View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0436_high_6 (Length: 249)

Name: NF0436_high_6
Description: NF0436
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0436_high_6
NF0436_high_6
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (99-249)||(14409445-14409595)
chr8 (99-249)||(1484413-1484563)
chr8 (99-249)||(5853293-5853443)
chr8 (99-249)||(15203232-15203382)
chr8 (99-249)||(16413317-16413467)
chr8 (99-249)||(20403238-20403388)
chr8 (99-249)||(22001764-22001914)
chr8 (99-249)||(41598199-41598349)
chr8 (99-249)||(4483292-4483441)
chr8 (99-249)||(20046196-20046346)
chr8 (99-249)||(4542374-4542524)
chr8 (99-249)||(19896276-19896429)
chr8 (99-249)||(45290695-45290846)
chr8 (99-249)||(14823785-14823934)
chr8 (103-244)||(19801387-19801527)
chr8 (101-247)||(15070571-15070718)
chr8 (99-249)||(26223930-26224080)
chr8 (99-249)||(25484276-25484419)
chr8 (99-249)||(18818365-18818516)
chr8 (99-249)||(16092298-16092449)
chr8 (99-249)||(19937006-19937157)
chr8 (111-249)||(7372792-7372931)
chr8 (99-249)||(6759272-6759420)
chr8 (99-249)||(20536222-20536373)
chr8 (99-247)||(21918956-21919105)
chr8 (115-249)||(21923900-21924035)
chr8 (99-249)||(28649000-28649151)
chr8 (99-249)||(23406393-23406546)
chr8 (118-249)||(26219728-26219858)
chr8 (99-249)||(22875079-22875229)
chr8 (99-249)||(22626750-22626900)
chr8 (118-249)||(26225268-26225398)
chr8 (99-249)||(18879192-18879338)
chr8 (99-247)||(31971273-31971420)
chr8 (99-245)||(13508041-13508188)
chr8 (99-245)||(13597573-13597720)
chr8 (99-245)||(17612066-17612213)
chr8 (162-244)||(45131017-45131098)
chr8 (99-244)||(20498581-20498727)
chr8 (99-147)||(24486045-24486093)
chr8 (102-249)||(38855212-38855358)
chr8 (162-244)||(16199664-16199746)
chr8 (102-249)||(21285611-21285758)
chr8 (115-249)||(23648567-23648702)
chr8 (135-249)||(18678094-18678209)
chr8 (102-244)||(5866237-5866376)
chr8 (99-244)||(37116366-37116513)
chr8 (102-247)||(17140932-17141074)
chr8 (102-247)||(21491011-21491153)
chr8 (202-249)||(6520382-6520430)
chr8 (202-248)||(983465-983512)
chr8 (202-248)||(23760903-23760950)
chr8 (135-249)||(32121746-32121861)
chr8 (99-137)||(32810054-32810092)
chr8 (164-244)||(21389473-21389552)
chr8 (164-244)||(21396003-21396082)
chr8 (164-244)||(21778799-21778878)
chr8 (164-244)||(21790496-21790575)
chr8 (210-249)||(26355766-26355805)
chr8 (99-244)||(17439462-17439609)
chr8 (213-247)||(21249400-21249434)
chr8 (213-247)||(21255238-21255272)
chr8 (210-249)||(21673718-21673757)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (99-249)||(18215275-18215425)
chr4 (99-249)||(12308-12458)
chr4 (99-249)||(15118353-15118503)
chr4 (99-249)||(52312521-52312671)
chr4 (99-249)||(44615299-44615449)
chr4 (99-249)||(44773088-44773238)
chr4 (99-249)||(50222340-50222490)
chr4 (99-249)||(1837510-1837660)
chr4 (99-249)||(3515018-3515168)
chr4 (99-249)||(18239420-18239570)
chr4 (99-249)||(19242710-19242860)
chr4 (99-249)||(19618173-19618323)
chr4 (99-249)||(15355325-15355476)
chr4 (99-249)||(23803266-23803416)
chr4 (99-249)||(44102225-44102375)
chr4 (99-249)||(51463869-51464019)
chr4 (99-249)||(44928880-44929031)
chr4 (99-249)||(14970708-14970858)
chr4 (100-244)||(21815587-21815731)
chr4 (99-245)||(15367708-15367855)
chr4 (99-245)||(15402721-15402868)
chr4 (99-249)||(12610961-12611104)
chr4 (99-245)||(15371220-15371367)
chr4 (99-245)||(15373501-15373648)
chr4 (99-245)||(15370036-15370182)
chr4 (99-245)||(16223550-16223697)
chr4 (99-249)||(7641193-7641333)
chr4 (99-249)||(20149840-20149991)
chr4 (99-247)||(12902773-12902922)
chr4 (99-249)||(7088891-7089042)
chr4 (115-249)||(7798788-7798923)
chr4 (99-249)||(16377479-16377628)
chr4 (118-249)||(54798729-54798861)
chr4 (99-249)||(7893717-7893868)
chr4 (99-249)||(14038662-14038813)
chr4 (142-249)||(14280327-14280434)
chr4 (99-249)||(22636449-22636600)
chr4 (151-249)||(52873375-52873474)
chr4 (99-244)||(22353852-22353998)
chr4 (118-246)||(8574844-8574971)
chr4 (99-249)||(44052843-44052994)
chr4 (99-249)||(16270192-16270342)
chr4 (99-247)||(23374315-23374464)
chr4 (99-244)||(13807-13953)
chr4 (99-248)||(52243150-52243302)
chr4 (99-249)||(6899905-6900055)
chr4 (100-249)||(16239927-16240076)
chr4 (99-248)||(43198509-43198661)
chr4 (178-247)||(3096309-3096379)
chr4 (109-244)||(6190481-6190618)
chr4 (100-189)||(15464888-15464977)
chr4 (202-249)||(12774021-12774069)
chr4 (202-248)||(12288269-12288316)
chr4 (210-249)||(39706356-39706395)
chr4 (99-244)||(46640412-46640558)
chr4 (202-247)||(15551833-15551879)
chr4 (162-244)||(14053321-14053403)
chr4 (202-244)||(17046506-17046549)
chr4 (202-249)||(8846370-8846418)
chr4 (202-242)||(17333298-17333338)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (99-249)||(29172584-29172734)
chr3 (99-249)||(9707608-9707758)
chr3 (99-249)||(17463189-17463339)
chr3 (99-249)||(34159337-34159487)
chr3 (99-249)||(38961892-38962042)
chr3 (99-249)||(45606908-45607058)
chr3 (99-249)||(55476502-55476652)
chr3 (99-249)||(7781348-7781498)
chr3 (99-249)||(8899105-8899255)
chr3 (99-249)||(16454282-16454432)
chr3 (99-249)||(28848612-28848762)
chr3 (99-249)||(13151791-13151942)
chr3 (99-249)||(13154256-13154407)
chr3 (99-249)||(6469135-6469285)
chr3 (99-249)||(10247724-10247874)
chr3 (99-249)||(12567571-12567721)
chr3 (99-249)||(13544036-13544186)
chr3 (99-249)||(16282812-16282962)
chr3 (99-249)||(17446656-17446805)
chr3 (99-249)||(50242833-50242983)
chr3 (99-249)||(41123901-41124048)
chr3 (99-249)||(17672637-17672787)
chr3 (99-244)||(53070654-53070799)
chr3 (99-249)||(12119725-12119876)
chr3 (99-244)||(43550479-43550625)
chr3 (101-249)||(15412440-15412589)
chr3 (99-249)||(8499529-8499680)
chr3 (129-249)||(15977526-15977646)
chr3 (99-249)||(14972868-14973019)
chr3 (99-249)||(17487870-17488021)
chr3 (99-249)||(17499352-17499503)
chr3 (99-249)||(40213677-40213827)
chr3 (149-249)||(55500953-55501053)
chr3 (118-249)||(36166609-36166739)
chr3 (99-245)||(42386428-42386575)
chr3 (99-249)||(43840946-43841097)
chr3 (99-248)||(26686902-26687052)
chr3 (99-249)||(13442288-13442439)
chr3 (99-249)||(14576789-14576939)
chr3 (99-249)||(20698392-20698542)
chr3 (118-249)||(21618460-21618590)
chr3 (99-249)||(23083317-23083468)
chr3 (99-249)||(25476341-25476492)
chr3 (117-249)||(14572603-14572735)
chr3 (113-247)||(12399225-12399360)
chr3 (99-249)||(18438548-18438699)
chr3 (164-249)||(44494820-44494905)
chr3 (164-249)||(10556996-10557081)
chr3 (99-249)||(11424719-11424866)
chr3 (99-245)||(24340679-24340826)
chr3 (115-249)||(24153181-24153315)
chr3 (164-249)||(17737247-17737335)
chr3 (99-244)||(52523683-52523831)
chr3 (99-249)||(27165261-27165412)
chr3 (99-245)||(23274705-23274852)
chr3 (99-245)||(37642221-37642368)
chr3 (99-249)||(53301506-53301658)
chr3 (99-189)||(22147481-22147571)
chr3 (102-248)||(15470939-15471085)
chr3 (99-182)||(2051155-2051238)
chr3 (207-249)||(45577947-45577989)
chr3 (102-249)||(16097342-16097489)
chr3 (99-144)||(17248242-17248287)
chr3 (138-249)||(32307691-32307802)
chr3 (202-249)||(12174318-12174366)
chr3 (202-249)||(28194704-28194752)
chr3 (135-249)||(46822279-46822394)
chr3 (135-248)||(30029855-30029968)
chr3 (210-247)||(13210395-13210432)
chr3 (102-249)||(16103794-16103940)
chr3 (202-249)||(49668135-49668183)
chr3 (149-249)||(12511071-12511172)
chr3 (102-249)||(14234501-14234648)
chr3 (202-249)||(9512934-9512982)
chr3 (202-249)||(9520909-9520957)
chr3 (202-242)||(13919350-13919390)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (99-249)||(6726006-6726156)
chr2 (99-249)||(21155061-21155211)
chr2 (99-249)||(18808954-18809104)
chr2 (99-249)||(23130873-23131023)
chr2 (99-249)||(23133340-23133490)
chr2 (99-249)||(23709533-23709683)
chr2 (99-249)||(23712014-23712164)
chr2 (99-249)||(24367785-24367935)
chr2 (99-249)||(26505390-26505540)
chr2 (99-249)||(26507868-26508018)
chr2 (99-249)||(34402523-34402673)
chr2 (99-249)||(39682324-39682474)
chr2 (99-249)||(571408-571558)
chr2 (99-249)||(23135601-23135751)
chr2 (99-249)||(32214922-32215072)
chr2 (99-249)||(24898196-24898347)
chr2 (99-249)||(24900679-24900830)
chr2 (99-249)||(24903156-24903307)
chr2 (99-249)||(24905633-24905784)
chr2 (99-249)||(24908108-24908259)
chr2 (99-249)||(32039499-32039649)
chr2 (99-249)||(28577110-28577260)
chr2 (99-249)||(43137310-43137460)
chr2 (99-249)||(22105423-22105574)
chr2 (99-249)||(45029855-45030005)
chr2 (99-249)||(24529529-24529680)
chr2 (99-249)||(38967385-38967536)
chr2 (99-249)||(23060527-23060678)
chr2 (99-245)||(23076460-23076607)
chr2 (99-249)||(22337129-22337280)
chr2 (99-249)||(22731190-22731341)
chr2 (99-249)||(22738136-22738286)
chr2 (99-249)||(23285879-23286026)
chr2 (99-249)||(298770-298922)
chr2 (99-245)||(19671848-19671994)
chr2 (99-175)||(24642857-24642933)
chr2 (99-248)||(23708575-23708725)
chr2 (162-247)||(38134-38219)
chr2 (99-247)||(23654342-23654491)
chr2 (182-249)||(24643034-24643101)
chr2 (99-249)||(23660037-23660187)
chr2 (99-244)||(7689-7835)
chr2 (115-244)||(23103369-23103497)
chr2 (202-249)||(23040249-23040296)
chr2 (142-249)||(28405990-28406099)
chr2 (187-249)||(8946671-8946734)
chr2 (99-244)||(20520149-20520295)
chr2 (109-244)||(32451894-32452031)
chr2 (99-168)||(22459518-22459587)
chr2 (164-244)||(20309127-20309206)
chr2 (135-249)||(25616199-25616314)
chr2 (149-249)||(7679599-7679699)
chr2 (210-248)||(18786971-18787009)
chr2 (99-137)||(22173830-22173868)
chr2 (202-242)||(22134266-22134306)
chr2 (142-249)||(25175864-25175972)
chr2 (202-242)||(23287384-23287424)
chr2 (202-242)||(26392403-26392443)
chr2 (212-247)||(23072019-23072054)
chr2 (99-182)||(23791357-23791439)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (99-249)||(20758-20908)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (99-249)||(37832-37982)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (99-249)||(94422-94572)
scaffold0023 (99-249)||(17441-17591)
scaffold0023 (101-249)||(44465-44614)
scaffold0023 (102-249)||(100388-100534)
scaffold0023 (202-247)||(119891-119937)
scaffold0023 (102-249)||(40135-40281)
scaffold0023 (210-249)||(101513-101552)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (99-249)||(158451-158601)
scaffold0003 (99-248)||(339906-340053)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (99-249)||(456332-456482)
chr7 (99-249)||(11393288-11393438)
chr7 (99-249)||(11972507-11972657)
chr7 (99-249)||(14949123-14949273)
chr7 (99-249)||(15376714-15376864)
chr7 (99-249)||(16232531-16232681)
chr7 (99-249)||(18640283-18640433)
chr7 (99-249)||(20385124-20385274)
chr7 (99-249)||(21189596-21189746)
chr7 (99-249)||(32125502-32125652)
chr7 (99-249)||(41522928-41523078)
chr7 (99-249)||(41525390-41525540)
chr7 (99-249)||(24702249-24702399)
chr7 (99-249)||(27216871-27217021)
chr7 (100-249)||(16410070-16410219)
chr7 (111-249)||(24275182-24275320)
chr7 (99-249)||(44116520-44116670)
chr7 (99-249)||(3386344-3386494)
chr7 (99-249)||(16213695-16213845)
chr7 (99-249)||(18430723-18430873)
chr7 (99-244)||(13647344-13647490)
chr7 (99-249)||(24704699-24704846)
chr7 (99-249)||(17061916-17062066)
chr7 (99-249)||(38898377-38898528)
chr7 (99-244)||(12756672-12756817)
chr7 (99-249)||(20110567-20110707)
chr7 (101-249)||(13869357-13869506)
chr7 (111-249)||(3564332-3564471)
chr7 (99-205)||(26355984-26356090)
chr7 (99-205)||(26358436-26358542)
chr7 (141-249)||(48273403-48273512)
chr7 (99-249)||(12698845-12698997)
chr7 (134-249)||(13831384-13831499)
chr7 (115-249)||(9509203-9509338)
chr7 (99-249)||(18456369-18456519)
chr7 (99-247)||(26212012-26212161)
chr7 (99-245)||(38227499-38227645)
chr7 (99-247)||(10589055-10589203)
chr7 (99-248)||(2280075-2280225)
chr7 (111-248)||(15144006-15144143)
chr7 (99-245)||(19486700-19486847)
chr7 (159-247)||(16386263-16386353)
chr7 (142-249)||(22072927-22073036)
chr7 (99-244)||(40443410-40443554)
chr7 (99-241)||(12255747-12255892)
chr7 (99-148)||(15081950-15081999)
chr7 (102-247)||(34200802-34200944)
chr7 (141-249)||(67759-67868)
chr7 (102-249)||(18005660-18005806)
chr7 (99-176)||(15116568-15116644)
chr7 (102-248)||(16056343-16056488)
chr7 (210-249)||(811199-811238)
chr7 (210-249)||(44014192-44014231)
chr7 (210-249)||(47831821-47831860)
chr7 (99-248)||(1867951-1868101)
chr7 (102-244)||(16495421-16495560)
chr7 (99-176)||(15113031-15113107)
chr7 (166-249)||(28505321-28505405)
chr7 (102-248)||(16219677-16219823)
chr7 (202-245)||(18154901-18154944)
chr7 (210-247)||(15754955-15754992)
chr7 (217-248)||(14044761-14044792)
chr7 (217-248)||(14354791-14354822)
chr7 (135-236)||(15211484-15211586)
chr7 (99-133)||(15008455-15008489)
chr7 (99-133)||(20220146-20220180)
chr7 (210-247)||(11996095-11996132)
chr7 (164-244)||(27847853-27847932)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (99-249)||(12742328-12742478)
chr6 (99-249)||(18334593-18334743)
chr6 (99-249)||(19005057-19005207)
chr6 (99-249)||(19858920-19859070)
chr6 (99-249)||(22782238-22782388)
chr6 (99-249)||(24422558-24422708)
chr6 (99-249)||(33861805-33861955)
chr6 (99-249)||(33864289-33864439)
chr6 (99-249)||(2291181-2291331)
chr6 (99-249)||(8055040-8055190)
chr6 (99-249)||(26924641-26924791)
chr6 (99-249)||(30676711-30676861)
chr6 (99-249)||(25754820-25754970)
chr6 (99-249)||(34963384-34963534)
chr6 (99-244)||(18456735-18456880)
chr6 (99-249)||(1540912-1541062)
chr6 (99-249)||(16448527-16448678)
chr6 (99-249)||(3852018-3852168)
chr6 (108-244)||(18461895-18462031)
chr6 (99-249)||(20556895-20557043)
chr6 (99-249)||(1595560-1595710)
chr6 (99-249)||(25656640-25656790)
chr6 (99-249)||(25688513-25688663)
chr6 (99-249)||(20360916-20361067)
chr6 (99-249)||(25629311-25629462)
chr6 (99-248)||(25644335-25644486)
chr6 (101-249)||(29060554-29060703)
chr6 (115-249)||(17287768-17287903)
chr6 (99-249)||(18409783-18409934)
chr6 (99-247)||(16496260-16496409)
chr6 (111-249)||(20593787-20593926)
chr6 (99-244)||(18821802-18821946)
chr6 (99-249)||(19303497-19303647)
chr6 (115-249)||(22780199-22780334)
chr6 (99-249)||(20076714-20076861)
chr6 (161-249)||(20638301-20638390)
chr6 (99-249)||(19847950-19848102)
chr6 (107-248)||(20109153-20109295)
chr6 (99-247)||(8227467-8227616)
chr6 (202-249)||(25714431-25714478)
chr6 (102-244)||(23019425-23019567)
chr6 (202-249)||(27333277-27333325)
chr6 (202-249)||(27394017-27394065)
chr6 (102-246)||(28496434-28496575)
chr6 (102-246)||(29808845-29808986)
chr6 (202-248)||(9098573-9098620)
chr6 (113-244)||(35245605-35245735)
chr6 (210-249)||(19652209-19652248)
chr6 (202-248)||(19668386-19668433)
chr6 (151-249)||(23992441-23992540)
chr6 (210-244)||(11185524-11185558)
chr6 (210-247)||(1561319-1561356)
chr6 (202-242)||(22831524-22831565)
chr6 (202-242)||(33443068-33443108)
chr6 (210-240)||(16920698-16920728)
chr6 (216-249)||(22080799-22080832)
chr6 (202-249)||(4185880-4185928)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (99-249)||(264769-264919)
chr5 (99-249)||(10732941-10733091)
chr5 (99-249)||(39363395-39363545)
chr5 (99-249)||(20909023-20909173)
chr5 (99-249)||(29329945-29330095)
chr5 (99-249)||(42245366-42245516)
chr5 (99-248)||(20902009-20902159)
chr5 (99-249)||(29345991-29346141)
chr5 (99-249)||(36154784-36154931)
chr5 (99-249)||(29348464-29348614)
chr5 (99-249)||(29350937-29351087)
chr5 (99-249)||(39245147-39245297)
chr5 (99-249)||(2154614-2154765)
chr5 (99-249)||(18319034-18319185)
chr5 (99-249)||(11581200-11581350)
chr5 (99-249)||(32027404-32027554)
chr5 (99-249)||(10775676-10775827)
chr5 (99-249)||(20917953-20918099)
chr5 (99-249)||(24067118-24067269)
chr5 (99-249)||(31061079-31061230)
chr5 (102-249)||(38619445-38619593)
chr5 (101-249)||(23064522-23064671)
chr5 (99-249)||(23390452-23390603)
chr5 (99-249)||(25421546-25421697)
chr5 (99-249)||(9077966-9078117)
chr5 (99-247)||(21729020-21729169)
chr5 (99-247)||(21808345-21808494)
chr5 (99-243)||(25431414-25431559)
chr5 (99-249)||(1096481-1096632)
chr5 (99-249)||(8286798-8286950)
chr5 (99-249)||(24529234-24529385)
chr5 (99-244)||(22144068-22144214)
chr5 (99-249)||(24493583-24493733)
chr5 (164-249)||(21997555-21997641)
chr5 (99-247)||(22075035-22075184)
chr5 (118-249)||(22412198-22412329)
chr5 (99-249)||(13025325-13025475)
chr5 (99-249)||(13095509-13095659)
chr5 (99-245)||(40725871-40726018)
chr5 (163-244)||(21292991-21293071)
chr5 (102-249)||(21565556-21565703)
chr5 (115-244)||(37723922-37724050)
chr5 (102-248)||(26011995-26012141)
chr5 (118-205)||(20766095-20766181)
chr5 (149-244)||(20026945-20027043)
chr5 (202-249)||(21329556-21329604)
chr5 (202-249)||(22959591-22959639)
chr5 (165-249)||(18418594-18418678)
chr5 (202-247)||(19660894-19660940)
chr5 (201-249)||(20806845-20806893)
chr5 (135-249)||(17517193-17517308)
chr5 (202-244)||(36314596-36314639)
chr5 (99-244)||(22178176-22178323)
chr5 (202-244)||(26740705-26740747)
chr5 (102-249)||(21502116-21502263)
chr5 (202-247)||(26732892-26732937)
chr5 (205-245)||(26704089-26704129)
chr5 (205-245)||(26973822-26973862)
chr5 (210-249)||(19668912-19668951)
chr5 (163-236)||(21873277-21873351)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (99-249)||(13988877-13989027)
chr1 (99-249)||(21923292-21923442)
chr1 (99-249)||(21475088-21475238)
chr1 (99-249)||(23593736-23593886)
chr1 (99-249)||(21840778-21840928)
chr1 (99-249)||(29298148-29298297)
chr1 (99-249)||(29776699-29776849)
chr1 (99-249)||(31612324-31612474)
chr1 (99-249)||(16361928-16362078)
chr1 (99-244)||(45574843-45574989)
chr1 (99-249)||(13212862-13213013)
chr1 (99-249)||(21346972-21347123)
chr1 (99-245)||(22123068-22123215)
chr1 (99-249)||(21707178-21707328)
chr1 (99-249)||(21711720-21711870)
chr1 (99-249)||(16275364-16275515)
chr1 (99-249)||(21342107-21342258)
chr1 (99-249)||(433023-433171)
chr1 (99-249)||(40389165-40389316)
chr1 (99-249)||(15860009-15860160)
chr1 (99-247)||(27250685-27250834)
chr1 (99-249)||(50210169-50210320)
chr1 (99-249)||(34509794-34509945)
chr1 (99-249)||(22532283-22532434)
chr1 (99-247)||(21026696-21026845)
chr1 (99-244)||(21861526-21861672)
chr1 (99-244)||(21896212-21896358)
chr1 (99-249)||(22468652-22468803)
chr1 (164-247)||(20847175-20847259)
chr1 (99-244)||(35261037-35261180)
chr1 (99-248)||(16758664-16758815)
chr1 (202-249)||(20454613-20454660)
chr1 (102-248)||(33681022-33681168)
chr1 (100-249)||(20135201-20135351)
chr1 (102-247)||(20918620-20918762)
chr1 (138-249)||(21754059-21754170)
chr1 (99-244)||(41049992-41050138)
chr1 (102-248)||(22237642-22237788)
chr1 (210-248)||(52928038-52928076)
chr1 (102-243)||(14295514-14295652)
chr1 (205-249)||(21714556-21714600)
chr1 (99-187)||(22354528-22354616)
chr1 (210-249)||(22921937-22921976)
chr1 (210-249)||(20248293-20248332)
chr1 (202-237)||(38801447-38801483)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (99-249)||(4705-4855)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (99-249)||(13403-13553)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (99-249)||(13958-14108)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (99-249)||(136691-136841)
scaffold0028 (99-249)||(139160-139310)
scaffold0028 (99-249)||(144098-144248)
scaffold0028 (99-249)||(134222-134372)
scaffold0028 (99-249)||(141629-141779)
scaffold0028 (138-249)||(132672-132784)
scaffold0028 (166-245)||(62216-62296)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (99-246)||(29946-30093)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (99-249)||(10784-10934)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (99-249)||(16795-16945)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (99-249)||(501095-501245)
scaffold0001 (99-249)||(85580-85731)
scaffold0001 (102-249)||(160698-160844)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (99-249)||(4308-4458)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (99-249)||(40411-40561)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (99-249)||(82083-82233)
scaffold0037 (102-248)||(22630-22776)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (99-249)||(11299-11449)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (99-249)||(9760-9911)
scaffold0145 (99-249)||(32956-33106)
scaffold0145 (99-249)||(38775-38925)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (99-249)||(12250-12400)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (99-249)||(9253-9403)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (99-244)||(20380-20524)
scaffold0031 (99-249)||(128765-128915)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (99-249)||(117-267)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (99-244)||(79285-79430)
scaffold0056 (99-249)||(17171-17324)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (99-249)||(4225-4376)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (99-249)||(12075-12219)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (99-249)||(2129-2280)
scaffold0247 (99-245)||(17983-18130)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (99-249)||(1281-1432)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (99-247)||(161090-161239)
scaffold0007 (99-181)||(164591-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (99-249)||(22897-23047)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (99-249)||(26021-26172)
scaffold0122 (118-249)||(44682-44814)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (99-249)||(13225-13376)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (99-249)||(51927-52078)
scaffold0011 (99-247)||(167935-168083)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (99-249)||(3142-3293)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (99-249)||(3107-3257)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (99-249)||(4522-4672)
scaffold0228 (99-249)||(12104-12254)
scaffold0228 (99-249)||(22056-22206)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (99-249)||(16556-16707)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (99-249)||(1865-2016)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (99-247)||(1005-1153)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (99-249)||(39491-39641)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (99-249)||(75171-75321)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (99-249)||(3484-3635)
scaffold0292 (99-245)||(361-507)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (111-249)||(32926-33063)
scaffold0120 (111-249)||(45942-46079)
scaffold0120 (99-249)||(16127-16278)
scaffold0120 (201-249)||(17388-17436)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (118-249)||(116441-116571)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (99-245)||(24258-24406)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (99-247)||(4865-5014)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (99-249)||(8489-8636)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (149-249)||(28428-28529)
scaffold0046 (149-247)||(11308-11407)
scaffold0046 (210-247)||(2013-2050)
scaffold0046 (210-247)||(4568-4605)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (99-249)||(6077-6231)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (115-249)||(8493-8628)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (107-248)||(8481-8623)
scaffold0621 (102-249)||(6549-6695)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (99-248)||(27705-27855)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (99-249)||(25910-26060)
scaffold0026 (99-249)||(39872-40022)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (113-244)||(1971-2103)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (99-245)||(11482-11629)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (99-199)||(3486-3586)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (99-245)||(38212-38359)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (99-248)||(16056-16206)
scaffold0357 (99-244)||(13147-13294)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (99-249)||(38658-38809)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (173-247)||(4728-4803)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (99-244)||(53505-53651)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (162-247)||(13513-13598)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (162-247)||(11462-11548)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (99-247)||(32083-32229)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (103-176)||(13092-13165)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (99-211)||(13144-13257)
scaffold0175 (207-249)||(287-329)
scaffold0175 (102-247)||(34139-34281)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (99-249)||(39927-40077)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (113-247)||(10395-10528)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (162-247)||(15483-15568)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (115-244)||(174785-174913)
scaffold0021 (202-249)||(121780-121827)
scaffold0021 (99-174)||(124675-124750)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (184-244)||(11982-12042)
scaffold0503 (99-154)||(12039-12094)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (99-244)||(12587-12732)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (99-189)||(225482-225571)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (99-244)||(60671-60818)
scaffold0010 (102-249)||(129919-130066)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (102-249)||(45752-45899)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (102-248)||(10501-10647)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (99-245)||(20928-21076)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (102-249)||(15675-15819)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (102-249)||(19278-19424)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (113-242)||(4545-4675)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (99-183)||(27911-27995)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (164-244)||(1051-1132)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (102-249)||(5657-5803)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (102-249)||(143-290)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (99-242)||(8015-8161)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (164-244)||(16301-16380)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (102-248)||(32551-32696)
scaffold0034 (99-244)||(51840-51985)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (210-249)||(1096-1135)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (210-249)||(1102-1141)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (202-249)||(4893-4940)
scaffold0395 (99-187)||(919-1006)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (210-249)||(6625-6664)
scaffold0333 (210-249)||(14005-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (210-249)||(6191-6230)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (210-249)||(2713-2752)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (202-249)||(15298-15345)
scaffold0106 (164-244)||(1308-1387)
scaffold0106 (210-244)||(7285-7319)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (210-249)||(15845-15884)
scaffold0020 (205-245)||(178912-178952)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (99-244)||(6239-6386)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (113-199)||(6675-6761)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (102-244)||(1032-1171)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (99-248)||(25121-25271)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (102-249)||(14658-14804)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (142-249)||(2805-2913)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (138-249)||(32112-32224)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (189-244)||(51601-51658)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (205-249)||(23853-23897)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (102-189)||(8090-8176)
scaffold0556 (202-249)||(6826-6874)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (210-249)||(12780-12819)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (210-249)||(36464-36503)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (202-248)||(23942-23989)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (210-244)||(5196-5230)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (188-248)||(8118-8180)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (211-249)||(28839-28877)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (99-240)||(38339-38482)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (162-244)||(47014-47095)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (99-244)||(97024-97171)
scaffold0006 (99-244)||(106302-106449)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (102-248)||(10542-10688)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (113-244)||(1021-1151)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (135-236)||(192968-193070)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (99-137)||(6070-6108)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (210-248)||(12954-12992)
scaffold0138 (99-171)||(18194-18265)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (202-242)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 14409445 - 14409595
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409445 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 14409544  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409545 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1484563 - 1484413
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484563 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 1484464  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484463 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 5853293 - 5853443
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853293 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 5853392  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853393 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 15203232 - 15203382
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203232 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 15203331  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203332 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16413317 - 16413467
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413317 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 16413416  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413417 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20403388 - 20403238
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403388 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20403289  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403288 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22001914 - 22001764
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001914 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22001815  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001814 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41598349 - 41598199
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41598349 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 41598250  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598249 ctgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4483441 - 4483292
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483441 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 4483342  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483341 ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20046196 - 20046346
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20046196 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 20046295  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046296 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 4542374 - 4542524
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4542374 gtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttg 4542473  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542474 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19896429 - 19896276
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19896429 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtata 19896330  T
Q  196 ctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896329 ccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 45290695 - 45290846
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290695 gtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45290794  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290795 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14823934 - 14823785
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823934 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 14823835  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  14823834 ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgat 14823785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 244
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  103 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgt 19801485  T
Q  203 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801486 gttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15070718 - 15070571
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15070718 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15070619  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070618 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26224080 - 26223930
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26224080 gtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattg 26223981  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26223980 ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 25484276 - 25484419
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25484276 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-- 25484373  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
         | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25484374 -----tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18818365 - 18818516
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818365 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18818464  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818465 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18818516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16092298 - 16092449
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092298 gtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 16092397  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092398 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16092449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 19937006 - 19937157
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937006 gtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatact 19937105  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19937106 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372792
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 209  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7372792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6759420 - 6759272
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759420 gtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 6759324  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759323 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6759272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20536373 - 20536222
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536373 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20536274  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536273 cctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20536222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 21918956 - 21919105
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918956 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21919054  T
Q  198 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919055 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924035
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21924035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 28649000 - 28649151
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28649000 gtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactg 28649099  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649100 cctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28649151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23406546 - 23406393
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23406546 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 23406447  T
Q  197 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406446 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219728
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26219728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22875229 - 22875079
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22875229 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg 22875131  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875130 cctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 22875079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22626900 - 22626750
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22626900 gtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg 22626802  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626801 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22626750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225398
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18879192 - 18879338
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  18879192 gtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactg 18879286  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879287 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31971420 - 31971273
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31971420 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg 31971323  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971322 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 13508041 - 13508188
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||    
T  13508041 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatattg 13508139  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508140 cctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 13597573 - 13597720
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  13597573 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcattctg 13597671  T
Q  199 c-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597672 cttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 17612066 - 17612213
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  17612066 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 17612164  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612165 cctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Original strand, 45131017 - 45131098
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131017 aattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20498727 - 20498581
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||    
T  20498727 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactg 20498629  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498628 cctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 24486045 - 24486093
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486045 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855358
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Original strand, 16199664 - 16199746
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199664 aattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21285758 - 21285611
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  21285758 atataattgtatatacattacatgaactatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 21285661  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21285660 atgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23648702 - 23648567
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg 212  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||| |||    
T  23648702 tgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattg 23648604  T
Q  213 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23648603 ttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678209
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 5866237 - 5866376
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  5866237 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 5866331  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866332 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37116513 - 37116366
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||    
T  37116513 gtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtac 37116416  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116415 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17141074 - 17140932
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| |    
T  17141074 atataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcct 17140980  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140979 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21491153 - 21491011
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  21491153 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 21491059  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491058 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6520430 - 6520382
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520430 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  202 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760950
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121746
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    |||  |||||||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32810092 - 32810054
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810092 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 21389473 - 21389552
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389473 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 21396003 - 21396082
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396003 ttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 21778799 - 21778878
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778799 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 21790496 - 21790575
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790496 ttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 17439462 - 17439609
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||    
T  17439462 gtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtac 17439559  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439560 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249400
Alignment:
Q  213 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255238
Alignment:
Q  213 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18215275 - 18215425
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215275 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18215374  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215375 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 12308 - 12458
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12308 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 12407  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12408 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 15118353 - 15118503
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118353 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 15118452  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118453 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52312671 - 52312521
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312671 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 52312572  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312571 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44615449 - 44615299
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44615449 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 44615350  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615349 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 44773088 - 44773238
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773088 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 44773187  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773188 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 50222340 - 50222490
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50222340 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg 50222439  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222440 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 1837510 - 1837660
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837510 gtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactg 1837609  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837610 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3515168 - 3515018
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3515168 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg 3515069  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515068 ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18239420 - 18239570
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239420 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18239519  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239520 ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19242860 - 19242710
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242860 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 19242761  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242760 ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 19618173 - 19618323
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19618173 gtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg 19618272  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618273 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 15355325 - 15355476
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355325 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15355424  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355425 gctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23803266 - 23803416
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23803266 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 23803365  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803366 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44102375 - 44102225
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44102375 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 44102276  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102275 ctgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 51463869 - 51464019
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51463869 gtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 51463968  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463969 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 44928880 - 44929031
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928880 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactg 44928979  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928980 cttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 14970708 - 14970858
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14970708 gtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg 14970807  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970808 ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  100 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt 21815686  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815687 tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15367855 - 15367708
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367855 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15367756  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367755 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15402868 - 15402721
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402868 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15402769  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402768 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12611104 - 12610961
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||          
T  12611104 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt------ 12611011  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611010 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15371367 - 15371220
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371367 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15371268  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371267 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15373648 - 15373501
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373648 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15373549  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373548 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15370182 - 15370036
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370182 gtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15370084  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370083 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16223697 - 16223550
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223697 gtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16223598  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223597 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 7641193 - 7641333
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||             
T  7641193 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt--------- 7641283  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641284 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20149991 - 20149840
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149991 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20149892  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20149891 gatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12902922 - 12902773
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902922 gtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 12902823  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902822 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7089042 - 7088891
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089042 gtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7088943  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088942 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7088891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7798923 - 7798788
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7798923 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 7798824  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798823 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7798788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16377479 - 16377628
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16377479 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactg 16377576  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377577 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16377628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798861
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 216  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  217 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7893868 - 7893717
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893868 gtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7893769  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893768 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 7893717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14038813 - 14038662
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14038813 gtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactg 14038714  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038713 catgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 14038662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280327
Alignment:
Q  142 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 241  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  242 aagttgat 249  Q
    ||||||||    
T  14280334 aagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22636600 - 22636449
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22636600 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactg 22636501  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636500 tctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22636449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873474
Alignment:
Q  151 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22353998 - 22353852
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  |||    
T  22353998 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctg 22353899  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353898 cctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574971
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44052994 - 44052843
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052994 gtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 44052895  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44052894 cctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgat 44052843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16270192 - 16270342
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16270192 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 16270290  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16270291 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgat 16270342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 23374315 - 23374464
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23374315 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactg 23374414  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23374415 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 13807 - 13953
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  13807 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactg 13905  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13906 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 52243150 - 52243302
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  |||  |||| ||||    
T  52243150 gtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatac 52243248  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243249 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6900055 - 6899905
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  6900055 gtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactg 6899957  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6899956 cctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 6899905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240076
Alignment:
Q  100 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 198  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgat 16240076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 43198509 - 43198661
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||  |||| |||||  |  ||||| ||| |    
T  43198509 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatatt 43198608  T
Q  198 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198609 gtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096309
Alignment:
Q  178 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6190618 - 6190481
Alignment:
Q  109 tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg 206  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||    
T  6190618 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 6190520  T
Q  207 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190519 ctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  100 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12774069 - 12774021
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774069 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 12288269 - 12288316
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288269 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706395
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 46640412 - 46640558
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| |||| || || |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||    
T  46640412 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatac 46640508  T
Q  197 tg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640509 tgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551833
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Original strand, 14053321 - 14053403
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053321 aattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046506
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 29172584 - 29172734
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172584 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29172683  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172684 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 9707608 - 9707758
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707608 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 9707707  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707708 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17463339 - 17463189
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463339 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17463240  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463239 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34159487 - 34159337
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159487 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 34159388  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159387 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 38961892 - 38962042
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961892 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 38961991  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961992 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 45606908 - 45607058
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606908 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 45607007  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607008 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 55476652 - 55476502
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476652 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 55476553  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476552 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 7781348 - 7781498
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781348 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7781447  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781448 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8899255 - 8899105
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899255 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 8899156  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899155 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16454282 - 16454432
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454282 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 16454381  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454382 ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 28848612 - 28848762
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848612 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 28848711  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848712 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 13151791 - 13151942
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151791 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13151890  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151891 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 13154256 - 13154407
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154256 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13154355  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154356 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 6469135 - 6469285
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469135 gtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 6469234  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469235 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 10247724 - 10247874
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247724 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10247823  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10247824 ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12567721 - 12567571
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12567721 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg 12567622  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567621 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13544186 - 13544036
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13544186 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg 13544087  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544086 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16282812 - 16282962
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282812 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 16282911  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282912 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 17446656 - 17446805
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446656 gtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17446755  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17446756 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50242983 - 50242833
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  50242983 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 50242884  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242883 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41124048 - 41123901
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124048 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 41123949  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123948 ttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17672787 - 17672637
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672787 gtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17672688  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672687 ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 53070654 - 53070799
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53070654 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactg 53070753  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070754 ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 12119725 - 12119876
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119725 gtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12119824  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119825 gctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 43550479 - 43550625
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43550479 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactg 43550578  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550579 catatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15412589 - 15412440
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412589 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15412490  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412489 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8499680 - 8499529
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8499680 gtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 8499581  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499580 actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977526
Alignment:
Q  129 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  229 catgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14973019 - 14972868
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973019 gtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 14972920  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972919 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14972868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17488021 - 17487870
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488021 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17487922  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487921 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17487870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17499503 - 17499352
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499503 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17499404  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499403 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 40213677 - 40213827
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40213677 gtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg 40213776  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213777 ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500953
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  55500953 t 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166609
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42386575 - 42386428
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42386575 gtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactg 42386476  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386475 cctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43841097 - 43840946
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841097 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 43840998  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43840997 tctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 43840946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26687052 - 26686902
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687052 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 26686953  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686952 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13442439 - 13442288
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442439 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 13442340  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442339 cctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13442288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 14576789 - 14576939
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14576789 gtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactg 14576887  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576888 tctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20698392 - 20698542
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20698392 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactg 20698490  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698491 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20698542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23083317 - 23083468
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23083317 gtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactg 23083416  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083417 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23083468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 25476341 - 25476492
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact- 197  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25476341 gtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 25476440  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476441 cctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 25476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  117 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 215  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  216 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399225
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 211  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  212 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18438699 - 18438548
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18438699 gtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg 18438600  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18438599 cctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 18438548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494820
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10557081 - 10556996
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557081 ttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 11424719 - 11424866
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11424719 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactg 11424814  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11424815 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 11424866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 24340679 - 24340826
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  24340679 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactg 24340777  T
Q  199 c-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340778 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 24153181 - 24153315
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||    
T  24153181 tgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgt 24153279  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153280 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737247
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 52523683 - 52523831
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || | |||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||    
T  52523683 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatac 52523781  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523782 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27165412 - 27165261
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||| | ||||||    
T  27165412 gtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactg 27165314  T
Q  199 -ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165313 tctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23274852 - 23274705
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  23274852 gtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 23274754  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274753 cctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 37642221 - 37642368
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  37642221 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactg 37642319  T
Q  199 c-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642320 cctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 53301506 - 53301658
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt-tgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||| || |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  53301506 gtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 53301604  T
Q  198 g-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301605 gtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 22147481 - 22147571
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147481 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  201 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Original strand, 2051155 - 2051238
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||    
T  2051155 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 249
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577989
Alignment:
Q  207 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16097489 - 16097342
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||| |    
T  16097489 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcct 16097392  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097391 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 17248242 - 17248287
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248242 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  138 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 235  Q
    |||||||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  236 cggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174366
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194704
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822279
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029855
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  234 gtcggtctaagttga 248  Q
    ||| |||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210432
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16103940 - 16103794
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16103940 atataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16103844  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103843 atgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668183
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511071
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  12511072 at 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14234648 - 14234501
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14234648 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 14234551  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14234550 atgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512934
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520909
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6726156 - 6726006
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726156 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 6726057  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726056 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 21155061 - 21155211
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155061 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 21155160  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155161 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18809104 - 18808954
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809104 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18809005  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809004 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23131023 - 23130873
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131023 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23130924  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130923 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23133490 - 23133340
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133490 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23133391  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133390 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23709533 - 23709683
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709533 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23709632  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709633 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23712014 - 23712164
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712014 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23712113  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712114 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24367935 - 24367785
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367935 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24367836  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367835 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26505540 - 26505390
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26505540 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 26505441  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505440 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26508018 - 26507868
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26508018 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 26507919  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507918 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 34402523 - 34402673
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402523 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 34402622  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402623 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39682474 - 39682324
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682474 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 39682375  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682374 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 571558 - 571408
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571558 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 571459  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571458 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23135751 - 23135601
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135751 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23135652  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135651 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 32214922 - 32215072
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214922 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 32215021  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215022 ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24898196 - 24898347
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898196 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24898295  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898296 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24900679 - 24900830
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900679 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24900778  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900779 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24903156 - 24903307
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903156 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24903255  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903256 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24905633 - 24905784
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905633 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24905732  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905733 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24908108 - 24908259
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908108 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24908207  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908208 ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 32039499 - 32039649
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039499 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 32039598  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32039599 ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28577260 - 28577110
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28577260 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg 28577161  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577160 ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43137460 - 43137310
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  43137460 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatta 43137361  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137360 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22105574 - 22105423
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105574 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactg 22105475  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105474 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 45029855 - 45030005
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45029855 gtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg 45029954  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029955 ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 24529529 - 24529680
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529529 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24529628  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529629 gatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38967536 - 38967385
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  38967536 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatatt 38967437  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967436 gttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23060678 - 23060527
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060678 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23060579  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060578 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23060527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23076607 - 23076460
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076607 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23076508  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076507 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22337280 - 22337129
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22337280 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacag 22337181  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337180 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22337129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 22731190 - 22731341
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22731190 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactg 22731289  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22731290 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgat 22731341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 22738136 - 22738286
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22738136 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactg 22738235  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738236 cctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23286026 - 23285879
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  23286026 gtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactg 23285931  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285930 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23285879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 298770 - 298922
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  298770 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactg 298869  T
Q  199 c-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298870 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19671994 - 19671848
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  19671994 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 19671897  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671896 cctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 24642857 - 24642933
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24642857 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 23708575 - 23708725
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  23708575 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactg 23708673  T
Q  199 -ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708674 cctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 247
Target Start/End: Original strand, 38134 - 38219
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38134 aattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 23654342 - 23654491
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  23654342 gtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctg 23654441  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654442 cctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643101
Alignment:
Q  182 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23660187 - 23660037
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23660187 gtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactg 23660089  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23660088 cctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgat 23660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 7689 - 7835
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  7689 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactg 7787  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7788 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 244
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103497
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040296
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23040296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  142 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 239  Q
    |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  240 ctaagttgat 249  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946671
Alignment:
Q  187 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8946671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 20520149 - 20520295
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||    
T  20520149 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtac 20520245  T
Q  197 tgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520246 tgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 244
Target Start/End: Original strand, 32451894 - 32452031
Alignment:
Q  109 tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg 206  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||    
T  32451894 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 32451992  T
Q  207 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451993 ctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 22459518 - 22459587
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgat 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  22459518 gtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20309206 - 20309127
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309206 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616199
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7679699 - 7679599
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7679699 gttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 7679602  T
Q  247 gat 249  Q
    |||    
T  7679601 gat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 137
Target Start/End: Original strand, 22173830 - 22173868
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173830 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134306
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175864
Alignment:
Q  142 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 239  Q
    |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  240 ctaagttgat 249  Q
    ||||||||||    
T  25175873 ctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 247
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072054
Alignment:
Q  212 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23791439 - 23791357
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||    
T  23791439 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20908 - 20758
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20809  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20808 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37982 - 37832
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37982 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 37883  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37882 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 94572 - 94422
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94572 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 94473  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94472 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 17441 - 17591
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17441 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17540  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17541 ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119891
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  201 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101513
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 158451 - 158601
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158451 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 158550  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158551 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 339906 - 340053
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  339906 gtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg 340003  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340004 cctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 456482 - 456332
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456482 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 456383  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456382 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 11393288 - 11393438
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393288 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 11393387  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393388 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11972657 - 11972507
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972657 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 11972558  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972557 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 14949123 - 14949273
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949123 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 14949222  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949223 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 15376714 - 15376864
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376714 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 15376813  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376814 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16232681 - 16232531
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232681 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 16232582  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232581 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18640433 - 18640283
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640433 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18640334  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640333 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20385124 - 20385274
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385124 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20385223  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385224 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 21189596 - 21189746
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189596 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 21189695  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189696 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32125652 - 32125502
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125652 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 32125553  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125552 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41523078 - 41522928
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523078 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 41522979  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522978 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41525540 - 41525390
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525540 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 41525441  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525440 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24702399 - 24702249
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24702399 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 24702300  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702299 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27217021 - 27216871
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217021 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 27216922  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27216921 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410070
Alignment:
Q  100 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410119 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275182
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  211 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44116670 - 44116520
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44116670 gtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 44116571  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116570 ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3386494 - 3386344
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3386494 gtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatacta 3386395  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386394 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16213845 - 16213695
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16213845 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 16213746  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213745 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18430873 - 18430723
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18430873 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg 18430774  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430773 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13647490 - 13647344
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647490 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactg 13647391  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647390 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24704846 - 24704699
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  24704846 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactg 24704750  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704749 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 17061916 - 17062066
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17061916 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatactg 17062014  T
Q  199 ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062015 ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 38898377 - 38898528
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38898377 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 38898476  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898477 gctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 12756672 - 12756817
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12756672 gtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg 12756771  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756772 ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20110707 - 20110567
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20110707 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata--- 20110611  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110610 -------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13869506 - 13869357
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869506 gatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 13869407  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869406 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 3564332 - 3564471
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  3564332 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg 3564431  T
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564432 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3564471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 26355984 - 26356090
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355984 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26356083  T
Q  199 ctgtgtt 205  Q
     ||||||    
T  26356084 ttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 26358436 - 26358542
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26358436 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26358535  T
Q  199 ctgtgtt 205  Q
     ||||||    
T  26358536 ttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273403
Alignment:
Q  141 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 239  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  240 ctaagttgat 249  Q
    ||||||||||    
T  48273412 ctaagttgat 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12698997 - 12698845
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatact 197  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12698997 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatact 12698898  T
Q  198 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698897 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12698845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831384
Alignment:
Q  134 gtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| |||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9509338 - 9509203
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 213  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||    
T  9509338 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgt 9509239  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509238 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9509203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18456369 - 18456519
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18456369 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg 18456467  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456468 cctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26212161 - 26212012
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26212161 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactg 26212062  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212061 cctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38227645 - 38227499
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38227645 gtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg 38227547  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227546 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 38227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10589203 - 10589055
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |||| | |  ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10589203 gtgatataat-gtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactg 10589105  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589104 catatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 2280075 - 2280225
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  2280075 gtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactg 2280173  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280174 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 248
Target Start/End: Original strand, 15144006 - 15144143
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||    
T  15144006 tatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgt 15144105  T
Q  211 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144106 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 19486700 - 19486847
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  19486700 gtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactg 19486798  T
Q  199 c-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486799 cctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 247
Target Start/End: Original strand, 16386263 - 16386353
Alignment:
Q  159 tacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386263 tacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072927
Alignment:
Q  142 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 239  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  240 ctaagttgat 249  Q
    ||||||||||    
T  22072936 ctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40443554 - 40443410
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  40443554 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactg 40443458  T
Q  199 c-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443457 cgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 12255747 - 12255892
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || || |||||||| |||| |||||  |   |||| |||||    
T  12255747 gtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatact 12255846  T
Q  198 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 241  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255847 gactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 15081950 - 15081999
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081950 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34200944 - 34200802
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  34200944 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 34200850  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200849 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67759
Alignment:
Q  141 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 238  Q
    ||||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  239 tctaagttgat 249  Q
    |||||||||||    
T  67769 tctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 201  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  202 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15116644 - 15116568
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15116644 gtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811238
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014192
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831821
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 1867951 - 1868101
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||| | || || |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||    
T  1867951 gtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatac 1868047  T
Q  197 tgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868048 tgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16495560 - 16495421
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  16495560 atataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 16495466  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495465 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15113107 - 15113031
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  15113107 gtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505405
Alignment:
Q  166 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 28505405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 245
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154944
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15754992
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  217 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  217 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15211586 - 15211484
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15211586 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 15211488  T
Q  233 agtc 236  Q
    ||||    
T  15211487 agtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Original strand, 15008455 - 15008489
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15008455 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 15008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Original strand, 20220146 - 20220180
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20220146 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 20220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996132
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 27847853 - 27847932
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847853 ttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12742478 - 12742328
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742478 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 12742379  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742378 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18334593 - 18334743
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334593 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 18334692  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334693 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19005207 - 19005057
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005207 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 19005108  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005107 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 19858920 - 19859070
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858920 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 19859019  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859020 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22782388 - 22782238
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782388 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22782289  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782288 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24422708 - 24422558
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422708 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 24422609  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422608 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33861955 - 33861805
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861955 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 33861856  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861855 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33864439 - 33864289
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864439 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 33864340  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864339 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 2291181 - 2291331
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2291181 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 2291280  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291281 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8055190 - 8055040
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8055190 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactt 8055091  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055090 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 26924641 - 26924791
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26924641 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 26924740  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924741 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 30676711 - 30676861
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30676711 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg 30676810  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676811 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25754970 - 25754820
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25754970 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 25754871  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754870 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34963534 - 34963384
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963534 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 34963435  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963434 ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18456880 - 18456735
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18456880 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 18456781  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456780 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 1540912 - 1541062
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1540912 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg 1541011  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1541012 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16448527 - 16448678
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448527 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16448626  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16448627 gctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 3852018 - 3852168
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3852018 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatacta 3852117  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852118 ttgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  108 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  208 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20556895 - 20557043
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556895 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg 20556992  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20556993 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1595710 - 1595560
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1595710 gtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 1595611  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1595610 ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25656790 - 25656640
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656790 gtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 25656691  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25688663 - 25688513
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688663 gtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 25688564  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25688563 ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20360916 - 20361067
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20360916 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctg 20361015  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20361016 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 20361067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 25629311 - 25629462
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25629311 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactg 25629410  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629411 catgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25629462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25644486 - 25644335
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  25644486 gtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactg 25644387  T
Q  199 -ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644386 cctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060554
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 199  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgat 29060554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287903
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18409783 - 18409934
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409783 gtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactg 18409882  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409883 cctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgat 18409934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16496409 - 16496260
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16496409 gtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactg 16496310  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496309 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20593926 - 20593787
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20593926 tatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctg 20593827  T
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20593826 tttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgat 20593787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 18821802 - 18821946
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18821802 gtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatact 18821899  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821900 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 19303497 - 19303647
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  19303497 gtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactt 19303595  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303596 cctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 19303647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780334
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 22780334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20076861 - 20076714
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20076861 gtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactg 20076766  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076765 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Original strand, 20638301 - 20638390
Alignment:
Q  161 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20638301 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20638390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 19847950 - 19848102
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||    
T  19847950 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatct 19848049  T
Q  198 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19848050 gcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109153
Alignment:
Q  107 attgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| | ||| || ||||| |||||| || ||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgtt 20109197  T
Q  206 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109196 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 8227467 - 8227616
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  8227467 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 8227565  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227566 cctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 8227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 201  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgctt 23019470  T
Q  202 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333325
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394065
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 28496434 - 28496575
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  28496434 atataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcct 28496528  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496529 atgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 29808845 - 29808986
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29808845 atataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcct 29808939  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808940 atgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098620
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35245735 - 35245605
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 211  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  35245735 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtt 35245639  T
Q  212 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245638 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652209
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19668433 - 19668386
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668433 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992441
Alignment:
Q  151 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561319
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 240
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920728
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 249
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080832
Alignment:
Q  216 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22080832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  202 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 264769 - 264919
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264769 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 264868  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264869 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733091
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733041 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39363545 - 39363395
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363545 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 39363446  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363445 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20909173 - 20909023
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909173 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20909074  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909073 ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29330095 - 29329945
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29330095 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 29329996  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329995 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 42245366 - 42245516
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245366 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 42245465  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245466 ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 20902009 - 20902159
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902009 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20902108  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902109 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29346141 - 29345991
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346141 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29346042  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29346041 ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 36154784 - 36154931
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154784 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 36154883  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154884 ctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29348614 - 29348464
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348614 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29348515  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29348514 ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29351087 - 29350937
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351087 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29350988  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29350987 ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39245297 - 39245147
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245297 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 39245198  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245197 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 2154614 - 2154765
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154614 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 2154713  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154714 gttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 18319034 - 18319185
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319034 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18319133  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18319134 gctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 11581200 - 11581350
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11581200 gtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 11581299  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581300 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32027554 - 32027404
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027554 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 32027455  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32027454 ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 10775676 - 10775827
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10775676 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatact 10775775  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775776 gctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 20917953 - 20918099
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20917953 gtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatactg 20918048  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918049 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24067269 - 24067118
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24067269 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24067170  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24067169 gttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31061230 - 31061079
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061230 gtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31061131  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31061130 actgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38619593 - 38619445
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgct 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38619593 atataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactact 38619494  T
Q  201 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619493 gtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23064671 - 23064522
Alignment:
Q  101 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23064671 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 23064572  T
Q  200 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064571 tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23390452 - 23390603
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23390452 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23390551  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390552 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23390603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25421697 - 25421546
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421697 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 25421598  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421597 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25421546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9078117 - 9077966
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9078117 gtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactg 9078018  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9078017 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgat 9077966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 21729020 - 21729169
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21729020 gtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactg 21729119  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729120 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 21808345 - 21808494
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21808345 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactg 21808444  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808445 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25431559 - 25431414
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431559 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 25431460  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 243  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431459 cctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1096632 - 1096481
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  1096632 gtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatacta 1096533  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096532 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 8286798 - 8286950
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt-gtatact 197  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286798 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatact 8286897  T
Q  198 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286898 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8286950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24529385 - 24529234
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529385 gtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactg 24529286  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529285 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24529234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22144214 - 22144068
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||     
T  22144214 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatacta 22144116  T
Q  199 c-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144115 cctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24493733 - 24493583
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24493733 gtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 24493635  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24493634 cctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24493583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997641
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21997641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22075184 - 22075035
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  22075184 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatactt 22075085  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075084 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412198
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 216  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  217 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13025475 - 13025325
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13025475 gtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactg 13025377  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13025376 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 13025325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13095659 - 13095509
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13095659 gtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactg 13095561  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13095560 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 13095509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40726018 - 40725871
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||    
T  40726018 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactg 40725920  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725919 cctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Original strand, 21292991 - 21293071
Alignment:
Q  163 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21292991 attgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21565703 - 21565556
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  21565703 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttggatactgcct 21565606  T
Q  201 gtgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565605 atgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 212  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  213 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| | ||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 205  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329604
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959639
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  165 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660940
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806893
Alignment:
Q  201 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517308
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 233  Q
    |||||| || ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  234 gtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||||||||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314596
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 22178176 - 22178323
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| | || ||||  |||| |||| |||||    
T  22178176 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatac 22178273  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178274 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 244
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 21502116 - 21502263
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| | || |||||| || | |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcct 21502213  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704089
Alignment:
Q  205 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973822
Alignment:
Q  205 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668912
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgat 19668912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21873351 - 21873277
Alignment:
Q  163 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 236  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873351 attgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13989027 - 13988877
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989027 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13988928  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988927 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 21923292 - 21923442
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923292 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 21923391  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923392 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 21475088 - 21475238
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475088 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 21475187  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475188 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 23593736 - 23593886
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593736 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23593835  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593836 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21840928 - 21840778
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21840928 gtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg 21840829  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840828 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29298297 - 29298148
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29298297 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactg 29298199  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298198 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29776849 - 29776699
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29776849 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactg 29776750  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776749 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31612474 - 31612324
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31612474 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 31612375  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612374 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16362078 - 16361928
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16362078 gtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg 16361979  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361978 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 45574843 - 45574989
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45574843 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactg 45574942  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574943 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 13212862 - 13213013
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13212862 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13212961  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212962 gttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21347123 - 21346972
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21347123 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 21347024  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347023 gctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 22123068 - 22123215
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22123068 gtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 22123167  T
Q  199 ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123168 ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21707328 - 21707178
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  21707328 gtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatacta 21707229  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707228 ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21711870 - 21711720
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  21711870 gtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatacta 21711771  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711770 ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16275364 - 16275515
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275364 gtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16275463  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16275464 gctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21342258 - 21342107
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21342258 gtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 21342159  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342158 gctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 433171 - 433023
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  433171 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactg 433072  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433071 cctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40389316 - 40389165
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389316 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 40389217  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  40389216 gatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 15860009 - 15860160
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15860009 gtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatact 15860108  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15860109 gctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 27250685 - 27250834
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250685 gtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 27250784  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250785 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 50210169 - 50210320
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50210169 gtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 50210268  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210269 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50210320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34509945 - 34509794
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34509945 gtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactg 34509846  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509845 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34509794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22532434 - 22532283
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532434 gtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22532335  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  22532334 cctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgat 22532283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21026845 - 21026696
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21026845 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactg 21026746  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026745 cctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 21861526 - 21861672
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21861526 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactg 21861624  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861625 cctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 21896212 - 21896358
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  21896212 gtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatactg 21896310  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896311 cctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 22468652 - 22468803
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||    
T  22468652 gtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctg 22468751  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22468752 cctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847259
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 35261037 - 35261180
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35261037 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactg 35261132  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261133 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16758815 - 16758664
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||  | |||||||| |||| |||||  |||  |||| ||||    
T  16758815 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatac 16758718  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758717 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454660
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33681168 - 33681022
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  ||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33681168 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 33681071  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681070 atgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135201
Alignment:
Q  100 tgatataattgtatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | || |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20918762 - 20918620
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  20918762 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 20918668  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918667 atgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  138 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 235  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  236 cggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 41049992 - 41050138
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatact 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||    
T  41049992 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatact 41050089  T
Q  198 g-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | || |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050090 gcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 14295514 - 14295652
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  14295514 atataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacct 14295608  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 243  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295609 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714556
Alignment:
Q  205 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 22354528 - 22354616
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 187  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354528 gtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921976
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248293
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 237
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801483
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4855 - 4705
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4855 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 4756  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4755 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13553 - 13403
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13553 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13454  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14108 - 13958
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14108 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 14009  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14008 ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 136841 - 136691
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  136841 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 136742  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136741 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 139310 - 139160
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  139310 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 139211  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139210 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 144248 - 144098
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  144248 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 144149  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144148 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 134372 - 134222
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  134372 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 134273  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  134272 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 141779 - 141629
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  141779 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg 141680  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141679 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  138 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  236 cggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62216
Alignment:
Q  166 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30093 - 29946
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30093 gtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29994  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29993 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10934 - 10784
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10934 gtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg 10835  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16945 - 16795
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16945 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 16846  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16845 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 501245 - 501095
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  501245 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg 501146  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501145 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 85580 - 85731
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85580 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 85679  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85680 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 160844 - 160698
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  160844 atataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 160748  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160747 atgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4308
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4458 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 4359  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4358 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40561 - 40411
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40561 gtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactg 40462  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40461 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 82233 - 82083
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  82233 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta 82134  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82133 ctgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 22630 - 22776
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22630 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 22727  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22728 atgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11449 - 11299
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11449 gtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 11350  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11349 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9911 - 9760
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9911 gtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 9812  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33106 - 32956
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33106 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 33008  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33007 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgat 32956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38925 - 38775
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38925 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 38827  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38826 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgat 38775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 12250 - 12400
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  12250 gtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg 12349  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12350 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9403 - 9253
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9403 gtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg 9304  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 20380 - 20524
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20380 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg 20478  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20479 atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 128915 - 128765
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |  |     
T  128915 gtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttttt 128816  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  128815 ttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 267 - 117
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  267 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 168  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  167 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 79285 - 79430
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79285 gtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactg 79384  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79385 tcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 17171 - 17324
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt--gtatac 196  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17171 gtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatac 17270  T
Q  197 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17271 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4376 - 4225
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4376 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatact 4277  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4276 gctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12219 - 12075
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12219 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactg 12120  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119 ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 2129 - 2280
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2129 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2228  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2229 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 17983 - 18130
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||    
T  17983 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatg 18081  T
Q  199 c-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18082 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 1281 - 1432
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1281 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1380  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
      ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1381 catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 161090 - 161239
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  161090 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatact 161189  T
Q  198 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161190 gctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 181
Target Start/End: Original strand, 164591 - 164674
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  164591 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23047 - 22897
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23047 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22948  T
Q  199 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22947 gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 26021 - 26172
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26021 gtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 26120  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26121 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44814
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 216  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  217 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13376 - 13225
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13376 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13277  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13276 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 13225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52078 - 51927
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52078 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg 51979  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51978 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 167935 - 168083
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  167935 gtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 168033  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168034 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 3142 - 3293
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3142 gtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg 3241  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 3107 - 3257
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3107 gtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg 3205  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4522
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4672 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 4573  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4572 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12254 - 12104
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12254 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 12155  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12154 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22206 - 22056
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22206 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 22107  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22106 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 16556 - 16707
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16556 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactg 16655  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16656 cttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 16707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1865
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2016 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 1917  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1153
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1005 gtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 1103  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1104 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39641 - 39491
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39641 gtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 39543  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39542 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 75171 - 75321
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  75171 gtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 75269  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75270 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 75321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3635 - 3484
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635 gtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3536  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3535 cctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 507 - 361
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  507 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactg 409  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408 cctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 32926 - 33063
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32926 tatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctg 33023  T
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33024 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46079 - 45942
Alignment:
Q  111 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46079 tatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctg 45982  T
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45981 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16127
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17436
Alignment:
Q  201 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 17436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116441
Alignment:
Q  118 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 217  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  218 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 24258 - 24406
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatact 197  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24258 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatact 24357  T
Q  198 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24358 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5014 - 4865
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5014 gtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactg 4915  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4914 cctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 8489 - 8636
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8489 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactg 8587  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8588 cctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28428
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  28429 at 28428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11308
Alignment:
Q  149 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 246  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2013
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4568
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6231
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6077 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatacta 6176  T
Q  199 c---tg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8493
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgt 213  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  214 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8481
Alignment:
Q  107 attgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgtt 8525  T
Q  206 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6549
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 27705 - 27855
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||     
T  27705 gtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatacta 27803  T
Q  199 c-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    | | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27804 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26060 - 25910
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  26060 gtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactg 25962  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25961 cctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 25910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40022 - 39872
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  40022 gtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactg 39924  T
Q  199 -ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39923 cctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgat 39872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 211  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  212 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11629 - 11482
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  11629 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 11531  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11530 cctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 3486 - 3586
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3486 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T
Q  199 c 199  Q
    |    
T  3586 c 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 38212 - 38359
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  38212 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactg 38310  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38311 cctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 16056 - 16206
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||     
T  16056 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatacta 16154  T
Q  198 gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13294 - 13147
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  13294 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatact 13196  T
Q  198 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13195 gcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 38658 - 38809
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  38658 gtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactg 38756  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38757 tctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4728
Alignment:
Q  173 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 53505 - 53651
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  53505 gtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactg 53603  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53604 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13598 - 13513
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598 aattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 247
Target Start/End: Original strand, 11462 - 11548
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11462 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32229 - 32083
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||    
T  32229 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactg 32133  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  103 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13257 - 13144
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13158  T
Q  199 -ctgtgttgctgtt 211  Q
     || ||||||||||    
T  13157 cctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 287
Alignment:
Q  207 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34281 - 34139
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||   |||||||||| ||    
T  34281 atataattgtatatatattacttgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttgtatactgcct 34187  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34186 atgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40077 - 39927
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40077 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg 39979  T
Q  199 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39978 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgat 39927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10528
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-t 210  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| |    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  211 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 247
Target Start/End: Original strand, 15483 - 15568
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15483 aattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  115 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 212  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  213 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121780
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 121780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 124750 - 124675
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatt 174  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  124750 gtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  184 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12094 - 12039
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12094 gtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12732 - 12587
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12732 gtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactg 12635  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12634 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 225571 - 225482
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  225571 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 60671 - 60818
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || | |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||    
T  60671 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatac 60768  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60769 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  201 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 45752 - 45899
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45752 atataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 45849  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45850 atttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 10501 - 10647
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10501 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10598  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10599 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21076 - 20928
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  21076 gtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattg 20977  T
Q  199 -ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
     || |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20976 cctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15819 - 15675
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||    
T  15819 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgtatactgcct 15725  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15724 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| | |||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  212 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27995 - 27911
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgc 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27995 gtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1051
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1132 ttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Original strand, 8015 - 8161
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||    
T  8015 gtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctg-atttgcatac 8113  T
Q  197 tg-ctgtgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    || || || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8114 tgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16380 - 16301
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32696 - 32551
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  32696 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 32600  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 51840 - 51985
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 197  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||    
T  51840 gtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgct 51937  T
Q  198 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    | || || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51938 gcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1096
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1141
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4940
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 4940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 919 - 1006
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 187  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  919 gtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6625
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 14005
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6230
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15345
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1387 - 1308
Alignment:
Q  164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1387 ttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7285
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15884
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178912
Alignment:
Q  205 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 6239 - 6386
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| | || ||||  |||| |||| |||||    
T  6239 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatac 6336  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6337 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 199  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 1032 - 1171
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  1032 atataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 1126  T
Q  201 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1127 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25271 - 25121
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||  |||| |||||  |||||||  |||||    
T  25271 gtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatac 25175  T
Q  197 tgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14804
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| |    
T  14658 atataatagtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcct 14754  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755 atgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  142 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 239  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  240 ctaagttgat 249  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  138 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  236 cggtctaagttgat 249  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51658 - 51601
Alignment:
Q  189 ttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51658 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23853
Alignment:
Q  205 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6826
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874 tgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36464
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 23942 - 23989
Alignment:
Q  202 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 244
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  188 tttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  211 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38482 - 38339
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| | || |||||  |||||||  |||||    
T  38482 gtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatac 38385  T
Q  197 tgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 240  Q
    ||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38384 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47095 - 47014
Alignment:
Q  162 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47095 aattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 97171 - 97024
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||    
T  97171 gtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtac 97074  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97073 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 106449 - 106302
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||    
T  106449 gtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtac 106352  T
Q  197 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
    || || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106351 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10688 - 10542
Alignment:
Q  102 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |  || |  |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10688 atataattgtatatacattacatgaattatgttcga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10591  T
Q  201 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
     ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 atgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1151
Alignment:
Q  113 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 211  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  212 g-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 244  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193070
Alignment:
Q  135 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  233 agtc 236  Q
    ||||    
T  193067 agtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 6070
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 137  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6108 gtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12992 - 12954
Alignment:
Q  210 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 248  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12992 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 18194 - 18265
Alignment:
Q  99 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  18194 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  202 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 70 times since January 2019
Visitors: 3266