View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0410_low_16 (Length: 318)

Name: NF0410_low_16
Description: NF0410
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0410_low_16
NF0410_low_16
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (2-234)||(10312-10544)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-234)||(16199531-16199765)
chr8 (1-234)||(31971257-31971491)
chr8 (1-234)||(45130883-45131117)
chr8 (16-234)||(21389353-21389571)
chr8 (21-234)||(21395888-21396101)
chr8 (21-234)||(21790381-21790594)
chr8 (34-234)||(21778697-21778897)
chr8 (1-234)||(21918885-21919121)
chr8 (2-234)||(20536208-20536443)
chr8 (5-234)||(18879126-18879352)
chr8 (21-234)||(22626736-22626951)
chr8 (2-234)||(18818295-18818530)
chr8 (2-234)||(21923814-21924049)
chr8 (6-233)||(28648934-28649164)
chr8 (21-234)||(7372778-7372986)
chr8 (21-234)||(23406379-23406597)
chr8 (6-237)||(6759255-6759487)
chr8 (21-234)||(22875065-22875281)
chr8 (2-233)||(23648554-23648788)
chr8 (6-234)||(16092231-16092463)
chr8 (138-234)||(5866297-5866395)
chr8 (138-234)||(17140916-17141014)
chr8 (139-234)||(21490995-21491092)
chr8 (118-234)||(6520368-6520486)
chr8 (162-234)||(38855300-38855372)
chr8 (162-234)||(23760893-23760962)
chr8 (2-98)||(25363026-25363123)
chr8 (138-227)||(13508108-13508199)
chr8 (117-218)||(20498578-20498681)
chr8 (138-234)||(17612133-17612231)
chr8 (163-218)||(24353036-24353091)
chr8 (163-218)||(37116363-37116418)
chr8 (161-218)||(19154935-19154992)
chr8 (117-215)||(21285616-21285716)
chr8 (138-234)||(21249384-21249483)
chr8 (138-234)||(21255222-21255321)
chr8 (85-231)||(14409459-14409606)
chr8 (163-218)||(17267044-17267099)
chr8 (71-215)||(16413316-16413462)
chr8 (162-215)||(983455-983508)
chr8 (138-227)||(13597640-13597731)
chr8 (136-231)||(20046261-20046357)
chr8 (162-230)||(26355747-26355815)
chr8 (85-231)||(1484402-1484549)
chr8 (85-231)||(5853307-5853454)
chr8 (163-218)||(17439557-17439612)
chr8 (85-231)||(20403227-20403374)
chr8 (85-231)||(22001753-22001900)
chr8 (85-231)||(4483281-4483427)
chr8 (85-231)||(41598188-41598335)
chr8 (136-231)||(15203297-15203393)
chr8 (172-231)||(4542477-4542535)
chr8 (172-231)||(19896265-19896323)
chr8 (181-231)||(26225359-26225409)
chr8 (136-218)||(19801448-19801530)
chr8 (166-215)||(21673723-21673772)
chr8 (117-215)||(26219733-26219831)
chr8 (136-215)||(15070574-15070654)
chr8 (181-237)||(19937118-19937174)
chr8 (163-219)||(22525573-22525628)
chr8 (136-215)||(45290761-45290841)
chr8 (165-219)||(20502154-20502207)
chr8 (166-218)||(28397566-28397617)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-234)||(32067-32300)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-234)||(937-1170)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (1-234)||(20309108-20309341)
chr2 (1-234)||(38001-38235)
chr2 (2-234)||(23285865-23286096)
chr2 (2-234)||(22731120-22731355)
chr2 (2-234)||(23654272-23654507)
chr2 (2-231)||(298700-298933)
chr2 (2-234)||(22738066-22738300)
chr2 (7-234)||(23060513-23060742)
chr2 (16-234)||(23076442-23076663)
chr2 (2-234)||(22337115-22337350)
chr2 (117-234)||(23103399-23103516)
chr2 (16-234)||(23660023-23660243)
chr2 (22-215)||(23708524-23708721)
chr2 (117-218)||(7735-7838)
chr2 (138-234)||(19671830-19671928)
chr2 (85-231)||(22105412-22105560)
chr2 (138-234)||(23071972-23072070)
chr2 (30-230)||(40622123-40622327)
chr2 (161-218)||(23207293-23207350)
chr2 (118-230)||(7679589-7679702)
chr2 (158-234)||(8946657-8946732)
chr2 (163-218)||(20520243-20520298)
chr2 (85-231)||(26505379-26505526)
chr2 (85-231)||(26507857-26508004)
chr2 (162-229)||(28405981-28406048)
chr2 (2-84)||(27753728-27753810)
chr2 (161-218)||(22413186-22413243)
chr2 (85-228)||(21155075-21155219)
chr2 (170-234)||(23040247-23040310)
chr2 (162-230)||(25175854-25175922)
chr2 (71-233)||(32214921-32215085)
chr2 (85-231)||(18808943-18809090)
chr2 (162-233)||(22134256-22134326)
chr2 (163-218)||(23004764-23004819)
chr2 (85-231)||(23130862-23131009)
chr2 (85-231)||(23133329-23133476)
chr2 (85-231)||(23135590-23135737)
chr2 (85-231)||(23709547-23709694)
chr2 (85-231)||(23712028-23712175)
chr2 (163-218)||(25108903-25108958)
chr2 (85-231)||(34402537-34402684)
chr2 (85-231)||(39682313-39682460)
chr2 (136-231)||(571397-571493)
chr2 (136-231)||(6725995-6726091)
chr2 (163-219)||(23287378-23287433)
chr2 (163-218)||(23791289-23791344)
chr2 (85-215)||(24367790-24367921)
chr2 (164-219)||(26392397-26392451)
chr2 (135-217)||(32451948-32452033)
chr2 (85-231)||(45029869-45030016)
chr2 (136-229)||(43137301-43137395)
chr2 (162-215)||(18786952-18787005)
chr2 (85-231)||(24898210-24898358)
chr2 (85-231)||(24900693-24900841)
chr2 (85-231)||(24903170-24903318)
chr2 (85-231)||(24905647-24905795)
chr2 (85-231)||(24908122-24908270)
chr2 (163-218)||(24697657-24697712)
chr2 (85-231)||(32039513-32039660)
chr2 (181-231)||(28577099-28577149)
chr2 (181-231)||(38967374-38967424)
chr2 (136-231)||(24529595-24529691)
chr2 (172-228)||(24643054-24643109)
chr2 (165-219)||(9241941-9241994)
chr2 (115-161)||(23019706-23019752)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-232)||(40443393-40443625)
chr7 (1-234)||(27847718-27847951)
chr7 (1-234)||(10589039-10589274)
chr7 (21-234)||(12698831-12699048)
chr7 (2-234)||(9509189-9509424)
chr7 (2-234)||(26211995-26212231)
chr7 (2-234)||(16386133-16386369)
chr7 (22-231)||(18456319-18456530)
chr7 (2-234)||(38227481-38227715)
chr7 (6-231)||(3564254-3564482)
chr7 (138-234)||(16495402-16495500)
chr7 (138-234)||(28505321-28505419)
chr7 (138-234)||(34200786-34200884)
chr7 (85-234)||(13647325-13647476)
chr7 (139-234)||(11996051-11996148)
chr7 (65-231)||(16213684-16213852)
chr7 (30-230)||(17137978-17138177)
chr7 (162-234)||(67745-67817)
chr7 (117-215)||(2280121-2280221)
chr7 (30-134)||(12187115-12187218)
chr7 (115-234)||(16219717-16219835)
chr7 (117-231)||(48273392-48273508)
chr7 (85-231)||(24704688-24704832)
chr7 (162-230)||(811180-811248)
chr7 (162-230)||(18005650-18005718)
chr7 (162-230)||(44014182-44014250)
chr7 (162-234)||(47831807-47831879)
chr7 (138-234)||(10063841-10063939)
chr7 (138-234)||(15754910-15755008)
chr7 (85-231)||(24702238-24702385)
chr7 (116-181)||(2530139-2530205)
chr7 (85-234)||(18430709-18430859)
chr7 (158-215)||(12901342-12901399)
chr7 (163-215)||(14044765-14044817)
chr7 (163-215)||(14354795-14354847)
chr7 (136-231)||(44116509-44116605)
chr7 (85-231)||(456321-456468)
chr7 (85-231)||(11972496-11972643)
chr7 (85-231)||(14949137-14949284)
chr7 (85-231)||(15376728-15376875)
chr7 (117-215)||(16056347-16056446)
chr7 (85-231)||(16232520-16232667)
chr7 (85-231)||(18640272-18640419)
chr7 (138-234)||(19486767-19486865)
chr7 (163-218)||(20220238-20220293)
chr7 (85-231)||(20385138-20385285)
chr7 (85-231)||(21189610-21189757)
chr7 (85-215)||(24275187-24275318)
chr7 (85-231)||(32125491-32125638)
chr7 (85-231)||(41522917-41523064)
chr7 (85-231)||(41525379-41525526)
chr7 (161-215)||(1868043-1868097)
chr7 (85-230)||(11393302-11393448)
chr7 (136-231)||(17061981-17062077)
chr7 (161-218)||(15008547-15008604)
chr7 (161-218)||(48991196-48991253)
chr7 (136-231)||(16410059-16410155)
chr7 (166-234)||(22072913-22072981)
chr7 (163-206)||(14036282-14036325)
chr7 (163-206)||(14346312-14346355)
chr7 (85-231)||(27216860-27217007)
chr7 (136-231)||(13869346-13869442)
chr7 (172-231)||(3386333-3386391)
chr7 (162-212)||(12255842-12255892)
chr7 (153-215)||(18154882-18154943)
chr7 (181-231)||(20110556-20110606)
chr7 (139-231)||(13831373-13831466)
chr7 (171-215)||(15144096-15144139)
chr7 (163-218)||(18203828-18203882)
chr7 (137-207)||(15211484-15211557)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-234)||(16282-16515)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-234)||(13497-13731)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-234)||(15350-15584)
scaffold0114 (66-230)||(7295-7459)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-234)||(1289-1522)
scaffold0106 (1-234)||(7266-7499)
scaffold0106 (165-231)||(15291-15356)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-234)||(17046487-17046720)
chr4 (1-234)||(14053187-14053422)
chr4 (1-234)||(12902757-12902993)
chr4 (2-234)||(7088877-7089112)
chr4 (2-232)||(22636437-22636669)
chr4 (2-234)||(44052829-44053064)
chr4 (2-227)||(23374245-23374473)
chr4 (2-234)||(7893703-7893935)
chr4 (25-234)||(16270145-16270356)
chr4 (6-231)||(16377413-16377639)
chr4 (2-234)||(16239856-16240090)
chr4 (53-234)||(7798774-7798958)
chr4 (22-229)||(14038653-14038863)
chr4 (65-234)||(6899891-6900062)
chr4 (115-234)||(52873367-52873488)
chr4 (138-234)||(15551817-15551915)
chr4 (65-218)||(13800-13956)
chr4 (16-108)||(3096772-3096864)
chr4 (153-234)||(3096293-3096373)
chr4 (85-232)||(22353835-22353984)
chr4 (62-148)||(15121749-15121834)
chr4 (62-181)||(43256106-43256227)
chr4 (162-230)||(12774011-12774079)
chr4 (162-234)||(39706337-39706409)
chr4 (117-231)||(14280316-14280431)
chr4 (162-215)||(12288259-12288312)
chr4 (161-218)||(46640504-46640561)
chr4 (162-215)||(52243245-52243298)
chr4 (85-231)||(18215289-18215436)
chr4 (85-231)||(44928894-44929042)
chr4 (163-218)||(53082202-53082257)
chr4 (117-231)||(54798756-54798872)
chr4 (71-231)||(23803265-23803427)
chr4 (2-98)||(17047958-17048055)
chr4 (162-230)||(8846360-8846428)
chr4 (71-237)||(19242693-19242861)
chr4 (71-233)||(19618172-19618336)
chr4 (85-231)||(12322-12469)
chr4 (135-217)||(6190479-6190564)
chr4 (85-231)||(15118367-15118514)
chr4 (85-231)||(44615288-44615435)
chr4 (85-231)||(52312510-52312657)
chr4 (71-231)||(3515007-3515169)
chr4 (169-215)||(43198611-43198657)
chr4 (71-231)||(51463868-51464030)
chr4 (117-215)||(8574871-8574969)
chr4 (65-231)||(1837503-1837671)
chr4 (136-231)||(44773153-44773249)
chr4 (85-231)||(18239434-18239581)
chr4 (85-231)||(50222354-50222501)
chr4 (71-231)||(12610950-12611105)
chr4 (136-215)||(15355391-15355471)
chr4 (172-231)||(7641286-7641344)
chr4 (136-234)||(15367690-15367789)
chr4 (136-234)||(15370018-15370117)
chr4 (136-234)||(15371202-15371301)
chr4 (136-234)||(15373483-15373582)
chr4 (136-234)||(15402703-15402802)
chr4 (181-231)||(44102214-44102264)
chr4 (181-234)||(16223532-16223585)
chr4 (163-219)||(17333292-17333347)
chr4 (71-215)||(14970707-14970853)
chr4 (138-196)||(16596686-16596746)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-234)||(46995-47222)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (2-234)||(16920519-16920751)
chr6 (62-234)||(35245586-35245758)
chr6 (2-234)||(22831503-22831737)
chr6 (2-234)||(20360846-20361081)
chr6 (1-222)||(11185517-11185738)
chr6 (2-234)||(20638169-20638404)
chr6 (22-234)||(29060540-29060755)
chr6 (16-234)||(19303441-19303661)
chr6 (84-234)||(16496244-16496396)
chr6 (5-234)||(22780116-22780348)
chr6 (21-234)||(17287701-17287917)
chr6 (6-233)||(18409717-18409947)
chr6 (21-234)||(25629260-25629476)
chr6 (23-234)||(20593773-20593987)
chr6 (70-234)||(20076700-20076863)
chr6 (89-215)||(20109157-20109285)
chr6 (162-234)||(27333267-27333339)
chr6 (162-234)||(27394007-27394079)
chr6 (138-234)||(28496494-28496592)
chr6 (138-234)||(29808905-29809003)
chr6 (117-234)||(23019408-23019525)
chr6 (62-181)||(27415887-27416008)
chr6 (136-231)||(25656629-25656725)
chr6 (138-234)||(1561303-1561401)
chr6 (89-231)||(1595549-1595692)
chr6 (85-231)||(2291195-2291342)
chr6 (117-215)||(25644339-25644440)
chr6 (169-215)||(19668390-19668436)
chr6 (71-231)||(25754809-25754971)
chr6 (162-215)||(9098563-9098616)
chr6 (163-216)||(23076748-23076801)
chr6 (163-216)||(35008166-35008219)
chr6 (162-230)||(19652199-19652267)
chr6 (136-231)||(22782227-22782323)
chr6 (71-233)||(30676710-30676874)
chr6 (138-234)||(8227534-8227632)
chr6 (85-231)||(12742317-12742464)
chr6 (85-231)||(18334607-18334754)
chr6 (85-231)||(19005046-19005193)
chr6 (85-231)||(19858934-19859081)
chr6 (85-231)||(24422547-24422694)
chr6 (85-231)||(33861794-33861941)
chr6 (85-231)||(33864278-33864425)
chr6 (161-219)||(33443062-33443119)
chr6 (71-233)||(34963371-34963535)
chr6 (85-231)||(1540926-1541073)
chr6 (85-231)||(8055029-8055176)
chr6 (85-231)||(26924655-26924802)
chr6 (85-218)||(18456732-18456866)
chr6 (85-218)||(18461892-18462026)
chr6 (188-234)||(22080800-22080846)
chr6 (172-234)||(25714417-25714478)
chr6 (121-211)||(4185827-4185919)
chr6 (153-230)||(22432249-22432325)
chr6 (153-230)||(22438799-22438875)
chr6 (136-215)||(25688518-25688598)
chr6 (172-218)||(18821904-18821949)
chr6 (136-228)||(16448593-16448686)
chr6 (136-231)||(20556958-20557054)
chr6 (172-231)||(3852121-3852179)
chr6 (168-219)||(18199473-18199523)
chr6 (165-219)||(18453197-18453250)
chr6 (121-211)||(4186390-4186482)
chr6 (153-230)||(19873120-19873196)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-234)||(51582-51815)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-234)||(21292855-21293090)
chr5 (2-234)||(23390382-23390617)
chr5 (2-234)||(22075018-22075254)
chr5 (2-234)||(8286728-8286964)
chr5 (2-234)||(24493569-24493803)
chr5 (6-234)||(25421532-25421763)
chr5 (6-214)||(25431414-25431625)
chr5 (6-234)||(9077952-9078183)
chr5 (2-234)||(13025311-13025545)
chr5 (2-234)||(13095495-13095729)
chr5 (70-234)||(21808343-21808510)
chr5 (84-234)||(21729033-21729185)
chr5 (16-231)||(24529223-24529441)
chr5 (117-227)||(37723910-37724020)
chr5 (21-234)||(1096467-1096683)
chr5 (136-234)||(21997555-21997655)
chr5 (138-234)||(36314577-36314675)
chr5 (162-234)||(19660884-19660956)
chr5 (118-234)||(21329500-21329618)
chr5 (2-99)||(22107259-22107357)
chr5 (162-234)||(21502205-21502277)
chr5 (118-218)||(20026942-20027046)
chr5 (30-230)||(22032323-22032520)
chr5 (30-230)||(18769919-18770118)
chr5 (136-215)||(26012056-26012137)
chr5 (62-181)||(18356367-18356488)
chr5 (117-218)||(22144065-22144168)
chr5 (162-230)||(22959581-22959649)
chr5 (62-134)||(23572180-23572252)
chr5 (119-230)||(21565546-21565659)
chr5 (22-231)||(22412187-22412388)
chr5 (85-231)||(29329934-29330081)
chr5 (62-181)||(20910745-20910866)
chr5 (161-218)||(22178269-22178326)
chr5 (136-231)||(11581265-11581361)
chr5 (85-231)||(264783-264930)
chr5 (85-231)||(10732955-10733102)
chr5 (85-231)||(20909012-20909159)
chr5 (85-231)||(39363384-39363531)
chr5 (22-215)||(18418599-18418793)
chr5 (162-234)||(19668898-19668970)
chr5 (136-215)||(20902075-20902155)
chr5 (136-231)||(39245136-39245232)
chr5 (138-234)||(40725853-40725951)
chr5 (85-231)||(42245380-42245527)
chr5 (164-218)||(26740697-26740750)
chr5 (85-231)||(36154798-36154942)
chr5 (164-213)||(26732884-26732932)
chr5 (136-231)||(2154680-2154776)
chr5 (172-231)||(20918052-20918110)
chr5 (85-231)||(29345980-29346127)
chr5 (165-219)||(15796434-15796487)
chr5 (165-219)||(23469818-23469871)
chr5 (181-231)||(38619434-38619484)
chr5 (136-228)||(18319100-18319193)
chr5 (181-230)||(23064512-23064561)
chr5 (181-218)||(27988997-27989034)
chr5 (183-231)||(10775790-10775838)
chr5 (136-231)||(31061068-31061164)
chr5 (85-231)||(32027393-32027540)
chr5 (153-215)||(26704090-26704151)
chr5 (153-215)||(26973823-26973884)
chr5 (165-218)||(21328268-21328320)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-234)||(4712-4947)
scaffold0358 (1-159)||(13-171)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-231)||(5016-5246)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (1-234)||(38801276-38801508)
chr1 (18-234)||(27250631-27250850)
chr1 (2-234)||(21026680-21026915)
chr1 (6-233)||(50210103-50210333)
chr1 (6-231)||(34509783-34510011)
chr1 (2-159)||(22354458-22354616)
chr1 (6-234)||(22532269-22532500)
chr1 (21-233)||(20135188-20135403)
chr1 (23-233)||(22468604-22468816)
chr1 (138-234)||(14295574-14295672)
chr1 (117-218)||(21896258-21896361)
chr1 (140-234)||(45574912-45575008)
chr1 (158-234)||(20847200-20847275)
chr1 (117-218)||(21861572-21861675)
chr1 (62-181)||(33797573-33797694)
chr1 (21-98)||(48603652-48603730)
chr1 (2-125)||(22356060-22356185)
chr1 (2-125)||(22357746-22357871)
chr1 (136-218)||(35261099-35261183)
chr1 (162-230)||(22921918-22921986)
chr1 (163-218)||(50614167-50614222)
chr1 (163-218)||(50621995-50622050)
chr1 (162-234)||(33681010-33681079)
chr1 (165-218)||(16368338-16368391)
chr1 (138-215)||(20918623-20918702)
chr1 (85-231)||(433012-433157)
chr1 (136-215)||(21754064-21754145)
chr1 (117-234)||(22237630-22237746)
chr1 (71-231)||(23593735-23593897)
chr1 (162-215)||(16758668-16758721)
chr1 (161-218)||(41050084-41050141)
chr1 (85-231)||(13988866-13989013)
chr1 (71-232)||(21840766-21840929)
chr1 (85-231)||(21923306-21923453)
chr1 (85-231)||(29776688-29776835)
chr1 (85-231)||(31612313-31612460)
chr1 (164-218)||(50686627-50686681)
chr1 (162-234)||(52928019-52928088)
chr1 (162-230)||(20248283-20248351)
chr1 (165-233)||(20454606-20454673)
chr1 (136-215)||(22123133-22123214)
chr1 (136-234)||(13212928-13213027)
chr1 (139-237)||(15860078-15860177)
chr1 (161-216)||(16093933-16093988)
chr1 (85-231)||(21475102-21475249)
chr1 (163-218)||(26064954-26065009)
chr1 (136-237)||(21342090-21342192)
chr1 (71-233)||(16361915-16362079)
chr1 (136-231)||(21346961-21347057)
chr1 (172-231)||(29298137-29298195)
chr1 (134-231)||(16275428-16275526)
chr1 (181-231)||(21707167-21707217)
chr1 (181-231)||(21711709-21711759)
chr1 (153-230)||(21714546-21714622)
chr1 (163-219)||(21533923-21533978)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (2-234)||(20698322-20698556)
chr3 (2-234)||(13442274-13442509)
chr3 (2-234)||(17487856-17488091)
chr3 (2-234)||(17499338-17499573)
chr3 (18-234)||(12399209-12399428)
chr3 (6-234)||(14972854-14973085)
chr3 (2-234)||(23083247-23083482)
chr3 (2-215)||(14576719-14576934)
chr3 (21-234)||(26686887-26687103)
chr3 (7-234)||(43840932-43841162)
chr3 (6-234)||(18438534-18438765)
chr3 (22-231)||(24153115-24153326)
chr3 (21-234)||(25476290-25476506)
chr3 (2-215)||(14572608-14572823)
chr3 (21-234)||(11424668-11424880)
chr3 (6-231)||(40213611-40213838)
chr3 (138-234)||(13210350-13210448)
chr3 (16-215)||(42386429-42386632)
chr3 (162-230)||(49668125-49668193)
chr3 (138-234)||(24340746-24340844)
chr3 (136-234)||(43550544-43550644)
chr3 (21-98)||(14179570-14179648)
chr3 (117-234)||(15470927-15471043)
chr3 (162-230)||(9512924-9512992)
chr3 (162-230)||(9520899-9520967)
chr3 (162-230)||(12174308-12174376)
chr3 (163-218)||(22110402-22110457)
chr3 (163-218)||(43925974-43926029)
chr3 (66-230)||(856140-856304)
chr3 (161-230)||(37251216-37251283)
chr3 (117-231)||(27165250-27165366)
chr3 (162-215)||(32307696-32307749)
chr3 (162-218)||(52523778-52523834)
chr3 (85-231)||(9707622-9707769)
chr3 (118-234)||(14234487-14234605)
chr3 (85-231)||(29172598-29172745)
chr3 (71-231)||(17672626-17672788)
chr3 (169-231)||(28194693-28194755)
chr3 (71-215)||(50242838-50242984)
chr3 (85-218)||(53070668-53070802)
chr3 (136-231)||(53301572-53301669)
chr3 (165-218)||(606378-606431)
chr3 (2-98)||(16796685-16796782)
chr3 (117-231)||(36166598-36166712)
chr3 (161-217)||(12377938-12377994)
chr3 (166-230)||(16097332-16097396)
chr3 (162-230)||(16103784-16103852)
chr3 (138-215)||(23274706-23274785)
chr3 (85-231)||(7781362-7781509)
chr3 (71-232)||(13544024-13544187)
chr3 (85-231)||(17463178-17463325)
chr3 (85-231)||(28848626-28848773)
chr3 (85-231)||(34159326-34159473)
chr3 (138-234)||(37642288-37642386)
chr3 (85-231)||(45606922-45607069)
chr3 (85-231)||(55476491-55476638)
chr3 (71-215)||(12567576-12567722)
chr3 (119-231)||(55500942-55501055)
chr3 (136-231)||(6469200-6469296)
chr3 (136-231)||(8499518-8499614)
chr3 (136-231)||(15977515-15977611)
chr3 (85-231)||(8899094-8899241)
chr3 (85-231)||(16454296-16454443)
chr3 (85-215)||(38961906-38962037)
chr3 (117-215)||(21618465-21618563)
chr3 (136-231)||(12119791-12119887)
chr3 (85-231)||(13151805-13151953)
chr3 (85-231)||(13154270-13154418)
chr3 (163-219)||(13919344-13919399)
chr3 (136-231)||(15412429-15412525)
chr3 (85-231)||(10247738-10247885)
chr3 (139-229)||(16282880-16282971)
chr3 (85-231)||(17446670-17446816)
chr3 (172-231)||(17737236-17737294)
chr3 (181-231)||(10556985-10557035)
chr3 (181-231)||(45577950-45578000)
chr3 (181-229)||(41123892-41123940)
chr3 (136-231)||(44494809-44494905)
chr3 (138-234)||(22147548-22147646)
chr3 (165-218)||(15246034-15246086)
chr3 (153-230)||(15878092-15878168)
chr3 (153-230)||(23408428-23408504)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (2-234)||(935-1169)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (2-234)||(167865-168099)
scaffold0011 (2-234)||(51913-52148)
scaffold0011 (165-218)||(38204-38256)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-234)||(13211-13446)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (2-234)||(1851-2086)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-234)||(1952-2188)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (2-234)||(3470-3705)
scaffold0292 (21-234)||(343-558)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (2-234)||(20910-21146)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-234)||(6007-6245)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (27-234)||(4849-5059)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (21-215)||(24206-24405)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (6-234)||(3041-3271)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (2-234)||(38761-38995)
scaffold0145 (25-234)||(32942-33153)
scaffold0145 (136-236)||(9744-9845)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-234)||(8438-8650)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (6-232)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-232)||(75105-75333)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (6-231)||(339840-340065)
scaffold0003 (62-181)||(71353-71474)
scaffold0003 (85-231)||(158465-158612)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (6-233)||(17105-17337)
scaffold0056 (172-218)||(79388-79433)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (117-233)||(174767-174883)
scaffold0021 (2-146)||(124675-124820)
scaffold0021 (164-234)||(121766-121835)
scaffold0021 (158-218)||(136414-136474)
scaffold0021 (158-218)||(145122-145182)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (6-227)||(25955-26179)
scaffold0122 (117-231)||(44709-44825)
scaffold0122 (6-82)||(33385-33461)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-234)||(25896-26111)
scaffold0026 (21-234)||(39858-40073)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (6-234)||(39913-40143)
scaffold0080 (161-218)||(19933-19990)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (6-231)||(22886-23113)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (33-233)||(3103-3306)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (98-234)||(28414-28552)
scaffold0046 (138-234)||(11292-11390)
scaffold0046 (138-234)||(1997-2095)
scaffold0046 (178-234)||(4552-4608)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (62-234)||(32904-33077)
scaffold0120 (62-234)||(45928-46101)
scaffold0120 (26-234)||(16113-16323)
scaffold0120 (172-234)||(17389-17450)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-174)||(6669-6846)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (6-234)||(16490-16721)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-234)||(8479-8710)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (6-234)||(4508-4738)
scaffold0228 (6-234)||(12090-12320)
scaffold0228 (6-234)||(22042-22272)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (21-184)||(13141-13308)
scaffold0175 (138-234)||(34123-34221)
scaffold0175 (181-234)||(273-326)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (119-234)||(11447-11564)
scaffold0235 (2-43)||(11399-11440)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (30-218)||(26840-27027)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (138-234)||(1092-1190)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (162-234)||(119875-119947)
scaffold0023 (117-230)||(100378-100493)
scaffold0023 (85-231)||(44454-44602)
scaffold0023 (163-230)||(40224-40291)
scaffold0023 (85-231)||(94411-94558)
scaffold0023 (71-215)||(17440-17586)
scaffold0023 (162-230)||(101503-101571)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (66-230)||(1881-2045)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (30-230)||(21721-21920)
scaffold0210 (30-230)||(29613-29812)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (65-218)||(53498-53654)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (117-218)||(1048-1151)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (117-230)||(2808-2923)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (162-234)||(6535-6607)
scaffold0621 (89-215)||(8485-8613)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (117-218)||(12584-12687)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (138-231)||(15664-15759)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (136-215)||(32555-32636)
scaffold0034 (135-217)||(51903-51987)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (2-98)||(1052-1149)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (6-154)||(27912-28061)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (117-218)||(13144-13247)
scaffold0357 (136-215)||(16121-16202)
scaffold0357 (163-218)||(2677-2732)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (162-234)||(6611-6683)
scaffold0333 (162-234)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (162-234)||(6172-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (162-230)||(19268-19336)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (62-134)||(12859-12931)
scaffold0029 (71-214)||(11305-11450)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (162-234)||(15826-15898)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (158-218)||(60761-60821)
scaffold0010 (117-215)||(129924-130024)
scaffold0010 (166-219)||(662-714)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (138-234)||(11464-11562)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (138-234)||(18050-18148)
scaffold0247 (136-215)||(2195-2275)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (138-234)||(38279-38377)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (163-230)||(14747-14814)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (71-215)||(4710-4856)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (117-234)||(10543-10659)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (161-215)||(25125-25179)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (62-181)||(15362-15483)
scaffold0107 (165-219)||(36195-36248)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (162-234)||(23932-24001)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (21-213)||(4545-4739)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (165-218)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (161-218)||(6332-6389)
scaffold0420 (168-218)||(13793-13843)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (158-215)||(8119-8176)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (117-231)||(38704-38820)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (136-230)||(160688-160784)
scaffold0001 (71-215)||(501100-501246)
scaffold0001 (136-231)||(85646-85742)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (162-218)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (162-234)||(1083-1155)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (162-230)||(2694-2762)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (2-78)||(3640-3716)
scaffold0165 (2-78)||(7704-7780)
scaffold0165 (136-215)||(27770-27851)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (85-218)||(20394-20527)
scaffold0031 (70-159)||(128827-128917)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (71-228)||(4300-4459)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (163-218)||(129021-129075)
scaffold0022 (165-218)||(78338-78391)
scaffold0022 (117-231)||(116430-116544)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (161-211)||(38339-38389)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (117-234)||(22672-22788)
scaffold0037 (71-231)||(82072-82234)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (162-215)||(1101-1154)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (16-159)||(3429-3574)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (162-215)||(5662-5715)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (118-234)||(12942-13057)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (161-218)||(2691-2748)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (136-231)||(16784-16880)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (162-230)||(45841-45909)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (170-230)||(132662-132722)
scaffold0028 (85-231)||(136680-136827)
scaffold0028 (85-231)||(139149-139296)
scaffold0028 (85-231)||(144087-144234)
scaffold0028 (162-215)||(62217-62270)
scaffold0028 (85-231)||(134211-134358)
scaffold0028 (85-231)||(141618-141765)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (118-234)||(12766-12884)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (71-232)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (85-231)||(13392-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (85-231)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (85-231)||(37821-37968)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (6-77)||(10323-10394)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (163-218)||(97021-97076)
scaffold0006 (163-218)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (71-231)||(106-268)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (117-215)||(10546-10646)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (161-218)||(267676-267733)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (162-230)||(133-201)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (170-230)||(32102-32162)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (167-234)||(4888-4954)
scaffold0395 (34-174)||(881-1021)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (85-231)||(13947-14094)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (161-215)||(103679-103733)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (162-230)||(28818-28887)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (136-215)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (136-231)||(40400-40496)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (136-231)||(161156-161252)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (71-232)||(9241-9404)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (172-218)||(11979-12024)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (163-213)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (161-218)||(1846-1903)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (115-218)||(8059-8166)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (85-231)||(12064-12205)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (153-230)||(23843-23919)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (136-231)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (71-233)||(12249-12413)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (2-57)||(17873-17928)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (181-230)||(36454-36503)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (165-218)||(7447-7499)
scaffold0111 (165-218)||(14566-14618)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (166-219)||(3272-3324)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (137-207)||(192997-193070)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (153-230)||(69794-69870)
scaffold0004 (30-99)||(69930-70000)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (163-219)||(17517-17572)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (115-230)||(4804-4921)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (166-218)||(30347-30398)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 10312 - 10544
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 10411  T
Q  102 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10412 atatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgca 10511  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10512 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16199531 - 16199765
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16199531 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaag 16199630  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctg 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16199631 aatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 16199730  T
Q  200 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199731 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31971491 - 31971257
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31971491 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 31971392  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31971391 aatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 31971293  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971292 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 45130883 - 45131117
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45130883 gattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 45130982  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45130983 aataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 45131081  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131082 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat 115  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 21389452  T
Q  116 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389453 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21389553 atgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 220  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  221 gaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 220  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  221 gaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  134 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21918885 - 21919121
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21918885 gattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 21918984  T
Q  101 aa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
    || |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21918985 aattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 21919083  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919084 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20536443 - 20536208
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  20536443 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 20536344  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20536343 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagc 20536245  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20536244 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 18879126 - 18879352
Alignment:
Q  5 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaa 102  Q
    |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18879126 aagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaa 18879223  T
Q  103 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18879224 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 18879320  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18879321 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 18818295 - 18818530
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18818295 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 18818394  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18818395 tataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 18818493  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18818494 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 21923814 - 21924049
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||||||||    
T  21923814 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaag 21923913  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21923914 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagc 21924012  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21924013 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Original strand, 28648934 - 28649164
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||     
T  28648934 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 28649033  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28649034 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgca 28649132  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28649133 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  120 tgtt--gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    || |  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6759487 - 6759255
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 103  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||    
T  6759487 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattat 6759388  T
Q  104 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
       ||||||  | |||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6759387 gagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgc 6759292  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6759291 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  217 tgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23648788 - 23648554
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23648788 attaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaag 23648689  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
      |  ||| |||  |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  23648688 ttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagt 23648590  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23648589 tgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 16092231 - 16092463
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 103  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||    
T  16092231 agacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattat 16092330  T
Q  104 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
       ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16092331 gaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgc 16092429  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092430 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  139 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 25363026 - 25363123
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363026 attaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgtt-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32300 - 32067
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32300 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 32201  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctg 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32200 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 32102  T
Q  200 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32101 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 937 - 1170
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  937 gattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 1036  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1037 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgc 1136  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1137 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20309341 - 20309108
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20309341 gattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 20309242  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20309241 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgc 20309142  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309141 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38001 - 38235
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38001 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 38100  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38101 aatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 38199  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38200 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23286096 - 23285865
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23286096 attaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaag 23285997  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23285996 aacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 23285899  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285898 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 22731120 - 22731355
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22731120 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 22731219  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22731220 aatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 22731318  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22731319 tgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 23654272 - 23654507
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  23654272 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagt 23654371  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  23654372 aatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagc 23654470  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654471 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 298700 - 298933
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  298700 attaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 298799  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298800 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 298899  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298900 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 22738066 - 22738300
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22738066 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 22738165  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||| ||||||||||    
T  22738166 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagc 22738263  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22738264 tgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060513
Alignment:
Q  7 gacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatat 105  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  106 ttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
    ||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 23060545  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23060544 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23076663 - 23076442
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  23076663 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 23076564  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076563 taagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23076465  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  23076464 taagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22337350 - 22337115
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||     
T  22337350 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 22337251  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     ||   ||||||  | |||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22337250 tatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagc 22337152  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337151 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23660243 - 23660023
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 114  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||      
T  23660243 atgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatt 23660144  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  23660143 taagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtct 23660045  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  23660044 aagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708721
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 124  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  125 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 222  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  223 agatgatg 230  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  216 atgttgaagatgatg 230  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27753810 - 27753728
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 84  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753810 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 32451948 - 32452033
Alignment:
Q  135 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451948 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241941
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgtt-gtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 9241941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 161  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40443625 - 40443393
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443625 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 40443526  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctg 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443525 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctg 40443426  T
Q  200 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443425 cacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 27847718 - 27847951
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27847718 gattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaag 27847817  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27847818 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgc 27847917  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847918 atgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10589274 - 10589039
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10589274 gattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaag 10589175  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10589174 aatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagc 10589076  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589075 tgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9509424 - 9509189
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  9509424 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaag 9509325  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  9509324 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagc 9509226  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9509225 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26212231 - 26211995
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||      
T  26212231 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 26212132  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  26212131 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagt 26212033  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 234  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212032 tgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 16386133 - 16386369
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||      
T  16386133 attaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga 16386232  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16386233 attgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagc 16386332  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386333 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  219 ttgaagatgatga 231  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38227715 - 38227481
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  38227715 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaag 38227616  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  38227615 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagct 38227517  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227516 gcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 3564254 - 3564482
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||     
T  3564254 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatg 3564353  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3564354 aatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 3564452  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3564453 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  139 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  65 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 160  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  130 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187115
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  130 ttgaa 134  Q
    |||||    
T  12187119 ttgaa 12187115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  185 taattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 17061981 - 17062077
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061981 ttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  139 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  171 atgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211484
Alignment:
Q  137 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16515 - 16282
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16515 gattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 16416  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16415 aatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgc 16316  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16315 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13731 - 13497
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13731 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 13632  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13631 aatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 13533  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13532 gcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15350 - 15584
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15350 gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaag 15449  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15450 aatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagct 15548  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15549 gcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  66 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 163  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 1289
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1522 gattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 1423  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1422 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 1323  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1322 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7266
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7499 gattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 7400  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7399 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 7300  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7299 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17046720 - 17046487
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17046720 gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaag 17046621  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046620 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 17046521  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046520 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14053187 - 14053422
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14053187 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 14053286  T
Q  101 aatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |    
T  14053287 aatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagtt 14053386  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053387 gcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12902993 - 12902757
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaa 99  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12902993 gattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaa 12902894  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
     |||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12902893 taatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 12902795  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902794 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7089112 - 7088877
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  7089112 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaat 7089013  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7089012 aatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 7088914  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088913 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22636669 - 22636437
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22636669 attaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 22636571  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22636570 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagc 22636472  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22636471 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44053064 - 44052829
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44053064 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaa 44052966  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||    
T  44052965 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgag 44052867  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052866 ctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 23374245 - 23374473
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  23374245 attaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 23374344  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23374345 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 23374443  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374444 tgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893703
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagc 7893740  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893739 tgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  25 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  124 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 221  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  222 aagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 16377413 - 16377639
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  16377413 agacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16377512  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatg 203  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16377513 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatg 16377611  T
Q  204 agtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16377612 agtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 16239856 - 16240090
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||    
T  16239856 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaag 16239955  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| |    
T  16239956 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagtt 16240054  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240055 gcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  53 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 151  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  152 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  218 gttgaagatgat 229  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  65 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  65 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 161  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3096864 - 3096772
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096864 atgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 148  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 159  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  160 -gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 44928894 - 44929042
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  44928894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt 44928993  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928994 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 17047958 - 17048055
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||  | |||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17047958 attaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    |  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190479
Alignment:
Q  135 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    || | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  65 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 160  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  170 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47222 - 46995
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  47222 gattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggag 47129  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  47128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctac 47029  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47028 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 16920519 - 16920751
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16920519 attaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaaga 16920618  T
Q  102 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16920619 atatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgca 16920718  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920719 tgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22831737 - 22831503
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22831737 attaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaaga 22831638  T
Q  102 atatttgtatacat--aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctg 199  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22831637 atgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 22831538  T
Q  200 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831537 catgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 20360846 - 20361081
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20360846 attaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 20360945  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20360946 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 20361044  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361045 tgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11185738 - 11185517
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  11185738 gattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaag 11185639  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11185638 aatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 11185539  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11185538 atgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 20638169 - 20638404
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20638169 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaag 20638268  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    ||| |||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  20638269 aatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagc 20638367  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638368 tgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 19303441 - 19303661
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||     
T  19303441 atgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataa 19303539  T
Q  114 ataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
     | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  84 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 180  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780348
Alignment:
Q  5 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 103  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  104 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    | ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgc 22780314  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22780315 atgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  217 tgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Original strand, 18409717 - 18409947
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||     
T  18409717 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatg 18409816  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      || ||   | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18409817 aatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgca 18409915  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18409916 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  217 tgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  23 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  122 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  219 ttgaagatgatgatgt 234  Q
     |||||||||||||||    
T  20593788 atgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  70 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 166  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  89 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 186  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  187 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  159 tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  89 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 185  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  186 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  214 ag 215  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 22080800 - 22080846
Alignment:
Q  188 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080800 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  168 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453197
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgt 18453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51815 - 51582
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  51815 gattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaag 51716  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51715 gatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 51616  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51615 atgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21292855 - 21293090
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21292855 gattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 21292954  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21292955 aataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 21293053  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293054 tgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 23390382 - 23390617
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23390382 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 23390481  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23390482 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 23390580  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23390581 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22075254 - 22075018
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  22075254 attaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 22075155  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22075154 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 22075056  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 234  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075055 tgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 8286728 - 8286964
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  8286728 attaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 8286827  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
    ||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8286828 aatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 8286926  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286927 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24493803 - 24493569
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  24493803 attaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaag 24493704  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  24493703 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagct 24493605  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24493604 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25421763 - 25421532
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  25421763 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25421664  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
     ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  25421663 attgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgca 25421565  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25421564 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25431625 - 25431414
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  25431625 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25431526  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
     ||| | |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  25431525 attgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgca 25431427  T
Q  202 tgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  25431426 tgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9078183 - 9077952
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||     
T  9078183 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatg 9078084  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9078083 aatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 9077985  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9077984 tgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13025545 - 13025311
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  13025545 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaa 13025447  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  13025446 gtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgc 13025348  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13025347 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13095729 - 13095495
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  13095729 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaa 13095631  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  13095630 gtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgc 13095532  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13095531 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  70 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 165  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  84 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 180  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24529441 - 24529223
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||      
T  24529441 atgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataat 24529342  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529341 taagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24529243  T
Q  212 taagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  24529242 taagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  217 tgttgaagatg 227  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  217 tgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  233 gt 234  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 22107259 - 22107357
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107259 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  214 agatg 218  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  130 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  130 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  160 gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22144168 - 22144065
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22144168 agatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22144069  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  22144068 gatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 134  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  217 tgttgaagatgatg 230  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  122 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  220 tgaagatgatga 231  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  159 tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----t 36154892  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 218
Target Start/End: Original strand, 27988997 - 27989034
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988997 ttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  183 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328320
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgct-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 21328320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4947 - 4712
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4947 gattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaag 4848  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  4847 aatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagc 4749  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4748 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 171 - 13
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  171 gattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaag 72  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  71 aatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5016 - 5246
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  5016 gattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaag 5115  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5116 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgc 5215  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5216 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38801276 - 38801508
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38801276 gattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 38801375  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgc 200  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38801376 aataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 38801475  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801476 atgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 27250631 - 27250850
Alignment:
Q  18 gaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  27250631 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattta 27250730  T
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27250829  T
Q  214 agatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27250830 agttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21026915 - 21026680
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  21026915 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 21026816  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  21026815 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagc 21026717  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026716 tgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Original strand, 50210103 - 50210333
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  50210103 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 50210202  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50210203 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 50210301  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50210302 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34510011 - 34509783
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||     
T  34510011 agacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatg 34509912  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34509911 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 34509813  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34509812 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 22354458 - 22354616
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22354458 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaag 22354557  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 159  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354558 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22532500 - 22532269
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  22532500 agacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 22532401  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      || |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  22532400 aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgca 22532302  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22532301 tgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  217 tgttgaagatgatgatg 233  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  23 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  122 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  219 ttgaagatgatgatg 233  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 234
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  140 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  159 tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 22356060 - 22356185
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22356060 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22356159  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttga 125  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356160 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 22357746 - 22357871
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22357746 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22357845  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttga 125  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357846 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 433157 - 433012
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||        
T  433157 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---- 433062  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433061 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 233
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  139 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  233 gtcca 237  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  134 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgtt-gtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 20698322 - 20698556
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20698322 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 20698421  T
Q  102 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20698422 atatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 20698520  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698521 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13442509 - 13442274
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  13442509 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 13442410  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  13442409 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagc 13442311  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442310 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17488091 - 17487856
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17488091 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17487992  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  17487991 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagc 17487893  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487892 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17499573 - 17499338
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17499573 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17499474  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  17499473 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagc 17499375  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499374 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12399428 - 12399209
Alignment:
Q  18 gaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatga-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  12399428 gaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatattta 12399329  T
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12399230  T
Q  214 agatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12399229 agttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14973085 - 14972854
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  14973085 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 14972986  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      |||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14972985 aatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 14972887  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14972886 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 23083247 - 23083482
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  23083247 attaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaag 23083346  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     | | ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  23083347 taaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagc 23083445  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23083446 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 14576719 - 14576934
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14576719 attaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 14576818  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  14576819 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagtt 14576917  T
Q  199 gcatgagtcggtctaag 215  Q
    | |||||||||||||||    
T  14576918 gaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  217 tgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840932
Alignment:
Q  7 gacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatat 105  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |||     
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  106 ttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
    ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcat 43840964  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43840963 gagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18438765 - 18438534
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||     
T  18438765 agacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatg 18438666  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      |||||| | ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  18438665 aatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctaca 18438567  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18438566 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  22 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  121 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  219 ttgaagatgatga 231  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataag 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | ||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgag 25476388  T
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25476389 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaag 25476487  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || |||||||||||||||    
T  25476488 ttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14572823 - 14572608
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||    
T  14572823 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaag 14572724  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14572723 tataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagct 14572625  T
Q  199 gcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  14572624 gcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||||||   |||  ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 40213611 - 40213838
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||     
T  40213611 agacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatg 40213710  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||| ||    
T  40213711 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctaca 40213808  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40213809 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42386632 - 42386429
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatac 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||     
T  42386632 atgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatat 42386533  T
Q  114 ataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 210  Q
     | |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42386532 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggt 42386434  T
Q  211 ctaag 215  Q
    |||||    
T  42386433 ctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  233 gt 234  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  66 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 163  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070802
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16796782 - 16796685
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796782 attaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  216 atgttgaagatgatga 231  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  182 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  139 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 22147548 - 22147646
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||| ||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  22147548 gatattattatatcatgatgttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246034
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgtt-gtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 15246034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23408504 - 23408428
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  23408504 tgttgttgtaatctgtctatgttgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 935 - 1169
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  935 attaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaata 1034  T
Q  102 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  1035 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagct 1133  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1134 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 167865 - 168099
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 101  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  167865 attaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaata 167964  T
Q  102 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  167965 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagct 168063  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168064 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52148 - 51913
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  52148 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 52049  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52048 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 51950  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51949 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38256
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatg 38256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13446 - 13211
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13446 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 13347  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13346 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 13248  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13247 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1851
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  2086 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 1987  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1986 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 1888  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1887 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2188 - 1952
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaa 99  Q
    |||||||||||||  || |||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  2188 gattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaa 2089  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 196  Q
     ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2088 taatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaag 1990  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3705 - 3470
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  3705 attaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaag 3606  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  3605 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagc 3507  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3506 tacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21146 - 20910
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  21146 attaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtag 21047  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21046 aacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagc 20947  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20946 tttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 6007 - 6245
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  6007 attaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 6106  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttaattaactaa 195  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  6107 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaa 6206  T
Q  196 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6207 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  27 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  126 tgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 222  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttga 4861  T
Q  223 agatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||    
T  4860 agatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 3041 - 3271
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  3041 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 3140  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3141 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 3239  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3240 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38995 - 38761
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  38995 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 38896  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagct 198  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  38895 tataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagct 38797  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38796 gcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  25 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  124 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 221  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  222 aagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  233 gtcc 236  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39707 - 39479
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  39707 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 39608  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  39607 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcat 39509  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39508 gagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 75105 - 75333
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  75105 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 75204  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  75205 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcat 75303  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75304 gagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 339840 - 340065
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||     
T  339840 agacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 339939  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  339940 aatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcat 340036  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  340037 gagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  159 tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Original strand, 17105 - 17337
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  17105 agacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 17204  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctg 199  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17205 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 17303  T
Q  200 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17304 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  217 tgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 124820 - 124675
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  124820 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 124721  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 146  Q
    |||||||| |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  124720 aatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 25955 - 26179
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  25955 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 26054  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||| | ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26055 aatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 26153  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  26154 tgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 33385 - 33461
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 82  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33385 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40143 - 39913
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  40143 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 40044  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 202  Q
     |   |||  |||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  40043 atcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcat 39945  T
Q  203 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39944 gagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23113 - 22886
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  23113 agacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 23014  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
     ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23013 attgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 22916  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22915 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  132 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  229 tgatg 233  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  98 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaacta 194  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  195 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  178 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Original strand, 32904 - 33077
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 159  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  32904 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 33002  T
Q  160 -gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33003 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46101 - 45928
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 159  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  46101 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 46003  T
Q  160 -gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46002 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  26 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 124  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  125 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 221  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  222 aagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6846 - 6669
Alignment:
Q  1 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaa 99  Q
    |||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  6846 gattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaa 6747  T
Q  100 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 174  Q
     ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6746 taatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 16490 - 16721
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  16490 agacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16589  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16590 aatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 16688  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16689 tgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8710 - 8479
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | ||||||||||||||    
T  8710 attaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaag 8615  T
Q  101 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 197  Q
     | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  8614 tacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagc 8516  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8515 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4738 - 4508
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  4738 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 4639  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  4638 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 4541  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  4540 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12320 - 12090
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  12320 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 12221  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  12220 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 12123  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  12122 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22272 - 22042
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  22272 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 22173  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgca 201  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  22172 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 22075  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  22074 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13141
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 184  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 11399 - 11440
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11399 attaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  130 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  215 gatgttgaagatgatg 230  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 180  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  66 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 163  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  130 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 129  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  130 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  65 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 161  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  215 gatgttgaagatgatg 230  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  89 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 186  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  187 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 51903 - 51987
Alignment:
Q  135 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||| || |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51903 attgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1149 - 1052
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1149 attaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28061 - 27912
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 104  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  28061 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 27962  T
Q  105 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 154  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27961 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 134  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 662
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  138 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  62 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  159 tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4739 - 4545
Alignment:
Q  21 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 119  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||    
T  4739 gttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaaga 4641  T
Q  120 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4640 tgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  168 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3716 - 3640
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 78  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3716 attaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7780 - 7704
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 78  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7780 attaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 182  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  183 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128827
Alignment:
Q  70 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 159  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 3429 - 3574
Alignment:
Q  16 atgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatac 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||     
T  3429 atgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataa 3528  T
Q  114 ataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 159  Q
     | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10394 - 10323
Alignment:
Q  6 agacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 77  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10394 agacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
       | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 132  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  133 aaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 174  Q
     | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  981 ca-ttgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtt-tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 1846 - 1903
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846 tatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 210  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  211 ctaagatg 218  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  182 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  71 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  167 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 17873 - 17928
Alignment:
Q  2 attaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 57  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17873 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  181 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7447
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14566
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3272
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 3272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193070
Alignment:
Q  137 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  153 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 99  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17517
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17572 tactgcctaagttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 17517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  212 taagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30347
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 30347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 406 times since January 2019
Visitors: 3060