)||(1528881-1529113)
chr3 (256-392)||(40499339-40499475)
chr3 (267-332)||(20509729-20509793)
chr3 (289-402)||(2566717-2566830)
chr3 (256-332)||(7328169-7328244)
chr3 (256-392)||(37996328-37996463)
chr3 (99-149)||(42229923-42229973)
chr3 (256-332)||(53192853-53192927)
chr3 (101-147)||(30787350-30787396)
chr3 (101-143)||(7328021-7328062)
chr3 (101-149)||(50287020-50287068)
chr3 (31-61)||(6134391-6134421)
chr3 (101-143)||(22610557-22610598)
chr3 (101-143)||(25936359-25936400)
chr3 (142-188)||(37996513-37996559)
chr3 (271-304)||(14996053-14996086)
chr3 (101-138)||(52121558-52121595)
chr3 (101-141)||(10224442-10224481)
chr3 (101-160)||(45347558-45347615)
chr3 (296-332)||(52684899-52684935)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (101-332)||(31235792-31236021)
chr2 (101-332)||(1005773-1006003)
chr2 (101-318)||(14824400-14824616)
chr2 (123-332)||(35996814-35997022)
chr2 (104-402)||(34146466-34146764)
chr2 (101-332)||(44156859-44157088)
chr2 (101-331)||(28746288-28746518)
chr2 (104-393)||(4562053-4562341)
chr2 (106-332)||(3564106-3564330)
chr2 (101-282)||(4355573-4355754)
chr2 (101-330)||(24585796-24586028)
chr2 (121-330)||(40536498-40536706)
chr2 (101-332)||(5588299-5588529)
chr2 (101-332)||(40431643-40431879)
chr2 (101-394)||(35342600-35342891)
chr2 (104-332)||(2319561-2319786)
chr2 (135-324)||(10573799-10573988)
chr2 (101-332)||(3545187-3545416)
chr2 (101-277)||(45158835-45159011)
chr2 (117-332)||(12206264-12206483)
chr2 (101-332)||(20537122-20537359)
chr2 (101-332)||(8482540-8482774)
chr2 (190-332)||(14216861-14217003)
chr2 (142-402)||(6125021-6125272)
chr2 (142-332)||(4169608-4169790)
chr2 (111-330)||(9293655-9293877)
chr2 (142-394)||(6496697-6496941)
chr2 (151-402)||(22485126-22485370)
chr2 (142-398)||(40307858-40308106)
chr2 (101-332)||(5371358-5371593)
chr2 (101-289)||(18301378-18301564)
chr2 (142-402)||(7806876-7807125)
chr2 (101-332)||(12819598-12819836)
chr2 (162-332)||(21104817-21104983)
chr2 (256-394)||(22571364-22571501)
chr2 (257-394)||(7877080-7877216)
chr2 (256-332)||(16562174-16562249)
chr2 (274-331)||(4356303-4356359)
chr2 (101-143)||(4169802-4169843)
chr2 (101-143)||(22485064-22485105)
chr2 (101-143)||(40308118-40308159)
chr2 (101-138)||(21104766-21104803)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (101-332)||(47607362-47607592)
chr4 (99-332)||(42630083-42630315)
chr4 (101-332)||(31945854-31946083)
chr4 (104-332)||(1177241-1177469)
chr4 (111-332)||(30683286-30683507)
chr4 (104-308)||(24784658-24784862)
chr4 (104-308)||(24823404-24823608)
chr4 (101-332)||(51859056-51859286)
chr4 (101-308)||(52721637-52721843)
chr4 (101-402)||(3108841-3109140)
chr4 (99-332)||(40694329-40694561)
chr4 (101-323)||(24793346-24793566)
chr4 (101-332)||(44521650-44521881)
chr4 (101-332)||(2586599-2586827)
chr4 (101-294)||(39957971-39958164)
chr4 (104-332)||(51675053-51675278)
chr4 (104-313)||(17892534-17892741)
chr4 (101-322)||(36943952-36944177)
chr4 (105-331)||(258702-258923)
chr4 (116-313)||(7952757-7952953)
chr4 (142-402)||(14795857-14796110)
chr4 (101-332)||(36511557-36511790)
chr4 (101-330)||(49470559-49470780)
chr4 (99-402)||(41146399-41146706)
chr4 (105-402)||(14614769-14615055)
chr4 (101-261)||(55900823-55900983)
chr4 (142-332)||(52573035-52573218)
chr4 (101-332)||(5835226-5835461)
chr4 (99-394)||(5325042-5325342)
chr4 (143-332)||(43509524-43509705)
chr4 (101-332)||(28377293-28377530)
chr4 (142-332)||(8063183-8063365)
chr4 (142-331)||(3402663-3402842)
chr4 (223-332)||(10258433-10258542)
chr4 (207-332)||(46431566-46431690)
chr4 (206-393)||(53324587-53324767)
chr4 (105-197)||(37992295-37992387)
chr4 (257-332)||(19739064-19739139)
chr4 (260-332)||(42472255-42472327)
chr4 (270-394)||(52122242-52122365)
chr4 (260-332)||(31227451-31227522)
chr4 (101-393)||(38491804-38492083)
chr4 (142-208)||(53323189-53323255)
chr4 (135-200)||(46431682-46431747)
chr4 (291-395)||(52721920-52722024)
chr4 (142-222)||(31227190-31227270)
chr4 (101-143)||(3402854-3402895)
chr4 (101-143)||(31227137-31227178)
chr4 (101-143)||(52572982-52573023)
chr4 (350-402)||(52573670-52573724)
chr4 (101-143)||(53323136-53323177)
chr4 (283-332)||(18569154-18569202)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (105-332)||(32380686-32380911)
chr1 (101-332)||(10822655-10822885)
chr1 (101-332)||(9528471-9528701)
chr1 (101-332)||(9781903-9782135)
chr1 (101-294)||(24851753-24851946)
chr1 (105-330)||(29168212-29168436)
chr1 (101-327)||(34432047-34432272)
chr1 (104-332)||(37922478-37922705)
chr1 (104-387)||(29862061-29862346)
chr1 (101-402)||(36551667-36551965)
chr1 (101-326)||(14167330-14167554)
chr1 (101-332)||(34096179-34096410)
chr1 (111-285)||(32797462-32797636)
chr1 (151-332)||(28948294-28948468)
chr1 (142-392)||(5985024-5985266)
chr1 (101-402)||(43190040-43190349)
chr1 (171-332)||(33040711-33040869)
chr1 (135-294)||(3707936-3708099)
chr1 (101-262)||(24589798-24589958)
chr1 (142-394)||(25257454-25257694)
chr1 (142-332)||(3427694-3427877)
chr1 (191-332)||(15417920-15418061)
chr1 (153-394)||(28658426-28658660)
chr1 (143-332)||(37346443-37346623)
chr1 (101-294)||(13012520-13012711)
chr1 (101-331)||(31652903-31653137)
chr1 (101-332)||(14334554-14334789)
chr1 (144-330)||(30324559-30324737)
chr1 (142-332)||(6915950-6916132)
chr1 (142-332)||(38331287-38331469)
chr1 (101-200)||(47654947-47655046)
chr1 (142-332)||(8133020-8133199)
chr1 (101-332)||(10763914-10764126)
chr1 (142-332)||(52894789-52894971)
chr1 (142-332)||(37104488-37104667)
chr1 (113-196)||(15417689-15417772)
chr1 (209-393)||(38218733-38218915)
chr1 (101-183)||(41675743-41675825)
chr1 (257-332)||(38949098-38949172)
chr1 (270-332)||(1036947-1037008)
chr1 (270-332)||(1043853-1043914)
chr1 (257-394)||(20409136-20409273)
chr1 (142-332)||(36363153-36363324)
chr1 (101-155)||(38218664-38218718)
chr1 (204-262)||(47656063-47656121)
chr1 (137-189)||(2472682-2472734)
chr1 (251-305)||(47656142-47656195)
chr1 (258-332)||(4027452-4027523)
chr1 (257-304)||(2472636-2472683)
chr1 (101-143)||(28948489-28948530)
chr1 (134-178)||(33039916-33039960)
chr1 (286-332)||(24851969-24852015)
chr1 (101-143)||(25257401-25257442)
chr1 (101-143)||(28658684-28658725)
chr1 (101-143)||(36363336-36363377)
chr1 (142-188)||(36367402-36367448)
chr1 (101-143)||(36367460-36367501)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (99-332)||(27084233-27084464)
chr6 (101-332)||(19128414-19128645)
chr6 (104-308)||(32018382-32018585)
chr6 (104-332)||(13044986-13045213)
chr6 (101-332)||(7255204-7255431)
chr6 (120-332)||(3299339-3299550)
chr6 (104-332)||(11105573-11105799)
chr6 (101-393)||(13060919-13061209)
chr6 (101-294)||(3212852-3213045)
chr6 (101-332)||(234570-234806)
chr6 (101-258)||(10894196-10894354)
chr6 (105-258)||(6707718-6707871)
chr6 (149-402)||(8357737-8357982)
chr6 (101-332)||(13607381-13607613)
chr6 (105-258)||(26327582-26327735)
chr6 (142-402)||(7187796-7188047)
chr6 (101-331)||(22988749-22988961)
chr6 (101-331)||(23799435-23799647)
chr6 (143-332)||(32130146-32130327)
chr6 (173-332)||(4153168-4153325)
chr6 (142-332)||(1035902-1036084)
chr6 (251-402)||(26327754-26327904)
chr6 (256-394)||(31186979-31187117)
chr6 (251-331)||(6707612-6707691)
chr6 (223-332)||(31738255-31738357)
chr6 (101-231)||(31740394-31740537)
chr6 (291-332)||(3213134-3213175)
chr6 (142-210)||(31195551-31195619)
chr6 (30-61)||(6708050-6708081)
chr6 (101-143)||(7188059-7188100)
chr6 (101-143)||(31195631-31195672)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (142-402)||(43621-43874)
scaffold0005 (105-402)||(202321-202607)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (142-402)||(29661-29913)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (104-332)||(5930-6160)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (105-332)||(13664-13911)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (270-402)||(7453-7583)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (270-393)||(24923-25045)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (178-233)||(41276-41331)
scaffold0112 (101-141)||(41367-41406)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 99 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19820835 - 19820534
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19820835 gaatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataatactgatggtgctctttttgagatatattgtgcatgtaattgactaatcat 19820736  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19820735 cactattttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaagaaaaa 19820636  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgttcgtatcttgattttgaaatttttccatatcggtgca 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820635 tggttataattatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacg--tatctcagccgttcgtatcttgattttgaaatttttccatatcggtgca 19820539  T
Q  399 gtatt 403  Q
    |||||    
T  19820538 gtatt 19820534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 44270000 - 44270230
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44270000 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatatattgtttatgtaattgactaatcatca 44270099  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44270100 ctctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 44270198  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44270199 gttataattatattatatatttaattatataa 44270230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23078944 - 23078714
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078944 atcgatatagtatagcactaacaatgttcctttttgatatagtatagcactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgagtaatcatca 23078845  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23078844 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctatgagcctatgattggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 23078746  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23078745 gttataattatattgtacatttaattagataa 23078714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 36413627 - 36413858
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36413627 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatgatgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgattaagcatca 36413726  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36413727 ctcacttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatg 36413826  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  36413827 gttataattatattgttcatttaattacataa 36413858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15878259 - 15878030
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15878259 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 15878160  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15878159 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 15878062  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15878061 gg-tataattatattgtacatttatttatataa 15878030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44959168 - 44958942
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44959168 atatagtatagcactagcaatgttccttttggatatagtacaacactcatagtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 44959069  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44959068 cttaatcgtcaatattatttatgtttatatggatatgctacgagcctatgactgatttcttttgtctgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggtta 44958970  T
Q  305 taattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44958969 taattatattgtacatttaattatataa 44958942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 554747 - 554457
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  554747 atcgatatagtataacactaacaatgtatcttttagatatagtatatcacttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 554648  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  554647 ctctcttaatcgttaatattacttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgctttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 554549  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  554548 gttataattatattgtaca--taattatataattttttttattaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttcccgtatcgg 554457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Original strand, 48153803 - 48154026
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48153803 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 48153902  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48153903 ctctcttaatcgtcaccattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgact-gttttttttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 48154000  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaatt 326  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48154001 gttataattatattgtacattaaatt 48154026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36763630 - 36763398
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaa----caatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36763630 atcgatatagtataacactaattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctttttttg-gatatattgtgtatgtaattgactaatc 36763532  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36763531 atcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgatgtgctacgagcctataactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-a 36763433  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  36763432 aatggttat-attatattgtgcatttaattatataa 36763398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 21409648 - 21409946
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21409648 atcgatatagtatagcactaacaatatttcttttggatatagtatagcacttatgttgctctttttggaatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 21409747  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  21409748 ctctcttaatcgtcaatattatttacatttatgttgatgtgctatgagcctatgact-gtttcttttgtttgttaatatattttcatatgaaaa-aaatg 21409845  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgca 398  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  | |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21409846 gttataattatattgtatatttaattatataa-tttttttattaa--tgtatcccagctgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatcggtgca 21409942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36757851 - 36757619
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacact----aacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36757851 atcgatatagtataacactgattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatc 36757752  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36757751 atcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgatgtgctacgagcctataactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaa--a 36757654  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  36757653 aatggttat-attatattgtgcatttaattatataa 36757619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36767375 - 36767143
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacact----aacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36767375 atcgatatagtataacactgattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatc 36767276  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36767275 atcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgatgtgctacgagcctataactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaa--a 36767178  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  36767177 aatggttat-attatattgtgcatttaattatataa 36767143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9250146 - 9249953
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9250146 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 9250047  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250046 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 9249953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9283696 - 9283503
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9283696 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 9283597  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283596 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 9283503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 25969787 - 25969980
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25969787 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 25969886  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969887 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 25969980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 332
Target Start/End: Original strand, 21180133 - 21180329
Alignment:
Q  136 gatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21180133 gatatagtataacactgatgatgttctttttgggatatattgtatatctaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 21180232  T
Q  236 gatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21180233 gatgtgctacaagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttacatattaaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataa 21180329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 26973315 - 26973549
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggt----gctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    |  ||||||   ||||||||  ||||||||||| ||||     
T  26973315 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtacaacacttatggtataagtgcttttttttatatattggatatgtaattgagtaatt 26973414  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26973415 gtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-a 26973513  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26973514 aatggttataattatattgtacatttaattatataa 26973549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 35160142 - 35160375
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaa----caatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35160142 atcgatatagtatagcactaattaacaatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatc 35160241  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    |||||| |||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35160242 atcactctcttaattattaatgttatttatatttatgttgatgtgctacgagtctataactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-a 35160340  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||    
T  35160341 aatggttat-attatattgtgcatttaattgtataa 35160375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 332
Target Start/End: Original strand, 35136297 - 35136517
Alignment:
Q  111 tataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaat 210  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35136297 tatagcactaataatgttcattttgaatatattatagcattaatgatgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcattctcttaat 35136396  T
Q  211 cgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataatta 310  Q
     | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35136397 tgccaatattacttatatttatgttgatatgctacgagtctatgactggtttattgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattgttataatta 35136495  T
Q  311 tatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  35136496 tattgtacatttaattatataa 35136517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1400103 - 1399949
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1400103 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaataatca 1400004  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgac 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  1400003 ctatcttaatcgtcaatattatttatatttat-ttgatgtactacgagcctatgac 1399949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 262
Target Start/End: Original strand, 38064951 - 38065111
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38064951 atcgatataatataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcact-atggtgctctttttgggatatattgcgtatgtaattgactaatcatga 38065049  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggttt 262  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38065050 ctatcttaatcatcaatattgtttatatttatgttgatgtgcttcgagcctatgactggttt 38065111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 24956507 - 24956734
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactg-atggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24956507 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttgga---agtatagcactttatggtgctctctttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatc 24956603  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  24956604 actctattaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcatatgactgatttcttttgtttgctaatatatttgcatattaaa--aaat 24956701  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     ||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24956702 agttttaattatactgtacatttaattatataa 24956734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16564076 - 16563842
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  16564076 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattg 16563977  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||      ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16563976 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgaatcta------gtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 16563883  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16563882 taaa--aaaaggttataattatattatacatttagttatataa 16563842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 16601586 - 16601820
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  16601586 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattg 16601685  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||      ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16601686 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgaatcta------gtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 16601779  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16601780 taaa--aaaaggttataattatattatacatttagttatataa 16601820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 11830537 - 11830790
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11830537 gtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgaccaatgaccactatcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 11830635  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
     |||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  11830636 ttacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatgggtacaattatattgtacatttaattatataatttttttta 11830729  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11830730 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttaatttttgaaatttttccttatcggtgcagtat 11830790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 4291953 - 4292247
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  4291953 atcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaattg 4292052  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4292053 actaatcaccactctcttaatcgttaatagtatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 4292146  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcc 387  Q
    ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4292147 taaaaaaaat-gttataattatattatacatttaattatataa-tttttttattaacg--tatcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttccc 4292242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1042903 - 1042666
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata-------------gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  1042903 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 1042804  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||      || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1042803 tgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgcta------taag-ttagtttcttgtgtttgttaatatatttgcat 1042711  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1042710 attaaaaaaaaaggttataattatattatacatttaattatataa 1042666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47238020 - 47237836
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  47238020 gtatagcactggtggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcatcactttcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 47237921  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||||| |||     ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47237920 ctacgagcct----ttggtttcttatgtttgttaatatatttccatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttagttatata 47237836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27397387 - 27397205
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  27397387 gtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtg 27397289  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27397288 ctacga------gtctggtttcttgggtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 27397205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 332
Target Start/End: Original strand, 11058729 - 11058925
Alignment:
Q  136 gatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgtt 235  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11058729 gatataatgtaacactgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgacaaatcatcattctcttaatcgtcaatattacttatatttatgtt 11058828  T
Q  236 gatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg-gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11058829 gatgtgctaccagactatgactagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattagaa-aattgttttttaattatattgtatatttaattatataa 11058925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23969983 - 23969841
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23969983 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggataaattgtgtatgtaattgactaatcatca 23969884  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacga 247  Q
    || ||||||||||||  |    |||||||||||||||||||||||||    
T  23969883 ctctcttaatcgtcacta----ttatatttatgttgatgtgctacga 23969841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26773416 - 26773179
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-------------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  26773416 atcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 26773317  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||       |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26773316 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgaatcta------atttattgtgtttgttaatatatttgcat 26773223  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  26773222 attaaaa-aaaaggttataattatattatacatttagttatataa 26773179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 33454350 - 33454505
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33454350 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatca 33454449  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgac 256  Q
     | |||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  33454450 ttctcttaatcgtcggtataatttatatttatgttgatatgctacgagtctatgac 33454505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 19510908 - 19511099
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatg----gtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19510908 atcgatataatataacactagcaatgttccttttggatatagtataacattgatgtatggtgctcttttttgtatattttgagtatgtaattgactaatc 19511007  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||      | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19511008 accactctcttaattgtcaatattatttatatttttgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 19511099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 241
Target Start/End: Original strand, 40053573 - 40053689
Alignment:
Q  125 tgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattattt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  40053573 tgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgaggtatattgcatatgtaattgactaatcatcactctcttagtcatcaatattattt 40053672  T
Q  225 atatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  40053673 atatttatgttgatgtg 40053689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 39521412 - 39521595
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39521412 gtataacagtgatgatgctcttttttgtatatattgcgtatgtaattgattaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 39521511  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39521512 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattcaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 39521595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Original strand, 8029146 - 8029389
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8029146 gtataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaagtgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 8029245  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||        |    
T  8029246 ctacga------gtctagtttcttgtgttcgttaatatatttgcatattaaa--aaagtgttataattatattataca-ttaattatataatttttttta 8029336  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8029337 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttcccatatcgg 8029389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 36661313 - 36661489
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||      |||||    
T  36661313 gtatagcactgatggtgctctttttggtatatattacgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt------atgtg 36661406  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36661407 ctacga------gcctggtttcttgt-tttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 36661489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 16851152 - 16851401
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  16851152 gtataatactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattatctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 16851247  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |    
T  16851248 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatataatacatttaattatataatttttttta 16851340  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16851341 ttaacg--tatcacagccgtatcgtatcttaatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 16851401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 40096507 - 40096689
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  40096507 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 40096602  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40096603 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 40096689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 402
Target Start/End: Original strand, 33454535 - 33454686
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtat 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||  |    
T  33454535 tatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggttataattatattgcacatttaattatataaattattttattaacg--t 33454632  T
Q  351 atcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33454633 atcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatcgatgctgtat 33454686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47719948 - 47719856
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgtt 235  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47719948 tatatcaccgatggtgctctttttggtatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 47719856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26843735 - 26843659
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26843735 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaaaaaatggttataattatatagtacatttaattatataa 26843659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 394
Target Start/End: Original strand, 42897347 - 42897483
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||    
T  42897347 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataattttttttattaacg--tatccca 42897443  T
Q  357 gccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42897444 gccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 42897483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 400
Target Start/End: Original strand, 34238519 - 34238663
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa-nnnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||  |||| |    
T  34238519 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaaaaaatggtcataattatatagtacatttaattatataattttttttcattaacg--tatccc 34238616  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34238617 agccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagt 34238663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34122304 - 34122229
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34122304 ctggtttcatgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaattgttataattatatagtacatttaattatataa 34122229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 48163777 - 48164017
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||        | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  48163777 gtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 48163864  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||        |    
T  48163865 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatgattataattttataatacatttaattatataatttttttta 48163957  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    |||||||||    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48163958 ttaacgtat---ccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 48164017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47719829 - 47719760
Alignment:
Q  218 attatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47719829 attatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttgatatatttgcat 47719760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 27354290 - 27354531
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||        | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  27354290 gtataacactgctggtgctctttttgatatatgttgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 27354377  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||        |    
T  27354378 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaagatacttacataataaaa-aaatgattataattatataatacatttaattatataatttttttta 27354470  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27354471 ttaacg--tatcccagccgtattgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgatgcagtat 27354531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27555168 - 27554944
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt-------------ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  27555168 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaat 27555070  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |        | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||||||||||| |||      | |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  27555069 t--------accactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtgctacgagcct------gctttcttgtgtttgctaatatacttgcat 27554988  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27554987 aataaaa-aaatgattataattatataatacatttaattatataa 27554944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 332
Target Start/End: Original strand, 38065138 - 38065204
Alignment:
Q  267 tgtttgttaatatatttgcatatt-aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38065138 tgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaaattgttaaaattatattgtacattaaattatataa 38065204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9249864 - 9249762
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcca 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  9249864 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccg 9249767  T
Q  389 tatcg 393  Q
    |||||    
T  9249766 tatcg 9249762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9283414 - 9283312
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcca 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  9283414 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccg 9283317  T
Q  389 tatcg 393  Q
    |||||    
T  9283316 tatcg 9283312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Original strand, 25970069 - 25970171
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcca 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  25970069 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccg 25970166  T
Q  389 tatcg 393  Q
    |||||    
T  25970167 tatcg 25970171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19820903 - 19820873
Alignment:
Q  31 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820903 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 19820873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Original strand, 21179912 - 21179942
Alignment:
Q  31 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21179912 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 21179942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Original strand, 23311798 - 23311828
Alignment:
Q  31 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23311798 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 23311828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 36661260 - 36661301
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36661260 atcgataaagtataacactaacaa-gttccttttggatatagt 36661301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 48163724 - 48163765
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48163724 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 48163765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47718821 - 47718780
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47718821 aaaaaaaatagttataattatattgtacatttaattatataa 47718780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Original strand, 11830484 - 11830523
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11830484 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 11830523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 20182650 - 20182880
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20182650 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatatattgtttatgtaattgactaatcatca 20182749  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20182750 ctctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 20182848  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  20182849 gttataattatattatatatttaattatataa 20182880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 3892228 - 3892454
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3892228 gatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcgctc 3892327  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3892328 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttattttgttatttaatatatttgcatattaaa--aaatggtt 3892425  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3892426 ataattatattgtacatttaattatataa 3892454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27109030 - 27108802
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27109030 atcgatatagtataacactaacaattttccttttggatatagtatagcacttattgtgctctttttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatca 27108931  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||   | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27108930 ctctcttaattgtcaatattatttatagttatgttgatgtgttacgagcctatgatcaggttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 27108832  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27108831 gttataattatattgtacatttaattatat 27108802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 40412826 - 40413019
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40412826 atcgatatagtatagcactaacaatgttctctttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 40412925  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40412926 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 40413019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5818181 - 5817889
Alignment:
Q  108 tagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacact-gatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatct 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  5818181 tagtatagcactaacaatgttccttttgaatatagtatagcatttgatggtgctcttttgg-gatatattgtgtatgtagttgactaatcatcactttct 5818083  T
Q  207 taatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttata 306  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5818082 taatggacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatggttata 5817985  T
Q  307 attatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtatt 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5817984 attatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttcccgtatcggtgcagtatt 5817889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 27968375 - 27968550
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27968375 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 27968474  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaa 276  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| | ||||||||||    
T  27968475 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagtctatgaccgatttcttttgtttgttaa 27968550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Original strand, 32867 - 33096
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttga---gatatattgtgtatgtaattgactaatcatcac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32867 atatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgttttttttttttggatatattgtatatgtaattgactaatcgtcac 32966  T
Q  202 tatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatgg 301  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  32967 tctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcatatgactggtttcttttatttgttaatatgtttgcatattcaaa-aaatgg 33065  T
Q  302 ttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33066 ttataattatattgtacatttaattatataa 33096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8170941 - 8170735
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8170941 atcgatatagtatagcactaccaatgttctttttggatattgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 8170842  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8170841 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttacgttgatatgctacaagcccatgactggtttcttgtgtttggtaatatatttgcatattaaaa-aaatg 8170743  T
Q  301 gttataat 308  Q
    ||||||||    
T  8170742 gttataat 8170735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 27886460 - 27886635
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27886460 atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggctctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 27886559  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaa 276  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27886560 ctctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgaccggtttcttttgtttgttaa 27886635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 27945118 - 27945293
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27945118 atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggctctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 27945217  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaa 276  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27945218 ctctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgaccggtttcttttgtttgttaa 27945293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 28025361 - 28025536
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025361 atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggctctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 28025460  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaa 276  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  28025461 ctctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgaccggtttcttttgtttgttaa 28025536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Original strand, 28737781 - 28738008
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28737781 atcgatataatataccattaataatgtttcttttggatatagtatagcacttattgtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 28737880  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  28737881 ctcttttaatcgtcaatgttatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactagattcttttatttgttaatatattttcatattaaa--aaatg 28737978  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28737979 gttataattatattgtaca-ttaattatata 28738008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 7411885 - 7412114
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  7411885 atcgatatagtataacactaacaatgtttattttagatataatatagcattgatggtgctatttttgggatatattgtttatgcaattgactaatcacca 7411984  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7411985 ctctcttaatcgtcaatattatttacatttatgtttatgtgctacgagcctatgattggttt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 7412082  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7412083 gg-tataattatattgtacatttatatatataa 7412114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 37372542 - 37372738
Alignment:
Q  130 cttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37372542 cttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatt 37372641  T
Q  230 tatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattata 329  Q
    |||||||||||     |  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  37372642 tatgttgatgt-----gtccctatgactggtttcttttgtttgttaatacatttgtatattaaaa-aaatggttttaattatactgtacatttaattata 37372735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41098798 - 41098645
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41098798 atatagtataacattaacaatgtacattttagatatagtataacactaattgtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 41098699  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactg 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41098698 cttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgtgctacgagcctatgactg 41098645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 19436648 - 19436883
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataaca-----------ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  19436648 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttggtatattttgcgtatgtaattg 19436747  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19436748 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 19436841  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19436842 taaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 19436883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 19572797 - 19573032
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataaca-----------ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  19572797 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttggtatattttgcgtatgtaattg 19572896  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19572897 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 19572990  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19572991 taaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 19573032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 32877851 - 32878088
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtat-------------aacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  32877851 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcgttgatgtataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 32877950  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32877951 tgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctaatttcttgtgtttgttaatatatttgcat 32878044  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32878045 attaaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 32878088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12579762 - 12579545
Alignment:
Q  179 gtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaata 278  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||      | |||||||| ||||||||||||||    
T  12579762 gtatgtaattgactaatgaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatatgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaata 12579669  T
Q  279 tatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-tttt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12579668 tatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgattttt 12579572  T
Q  377 gaaatttttccatatcggtgcagtatt 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12579571 gaaatttttccgtatcggtgcagtatt 12579545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 32760203 - 32760385
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32760203 gtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 32760301  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32760302 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 32760385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43770974 - 43770791
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43770974 gtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 43770875  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43770874 ctacga------gtctggtttcttgtgattgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtaaatttaattatataa 43770791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45216543 - 45216306
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt-------------ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  45216543 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtatagcaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaat 45216445  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  45216444 tgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgttacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcat 45216351  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45216350 attaaaaaaaatggttacaattatattgtacatttaattatataa 45216306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28875827 - 28875590
Alignment:
Q  150 ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaac 249  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  28875827 ctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga-- 28875730  T
Q  250 ctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgta 349  Q
        | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||      
T  28875729 ----gcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaaa-aaatagttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg-- 28875637  T
Q  350 tatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28875636 tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 28875590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 25022603 - 25022784
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25022603 tataacactgatggtgctctttttggtatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 25022702  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25022703 tacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 25022784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 36484272 - 36484454
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36484272 gtataacactgatagtgctcttttt-atatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 36484370  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36484371 ctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 36484454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32638484 - 32638237
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||    
T  32638484 gtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaacatg 32638385  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||      | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  32638384 ctac------aagtctggtttcttgtgtttgttaatatattttcatattaaaag-aatgattataattatattgtacatttaattatataatttttttta 32638292  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtg 396  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32638291 ttaacg--tatctcaaccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtg 32638237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Original strand, 37669417 - 37669661
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  37669417 gtataatactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgta 37669515  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
     ||||| |||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  37669516 gtacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 37669608  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37669609 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 37669661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 5540270 - 5540522
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5540270 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaataaactaatgaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 5540369  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  5540370 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaaa-caatagttacaattatattgtacatttaattatataa-ttttttta 5540461  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5540462 ttaacg--tatcccagtcgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 5540522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 42949518 - 42949699
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  42949518 tataacaccgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgtgc 42949617  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||      | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42949618 tacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttacatattaaa--aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 42949699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 4246777 - 4246956
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  4246777 gtataacaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 4246872  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4246873 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 4246956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19947697 - 19947463
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgat-----------ggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||           |||||||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  19947697 atcgatatagtataacattaacaatgtttcttttgggtatagtataacattgatataacactggtggtgctctttttggtatgttttgcgtatgtaattg 19947598  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||      | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19947597 actaatcaccactgtgttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctac------aagtctagtttcttgtgtttgctaatatatttgcatat 19947504  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19947503 taaa--aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 19947463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34900639 - 34900457
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  34900639 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 34900544  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34900543 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 34900457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22201088 - 22200908
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  22201088 gtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 22200993  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22200992 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatatttgcataataaaaaaaatggttataattatataatacatttaattatataa 22200908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 287
Target Start/End: Original strand, 6028886 - 6029079
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtat-------------aacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| | |||||||||||   |||| ||| |||||||||    
T  6028886 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttttgtatattttgcgtatgtaat 6028985  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6028986 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctgcga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcat 6029079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Original strand, 32425200 - 32425315
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaat---gttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32425200 gatatagtataacactaacaataatgttctttttgaatatagtataacattgatgatgctattttggggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 32425299  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaa 216  Q
    || |||||||||||||    
T  32425300 ctctcttaatcgtcaa 32425315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 38388948 - 38389047
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38388948 gaatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggataaaatatagcactcatgatgctc--tttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcat 38389045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Original strand, 38389102 - 38389181
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38389102 tatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatgg-tataattatattgtacatttaattatataa 38389181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41098628 - 41098547
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41098628 tatgactggtttcttttgtttgctaatatatcttcatattaaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataa 41098547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 394
Target Start/End: Original strand, 16384993 - 16385129
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| |    
T  16384993 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttat-attatataatacatttaattatataattttttttattaacg--tatccc 16385088  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16385089 agccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 16385129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 13422576 - 13422651
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13422576 ctggtttcttgtgtttgttaataaacttgcatattaaaa-aaatggttataattataaagtacatttaattatataa 13422651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2871644 - 2871589
Alignment:
Q  276 atatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2871644 atatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 2871589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Original strand, 29355905 - 29355968
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  29355905 atatagtataacactaacaatgtttcttttgaatatagtatagcactcatggtgctatttttga 29355968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 27886637 - 27886673
Alignment:
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27886637 aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 27886673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 27945295 - 27945331
Alignment:
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27945295 aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 27945331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 27968552 - 27968588
Alignment:
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27968552 aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 27968588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 28025538 - 28025574
Alignment:
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28025538 aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 28025574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12579859 - 12579818
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12579859 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 12579818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24100232 - 24100202
Alignment:
Q  31 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100232 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 24100202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28875888 - 28875847
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28875888 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 28875847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 32760150 - 32760191
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32760150 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 32760191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 36484219 - 36484260
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36484219 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 36484260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 332
Target Start/End: Original strand, 32425330 - 32425393
Alignment:
Q  267 tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||    
T  32425330 tgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaatgg-tataattatattgtaaatttatatatataa 32425393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 21251745 - 21251975
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251745 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgcgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 21251844  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21251845 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctttgactggtttcttgtgtttattaatatatttgcatattaaaa-aaatg 21251943  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21251944 gttataattatattgtacatttacttatataa 21251975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 3701347 - 3701647
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3701347 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctctttttg-gatatattgtgcatgtaattgactaatcatca 3701445  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatatt-aaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3701446 ctctcttaatcgtcaatattttttatatttatgttgatgcgctacgagcctataactgatttcttatgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaaat 3701545  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgc 397  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3701546 agttataattatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacgtat-tc-cagctgtatcgtatcttgagttttgaaatttttccatatcagtgc 3701642  T
Q  398 agtat 402  Q
    |||||    
T  3701643 agtat 3701647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3934644 - 3934413
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3934644 atcgatataatataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgatctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 3934545  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  3934544 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatataaaaaaaaata 3934445  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  3934444 gttatgattatattatatatttaattatataa 3934413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 293
Target Start/End: Original strand, 26691900 - 26692092
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26691900 atcgatagagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 26691999  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaa 293  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26692000 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtggtacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgcatattaaa 26692092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 293
Target Start/End: Original strand, 26961632 - 26961824
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26961632 atcgatagagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 26961731  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaa 293  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26961732 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtggtacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgcatattaaa 26961824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 1921043 - 1921272
Alignment:
Q  101 atcgatatagtat-aacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  1921043 atcgatataatattaacactaacaatgatccttttggatatagtatatcactgatgatgctctttttgggatatattttgcatgtaatatactaatcatc 1921142  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1921143 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaat 1921241  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  1921242 ggttataattatattgtaccattaattatat 1921272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 26716534 - 26716743
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26716534 atcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 26716633  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26716634 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 26716732  T
Q  301 gttataattat 311  Q
    |||||||||||    
T  26716733 gttataattat 26716743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 26986274 - 26986483
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986274 atcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 26986373  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26986374 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 26986472  T
Q  301 gttataattat 311  Q
    |||||||||||    
T  26986473 gttataattat 26986483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 11907574 - 11907798
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11907574 atcgatatattataacaccaacaatgtaccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 11907673  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11907674 ctctcttaatcgtcaatat------tatttatgttgatgtgctacgagcctacgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgaatattaaaa-aaatg 11907766  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11907767 gttataattatattgtacatttaattatataa 11907798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 25749867 - 25750097
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25749867 atcgatgtaatatagcactaacaatgttcattttggatatagtgtagcacttatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 25749966  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25749967 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 25750065  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  25750066 gttataattatattgtacattaaattttataa 25750097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 1795654 - 1795883
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttttt-gagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1795654 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgcttttttttgggatatattgtatatgtaattgactaatcgtc 1795753  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  1795754 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatgtttgca-attaaa--aaat 1795850  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1795851 ggttataattatattgtatatttaattatataa 1795883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6242861 - 6242659
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6242861 atatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctttttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 6242762  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6242761 cttaatcgtcaatattatttatattaatgttgatgtgctatgagtctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggtta 6242663  T
Q  305 taat 308  Q
    ||||    
T  6242662 taat 6242659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 27938420 - 27938650
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27938420 atcgatatagtgtagcactaacagtgttccttttggatatagtatagcacgtatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaattatca 27938519  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27938520 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 27938618  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27938619 gttataattatattgtacattaaattttataa 27938650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42365963 - 42365728
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataa-----cactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaat 195  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  42365963 atcgatatagtatataactaagaatcttccttttggatatagtataatattacactcatggtgctctttttgggatatattgtgcatctaattgactaat 42365864  T
Q  196 catcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaag 295  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42365863 catcactctgttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattttcatattaaaa- 42365765  T
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42365764 aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 42365728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 117 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39796785 - 39796571
Alignment:
Q  117 actaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaa 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39796785 actaacaatgttccttttagatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaa 39796686  T
Q  217 cattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgt 316  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  39796685 tattacttatatttatgttgatatgatacgcacatatgagtggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattattataattatattgt 39796587  T
Q  317 acatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| ||||||    
T  39796586 acatttaatcatataa 39796571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30777245 - 30777052
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30777245 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 30777146  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777145 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 30777052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43357618 - 43357387
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttttt-gagatatattgtgtatgtaattgactaatca 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||     
T  43357618 gaatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagtacttatggtgcttttttttgggatatattatgtatgtaattgac--atcg 43357521  T
Q  198 tcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  43357520 tcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatgtttacatattaaaa-aa 43357422  T
Q  298 atggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43357421 atggttataattatattgtacatttaattatataa 43357387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30284442 - 30284204
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttga-------gatatattgtgtatgtaattgacta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||         |||||||||||| | ||||||||||    
T  30284442 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtatagcactaatggtgttttttttttttttgtggatatattgtgtttctaattgacta 30284343  T
Q  194 atcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaa 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30284342 atcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctaggagcctatgaccggtttcttttgcttgttaatatatttgcatattaaa 30284243  T
Q  294 agaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30284242 aaaaatggttataactatattgtacatttaattatataa 30284204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 115 - 332
Target Start/End: Original strand, 9654025 - 9654242
Alignment:
Q  115 acactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtc 214  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||     
T  9654025 acactaacaatattccttatggatatattataacatcaatggtgctctttttgtgatatattgtgtatgcaattgactaatcatcattttcttaattgtt 9654124  T
Q  215 aacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatc 314  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  9654125 aatattacttatatttatgttgatatgccacaagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaattgctataattatatt 9654224  T
Q  315 gtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9654225 gtacatttaattatataa 9654242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 7629307 - 7629537
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7629307 atcgatatagtatagcactaacaatgtatcttttggatatagtatagcactaatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtcattgactaatcatca 7629406  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7629407 ctctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgaatgatttcttttgttagttaatatattttcatattaaaa-aaatg 7629505  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     ||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  7629506 attatagttatactgcacatttaattatataa 7629537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 395
Target Start/End: Original strand, 27085632 - 27085925
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27085632 atcgatataatatagcactaacaatgttcattttgaatatagtatagcactcgtggtgctctttttg-gatatattgtgtatgtaattgactaattatca 27085730  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttata----tttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | | |    
T  27085731 ctttcttaatcatcaatattatttataattatttatgttgatgtgctacgagcctattactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatat--acaaa 27085828  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27085829 aatggttataattatattgtatatttaattatataa--ttttttattaacg--tatcccagtcgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatcgg 27085924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 328
Target Start/End: Original strand, 22738120 - 22738339
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaa---tca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  22738120 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacatt---------ctttttgggatatattgtgtatgtaactgactaaatatca 22738210  T
Q  198 tcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaa 297  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22738211 tcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactagtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaa--aa 22738308  T
Q  298 atggttataattatatcgtacatttaattat 328  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22738309 atagttataattatattgtacatttaattat 22738339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18001780 - 18001583
Alignment:
Q  134 tggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatg 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  18001780 tggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattggatatgtaattgattaatcatcactctcttacttgtcaatattatttatatttatg 18001681  T
Q  234 ttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18001680 ttgatgggctacaagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttacatattaaaa-taatggttataataatattgtacatttaattatataa 18001583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 331
Target Start/End: Original strand, 34032667 - 34032858
Alignment:
Q  135 ggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgt 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||| |    
T  34032667 ggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaata----ttatatttatat 34032762  T
Q  235 tgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34032763 tgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaaagattataattatattgtacatttaattatata 34032858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 332
Target Start/End: Original strand, 41233634 - 41233808
Alignment:
Q  157 tgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgac 256  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41233634 tgctctttttggtatatatcgtatatgtaattgactaatcatcacgctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgac 41233733  T
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41233734 tggtttcttttgtttgttaatatatttacatattaaaa-aaatagttataattatattgtacatttaattatataa 41233808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 14836593 - 14836814
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttt-ttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14836593 atcgatatagtatatcactaacaaagtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttattgagatatattttgtatgtaattgactaatcgtc 14836692  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||  | |||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  14836693 actctcttaaccgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcc---------tttattttgtttgtta--atgtttgcatattaaaaaaaat 14836781  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14836782 ggttataattatattgtacatttaataatataa 14836814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9728176 - 9728011
Alignment:
Q  170 atatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9728176 atatattgtgtacgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactgatttcttgtgt 9728077  T
Q  270 ttgttaatatatttgcatatt---aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9728076 ttgttaatatatttccatattaaaaaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataa 9728011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39689990 - 39689816
Alignment:
Q  151 tgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacc 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||       
T  39689990 tgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga--- 39689894  T
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
       | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39689893 ---gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 39689816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5612249 - 5612078
Alignment:
Q  160 tctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactgg 259  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  5612249 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgtgctaagagcatatgactgg 5612150  T
Q  260 tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5612149 tttcttttacttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatgaatataattatattgtacatttaattatataa 5612078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35746162 - 35746021
Alignment:
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35746162 actaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatat 35746063  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35746062 taaaa-aaatggttataattatattgtacattttattatataa 35746021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 30918994 - 30919176
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30918994 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 30919093  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30919094 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 30919176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 10657241 - 10657478
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-------------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  10657241 atcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 10657340  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||       |||  |||||||||||||||||||||||    
T  10657341 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtgctacgaatcta------atttattgtgtttgttaatatatttgcat 10657434  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10657435 attaaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 10657478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 15066478 - 15066598
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15066478 atatagtataacactaacaatgttcctttcggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcattactct 15066577  T
Q  205 cttaatcgtcaacattattta 225  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  15066578 cttaatcgtcaatattattta 15066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1639058 - 1638818
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1639058 gtatatcactgacggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccact--cttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 1638962  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  1638961 ctacga------gcctggtttcttgtgtttattaatatatttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatataa-ttttttta 1638871  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1638870 ttaacg--tatcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 1638818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5985746 - 5985510
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5985746 gtataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 5985647  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||        |    
T  5985646 ctacga------gtctagttttttgtgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaaaggttataattatattatacatttaattatataatttttttta 5985555  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttgattttgaaatttttcc 387  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5985554 ttaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttaaaattttcc 5985510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 9793146 - 9793325
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  9793146 gtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 9793241  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9793242 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 9793325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 5722258 - 5722403
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5722258 gaatcgatataggataacactaacaatgtttattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcat 5722357  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgcta 244  Q
    || | ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  5722358 cattctcttaatcgtcagtataatttatatttatgttggtgtgcta 5722403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17138086 - 17137945
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  17138086 gatataatatagcactaacaatgttccttttgcatataatatagcattgatggtgctcttttgg-gatatattgtgtatatatttgactaatcatcactc 17137988  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacga 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17137987 tcttaatcgtcaatattatttata-ttatgttgatgtgctacga 17137945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26794262 - 26794099
Alignment:
Q  150 ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaac 249  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26794262 ctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga-- 26794165  T
Q  250 ctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacat 320  Q
        | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26794164 ----gcctggtttcttgtgtttgttaatatcgttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacat 26794099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Original strand, 5722430 - 5722510
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5722430 tatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 5722510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41392410 - 41392335
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41392410 ctggtttcatgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaattgttataattatatagtacatttaattatataa 41392335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32707327 - 32707204
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  32707327 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattgtataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatc 32707231  T
Q  369 ttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32707230 ttgatttttgaaatttttccgtatcgg 32707204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9729471 - 9729397
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatat 175  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9729471 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatactgcgacactgatggtgctctttttgagatatat 9729397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 7977603 - 7977678
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7977603 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aattggttataattatataatacatttaattatataa 7977678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 11694466 - 11694530
Alignment:
Q  192 taatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgac 256  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11694466 taatcatcactctcttaatcgtgaatattatttatacttatgttgatgtgctacgagcctatgac 11694530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30776963 - 30776861
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcca 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  30776963 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccg 30776866  T
Q  389 tatcg 393  Q
    |||||    
T  30776865 tatcg 30776861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Original strand, 32625253 - 32625305
Alignment:
Q  260 tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatat 313  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32625253 tttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatat 32625305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39690052 - 39690011
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39690052 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagt 39690011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Original strand, 15066593 - 15066646
Alignment:
Q  279 tatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15066593 tatttacatattaaaaaaaatggttataattatagtatacatttaattatataa 15066646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5985800 - 5985762
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggata 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5985800 atcgatatagtatagcactagcaatgttccttttggata 5985762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Original strand, 33830638 - 33830692
Alignment:
Q  350 tatcacagccgt-tcgtatcttgatttt-gaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33830638 tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 33830692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 402
Target Start/End: Original strand, 32625337 - 32625378
Alignment:
Q  362 tcgtatcttgatttt-gaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32625337 tcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 32625378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Original strand, 33830557 - 33830593
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33830557 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggat 33830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26794323 - 26794284
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26794323 atcgatttagtataacactaacaa-gttccttttggatata 26794284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 25701046 - 25701275
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25701046 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgacggtgctctttttgggatatattgtgtttgtaattgactaatcatca 25701145  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  25701146 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtcctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttacatattaaa--aaatg 25701243  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  25701244 gttataattatattgtacatttgatgatataa 25701275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21006198 - 21005991
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21006198 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 21006099  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21006098 ctctcttaatcgtcaatattatttatattcatgttgatgtgctacgaacctgtgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatg 21005999  T
Q  301 gttataat 308  Q
    ||||||||    
T  21005998 gttataat 21005991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 308
Target Start/End: Original strand, 52684610 - 52684816
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52684610 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 52684709  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52684710 ctcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 52684808  T
Q  301 gttataat 308  Q
    ||||||||    
T  52684809 gttataat 52684816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45057136 - 45056905
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45057136 atcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttgtatatagtatagcactgctggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 45057037  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45057036 ctctcttaattgttgatattatttatatttatgttgatgcgctacgagcctaagactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatg 45056937  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  45056936 gttataatcatattttacatttaattatataa 45056905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 101 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19878937 - 19878729
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19878937 atcgatataatatatcactaacaatattccttttggatatattatagcactggtggtgctctttttg-gatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 19878839  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19878838 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacttatgactggtttcttttgtttattaatatatttgcatattaaa--aaatg 19878741  T
Q  301 gttataattata 312  Q
    ||||||||||||    
T  19878740 gttataattata 19878729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 29916053 - 29916283
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaat-catc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  29916053 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgtttatgtaatcgactaatccatc 29916152  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  29916153 actctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcattttaaa--aaat 29916250  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29916251 gattatacttatattgtacatttaattatataa 29916283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 29965206 - 29965436
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaat-catc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  29965206 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgtttatgtaatcgactaatccatc 29965305  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  29965306 actctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcattttaaa--aaat 29965403  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29965404 gattatacttatattgtacatttaattatataa 29965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7899554 - 7899256
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7899554 atcgatatagtatagcactagcaatgtttcttttggatgtagtataacactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 7899455  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7899454 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgactggttt-atgttgttttttaatatattttcatattaaaa-aaat 7899357  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgc 397  Q
    || ||||| ||||| |||||||||  |||||||        |||||||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7899356 gg-tataagtatattgtacatttatatatataa-tttttatattaacg--tatcctagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgc 7899261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22289578 - 22289351
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  22289578 atcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtt-tttttgggatatattcggtatgtaattgaataatcatca 22289480  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22289479 ctctattaatcgtcaatattatttatatttacgttgatgtactacgagcctatgaatggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatg 22289382  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22289381 gttataattatattatacatttaattatata 22289351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25322334 - 25322122
Alignment:
Q  119 taacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaaca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25322334 taacaatgttccttttggatatagtataacattgatagtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaata 25322235  T
Q  219 ttatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtac 318  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  25322234 ttacttatatttatgtagatatgctatgagcctgtgattggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattgttataattatattatac 25322136  T
Q  319 atttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||    
T  25322135 atttaattatataa 25322122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 140 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38888893 - 38888702
Alignment:
Q  140 tagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatg 239  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38888893 tagtataacattgatgatgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactgtcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatg 38888794  T
Q  240 tgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||||| | || ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  38888793 tgctacaagcccatgactgatttcttttgtttgttaatgtatttgcatattaaaaaaaatggttataattatatttgacatttaattatata 38888702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 28968794 - 28969092
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28968794 atcgatataatataacactaacaatgttcattttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggttaataatca 28968893  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  28968894 ctctattaattgtcaatattatttatatttatattgatgtgctacgagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaa--aaat 28968990  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgc 397  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  28968991 gg-tataattatattgtacatttatatatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgatgc 28969087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 328
Target Start/End: Original strand, 28548307 - 28548531
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28548307 atcgatatagcatagcactaacaatgttctttttgaatatagcatatcactgatgttgctctttttgagttatagtgtatatgtaattgactaattatca 28548406  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||    
T  28548407 ctctcttaatcggtaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactagtttcttatgtttgttaatatatttgcatat---aaaaaatg 28548503  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattat 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28548504 gttataattatattgtacatttaattat 28548531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 313
Target Start/End: Original strand, 48333223 - 48333432
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| | | |||    
T  48333223 atcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataacactgatggtgttcttttcgggatatattgtgtatgtagttgactgaccgtca 48333322  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48333323 ctctcttaattgtcaatattatatatatttatgttgatgtgctacgagcctatgact-gtttcttgtgtttg-taatatatttgcatattaaaa-aaatg 48333419  T
Q  301 gttataattatat 313  Q
    |||||||||||||    
T  48333420 gttataattatat 48333432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 323
Target Start/End: Original strand, 47642289 - 47642509
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47642289 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgtgatatattgtgtatgtaattggctaataatca 47642388  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47642389 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttgcgagtctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 47642486  T
Q  300 ggttataattatatcgtacattta 323  Q
    || ||||||||||| | |||||||    
T  47642487 gg-tataattatattgaacattta 47642509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 332
Target Start/End: Original strand, 212810 - 213007
Alignment:
Q  134 tggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatg 233  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  212810 tggatatagtatagcactcatgttgctctttttgagatatattatgtatgtaattgactaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttacg 212909  T
Q  234 ttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  212910 ttgatgtggtacgagcctatgactaatttcttttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 213007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 332
Target Start/End: Original strand, 2122976 - 2123204
Alignment:
Q  107 atagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatct 206  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||    
T  2122976 atagtataagactaacaatctttcttttggatataatataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgaaagtaattgactaatcatcacccact 2123075  T
Q  207 taatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaag---aaatggtt 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  2123076 taatcgtcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcttatgatttgtttcttttgtttgttaatatttttgcatattaaaagaaaaaatggtt 2123175  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2123176 ataattatattgtacatttaattatataa 2123204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2567104 - 2566900
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2567104 atcgatatagtataacacatacaatgttctttttggatatagcatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 2567005  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2567004 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctaggagcttgtgact-atttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatg 2566908  T
Q  301 gttataat 308  Q
    ||||||||    
T  2566907 gttataat 2566900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 313
Target Start/End: Original strand, 48334166 - 48334377
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||  |||||| | | | |    
T  48334166 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacacggatggtgttcttttcgggatatattgtgcatgtcgttgactgaccgtta 48334265  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48334266 ccctcttaatcgtcaatattatatatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttgtgtttg-taatatatttgcatattaaaaaaaatg 48334364  T
Q  301 gttataattatat 313  Q
     ||||||||||||    
T  48334365 tttataattatat 48334377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 42464409 - 42464155
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42464409 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 42464310  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  42464309 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 42464216  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42464215 ttaacg--tatcccatccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 42464155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19349461 - 19349174
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttt--ttgag---atatattgtgtatgtaattgactaat 195  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||  || |    || |||||||||||||||||||||||    
T  19349461 atcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgttttttattttattttatgtattgtgtatgtaattgactaat 19349362  T
Q  196 catcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaag 295  Q
    | || || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||     
T  19349361 cgtcgctctcttaatcgtcaatataatttatatttatgttgatgtgttatgagcctatgactagtttcttttg-ttgttaatatgtttgcatattaaaaa 19349263  T
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttt 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19349262 aaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttt 19349174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47750758 - 47750537
Alignment:
Q  111 tataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagata-tattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaa 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47750758 tataacactaacaatattccttttggatatagtataatattgatggtgctcttttgg-gataatattgtatatgtaattgattaatcatcactctcttaa 47750660  T
Q  210 tcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataatt 309  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  47750659 tcttcaatattacttatatttatgttgatatgttaccggcctatgactggtttcttgtgttaattaatatatttgcgtattaaaaaaaattgttataatt 47750560  T
Q  310 atatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  47750559 atgttgtacatttaattatataa 47750537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 19421697 - 19421925
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatag------tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgact 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19421697 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttatgaatataaatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgact 19421796  T
Q  193 aatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaa 292  Q
    |||||||||| |||||| | ||||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19421797 aatcatcactctcttaagcatcaat----------tttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaa 19421886  T
Q  293 aagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19421887 aa-aaatggttataattatattgtatatttaattatataa 19421925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 332
Target Start/End: Original strand, 983478 - 983683
Alignment:
Q  126 gttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattattta 225  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  983478 gttccttttggacatagtatagcactgatggtgctctttttatgatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttattcgtcaatattattta 983577  T
Q  226 tatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaat 325  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||  |||| | ||||||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  983578 tatttacgttgatgtactacgagactatgactaatttcttttgtttgttagtgtatttgcatatt-tattaaatggttataattatattgtacatttaat 983676  T
Q  326 tatataa 332  Q
    |||||||    
T  983677 tatataa 983683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20509991 - 20509837
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20509991 atcgacatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctccttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 20509892  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatga 255  Q
    || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20509891 ctctcttaatcatcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatga 20509837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 22311126 - 22311361
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  22311126 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttggtatatcttgtgtatgtaattg 22311225  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22311226 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 22311319  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  22311320 taaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattttataa 22311361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 39664679 - 39664909
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttga----gatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||      |||||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  39664679 gatatagtataacactgacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtatttttttttttttggatatattgt-tatataattgacaaatcgtc 39664777  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39664778 actctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgacgtgctacgagcctatgcctgatttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaat 39664876  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39664877 ggttataattatattgtacatttaattatataa 39664909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Original strand, 45347907 - 45348065
Alignment:
Q  173 tattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttg 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||    
T  45347907 tattgtgtttgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttcttttgtttg 45348006  T
Q  273 ttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45348007 ttaatatgtttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 45348065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13353022 - 13352807
Alignment:
Q  109 agtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatctta 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||    
T  13353022 agtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatatcattaatggtgttgtttttaggatatattgtgtatgtaattgactaattatcatactttta 13352923  T
Q  209 atcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataat 308  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  13352922 atcctcaatattatttatatctatgttgatgtgctacgagcctatgattggtt-----tgtttgttaatatatttgtatattaa---aaatggttataat 13352831  T
Q  309 tatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  13352830 tatattgtacatttacttatataa 13352807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28882401 - 28882166
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataaca-----------ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  28882401 atcgatatagtatagcattaacaatgtttcttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattg 28882302  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28882301 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 28882208  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28882207 taaaa-aaagggttataattatattatacatttaattatataa 28882166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21157536 - 21157365
Alignment:
Q  160 tctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactgg 259  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21157536 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgtgctaagagcatatgactgg 21157437  T
Q  260 tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21157436 tttcttttacttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatgaatataattatattgtacatttaattatataa 21157365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 35390146 - 35390377
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgat--------ggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgact 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  35390146 atcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatatgacactggtgctctttttggtatattttacgtatgtaattgact 35390245  T
Q  193 aatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaa 292  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35390246 aatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaa 35390339  T
Q  293 aagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |  ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35390340 a--aaaagattataattatattatacatttaattatataa 35390377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 52121612 - 52121864
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||    
T  52121612 gtataacagtgatggtgctctttttgatatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtaaataatatttatatttatgttaatgtg 52121711  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||        |    
T  52121712 ctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaat-gttataattatattatacatttaattatataatttttttta 52121803  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52121804 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 52121864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13748287 - 13748126
Alignment:
Q  169 gatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||    
T  13748287 gatatattgtgtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctataactggtttattttg 13748188  T
Q  269 tttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13748187 tttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtaca-ttaattatataa 13748126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45532331 - 45532149
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45532331 gtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccaccctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 45532233  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45532232 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 45532149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41741913 - 41741772
Alignment:
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  41741913 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattcgcatat 41741814  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41741813 taaaa-aaatggttataattatattgtacattttattatataa 41741772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22610545 - 22610363
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22610545 gtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 22610447  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22610446 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 22610363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30787350 - 30787195
Alignment:
Q  172 atattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgttt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||| | |||||    
T  30787350 atattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtct---accggtttcttttgttt 30787254  T
Q  272 gttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30787253 gttaatatatttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 30787195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 48123674 - 48123857
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48123674 gtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 48123773  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||      | | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48123774 ctac------aagtctcgtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattgaaa-aaatggttataattatattgtatatttaattatataa 48123857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50287015 - 50286833
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |    
T  50287015 tataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgtac 50286916  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||  ||      ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50286915 tacgaattta------gttttttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 50286833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52505145 - 52504909
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt-------------ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||| |||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  52505145 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtatagcactaatggtgctctttttagtatatattgcgtatgtaat 52505047  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52505046 tgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgttacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcat 52504953  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52504952 attaaaa-aaatggttacaattatattgtacatttaattatataa 52504909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25936347 - 25936183
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  25936347 gtatagcactaatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattgtttatatttatgttaatgtg 25936248  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatat 313  Q
    ||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25936247 ctacgaac------ttggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatat 25936183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1678949 - 1678770
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  1678949 gtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 1678854  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1678853 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 1678770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10224420 - 10224257
Alignment:
Q  150 ctgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaac 249  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  10224420 ctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga-- 10224323  T
Q  250 ctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacat 320  Q
        | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10224322 ----gcctggtttcttgtgtttgttaatatcgttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacat 10224257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Original strand, 33241166 - 33241364
Alignment:
Q  131 ttttggatatagtataacactgat-----ggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattattta 225  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33241166 ttttggatataatataacattgatataacggtgctcttttttatatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 33241265  T
Q  226 tatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaat 325  Q
    |||||||||| |||||||||||      | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  33241266 tatttatgttaatgtgctacga------gtctaatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaaagattataattatattatacatttaat 33241357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 28705590 - 28705769
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  28705590 gtataacattgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattgtctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 28705685  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28705686 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 28705769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 393
Target Start/End: Original strand, 1528881 - 1529113
Alignment:
Q  144 ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||||    
T  1528881 ataacactgctggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtgct 1528976  T
Q  244 acgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnatt 343  Q
    |            ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |||    
T  1528977 a------------tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatataatacatttaattatataattttttttatt 1529063  T
Q  344 aacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcg 393  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1529064 aacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcg 1529113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 392
Target Start/End: Original strand, 40499339 - 40499475
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| |    
T  40499339 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaaaaaatggttataattatataatacatttaattatataattttttttattaacg--tatccc 40499436  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatc 392  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40499437 agccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatc 40499475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20509793 - 20509729
Alignment:
Q  267 tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20509793 tgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatggttataattatattgtatatttaattatataa 20509729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2566830 - 2566717
Alignment:
Q  289 ttaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttgatttt-gaaatttttc 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||        ||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2566830 ttaaaaaaaatggttataattatattgtacatttagttatataattttttttattaacgtat--cccagccatatcgtatcttgatttttgaaatttttc 2566733  T
Q  387 catatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||||||||||||    
T  2566732 catatcggtgcagtat 2566717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 7328169 - 7328244
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7328169 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatgattataattatataatacatttaattatataa 7328244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37996463 - 37996328
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| |    
T  37996463 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaataattataattatataatacatttaattatataattttttttattaacg--tatccc 37996367  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatc 392  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37996366 agccatatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatc 37996328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 42229923 - 42229973
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataaca 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42229923 gaatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataaca 42229973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 53192853 - 53192927
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53192853 ctggtttcttgggtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaat-gttataattatataatacatttaattatataa 53192927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30787396 - 30787350
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataa 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30787396 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttagatatagtataa 30787350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 7328021 - 7328062
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7328021 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagt 7328062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50287068 - 50287020
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataaca 149  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50287068 atcgatatagtatagcatcaataatgttccttttggatatagtataaca 50287020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6134421 - 6134391
Alignment:
Q  31 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6134421 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 6134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22610598 - 22610557
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22610598 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 22610557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25936400 - 25936359
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25936400 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 25936359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37996559 - 37996513
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaatt 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37996559 gtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt 37996513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14996086 - 14996053
Alignment:
Q  271 tgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14996086 tgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggtta 14996053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Original strand, 52121558 - 52121595
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggat 138  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52121558 atcgatataatatagcactaacaatgttccttttggat 52121595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10224481 - 10224442
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10224481 atcgatttagtataacactaacaa-gttccttttggatata 10224442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 45347558 - 45347615
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgct 160  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  45347558 atcgatatagtatagcccttacaatgtttcttttgg--atagtataacacttatggtgct 45347615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 52684899 - 52684935
Alignment:
Q  296 aaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52684899 aaatggttataattatattgtatatttaattatataa 52684935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31236021 - 31235792
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31236021 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatatcattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 31235922  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31235921 ctctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactagtttcttttgtttgttaatatatttgtatattaaaaaaaatg 31235822  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  31235821 gttataat--tattgtatatttaattatataa 31235792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 1005773 - 1006003
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1005773 atcgatatagtataacactaacaatattccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 1005872  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1005873 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 1005971  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1005972 gttataattatattgtacattaaattttataa 1006003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 318
Target Start/End: Original strand, 14824400 - 14824616
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824400 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 14824499  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14824500 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 14824598  T
Q  301 gttataattatatcgtac 318  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14824599 gttataattatattgtac 14824616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 332
Target Start/End: Original strand, 35996814 - 35997022
Alignment:
Q  123 aatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35996814 aatgttcattttggatatagtataacacttatggtgctccttttgggatatattgtgcatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattat 35996913  T
Q  223 ttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacattt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35996914 ttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacattt 35997012  T
Q  323 aattatataa 332  Q
    ||||||||||    
T  35997013 aattatataa 35997022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 402
Target Start/End: Original strand, 34146466 - 34146764
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  34146466 gatatagtatagcactaacagtgttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtaggtaattgactaatcatcactc 34146565  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  34146566 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacgatcctaatacttgtttcttttgtttgttaatacatttgcatattaaaa-aattagtt 34146664  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcc-atatcggtgcagt 400  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34146665 ataattatattgcacatttaattatataaatttttttattaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgttatcggtgcagt 34146762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 44156859 - 44157088
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44156859 atcgatataatatagaactaacaatgtttcttctggatatagtataacacttgtggtgctctttttggg-tatgttgtgtatgtaattgactaatcatca 44156957  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44156958 ctcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 44157056  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44157057 gtcataattatattatacatttaattatataa 44157088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28746518 - 28746288
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgag-atatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28746518 atcgatatagtataacaataacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtc 28746419  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28746418 actctcttaatcatcaatattatttatatttatgctgatgtgatacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaat 28746320  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28746319 ggttataattatattgtacatttaattatata 28746288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 393
Target Start/End: Original strand, 4562053 - 4562341
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4562053 gatatagtatatcactaacaatgttccttttggatatagtatagtacttatggtactctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactc 4562152  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatata-tttgcatattaaaagaaatggt 302  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||    
T  4562153 tcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgactggtttattttgtttgttagtatattttgtatattaaaa-aactggt 4562251  T
Q  303 tataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcg 393  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4562252 tataattatattgtacattaaattttataa-tttttttattaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatcg 4562341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 332
Target Start/End: Original strand, 3564106 - 3564330
Alignment:
Q  106 tatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatc 205  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3564106 tatagtatagcattaacaatgcttcttttggatatagtataacagttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgcaattgactaatcatcactctc 3564205  T
Q  206 ttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttat 305  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  3564206 ttaatcgtcaatatta-ttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttaaatattaaaa-aaatggttat 3564303  T
Q  306 aattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  3564304 aattatactgtacatttaattatataa 3564330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 4355573 - 4355754
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4355573 atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggggctctttttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatca 4355672  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatt 282  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  4355673 ctctcttagtcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactgatttcttttgtttgttaatatatt 4355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 24585796 - 24586028
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttcctttt-ggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24585796 atcgatatagtatagcactaacaatgtttctttttggatatagtatagcacttatggtactctttttgggatatattctgtatgtaattgactaatcttc 24585895  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgtta--atatatttgcatattaaaagaa 297  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  24585896 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtttatgtgctacgagcatatgacttgtttcttttgtttgttattatatacttgcatattaaaaaaa 24585995  T
Q  298 atggttataattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24585996 atagttataattatattgtacatttaattatat 24586028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 330
Target Start/End: Original strand, 40536498 - 40536706
Alignment:
Q  121 acaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  40536498 acaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttggaatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatatt 40536597  T
Q  221 atttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacat 320  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  40536598 acttatatttatgttgatattttacgagcctatgattggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattgttataattatattctacat 40536696  T
Q  321 ttaattatat 330  Q
    ||||||||||    
T  40536697 ttaattatat 40536706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 5588299 - 5588529
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5588299 atcgatataatataacactaacaatgtttcttttgcatacagtatatcacttatggtgctctcttcgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 5588398  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
     | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5588399 ttctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagtctatgattgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 5588497  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5588498 gctataattatattgtacatttaactatataa 5588529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40431879 - 40431643
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40431879 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttaggatattttgtgtatgtaattgactaagcatca 40431780  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttg------atgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || | |||||| |||| ||||||| |||||||||||      |||||||||||  |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40431779 ctctgttaatcatcaatattatttgtatttatgttgatgttgatgtgctacgagtctatgactgacttcttttgtttgctaatatatttgcatattaaaa 40431680  T
Q  295 gaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40431679 -aaatggttataattatattgttcatttaattatataa 40431643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 394
Target Start/End: Original strand, 35342600 - 35342891
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35342600 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatataacactgatgatgctctttttaggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 35342699  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35342700 atctcttaatcgtcaatattatttatatttattttgatgtgctacaagccgatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 35342797  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||||        |||||||  |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35342798 gg-tataattatattgtacatttatatatataattttttttattaacg--tatctcaaccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 35342891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 2319561 - 2319786
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||| |     
T  2319561 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatatccatgatg-tgctctttttgggatatattttctaattaattgactaatcatcattc 2319659  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2319660 ttttaatcgtcaatattatttatattaatgtggatgtgctacgagcct--gactggtttcttttatttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggtt 2319757  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2319758 ataattatattgtacattttattatataa 2319786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 324
Target Start/End: Original strand, 10573799 - 10573988
Alignment:
Q  135 ggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacatt-atttatatttatg 233  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10573799 ggatatagtatatcattggtggtgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcacttaatcgtcaatatttatttatatttatg 10573898  T
Q  234 ttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaa 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  10573899 ttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattgttataattatattggacatttaa 10573988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3545416 - 3545187
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3545416 atcgatatagtatagcactaataatatttcttttggatatagtataccactgatgatgctccttttaggatatattgtgtatgtaattgattaattatca 3545317  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  3545316 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcctatgatcggtttcttttgtatgttaatatattttcatattaaa--aaatg 3545219  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  3545218 attataattatattgtacatctaattaaataa 3545187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45159011 - 45158835
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45159011 atcgatatagtatagcactaaaaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 45158912  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaat 277  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45158911 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactgatttcttgtgtttgttaat 45158835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 117 - 332
Target Start/End: Original strand, 12206264 - 12206483
Alignment:
Q  117 actaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12206264 actaacaatgttccttttggatataatataacattgatggtgctttttttcggatatattttgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaa 12206363  T
Q  217 cattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactgg-----tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattat 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     |||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12206364 tattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgagtggtttttttttttttttttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattat 12206462  T
Q  312 atcgtacatttaattatataa 332  Q
    || | |||||||| |||||||    
T  12206463 attgcacatttaaatatataa 12206483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 20537122 - 20537359
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtat-------------aacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  20537122 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgtataacactgattgtgctctttttgatatattttgcttatgtaat 20537221  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20537222 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgttacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcat 20537315  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20537316 attaaaa-aaatggtcataattatattgtacatttaattatataa 20537359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8482774 - 8482540
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  8482774 atcgatataatataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcaccgatggtgctcgttttgggatatattgtgtttgtaattgaccaataatca 8482675  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacat----tatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    || ||||||||| ||| ||    ||| ||||| ||| ||||| ||||||    | ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8482674 ctctcttaatcgacaatattatctatatatatatatcttgatatgctacacgtccatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-a 8482576  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8482575 aatggttataattatattgtacatataattatataa 8482540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14217003 - 14216861
Alignment:
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14217003 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatat 14216904  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14216903 taaaaaaaatggttataattatattgtacattttattatataa 14216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 6125021 - 6125272
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6125021 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 6125120  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||             
T  6125121 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtaaatttaattatataattttttt-- 6125211  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6125212 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 6125272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4169790 - 4169608
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4169790 gtatagcactgatggtgctctttttgt-acatattgcgtatgtaattgactaatgactactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 4169692  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4169691 ctacga------gcctgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 4169608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Original strand, 9293655 - 9293877
Alignment:
Q  111 tataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaat 210  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||| | |    
T  9293655 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatataatatgcatttaattgactaatcatcactctctcact 9293754  T
Q  211 cg----tcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttata 306  Q
     |    |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  9293755 tgacaatcaatattatttatatttacactgatgtgctacgagcctatgaatgatttcttttgtttgttaatatatttacatattaaaa-aaattgttata 9293853  T
Q  307 attatatcgtacatttaattatat 330  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  9293854 attatattgtatatttaattatat 9293877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6496941 - 6496697
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6496941 gtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctttcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 6496843  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||| ||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  6496842 ctatga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 6496750  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||  |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6496749 ttaacg--tatctcagctgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 6496697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 402
Target Start/End: Original strand, 22485126 - 22485370
Alignment:
Q  151 tgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacc 250  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||       
T  22485126 tgatgttgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgctacga--- 22485222  T
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtat 350  Q
       | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||||  |    
T  22485223 ---gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaacggttataattatattgcacatttaattatatatatttttttattaacg--t 22485316  T
Q  351 atcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  22485317 atcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttctccgtatcagtgcagtat 22485370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40308106 - 40307858
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40308106 gtataacattgatgatgctcttttcggtatatattgagtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 40308007  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    |||      | || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  40308006 cta------tgtgcctggtttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaaa-aaatagttataattatattgtacatttaattatataa-ttttttta 40307915  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgca 398  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40307914 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgca 40307858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 5371358 - 5371593
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatag-----------tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||| | ||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  5371358 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataaaatagcattcatataacactgatggtgttttttttggtatattttgcgtatgtaattg 5371457  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  5371458 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgtactacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcaaat 5371551  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5371552 taaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 5371593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 289
Target Start/End: Original strand, 18301378 - 18301564
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatg----gtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18301378 atcgatataatatagcactagcaatgttccttttggatataatataacattgatgtatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatc 18301477  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18301478 accactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 18301564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7807125 - 7806876
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  7807125 gtataacattgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattttctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 7807030  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |        |    
T  7807029 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatatgatttttttta 7806937  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7806936 ttaacg--tatctcagtcgtatcgtatcttgatttttgaaattttcccgtatcggtgcagtat 7806876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 12819598 - 12819836
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||           |||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||    
T  12819598 atcgatatagtatagcattaacaatattccttttggatatagtatagcattgatataacactggtggtgctctttttggtatattttacgtatgtaattg 12819697  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||      | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12819698 actaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgttaatctgctac------aagtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatat 12819791  T
Q  290 taaaagaaatggt---tataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||| | |   |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12819792 taaaa-aaaggttatgtataattatattatacatttaattatataa 12819836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 332
Target Start/End: Original strand, 21104817 - 21104983
Alignment:
Q  162 tttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtt 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||     
T  21104817 tttttgggatatattgtgtatgtaattggtta-taatcactctcttaatcgtcaatattatttatgtttatgttgatgtattacgagcctatgactggtg 21104915  T
Q  262 tcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  21104916 tctgttatttgttaatatattttcatattaaa--aaatgg-tataattatattgtacatttatatatataa 21104983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 394
Target Start/End: Original strand, 22571364 - 22571501
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| |    
T  22571364 ctggtttcatgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaattgttataattatatagtacatttaattatataattttttttattaacg--tatccc 22571460  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22571461 agccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 22571501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 394
Target Start/End: Original strand, 7877080 - 7877216
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||    
T  7877080 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataattttttttattaacg--tatccca 7877176  T
Q  357 gccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7877177 gccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 7877216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 16562174 - 16562249
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16562174 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 16562249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 4356303 - 4356359
Alignment:
Q  274 taatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4356303 taatatatttgcatatttaaa-aaatagttataattatattgtacatttaattatata 4356359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4169843 - 4169802
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4169843 atcgatatagtataacactaacaa-gttcctttttgatatagt 4169802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 22485064 - 22485105
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22485064 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 22485105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40308159 - 40308118
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40308159 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 40308118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Original strand, 21104766 - 21104803
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21104766 atcgatatagtatatcactaacaatattccttttggat 21104803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 47607362 - 47607592
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47607362 atcgatataatatagcaccaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaattatca 47607461  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47607462 ctatcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatt 47607560  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47607561 gttataattatattatacatttaattatataa 47607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42630315 - 42630083
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630315 gaatcgatgtagtataacactaacaatgttccttttggatagagtataacactgatgatgcttttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcat 42630216  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42630215 cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgtgtctatgactgtttccttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaa 42630117  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42630116 tggttataattatattgtatatttaattatataa 42630083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31946083 - 31945854
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31946083 atcgatat-gtatagcactaacaatgttccttttagatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 31945985  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31945984 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaaa-aaatg 31945886  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  31945885 gttataattatattgtacattaaattttataa 31945854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 1177241 - 1177469
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttttt-gagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcact 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1177241 gatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtacttttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtcact 1177340  T
Q  203 atcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggt 302  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1177341 ctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaatggt 1177439  T
Q  303 tataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1177440 tataattatattgtacatttaattatataa 1177469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30683507 - 30683286
Alignment:
Q  111 tataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaat 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30683507 tatagcactaacaatgttccttttgaatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 30683408  T
Q  211 cgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataatta 310  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30683407 cgtcgatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatggctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaattgttataatta 30683308  T
Q  311 tatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  30683307 tattgtacatttaattatataa 30683286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 308
Target Start/End: Original strand, 24784658 - 24784862
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24784658 gatatagtatagcactatcaatgttctttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactc 24784757  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24784758 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggtt 24784857  T
Q  304 ataat 308  Q
    |||||    
T  24784858 ataat 24784862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24823608 - 24823404
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24823608 gatatagtatagcactatcaatgttctttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactc 24823509  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24823508 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggtt 24823409  T
Q  304 ataat 308  Q
    |||||    
T  24823408 ataat 24823404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 51859056 - 51859286
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51859056 atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgtgatatattgtgaaagtaattgactaatcatca 51859155  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51859156 cccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtggtacgagtttatgatttgtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 51859254  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51859255 gttataattatattgtacatttaattatataa 51859286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 308
Target Start/End: Original strand, 52721637 - 52721843
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52721637 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcattgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 52721736  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  52721737 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatt 52721835  T
Q  301 gttataat 308  Q
    ||||||||    
T  52721836 gttataat 52721843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3109140 - 3108841
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3109140 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacacagatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 3109041  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3109040 ctcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatttgctacgagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 3108943  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgc 397  Q
    || ||||||||||| ||| |||||  |||||||        |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||    
T  3108942 gg-tataattatattgtatatttatatatataattttttttattaacg--tatctcagtcgtatcgtatcttgatttttgaaatttttcagtattggtgc 3108846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 40694329 - 40694561
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40694329 gaatcgatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatataatatatcacttatgatgctctttttgggatatattacgtatgtaattgactaatcat 40694428  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40694429 cactctcttaattgtcgatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcctttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaa 40694527  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40694528 tggttataattatattctaaatttaattatataa 40694561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24793566 - 24793346
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24793566 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatctaattggctaataatca 24793467  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24793466 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcgagcctacgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaat 24793369  T
Q  300 ggttataattatatcgtacattta 323  Q
    || ||||||||||| | |||||||    
T  24793368 gg-tataattatattgaacattta 24793346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44521881 - 44521650
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44521881 atcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgagatattttgtgtatgtaattgactaatcatca 44521782  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  44521781 ctctcttaatcgtcaatgttatttatatttatgtagatgtgttacgagcgtataactgatttcttttgtttgttaatatatttacatattaaaa-aaata 44521683  T
Q  301 gttataat-tatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  44521682 gttatattatatattgtgcatttaattatataa 44521650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 2586599 - 2586827
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2586599 atcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatataatataacactgatgatgctctttt-gaggtatattgtgtatgtaattggctaataatca 2586697  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  2586698 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcgagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaa--aaat 2586794  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     | ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  2586795 tggtataattatattgtacatttatatatataa 2586827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 39957971 - 39958164
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39957971 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttagatatagtataacaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 39958070  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39958071 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtcgatgtgttacgagcctatgattgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 39958164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 51675053 - 51675278
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  51675053 gatatagtatatcactaacaatattcctttctaatatagtataacacttatgattctctttttg-gatatattgtatatgtaattgattaatcatcactc 51675151  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51675152 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcatatgacttgtttattttgtttgttaatata-ttgcatattaaaa-aaatggtt 51675249  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51675250 ataattatattatacatttaattatataa 51675278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 313
Target Start/End: Original strand, 17892534 - 17892741
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  17892534 gatatagtataacactaacaatgttccttttgaatatagtataacactgatgatgctctttttggtttatattgtgtatgtaattgtctaataatcactc 17892633  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggt 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  17892634 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcaagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaatgg- 17892730  T
Q  303 tataattatat 313  Q
    |||||||||||    
T  17892731 tataattatat 17892741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Original strand, 36943952 - 36944177
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36943952 atcgatatagtataatactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 36944051  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacat------tatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaa 293  Q
     | ||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36944052 atctcttaatcgtcaatattatttatatttatatttatgttgatgtgttgcgagcctatgactgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaa 36944150  T
Q  294 agaaatggttataattatatcgtacattt 322  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36944151 a-aaatgg-tataattatattgtacattt 36944177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 258923 - 258702
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttcc-ttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  258923 atatagtatagcagtaacaatgttccgttttggatatagtataacacttatggtactctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaattatcactc 258824  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||    ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  258823 tcttaatcgtcactattatttatatttaagttgatttgctacgagtcta----tggtttattttgtttgttaatatatttgtatattaaa--aaatggtt 258730  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  258729 ataattatattgtacattaaattttata 258702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7952953 - 7952757
Alignment:
Q  116 cactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  7952953 cactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgacgctccttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactcttttaatcgtca 7952854  T
Q  216 acattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatat 313  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7952853 atattacttatatttatgttgatatgctacgagtgtatgactggtttcttgtgtttgttaatataattgcatattaaaa-aaattgttataattatat 7952757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 14795857 - 14796110
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  14795857 gtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtg 14795956  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  14795957 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 14796049  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  14796050 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaaattttctgtatcggtgcagtat 14796110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36511790 - 36511557
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttga---gatatattgtgtatgtaattgactaatca 197  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||     |||||||| |||||||||||||||||||     
T  36511790 atcgatataatatagcactaagaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgtttttttttttttgatatattttgtatgtaattgactaatcg 36511691  T
Q  198 tcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  36511690 tcactctcttaatcgtcaatattatttatatttgtattgatgtgctacgagcctatgaccggtttcttttgtttgttaatatgtttccatattaaaa-aa 36511592  T
Q  298 atggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36511591 atggttatgattatattgtaaatttaattatataa 36511557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 49470559 - 49470780
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49470559 atcgatatagtatgtcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgatgcactttttggaaaatattgtgtatgtaattgattaatcatca 49470658  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||      |||||||| || |||||| |   |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  49470659 ctctcttaatcgtcaatattatttatattt------atgtgctaggagcctatggcccatttcttatgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatg 49470750  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49470751 gttataattatattgtacatttaattatat 49470780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 402
Target Start/End: Original strand, 41146399 - 41146706
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt-------------ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgta 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  41146399 gaatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgta 41146496  T
Q  186 attgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgc 285  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41146497 attgactaatgaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgtttatgtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgc 41146590  T
Q  286 atattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaattt 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  41146591 atattaaaa-aaatggttataattatattatacatttaattatataaaattttttattaacg--tatcccagccgtattgtatcttgatttttgaaattt 41146687  T
Q  384 ttccatatcggtgcagtat 402  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  41146688 ttccgtatcgatgcagtat 41146706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 402
Target Start/End: Original strand, 14614769 - 14615055
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||          
T  14614769 atataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtatatgtaattgactaatcat------ 14614862  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  14614863 -ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgtatattaa---aaatggtta 14614958  T
Q  305 taattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614959 tatttatattgtatatttaattatataa-tttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcatgatttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 14615055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 55900983 - 55900823
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55900983 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 55900884  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtt 261  Q
     | || ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55900883 ttctcgtaatcgtgagtataatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtt 55900823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 52573035 - 52573218
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  52573035 gtatagcactgatggtgctctttttggtatatactgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 52573134  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52573135 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattttacatttaattatataa 52573218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 5835226 - 5835461
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgat-----------ggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  5835226 atcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacattgatggtgctctttttgatatattttgcgtatgtaattg 5835325  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||      | || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5835326 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgttacga------gtctagtttcttgcgtttgttaatatatttgcatat 5835419  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5835420 taaaaaaaat-gttataattatattatacatttaattatataa 5835461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5325342 - 5325042
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata-------------gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  5325342 gaatcgatatagcataacactaacaa-gttccttttggatataatgtagcattgatgtatagcacttatggtgctctttttggtatatattgcgtatgta 5325244  T
Q  186 attgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgc 285  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5325243 attgactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgttacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgc 5325150  T
Q  286 atattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaattt 383  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5325149 atattaaaa-aaatggttacaattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaattt 5325053  T
Q  384 ttccatatcgg 394  Q
    || | ||||||    
T  5325052 tttcgtatcgg 5325042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43509705 - 43509524
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43509705 tataatactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 43509606  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||      | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43509605 tacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatattttcatattaaa--aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 43509524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 28377293 - 28377530
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata-------------gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  28377293 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctctttttgttatattttgcgtatgtaat 28377392  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||      | || ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  28377393 tgactaatcaccactctcttaattgccaatattatttatatttatgttaatgtgctatga------gtctagtttcttgtgcttgttaatatattttcat 28377486  T
Q  288 attaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  28377487 attaaaa-aaaaggttataattatattatatatttaattatataa 28377530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8063365 - 8063183
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  8063365 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 8063270  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8063269 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 8063183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3402842 - 3402663
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    |||||| || |||||    
T  3402842 gtataacacttattgtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcatcaatattat----atttatattaatgtg 3402747  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    || ||| | |      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3402746 ctgcgagcat------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaaaaaatggttataattatatagtacatttaattatata 3402663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Original strand, 10258433 - 10258542
Alignment:
Q  223 ttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacattt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  10258433 ttatatttatgttgatgtgctacaagcttatgactggtttcttttgtttgataatatatttgcatattaaataaaatggttataattatattctacattt 10258532  T
Q  323 aattatataa 332  Q
    ||||||||||    
T  10258533 aattatataa 10258542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 46431690 - 46431566
Alignment:
Q  207 taatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttata 306  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46431690 taatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcccatgactcatttattttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttata 46431592  T
Q  307 attatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  46431591 attatattgtacatataattatataa 46431566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 393
Target Start/End: Original strand, 53324587 - 53324767
Alignment:
Q  206 ttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttat 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||      | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  53324587 ttaatcatcaatattatttatatttatgttaatgtactacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatttatttgcatattaaaa-aaatggttat 53324679  T
Q  306 aattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcg 393  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53324680 aatcatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcg 53324767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37992387 - 37992295
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatca 197  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37992387 atatagtataggactaacaatgttccttttggatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgggtatgtaatcgactaatca 37992295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 19739064 - 19739139
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19739064 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaaaaaatggttataattatatagtacatttaattatataa 19739139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42472327 - 42472255
Alignment:
Q  260 tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42472327 tttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaaaaattggttataattatatagtacatttaattatataa 42472255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 52122365 - 52122242
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  52122365 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattgtataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatc 52122269  T
Q  369 ttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52122268 ttgatttttgaaatttttccgtatcgg 52122242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Original strand, 31227451 - 31227522
Alignment:
Q  260 tttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31227451 tttcttgtgtttgttaatatacttgaatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 31227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38492083 - 38491804
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatg------gtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaa 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||      ||||||||||||  |||||||| ||||||||||          
T  38492083 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtatctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt------ 38491991  T
Q  195 tcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
      | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||||| ||||| |||      |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  38491990 --accactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtgttacgagcct------ggtttcttgtgtttgtcaatatacttgcataataaaa 38491903  T
Q  295 gaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa-nnnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatat 391  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  38491902 -aaatgattataattatataatacatttaattatataatttttttttattaacg--tatcacagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtat 38491806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 53323189 - 53323255
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatctta 208  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  53323189 gtatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctctta 53323255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46431747 - 46431682
Alignment:
Q  135 ggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46431747 ggatacagtatagcactaatggttctctttttgaaatatatcgtgtgtgtaattgactaatcatca 46431682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 395
Target Start/End: Original strand, 52721920 - 52722024
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcca 388  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||  | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  52721920 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaa--tgtatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttccca 52722017  T
Q  389 tatcggt 395  Q
    |||||||    
T  52722018 tatcggt 52722024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 31227190 - 31227270
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattat 222  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  31227190 gtatagcactcatgatgctctttttggtatgtattgcgcatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 31227270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3402895 - 3402854
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3402895 atcgatatagtatatcactaacaa-gttccttttggatatagt 3402854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 31227137 - 31227178
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31227137 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 31227178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 52572982 - 52573023
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52572982 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 52573023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Original strand, 52573670 - 52573724
Alignment:
Q  350 tatcacagccgt-tcgtatcttgatttt-gaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52573670 tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 52573724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 53323136 - 53323177
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53323136 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 53323177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 332
Target Start/End: Original strand, 18569154 - 18569202
Alignment:
Q  283 tgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18569154 tgcattttaaaa-aaatggttataattctattgtacatttaattatataa 18569202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32380911 - 32380686
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  32380911 atatagtataacactaacaatgttccttttgaatatagtataacactaatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaatcgactaatcatcactct 32380812  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  32380811 cttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgaccgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatagtta 32380714  T
Q  305 taattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  32380713 taattacattgtacatttaattatataa 32380686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 10822655 - 10822885
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822655 atcgatataatatatcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttacggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 10822754  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10822755 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtactacgagcctatgacggttttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 10822853  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10822854 gttatgattatattgtacatttaattatataa 10822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9528701 - 9528471
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9528701 atcgatatagtatagcactaacgatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgtcctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 9528602  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9528601 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcatatgactagtttcttttgtttattaatatatttgcatattaaaa-aaatg 9528503  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9528502 gttataattatattgtacatttaattatataa 9528471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 9781903 - 9782135
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctcttttt--gagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9781903 atcgatacagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttgggatatattgtgtacgtaattgactaatcgt 9782002  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9782003 cactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaa 9782101  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9782102 tggttataattatattgtacatttaattatataa 9782135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 24851753 - 24851946
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851753 atcgatatagtatagcactaacaatgttcgttttggatatagtatagcacaaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 24851852  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851853 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagccaatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 24851946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 29168212 - 29168436
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29168212 atatagtatagtactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatgatgctcttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 29168311  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29168312 cttaatcgtcgatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatggctggtttcttttgtttgctaatatatttgcatattaaaa-aaatggtta 29168410  T
Q  305 taattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  29168411 taattatattctacatttaattatat 29168436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34432272 - 34432047
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34432272 atcgatatagtataacactaacaatgtttctttgggatatagtatagtacttatggtgttctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 34432173  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34432172 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctaagagcctatga-ttgtttcttttgttcgttaatatatttgcatattaaaaaaaatg 34432074  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaatta 327  Q
    |||||||||||||  || |||||||||    
T  34432073 gttataattatattatatatttaatta 34432047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 37922478 - 37922705
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |||     
T  37922478 gatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattgattataactc 37922577  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37922578 tcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgtgatatgagcctatgaatggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggtt 37922676  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37922677 ataattatattgtaaatttaattatataa 37922705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 29862061 - 29862346
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtg---ctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29862061 gataaagtataccactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatagtgtttttttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtca 29862160  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29862161 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaatg 29862259  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttcc 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29862260 gttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tatcacaaccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttcc 29862346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 36551667 - 36551965
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  36551667 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatataacactgata-tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaacaatca 36551765  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  36551766 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtcctacgagcctatgattgattt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-caat 36551863  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgc 397  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  36551864 gg-tataattatattgtacatttatatatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgatgc 36551960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Original strand, 14167330 - 14167554
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14167330 atcgatatagtataacactaacaatgtatcttttggatatagtatagctcttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtca 14167429  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14167430 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactaatttattttgtttattaatatatttgcatattaaaa-aaacg 14167528  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaatt 326  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||    
T  14167529 gtaataattaaagtgtacatttaatt 14167554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34096410 - 34096179
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtg-ctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | | ||  | |||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  34096410 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcacttacgatgtttttttttgggacatattgtgtatgtaattgattgatcgtc 34096311  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34096310 actctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgaatggtttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaat 34096212  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34096211 gcttataattatattatacatttaattatataa 34096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 285
Target Start/End: Original strand, 32797462 - 32797636
Alignment:
Q  111 tataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaat 210  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32797462 tataacactaataatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 32797561  T
Q  211 cgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgc 285  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32797562 cgtcaatattacttatatttatgttgatatgctacgagcctatgattggtttcttgtgtttgttaatatacttgc 32797636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28948468 - 28948294
Alignment:
Q  151 tgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacc 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||       
T  28948468 tgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga--- 28948372  T
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
       | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28948371 ---gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 28948294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 5985024 - 5985266
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5985024 gtataacactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaatttactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 5985122  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  5985123 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaattgttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 5985215  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgttcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatc 392  Q
    ||||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5985216 ttaacgtatctca-gcccgatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatc 5985266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 43190040 - 43190349
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtat-------------aacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| | |||||||||||   |||| ||| ||||||| |    
T  43190040 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttttgtatattttgcgtatgtatt 43190139  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcat 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43190140 tgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcat 43190233  T
Q  288 attaaaagaaat-ggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttt 384  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  43190234 attaaaaaaaatatgttataattatattatacatttaattatataattttttttattaacg--tatcccagctgtatcgtatcttgatttttgaaatttt 43190331  T
Q  385 tccatatcggtgcagtat 402  Q
     || ||||||||||||||    
T  43190332 cccgtatcggtgcagtat 43190349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 332
Target Start/End: Original strand, 33040711 - 33040869
Alignment:
Q  171 tatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtt 270  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  33040711 tatattgtgtatgta-ttgaataataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacaaacctatgactcgtttcttttgtt 33040809  T
Q  271 tgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33040810 tgttaatatatttgcatattaaa--aattggttataattatattgtacatttaattatataa 33040869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3708099 - 3707936
Alignment:
Q  135 ggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgt 234  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3708099 ggatatagtatagcactggtggtcctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 3708000  T
Q  235 tgatgtgcta-cgaacctatgactg---gtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3707999 tgatgtgctaacgagcctatgactactagtttattttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 3707936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24589958 - 24589798
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24589958 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatataatatataattgatgaagctctttttaagatatattgtgta-gtaattgactaatcatca 24589860  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggttt 262  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24589859 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgactagttt 24589798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Original strand, 25257454 - 25257694
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25257454 gtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaaac--cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 25257550  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |        |    
T  25257551 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatatga-ttttttta 25257641  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25257642 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccatatcgg 25257694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 3427694 - 3427877
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3427694 gtatagcacagatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 3427793  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3427794 ctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtaaatttaattatataa 3427877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 15417920 - 15418061
Alignment:
Q  191 ctaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatatt 290  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15417920 ctaatcttcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgatacgagcctatgaccggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatatt 15418019  T
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15418020 aaaaaaatttgttataattatattgtacatttaattatataa 15418061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28658660 - 28658426
Alignment:
Q  153 atggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaaccta 252  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28658660 atggtgttctttttggtatatattgcatatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgagccta 28658561  T
Q  253 tgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatat 352  Q
          ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||    
T  28658560 ------gtttcttgtgtttgttaatatatctgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg--tat 28658470  T
Q  353 cacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28658469 ctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaaattttccgtatcgg 28658426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37346623 - 37346443
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37346623 tataacaccaatggtgctctttttgg--tattttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 37346526  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37346525 tacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaaaggttataattatattatacatttaattatataa 37346443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13012711 - 13012520
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatg----gtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13012711 atcgatataatatagcactagcaatgttccttttagatatagtataacattgatgtatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatc 13012612  T
Q  197 atcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13012611 accactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 13012520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31653137 - 31652903
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  31653137 atcgatatagtatagcattaacaattttccttttggatatagtatagcattgatataacacttatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattg 31653038  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      | || ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31653037 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga------gtctagtttcttgtgtttactaatatatttgcatat 31652944  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31652943 taaaa-aaaagattataattatattatacatttaattatata 31652903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 14334554 - 14334789
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||    
T  14334554 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatataacactgatggtgctctttttggtatattttacgtatgtaattg 14334653  T
Q  190 actaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatat 289  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||      | || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14334654 actaatcaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtactacga------gtctagttttttgtgtttgttaatatatttgcatat 14334747  T
Q  290 taaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||| | ||  || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14334748 taaaaaatat-attttaattatattatacatttaattatataa 14334789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 330
Target Start/End: Original strand, 30324559 - 30324737
Alignment:
Q  144 ataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgct 243  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  30324559 ataacactgatagtgatctttttgt-atatattgcgtacgtaattgactaatgaccactctcttattcgccaatattatttatatttatgttaatgtgct 30324657  T
Q  244 acgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatat 330  Q
    |||| | |      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30324658 acgagctt------ggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatat 30324737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6916132 - 6915950
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  6916132 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 6916037  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6916036 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 6915950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 38331287 - 38331469
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  38331287 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 38331382  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38331383 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 38331469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 47654947 - 47655046
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47654947 atcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 47655046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 8133020 - 8133199
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  8133020 gtataacagtgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattggctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 8133115  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8133116 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 8133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 10763914 - 10764126
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgag--atatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10763914 atcgatatagtatagcactaaaaatgtttcttttggatatagaatatcacttatggtgctttttttttggaatatattgtgtatgtaattgactaaccgt 10764013  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    || | |              |||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10764014 caattt--------------ttatttatatttatgttgatgtgctacga------gtctggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaa 10764092  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10764093 tgattataattatattgtacatttaattatataa 10764126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52894971 - 52894789
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  52894971 gtattacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 52894876  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52894875 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 52894789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 37104488 - 37104667
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  37104488 gtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 37104583  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37104584 ctacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatataatacatttaattatataa 37104667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 196
Target Start/End: Original strand, 15417689 - 15417772
Alignment:
Q  113 taacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15417689 taacactaacaatgttcctttttgatatagtataacattgatggtcctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatc 15417772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 393
Target Start/End: Original strand, 38218733 - 38218915
Alignment:
Q  209 atcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatg-tgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataa 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  38218733 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcctatgactggttt-atgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaatag-tataa 38218829  T
Q  308 ttatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcg 393  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38218830 ttatattgtaaatttatatatataattttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcg 38218915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41675825 - 41675743
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatg 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41675825 atcgatatagtataacattaacaatgttgcttttagatatagtataacattgatgatgctctttttgaaatatattgtgtatg 41675743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 38949098 - 38949172
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38949098 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 38949172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 1036947 - 1037008
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1036947 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 1037008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 1043853 - 1043914
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1043853 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa 1043914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20409273 - 20409136
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||        |||||||  |||| ||    
T  20409273 tggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaaaaaatgactataattatataatacaattaattatataattttttttattaacg--tatccca 20409176  T
Q  357 gccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20409175 gccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 20409136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36363324 - 36363153
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||        | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || |||||    
T  36363324 gtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaatgtg 36363237  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     ||||| |||      |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36363236 ttacgagcct------ggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatgattataattatataatacatttaattatataa 36363153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Original strand, 38218664 - 38218718
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatg 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38218664 atcgatataatataacactaacaatgttacttttggatataatataacactgatg 38218718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 262
Target Start/End: Original strand, 47656063 - 47656121
Alignment:
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggttt 262  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47656063 tcttaatcgtcagtataatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggttt 47656121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2472734 - 2472682
Alignment:
Q  137 atatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattg 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2472734 atatagtatagcactgatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattg 2472682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 305
Target Start/End: Original strand, 47656142 - 47656195
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttat 305  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47656142 tatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttat 47656195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4027523 - 4027452
Alignment:
Q  258 ggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  4027523 ggtttcttttgtttgttaacatatttgcatattaaaa---atggttatagttatattgtatatttaattatataa 4027452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2472683 - 2472636
Alignment:
Q  257 tggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2472683 tggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaaaaaatggtta 2472636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28948530 - 28948489
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28948530 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagt 28948489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 33039916 - 33039960
Alignment:
Q  134 tggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgt 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33039916 tggatatagtagagcactgatggtgctctttttgggatatattgt 33039960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 332
Target Start/End: Original strand, 24851969 - 24852015
Alignment:
Q  286 atattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  24851969 atattaaaaaaaatggttataattatattgtacattagattatataa 24852015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 25257401 - 25257442
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25257401 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 25257442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28658725 - 28658684
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28658725 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 28658684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36363377 - 36363336
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36363377 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 36363336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36367448 - 36367402
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaatt 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  36367448 gtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt 36367402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36367501 - 36367460
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36367501 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 36367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 27084233 - 27084464
Alignment:
Q  99 gaatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcat 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27084233 gaatcgatatagtatagaactaacaatgttcctttcggatatagtataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaaccat 27084332  T
Q  199 cactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaa 298  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27084333 cactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatggctggtttcttttgtttgttaatata-ttgcatattaaaa-aaa 27084430  T
Q  299 tggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27084431 tggttataattatattatacatttaattatataa 27084464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 19128414 - 19128645
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgag-atatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19128414 atcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtc 19128513  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19128514 actctcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgaccgatttcttttgtttgttaatatgtttgcatattaaaa-aaat 19128612  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19128613 ggttataattatattgtacatttaattatataa 19128645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 308
Target Start/End: Original strand, 32018382 - 32018585
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32018382 gatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactc 32018481  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32018482 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggtt 32018580  T
Q  304 ataat 308  Q
    |||||    
T  32018581 ataat 32018585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13045213 - 13044986
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13045213 gatatagtataacactaacgatcttccttttggatatagtattgcactgatggtgcttttttag-gatatattgtgtatgtaattggctaatcatcactc 13045115  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13045114 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgatttgtttcttttgtttgttaatatatttgcatattgaaaaaaatggtt 13045015  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13045014 ataattatattgtacatttaatgatataa 13044986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 7255204 - 7255431
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaa-tgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||    
T  7255204 atcgatatagtataacattaacaaatgttccttttggatatagtatagcactgattgtgctctttgtgggatatattgtgta----attgactaatcatc 7255299  T
Q  200 actatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaat 299  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7255300 actctcttaatcgtcaatattatttatattaatgttgatgtgctacgagtctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaat 7255398  T
Q  300 ggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7255399 ggttataattatattgtacatttaattatataa 7255431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 332
Target Start/End: Original strand, 3299339 - 3299550
Alignment:
Q  120 aacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacat 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  |    
T  3299339 aacaatgttccttttggatatattatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgttaatgt 3299438  T
Q  220 tatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtaca 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3299439 tatttatattcatgttgatgtggtacgagcctatgattggtttattgtgtttgttaatatatttgcatgttaaaa-aaatggttataattatattgtaca 3299537  T
Q  320 tttaattatataa 332  Q
    |||||||||||||    
T  3299538 tttaattatataa 3299550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 11105573 - 11105799
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcacta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||     
T  11105573 gatatagtataacactaacaatgttcattttggatataaaataacactgatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaattggctaataaccactc 11105672  T
Q  204 tcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  11105673 tcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctacgactggtttctgttgtttgttaatatattttcatattaaaa-aaatgg-t 11105770  T
Q  304 ataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  11105771 ataattatattgtacatttatatatataa 11105799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 101 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13061209 - 13060919
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13061209 atcgatatagtatagcactaatgatcttcctcttgggtatagtataacactgatgctgtt-tttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 13061111  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||    
T  13061110 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatcacttgtttcttttgtttattaatatatttgcatattgaaaaaactg 13061011  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgttc-gtatcttgatttt-gaaatttttccatatcg 393  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13061010 gttataatcatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacg--tatcacagccgtactgtatcttgattttcgaaatttttccatatcg 13060919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Original strand, 3212852 - 3213045
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3212852 atcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacca 3212951  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212952 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatatttgcatattaaaa 3213045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Original strand, 234570 - 234806
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgag------atatattgtgtatgtaattgactaa 194  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||         |||||||||||||||| ||||||||    
T  234570 atcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtttttttttttttttttatatattgtgtatgtagttgactaa 234669  T
Q  195 tcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa 294  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  234670 tcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactagtttcttttgtttgttaatatgtttgtatattaaaa 234769  T
Q  295 gaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  234770 -aaatggttataattatactgtacatttaattatataa 234806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10894354 - 10894196
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10894354 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 10894255  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacatta-tttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactg 258  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  10894254 ctctcttaatcgtcaatattattttatatttatgctgatgtgcttcgagcctatgactg 10894196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6707871 - 6707718
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6707871 atatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtatagcattgatggtgctccttttgggatgtattgtgtatgtaattgattaatcatcactct 6707772  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactg 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6707771 cttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactg 6707718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 149 - 402
Target Start/End: Original strand, 8357737 - 8357982
Alignment:
Q  149 actgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaa 248  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8357737 actgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga- 8357834  T
Q  249 cctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgt 348  Q
         | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||     
T  8357835 -----gtctggtttcttgtgtttgttaatatatttgcctattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataattttttttattaacg- 8357927  T
Q  349 atatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8357928 -tatctcagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 8357982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13607613 - 13607381
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13607613 atcgatttagtataacacttacaatttttcttttgaatataatataacaatgatgtt---ctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 13607517  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatat----ttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaaga 296  Q
    || |||||||| |||| ||| |||||||    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13607516 ctctcttaatcatcaatattgtttatatatacttatgttgaagtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatttgcatataaaaaaa 13607417  T
Q  297 aatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  13607416 aatggttataattatgtggtatatttaattatataa 13607381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Original strand, 26327582 - 26327735
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  26327582 atatagtataacactaacaatgtacattttagatatagtataacactaattgtgctctttttgagatatattgtctatgtaactgactaatcatcactct 26327681  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactg 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26327682 cttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgtgctacgagcctatgactg 26327735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7188047 - 7187796
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  7188047 gtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattaactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtg 7187948  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  7187947 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaaaatacttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatataa-ttttttta 7187857  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7187856 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaattttttcgtatcggtgcagtat 7187796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22988961 - 22988749
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  22988961 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatca 22988865  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||               || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22988864 ctcgcttaatcgtcaatattacttata--------------atatgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 22988780  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22988779 gttataattatattgtacatttaattatata 22988749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Original strand, 23799435 - 23799647
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23799435 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatca 23799531  T
Q  201 ctatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatg 300  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||               || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23799532 ctcgcttaatcgtcaatattacttata--------------atatgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatg 23799616  T
Q  301 gttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23799617 gttataattatattgtacatttaattatata 23799647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32130327 - 32130146
Alignment:
Q  143 tataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32130327 tataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 32130228  T
Q  243 tacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||      | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32130227 tacga------gtctagtttcttatgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaat-gttataattatattatacatttaattatataa 32130146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4153325 - 4153168
Alignment:
Q  173 tattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttg 272  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||||    
T  4153325 tattgtgtaagtaattgagtgatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgtgctatgagcctatgactgatttcttttgtttg 4153226  T
Q  273 ttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4153225 ttaatatatttgcatatgaaa--aaattgttataattatattgtacattcaattatataa 4153168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1036084 - 1035902
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctt---tttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    |||||| || ||    
T  1036084 gtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat----atttatattaat 1035989  T
Q  239 gtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1035988 gtgctacga------gtctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaa-aaatggttataattatatagtacatttaattatataa 1035902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 402
Target Start/End: Original strand, 26327754 - 26327904
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtat 350  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |    
T  26327754 tatgactggtttcttttgtttgctaatatacctgcatattaaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacg--t 26327850  T
Q  351 atcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26327851 atcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtgtagtat 26327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31187117 - 31186979
Alignment:
Q  256 ctggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcac 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |||||||  |||| |    
T  31187117 ctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcataataaaaaaaatggttataattatataatacatttaattatataattttttttattaacg--tatctc 31187020  T
Q  356 agccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcgg 394  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31187019 agccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcgg 31186979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6707691 - 6707612
Alignment:
Q  251 tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatata 331  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6707691 tatgtctggtttcttttgtttgttaatatatttgcatattgaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatata 6707612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31738357 - 31738255
Alignment:
Q  223 ttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacattt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31738357 ttatatttatgttaatgtgctacgagtcta------gtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaaaa-aaaaggttataattatattatacattt 31738265  T
Q  323 aattatataa 332  Q
    ||||||||||    
T  31738264 aattatataa 31738255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31740537 - 31740394
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata-------------gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaat 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||     
T  31740537 atcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataatataacattgatgtataacactgattgtgctatttttggtatattttgcgtatgcaaa 31740438  T
Q  188 tgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatattta 231  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31740437 tgactaatccccactctctttatcgtcaatattatttatattta 31740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 332
Target Start/End: Original strand, 3213134 - 3213175
Alignment:
Q  291 aaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3213134 aaaaaaaatggttataattatattgtacatttaattatataa 3213175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31195619 - 31195551
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaat 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| |||||||    
T  31195619 gtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaat 31195551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6708081 - 6708050
Alignment:
Q  30 aatatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6708081 aatatgtatcaggagagtatccgaagattaaa 6708050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7188100 - 7188059
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7188100 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 7188059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31195672 - 31195631
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31195672 atcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagt 31195631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43874 - 43621
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  43874 gtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtg 43775  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  43774 ctacga------gcctggtttcttgtgtttgttaatatacttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 43682  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  43681 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaaattttctgtatcggtgcagtat 43621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 202607 - 202321
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||          
T  202607 atataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtatatgtaattgactaatcat------ 202514  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggtta 304  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  202513 -ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttgtatattaa---aaatggtta 202418  T
Q  305 taattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202417 tatttatattgtatatttaattatataa-tttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatcatgatttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 202321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29913 - 29661
Alignment:
Q  142 gtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtg 241  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  29913 gtataaaactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgtg 29814  T
Q  242 ctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnna 341  Q
    ||||||      | ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |    
T  29813 ctacga------gcctgttttcttgtgtttgttaatatccttgcatattaaa--aaatggttataattatattgtacatttaattatataatttttttta 29722  T
Q  342 ttaacgtatatcacagccgt-tcgtatcttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29721 ttaacg--tatcccagccgtatcgtatcttgatttttgaaatttttccgtatcggtacagtat 29661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Original strand, 5930 - 6160
Alignment:
Q  104 gatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtata-----------acactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgact 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  5930 gatatagtataacattaacaatgttcctttttgatatagtatagcattgatataacaccgatggtgctctttttgg--tattttgtgtatgtaattgact 6027  T
Q  193 aatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttgcatattaa 292  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||      | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 aatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatatgatacga------gtctagtttcttgtgtttgttaatatatttgcatattaa 6121  T
Q  293 aagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6122 aaaaaat-gttataattatattatacatttaattatataa 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Original strand, 13664 - 13911
Alignment:
Q  105 atatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13664 atatagtataacagtaacaatgtacattttagatatagtataacactaattgtgctctttttgatatatattgtgtatgtcattgactaatcatcactct 13763  T
Q  205 cttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgctacgaacc--------------------tatgactggtttcatgtgtttgttaatatatttg 284  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| || ||                    ||||||||||||  | |||||| |||||||| ||    
T  13764 cttaatcgtcataattatttatattaatgtttatgtgctatgagcctctgagtttttttttagagatatgactggtttattttgtttgctaatatatctg 13863  T
Q  285 catattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataa 332  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13864 catattaaaaaaaattgttataattatattgtacatttaattatataa 13911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7583 - 7453
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  7583 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattatataa-tttttttattaacg--tatctcagccgtatcgtatc 7488  T
Q  369 ttga-ttttgaaatttttccatatcggtgcagtat 402  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7487 ttgatttttgaaatttttccgtatcggtgcagtat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25045 - 24923
Alignment:
Q  270 ttgttaatatatttgcatattaaaagaaatggttataattatatcgtacatttaattatataannnnnnnnattaacgtatatcacagccgt-tcgtatc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25045 ttgttaatatatttgcatattaaaa-aaatggttataattatattgtacatttaattgtataattttttttattaacg--tatcacagccgtatcgtatc 24949  T
Q  369 ttga-ttttgaaatttttccatatcg 393  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  24948 ttgatttttgaaatttttccgtatcg 24923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41331 - 41276
Alignment:
Q  178 tgtatgtaattgactaatcatcactatcttaatcgtcaacattatttatatttatg 233  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41331 tgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatg 41276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41406 - 41367
Alignment:
Q  101 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatata 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41406 atcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatata 41367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 868 times since January 2019
Visitors: 3069