View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0433_low_5 (Length: 306)

Name: NF0433_low_5
Description: NF0433
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0433_low_5
NF0433_low_5
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (80-227)||(18167166-18167313)
chr4 (102-227)||(18246639-18246763)
chr4 (75-214)||(15288584-15288722)
chr4 (75-214)||(15295751-15295889)
chr4 (102-227)||(14994649-14994773)
chr4 (102-227)||(47355774-47355898)
chr4 (102-225)||(19998978-19999100)
chr4 (118-227)||(8372922-8373031)
chr4 (75-198)||(10642589-10642711)
chr4 (104-227)||(26678493-26678615)
chr4 (102-214)||(10487133-10487244)
chr4 (118-222)||(15138158-15138262)
chr4 (102-214)||(16329507-16329618)
chr4 (75-198)||(9293927-9294049)
chr4 (102-214)||(13049748-13049859)
chr4 (76-198)||(54119863-54119983)
chr4 (102-214)||(14950482-14950593)
chr4 (102-214)||(26337947-26338058)
chr4 (102-198)||(109960-110055)
chr4 (75-197)||(53909403-53909523)
chr4 (118-198)||(15274359-15274439)
chr4 (102-198)||(15211817-15211913)
chr4 (90-198)||(16366348-16366454)
chr4 (102-198)||(22356148-22356242)
chr4 (102-198)||(5684488-5684583)
chr4 (125-198)||(44054334-44054406)
chr4 (102-170)||(16521294-16521361)
chr4 (120-198)||(13244768-13244845)
chr4 (79-196)||(7134048-7134152)
chr4 (125-198)||(12901388-12901459)
chr4 (125-175)||(21961184-21961234)
chr4 (120-198)||(33738638-33738715)
chr4 (125-177)||(8874109-8874161)
chr4 (120-198)||(12837938-12838017)
chr4 (120-177)||(44345260-44345317)
chr4 (124-198)||(7848829-7848902)
chr4 (75-160)||(53706437-53706521)
chr4 (120-177)||(43283059-43283118)
chr4 (120-177)||(14899970-14900029)
chr4 (120-173)||(52267141-52267196)
chr4 (134-198)||(53706515-53706578)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (75-213)||(21651574-21651712)
chr1 (102-227)||(17147229-17147353)
chr1 (102-227)||(22226430-22226554)
chr1 (102-227)||(35935165-35935289)
chr1 (102-214)||(51451074-51451185)
chr1 (102-214)||(20826814-20826925)
chr1 (102-214)||(22034309-22034420)
chr1 (75-225)||(21857931-21858081)
chr1 (75-198)||(22365158-22365280)
chr1 (102-213)||(41392914-41393024)
chr1 (113-227)||(45050135-45050249)
chr1 (102-214)||(7642175-7642286)
chr1 (102-214)||(17003286-17003397)
chr1 (109-214)||(29137281-29137385)
chr1 (102-214)||(5073893-5074004)
chr1 (102-214)||(18602636-18602747)
chr1 (102-198)||(22352604-22352699)
chr1 (102-226)||(44036492-44036615)
chr1 (77-194)||(22250594-22250711)
chr1 (75-198)||(9785871-9785992)
chr1 (102-224)||(20929924-20930044)
chr1 (102-198)||(20444217-20444311)
chr1 (102-198)||(37846065-37846159)
chr1 (113-198)||(20529981-20530065)
chr1 (102-194)||(15863018-15863108)
chr1 (75-198)||(20895362-20895483)
chr1 (92-198)||(49966058-49966162)
chr1 (92-198)||(22407883-22407987)
chr1 (94-198)||(2422724-2422826)
chr1 (75-138)||(41210509-41210571)
chr1 (125-177)||(35053332-35053384)
chr1 (125-195)||(5676222-5676291)
chr1 (120-198)||(22836927-22837006)
chr1 (120-177)||(20956643-20956702)
chr1 (90-145)||(18505814-18505868)
chr1 (102-147)||(77631-77676)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (75-214)||(18981541-18981680)
chr7 (75-224)||(2192330-2192479)
chr7 (75-224)||(16480560-16480709)
chr7 (75-214)||(15925758-15925896)
chr7 (102-227)||(16416920-16417044)
chr7 (102-214)||(7821390-7821501)
chr7 (102-214)||(7828701-7828812)
chr7 (102-214)||(13757044-13757155)
chr7 (102-214)||(15443145-15443256)
chr7 (102-214)||(15518444-15518555)
chr7 (102-214)||(25293865-25293976)
chr7 (102-214)||(27175082-27175193)
chr7 (118-214)||(30263725-30263821)
chr7 (102-214)||(38785225-38785336)
chr7 (102-220)||(2436088-2436205)
chr7 (102-214)||(10988077-10988188)
chr7 (118-214)||(11514588-11514684)
chr7 (102-214)||(26010779-26010890)
chr7 (102-214)||(27103133-27103244)
chr7 (102-214)||(27110481-27110592)
chr7 (75-197)||(36051071-36051193)
chr7 (79-198)||(16210186-16210305)
chr7 (102-214)||(13912700-13912811)
chr7 (102-198)||(32496144-32496239)
chr7 (75-198)||(7291259-7291381)
chr7 (102-201)||(18255410-18255508)
chr7 (74-198)||(11582506-11582628)
chr7 (102-198)||(369367-369462)
chr7 (102-177)||(1938365-1938439)
chr7 (75-198)||(13038781-13038902)
chr7 (90-198)||(13867675-13867781)
chr7 (102-198)||(15761955-15762050)
chr7 (102-194)||(15952682-15952772)
chr7 (121-194)||(122986-123059)
chr7 (120-198)||(112913-112990)
chr7 (102-172)||(42057750-42057819)
chr7 (125-198)||(3893569-3893641)
chr7 (120-175)||(12753377-12753432)
chr7 (92-198)||(44863618-44863722)
chr7 (125-198)||(45453873-45453944)
chr7 (92-195)||(142046-142147)
chr7 (127-198)||(26071886-26071956)
chr7 (127-198)||(26095673-26095743)
chr7 (120-198)||(15824120-15824197)
chr7 (120-198)||(47288151-47288228)
chr7 (121-177)||(11285642-11285698)
chr7 (166-214)||(42059941-42059989)
chr7 (141-198)||(3055196-3055253)
chr7 (102-146)||(3058582-3058625)
chr7 (122-198)||(12545423-12545498)
chr7 (136-194)||(2024945-2025002)
chr7 (102-147)||(21676632-21676677)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (102-227)||(25174011-25174135)
chr6 (75-214)||(18088344-18088482)
chr6 (75-211)||(22227233-22227369)
chr6 (102-227)||(1659292-1659416)
chr6 (102-227)||(23976024-23976148)
chr6 (102-227)||(33316165-33316289)
chr6 (102-226)||(11214595-11214719)
chr6 (75-214)||(19608891-19609029)
chr6 (75-201)||(17343819-17343945)
chr6 (102-214)||(27655669-27655780)
chr6 (75-198)||(18004607-18004729)
chr6 (102-227)||(1651531-1651655)
chr6 (75-198)||(18825392-18825513)
chr6 (77-198)||(13622756-13622877)
chr6 (102-214)||(16230049-16230160)
chr6 (76-195)||(18740861-18740980)
chr6 (102-214)||(29871058-29871169)
chr6 (75-198)||(18843453-18843574)
chr6 (102-214)||(10487348-10487459)
chr6 (102-214)||(16377868-16377979)
chr6 (102-214)||(16385192-16385303)
chr6 (102-214)||(16650829-16650940)
chr6 (102-224)||(14628194-14628315)
chr6 (102-214)||(16557599-16557710)
chr6 (102-214)||(26088303-26088414)
chr6 (102-199)||(23993644-23993740)
chr6 (102-198)||(16238849-16238944)
chr6 (118-214)||(16642609-16642705)
chr6 (102-198)||(19984789-19984884)
chr6 (102-198)||(1554325-1554420)
chr6 (102-198)||(4989381-4989476)
chr6 (92-198)||(25646507-25646611)
chr6 (120-198)||(18128757-18128833)
chr6 (75-177)||(35017274-35017376)
chr6 (102-172)||(15861243-15861312)
chr6 (102-176)||(16827461-16827534)
chr6 (92-198)||(18422210-18422314)
chr6 (120-198)||(31626914-31626991)
chr6 (120-198)||(25745914-25745991)
chr6 (125-198)||(18775687-18775759)
chr6 (125-175)||(22428673-22428723)
chr6 (125-175)||(16105056-16105106)
chr6 (132-176)||(32896494-32896538)
chr6 (195-227)||(15861210-15861242)
chr6 (102-147)||(21930418-21930463)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (102-227)||(10802-10926)
chr5 (102-227)||(25425073-25425197)
chr5 (76-214)||(7424067-7424204)
chr5 (102-227)||(29192320-29192444)
chr5 (102-227)||(11341087-11341211)
chr5 (102-225)||(19498253-19498375)
chr5 (75-198)||(17473522-17473645)
chr5 (75-177)||(18779745-18779847)
chr5 (102-214)||(4201669-4201780)
chr5 (102-214)||(21075191-21075302)
chr5 (102-227)||(9732369-9732493)
chr5 (102-214)||(24594965-24595076)
chr5 (102-214)||(37051449-37051560)
chr5 (102-214)||(21933862-21933973)
chr5 (102-214)||(21940032-21940143)
chr5 (118-214)||(25902043-25902139)
chr5 (102-214)||(27008476-27008587)
chr5 (102-214)||(35580719-35580830)
chr5 (102-214)||(37010866-37010977)
chr5 (102-224)||(43445460-43445581)
chr5 (118-214)||(20615077-20615173)
chr5 (79-198)||(23510395-23510513)
chr5 (102-198)||(22368187-22368282)
chr5 (102-214)||(23327417-23327528)
chr5 (102-214)||(21235108-21235220)
chr5 (102-198)||(10779882-10779977)
chr5 (102-194)||(16534791-16534882)
chr5 (75-198)||(1170293-1170414)
chr5 (75-194)||(11582325-11582442)
chr5 (75-198)||(24470711-24470832)
chr5 (102-177)||(35792833-35792907)
chr5 (102-198)||(110687-110782)
chr5 (102-194)||(22884886-22884976)
chr5 (118-198)||(1221450-1221529)
chr5 (102-198)||(11213306-11213401)
chr5 (125-198)||(27185449-27185521)
chr5 (120-198)||(4863740-4863817)
chr5 (120-198)||(21392605-21392682)
chr5 (92-198)||(21653041-21653145)
chr5 (125-198)||(21661339-21661411)
chr5 (131-198)||(25211623-25211689)
chr5 (131-198)||(25275775-25275841)
chr5 (77-135)||(25192751-25192808)
chr5 (75-177)||(28258021-28258121)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (102-227)||(2450909-2451033)
chr3 (102-227)||(18909140-18909264)
chr3 (102-227)||(22273495-22273619)
chr3 (102-227)||(16819357-16819481)
chr3 (113-226)||(18905349-18905462)
chr3 (102-227)||(23081747-23081871)
chr3 (104-227)||(15470048-15470170)
chr3 (102-227)||(15574495-15574619)
chr3 (102-227)||(15613514-15613638)
chr3 (102-212)||(16745753-16745862)
chr3 (102-214)||(8269985-8270096)
chr3 (102-214)||(8277096-8277207)
chr3 (102-214)||(8305905-8306016)
chr3 (102-214)||(12266072-12266183)
chr3 (102-214)||(30151797-30151908)
chr3 (102-214)||(53769121-53769232)
chr3 (75-198)||(25057250-25057372)
chr3 (75-198)||(30141363-30141486)
chr3 (102-214)||(1469235-1469346)
chr3 (102-214)||(13956387-13956498)
chr3 (102-214)||(13977220-13977331)
chr3 (102-214)||(27839168-27839279)
chr3 (102-214)||(44227888-44227999)
chr3 (102-214)||(45859480-45859591)
chr3 (75-198)||(17957968-17958090)
chr3 (102-216)||(14846244-14846357)
chr3 (75-198)||(15860780-15860901)
chr3 (102-214)||(55314842-55314953)
chr3 (102-219)||(15940045-15940161)
chr3 (102-198)||(33340320-33340415)
chr3 (102-214)||(41268702-41268813)
chr3 (104-198)||(19262602-19262695)
chr3 (102-198)||(2048538-2048633)
chr3 (102-198)||(19945107-19945201)
chr3 (102-198)||(23490983-23491078)
chr3 (103-200)||(5227193-5227290)
chr3 (102-198)||(17913835-17913930)
chr3 (75-198)||(11813310-11813431)
chr3 (113-198)||(10737036-10737121)
chr3 (90-198)||(19572417-19572523)
chr3 (102-198)||(51160067-51160161)
chr3 (102-177)||(16259544-16259618)
chr3 (117-198)||(17099088-17099168)
chr3 (125-198)||(50113743-50113816)
chr3 (113-197)||(19230531-19230614)
chr3 (118-194)||(49230696-49230771)
chr3 (75-198)||(16183637-16183758)
chr3 (120-177)||(8630338-8630395)
chr3 (124-198)||(319228-319301)
chr3 (128-198)||(45581313-45581382)
chr3 (99-198)||(6148453-6148548)
chr3 (92-198)||(30204870-30204972)
chr3 (92-198)||(22145871-22145975)
chr3 (126-175)||(12351462-12351511)
chr3 (120-175)||(7852301-7852356)
chr3 (124-177)||(12563156-12563211)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (102-227)||(19888361-19888485)
chr2 (102-227)||(8942095-8942219)
chr2 (102-227)||(12637748-12637872)
chr2 (102-227)||(21140326-21140450)
chr2 (102-227)||(21276110-21276234)
chr2 (102-227)||(34822647-34822771)
chr2 (102-227)||(3800696-3800820)
chr2 (75-198)||(461142-461265)
chr2 (113-227)||(24828154-24828268)
chr2 (113-227)||(24832606-24832720)
chr2 (102-214)||(12726515-12726626)
chr2 (76-197)||(9654462-9654583)
chr2 (102-214)||(14908021-14908132)
chr2 (102-214)||(20013585-20013696)
chr2 (102-214)||(23772999-23773110)
chr2 (102-214)||(23818642-23818753)
chr2 (102-214)||(28777282-28777393)
chr2 (102-214)||(5889879-5889990)
chr2 (102-214)||(11232834-11232945)
chr2 (102-214)||(17398179-17398290)
chr2 (102-214)||(22514681-22514792)
chr2 (79-198)||(24966693-24966812)
chr2 (102-225)||(22692741-22692863)
chr2 (102-225)||(22697388-22697510)
chr2 (102-225)||(22273336-22273458)
chr2 (102-225)||(22282569-22282691)
chr2 (104-214)||(24687254-24687363)
chr2 (127-224)||(25211332-25211429)
chr2 (102-198)||(8886612-8886706)
chr2 (102-198)||(20629016-20629111)
chr2 (102-198)||(12643609-12643703)
chr2 (92-198)||(25877607-25877711)
chr2 (113-198)||(43644570-43644654)
chr2 (120-198)||(15631867-15631945)
chr2 (120-198)||(36892376-36892453)
chr2 (125-198)||(6877914-6877986)
chr2 (126-198)||(22861959-22862030)
chr2 (124-198)||(25600432-25600505)
chr2 (118-177)||(720859-720920)
chr2 (120-177)||(19435084-19435143)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (75-214)||(15503-15641)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (102-227)||(5632-5756)
scaffold0003 (102-225)||(217336-217458)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (75-198)||(22008111-22008233)
chr8 (102-227)||(3433159-3433283)
chr8 (102-225)||(23509370-23509492)
chr8 (102-227)||(24547674-24547798)
chr8 (75-198)||(13664268-13664390)
chr8 (75-198)||(13723543-13723665)
chr8 (75-198)||(24108217-24108338)
chr8 (75-197)||(43375156-43375278)
chr8 (102-214)||(642953-643064)
chr8 (102-214)||(5236658-5236769)
chr8 (102-214)||(21846074-21846185)
chr8 (102-214)||(21853479-21853590)
chr8 (102-214)||(24662829-24662940)
chr8 (102-214)||(224746-224857)
chr8 (102-214)||(272785-272896)
chr8 (102-214)||(738369-738480)
chr8 (102-214)||(828759-828870)
chr8 (102-214)||(862264-862375)
chr8 (102-214)||(22090027-22090138)
chr8 (102-214)||(43684117-43684228)
chr8 (102-214)||(15320643-15320754)
chr8 (102-214)||(15501012-15501123)
chr8 (102-214)||(16675909-16676020)
chr8 (75-198)||(22909116-22909239)
chr8 (102-214)||(701159-701270)
chr8 (102-202)||(16874522-16874621)
chr8 (102-225)||(24387294-24387415)
chr8 (102-198)||(29758771-29758866)
chr8 (75-197)||(24719049-24719169)
chr8 (102-198)||(16203922-16204016)
chr8 (102-191)||(24930701-24930789)
chr8 (102-192)||(270226-270314)
chr8 (102-192)||(645606-645694)
chr8 (102-192)||(831341-831429)
chr8 (120-198)||(19994818-19994895)
chr8 (92-177)||(25120939-25121023)
chr8 (125-198)||(37605464-37605536)
chr8 (120-177)||(16416737-16416794)
chr8 (120-193)||(41244113-41244185)
chr8 (120-198)||(20480073-20480150)
chr8 (92-198)||(22323091-22323194)
chr8 (124-177)||(17731137-17731192)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (102-227)||(1372-1497)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (102-227)||(15893-16017)
scaffold0396 (120-198)||(13806-13883)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (102-227)||(155936-156060)
scaffold0023 (102-214)||(34796-34907)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (102-226)||(4292-4415)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (102-226)||(14751-14874)
scaffold0225 (102-226)||(28272-28395)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (104-222)||(1-118)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (113-226)||(9522-9635)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (113-226)||(51483-51596)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (102-214)||(17676-17787)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (102-214)||(25366-25477)
scaffold0141 (102-214)||(21111-21222)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (102-214)||(3159-3270)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (102-226)||(6735-6858)
scaffold0022 (102-226)||(59022-59145)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (76-197)||(6782-6902)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (75-197)||(33756-33878)
scaffold0184 (102-226)||(32779-32902)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (75-197)||(38966-39088)
scaffold0078 (102-226)||(39942-40065)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (77-198)||(77900-78020)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (102-214)||(37752-37863)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (102-222)||(128843-128962)
scaffold0028 (75-194)||(90572-90689)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (79-198)||(1510-1627)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (75-198)||(76365-76486)
scaffold0011 (79-195)||(192983-193097)
scaffold0011 (79-198)||(71988-72105)
scaffold0011 (75-198)||(124965-125086)
scaffold0011 (120-198)||(256576-256653)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (102-214)||(29814-29925)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (102-220)||(13-131)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (75-195)||(712-830)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (75-198)||(19202-19325)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (103-198)||(54119-54213)
scaffold0032 (102-177)||(109668-109742)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (75-197)||(40006-40126)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (102-216)||(106461-106574)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (75-173)||(17075-17174)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (74-198)||(31211-31333)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (102-218)||(197688-197803)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (75-197)||(3426-3546)
scaffold0269 (102-198)||(558-652)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (75-197)||(30998-31118)
scaffold0049 (113-163)||(44639-44689)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (113-198)||(270599-270684)
scaffold0009 (125-198)||(236654-236726)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (102-198)||(4337-4432)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (102-198)||(11618-11713)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (132-212)||(24878-24958)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (102-198)||(49177-49272)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (113-193)||(129797-129877)
scaffold0008 (75-196)||(21037-21156)
scaffold0008 (117-196)||(28627-28705)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (102-193)||(12787-12876)
scaffold0266 (102-193)||(5185-5274)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (156-227)||(25804-25875)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (76-198)||(20879-20999)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (102-198)||(2718-2815)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (102-177)||(870-944)
scaffold0383 (120-198)||(5706-5783)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (102-197)||(145012-145105)
scaffold0025 (113-197)||(147271-147354)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (120-198)||(14149-14228)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (75-177)||(28254-28355)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (103-177)||(56432-56505)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (113-193)||(7465-7545)
scaffold0498 (137-177)||(7322-7362)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (75-198)||(14978-15099)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (100-198)||(1043-1139)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (120-198)||(76760-76837)
scaffold0021 (120-198)||(138422-138499)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (124-198)||(249158-249231)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (75-192)||(6282-6397)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (125-198)||(60047-60119)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (102-225)||(41158-41280)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (92-198)||(18058-18162)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (125-198)||(27045-27119)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (120-198)||(26432-26509)
scaffold0037 (125-177)||(66337-66389)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (121-198)||(7030-7106)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (125-198)||(12671-12743)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (120-175)||(7927-7982)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (120-198)||(6019-6096)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (120-198)||(17778-17855)
scaffold0195 (120-198)||(19862-19939)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (125-198)||(4601-4674)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (120-177)||(163828-163885)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (120-199)||(3723-3801)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (120-198)||(3098-3175)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (120-198)||(3132-3209)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (125-175)||(72127-72177)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (120-177)||(7225-7282)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (125-198)||(37935-38007)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (75-111)||(28144-28180)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (120-175)||(13450-13505)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (126-177)||(15833-15884)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (184-214)||(67062-67092)
scaffold0044 (185-214)||(67093-67122)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18167313 - 18167166
Alignment:
Q  80 gatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18167313 gatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgt 18167214  T
Q  180 gaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18167213 gacatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 18167166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18246763 - 18246639
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246763 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 18246665  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18246664 ttgagatgaatgattattgatgatgt 18246639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 15288584 - 15288722
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  15288584 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 15288682  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15288683 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 15288722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 15295751 - 15295889
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  15295751 gcagagatcttttgagatatggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 15295849  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295850 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 15295889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14994773 - 14994649
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14994773 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgatgaa 14994675  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  14994674 atgagatgaatgattattgatgatgt 14994649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47355898 - 47355774
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355898 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 47355800  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47355799 ttgagatgaatgattattgatgatgt 47355774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19999100 - 19998978
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999100 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 19999002  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19999001 atgagatgaatgattattgatgat 19998978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8373031 - 8372922
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgatta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8373031 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgatta 8372932  T
Q  218 ttgatgatgt 227  Q
    ||||||||||    
T  8372931 ttgatgatgt 8372922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10642711 - 10642589
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10642711 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 10642613  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  10642612 tgtttgataaatgtgattggtgat 10642589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26678615 - 26678493
Alignment:
Q  104 tgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaatt 203  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26678615 tgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaat 26678517  T
Q  204 gagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26678516 gagatgaatgattattgatgatgt 26678493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10487244 - 10487133
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10487244 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 10487146  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  10487145 ttgagatgaatga 10487133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Original strand, 15138158 - 15138262
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgatta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15138158 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgtgatgaatgatta 15138257  T
Q  218 ttgat 222  Q
    |||||    
T  15138258 ttgat 15138262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16329507 - 16329618
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16329507 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 16329605  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  16329606 ttgagatgaatga 16329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9294049 - 9293927
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9294049 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 9293951  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | | | | ||||||||||||||    
T  9293950 tgtttcataaatgtgattggtgat 9293927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 13049748 - 13049859
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13049748 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 13049846  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  13049847 ttgagatgaatga 13049859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 54119863 - 54119983
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54119863 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgac-tctttggagatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctt 54119961  T
Q  176 atgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    || ||| ||||||||| ||||||    
T  54119962 at-tgatatatgtgatcggtgat 54119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14950593 - 14950482
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14950593 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattggtgatgaa 14950495  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  14950494 ttgagatgaatga 14950482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26338058 - 26337947
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26338058 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagttctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 26337960  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  26337959 ttgagatgaatga 26337947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 110055 - 109960
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  110055 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 109960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Original strand, 53909403 - 53909523
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  53909403 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 53909501  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  53909502 tat-tgatatatgtgattggtga 53909523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 15274359 - 15274439
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15274359 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15274439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15211913 - 15211817
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  15211913 ggtgacgtcctttttggatatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 15211817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 198
Target Start/End: Original strand, 16366348 - 16366454
Alignment:
Q  90 gatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16366348 gatctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtg 16366445  T
Q  190 attggtgat 198  Q
    ||| |||||    
T  16366446 attagtgat 16366454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 22356148 - 22356242
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22356148 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 22356242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 5684488 - 5684583
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||| ||||    
T  5684488 ggtgacgaccttgttg-agatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 5684583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44054406 - 44054334
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44054406 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 44054334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16521361 - 16521294
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatga 170  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16521361 ggtgacgacctttt-gaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13244845 - 13244768
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13244845 gatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 13244768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 7134048 - 7134152
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||     
T  7134048 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt---------ggtac---atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7134135  T
Q  179 tgaaatatgtgattggtg 196  Q
    || || ||||||||||||    
T  7134136 tggaa-atgtgattggtg 7134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 12901388 - 12901459
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  12901388 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaa--atgtgattggtgat 12901459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Original strand, 21961184 - 21961234
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21961184 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 21961234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33738715 - 33738638
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  33738715 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtgat 33738638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 8874109 - 8874161
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8874109 ggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 8874161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 12837938 - 12838017
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtc--cataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  12837938 gatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctt-tttgatatatgtgattggtgat 12838017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44345317 - 44345260
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44345317 gatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat 44345260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848829
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgat 7848829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 160
Target Start/End: Original strand, 53706437 - 53706521
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatat 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  || ||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  53706437 gcagggatcttttgagatctggatatgggtgacgacc-ctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 43283059 - 43283118
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  43283059 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttat 43283118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14900029 - 14899970
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14900029 gatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttat 14899970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Original strand, 52267141 - 52267196
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||    
T  52267141 gatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706578
Alignment:
Q  134 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatttgtgtttggtgat 53706578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 21651574 - 21651712
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  21651574 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 21651673  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatg 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21651674 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatg 21651712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17147353 - 17147229
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147353 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 17147255  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17147254 ttgagatgaatgattattgatgatgt 17147229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22226554 - 22226430
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22226554 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 22226456  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  22226455 atgagatgaatgattattgatgatgt 22226430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 35935165 - 35935289
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35935165 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtcaaattcgtgattggtgatgaa 35935263  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  35935264 atgagatgaatgattattgatgatgt 35935289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51451185 - 51451074
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51451185 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 51451087  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  51451086 ttgagatgaatga 51451074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 20826814 - 20826925
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20826814 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 20826912  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  20826913 ttgagatgaatga 20826925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22034420 - 22034309
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22034420 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 22034322  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  22034321 ttgagatgaatga 22034309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21858081 - 21857931
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21858081 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtc 21857982  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgat 225  Q
    |||| ||| |||||||| || |  |||| || ||| |||||||||| |||||    
T  21857981 ttat-tgacatatgtgactgtttttgaaatgtgattaatgattattcatgat 21857931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22365280 - 22365158
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22365280 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtct 22365182  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  22365181 tgtttgataaatgtgattggtgat 22365158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41393024 - 41392914
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41393024 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 41392926  T
Q  202 ttgagatgaatg 213  Q
     |||||||||||    
T  41392925 atgagatgaatg 41392914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45050249 - 45050135
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  45050249 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatggaatgagatgaat 45050150  T
Q  213 gattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||    
T  45050149 gattattgatgatgt 45050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 7642175 - 7642286
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7642175 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgatgaa 7642273  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | || ||||||||    
T  7642274 tcgatatgaatga 7642286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17003397 - 17003286
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17003397 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 17003299  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  17003298 tggagaagaatga 17003286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29137385 - 29137281
Alignment:
Q  109 acctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagat 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29137385 acctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagat 29137287  T
Q  209 gaatga 214  Q
    ||||||    
T  29137286 gaatga 29137281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 5073893 - 5074004
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||     
T  5073893 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgat 5073991  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  5073992 ttgagatgaatga 5074004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 18602636 - 18602747
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||     
T  18602636 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgat 18602734  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  18602735 ttgagatgaatga 18602747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22352699 - 22352604
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22352699 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22352604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 44036492 - 44036615
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  44036492 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 44036590  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     || ||| |||||||||| ||||||    
T  44036591 atgtgattaatgattattcatgatg 44036615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 22250594 - 22250711
Alignment:
Q  77 agagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||     
T  22250594 agagatcttttgagatctggatttggaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtca 22250692  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    ||| || || ||||||||||    
T  22250693 tatttggaa-atgtgattgg 22250711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 9785871 - 9785992
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9785871 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 9785969  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  9785970 tat-tgataaatgtggttggtgat 9785992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20930044 - 20929924
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||   |||||    
T  20930044 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgtccatgaa 20929947  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatga 224  Q
     || ||| |||||||||| ||||    
T  20929946 atgtgattaatgattattcatga 20929924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20444311 - 20444217
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20444311 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20444217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 37846065 - 37846159
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37846065 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 37846159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20530065 - 20529981
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20530065 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20529981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 15863018 - 15863108
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  15863018 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 15863108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 20895362 - 20895483
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20895362 gcagagatcttttgagatcaggatatgggtgacgaccctga-gatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 20895460  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20895461 tat-tgatatatgtgattggtgat 20895483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49966162 - 49966058
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  49966162 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgat 49966065  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  49966064 tggtgat 49966058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 22407883 - 22407987
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  22407883 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttat-tgatatatgtgat 22407980  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  22407981 tggtgat 22407987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 2422724 - 2422826
Alignment:
Q  94 tggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  2422724 tggatatgggtgacgac-tttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattg 2422821  T
Q  194 gtgat 198  Q
    |||||    
T  2422822 gtgat 2422826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41210571 - 41210509
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41210571 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacc-tttaggagatttggtaccacatgcat 41210509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35053384 - 35053332
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35053384 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 35053332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Original strand, 5676222 - 5676291
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  5676222 ggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggt 5676291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 22836927 - 22837006
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  22836927 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtgattgatgat 22837006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 20956643 - 20956702
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  20956643 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttat 20956702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18505868 - 18505814
Alignment:
Q  90 gatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtg 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18505868 gatctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtg 18505814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 147
Target Start/End: Original strand, 77631 - 77676
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 147  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  77631 ggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 77676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 18981541 - 18981680
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||     
T  18981541 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatagcatgagtcc 18981640  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18981641 tatgtgaattatgtgattggtgatgaaatgagatgaatga 18981680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 224
Target Start/End: Original strand, 2192330 - 2192479
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2192330 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 2192429  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 224  Q
    | | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  2192430 tgtttgataaatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgactattcatga 2192479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 224
Target Start/End: Original strand, 16480560 - 16480709
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16480560 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtct 16480659  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 224  Q
    | | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  16480660 tgtttgataaatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgactattcatga 16480709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15925896 - 15925758
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  15925896 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 15925798  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15925797 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 15925758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16417044 - 16416920
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16417044 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgatgaa 16416946  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16416945 ttgagatgaatgattattgatgatgt 16416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7821501 - 7821390
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7821501 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 7821403  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  7821402 ttgagaagaatga 7821390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7828812 - 7828701
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7828812 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 7828714  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  7828713 ttgagaagaatga 7828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13757155 - 13757044
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13757155 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 13757057  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  13757056 ttgagatgaatga 13757044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 15443145 - 15443256
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15443145 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 15443243  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  15443244 ttgagatgaatga 15443256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 15518444 - 15518555
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15518444 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 15518542  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  15518543 atgagatgaatga 15518555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 25293865 - 25293976
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25293865 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 25293963  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  25293964 ttgagatgaatga 25293976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27175193 - 27175082
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27175193 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 27175095  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  27175094 ttgagaagaatga 27175082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 30263725 - 30263821
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30263725 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 30263821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 38785225 - 38785336
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38785225 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 38785323  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  38785324 ttgagaagaatga 38785336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2436205 - 2436088
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2436205 ggtgacgacctttttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 2436107  T
Q  202 ttgagatgaatgattattg 220  Q
     || |||||||||||||||    
T  2436106 atgggatgaatgattattg 2436088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10988188 - 10988077
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10988188 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaa 10988090  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  10988089 atgagatgaatga 10988077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11514684 - 11514588
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514684 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 11514588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 26010779 - 26010890
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26010779 ggtgacgaccttgttg-agatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 26010877  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  26010878 ttgagatgaatga 26010890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 27103133 - 27103244
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27103133 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 27103231  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  27103232 tggagaagaatga 27103244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 27110481 - 27110592
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27110481 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 27110579  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  27110580 tggagaagaatga 27110592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36051193 - 36051071
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||    
T  36051193 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtc 36051094  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  36051093 ttat-tgatatatgtgattggtga 36051071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16210305 - 16210186
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16210305 agatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcat 16210206  T
Q  178 gtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
     ||| |||||||||| |||||    
T  16210205 -tgatatatgtgatttgtgat 16210186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 13912700 - 13912811
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  13912700 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattgacgatgaa 13912798  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  13912799 ttgagatgaatga 13912811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 32496144 - 32496239
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32496144 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 32496239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7291381 - 7291259
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7291381 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtggcggcctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 7291283  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | ||| ||||  ||||||||||||||    
T  7291282 catatttgaa--atgtgattggtgat 7291259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 201
Target Start/End: Original strand, 18255410 - 18255508
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18255410 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 18255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Original strand, 11582506 - 11582628
Alignment:
Q  74 agcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttgga--gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11582506 agcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccct---gaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgag 11582602  T
Q  172 tcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11582603 tcttat-tgatatatgtgattggtgat 11582628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 369462 - 369367
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  369462 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 369367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 1938365 - 1938439
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1938365 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 1938439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 13038781 - 13038902
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttgga--gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |   | |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13038781 gcagagatcttttgagatctggatatgagtgacgaccct---gaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagt 13038877  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13038878 tttat-tgatatatgtgattggtgat 13038902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 198
Target Start/End: Original strand, 13867675 - 13867781
Alignment:
Q  90 gatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13867675 gatctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtg 13867772  T
Q  190 attggtgat 198  Q
     ||||||||    
T  13867773 gttggtgat 13867781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 15761955 - 15762050
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  15761955 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgat 15762050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 15952682 - 15952772
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15952682 ggtgacgaccttgttg-agacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaa-atgtgattgg 15952772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122986
Alignment:
Q  121 atttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 122986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 112913 - 112990
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  112913 gattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaa-atgtgattggtgat 112990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Original strand, 42057750 - 42057819
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42057750 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3893641 - 3893569
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  3893641 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 3893569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12753432 - 12753377
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12753432 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 12753377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44863722 - 44863618
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  44863722 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgat 44863625  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  44863624 tggtgat 44863618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 45453873 - 45453944
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  45453873 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaa--ttgtgattggtgat 45453944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 142147 - 142046
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  142147 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgat 142050  T
Q  192 tggt 195  Q
    ||||    
T  142049 tggt 142046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Original strand, 26071886 - 26071956
Alignment:
Q  127 taccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26071886 taccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26071956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Original strand, 26095673 - 26095743
Alignment:
Q  127 taccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26095673 taccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26095743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 15824120 - 15824197
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  15824120 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgtttggtgat 15824197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47288228 - 47288151
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  47288228 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtaattggtgat 47288151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11285698 - 11285642
Alignment:
Q  121 atttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11285698 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat 11285642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 42059941 - 42059989
Alignment:
Q  166 catgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42059941 catgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 42059989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3055253 - 3055196
Alignment:
Q  141 atgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  3055253 atgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgat 3055196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3058625 - 3058582
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgt 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058625 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgt 3058582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 198
Target Start/End: Original strand, 12545423 - 12545498
Alignment:
Q  122 tttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  12545423 tttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 12545498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2025002 - 2024945
Alignment:
Q  136 catttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  2025002 catttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 2024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 147
Target Start/End: Original strand, 21676632 - 21676677
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 147  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21676632 ggtgacgacctttgaggcgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 21676677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25174135 - 25174011
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174135 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 25174037  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25174036 ttgagatgaatgattattgatgatgt 25174011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 18088344 - 18088482
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  18088344 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 18088442  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18088443 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 18088482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 22227233 - 22227369
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  22227233 gcagaggtcttttgagatctggattagggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 22227332  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22227333 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaaacgagatgaa 22227369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 1659292 - 1659416
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1659292 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgatgaa 1659390  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  1659391 ttgagatgaatgcttattgatgatgt 1659416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23976148 - 23976024
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976148 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 23976050  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  23976049 atgagatgaatgattattgatgatgt 23976024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 33316165 - 33316289
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33316165 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 33316263  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  33316264 atgagatgaatgattattgatgatgt 33316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11214719 - 11214595
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11214719 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgatgaa 11214620  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  11214619 atgagattaatgattattgatgatg 11214595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19609029 - 19608891
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  19609029 gcagagatcttttgagatttggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgtatatcatagcatgagtcc 19608931  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19608930 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgtgatgaatga 19608891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 201
Target Start/End: Original strand, 17343819 - 17343945
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  17343819 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtct 17343918  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17343919 tatgtgatataagtgattggtgatgaa 17343945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 27655669 - 27655780
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655669 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 27655767  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  27655768 atgagatgaatga 27655780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 18004607 - 18004729
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18004607 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 18004705  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  18004706 tgtttgagaaatgtgattggtgat 18004729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 1651531 - 1651655
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1651531 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 1651629  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  1651630 atgagatgaatgattattgatgatgt 1651655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 18825392 - 18825513
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  18825392 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtca 18825490  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18825491 tatttgaaa-atgtgattggtgat 18825513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 198
Target Start/End: Original strand, 13622756 - 13622877
Alignment:
Q  77 agagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13622756 agagatctattgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctt 13622855  T
Q  176 atgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    || ||| ||||||||||||||||    
T  13622856 at-tgatatatgtgattggtgat 13622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16230160 - 16230049
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16230160 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 16230062  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  16230061 ttgagatgaatga 16230049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18740980 - 18740861
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  18740980 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtct 18740881  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggt 195  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  18740880 tat-tgatatatgtgattggt 18740861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 29871058 - 29871169
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29871058 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 29871156  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  29871157 ttgagatgaatga 29871169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 18843453 - 18843574
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||     
T  18843453 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtca 18843551  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18843552 tatttgaaa-atgtgattggtgat 18843574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10487459 - 10487348
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10487459 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 10487361  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  10487360 tggagaagaatga 10487348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16377868 - 16377979
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16377868 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 16377966  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  16377967 tggagaagaatga 16377979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16385192 - 16385303
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16385192 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 16385290  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  16385291 tggagaagaatga 16385303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16650829 - 16650940
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  16650829 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 16650927  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  16650928 ttgagatgaatga 16650940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 14628194 - 14628315
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  14628194 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgatgaa 14628292  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatga 224  Q
     |||||||||||| |||| ||||    
T  14628293 atgagatgaatgactattcatga 14628315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16557599 - 16557710
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  16557599 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 16557697  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  16557698 ttgagatgaatga 16557710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26088414 - 26088303
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26088414 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 26088316  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
      || ||||||||    
T  26088315 acgaaatgaatga 26088303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23993740 - 23993644
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatg 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23993740 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatg 23993644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16238944 - 16238849
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16238944 ggtgacgacctttttggagattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 16238849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 16642609 - 16642705
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16642609 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 16642705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 19984789 - 19984884
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19984789 ggtgacgacctttt-ggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 19984884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1554420 - 1554325
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  1554420 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgat 1554325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4989476 - 4989381
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||| ||||    
T  4989476 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 4989381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 25646507 - 25646611
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  25646507 tctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatttgat 25646604  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  25646605 tggtgat 25646611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18128833 - 18128757
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18128833 gatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaa--atgtgattggtgat 18128757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 35017274 - 35017376
Alignment:
Q  75 gcagagatctttt-gagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  35017274 gcagagatctttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtc 35017372  T
Q  174 ttat 177  Q
    ||||    
T  35017373 ttat 35017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15861312 - 15861243
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15861312 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Original strand, 16827461 - 16827534
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctta 176  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16827461 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtctta 16827534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18422314 - 18422210
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  18422314 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgat 18422217  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  18422216 tggtgat 18422210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31626991 - 31626914
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31626991 gatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 31626914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 25745914 - 25745991
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25745914 gatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 25745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18775759 - 18775687
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  18775759 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaa-atgtgaatggtgat 18775687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22428723 - 22428673
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22428723 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 22428673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16105106 - 16105056
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16105106 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtctt 16105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  132 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctta 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15861242 - 15861210
Alignment:
Q  195 tgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861242 tgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 15861210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21930463 - 21930418
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 147  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21930463 ggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 21930418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10926 - 10802
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 10828  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10827 ttgagatgaatgattattgatgatgt 10802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25425197 - 25425073
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425197 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 25425099  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25425098 ttgagatgaatgattattgatgatgt 25425073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7424204 - 7424067
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7424204 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcct 7424106  T
Q  176 atgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7424105 atgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 7424067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 29192320 - 29192444
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29192320 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgatgaa 29192418  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29192419 ttgagatgaatgattattgatgatgt 29192444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11341211 - 11341087
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341211 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 11341113  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  11341112 atgagatgaatgattattgatgatgt 11341087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19498375 - 19498253
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498375 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 19498277  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19498276 atgagatgaatgattattgatgat 19498253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 17473522 - 17473645
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17473522 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtc 17473621  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17473622 ttat-tgatatatgtgattggtgat 17473645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 18779745 - 18779847
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18779745 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgatgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 18779844  T
Q  175 tat 177  Q
    |||    
T  18779845 tat 18779847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 4201669 - 4201780
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4201669 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 4201767  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  4201768 atgagatgaatga 4201780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21075191 - 21075302
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21075191 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21075289  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  21075290 atgagatgaatga 21075302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 9732369 - 9732493
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9732369 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattggtgatgaa 9732467  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  9732468 atgagatgaatgattattgatgatgt 9732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24595076 - 24594965
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24595076 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 24594978  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  24594977 ttgagatgaatga 24594965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37051560 - 37051449
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37051560 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 37051462  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  37051461 ttgagatgaatga 37051449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21933862 - 21933973
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21933862 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21933960  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  21933961 tggagaagaatga 21933973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21940032 - 21940143
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21940032 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21940130  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  21940131 tggagaagaatga 21940143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 25902043 - 25902139
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25902043 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 25902139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27008587 - 27008476
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27008587 ggtgacgaccttgttg-agatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 27008489  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  27008488 ttgagatgaatga 27008476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35580830 - 35580719
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35580830 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 35580732  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  35580731 tggagaagaatga 35580719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 37010866 - 37010977
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37010866 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 37010964  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  37010965 tagagaagaatga 37010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 43445460 - 43445581
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43445460 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgatgaa 43445558  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatga 224  Q
     |||||||||||| |||| ||||    
T  43445559 atgagatgaatgactattcatga 43445581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20615173 - 20615077
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615173 gagatttggtagcgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 20615077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23510513 - 23510395
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23510513 agatcttttgagatctggatatgggtgataacctttt-ggagatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatg 23510415  T
Q  179 tgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  23510414 tgataaatgtgattggtgat 23510395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 22368187 - 22368282
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368187 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22368282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23327528 - 23327417
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23327528 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattcgtgatgaa 23327430  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    ||||| |||||||    
T  23327429 ttgaggtgaatga 23327417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21235108 - 21235220
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagattt-ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatga 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21235108 ggtgacgaccttgttg-agattttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcataacatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatga 21235206  T
Q  201 attgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21235207 attgagatgaatga 21235220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 10779882 - 10779977
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10779882 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 10779977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16534882 - 16534791
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16534882 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattgg 16534791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 1170293 - 1170414
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  1170293 gcagagatcttttgagatctagatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtct 1170391  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1170392 tat-tgatatatgtgattggtgat 1170414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11582442 - 11582325
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11582442 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-gatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtct 11582344  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    ||| |||  |||||||||||    
T  11582343 tat-tgatgtatgtgattgg 11582325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24470832 - 24470711
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24470832 gcagagatcttttgagatctggacatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 24470734  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  24470733 ta-ctgatatatgtgattgctgat 24470711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 35792833 - 35792907
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35792833 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 35792907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 110687 - 110782
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||| ||||    
T  110687 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 110782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 22884886 - 22884976
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  22884886 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 22884976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 1221450 - 1221529
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaa-atgtgattggtgat 1221529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 11213306 - 11213401
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||    
T  11213306 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgat 11213401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 27185449 - 27185521
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  27185449 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 27185521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4863817 - 4863740
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4863817 gatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 4863740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21392682 - 21392605
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21392682 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 21392605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 21653041 - 21653145
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||    
T  21653041 tctggatatgggtgacgaccttga-ggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttat-tgataaatgtgat 21653138  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  21653139 tggtgat 21653145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 21661339 - 21661411
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  21661339 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgaatggtgat 21661411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211689
Alignment:
Q  131 acatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 25211689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275841
Alignment:
Q  131 acatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 25275841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 25192751 - 25192808
Alignment:
Q  77 agagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25192751 agagatcttttgagatttggatatgggtgacgacc-ttttggagatttggtaccacatg 25192808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28258121 - 28258021
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |    
T  28258121 gcagagatccttggtggtctggatatgggtgacgaccttga-ggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttt 28258024  T
Q  175 tat 177  Q
    |||    
T  28258023 tat 28258021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 2450909 - 2451033
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450909 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 2451007  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2451008 ttgagatgaatgattattgatgatgt 2451033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18909264 - 18909140
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909264 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 18909166  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18909165 ttgagatgaatgattattgatgatgt 18909140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22273619 - 22273495
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273619 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 22273521  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22273520 ttgagatgaatgattattgatgatgt 22273495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16819481 - 16819357
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819481 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 16819383  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  16819382 ttgagatgaatgattactgatgatgt 16819357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 18905349 - 18905462
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18905349 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaat 18905448  T
Q  213 gattattgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||    
T  18905449 gattattgatgatg 18905462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 23081747 - 23081871
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23081747 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaa 23081845  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  23081846 atgagatgaatgattattgatgatgt 23081871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470170
Alignment:
Q  104 tgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15470048 tgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgatgaaat 15470146  T
Q  204 gagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15470147 gagatgaatgattattgatgatgt 15470170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15574619 - 15574495
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15574619 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 15574521  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15574520 atgagatgaatgattattgatgatgt 15574495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15613638 - 15613514
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15613638 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 15613540  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15613539 atgagatgaatgattattgatgatgt 15613514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Original strand, 16745753 - 16745862
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16745753 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 16745851  T
Q  202 ttgagatgaat 212  Q
     ||||||||||    
T  16745852 atgagatgaat 16745862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 8269985 - 8270096
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8269985 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 8270083  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  8270084 ttgagatgaatga 8270096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 8277096 - 8277207
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8277096 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 8277194  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  8277195 ttgagatgaatga 8277207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 8305905 - 8306016
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8305905 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 8306003  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  8306004 ttgagatgaatga 8306016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 12266072 - 12266183
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12266072 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgatgaa 12266170  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  12266171 atgagatgaatga 12266183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30151908 - 30151797
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30151908 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 30151810  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  30151809 ttgagatgaatga 30151797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53769232 - 53769121
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53769232 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 53769134  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  53769133 ttgagatgaatga 53769121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25057372 - 25057250
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25057372 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccttat-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 25057274  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  25057273 tgtttgataaatgtgattggtgat 25057250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30141486 - 30141363
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30141486 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 30141388  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  30141387 catatttgaaa-atgtgattggtgat 30141363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 1469235 - 1469346
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1469235 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 1469333  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  1469334 tggagaagaatga 1469346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 13956387 - 13956498
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  13956387 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 13956485  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  13956486 ttgagatgaatga 13956498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 13977220 - 13977331
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  13977220 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 13977318  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  13977319 ttgagatgaatga 13977331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27839279 - 27839168
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27839279 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgatgaa 27839181  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  27839180 ttgagatgaatga 27839168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44227999 - 44227888
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  44227999 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaa 44227901  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  44227900 atgagatgaatga 44227888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45859591 - 45859480
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  45859591 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 45859493  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  45859492 ttgagatgaatga 45859480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 17957968 - 17958090
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17957968 gcagagatctattgagatctggatataggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtct 17958066  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17958067 tatatgatatatgtgattgatgat 17958090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Original strand, 14846244 - 14846357
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  14846244 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgataaa 14846342  T
Q  202 ttgagatgaatgatt 216  Q
     ||||||||||||||    
T  14846343 atgagatgaatgatt 14846357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 15860780 - 15860901
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15860780 gcagagatattttgagatctggatttgggtgacgacccttt-ggagatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtct 15860878  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15860879 tat-tgatatatgtgattggtgat 15860901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55314953 - 55314842
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||     
T  55314953 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgat 55314855  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  55314854 ttgagatgaatga 55314842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Original strand, 15940045 - 15940161
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15940045 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgatgaa 15940143  T
Q  202 ttgagatgaatgattatt 219  Q
     || | ||||||||||||    
T  15940144 atgtggtgaatgattatt 15940161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33340415 - 33340320
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33340415 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 33340320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41268813 - 41268702
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||      
T  41268813 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgtt 41268715  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  41268714 ttgagatgaatga 41268702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262695
Alignment:
Q  104 tgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19262602 tgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 19262695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2048633 - 2048538
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2048633 ggtgacgacctttt-gaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgat 2048538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19945201 - 19945107
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19945201 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 19945107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23491078 - 23490983
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  23491078 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 23490983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5227290 - 5227193
Alignment:
Q  103 gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  5227290 gtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgattagtgatga 5227193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 17913835 - 17913930
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  17913835 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgat 17913930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11813431 - 11813310
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11813431 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 11813333  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  11813332 tat-tgataaatgtgattgctgat 11813310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10737121 - 10737036
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  10737121 ttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgat 10737036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 198
Target Start/End: Original strand, 19572417 - 19572523
Alignment:
Q  90 gatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19572417 gatctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtg 19572514  T
Q  190 attggtgat 198  Q
    | |||||||    
T  19572515 agtggtgat 19572523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 51160067 - 51160161
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  51160067 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcat-tgatatatgtgattggtgat 51160161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16259618 - 16259544
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16259618 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttat 16259544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17099168 - 17099088
Alignment:
Q  117 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17099168 ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 17099088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 50113743 - 50113816
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50113743 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 50113816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19230614 - 19230531
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19230614 ttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgataaatgtgattggtga 19230531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49230771 - 49230696
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 49230696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 16183637 - 16183758
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16183637 gcagagatccttggtggtctggatatgggtgacgac-tttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtct 16183735  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16183736 tat-tgatatatgtgtttggtgat 16183758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8630395 - 8630338
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8630395 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 8630338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Original strand, 319228 - 319301
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  319228 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgcgattggtgat 319301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581313
Alignment:
Q  128 accacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 45581313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 6148453 - 6148548
Alignment:
Q  99 ttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6148453 ttgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tg--atatgtgattggtgat 6148548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30204972 - 30204870
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    |||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  30204972 tctggattcgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcattt--gtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgat 30204877  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  30204876 tggtgat 30204870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 22145871 - 22145975
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||||||||| ||| |||||||||    
T  22145871 tctggatatgggtgacgaccttgaggta-atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttat-tgatatatgtgat 22145968  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  22145969 tggtgat 22145975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 175
Target Start/End: Original strand, 12351462 - 12351511
Alignment:
Q  126 gtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  12351462 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtctt 12351511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7852356 - 7852301
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7852356 gatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 7852301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Original strand, 12563156 - 12563211
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  12563156 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttat 12563211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 19888361 - 19888485
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888361 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 19888459  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19888460 ttgagatgaatgattattgatgatgt 19888485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8942219 - 8942095
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942219 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 8942121  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8942120 ttgagatgaatgattattgatgatgt 8942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 12637748 - 12637872
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637748 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 12637846  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  12637847 atgagatgaatgattattgatgatgt 12637872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21140450 - 21140326
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140450 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21140352  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  21140351 atgagatgaatgattattgatgatgt 21140326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 21276110 - 21276234
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21276110 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgatgaa 21276208  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21276209 ttgagatgaatgattattgatgatgt 21276234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34822771 - 34822647
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34822771 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 34822673  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  34822672 atgagatgaatgattattgatgatgt 34822647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 3800696 - 3800820
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3800696 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 3800794  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     ||||||||||| |||||||||||||    
T  3800795 atgagatgaatggttattgatgatgt 3800820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 461265 - 461142
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  461265 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtc 461166  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  461165 ttat-tgatatatgtgattggtgat 461142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 24828154 - 24828268
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24828154 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaaatgagatgaat 24828253  T
Q  213 gattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||    
T  24828254 gattattgatgatgt 24828268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 24832606 - 24832720
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24832606 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaaatgagatgaat 24832705  T
Q  213 gattattgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||    
T  24832706 gattattgatgatgt 24832720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12726626 - 12726515
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12726626 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 12726528  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  12726527 ttgagatgaatga 12726515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 197
Target Start/End: Original strand, 9654462 - 9654583
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9654462 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtct 9654561  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  9654562 tat-tgatatatgtgattggtga 9654583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 14908021 - 14908132
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14908021 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 14908119  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  14908120 ttgagaagaatga 14908132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20013696 - 20013585
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20013696 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 20013598  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  20013597 ttgagatgaatga 20013585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23773110 - 23772999
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23773110 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 23773012  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  23773011 ttgagatgaatga 23772999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23818753 - 23818642
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23818753 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 23818655  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  23818654 ttgagatgaatga 23818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 28777282 - 28777393
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28777282 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 28777380  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  28777381 ttgagaagaatga 28777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 5889879 - 5889990
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5889879 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 5889977  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  5889978 tggagaagaatga 5889990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 11232834 - 11232945
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11232834 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 11232932  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  11232933 tggagaagaatga 11232945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 17398179 - 17398290
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  17398179 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 17398277  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  17398278 ttgagatgaatga 17398290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 22514681 - 22514792
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22514681 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 22514779  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  22514780 tggagaagaatga 22514792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24966812 - 24966693
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacga-cctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24966812 agatcttttgagatctagatttgggtgacgaacctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttat 24966713  T
Q  178 gtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  24966712 -tgatatatgtgattggtgat 24966693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22692863 - 22692741
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22692863 ggtgacgaccttat-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgatgaa 22692765  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  22692764 atgagatgaatgattattgatgat 22692741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22697510 - 22697388
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22697510 ggtgacgaccttat-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgatgaa 22697412  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  22697411 atgagatgaatgattattgatgat 22697388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22273458 - 22273336
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  22273458 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 22273360  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     || ||| |||||||||| |||||    
T  22273359 atgtgattaatgattattcatgat 22273336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22282691 - 22282569
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  22282691 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 22282593  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     || ||| |||||||||| |||||    
T  22282592 atgtgattaatgattattcatgat 22282569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Original strand, 24687254 - 24687363
Alignment:
Q  104 tgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaatt 203  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  24687254 tgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgattt 24687352  T
Q  204 gagatgaatga 214  Q
    |||||||||||    
T  24687353 gagatgaatga 24687363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211332
Alignment:
Q  127 taccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatga 25211332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8886706 - 8886612
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  8886706 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatgtgtgattggtgat 8886612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 20629016 - 20629111
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20629016 ggtgacgatctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20629111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 12643609 - 12643703
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  12643609 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaa-atgtgattggtgat 12643703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 25877607 - 25877711
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25877607 tctggattaaggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttat-tgatatatgtgat 25877704  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  25877705 tggtgat 25877711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Original strand, 43644570 - 43644654
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  43644570 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 43644654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15631945 - 15631867
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  15631945 gattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggtgat 15631867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 36892376 - 36892453
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36892376 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 36892453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6877986 - 6877914
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  6877986 ggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 6877914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22862030 - 22861959
Alignment:
Q  126 gtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  |||||||||||||    
T  22862030 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaa-gtgtgattggtgat 22861959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25600505 - 25600432
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  25600505 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttat-tgataaatgtggttggtgat 25600432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 720920 - 720859
Alignment:
Q  118 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| || |||||||||    
T  720920 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttat 720859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 19435084 - 19435143
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  19435084 gatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttat 19435143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 15503 - 15641
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  15503 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgca-ttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcc 15601  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15602 tatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 15641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5756 - 5632
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5756 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgatgaa 5658  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5657 ttgagatgaatgattattgatgatgt 5632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 217336 - 217458
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  217336 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 217434  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     ||  || |||||||||| |||||    
T  217435 atgtaattaatgattattcatgat 217458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 22008111 - 22008233
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22008111 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 22008209  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22008210 tatttgatatatgtgattggtgat 22008233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 3433159 - 3433283
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3433159 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 3433257  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  3433258 atgagatgaatgattattgatgatgt 3433283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23509492 - 23509370
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509492 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 23509394  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23509393 atgagatgaatgattattgatgat 23509370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24547798 - 24547674
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  24547798 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 24547700  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  24547699 atgagatgaatgattattgatgatgt 24547674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 13664268 - 13664390
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13664268 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt-gaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 13664366  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  13664367 tgtttgataaatgtgattggtgat 13664390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 13723543 - 13723665
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13723543 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttt-gaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtct 13723641  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  13723642 tgtttgataaatgtgattggtgat 13723665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 24108217 - 24108338
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  24108217 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtca 24108315  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24108316 tatttgaaa-atgtgattggtgat 24108338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Original strand, 43375156 - 43375278
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43375156 gcagagatcttttgagatctggatttgggcgacgaccctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtc 43375255  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  43375256 ttat-tgatatatgtgattggtga 43375278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 643064 - 642953
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  643064 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 642966  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  642965 ttgagaagaatga 642953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5236769 - 5236658
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5236769 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 5236671  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||| ||||||    
T  5236670 ttgagaagaatga 5236658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21846074 - 21846185
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21846074 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21846172  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  21846173 ttgagatgaatga 21846185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 21853479 - 21853590
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21853479 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 21853577  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  21853578 ttgagatgaatga 21853590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 24662829 - 24662940
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24662829 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 24662927  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  24662928 ttgagatgaatga 24662940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 224746 - 224857
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  224746 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 224844  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  224845 ttgagatgaatga 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 272785 - 272896
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  272785 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 272883  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  272884 tggagaagaatga 272896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 738369 - 738480
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  738369 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 738467  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  738468 ttgagatgaatga 738480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 828870 - 828759
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  828870 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 828772  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  828771 tggagaagaatga 828759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 862264 - 862375
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  862264 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 862362  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  862363 ttgagatgaatga 862375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 22090027 - 22090138
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  22090027 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 22090125  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  22090126 ttgagatgaatga 22090138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43684228 - 43684117
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43684228 ggtgacgaccttgttg-agatttggtactgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 43684130  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  43684129 ttgagatgaatga 43684117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 15320643 - 15320754
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  15320643 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 15320741  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  15320742 ttgagatgaatga 15320754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 15501012 - 15501123
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  15501012 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 15501110  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  15501111 ttgagatgaatga 15501123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16675909 - 16676020
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16675909 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 16676007  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    ||| |||||||||    
T  16676008 ttgggatgaatga 16676020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 22909116 - 22909239
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22909116 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 22909214  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |  || ||||| ||||||||| ||||    
T  22909215 cagatttgaaa-atgtgattgatgat 22909239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 701159 - 701270
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  701159 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttttttgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaa 701257  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  701258 ttgagatgaatga 701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 16874522 - 16874621
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16874522 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 16874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 24387294 - 24387415
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | |||||    
T  24387294 ggtgacgacctttt--gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattgttcatgaa 24387391  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     || ||| |||||||||| |||||    
T  24387392 atgtgattaatgattattcatgat 24387415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29758866 - 29758771
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29758866 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 29758771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Original strand, 24719049 - 24719169
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24719049 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtct 24719147  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||    
T  24719148 tat-tgatatatatgattggtga 24719169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 16203922 - 16204016
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16203922 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 16204016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 24930701 - 24930789
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24930701 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 270314 - 270226
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgatt 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  270314 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Original strand, 645606 - 645694
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgatt 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  645606 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Original strand, 831341 - 831429
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgatt 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  831341 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 19994818 - 19994895
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  19994818 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 19994895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25121023 - 25120939
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25121023 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat 25120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37605536 - 37605464
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| ||||    
T  37605536 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgatgat 37605464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16416794 - 16416737
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16416794 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat 16416737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41244185 - 41244113
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  41244185 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttat-tgatatatgtgattg 41244113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20480150 - 20480073
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  20480150 gattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgctcggtgat 20480073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 22323091 - 22323194
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||| |    
T  22323091 tctggatatgggtgacgaccttga-ggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgataaatgtgtt 22323187  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  22323188 tggtgat 22323194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Original strand, 17731137 - 17731192
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtcca--taagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  17731137 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttat 17731192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1497
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtga-tga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1372 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattga 1470  T
Q  201 attgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  1471 aatgagatgaatgattattgatgatgt 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16017 - 15893
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16017 ggtgacgacctttt-ggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 15919  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15918 atgagatgaatgattattgatgatgt 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 13806 - 13883
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  13806 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttat-tgataaatgtggttggtgat 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 155936 - 156060
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  155936 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgatgaa 156034  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  156035 atgagatgaatgattattgatgatgt 156060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34907 - 34796
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34907 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaa 34809  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
     ||||||||||||    
T  34808 atgagatgaatga 34796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4292
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4415 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 4317  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  4316 atgagattaatgattattgatgatg 4292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14874 - 14751
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14874 ggtgacgacctttt-ggagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 14776  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14775 atgagatgaatgattattgatgatg 14751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28395 - 28272
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28395 ggtgacgacctttt-ggagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 28297  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  28296 atgagatgaatgattattgatgatg 28272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 1 - 118
Alignment:
Q  104 tgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1 tgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaat 99  T
Q  204 gagatgaatgattattgat 222  Q
    || ||||||||||||||||    
T  100 gaaatgaatgattattgat 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 9522 - 9635
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9522 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaat 9621  T
Q  213 gattattgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||    
T  9622 gattattgatgatg 9635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51596 - 51483
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51596 ttttggagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaat 51497  T
Q  213 gattattgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||    
T  51496 gattattgatgatg 51483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 17676 - 17787
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17676 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 17774  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  17775 ttgagatgaatga 17787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25477 - 25366
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25477 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 25379  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  25378 ttgagatgaatga 25366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21222 - 21111
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21222 ggtgacgaccttgttg-agatatggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 21124  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  21123 ttgagatgaatga 21111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 3159 - 3270
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3159 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaa 3257  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  3258 ttgagatgaatga 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 6735 - 6858
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6735 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 6833  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     |||||||| | | |||||||||||    
T  6834 atgagatgattaactattgatgatg 6858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 59022 - 59145
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  59022 ggtgacgacctttttaaa-atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 59120  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     |||||||| ||| |||||||||||    
T  59121 atgagatgattgactattgatgatg 59145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 197
Target Start/End: Original strand, 6782 - 6902
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6782 cagagatcttttgagatttggatttgggtgacaacctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctt 6881  T
Q  176 atgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    || ||| |||| ||||||||||    
T  6882 at-tgatatatatgattggtga 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33878 - 33756
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33878 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 33780  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||    
T  33779 catatttgaaa-atgtgattggtga 33756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 32779 - 32902
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  32779 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 32877  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     || ||| |||||||||| ||||||    
T  32878 atgtgattaatgattattcatgatg 32902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Original strand, 38966 - 39088
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38966 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 39064  T
Q  173 cttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||    
T  39065 catatttgaaa-atgtgattggtga 39088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39942
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  40065 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 39967  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgatg 226  Q
     || ||| |||||||||| ||||||    
T  39966 atgtgattaatgattattcatgatg 39942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 78020 - 77900
Alignment:
Q  77 agagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctta 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  78020 agagatcttttgagatctagatttgggtgacgacccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtctta 77921  T
Q  177 tgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    | || || ||||||||||||||    
T  77920 tttggaa-atgtgattggtgat 77900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37863 - 37752
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37863 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 37765  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    | |||| ||||||    
T  37764 tggagaagaatga 37752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 128962 - 128843
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  128962 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgatgaa 128864  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  128863 atgagatgaatgattattgat 128843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 194
Target Start/End: Original strand, 90572 - 90689
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |   || |||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  90572 gcagagatcttttgagatatggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtct 90670  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattgg 194  Q
    ||| |||  |||||||||||    
T  90671 tat-tgatgtatgtgattgg 90689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1627 - 1510
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  1627 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacccttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat- 1530  T
Q  179 tgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  1529 tgatatatgtgattggtgat 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 76365 - 76486
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  76365 gcagagatcttttgagatctggatttgcgtgacgacccttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtct 76463  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  76464 tat-tgatatatgtgattggtgat 76486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 193097 - 192983
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  193097 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacccttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat- 193000  T
Q  179 tgaaatatgtgattggt 195  Q
    ||| |||||||||||||    
T  192999 tgatatatgtgattggt 192983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 71988 - 72105
Alignment:
Q  79 agatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  71988 agatcttttgagatctggatttgcgtgacgacccttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat- 72085  T
Q  179 tgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  72086 tgatatatgtgattggtgat 72105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 124965 - 125086
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  124965 gcagagatcttttgagatctggttatgggtgacgacccttg-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtct 125063  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  125064 tat-tgatatatgtgattggtgat 125086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 256576 - 256653
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  256576 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 256653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29925 - 29814
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  29925 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgat 29827  T
Q  202 ttgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||    
T  29826 ttgagatgaatga 29814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 13
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  131 ggtgacgacctttttggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgatgaa 32  T
Q  202 ttgagatgaatgattattg 220  Q
     || ||| |||||| ||||    
T  31 atgtgattaatgatgattg 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 830 - 712
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  830 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccttta-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtct 732  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggt 195  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  731 tat-tgatatatgtgattggt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 19202 - 19325
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc-tttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  19202 gcagagatcttttgagatctggatttgagtgacgaccctttttggagatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtc 19301  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    || | ||| ||||||||||||||||    
T  19302 tt-tttgatatatgtgattggtgat 19325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54213 - 54119
Alignment:
Q  103 gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54213 gtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 54119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 109668 - 109742
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  109668 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat 109742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40126 - 40006
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40126 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacaaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtct 40028  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  40027 tat-tgatatatgtgattggtga 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 106574 - 106461
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  106574 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgatgaa 106476  T
Q  202 ttgagatgaatgatt 216  Q
     || | |||||||||    
T  106475 atgtggtgaatgatt 106461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17174 - 17075
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgg--gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17174 gcagagatcttttgagatctggatttggaggtgatgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 17076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31333 - 31211
Alignment:
Q  74 agcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31333 agcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtc 31235  T
Q  174 ttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31234 ttat-tgatatatgtgattggtgat 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 218
Target Start/End: Original strand, 197688 - 197803
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  197688 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 197786  T
Q  202 ttgagatgaatgattat 218  Q
     || ||| |||||||||    
T  197787 atgtgattaatgattat 197803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3546 - 3426
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  3546 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtct 3448  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  3447 tat-tgatatatgtgattggtga 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 558
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  652 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31118 - 30998
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31118 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtct 31020  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  31019 tat-tgatatatgtgattggtga 30998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44689 - 44639
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44689 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcat 44639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 270684 - 270599
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  270684 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 270599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 236726 - 236654
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  236726 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 236654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 4337 - 4432
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4337 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgat 4432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 11618 - 11713
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  11618 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgat 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 24878 - 24958
Alignment:
Q  132 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24878 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtggtgaattgagatgaat 24958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 49177 - 49272
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49177 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgat 49272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 129797 - 129877
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  129797 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21156 - 21037
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    ||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21156 gcagagacctttggtggtctggatatgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtct 21058  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtg 196  Q
    ||| |||  |||||||||||||    
T  21057 tat-tgatgtatgtgattggtg 21037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28705 - 28627
Alignment:
Q  117 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  28705 ggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtg 28627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 12787 - 12876
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12787 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 5185 - 5274
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  5185 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25875 - 25804
Alignment:
Q  156 catatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 227  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25875 catatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 25804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 20879 - 20999
Alignment:
Q  76 cagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20879 cagagatcttttgagatcaggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtctt 20977  T
Q  176 atgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||||    
T  20978 a-atgatatatgtgattggtgat 20999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 2718 - 2815
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtg--catatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  2718 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 870
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  944 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5783 - 5706
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  5783 gatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 5706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 145105 - 145012
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  145105 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 145012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 147354 - 147271
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  147354 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14228 - 14149
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg-tgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  14228 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgat 14149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28355 - 28254
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28355 gcagagttcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 28257  T
Q  175 tat 177  Q
    |||    
T  28256 tat 28254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 56505 - 56432
Alignment:
Q  103 gtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56505 gtgacgacctttt-ggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 56432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7545 - 7465
Alignment:
Q  113 ttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7545 ttttggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7362 - 7322
Alignment:
Q  137 atttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7362 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 14978 - 15099
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14978 gcagagatcttttgagatctggatatgggtgacgaccctga-gatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtct 15076  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||| ||| | |||||| |||||||    
T  15077 tat-tgatacatgtgactggtgat 15099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1139
Alignment:
Q  100 tgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1043 tgggtgacgaccttga-ggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 76837 - 76760
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  76837 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 76760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 138422 - 138499
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  138422 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Original strand, 249158 - 249231
Alignment:
Q  124 tggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  249158 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 249231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Original strand, 6282 - 6397
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |   |  ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  6282 gcagagatcttttgagatctggatataggtgacgaccctga-gatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtct 6380  T
Q  175 tatgtgaaatatgtgatt 192  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  6381 tat-tgatatatgtgatt 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 60119 - 60047
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  60119 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 60047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41280 - 41158
Alignment:
Q  102 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||| | | | ||||||||||| | |||||    
T  41280 ggtgacgacctttt-ggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattgttcatgaa 41182  T
Q  202 ttgagatgaatgattattgatgat 225  Q
     ||  || |||||||||| |||||    
T  41181 atgtcattaatgattattcatgat 41158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18162 - 18058
Alignment:
Q  92 tctggatttgggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgat 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  18162 tctggatatgggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggt 18065  T
Q  192 tggtgat 198  Q
    |||||||    
T  18064 tggtgat 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27119 - 27045
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatg-tgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  27119 ggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgat 27045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 26432 - 26509
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26432 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 66337 - 66389
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66337 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 66389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 7030 - 7106
Alignment:
Q  121 atttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7030 atttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12743 - 12671
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  12743 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaa-atgtgattggtgat 12671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7982 - 7927
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7982 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6096 - 6019
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  6096 gatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgattgatgat 6019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17855 - 17778
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17855 gatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 17778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19862
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19939 gatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4674 - 4601
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |   ||||||||||||||||    
T  4674 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattggtgat 4601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 163885 - 163828
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  163885 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat 163828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 3723 - 3801
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||| |||||    
T  3723 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgt-tgatatatgtgattgatgatg 3801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3175 - 3098
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  3175 gatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3209 - 3132
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  3209 gatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 3132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Original strand, 72127 - 72177
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  72127 ggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7282 - 7225
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7282 gatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat 7225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38007 - 37935
Alignment:
Q  125 ggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 198  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  38007 ggtaccacatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-gtgatgtatgtgattggtgat 37935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 111
Target Start/End: Original strand, 28144 - 28180
Alignment:
Q  75 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28144 gcagagatcttttgagatctggatttgggtgacgacc 28180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13505
Alignment:
Q  120 gatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtctt 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13450 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15884
Alignment:
Q  126 gtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatggcatgagtcttat 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 214
Target Start/End: Original strand, 67062 - 67092
Alignment:
Q  184 tatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67062 tatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 67092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 214
Target Start/End: Original strand, 67093 - 67122
Alignment:
Q  185 atgtgattggtgatgaattgagatgaatga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67093 atgtgattggtgatgaattgagatgaatga 67122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1499 times since January 2019
Visitors: 3230