View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0410_low_40 (Length: 237)

Name: NF0410_low_40
Description: NF0410
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0410_low_40
NF0410_low_40
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-237)||(13214-13450)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (1-237)||(12902760-12902997)
chr4 (1-237)||(7088880-7089117)
chr4 (2-237)||(44052832-44053068)
chr4 (1-237)||(22636438-22636674)
chr4 (1-233)||(23374240-23374473)
chr4 (6-237)||(7893706-7893935)
chr4 (1-237)||(16239851-16240087)
chr4 (29-237)||(16270145-16270353)
chr4 (57-237)||(7798777-7798958)
chr4 (1-235)||(14038653-14038888)
chr4 (1-237)||(16377404-16377639)
chr4 (1-237)||(14053183-14053419)
chr4 (1-237)||(17046490-17046724)
chr4 (115-237)||(52873363-52873485)
chr4 (69-237)||(6899894-6900062)
chr4 (26-237)||(44928829-44929042)
chr4 (75-237)||(18215274-18215436)
chr4 (75-237)||(12307-12469)
chr4 (75-237)||(15118352-15118514)
chr4 (75-237)||(52312510-52312672)
chr4 (26-237)||(54798669-54798872)
chr4 (69-237)||(1837503-1837671)
chr4 (12-125)||(3096759-3096872)
chr4 (89-237)||(23803280-23803427)
chr4 (75-237)||(44615288-44615450)
chr4 (75-237)||(44773087-44773249)
chr4 (75-237)||(50222339-50222501)
chr4 (89-237)||(3515007-3515154)
chr4 (89-237)||(18239434-18239581)
chr4 (89-237)||(19242699-19242846)
chr4 (89-237)||(51463883-51464030)
chr4 (26-237)||(14280316-14280518)
chr4 (75-233)||(15355324-15355483)
chr4 (89-233)||(19618187-19618330)
chr4 (75-237)||(44102214-44102376)
chr4 (1-117)||(17047953-17048070)
chr4 (154-237)||(3096296-3096379)
chr4 (26-233)||(15367697-15367905)
chr4 (26-233)||(15402710-15402918)
chr4 (26-225)||(52243099-52243302)
chr4 (89-237)||(12610950-12611090)
chr4 (26-233)||(15371209-15371417)
chr4 (26-233)||(15373490-15373698)
chr4 (89-226)||(14970722-14970858)
chr4 (63-221)||(13794-13953)
chr4 (106-233)||(15370025-15370152)
chr4 (106-233)||(16223539-16223666)
chr4 (114-237)||(8574864-8574985)
chr4 (75-237)||(22353836-22353999)
chr4 (75-237)||(7641192-7641344)
chr4 (75-234)||(20149832-20149992)
chr4 (77-221)||(21815587-21815731)
chr4 (66-191)||(43256106-43256230)
chr4 (63-225)||(43198496-43198661)
chr4 (164-236)||(12774011-12774084)
chr4 (169-237)||(15551820-15551889)
chr4 (117-237)||(39706286-39706406)
chr4 (122-225)||(12288211-12288316)
chr4 (64-236)||(15121747-15121917)
chr4 (139-221)||(6190481-6190564)
chr4 (164-236)||(8846360-8846433)
chr4 (63-236)||(15093775-15093949)
chr4 (170-219)||(17333298-17333347)
chr4 (138-236)||(16348682-16348780)
chr4 (138-236)||(16356970-16357068)
chr4 (1-44)||(15091093-15091136)
chr4 (163-221)||(46640499-46640558)
chr4 (66-213)||(16488023-16488171)
chr4 (177-214)||(11250619-11250656)
chr4 (26-77)||(8574784-8574836)
chr4 (177-213)||(15353365-15353401)
chr4 (170-221)||(53082202-53082254)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-237)||(27250610-27250847)
chr1 (1-237)||(21026683-21026920)
chr1 (1-237)||(22532272-22532509)
chr1 (1-237)||(50210094-50210331)
chr1 (1-237)||(34509783-34510020)
chr1 (1-163)||(22354453-22354616)
chr1 (8-233)||(20135194-20135420)
chr1 (27-233)||(22468604-22468810)
chr1 (1-237)||(38801272-38801505)
chr1 (75-237)||(13988866-13989028)
chr1 (75-237)||(21923291-21923453)
chr1 (89-237)||(23593750-23593897)
chr1 (75-237)||(21475087-21475249)
chr1 (75-237)||(31612313-31612475)
chr1 (75-237)||(45574842-45575005)
chr1 (2-129)||(22356056-22356185)
chr1 (2-129)||(22357742-22357871)
chr1 (26-237)||(433012-433222)
chr1 (75-237)||(29298137-29298298)
chr1 (75-237)||(29776688-29776850)
chr1 (89-233)||(21840771-21840914)
chr1 (75-237)||(16275363-16275526)
chr1 (20-117)||(48603637-48603735)
chr1 (140-237)||(20847175-20847272)
chr1 (75-237)||(13212861-13213024)
chr1 (89-233)||(16361921-16362064)
chr1 (75-237)||(21346961-21347124)
chr1 (89-237)||(21342096-21342244)
chr1 (75-234)||(40389157-40389317)
chr1 (118-237)||(15860052-15860171)
chr1 (63-221)||(21861513-21861672)
chr1 (63-221)||(21896199-21896358)
chr1 (75-237)||(22123067-22123230)
chr1 (66-191)||(33797570-33797694)
chr1 (106-237)||(21707167-21707297)
chr1 (106-237)||(21711709-21711839)
chr1 (26-225)||(16758664-16758866)
chr1 (32-221)||(35260992-35261180)
chr1 (172-233)||(20454606-20454667)
chr1 (57-236)||(21787979-21788159)
chr1 (114-236)||(22921864-22921986)
chr1 (114-236)||(33681011-33681133)
chr1 (151-236)||(21714546-21714631)
chr1 (133-233)||(21754052-21754152)
chr1 (114-236)||(22237631-22237753)
chr1 (142-237)||(14295574-14295669)
chr1 (1-63)||(20847100-20847163)
chr1 (142-224)||(20918620-20918702)
chr1 (164-236)||(20248283-20248356)
chr1 (164-225)||(52928014-52928076)
chr1 (121-221)||(50614117-50614219)
chr1 (121-221)||(50621945-50622047)
chr1 (121-221)||(41050036-41050138)
chr1 (163-221)||(16368329-16368388)
chr1 (151-236)||(42865245-42865330)
chr1 (34-103)||(21714684-21714754)
chr1 (177-237)||(24783150-24783210)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-237)||(930-1166)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-237)||(167860-168096)
scaffold0011 (1-237)||(51916-52153)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (1-237)||(20360841-20361078)
chr6 (5-237)||(20638168-20638401)
chr6 (9-237)||(22780116-22780345)
chr6 (1-237)||(17287677-17287914)
chr6 (1-237)||(29060543-29060780)
chr6 (1-237)||(18409708-18409945)
chr6 (1-237)||(25629236-25629473)
chr6 (74-237)||(16496247-16496411)
chr6 (1-237)||(20593776-20594013)
chr6 (1-237)||(19303422-19303658)
chr6 (1-237)||(16920514-16920748)
chr6 (74-237)||(20076703-20076863)
chr6 (66-237)||(35245589-35245758)
chr6 (1-237)||(22831506-22831742)
chr6 (75-237)||(1595549-1595711)
chr6 (75-237)||(12742317-12742479)
chr6 (75-237)||(18334592-18334754)
chr6 (75-237)||(19005046-19005208)
chr6 (75-237)||(19858919-19859081)
chr6 (75-237)||(22782227-22782389)
chr6 (75-237)||(24422547-24422709)
chr6 (75-237)||(33861794-33861956)
chr6 (75-237)||(33864278-33864440)
chr6 (89-237)||(25754809-25754956)
chr6 (75-237)||(2291180-2291342)
chr6 (75-237)||(8055029-8055191)
chr6 (75-237)||(26924640-26924802)
chr6 (89-233)||(30676725-30676868)
chr6 (134-237)||(25656629-25656731)
chr6 (26-225)||(25644335-25644537)
chr6 (89-237)||(1540926-1541073)
chr6 (89-237)||(25688502-25688649)
chr6 (89-233)||(34963377-34963520)
chr6 (1-221)||(11185524-11185742)
chr6 (75-234)||(16448526-16448686)
chr6 (26-221)||(18456735-18456930)
chr6 (1-217)||(25603266-25603482)
chr6 (75-237)||(3852017-3852179)
chr6 (89-221)||(18461895-18462026)
chr6 (75-233)||(19847949-19848109)
chr6 (75-237)||(20556894-20557054)
chr6 (63-237)||(20109143-20109318)
chr6 (110-233)||(23992434-23992554)
chr6 (1-217)||(25611604-25611820)
chr6 (34-213)||(15041465-15041644)
chr6 (69-221)||(18821795-18821946)
chr6 (66-191)||(27415887-27416011)
chr6 (164-237)||(27333262-27333336)
chr6 (164-237)||(27394002-27394076)
chr6 (179-237)||(25714420-25714478)
chr6 (142-237)||(28496494-28496589)
chr6 (142-237)||(29808905-29809000)
chr6 (187-237)||(1561306-1561356)
chr6 (26-233)||(8227416-8227625)
chr6 (164-236)||(19652199-19652272)
chr6 (163-225)||(9098557-9098620)
chr6 (125-228)||(4185827-4185930)
chr6 (163-219)||(33443068-33443124)
chr6 (122-225)||(19668386-19668491)
chr6 (121-237)||(23019411-23019525)
chr6 (151-236)||(19873120-19873205)
chr6 (91-236)||(21766695-21766839)
chr6 (68-213)||(18907134-18907280)
chr6 (151-236)||(19862978-19863063)
chr6 (187-236)||(31155465-31155514)
chr6 (125-228)||(4186379-4186482)
chr6 (193-237)||(22080799-22080843)
chr6 (177-214)||(19790837-19790874)
chr6 (170-221)||(23076749-23076801)
chr6 (170-221)||(35008167-35008219)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (2-237)||(17487859-17488095)
chr3 (6-237)||(20698322-20698553)
chr3 (5-237)||(13442277-13442510)
chr3 (2-237)||(17499341-17499577)
chr3 (1-237)||(12399212-12399449)
chr3 (11-237)||(26686890-26687117)
chr3 (1-237)||(23083242-23083479)
chr3 (11-237)||(43840935-43841162)
chr3 (1-237)||(14972857-14973094)
chr3 (1-236)||(14576714-14576949)
chr3 (26-237)||(24153115-24153326)
chr3 (1-237)||(18438537-18438774)
chr3 (1-227)||(14572602-14572828)
chr3 (1-237)||(11424644-11424877)
chr3 (1-237)||(25476266-25476503)
chr3 (25-222)||(42386428-42386627)
chr3 (1-237)||(40213602-40213838)
chr3 (1-225)||(30029855-30030079)
chr3 (75-237)||(29172583-29172745)
chr3 (75-237)||(7781347-7781509)
chr3 (75-237)||(9707607-9707769)
chr3 (75-237)||(17463178-17463340)
chr3 (75-237)||(34159326-34159488)
chr3 (75-237)||(45606907-45607069)
chr3 (75-237)||(55476491-55476653)
chr3 (89-237)||(17672626-17672773)
chr3 (89-237)||(28848626-28848773)
chr3 (75-237)||(8899094-8899256)
chr3 (75-237)||(16454281-16454443)
chr3 (75-237)||(17446655-17446816)
chr3 (75-237)||(38961891-38962053)
chr3 (75-237)||(13151790-13151953)
chr3 (75-237)||(13154255-13154418)
chr3 (75-237)||(6469134-6469296)
chr3 (75-237)||(10247723-10247885)
chr3 (75-235)||(16282811-16282971)
chr3 (1-117)||(16796670-16796787)
chr3 (89-233)||(12567564-12567707)
chr3 (89-233)||(13544029-13544172)
chr3 (89-237)||(50242822-50242969)
chr3 (123-237)||(55500942-55501055)
chr3 (75-235)||(41123892-41124049)
chr3 (114-237)||(36166598-36166719)
chr3 (75-237)||(43550478-43550641)
chr3 (110-233)||(46822272-46822395)
chr3 (75-221)||(53070653-53070799)
chr3 (20-117)||(14179555-14179653)
chr3 (134-237)||(12119785-12119887)
chr3 (134-237)||(15412429-15412531)
chr3 (106-237)||(15977515-15977645)
chr3 (62-233)||(12511064-12511237)
chr3 (26-233)||(24340628-24340837)
chr3 (134-237)||(8499518-8499620)
chr3 (140-237)||(44494809-44494905)
chr3 (114-226)||(21618460-21618570)
chr3 (134-237)||(10556985-10557087)
chr3 (117-237)||(14234490-14234610)
chr3 (26-221)||(52523633-52523831)
chr3 (106-237)||(27165250-27165381)
chr3 (140-237)||(17737236-17737335)
chr3 (121-236)||(15470928-15471043)
chr3 (26-222)||(23274705-23274903)
chr3 (96-237)||(53301527-53301669)
chr3 (114-237)||(13210325-13210445)
chr3 (164-236)||(12174303-12174376)
chr3 (114-236)||(16097332-16097454)
chr3 (114-236)||(16103784-16103905)
chr3 (164-233)||(32307684-32307754)
chr3 (164-236)||(49668120-49668193)
chr3 (70-236)||(856140-856304)
chr3 (176-237)||(28194693-28194755)
chr3 (26-233)||(37642170-37642379)
chr3 (164-236)||(9512924-9512997)
chr3 (164-236)||(9520899-9520972)
chr3 (184-237)||(45577947-45578000)
chr3 (17-117)||(12339890-12339986)
chr3 (164-233)||(1644718-1644787)
chr3 (151-236)||(23408428-23408513)
chr3 (63-158)||(2051142-2051238)
chr3 (172-236)||(23077530-23077594)
chr3 (121-221)||(37251168-37251270)
chr3 (121-221)||(43925977-43926079)
chr3 (90-236)||(11298499-11298644)
chr3 (170-219)||(13919350-13919399)
chr3 (151-236)||(15878083-15878168)
chr3 (177-237)||(14665400-14665460)
chr3 (172-236)||(14878569-14878633)
chr3 (170-221)||(22110402-22110454)
chr3 (117-221)||(12377940-12378046)
chr3 (177-214)||(3389994-3390031)
chr3 (171-236)||(15060284-15060349)
chr3 (177-237)||(14668556-14668616)
chr3 (171-235)||(15051509-15051573)
chr3 (66-227)||(19725857-19726018)
chr3 (26-81)||(21618594-21618650)
chr3 (26-77)||(36166747-36166799)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (2-237)||(9509192-9509428)
chr7 (1-237)||(12698834-12699072)
chr7 (1-231)||(26212005-26212236)
chr7 (1-237)||(10589042-10589278)
chr7 (5-237)||(16386132-16386366)
chr7 (1-237)||(40443394-40443629)
chr7 (26-237)||(18456319-18456530)
chr7 (1-237)||(38227484-38227720)
chr7 (1-237)||(3564245-3564482)
chr7 (1-237)||(27847714-27847948)
chr7 (75-237)||(13647328-13647491)
chr7 (75-237)||(456321-456483)
chr7 (75-237)||(11972496-11972658)
chr7 (75-237)||(14949122-14949284)
chr7 (75-237)||(15376713-15376875)
chr7 (75-237)||(16232520-16232682)
chr7 (75-237)||(18640272-18640434)
chr7 (75-237)||(20385123-20385285)
chr7 (75-237)||(21189595-21189757)
chr7 (75-237)||(32125491-32125653)
chr7 (75-237)||(41522917-41523079)
chr7 (75-237)||(41525379-41525541)
chr7 (75-236)||(11393287-11393448)
chr7 (69-237)||(16213684-16213852)
chr7 (89-233)||(24275175-24275318)
chr7 (121-237)||(48273392-48273508)
chr7 (75-237)||(18430712-18430874)
chr7 (75-237)||(24702238-24702400)
chr7 (75-237)||(27216860-27217022)
chr7 (77-237)||(16410059-16410219)
chr7 (75-237)||(44116509-44116671)
chr7 (75-237)||(3386333-3386495)
chr7 (35-237)||(2280033-2280235)
chr7 (72-236)||(14932685-14932851)
chr7 (72-236)||(15356120-15356286)
chr7 (72-236)||(15360234-15360400)
chr7 (109-237)||(13869346-13869474)
chr7 (75-237)||(24704688-24704847)
chr7 (26-237)||(17061866-17062077)
chr7 (75-233)||(38898376-38898535)
chr7 (8-225)||(15143925-15144143)
chr7 (75-237)||(20110556-20110708)
chr7 (111-237)||(13831373-13831498)
chr7 (121-237)||(22072916-22073033)
chr7 (121-237)||(67748-67864)
chr7 (142-237)||(28505321-28505416)
chr7 (142-237)||(34200789-34200884)
chr7 (63-236)||(17138006-17138177)
chr7 (65-217)||(15211480-15211633)
chr7 (75-237)||(26355983-26356156)
chr7 (75-237)||(26358435-26358608)
chr7 (117-236)||(811129-811248)
chr7 (117-236)||(16219715-16219834)
chr7 (75-221)||(12756671-12756817)
chr7 (114-236)||(18005650-18005772)
chr7 (64-236)||(12187019-12187189)
chr7 (107-191)||(2530126-2530208)
chr7 (164-236)||(44014182-44014255)
chr7 (117-237)||(47831810-47831930)
chr7 (142-237)||(16495405-16495500)
chr7 (151-234)||(18154873-18154956)
chr7 (187-237)||(15754955-15755005)
chr7 (26-225)||(1867901-1868101)
chr7 (143-237)||(11996051-11996145)
chr7 (63-218)||(12255734-12255892)
chr7 (26-233)||(19486649-19486858)
chr7 (121-225)||(16056343-16056446)
chr7 (142-222)||(10063841-10063921)
chr7 (26-213)||(15008404-15008593)
chr7 (26-81)||(48273538-48273594)
chr7 (163-225)||(12901338-12901401)
chr7 (170-225)||(14044761-14044817)
chr7 (170-225)||(14354791-14354847)
chr7 (151-236)||(19649521-19649606)
chr7 (177-214)||(20569654-20569691)
chr7 (177-237)||(2832499-2832559)
chr7 (177-213)||(9446216-9446252)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-237)||(23285868-23286101)
chr2 (1-237)||(22731115-22731352)
chr2 (1-237)||(23654267-23654504)
chr2 (1-237)||(22738061-22738297)
chr2 (11-237)||(23060516-23060742)
chr2 (1-237)||(298695-298933)
chr2 (25-237)||(23076445-23076658)
chr2 (1-237)||(37997-38232)
chr2 (1-237)||(20309111-20309345)
chr2 (1-237)||(22337118-22337355)
chr2 (1-237)||(23660026-23660262)
chr2 (75-237)||(22105412-22105575)
chr2 (75-234)||(21155060-21155219)
chr2 (75-237)||(18808943-18809105)
chr2 (75-237)||(23130862-23131024)
chr2 (75-237)||(23133329-23133491)
chr2 (75-237)||(23709532-23709694)
chr2 (75-237)||(23712013-23712175)
chr2 (75-237)||(26505379-26505541)
chr2 (75-237)||(26507857-26508019)
chr2 (75-237)||(34402522-34402684)
chr2 (75-237)||(39682313-39682475)
chr2 (89-237)||(23135590-23135737)
chr2 (75-237)||(571397-571559)
chr2 (75-237)||(6725995-6726157)
chr2 (26-237)||(23708524-23708735)
chr2 (75-237)||(24367774-24367936)
chr2 (75-237)||(24898195-24898358)
chr2 (75-237)||(24900678-24900841)
chr2 (75-237)||(24903155-24903318)
chr2 (75-237)||(24905632-24905795)
chr2 (75-237)||(24908107-24908270)
chr2 (89-233)||(32214936-32215079)
chr2 (75-237)||(32039498-32039660)
chr2 (75-237)||(28577099-28577261)
chr2 (75-237)||(45029854-45030016)
chr2 (72-237)||(23103348-23103513)
chr2 (75-235)||(43137301-43137461)
chr2 (110-233)||(25616192-25616315)
chr2 (75-237)||(24529528-24529691)
chr2 (75-237)||(38967374-38967537)
chr2 (2-86)||(27753730-27753814)
chr2 (163-237)||(8946660-8946734)
chr2 (69-233)||(19671837-19672001)
chr2 (114-235)||(28405981-28406103)
chr2 (74-221)||(7687-7835)
chr2 (117-236)||(7679589-7679707)
chr2 (177-237)||(23040247-23040307)
chr2 (114-236)||(25175854-25175976)
chr2 (34-236)||(40622123-40622327)
chr2 (158-234)||(24643034-24643109)
chr2 (63-236)||(22799069-22799243)
chr2 (69-221)||(32451878-32452031)
chr2 (164-237)||(22134251-22134324)
chr2 (142-237)||(23071972-23072067)
chr2 (63-236)||(23019649-23019823)
chr2 (164-225)||(18786947-18787009)
chr2 (26-221)||(20520098-20520295)
chr2 (170-219)||(23287384-23287433)
chr2 (151-219)||(23038048-23038116)
chr2 (121-221)||(23207296-23207398)
chr2 (171-219)||(26392403-26392451)
chr2 (90-236)||(25963687-25963832)
chr2 (75-151)||(24642856-24642933)
chr2 (177-214)||(25961592-25961629)
chr2 (74-221)||(23791292-23791441)
chr2 (177-213)||(24655396-24655432)
chr2 (177-213)||(24869903-24869939)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (1-237)||(20536211-20536448)
chr8 (6-237)||(21918886-21919118)
chr8 (1-237)||(18818290-18818527)
chr8 (1-237)||(31971260-31971495)
chr8 (1-237)||(21923809-21924046)
chr8 (10-237)||(7372781-7373001)
chr8 (2-237)||(18879119-18879349)
chr8 (1-237)||(45130879-45131114)
chr8 (1-237)||(22626739-22626975)
chr8 (11-237)||(23406382-23406611)
chr8 (1-237)||(16199527-16199762)
chr8 (1-237)||(28648925-28649162)
chr8 (1-233)||(23648560-23648793)
chr8 (10-237)||(16092231-16092460)
chr8 (1-237)||(6759261-6759496)
chr8 (25-237)||(22875068-22875281)
chr8 (20-237)||(21395883-21396098)
chr8 (20-237)||(21790376-21790591)
chr8 (25-237)||(21389358-21389568)
chr8 (38-237)||(21778697-21778894)
chr8 (75-237)||(14409444-14409606)
chr8 (75-237)||(1484402-1484564)
chr8 (75-237)||(5853292-5853454)
chr8 (75-237)||(20403227-20403389)
chr8 (75-237)||(22001753-22001915)
chr8 (89-233)||(16413331-16413474)
chr8 (75-237)||(41598188-41598350)
chr8 (1-117)||(25363021-25363138)
chr8 (75-237)||(4483281-4483442)
chr8 (75-237)||(4542373-4542535)
chr8 (75-237)||(15203231-15203393)
chr8 (75-237)||(20046195-20046357)
chr8 (110-233)||(18678093-18678216)
chr8 (75-237)||(19896265-19896430)
chr8 (110-233)||(32121739-32121862)
chr8 (75-237)||(14823774-14823935)
chr8 (75-237)||(25484275-25484430)
chr8 (140-233)||(45290761-45290853)
chr8 (63-233)||(13508028-13508199)
chr8 (134-237)||(19937066-19937168)
chr8 (114-237)||(26219717-26219838)
chr8 (75-233)||(26223923-26224081)
chr8 (134-224)||(15070571-15070660)
chr8 (117-237)||(6520371-6520491)
chr8 (63-233)||(13597560-13597731)
chr8 (114-237)||(38855246-38855369)
chr8 (114-237)||(26225288-26225409)
chr8 (125-237)||(17140919-17141031)
chr8 (26-221)||(19801333-19801527)
chr8 (63-221)||(20498581-20498740)
chr8 (143-237)||(21490998-21491092)
chr8 (69-233)||(17612059-17612224)
chr8 (142-237)||(5866297-5866392)
chr8 (121-236)||(21285601-21285716)
chr8 (122-225)||(983407-983512)
chr8 (169-236)||(23760893-23760961)
chr8 (57-236)||(23776772-23776952)
chr8 (164-236)||(26355742-26355815)
chr8 (190-237)||(21249387-21249434)
chr8 (190-237)||(21255225-21255272)
chr8 (114-228)||(21673716-21673830)
chr8 (64-213)||(20465982-20466132)
chr8 (121-221)||(37116366-37116468)
chr8 (170-221)||(24353039-24353091)
chr8 (26-77)||(26222987-26223039)
chr8 (63-213)||(17439449-17439601)
chr8 (163-213)||(19154930-19154981)
chr8 (177-216)||(20533467-20533506)
chr8 (90-227)||(16410225-16410361)
chr8 (151-236)||(17353975-17354060)
chr8 (172-221)||(20502154-20502203)
chr8 (170-219)||(22525579-22525628)
chr8 (170-221)||(17267044-17267096)
chr8 (172-236)||(17926758-17926822)
chr8 (26-81)||(26219862-26219918)
chr8 (64-213)||(30643235-30643385)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-237)||(1854-2086)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (6-237)||(23390382-23390614)
chr5 (1-237)||(8286723-8286961)
chr5 (1-231)||(22075028-22075259)
chr5 (1-237)||(25421535-25421772)
chr5 (1-237)||(25431398-25431634)
chr5 (1-237)||(9077955-9078192)
chr5 (1-237)||(24493572-24493808)
chr5 (1-237)||(21292851-21293087)
chr5 (1-237)||(13025314-13025550)
chr5 (1-237)||(13095498-13095734)
chr5 (12-237)||(24529223-24529449)
chr5 (74-237)||(21808343-21808507)
chr5 (1-233)||(1096474-1096707)
chr5 (74-237)||(21729018-21729182)
chr5 (26-226)||(18418594-18418793)
chr5 (75-237)||(264768-264930)
chr5 (134-237)||(21997549-21997652)
chr5 (75-237)||(39363384-39363546)
chr5 (76-237)||(10732941-10733102)
chr5 (26-237)||(22412187-22412388)
chr5 (75-237)||(20909012-20909174)
chr5 (75-237)||(29329934-29330096)
chr5 (75-237)||(42245365-42245527)
chr5 (1-103)||(22107254-22107357)
chr5 (75-237)||(29345980-29346142)
chr5 (75-237)||(36154783-36154942)
chr5 (89-237)||(39245136-39245283)
chr5 (75-237)||(29348453-29348615)
chr5 (75-237)||(29350926-29351088)
chr5 (75-234)||(18319033-18319193)
chr5 (75-237)||(20902008-20902172)
chr5 (34-233)||(37723910-37724108)
chr5 (75-237)||(2154613-2154776)
chr5 (75-237)||(11581199-11581361)
chr5 (75-237)||(32027393-32027555)
chr5 (75-237)||(10775675-10775838)
chr5 (110-233)||(17517192-17517315)
chr5 (66-191)||(18356364-18356488)
chr5 (37-221)||(22144068-22144254)
chr5 (134-237)||(31061068-31061170)
chr5 (134-237)||(38619434-38619536)
chr5 (143-237)||(20918017-20918110)
chr5 (66-191)||(20910745-20910869)
chr5 (134-236)||(23064512-23064613)
chr5 (75-234)||(24067110-24067270)
chr5 (122-221)||(20026942-20027043)
chr5 (114-236)||(21565546-21565668)
chr5 (164-237)||(19660879-19660953)
chr5 (164-237)||(21329541-21329615)
chr5 (63-236)||(22032323-22032492)
chr5 (117-237)||(21502154-21502274)
chr5 (164-236)||(22959576-22959649)
chr5 (63-236)||(18769947-18770118)
chr5 (34-236)||(21873254-21873453)
chr5 (64-236)||(23572084-23572254)
chr5 (142-237)||(36314580-36314675)
chr5 (1-102)||(21986028-21986130)
chr5 (151-236)||(26704075-26704160)
chr5 (151-236)||(26973808-26973893)
chr5 (164-237)||(26012079-26012151)
chr5 (164-237)||(19668901-19668975)
chr5 (183-237)||(20806850-20806904)
chr5 (26-233)||(40725860-40726069)
chr5 (171-224)||(26732884-26732937)
chr5 (114-174)||(20766115-20766174)
chr5 (171-221)||(26740697-26740747)
chr5 (26-77)||(20766035-20766087)
chr5 (172-236)||(20805552-20805616)
chr5 (74-221)||(22178174-22178323)
chr5 (173-236)||(20766974-20767037)
chr5 (172-221)||(23469822-23469871)
chr5 (121-191)||(29448052-29448123)
chr5 (172-236)||(23512098-23512162)
chr5 (177-213)||(26680605-26680641)
chr5 (177-213)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-237)||(3473-3710)
scaffold0292 (1-237)||(346-582)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-237)||(6003-6242)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (2-237)||(4852-5088)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (6-222)||(24187-24406)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-237)||(32070-32304)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-237)||(15346-15581)
scaffold0114 (64-236)||(7295-7465)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-237)||(38764-39000)
scaffold0145 (29-237)||(32945-33153)
scaffold0145 (75-237)||(9749-9912)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-237)||(4715-4951)
scaffold0358 (1-175)||(1-175)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-237)||(13500-13735)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-237)||(22886-23122)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-237)||(8424-8647)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-237)||(10307-10541)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-233)||(20917-21151)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-237)||(3032-3268)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-237)||(25899-26135)
scaffold0026 (1-237)||(39861-40097)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-237)||(1955-2192)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-233)||(25946-26179)
scaffold0122 (114-237)||(44702-44825)
scaffold0122 (1-88)||(33376-33463)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-237)||(8482-8715)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-237)||(39480-39716)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-237)||(75096-75332)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-237)||(16285-16519)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-235)||(4513-4747)
scaffold0228 (1-235)||(12095-12329)
scaffold0228 (1-235)||(22047-22281)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-237)||(39916-40152)
scaffold0080 (121-221)||(19885-19987)
scaffold0080 (63-213)||(18598-18749)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-237)||(17096-17335)
scaffold0056 (89-221)||(79299-79430)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (11-188)||(13144-13322)
scaffold0175 (165-237)||(34126-34199)
scaffold0175 (184-237)||(276-329)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (37-237)||(3103-3304)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-237)||(933-1167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-237)||(16481-16718)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-237)||(1292-1526)
scaffold0106 (1-237)||(7269-7503)
scaffold0106 (172-237)||(15291-15356)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (31-237)||(46998-47202)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (2-150)||(124675-124824)
scaffold0021 (63-237)||(174769-174943)
scaffold0021 (171-237)||(121769-121835)
scaffold0021 (122-221)||(136370-136471)
scaffold0021 (122-221)||(145078-145179)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-237)||(339831-340065)
scaffold0003 (75-237)||(158450-158612)
scaffold0003 (66-191)||(71350-71474)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (12-237)||(32851-33074)
scaffold0120 (12-237)||(45931-46154)
scaffold0120 (30-237)||(16116-16323)
scaffold0120 (179-237)||(17389-17447)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (102-237)||(28417-28552)
scaffold0046 (142-237)||(11295-11390)
scaffold0046 (142-237)||(2000-2095)
scaffold0046 (187-237)||(4555-4605)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-237)||(51585-51819)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-181)||(6669-6850)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-237)||(5012-5246)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-219)||(4545-4763)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (75-237)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (75-237)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (75-237)||(94411-94573)
scaffold0023 (89-237)||(44454-44602)
scaffold0023 (89-233)||(17455-17598)
scaffold0023 (113-236)||(100378-100501)
scaffold0023 (114-236)||(40169-40291)
scaffold0023 (169-237)||(119878-119947)
scaffold0023 (34-236)||(38394-38596)
scaffold0023 (164-236)||(101503-101576)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (89-237)||(13392-13539)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (75-237)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (75-237)||(136680-136842)
scaffold0028 (75-237)||(139149-139311)
scaffold0028 (75-237)||(144087-144249)
scaffold0028 (75-237)||(134211-134373)
scaffold0028 (75-237)||(141618-141780)
scaffold0028 (142-237)||(62201-62296)
scaffold0028 (154-236)||(132662-132745)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-117)||(1037-1154)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (89-237)||(4694-4841)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (15-177)||(3424-3588)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (118-234)||(11442-11558)
scaffold0235 (1-57)||(11394-11450)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (89-237)||(82072-82219)
scaffold0037 (114-225)||(22665-22776)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (75-237)||(16784-16946)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (89-234)||(4300-4444)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (89-233)||(10777-10920)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (89-233)||(11292-11435)
scaffold0029 (64-236)||(12763-12933)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (89-233)||(501088-501231)
scaffold0001 (35-237)||(85539-85742)
scaffold0001 (133-236)||(160688-160791)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-159)||(27911-28070)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (75-237)||(40400-40562)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (89-237)||(106-253)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (63-225)||(8481-8646)
scaffold0621 (114-237)||(6538-6661)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-82)||(3640-3721)
scaffold0165 (1-82)||(7704-7785)
scaffold0165 (35-225)||(27663-27855)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (75-237)||(4214-4377)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (89-233)||(12264-12407)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (89-233)||(9246-9389)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (34-213)||(26851-27027)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (75-223)||(29946-30094)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (75-237)||(12064-12220)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (66-191)||(15362-15486)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (63-221)||(53492-53651)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (74-237)||(128754-128917)
scaffold0031 (75-221)||(20379-20524)
scaffold0031 (151-212)||(65830-65891)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (75-237)||(161089-161252)
scaffold0007 (35-157)||(164550-164674)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (114-237)||(116430-116551)
scaffold0022 (121-221)||(128971-129072)
scaffold0022 (121-233)||(78328-78442)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (35-221)||(13147-13336)
scaffold0357 (35-225)||(16014-16206)
scaffold0357 (170-221)||(2680-2732)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (26-233)||(17932-18141)
scaffold0247 (35-237)||(2088-2291)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (75-234)||(1280-1440)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-181)||(844-1021)
scaffold0395 (174-237)||(4888-4951)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (76-236)||(29558-29720)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (75-237)||(38657-38820)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (114-236)||(19268-19390)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (34-236)||(21721-21920)
scaffold0210 (34-236)||(29613-29812)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (114-221)||(1051-1158)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (70-236)||(1881-2045)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (63-233)||(11471-11642)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (142-237)||(15664-15759)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (63-233)||(38199-38370)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (114-236)||(2801-2923)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (114-228)||(129917-130031)
scaffold0010 (26-213)||(60620-60810)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (114-236)||(14692-14814)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (117-237)||(6121-6241)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (114-225)||(10536-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (63-221)||(12587-12745)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-81)||(10323-10403)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (114-228)||(5655-5769)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (164-237)||(6614-6688)
scaffold0333 (164-237)||(13994-14068)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (69-221)||(51833-51985)
scaffold0034 (133-237)||(32541-32643)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (164-237)||(15821-15895)
scaffold0020 (173-236)||(178898-178961)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (63-219)||(8002-8161)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (151-236)||(23843-23928)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-61)||(17868-17928)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (169-236)||(2694-2762)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (142-237)||(1092-1187)
scaffold0184 (177-214)||(4284-4321)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (117-236)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (121-236)||(45794-45909)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (65-217)||(192920-193074)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (114-236)||(133-255)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (164-236)||(28813-28887)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (118-236)||(4803-4921)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (72-213)||(29117-29262)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (164-236)||(1086-1159)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (169-237)||(1083-1152)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (117-237)||(12769-12889)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (164-236)||(23927-24000)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (34-214)||(16264-16443)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (164-225)||(8118-8180)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (164-228)||(6824-6889)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (121-225)||(10542-10646)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (63-183)||(225465-225584)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (74-213)||(38343-38484)
scaffold0139 (151-236)||(19980-20065)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (142-236)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (173-236)||(36454-36517)
scaffold0131 (34-103)||(36592-36662)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (163-225)||(25121-25184)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (179-221)||(11982-12024)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (151-236)||(69794-69879)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (74-221)||(6237-6386)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (2-49)||(20595-20642)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (170-213)||(206575-206618)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (90-236)||(897-1042)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (90-236)||(1830-1975)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (138-236)||(44081-44179)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (64-214)||(46670-46821)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (172-236)||(6095-6159)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (172-236)||(10575-10639)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (163-221)||(569-628)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (175-214)||(4999-5038)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (177-214)||(7328-7365)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (133-221)||(2694-2784)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (172-236)||(14664-14728)
scaffold0081 (172-236)||(23679-23743)
scaffold0081 (172-236)||(39103-39167)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (121-221)||(97024-97126)
scaffold0006 (121-221)||(106302-106404)


Alignment Details
Target: scaffold0193 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13450 - 13214
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13450 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 13351  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13350 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 13251  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12902997 - 12902760
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12902997 gtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 12902898  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902897 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12902798  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12902797 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 12902760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7089117 - 7088880
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7089117 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 7089018  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089017 tgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 7088918  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7088917 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 7088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44053068 - 44052832
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  44053068 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 44052969  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44052968 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactg 44052869  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44052868 agctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatga 44052832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22636674 - 22636438
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636674 gtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 22636576  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22636575 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaact 22636476  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636475 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 22636438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 23374240 - 23374473
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23374240 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23374339  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374340 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23374439  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23374440 aagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893706
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 104  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  105 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct 7893739  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7893738 gcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatga 7893706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16239851 - 16240087
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  16239851 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattact 16239950  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16239951 taaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaatt 16240049  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16240050 aagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 16240087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270353
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  128 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
    | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  228 aagatgatga 237  Q
    ||||||||||    
T  16270344 aagatgatga 16270353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798777
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  156 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 7798777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14038888 - 14038653
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14038888 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 14038789  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14038788 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaact 14038689  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038688 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16377404 - 16377639
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16377404 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 16377503  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377504 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 16377601  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16377602 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 14053183 - 14053419
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053183 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 14053282  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaag-atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 198  Q
    |||||||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  14053283 gaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaac 14053380  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  14053381 taagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatga 14053419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046490
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaact 17046528  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  17046527 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 17046490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873485
Alignment:
Q  115 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  215 gtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatga 52873485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899894
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  168 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 6899894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  224 gatgaagatgatga 237  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   || |||||| ||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagat 54798759  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54798760 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 54798859  T
Q  225 atgaagatgatga 237  Q
    || ||||||||||    
T  54798860 attaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  168 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3096872 - 3096759
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatattt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096872 acttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatattt 3096773  T
Q  112 gaatatttaagatg 125  Q
    ||||||||| ||||    
T  3096772 gaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 23803280 - 23803427
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  23803280 tatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 23803378  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803379 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3515154 - 3515007
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3515154 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 3515056  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3515055 gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgtt 18239532  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18239533 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19242846 - 19242699
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19242747 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19242699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 51463883 - 51464030
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  51463883 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 51463981  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51463982 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||     ||     ||||||||||  ||   |  |||||| ||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----ctt-----attacttgaattatgaatctatatttgagat 14280428  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14280427 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14280329  T
Q  225 atgaagatgatga 237  Q
    || ||||||||||    
T  14280328 attaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 19618187 - 19618330
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19618187 tatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 19618285  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19618286 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19618330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44102276 ac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 17047953 - 17048070
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17047953 gtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 17048052  T
Q  100 tgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||  | |||||||||||    
T  17048053 tgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096296
Alignment:
Q  154 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 3096296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367697
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  124 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  15367707 cgttgaagatg 15367697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402710
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  124 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  15402720 cgttgaagatg 15402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 220  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  221 gttga 225  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12611090 - 12610950
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||    
T  12611090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt--------tgtgttgctgtt 12610999  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12610998 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371209
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15371319  T
Q  124 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
      ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371318 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  15371219 cgttgaagatg 15371209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373490
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15373600  T
Q  124 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
      ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373599 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  15373500 cgttgaagatg 15373490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Original strand, 14970722 - 14970858
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  14970722 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgtt 14970820  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14970821 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13953
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13894 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15370152 - 15370025
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
    |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15370152 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 15370054  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15370053 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15370025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16223666 - 16223539
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
    |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16223666 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 16223568  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16223567 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 16223539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353836
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 22353836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 221
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  77 tgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 175  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  176 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 43198496 - 43198661
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  |||| |||||       
T  43198496 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaat 43198595  T
Q  162 t-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43198596 tgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551820
Alignment:
Q  169 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 15551820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706406
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatga 39706406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  219 aagttga 225  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 162  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | |    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattat 15121843  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||  ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  15121844 tgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190481
Alignment:
Q  139 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15093949 - 15093775
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |   ||  ||||||  |||| ||||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  15093949 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctg 15093850  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    || ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||    
T  15093849 ttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 16348682 - 16348780
Alignment:
Q  138 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16348682 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 16356970 - 16357068
Alignment:
Q  138 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16356970 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15091136 - 15091093
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaag 44  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15091136 gtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 221
Target Start/End: Original strand, 46640499 - 46640558
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46640499 ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 16488023 - 16488171
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| ||||  | |||||||||||| | || |||||| |    
T  16488023 tgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgct 16488121  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16488122 tttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16488171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250656
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 11250656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 27250610 - 27250847
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250610 gtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 27250709  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27250710 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 27250809  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27250810 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 27250847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21026920 - 21026683
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026920 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21026821  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21026820 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaact 21026721  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  21026720 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatga 21026683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22532509 - 22532272
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22532509 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22532410  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532409 tgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22532310  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22532309 aaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 22532272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 50210094 - 50210331
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  50210094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 50210193  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210194 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 50210293  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50210294 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 50210331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34510020 - 34509783
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34510020 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattact 34509921  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509920 tgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 34509821  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34509820 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22354453 - 22354616
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22354453 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattact 22354552  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354553 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20135420 - 20135194
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaa 106  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  20135420 taagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagtt 20135321  T
Q  107 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 206  Q
    |  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
T  20135320 ttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgc 20135221  T
Q  207 atgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20135220 atgagtcagtctaagttgattaagatg 20135194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468810
Alignment:
Q  27 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  126 ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  226 tgaagatg 233  Q
    | ||||||    
T  22468803 ttaagatg 22468810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 38801272 - 38801505
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38801272 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattactt 38801371  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38801372 gaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaact 38801468  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  38801469 aagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatga 38801505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 23593750 - 23593897
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23593750 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23593848  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23593849 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575005
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 45575005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 22356056 - 22356185
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22356056 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22356155  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttga 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22356156 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 22357742 - 22357871
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22357742 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22357841  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttga 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22357842 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433012
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T
Q  224 gatgaagatgatga 237  Q
    ||| ||||||||||    
T  433025 gattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21840914 - 21840771
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21840914 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 21840816  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21840815 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21840771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||   ||| |||||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48603735 - 48603637
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  48603735 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847272
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213024
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13213024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16362064 - 16361921
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||     
T  16362064 tatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc 16361966  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16361921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21342244 - 21342096
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 187  Q
    ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||    
T  21342244 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgt 21342146  T
Q  188 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21342145 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21342096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 15860052 - 15860171
Alignment:
Q  118 ttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 216  Q
    |||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15860052 ttaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15860150  T
Q  217 ctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  15860151 ccaagttgattaagatgatga 15860171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861672
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21861613 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 21896199 - 21896358
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  21896199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21896298  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21896299 -ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  174 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21707297 - 21707167
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 205  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21707297 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21707199  T
Q  206 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21707198 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21711839 - 21711709
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 205  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711839 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21711741  T
Q  206 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21711740 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16758866 - 16758664
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||   ||    
T  16758866 ttaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-ga 16758768  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 220  Q
    ||||| || |||| | |||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16758767 tgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T
Q  221 gttga 225  Q
    |||||    
T  16758668 gttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Original strand, 35260992 - 35261180
Alignment:
Q  32 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 129  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||| ||||| | || ||||||| |||| || |||||||||||||||  || | ||||| ||| |||||||||    
T  35260992 ataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttga 35261091  T
Q  130 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35261092 t---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454667
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788159
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt 154  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  155 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21754152 - 21754052
Alignment:
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21754152 attgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatga 21754054  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  21754053 tg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295669
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatga 14295669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20847100 - 20847163
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgtt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20847100 gtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaagatgtgttgtt 20847163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918620
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 221
Target Start/End: Original strand, 16368329 - 16368388
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16368329 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21714754 - 21714684
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaa 103  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21714754 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783210
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatga 24783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 930 - 1166
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  930 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 1029  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1030 gaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaacta 1129  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1130 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 167860 - 168096
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167860 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 167959  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  167960 gaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaacta 168059  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  168060 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 168096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52153 - 51916
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  52153 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 52054  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52053 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaact 51954  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51953 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 51916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 20360841 - 20361078
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20360841 gtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 20360940  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360941 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaact 20361040  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  20361041 aagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatga 20361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 20638168 - 20638401
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaa 103  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20638168 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaa 20638267  T
Q  104 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 203  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20638268 gaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagc 20638367  T
Q  204 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20638368 tgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 20638401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780345
Alignment:
Q  9 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaat 107  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  108 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 207  Q
    | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgca 22780315  T
Q  208 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780316 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 22780345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17287677 - 17287914
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||    
T  17287677 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattact 17287776  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17287777 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaact 17287876  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17287877 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29060780 - 29060543
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29060780 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattact 29060681  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060680 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 29060581  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29060580 aagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatga 29060543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18409708 - 18409945
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18409708 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatt 18409807  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18409808 tgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 18409907  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18409908 gagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18409945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 25629236 - 25629473
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25629236 gtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 25629335  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  25629336 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaact 25629435  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25629436 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 25629473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496247
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 16496247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20594013 - 20593776
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20594013 gtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattact 20593914  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  20593913 tgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaact 20593814  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20593813 gagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatga 20593776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19303422 - 19303658
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  19303422 gtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattact 19303521  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19303522 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaact 19303620  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19303621 aagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatga 19303658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16920514 - 16920748
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16920514 gtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattactt 16920613  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16920614 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaact 16920710  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  16920711 aagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatga 16920748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076703
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 20076703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245589
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgt 35245662  T
Q  166 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  35245661 tgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 35245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22831742 - 22831506
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22831742 gtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattactt 22831643  T
Q  101 gaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 197  Q
    ||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  22831642 gaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaa 22831546  T
Q  198 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  22831545 ctaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 22831506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25754956 - 25754809
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  25754956 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 25754858  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25754857 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 30676725 - 30676868
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30676725 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 30676823  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30676824 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 30676868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656629
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  25656632 atga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25644537 - 25644335
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  25644537 ttaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 25644438  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644437 tgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T
Q  223 tga 225  Q
    |||    
T  25644337 tga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1541025 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25688649 - 25688502
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25688649 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgtt 25688551  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688550 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34963520 - 34963377
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  34963520 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 34963422  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34963421 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11185742 - 11185524
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||   |||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  11185742 gtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattactt 11185643  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||   |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  11185642 gaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaact 11185546  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11185545 aagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 25603266 - 25603482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  25603266 gtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25603365  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25603366 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25603464  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||  |||||||||||||    
T  25603465 aagtcgcatgagtcagtc 25603482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461895
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgtt 18461928  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18461927 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848109
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 19848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||   || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20109318 - 20109143
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||     
T  20109318 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgt 20109219  T
Q  160 tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  20109218 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatga 20109143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23992554 - 23992434
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23992554 ttgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatg 23992458  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  23992457 agtcagtctaagttgattaagatg 23992434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 25611604 - 25611820
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  25611604 gtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25611703  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25611704 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25611802  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||  |||||||||||||    
T  25611803 aagtcgcatgagtcagtc 25611820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatat-ttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||| || | |||||| | |||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  |||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattga 15041563  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041564 attgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18821795 ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgtttttg 18821893  T
Q  168 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18821894 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333336
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27333336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394076
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27394076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714420
Alignment:
Q  179 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25714420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496589
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatga 28496589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809000
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatga 29809000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561306
Alignment:
Q  187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatga 1561306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227625
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
    || ||||||||    
T  8227615 tgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  224 gatga 228  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  219 aagttga 225  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019411
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  220 agttgatgaagatgatga 237  Q
    || |||  ||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatga 23019411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766695
Alignment:
Q  91 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 190  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  191 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18907280 - 18907134
Alignment:
Q  68 attatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 165  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | || |||||||| |    
T  18907280 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgt 18907182  T
Q  166 tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907181 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186379
Alignment:
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  || | |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  224 gatga 228  Q
    |||||    
T  4186383 gatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080843
Alignment:
Q  193 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 22080843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790874
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 19790874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17488095 - 17487859
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17488095 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 17487996  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17487995 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17487896  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17487895 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17487859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 20698322 - 20698553
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698322 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 20698421  T
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698422 atatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 20698521  T
Q  206 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20698522 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 20698553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13442510 - 13442277
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaa 103  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13442510 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 13442411  T
Q  104 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442410 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagc 13442311  T
Q  204 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13442310 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13442277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17499577 - 17499341
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17499577 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattactt 17499478  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17499477 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17499378  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17499377 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17499341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12399449 - 12399212
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12399449 gtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 12399350  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399349 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12399250  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12399249 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 12399212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26687117 - 26686890
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  26687117 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 26687018  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26687017 tggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 26686918  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26686917 agtcggtctaagttgaagaagatgatga 26686890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23083242 - 23083479
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23083242 gtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 23083341  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
     |||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083342 agaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 23083441  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083442 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23083479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840935
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 43840963  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  43840962 agtcggtttaagttgatgaagataatga 43840935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14973094 - 14972857
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14973094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14972995  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14972994 tgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 14972895  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972894 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 14972857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 14576714 - 14576949
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14576714 gtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14576813  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14576814 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14576912  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14576913 aagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  225 atgaagatgatga 237  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18438774 - 18438537
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18438774 gtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattact 18438675  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438674 tgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18438575  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18438574 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18438537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14572828 - 14572602
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatg-cattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  14572828 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatt 14572729  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572728 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14572630  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14572629 aagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11424644 - 11424877
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11424644 gtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattact 11424743  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424744 tgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 11424839  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424840 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 11424877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 25476266 - 25476503
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  25476266 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattact 25476365  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25476366 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaact 25476465  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25476466 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 25476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386428
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||   ||||||||| ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  123 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 40213602 - 40213838
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40213602 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 40213701  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    || |  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  40213702 tggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgttgttatttaact 40213800  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40213801 aagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30030079 - 30029855
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  30030079 gtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattact 30029980  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||  |  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  30029979 tgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaact 30029881  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30029880 aagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17672773 - 17672626
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17672773 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt 17672675  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17672674 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16796787 - 16796670
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16796787 gtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 16796688  T
Q  100 tgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||  | |||||||||||    
T  16796687 tgagaattatttgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12567707 - 12567564
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 12567609  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12567608 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13544172 - 13544029
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 13544074  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13544073 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13544029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50242969 - 50242822
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  50242969 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 50242871  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  50242870 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  123 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  223 tgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550641
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 43550641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46822395 - 46822272
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46822395 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 46822296  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  46822295 agtcagtctaagttgattaagatg 46822272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14179653 - 14179555
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  14179653 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 12119785 - 12119887
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12119785 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  12119884 atga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15412531 - 15412429
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15412531 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  15412432 atga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 205  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  206 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12511237 - 12511064
Alignment:
Q  62 ttgttgattatgatgtgatataatgtttatg--cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 159  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||  ||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  12511237 ttgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  160 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatg 12511064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340837
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  24340827 cgttgaagatg 24340837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8499620 - 8499518
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8499620 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  8499521 atga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  214 agtctaagttgat 226  Q
     ||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234490
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatga 14234490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 220  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27165381 - 27165250
Alignment:
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagct 204  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27165381 atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagct 27165283  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27165282 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  220 agttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23274903 - 23274705
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgt-ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||| |||| || ||| | |||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  23274903 ttaatgatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23274803 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  96 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 193  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  194 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 13210325 - 13210445
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    ||||||||| |||||||   ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13210325 atatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 13210420  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  13210421 cggtctaagttgttgaagatgatga 13210445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16103905 - 16103784
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16103905 atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagt 16103808  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16103807 cggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttgt 168  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| ||||    
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttgt 856208  T
Q  169 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  856207 aatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  176 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642379
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  37642369 cgttgaagatg 37642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 237
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  184 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12339986 - 12339890
Alignment:
Q  17 atgaagaggttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  12339986 atgaagaggctaattataatatgtgaagctgttttaagatgtgttgttgt------tgatgtgatataatgttttatgcatcacttgagaattatttgaa 12339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Original strand, 2051142 - 2051238
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg 158  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  2051142 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 11298499 - 11298644
Alignment:
Q  90 atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 189  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||    
T  11298499 atgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattg 11298597  T
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  11298598 ttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665400
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||     
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  215 gtctaag 221  Q
    |||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390031
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 3390031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060284
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatg 15060284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668556
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14668556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051509
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  ||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgat 15051509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Original strand, 19725857 - 19726018
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  | |||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19725857 tgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gtcatgctgtt 19725954  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
      |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  19725955 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgatg 19726018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9509428 - 9509192
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  9509428 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattactt 9509329  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9509328 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaacta 9509229  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509228 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 9509192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12699072 - 12698834
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12699072 gtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 12698973  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698972 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 12698873  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12698872 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 12698834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26212236 - 26212005
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26212236 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattact 26212137  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212136 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26212037  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  26212036 aagttgtatgagtcggtctaagttgttgaaga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10589278 - 10589042
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10589278 gtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgctt 10589179  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10589178 gaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaacta 10589079  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  10589078 agctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatga 10589042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 16386132 - 16386366
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  16386132 cattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgag 16386231  T
Q  104 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 202  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16386232 aattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaag 16386331  T
Q  203 ctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16386332 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 16386366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40443629 - 40443394
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443629 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 40443530  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40443529 gaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaact 40443432  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  40443431 aagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 40443394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  225 atgaagatgatga 237  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38227720 - 38227484
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |    
T  38227720 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaat 38227621  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38227620 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaact 38227522  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38227521 aagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatga 38227484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 3564245 - 3564482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  3564245 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattact 3564344  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564345 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3564444  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3564445 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 27847714 - 27847948
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27847714 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattactt 27847813  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27847814 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaact 27847910  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  27847911 aagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatga 27847948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647328
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 13647328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  168 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275175
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 24275220  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24275219 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 220  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  221 gttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430712
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  77 tgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 175  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  176 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 gc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280235
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  232 tgatga 237  Q
    ||||||    
T  2280230 tgatga 2280235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  109 tttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 207  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 13869376  T
Q  208 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13869375 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || |||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  223 tgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 15143925 - 15144143
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga 105  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||      
T  15143925 taagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaatt 15144024  T
Q  106 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 205  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144025 atgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagctg 15144123  T
Q  206 catgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15144124 catgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  111 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 210  Q
    |||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  211 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072916
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  220 agttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatga 22072916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67748
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  220 agttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  67765 agttgattaagatgatga 67748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505416
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatga 28505416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200789
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 34200789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 161  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 17138102  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17138103 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211480
Alignment:
Q  65 ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  164 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 15211480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356156
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  174 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358608
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  174 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811248
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005650
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 162  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgt 12187093  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
      |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12187092 aattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 191
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530208
Alignment:
Q  107 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831810
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatga 47831810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495405
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 16495405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755005
Alignment:
Q  187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatga 15755005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 1867901 - 1868101
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| | || |||||||||| | || |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| ||||    
T  1867901 ttaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagat 1867999  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||| | | ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1868000 gttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T
Q  222 ttga 225  Q
    ||||    
T  1868098 ttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996145
Alignment:
Q  143 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 11996145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 12255734 - 12255892
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||       
T  12255734 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaat 12255833  T
Q  162 tt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    |  |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255834 tgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486858
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  19486848 cgttgaagatg 19486858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  220 agttga 225  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063921
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 15008404 - 15008593
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata-atgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| | || ||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||| || || ||| ||     
T  15008404 ttaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagg 15008502  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15008503 tgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 15008593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273538
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569691
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 20569691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832559
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 2832559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23286101 - 23285868
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23286101 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23286002  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286001 tgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23285906  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23285905 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23285868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 22731115 - 22731352
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22731115 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22731214  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731215 tgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaact 22731314  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22731315 aagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatga 22731352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23654267 - 23654504
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23654267 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23654366  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  23654367 tgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaact 23654466  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23654467 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 23654504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 22738061 - 22738297
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22738061 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22738160  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22738161 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaact 22738259  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22738260 aagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatga 22738297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060516
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23060544  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23060543 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 23060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 298695 - 298933
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298695 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 298794  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 198  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  298795 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 298894  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  298895 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076445
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtg 23076459  T
Q  224 gatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||    
T  23076458 gatgaagatgatga 23076445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 37997 - 38232
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37997 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 38096  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38097 gaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 38195  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38196 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 38232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20309345 - 20309111
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20309345 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattactt 20309246  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20309245 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaact 20309149  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20309148 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 20309111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22337355 - 22337118
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22337355 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22337256  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22337255 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaact 22337156  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22337155 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 22337118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23660262 - 23660026
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23660262 gtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 23660163  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||   ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660162 tgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaact 23660064  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23660063 aagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23660026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708735
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagt 23708722  T
Q  223 tgatgaagatgatga 237  Q
    |||  ||||||||||    
T  23708723 tga--aagatgatga 23708735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 32214936 - 32215079
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 32215034  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32215035 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32215079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  75 tgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103513
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||   |||||  || |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 23103513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25616315 - 25616192
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25616315 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatg 25616216  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  25616215 agtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27753814 - 27753730
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg 86  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27753814 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946660
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8946660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671837
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  168 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 19671837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  74 atgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  173 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679589
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7679609 tctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040307
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23040307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatt-----tgaatatttaagatgtt 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     || |||  |||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgtt 40622220  T
Q  128 gatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 226  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| ||||    
T  40622221 gatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgat 40622317  T
Q  227 gaagatgatg 236  Q
     |||||||||    
T  40622318 taagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  158 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 22799069 - 22799243
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |    
T  22799069 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgat 22799167  T
Q  161 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  22799168 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 32451878 - 32452031
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32451878 ttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttg 32451976  T
Q  168 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     || ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32451977 aatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134324
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatga 22134324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072067
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatga 23072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 23019649 - 23019823
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |    
T  23019649 tgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgtt 23019747  T
Q  161 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23019748 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 20520098 - 20520295
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||| | | || |||||||||| | || |||||||||||||||  |||| ||| | ||| |||    
T  20520098 ttaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgaga 20520196  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 220  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20520197 tgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20520294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 25963687 - 25963832
Alignment:
Q  90 atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 189  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||    
T  25963687 atgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattg 25963785  T
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  25963786 ttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 25963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatta 151  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961629
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 25961629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23791441 - 23791292
Alignment:
Q  74 atgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtat 170  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| | ||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |    
T  23791441 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgtttta-tgt 23791344  T
Q  171 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23791343 actgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20536448 - 20536211
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20536448 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 20536349  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20536348 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaact 20536249  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536248 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 20536211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 21918886 - 21919118
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918886 attaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 21918985  T
Q  106 at-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918986 attatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 21919085  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21919086 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21919118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18818290 - 18818527
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18818290 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 18818389  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818390 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18818489  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18818490 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18818527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31971495 - 31971260
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971495 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 31971396  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971395 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 31971297  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31971296 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 31971260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21923809 - 21924046
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||    
T  21923809 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattact 21923908  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923909 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaact 21924008  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21924009 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 21924046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7373001 - 7372781
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatat 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||| |||     
T  7373001 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataa 7372909  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372908 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 7372809  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7372808 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 7372781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 18879119 - 18879349
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18879119 tagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 18879217  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879218 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 18879312  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18879313 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 45130879 - 45131114
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130879 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 45130978  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130979 gaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaact 45131076  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  45131077 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 45131114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22626975 - 22626739
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22626975 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattact 22626876  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626875 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22626777  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22626776 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 22626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23406611 - 23406382
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  23406611 gacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23406512  T
Q  110 ttgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 207  Q
    |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406511 ttgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23406412  T
Q  208 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23406411 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23406382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16199527 - 16199762
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16199527 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattactt 16199626  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16199627 gaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaact 16199724  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  16199725 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 16199762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 28648925 - 28649162
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  28648925 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 28649024  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649025 tgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaact 28649124  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28649125 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 28649162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23648793 - 23648560
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23648793 gtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattact 23648694  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23648693 tgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaact 23648594  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23648593 aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 23648560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16092231 - 16092460
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 107  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||    
T  16092231 agacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattat 16092330  T
Q  108 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 207  Q
       || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092331 gaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 16092430  T
Q  208 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092431 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 16092460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6759496 - 6759261
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattac 98  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  6759496 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaa 6759397  T
Q  99 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 198  Q
    |||||  ||   || ||| || |||||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759396 ttgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaac 6759300  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6759299 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 6759261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875068
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  123 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  223 tgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatga 22875068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Original strand, 21395883 - 21396098
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatattt 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  21395883 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 21395982  T
Q  120 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21395983 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21396079  T
Q  219 aagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  21396080 aagatgttgaagatgatga 21396098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Original strand, 21790376 - 21790591
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatattt 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  21790376 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 21790475  T
Q  120 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21790476 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21790572  T
Q  219 aagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  21790573 aagatgttgaagatgatga 21790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389568
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 124  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  224 gatgaagatgatga 237  Q
    | ||||||||||||    
T  21389555 gttgaagatgatga 21389568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778894
Alignment:
Q  38 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 137  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||     
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  138 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 16413331 - 16413474
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16413331 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 16413429  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16413430 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 25363021 - 25363138
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25363021 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattact 25363120  T
Q  100 tgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||  | |||||||||||    
T  25363121 tgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 18678093 - 18678216
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18678093 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 18678192  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18678193 agtcagtctaagttgattaagatg 18678216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32121862 - 32121739
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32121862 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 32121763  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  32121762 agtcattctaagttgattaagatg 32121739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290853
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 13508028 - 13508199
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  13508028 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13508127  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    || | | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13508128 ttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 19937066 - 19937168
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  19937066 ttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  19937165 atga 19937168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     |||||||||||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223923
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatg 26223923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15070660 - 15070571
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070660 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520371
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatga 6520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 13597560 - 13597731
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  13597560 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13597659  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13597660 tttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855369
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatga 38855369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140919
Alignment:
Q  125 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    |||||||| || || | ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17140933  T
Q  224 gatgaagatgatga 237  Q
    | ||||||||||||    
T  17140932 gttgaagatgatga 17140919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||| |||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 19801431  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19801432 cgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498581
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct- 20498642  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20498641 attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490998
Alignment:
Q  143 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21490998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612224
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  168 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 17612224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866392
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5866392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  220 agttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  220 agttga 225  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  169 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776952
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt 154  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 23776870  T
Q  155 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23776871 catgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249387
Alignment:
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21249387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255225
Alignment:
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21255225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  213 cagtctaagttgatga 228  Q
    | ||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37116468 - 37116366
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37116468 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 37116370  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  37116369 taag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Original strand, 17439449 - 17439601
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--c 159  Q
    ||||||| || |||||||||| | || |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |    
T  17439449 tgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaac 17439547  T
Q  160 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17439548 tgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17439601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154981
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 19154981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533506
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 216  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagt 20533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Original strand, 16410225 - 16410361
Alignment:
Q  90 atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 189  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||    
T  16410225 atgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattg 16410323  T
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  16410324 ttatttcactaagttgcatgagtcattataagatgatg 16410361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 17926758 - 17926822
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  17926758 ctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219862
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Original strand, 30643235 - 30643385
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | || ||| ||    
T  30643235 gttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 30643333  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    || ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30643334 ttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 30643385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1854
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 104  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2086 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 1987  T
Q  105 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 1887  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1886 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 23390382 - 23390614
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 104  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23390382 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 23390481  T
Q  105 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390482 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 23390581  T
Q  205 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23390582 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23390614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 8286723 - 8286961
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8286723 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 8286822  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 198  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286823 tgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 8286922  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8286923 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8286961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22075259 - 22075028
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22075259 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 22075160  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22075159 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaact 22075060  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22075059 aagctgaatgagtcggtctaagttgttgaaga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25421772 - 25421535
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25421772 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25421673  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421672 tgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 25421573  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421572 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 25421535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25431634 - 25431398
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25431634 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25431535  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431534 tgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 25431435  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  25431434 aagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatga 25431398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9078192 - 9077955
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078192 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 9078093  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||   ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078092 tgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 9077993  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9077992 aagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatga 9077955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24493808 - 24493572
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  24493808 gtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcact 24493709  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  24493708 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaacc 24493610  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24493609 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24493572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21292851 - 21293087
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292851 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 21292950  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca--attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 198  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292951 gaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaac 21293048  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  21293049 taagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatga 21293087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13025550 - 13025314
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |    
T  13025550 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13025451  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025450 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13025352  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13025351 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13025314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13095734 - 13095498
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |    
T  13095734 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13095635  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095634 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13095536  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13095535 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13095498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24529449 - 24529223
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatt 110  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||       
T  24529449 acttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  111 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 210  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 24529250  T
Q  211 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529249 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808507
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1096707 - 1096474
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1096707 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 1096608  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1096607 tgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaact 1096508  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1096507 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729182
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21729182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |  ||||||||| ||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatt-aaga 18418695  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997652
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  21997649 atga 21997652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  76 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 174  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  175 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   || |||||| |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  126 ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  226 tgaagatgatga 237  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 22107254 - 22107357
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22107254 gtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattact 22107353  T
Q  100 tgaa 103  Q
    ||||    
T  22107354 tgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39245283 - 39245136
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| ||  || |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  39245283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39245185  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39245184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-atgaagatgatga 237  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20902108 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723910
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 131  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatg 37724010  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 230  Q
    ||||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37724009 aatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaag 37723913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11581299 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 17517192 - 17517315
Alignment:
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17517192 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatg 17517291  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  17517292 agtcagtctaagttgattaagatg 17517315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  165 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22144254 - 22144068
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaat 134  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |    
T  22144254 ctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt 22144155  T
Q  135 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22144154 tgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31061170 - 31061068
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31061170 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  31061071 atga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38619536 - 38619434
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38619536 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T
Q  234 atga 237  Q
    ||||    
T  38619437 atga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  143 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23064613 - 23064512
Alignment:
Q  134 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23064613 ttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T
Q  234 atg 236  Q
    |||    
T  23064514 atg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660953
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 19660953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329615
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21329615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 162  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| | |    
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgat-t 22032397  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
     ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  22032396 gtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502274
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatga 21502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 161  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 18770043  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  18770044 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873254
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||||      
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatggttaagatgttga-- 21873358  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
     | ||  ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  ||||    
T  21873357 -aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataaga 21873259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572084
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 162  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgt 23572158  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||   ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23572157 tgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314580
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 36314580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 21986028 - 21986130
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  21986028 gtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattact 21986127  T
Q  100 tga 102  Q
    |||    
T  21986128 tga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012151
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatga 26012151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668901
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatga 19668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  183 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725860
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  40725870 cgttgaagatg 40725860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 174  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805552
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 22178174 - 22178323
Alignment:
Q  74 atgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtat 170  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||    
T  22178174 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tat 22178271  T
Q  171 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22178272 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766974
Alignment:
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23512162 - 23512098
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23512162 ctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3710 - 3473
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3710 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattact 3611  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3610 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaact 3511  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3510 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 346
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  582 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 483  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  482 tgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaact 384  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  383 aagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatga 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6242
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6003 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 6102  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||    
T  6103 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaa 6202  T
Q  198 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6203 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5088 - 4852
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5088 tagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 4989  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4988 gagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 4889  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4888 atctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 24187 - 24406
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttga-ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaa 103  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24187 attaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 24286  T
Q  104 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 24386  T
Q  203 ctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24387 ctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32304 - 32070
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32304 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 32205  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32204 gaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaacta 32107  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32106 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 32070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15346 - 15581
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattactt 15445  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15446 gaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaacta 15544  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15545 agctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatga 15581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 162  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||  |||||  |||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aatttgtataatta--tcatgattgt 7369  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  7368 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39000 - 38764
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39000 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 38901  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38900 tgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 38802  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38801 aagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatga 38764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32945
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  128 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
    | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  228 aagatgatga 237  Q
    ||||||||||    
T  32954 aagatgatga 32945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9749
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4951 - 4715
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4951 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttactt 4852  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4851 gaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaacta 4752  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4751 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 1
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  175 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttactt 76  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 175  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  75 gaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13735 - 13500
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13735 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 13636  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 200  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 13537  T
Q  201 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  13536 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatga 13500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23122 - 22886
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  23122 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 23023  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  23022 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaact 22924  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22923 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8647
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  8424 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 8523  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8524 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatg 8619  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8620 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 8647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10541
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10307 gtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 10406  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10407 gaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaact 10503  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10504 atgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21151 - 20917
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21151 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21052  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 198  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21051 tgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaac 20952  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  20951 taagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatg 20917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 3032 - 3268
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3032 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 3131  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3132 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3230  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3231 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26135 - 25899
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26135 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 26036  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26035 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 25937  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25936 aagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40097 - 39861
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40097 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 39998  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39997 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 39899  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39898 aagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2192 - 1955
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2192 gtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattact 2093  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2092 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaact 1993  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1992 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 1955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25946 - 26179
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  25946 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 26045  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26046 tgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26145  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26146 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 33376 - 33463
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 88  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33376 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8715 - 8482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||| | |||||||||    
T  8715 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattact 8620  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| | | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  8619 tgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaacc 8520  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8519 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39716 - 39480
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39716 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 39617  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39616 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 39518  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39517 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatga 39480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 75096 - 75332
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  75096 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 75195  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  75196 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 75294  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  75295 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatga 75332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16519 - 16285
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16519 gtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattactt 16420  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16419 gaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaact 16323  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  16322 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 16285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4747 - 4513
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4747 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 4648  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4647 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 4548  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4547 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgat 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12095
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12329 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 12230  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12229 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 12130  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12129 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgat 12095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22281 - 22047
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22281 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22182  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22181 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 22082  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22081 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgat 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40152 - 39916
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40152 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 40053  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40052 tgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 39954  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39953 aagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Original strand, 18598 - 18749
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||  | |||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| ||||  | |||||||||||| | || || ||    
T  18598 tgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaacg-aattgatattatgaagttattct 18696  T
Q  161 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18697 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17096 - 17335
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  17096 gtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 17195  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt--tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 197  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17196 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 17295  T
Q  198 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17296 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 79299 - 79430
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  79299 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgtt 79397  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79398 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13144
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  13322 gacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 13223  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13222 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34126
Alignment:
Q  165 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 34126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 276
Alignment:
Q  184 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatga 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3304
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  136 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 235  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  236 ga 237  Q
    ||    
T  3303 ga 3304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 933 - 1167
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  933 gtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattactt 1032  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  1033 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaact 1129  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1130 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16481 - 16718
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16481 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattact 16580  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16581 tgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 16680  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16681 aagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatga 16718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1526 - 1292
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1526 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 1427  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1426 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaact 1330  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1329 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7503 - 7269
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7503 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 7404  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7403 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaact 7307  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  7306 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46998
Alignment:
Q  31 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgat 47103  T
Q  131 gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  47102 gaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaa 47006  T
Q  230 gatgatga 237  Q
    ||||||||    
T  47005 gatgatga 46998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 124824 - 124675
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  124824 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 124725  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatt 150  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  124724 gaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174769
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  161 gtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatga 174769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121769
Alignment:
Q  171 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  122 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 339831 - 340065
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  339831 gtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 339930  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 199  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  339931 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaact 340027  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  340028 aagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 32851 - 33074
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  32851 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 32948  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32949 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 33046  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33047 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46154 - 45931
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatat 109  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  46154 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 46057  T
Q  110 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46056 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 45959  T
Q  210 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45958 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 45931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16116
Alignment:
Q  30 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||   || ||| || ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  128 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 227  Q
    | ||  ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  228 aagatgatga 237  Q
    ||||||||||    
T  16125 aagatgatga 16116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 237
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17447
Alignment:
Q  179 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28417
Alignment:
Q  102 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 201  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  202 gctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 28417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11295
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 11295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 2000
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4555
Alignment:
Q  187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51819 - 51585
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  51819 gtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttctt 51720  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51719 gaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 51623  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  51622 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatga 51585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6850 - 6669
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattact 99  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6850 gtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattact 6751  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 181  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6750 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 5012 - 5246
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattactt 100  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5012 gtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 5111  T
Q  101 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaact 199  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||    
T  5112 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaact 5208  T
Q  200 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  5209 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4545
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattac 98  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763 gtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattac 4666  T
Q  99 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 198  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4665 ttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaac 4566  T
Q  199 taagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  4565 taagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgcctatgttgctgt 187  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  188 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44503 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 17455 - 17598
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  17455 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctatt 17553  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17554 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  113 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 211  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  212 tcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    || |||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40291
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  40268 cagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119878
Alignment:
Q  169 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 119878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38596
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 38491  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    || || |||||||||||  | |||||| |||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  38492 aaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaaga 38591  T
Q  232 tgatg 236  Q
    |||||    
T  38592 tgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13440 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62201
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatga 62201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  154 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1037
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1154 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 1055  T
Q  100 tgaagaatatttgaatat 117  Q
    |||  | |||||||||||    
T  1054 tgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4694
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4841 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 4743  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4742 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  15 taatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 112  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  113 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 177  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11558
Alignment:
Q  118 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  218 taagttgatgaagatga 234  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11542 taagttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11394 - 11450
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 57  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11394 gtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 82219 - 82072
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  82219 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 82121  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  82120 gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  213 cagtctaagttga 225  Q
    | |||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4444 - 4300
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| || || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  4444 tatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 4346  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4345 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10920 - 10777
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10920 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 10822  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10821 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11292
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11435 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 11337  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  11336 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatg 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12763
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 162  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgt 12837  T
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||   ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12836 tgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 501231 - 501088
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  501231 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 501133  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  501132 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 131  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  232 tgatga 237  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 160791 - 160688
Alignment:
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  160791 attgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatga 160693  T
Q  232 tgatg 236  Q
    |||||    
T  160692 tgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28070 - 27911
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28070 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 27971  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 159  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27970 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 253 - 106
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||    
T  253 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 155  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  154 gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8481
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8646 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgc 8547  T
Q  160 tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8546 tg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6538
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatga 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3721 - 3640
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7785 - 7704
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7785 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
     || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 12264 - 12407
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  12264 tatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt 12362  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  12363 gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 12407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9389 - 9246
Alignment:
Q  89 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 188  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  9389 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 9291  T
Q  189 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9290 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26851
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 26930  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26929 attg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtc 26851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 223  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 191  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53651
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53592 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128754
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatga 128754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 20477  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20478 ga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 131  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| |    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcat 157  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  214 agtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78328
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T
Q  218 taagttg-atgaagatg 233  Q
     ||| || |||||||||    
T  78344 caagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaata-tttaagatgttgatg 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
     || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18141
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 222  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  223 tgatgaagatg 233  Q
     | ||||||||    
T  18131 cgttgaagatg 18141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2291
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 131  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| ||| || |    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaa 2285  T
Q  232 tgatga 237  Q
    ||||||    
T  2286 tgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 234  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 844 - 1021
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||  || | || |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  844 gtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 943  T
Q  100 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 181  Q
    ||||  ||  |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  944 tgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4951
Alignment:
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 4951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  76 gtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  174 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  75 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  174 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatga 21818  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| ||||    
T  21819 attg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 21915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatga 29710  T
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| ||||    
T  29711 attg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 29807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  213 cagtctaag 221  Q
    | |||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgt 168  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||| ||||    
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgt 1949  T
Q  169 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  1948 aatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11642 - 11471
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||    
T  11642 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 11543  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  11542 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 11471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 38199 - 38370
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||    
T  38199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 38298  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 233  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38299 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 38370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  213 cagtctaagttgatga 228  Q
    | ||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 60620 - 60810
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| | || |||||||||| | || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  60620 ttaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 60719  T
Q  124 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  60720 tgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6241
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  213 cagtctaagttga 225  Q
    | |||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12587
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||  |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  12745 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 12647  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12646 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10403 - 10323
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10403 gtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  213 cagtctaagttgatga 228  Q
    | ||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6614
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13994
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 51833 - 51985
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51833 ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttg 51931  T
Q  168 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
     || ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51932 aatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32541
Alignment:
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 231  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  232 tgatga 237  Q
    ||||||    
T  32546 tgatga 32541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15895
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 219
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8161
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat--gc 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||  ||    
T  8002 tgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagc 8101  T
Q  160 tgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    ||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8102 tg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 17868 - 17928
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 61  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17868 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  169 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1187
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4321
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45909
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  220 agttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45893 agttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193074
Alignment:
Q  65 ttgattatgatgtgatataatgttt--atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  163 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 193074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  114 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 212  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  213 cagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 236
Target Start/End: Original strand, 4803 - 4921
Alignment:
Q  118 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||| |||||| ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  4803 ttaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  218 taagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttga--atatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 167  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||  |  ||||  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  168 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1152
Alignment:
Q  169 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12769
Alignment:
Q  117 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  216 tctaagttgatgaagatgatga 237  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatga 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16443
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 16361  T
Q  132 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    || |  |||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16362 aaatt-aattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtca 16443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  164 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 219  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  220 agttga 225  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 225584 - 225465
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  225584 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctg 225486  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttg 183  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  225485 -ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38484 - 38343
Alignment:
Q  74 atgtgatata-atgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtat 170  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||    
T  38484 atgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tat 38387  T
Q  171 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38386 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  142 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  173 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36662 - 36592
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaa 103  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36662 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25184 - 25121
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25184 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  179 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  151 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6386
Alignment:
Q  74 atgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtat 170  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||    
T  6237 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tat 6334  T
Q  171 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20642 - 20595
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtt 49  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20642 tagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206618
Alignment:
Q  170 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 206618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1042 - 897
Alignment:
Q  90 atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 189  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||    
T  1042 atgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattg 944  T
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  943 ttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1975 - 1830
Alignment:
Q  90 atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 189  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||  |||    
T  1975 atgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattg 1877  T
Q  190 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  1876 ttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44179 - 44081
Alignment:
Q  138 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  44179 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 46670 - 46821
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 161  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||  | |||||||||  ||| || |||||||||||| | || |||||     
T  46670 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaagttatgcta 46768  T
Q  162 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    || ||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  46769 ttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtca 46821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 569
Alignment:
Q  163 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  628 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 214
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5038
Alignment:
Q  175 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtca 5038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7365
Alignment:
Q  177 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 7365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  133 attgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 221  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| |||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  172 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 97126 - 97024
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||  |||    
T  97126 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  97027 taag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 106404 - 106302
Alignment:
Q  121 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcagtc 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||  |||    
T  106404 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T
Q  218 taag 221  Q
    ||||    
T  106305 taag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 736 times since January 2019
Visitors: 3064