View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0438_2D_low_7 (Length: 656)

Name: NF0438_2D_low_7
Description: NF0438_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0438_2D_low_7
NF0438_2D_low_7
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (1-647)||(13302-13948)
scaffold0197 (1-647)||(18181-18828)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (1-647)||(24265195-24265841)
chr7 (1-647)||(16880496-16881142)
chr7 (9-647)||(21640267-21640905)
chr7 (91-647)||(12397418-12397970)
chr7 (1-653)||(18409234-18409887)
chr7 (108-655)||(21983809-21984356)
chr7 (148-653)||(9189011-9189516)
chr7 (161-485)||(20000330-20000654)
chr7 (200-519)||(24275878-24276198)
chr7 (263-613)||(25404598-25404948)
chr7 (263-613)||(3320678-3321028)
chr7 (263-613)||(7073992-7074342)
chr7 (263-613)||(25409355-25409705)
chr7 (263-613)||(30246194-30246544)
chr7 (1-168)||(16885351-16885518)
chr7 (1-165)||(24260821-24260985)
chr7 (1-166)||(21811738-21811903)
chr7 (1-220)||(6592757-6592976)
chr7 (1-169)||(31109066-31109235)
chr7 (515-655)||(24273769-24273909)
chr7 (1-158)||(2058441-2058597)
chr7 (1-158)||(12406693-12406850)
chr7 (1-158)||(20357035-20357192)
chr7 (109-220)||(18390506-18390617)
chr7 (1-158)||(4873557-4873714)
chr7 (1-154)||(24023830-24023983)
chr7 (257-456)||(7393346-7393545)
chr7 (1-158)||(18392616-18392773)
chr7 (1-153)||(24789439-24789591)
chr7 (1-158)||(6594973-6595130)
chr7 (1-157)||(21646478-21646634)
chr7 (1-158)||(32060724-32060881)
chr7 (1-45)||(12397341-12397385)
chr7 (91-157)||(47264192-47264258)
chr7 (1-157)||(39730942-39731098)
chr7 (1-157)||(48408407-48408563)
chr7 (1-57)||(1533012-1533068)
chr7 (1-57)||(18414110-18414166)
chr7 (108-158)||(79955-80005)
chr7 (91-157)||(2479885-2479951)
chr7 (1-158)||(20343507-20343664)
chr7 (1-154)||(43504556-43504709)
chr7 (91-157)||(44847628-44847694)
chr7 (92-157)||(1532893-1532958)
chr7 (108-157)||(21989473-21989522)
chr7 (1-57)||(25767381-25767437)
chr7 (91-158)||(1562513-1562580)
chr7 (1-57)||(1562423-1562479)
chr7 (108-159)||(46515808-46515860)
chr7 (1-57)||(47264102-47264158)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (1-647)||(8512663-8513309)
chr3 (1-647)||(32475907-32476555)
chr3 (2-647)||(2676092-2676738)
chr3 (2-653)||(22172174-22172825)
chr3 (1-653)||(1306439-1307092)
chr3 (155-653)||(6793732-6794230)
chr3 (148-653)||(3327354-3327859)
chr3 (1-293)||(28503191-28503483)
chr3 (161-459)||(4386208-4386505)
chr3 (263-613)||(10201582-10201932)
chr3 (263-613)||(10094696-10095046)
chr3 (263-613)||(47878779-47879129)
chr3 (263-613)||(54192449-54192799)
chr3 (263-613)||(16461405-16461755)
chr3 (1-165)||(8517543-8517707)
chr3 (1-165)||(24968540-24968704)
chr3 (263-610)||(10900953-10901300)
chr3 (148-364)||(37466880-37467095)
chr3 (263-613)||(10595638-10595988)
chr3 (1-158)||(32480765-32480922)
chr3 (1-165)||(2672418-2672583)
chr3 (1-220)||(4598942-4599162)
chr3 (91-221)||(23198455-23198586)
chr3 (1-158)||(40372263-40372420)
chr3 (1-221)||(10057971-10058192)
chr3 (1-221)||(10060193-10060414)
chr3 (1-221)||(10062415-10062636)
chr3 (1-221)||(10064637-10064858)
chr3 (1-221)||(10066859-10067080)
chr3 (1-220)||(10210923-10211143)
chr3 (1-158)||(8477838-8477995)
chr3 (1-158)||(18656864-18657022)
chr3 (108-221)||(6718232-6718345)
chr3 (1-158)||(7167718-7167875)
chr3 (1-158)||(28501159-28501316)
chr3 (107-204)||(36029658-36029755)
chr3 (1-72)||(8738616-8738687)
chr3 (1-72)||(9090854-9090925)
chr3 (1-72)||(2671158-2671229)
chr3 (3-57)||(27352189-27352243)
chr3 (91-214)||(37407988-37408111)
chr3 (397-497)||(39989192-39989292)
chr3 (1-171)||(54634704-54634874)
chr3 (1-158)||(4601163-4601321)
chr3 (108-159)||(21711768-21711819)
chr3 (106-157)||(27974442-27974493)
chr3 (108-158)||(30709266-30709316)
chr3 (91-157)||(37726224-37726290)
chr3 (145-221)||(29812586-29812661)
chr3 (108-159)||(27038608-27038659)
chr3 (108-159)||(39032024-39032075)
chr3 (117-159)||(1730915-1730957)
chr3 (1-146)||(6716104-6716249)
chr3 (108-158)||(16264896-16264946)
chr3 (91-157)||(23200654-23200720)
chr3 (91-157)||(26928089-26928155)
chr3 (1-158)||(3617041-3617198)
chr3 (1-153)||(10055817-10055970)
chr3 (108-153)||(27027273-27027318)
chr3 (108-153)||(40734087-40734132)
chr3 (3-158)||(10208785-10208941)
chr3 (1-57)||(25637121-25637177)
chr3 (1-60)||(6718374-6718433)
chr3 (443-530)||(25512162-25512249)
chr3 (108-159)||(40592251-40592302)
chr3 (108-158)||(8738549-8738599)
chr3 (108-158)||(9090787-9090837)
chr3 (106-152)||(27985971-27986017)
chr3 (108-158)||(35926057-35926106)
chr3 (108-158)||(48438782-48438832)
chr3 (1-157)||(33386146-33386302)
chr3 (108-221)||(40734952-40735063)
chr3 (1-57)||(800794-800850)
chr3 (21-57)||(28503521-28503557)
chr3 (1-57)||(32143782-32143838)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-647)||(1257-1903)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (1-647)||(33334948-33335594)
chr6 (1-647)||(14741443-14742090)
chr6 (241-653)||(24434939-24435351)
chr6 (263-613)||(13882680-13883030)
chr6 (263-613)||(35201953-35202303)
chr6 (263-576)||(31249341-31249654)
chr6 (1-258)||(11857403-11857660)
chr6 (1-159)||(16839166-16839324)
chr6 (1-159)||(33329939-33330097)
chr6 (1-159)||(6005842-6006000)
chr6 (263-613)||(22344890-22345240)
chr6 (1-165)||(5343900-5344064)
chr6 (191-641)||(99789-100239)
chr6 (1-165)||(6438919-6439083)
chr6 (260-466)||(30517337-30517543)
chr6 (567-653)||(24713928-24714014)
chr6 (1-102)||(28155134-28155235)
chr6 (1-221)||(34166610-34166831)
chr6 (1-158)||(30125025-30125182)
chr6 (1-158)||(22010196-22010353)
chr6 (494-633)||(30517199-30517337)
chr6 (91-221)||(16554398-16554528)
chr6 (91-221)||(16630954-16631084)
chr6 (1-158)||(6136383-6136540)
chr6 (108-221)||(16652660-16652773)
chr6 (9-72)||(5266516-5266579)
chr6 (1-72)||(14737159-14737230)
chr6 (146-233)||(24435380-24435465)
chr6 (1-158)||(16578937-16579094)
chr6 (1-158)||(16616286-16616443)
chr6 (1-157)||(5674238-5674394)
chr6 (1-57)||(2171939-2171995)
chr6 (1-57)||(6026942-6026998)
chr6 (1-57)||(22709480-22709536)
chr6 (108-159)||(5016975-5017026)
chr6 (108-159)||(31085952-31086003)
chr6 (108-158)||(5266596-5266646)
chr6 (108-158)||(14737092-14737142)
chr6 (1-158)||(33342523-33342681)
chr6 (1-153)||(27647480-27647632)
chr6 (1-57)||(5757060-5757116)
chr6 (1-57)||(23896792-23896848)
chr6 (108-159)||(24714938-24714990)
chr6 (125-165)||(28155090-28155130)
chr6 (91-153)||(23896882-23896944)
chr6 (182-235)||(11138091-11138144)
chr6 (1-57)||(13150957-13151014)
chr6 (148-221)||(16568577-16568649)
chr6 (1-158)||(25420804-25420961)
chr6 (1-57)||(34164552-34164609)
chr6 (161-225)||(17759257-17759320)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-647)||(33768607-33769254)
chr5 (1-647)||(31400864-31401511)
chr5 (1-647)||(28806594-28807240)
chr5 (1-647)||(37560465-37561111)
chr5 (1-653)||(43592708-43593342)
chr5 (1-653)||(27445402-27446044)
chr5 (125-653)||(43625608-43626136)
chr5 (148-649)||(28832776-28833276)
chr5 (187-597)||(19589048-19589466)
chr5 (263-613)||(25451698-25452048)
chr5 (1-159)||(2785798-2785956)
chr5 (1-159)||(33791739-33791897)
chr5 (263-564)||(40222016-40222317)
chr5 (1-159)||(31396496-31396654)
chr5 (167-640)||(22828311-22828779)
chr5 (9-158)||(15045124-15045272)
chr5 (1-158)||(43599153-43599311)
chr5 (1-158)||(43604645-43604803)
chr5 (1-158)||(43610137-43610295)
chr5 (1-220)||(16546161-16546380)
chr5 (1-157)||(37556133-37556289)
chr5 (1-158)||(27450245-27450402)
chr5 (91-221)||(16409021-16409152)
chr5 (1-220)||(40381834-40382053)
chr5 (1-158)||(1456645-1456802)
chr5 (1-201)||(26177430-26177631)
chr5 (1-158)||(30631784-30631941)
chr5 (1-158)||(29402557-29402714)
chr5 (91-221)||(29722096-29722227)
chr5 (1-72)||(31180685-31180756)
chr5 (1-158)||(16544001-16544158)
chr5 (1-158)||(40379685-40379842)
chr5 (359-610)||(3885668-3885918)
chr5 (108-159)||(14520796-14520847)
chr5 (151-321)||(25785274-25785443)
chr5 (1-158)||(10592851-10593007)
chr5 (1-157)||(16407650-16407806)
chr5 (1-157)||(24136319-24136475)
chr5 (1-57)||(25077814-25077870)
chr5 (1-57)||(25135783-25135839)
chr5 (1-158)||(22536688-22536845)
chr5 (108-158)||(31180773-31180823)
chr5 (1-57)||(9352916-9352972)
chr5 (106-154)||(36931855-36931903)
chr5 (1-57)||(38219865-38219921)
chr5 (151-218)||(25767275-25767341)
chr5 (91-157)||(9352816-9352882)
chr5 (108-158)||(12083658-12083708)
chr5 (91-157)||(15465050-15465116)
chr5 (1-153)||(9789644-9789796)
chr5 (108-157)||(11916453-11916502)
chr5 (1-57)||(18442068-18442124)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-647)||(19344845-19345492)
chr2 (108-655)||(39483443-39483989)
chr2 (161-655)||(31056688-31057181)
chr2 (263-613)||(2740146-2740496)
chr2 (263-613)||(17942762-17943112)
chr2 (263-613)||(22713124-22713474)
chr2 (263-613)||(39686188-39686538)
chr2 (263-613)||(20050652-20051002)
chr2 (263-609)||(30478222-30478568)
chr2 (1-159)||(19349703-19349861)
chr2 (1-158)||(14291961-14292118)
chr2 (1-158)||(39811484-39811641)
chr2 (9-158)||(9295869-9296018)
chr2 (43-158)||(32247230-32247345)
chr2 (1-158)||(11098394-11098551)
chr2 (1-157)||(3492212-3492368)
chr2 (1-158)||(12647803-12647960)
chr2 (1-157)||(25410101-25410257)
chr2 (1-157)||(30832930-30833086)
chr2 (91-158)||(44310478-44310545)
chr2 (108-158)||(8389631-8389681)
chr2 (106-159)||(36757424-36757477)
chr2 (106-157)||(28258678-28258729)
chr2 (108-159)||(33528104-33528155)
chr2 (108-158)||(10706733-10706783)
chr2 (155-221)||(14634393-14634458)
chr2 (117-159)||(20522797-20522839)
chr2 (108-158)||(21630511-21630561)
chr2 (91-157)||(32289157-32289223)
chr2 (167-223)||(13828839-13828894)
chr2 (1-57)||(28258759-28258815)
chr2 (1-153)||(4484758-4484910)
chr2 (108-158)||(23077952-23078002)
chr2 (91-157)||(40739382-40739448)
chr2 (242-319)||(12550626-12550703)
chr2 (263-348)||(28462941-28463026)
chr2 (557-625)||(20056359-20056427)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (1-647)||(18856145-18856791)
chr4 (1-653)||(9228198-9228850)
chr4 (108-641)||(16627870-16628403)
chr4 (161-655)||(3791996-3792490)
chr4 (109-619)||(3778116-3778618)
chr4 (108-472)||(6742583-6742946)
chr4 (104-434)||(5143805-5144135)
chr4 (263-531)||(15316264-15316532)
chr4 (1-159)||(45347323-45347481)
chr4 (335-613)||(16638102-16638380)
chr4 (263-613)||(4569284-4569626)
chr4 (1-220)||(7124434-7124653)
chr4 (1-102)||(45356861-45356962)
chr4 (1-220)||(8395136-8395355)
chr4 (1-158)||(9223906-9224063)
chr4 (1-158)||(51520886-51521043)
chr4 (1-167)||(56141509-56141676)
chr4 (1-158)||(24742413-24742570)
chr4 (1-221)||(5137819-5138040)
chr4 (1-158)||(5733082-5733240)
chr4 (47-165)||(18860403-18860521)
chr4 (1-158)||(3814442-3814598)
chr4 (1-72)||(18712348-18712419)
chr4 (1-72)||(29761094-29761165)
chr4 (1-153)||(7122279-7122431)
chr4 (1-158)||(8392989-8393146)
chr4 (106-159)||(8689043-8689096)
chr4 (468-531)||(43708052-43708115)
chr4 (108-158)||(38151918-38151968)
chr4 (1-157)||(13992714-13992870)
chr4 (1-157)||(28467986-28468142)
chr4 (107-159)||(5148243-5148295)
chr4 (107-159)||(5268698-5268750)
chr4 (108-158)||(10047932-10047982)
chr4 (108-158)||(16622774-16622824)
chr4 (108-159)||(54867745-54867796)
chr4 (1-158)||(5135656-5135814)
chr4 (108-154)||(29761182-29761228)
chr4 (1-153)||(31495737-31495889)
chr4 (195-236)||(47566095-47566136)
chr4 (21-57)||(56141714-56141750)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (9-647)||(41391030-41391667)
chr1 (1-649)||(19360428-19361077)
chr1 (161-655)||(47702900-47703391)
chr1 (148-518)||(47101981-47102350)
chr1 (1-321)||(25444436-25444756)
chr1 (389-653)||(13599200-13599464)
chr1 (263-613)||(9525669-9526019)
chr1 (263-613)||(2393909-2394259)
chr1 (108-330)||(13598967-13599188)
chr1 (1-203)||(44023339-44023541)
chr1 (1-159)||(43987955-43988113)
chr1 (1-165)||(25439399-25439563)
chr1 (1-166)||(1054513-1054678)
chr1 (1-165)||(39445918-39446082)
chr1 (542-642)||(47101884-47101984)
chr1 (1-72)||(24786918-24786989)
chr1 (1-72)||(24793740-24793811)
chr1 (9-102)||(41398685-41398777)
chr1 (1-158)||(44203225-44203382)
chr1 (108-157)||(21536121-21536170)
chr1 (106-159)||(26644380-26644433)
chr1 (161-222)||(41360471-41360530)
chr1 (3-153)||(19365781-19365931)
chr1 (108-159)||(37070334-37070385)
chr1 (241-319)||(4650765-4650843)
chr1 (91-157)||(24202260-24202326)
chr1 (108-158)||(24793673-24793723)
chr1 (109-169)||(13604091-13604152)
chr1 (1-157)||(51764999-51765155)
chr1 (1-57)||(9986894-9986950)
chr1 (1-57)||(20622656-20622712)
chr1 (91-158)||(9036010-9036077)
chr1 (161-222)||(776791-776851)
chr1 (108-157)||(3282273-3282322)
chr1 (161-222)||(50167733-50167793)
chr1 (241-293)||(6483625-6483677)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (9-642)||(33036810-33037443)
chr8 (1-653)||(18869536-18870185)
chr8 (167-647)||(35741124-35741604)
chr8 (108-647)||(10688136-10688675)
chr8 (187-653)||(26297138-26297603)
chr8 (187-653)||(26310395-26310860)
chr8 (148-653)||(19751402-19751905)
chr8 (162-525)||(26402319-26402681)
chr8 (303-655)||(34586846-34587198)
chr8 (263-613)||(4813116-4813466)
chr8 (263-613)||(16753150-16753500)
chr8 (263-613)||(28331836-28332186)
chr8 (263-613)||(25683848-25684198)
chr8 (263-609)||(28894709-28895055)
chr8 (341-617)||(33494186-33494462)
chr8 (1-159)||(35745814-35745972)
chr8 (263-531)||(590100-590368)
chr8 (395-642)||(14602405-14602651)
chr8 (263-483)||(26268881-26269101)
chr8 (1-165)||(39784325-39784489)
chr8 (161-537)||(15948803-15949179)
chr8 (1-158)||(10683746-10683903)
chr8 (1-158)||(30656118-30656275)
chr8 (1-158)||(6311771-6311928)
chr8 (1-158)||(18852634-18852791)
chr8 (1-158)||(4759541-4759698)
chr8 (1-158)||(36979850-36980007)
chr8 (1-158)||(25327671-25327828)
chr8 (567-655)||(26402213-26402301)
chr8 (1-158)||(7289434-7289592)
chr8 (242-407)||(6367176-6367341)
chr8 (1-72)||(10688692-10688763)
chr8 (263-381)||(3275737-3275855)
chr8 (1-168)||(3439085-3439251)
chr8 (1-157)||(1261423-1261579)
chr8 (108-159)||(5701958-5702009)
chr8 (91-153)||(7412877-7412939)
chr8 (161-222)||(19492251-19492310)
chr8 (107-157)||(19175233-19175283)
chr8 (1-158)||(42575744-42575902)
chr8 (108-157)||(4456575-4456624)
chr8 (1-57)||(2627427-2627483)
chr8 (455-503)||(6367398-6367446)
chr8 (106-158)||(15290150-15290202)
chr8 (106-158)||(15470519-15470571)
chr8 (1-60)||(25689646-25689705)
chr8 (91-157)||(2627327-2627393)
chr8 (108-158)||(25689568-25689618)
chr8 (498-531)||(9024643-9024676)
chr8 (1-57)||(15290251-15290308)
chr8 (1-57)||(15470620-15470677)
chr8 (167-236)||(16753054-16753122)
chr8 (1-153)||(26288352-26288504)
chr8 (1-153)||(26301609-26301761)
chr8 (1-153)||(26313603-26313755)
chr8 (21-57)||(7289630-7289666)
chr8 (1-57)||(7412787-7412843)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (148-653)||(32757-33261)
[»] scaffold0006 (6 HSPs)
scaffold0006 (389-653)||(6485-6749)
scaffold0006 (389-653)||(6997-7261)
scaffold0006 (108-330)||(6252-6473)
scaffold0006 (261-330)||(6916-6985)
scaffold0006 (108-159)||(3060-3111)
scaffold0006 (109-169)||(132748-132809)
[»] scaffold1764 (1 HSPs)
scaffold1764 (263-613)||(660-1010)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-166)||(148443-148608)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-165)||(176450-176614)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-165)||(781-945)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (91-221)||(9233-9364)
scaffold0491 (1-157)||(11589-11744)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-193)||(4146-4338)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (1-158)||(3344-3501)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (1-57)||(34662-34718)
scaffold0135 (106-158)||(34561-34613)
[»] scaffold0665 (2 HSPs)
scaffold0665 (1-72)||(8128-8199)
scaffold0665 (108-158)||(8216-8266)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-158)||(3021-3178)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (91-165)||(1709-1783)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (504-613)||(998-1107)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (1-157)||(17440-17596)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-72)||(22033-22104)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (91-158)||(5866-5933)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (106-157)||(45744-45795)
scaffold0098 (1-57)||(45658-45714)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (106-159)||(36331-36384)
scaffold0087 (91-165)||(43434-43509)
scaffold0087 (1-57)||(43543-43599)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (1-57)||(1192-1248)
scaffold0510 (91-153)||(1096-1158)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (108-178)||(86153-86224)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (91-157)||(7920-7986)


Alignment Details
Target: scaffold0197 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 13948 - 13302
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13948 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctccctgatcgtgtcac 13849  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13848 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaagtcaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 13749  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 13649  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13648 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 13549  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13548 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 13449  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13448 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 13349  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13348 atttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 13302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 18828 - 18181
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  18828 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctctccgatcgtgtcac 18729  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18728 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 18629  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628 tcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 18529  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18528 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaat 18429  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18428 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 18329  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18328 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 18229  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18228 gatttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 18181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 24265841 - 24265195
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24265841 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctccctgatcgtgtcac 24265742  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24265741 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaagtcaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 24265642  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265641 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 24265542  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24265541 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 24265442  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265441 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 24265342  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265341 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 24265242  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24265241 atttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 24265195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 16880496 - 16881142
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16880496 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctcactgcctccctgatcgtgtcac 16880595  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16880596 gatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaagtcaattccaacatttctccaccttgacttctaaattggtggtgatgt 16880695  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880696 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaactactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 16880795  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16880796 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 16880895  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880896 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 16880995  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880996 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 16881095  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16881096 atttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 16881142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 647
Target Start/End: Original strand, 21640267 - 21640905
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtcacgactgca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||  | |  | |||||||||||   ||    
T  21640267 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgcca 21640365  T
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21640366 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagttta 21640465  T
Q  208 accatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttg 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21640466 accatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaatttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggcaatgacttg 21640565  T
Q  308 gtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21640566 gtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatgtcaatgt 21640665  T
Q  408 gctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640666 gctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 21640765  T
Q  508 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640766 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 21640865  T
Q  608 ttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21640866 ttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaac 21640905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 647
Target Start/End: Original strand, 12397418 - 12397970
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttg 190  Q
    ||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12397418 atcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcgcgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttg 12397517  T
Q  191 gtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttg 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397518 gtggtgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttg 12397617  T
Q  291 atcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtg 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12397618 atctaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtg 12397717  T
Q  391 caggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397718 caggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttga 12397817  T
Q  491 gtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccacca 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12397818 gtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgatatgtactccgcttgagttgtagataatgccacc- 12397916  T
Q  591 cggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12397917 ---attgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaac 12397970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 18409234 - 18409887
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  || ||||||  | ||||| ||  | |  | ||||||||    
T  18409234 acttaacaagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcatgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcaccacaaaatcgtgtca 18409332  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    |||   |||| |||||  |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18409333 cgatgccaaattcgtgttacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaagccaaatctcaacatttctctaccttgacttctaatttggtggtgat 18409432  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18409433 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggc 18409532  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  18409533 aataacttggtgaacacattcgccggattctcttccgatgccaccttttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctgacaaagtgcaagcgaa 18409632  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409633 tgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaattacactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 18409732  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18409733 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctctttcaccccttcaacaagggcaatgtactccgcttgagtggtagataatgcaaccacggattgt 18409832  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18409833 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 18409887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 655
Target Start/End: Original strand, 21983809 - 21984356
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||    
T  21983809 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatt-gttggtgatgttagttt 21983907  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21983908 aaccatcaaccaccttgctgctctctccaaaagggaattactcttcaacgaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgactt 21984007  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatg 406  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21984008 ggtaaacacatctgctggattctcttccgatgccattttttccaccacgatctcttttgattcaatcatgtctcttacaaagtgcaagcgaatgtcaatg 21984107  T
Q  407 tgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcac 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984108 tgctttgtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcac 21984207  T
Q  507 caatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgc 606  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21984208 caatcatacctttcaaccatatggcctctttcaccccttcaacaggggtaatatactccacttgagttgttgataatgccaccacagattgttgatttgc 21984307  T
Q  607 cttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  21984308 cttccaactaatagtcgtgccatagagagtaaacacaaaacccgataga 21984356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9189516 - 9189011
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  9189516 ttgaagtcaattacaacatttctccaccttgacttctaatt-gatgatgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgttgctctctccaatagggaattac 9189418  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  9189417 tcttcaacaaacttgatcaagttcaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgacttggtaaacacatccgccagattctcttccgatgccacttttt 9189318  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189317 ccaccataatctctctcgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtg 9189218  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcc 547  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  9189217 aatgacactttgactatcacactgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatacctttcaaccatatggcctctttcaccccttca 9189118  T
Q  548 acaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccacca-cggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaa 646  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9189117 acaagggcaatataatctgcttgagttgttgataatgccaccaccggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaa 9189018  T
Q  647 ctcgata 653  Q
    | |||||    
T  9189017 cccgata 9189011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 161 - 485
Target Start/End: Original strand, 20000330 - 20000654
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000330 caacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 20000429  T
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20000430 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgctggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctc 20000529  T
Q  361 ttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttga 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000530 ttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcagacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttga 20000629  T
Q  461 ctatcacaatgtatcttcacacatt 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  20000630 ctatcacaatgtatcctcacacatt 20000654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 200 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 24276198 - 24275878
Alignment:
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctcc-aaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  24276198 tcaatttaaccatcaaccaccttgctgttctctcccaaaagggaattactcttcaatgaacttgatgaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggt 24276099  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  24276098 aatgacttggtaaacacatccgtcggattctcttccgatgccactttttccaccacaatctcttttgattcaatcatgtctcttacaaagtgcaagcgaa 24275999  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275998 tgtcaatgtcctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatgtcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 24275899  T
Q  499 taactcaccaatcatcccttt 519  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24275898 taactcaccaatcataccttt 24275878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25404948 - 25404598
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25404948 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 25404849  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25404848 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 25404749  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  25404748 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 25404649  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  25404648 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 25404598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 3320678 - 3321028
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  3320678 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 3320777  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3320778 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttggcaaatgaatggcactttggct 3320877  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  3320878 atcacaatgtatattcacagatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 3320977  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    |||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  3320978 tccgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 3321028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7074342 - 7073992
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  7074342 atcaagtccaagcaatgcttgaactttgctcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 7074243  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||  ||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7074242 ttgtctcaatcatgtctcggacgaagtgcaaacgaatgtaaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 7074143  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  7074142 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagagctatgtat 7074043  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  7074042 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 7073992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25409705 - 25409355
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25409705 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctccaccatgatctcct 25409606  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||| | ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  25409605 ttgtctcaatcatgtcttttacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgattttccaaatgaatggcactttggct 25409506  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| | || || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| || |||| |    
T  25409505 atcacaatgcatcttcacacacccttgactgatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccgtgaccccttcaacaagggctatgtgc 25409406  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  25409405 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 25409355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 30246544 - 30246194
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  30246544 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 30246445  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  30246444 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgttaatgtgttttgttctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggaactttggct 30246345  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  30246344 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcataccttttaaccatatgacatccttgaccccttcaacaagggctatgtac 30246245  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  30246244 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 30246194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16885351 - 16885518
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16885351 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctcactgcctccctgatcgtgtcac 16885450  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacattt 168  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  16885451 gatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaagtcaattccaacattt 16885518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24260985 - 24260821
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24260985 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgctttcagattacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 24260886  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24260885 gatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattccaaca 24260821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21811903 - 21811738
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||| || || | |||||||||||    
T  21811903 acttaactagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacattgctcacggcatctcagatcgtgtcac 21811804  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacat 166  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  21811803 gatggcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatacaacat 21811738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6592757 - 6592976
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  6592757 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 6592856  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  6592857 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgc 6592956  T
Q  201 caatttaaccatcaaccacc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6592957 cactttaaccatcaaccacc 6592976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31109235 - 31109066
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || | |  | ||  |||||| |    
T  31109235 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttagcttacaggc-acttgaaatcgtgcc 31109137  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttc 169  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31109136 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatttcaacatttc 31109066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 515 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 24273909 - 24273769
Alignment:
Q  515 cctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaac 614  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273909 cctttcaaccatatggcctctttgaccccttcaacaagggaaatatactccgcttgagttgttgataatgccaccacggattgttgatttgccttccaac 24273810  T
Q  615 taatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  24273809 taatagttgtgccatagagagtaaacataaaacccgataga 24273769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 2058441 - 2058597
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  2058441 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcaaatcgtgtcac 2058539  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2058540 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 2058597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 12406693 - 12406850
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| | |||||| |||  | ||  ||||||||    
T  12406693 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcttgcaaac-tagctcacggcc-acttgaaatcgtgtc 12406790  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12406791 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 12406850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20357192 - 20357035
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  20357192 acttaacgagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 20357095  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20357094 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 20357035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 18390506 - 18390617
Alignment:
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaa 208  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  18390506 aatcgtggcacgatttccctgttcttctaaaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgccactttaa 18390605  T
Q  209 ccatcaaccacc 220  Q
    ||||||||||||    
T  18390606 ccatcaaccacc 18390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4873557 - 4873714
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |  || || |||  | ||  ||||||||    
T  4873557 acttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tatcttacggcc-acttgaaatcgtgtc 4873654  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4873655 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 4873714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24023983 - 24023830
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||| |||||  | ||  |||||| |    
T  24023983 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctctctgcc-acttgaaatcgtgcc 24023886  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagc 154  Q
    ||||   || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24023885 acgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagc 24023830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 456
Target Start/End: Original strand, 7393346 - 7393545
Alignment:
Q  257 aacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||| |||||||| | ||| ||  |||| |  | |||||||| ||| || |||| ||    
T  7393346 aacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctcgataatgatttggtgaatatatctgctagattatatttcgatgccagtttttctaccatga 7393445  T
Q  357 tctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcact 456  Q
    |||| ||||  |||| ||||||||||||| || |||  |||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || | |||||||||    
T  7393446 tctcctttgactcaaccatgtctctaacaaagggcaatcgaatgtcgacatgctttgtcctttcatggtaaacctgatgatttgctaaattaatggcact 7393545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18392616 - 18392773
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||  || |||| | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  18392616 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcacgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctccaatcgtgtcac 18392715  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18392716 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 18392773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24789591 - 24789439
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  24789591 acttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcaccctgcaaac-tagctcacggcaccacgaaatcgtgtca 24789493  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24789492 cgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 24789439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6594973 - 6595130
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  6594973 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 6595072  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  6595073 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgtttttccagaccacaaatttgaagacaat 6595130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 21646478 - 21646634
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  21646478 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacgaaatcgtgtca 21646576  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646577 cgatgccaaatttgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 21646634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 32060724 - 32060881
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  32060724 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 32060823  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  32060824 gataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 32060881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 12397341 - 12397385
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatc 45  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397341 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatc 12397385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 47264192 - 47264258
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47264192 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccacaaatttgaagccaa 47264258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39731098 - 39730942
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  39731098 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacaaaatcgtgtca 39731000  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39730999 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 39730942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48408563 - 48408407
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  48408563 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcgtgtca 48408465  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  48408464 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaa 48408407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1533068 - 1533012
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1533068 acttaacgagtaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 1533012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18414110 - 18414166
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18414110 acttaacaagcaagtttgagaatcgtgttacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 18414166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 79955 - 80005
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  79955 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaatcacaaatttgaagccaat 80005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 2479885 - 2479951
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2479885 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttacaaaccacaaatttgaagccaa 2479951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20343664 - 20343507
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| || ||| | |||||| || | ||   |||||||||    
T  20343664 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcatccggc-aacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 20343566  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   || ||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20343565 cgatgccacaatcgcgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 20343507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 43504556 - 43504709
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  43504556 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 43504654  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagc 154  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43504655 cgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagc 43504709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44847694 - 44847628
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  44847694 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttttaaaccacaaatttgaagccaa 44847628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1532958 - 1532893
Alignment:
Q  92 tcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1532958 tcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 1532893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Original strand, 21989473 - 21989522
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21989473 aaatcttgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 21989522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 25767381 - 25767437
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25767381 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgattt 25767437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Original strand, 1562513 - 1562580
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  1562513 atcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 1562580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 1562423 - 1562479
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  1562423 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttaccaaaatcgtgacacgattt 1562479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46515860 - 46515808
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttcc-aaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  46515860 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaaccataaatttgaagccaatt 46515808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 47264102 - 47264158
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  47264102 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacacaattgtgccacgattt 47264158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 8512663 - 8513309
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8512663 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctccctgatcgtgtcac 8512762  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512763 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaagtcaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 8512862  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512863 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactattcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 8512962  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8512963 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 8513062  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513063 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 8513162  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8513163 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacgaattgttg 8513262  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8513263 atttgccttccaactaatcgccgtgccatagagagtaaacacaaaac 8513309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 32475907 - 32476555
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475907 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgctttcagagaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 32476006  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat-tccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32476007 gatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaatcttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 32476106  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaa-gggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32476107 tcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 32476206  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32476207 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaa 32476306  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32476307 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 32476406  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32476407 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 32476506  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32476507 tgatttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 32476555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 2676738 - 2676092
Alignment:
Q  2 cttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||    
T  2676738 cttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcccgacatctccgatcgtgtcacg 2676639  T
Q  102 actgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa-ttccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2676638 attacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 2676539  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676538 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 2676439  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2676438 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgtttcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 2676339  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2676338 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatccttacacattcttgagtaattccta 2676239  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676238 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 2676139  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2676138 atttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtgaacacgaaac 2676092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 22172825 - 22172174
Alignment:
Q  2 cttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtcac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||  | |  | |||||||||    
T  22172825 cttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact-ggctcacggcacctcgaaatcgtgtcac 22172727  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22172726 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatat 22172627  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22172626 caatataaccatcaaccaccatgctgttctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggcaa 22172527  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172526 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 22172427  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172426 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 22172327  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22172326 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagcgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacagattgttg 22172227  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22172226 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 22172174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 1306439 - 1307092
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| | | ||  ||  |||||||    
T  1306439 acttaacgagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcac-gacaccacgaaatcgtgtc 1306536  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtga 197  Q
    ||||   |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1306537 acgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccataaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtga 1306636  T
Q  198 tgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgagg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1306637 tgtcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccagaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctagg 1306736  T
Q  298 caatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1306737 caatgacttggtgaacacatccgccggattctcttccgatgccaccttttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcga 1306836  T
Q  398 atgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattc 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306837 atgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattc 1306936  T
Q  498 ctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattg 597  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1306937 ctaactcaccaatcatctctttcaaccatatggcctctttcaccccttcaacaagggcaatgtactccgcttgagtggtagataatgcaaccacgaattg 1307036  T
Q  598 ttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1307037 ttgatttgccttccaactaatagtcgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 1307092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 155 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 6794230 - 6793732
Alignment:
Q  155 caattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcga 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6794230 caattacaacatttctccaccttgacttctaatgtggtgatgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcaa 6794131  T
Q  255 caaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccac 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  6794130 caaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgacttggtaaacacattcgccggattctcttccgatgccactttttccaccac 6794031  T
Q  355 gatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggca 454  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  6794030 aatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacactttatgattcgccaagtgaatgaca 6793931  T
Q  455 ctttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtg 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  6793930 ctttgactatcacaatgtatcttcacacattcttaagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaacaatatggcctctttcactccttcaacaagtg 6793831  T
Q  555 cgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  6793830 caatgtacttcgcttgagtggtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccttgtcataaagagtaaacacaaaacccgata 6793732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 3327859 - 3327354
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3327859 ttgaagtcaatttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctcttcaaaagggaattac 3327760  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3327759 tcttcaacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggtaattacttggttaacacatccgccggattctcttccgatgccacttttt 3327660  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3327659 ctaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagaaaatgtgaatgtgcttagtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtg 3327560  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcc 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  3327559 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcattcctttcaaccatatggcctctttcattccttca 3327460  T
Q  548 acaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3327459 acaagagcaatgtactccgcttgagtggtagataataccaccacagattttttatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaac 3327360  T
Q  648 tcgata 653  Q
     |||||    
T  3327359 ccgata 3327354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28503483 - 28503191
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| || |||  |||||||    
T  28503483 acttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtccagcaaactag-ctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 28503386  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28503385 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 28503286  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatc 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503285 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatc 28503191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 161 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 4386505 - 4386208
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 260  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  4386505 caacatttctccaccttgact-ctaaattggtgatgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgattctctctccaatagggaattactcttcaacaaaat 4386407  T
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctc 360  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4386406 tgaccaagtccaagcaattcttgaaccttgatctaggtaatgacttagtgaacacatccgccagattctctttcgatgcaactttctccaccacaatctc 4386307  T
Q  361 ttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttg 459  Q
    ||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4386306 tttcgattcaatcatgtctttcacaaagtgcaagcgaatgtcaatgggctttatcctctaatgatacacttgatgattcgccaagtggatggcactttg 4386208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 10201582 - 10201932
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  10201582 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 10201681  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10201682 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgtcaaatgaatggcactttggct 10201781  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  10201782 atcacaatgtatcctcacacatccttgaataatccccaattctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 10201881  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  10201882 tctgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgccttccaa 10201932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 10094696 - 10095046
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  10094696 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 10094795  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10094796 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgtcaaatgaatggcactttggct 10094895  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  10094896 atcacaatgtatcttcatacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 10094995  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  10094996 tctgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgccttccaa 10095046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 47878779 - 47879129
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  47878779 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 47878878  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  47878879 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 47878978  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  47878979 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 47879078  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  47879079 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 47879129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 54192799 - 54192449
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||| |    
T  54192799 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctatcatgatctcct 54192700  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  54192699 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 54192600  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  54192599 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaattcccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 54192500  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  54192499 tctgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgccttccaa 54192449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16461755 - 16461405
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  16461755 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 16461656  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16461655 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgtaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcaagatacaccagatgatttgccaaatgaatggcactttggct 16461556  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || | |||     
T  16461555 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctacgtat 16461456  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    |||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  16461455 tccgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgccttccaa 16461405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 8517543 - 8517707
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8517543 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctccctgatcgtgtcac 8517642  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  8517643 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcctaaaccactaatttgaagtcaattccaaca 8517707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 24968540 - 24968704
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24968540 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccccgatcgtgtcac 24968639  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  24968640 gattgccaaatcgtgacacgattcctttgttcttccaaaccactaatttgaagtcaattccaaca 24968704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 263 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10901300 - 10900953
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  10901300 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattttcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 10901201  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  10901200 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgattttccaaatgaatggcactttggct 10901101  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  10901100 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacatttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 10901001  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttc 610  Q
    ||  |||||||||| || |  |  || || ||||||||||||||||||    
T  10901000 tctacttgagttgttgaaagggttacaactgattgttgatttgccttc 10900953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 364
Target Start/End: Original strand, 37466880 - 37467095
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37466880 ttgaagtcaatttcaacatttctccaccttgacttctaatt-ggtgatgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattac 37466978  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |    
T  37466979 tcttcaacaaatttgatcaagtccaaacaatgcttgaaccttgatctcggtaatgacttggtaaacacatctgccggattctcttccgatactacttttt 37467078  T
Q  348 caaccacgatctctttt 364  Q
    | ||||| |||||||||    
T  37467079 ccaccacaatctctttt 37467095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 10595638 - 10595988
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  |   | ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  10595638 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtttactggattttcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 10595737  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10595738 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgttctttcatgatatacctaatgatttgccaaatgaatggcactttggct 10595837  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||| ||| ||||||| |||    |||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  10595838 atcataatatatcttcgcacgcctttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 10595937  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  10595938 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 10595988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 32480765 - 32480922
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480765 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgctttcagagaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 32480864  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32480865 gatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaat 32480922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2672583 - 2672418
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||||    
T  2672583 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcccggcatctccgatcgtgtcac 2672484  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagcc-aattccaaca 165  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2672483 gattacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaattccaaca 2672418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4598942 - 4599162
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttccca-agatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||     
T  4598942 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcg 4599041  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4599042 cgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 4599141  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacc 220  Q
     || |||||||||||||||||    
T  4599142 ccactttaaccatcaaccacc 4599162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 23198455 - 23198586
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaattt 189  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23198455 atcgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttctaattt 23198554  T
Q  190 ggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198555 gttggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 23198586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40372420 - 40372263
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  40372420 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 40372322  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40372321 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 40372263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10058192 - 10057971
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10058192 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10058093  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10058092 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10057993  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  10057992 ccactttaaccatcaaccacca 10057971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10060414 - 10060193
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10060414 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10060315  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10060314 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10060215  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  10060214 ccactttaaccatcaaccacca 10060193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10062636 - 10062415
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10062636 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10062537  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10062536 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10062437  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  10062436 ccactttaaccatcaaccacca 10062415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10064858 - 10064637
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10064858 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10064759  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10064758 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10064659  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  10064658 ccactttaaccatcaaccacca 10064637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10067080 - 10066859
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10067080 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10066981  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10066980 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10066881  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  10066880 ccactttaaccatcaaccacca 10066859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10211143 - 10210923
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10211143 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcatgattttcccaaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatcctaaatcgcgtca 10211044  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10211043 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttaaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 10210944  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacc 220  Q
     || |||||||||||||||||    
T  10210943 ccactttaaccatcaaccacc 10210923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 8477838 - 8477995
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  8477838 acttaacgagcaagtttctcaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcatccagcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 8477936  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8477937 cgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 8477995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18656864 - 18657022
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||  |||| || |  |   |||||||||    
T  18656864 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttcacggcaccacgaaatcgtgtca 18656963  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18656964 cgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaat 18657022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6718345 - 6718232
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  6718345 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgccacttta 6718246  T
Q  208 accatcaaccacca 221  Q
    ||||||||||||||    
T  6718245 accatcaaccacca 6718232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 7167718 - 7167875
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  || |||||    
T  7167718 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaattgtgtc 7167815  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  7167816 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaagccaat 7167875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28501316 - 28501159
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  28501316 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggtgtcctgcaaac-tagctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 28501219  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28501218 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaagccaat 28501159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 36029658 - 36029755
Alignment:
Q  107 aaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat-tccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaat 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36029658 aaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatatacaaca-ttctccaccttaacttctaatttggtggtgatgtcaat 36029755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8738687 - 8738616
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  8738687 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttagcgtcctgcaaact 8738616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9090925 - 9090854
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9090925 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttagcgtcctgcaaact 9090854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2671229 - 2671158
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2671229 acttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcatcctgcaaact 2671158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27352243 - 27352189
Alignment:
Q  3 ttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27352243 ttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 27352189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37408111 - 37407988
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaattt 189  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  37408111 atcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttc-aaatt 37408013  T
Q  190 ggtggtgatgtcaatttaaccatca 214  Q
    | || ||||| || |||||||||||    
T  37408012 gatgatgatgccactttaaccatca 37407988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39989292 - 39989192
Alignment:
Q  397 aatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaatt 496  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| |||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39989292 aatgccaatgtgctttttcctttcataatacaccagatgattttccaaataaacgagactttgactatcacattgtatcttcacacatccttgagtaatt 39989193  T
Q  497 c 497  Q
    |    
T  39989192 c 39989192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 54634874 - 54634704
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || || ||||| |||||| || | ||   |||||||||    
T  54634874 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattttgcaccctgc-aacttagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 54634776  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctc 171  Q
    | |   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||| |||||    
T  54634775 caatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacacttctc 54634704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4601163 - 4601321
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttccca-agatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||     
T  4601163 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcg 4601262  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4601263 cgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 4601321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 21711768 - 21711819
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21711768 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 21711819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27974493 - 27974442
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27974493 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 27974442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30709316 - 30709266
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30709316 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaat 30709266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 37726224 - 37726290
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37726224 atcgtgtcacgatatcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 37726290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29812661 - 29812586
Alignment:
Q  145 aaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29812661 aaattgaaggcaaatacaacatttctccaccttgacttc-aaattgatgatgatgtcactttaaccatcaaccacca 29812586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 27038608 - 27038659
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27038608 aaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaacttgaagccaatt 27038659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39032075 - 39032024
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39032075 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaagccaatt 39032024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1730957 - 1730915
Alignment:
Q  117 cacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1730957 cacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 1730915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6716249 - 6716104
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || || ||| | |||||| || | ||   |||||||||    
T  6716249 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcaccctgc-aacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 6716151  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaa 146  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6716150 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaa 6716104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 16264896 - 16264946
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16264896 aaatcgtgtcacgatttcgctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaat 16264946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 23200654 - 23200720
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23200654 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 23200720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26928155 - 26928089
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26928155 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 26928089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3617198 - 3617041
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  3617198 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgacacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 3617099  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  3617098 gataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 3617041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10055970 - 10055817
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  10055970 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 10055871  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10055870 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaag 10055817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Original strand, 27027273 - 27027318
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27027273 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 27027318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40734132 - 40734087
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40734132 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 40734087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10208941 - 10208785
Alignment:
Q  3 ttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacg 101  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||||    
T  10208941 ttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtcacg 10208842  T
Q  102 actgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |   |||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10208841 ataccaaaatcgtgtcatgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 10208785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25637177 - 25637121
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25637177 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattt 25637121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6718433 - 6718374
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgc 60  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  6718433 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgc 6718374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 25512249 - 25512162
Alignment:
Q  443 aagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatgg 530  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||    
T  25512249 aagtgaataacactttgactatatgaatgtatcttcacacactcttgagaaatttctagctcattaatcatccatttcatcaatatgg 25512162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40592302 - 40592251
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40592302 aaatcatgtcacgatttctccgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 40592251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8738599 - 8738549
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8738599 aaatcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 8738549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9090837 - 9090787
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9090837 aaatcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 9090787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27986017 - 27985971
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaa 152  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27986017 caaaatcgtgtcacgatttctctgttattccaaaccacaaatttgaa 27985971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 35926057 - 35926106
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35926057 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacc-caaatttgaagccaat 35926106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 48438782 - 48438832
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  48438782 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttacaaaccacaaatttaaagccaat 48438832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33386302 - 33386146
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  33386302 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcgtgtca 33386204  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  33386203 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcggaccacaaatttgaagccaa 33386146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40735063 - 40734952
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||||| |||||||||||| |||| || ||| || ||||| || ||||    
T  40735063 aaatcgtgtcacgatttatctgttcatccaaaccacaaatttgaagacatacacaaca-ttctccaccttgacttc-aaattgatgatgatgccacttta 40734966  T
Q  208 accatcaaccacca 221  Q
    |||||||| |||||    
T  40734965 accatcaatcacca 40734952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 800850 - 800794
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  800850 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgattt 800794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28503557 - 28503521
Alignment:
Q  21 aatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28503557 aatcgtgccacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 28503521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 32143782 - 32143838
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  32143782 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaagatcgtgtcacgattt 32143838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 575; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 1903 - 1257
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1903 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccccgatcgtgtcac 1804  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1803 gattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaagtcaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 1704  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1703 caatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattacttttcgacaaaattgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 1604  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1603 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttttcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 1504  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1503 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcctcacacattcttgagtaattccta 1404  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1403 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtggataatgccaccacggattgttg 1304  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1303 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagtgtaaacacaaaac 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 33335594 - 33334948
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  33335594 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 33335495  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33335494 gattgccaaatcgcgaaacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 33335395  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335394 tcaatataaccatcaaccaccatgctgctctctccaaa-gggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 33335296  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33335295 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctctgatgccactttctcaaccacaatctcttttgcttcaatcatgtctctgacaaagtgcaggcgaat 33335196  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335195 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 33335096  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335095 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 33334996  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33334995 gatttgccttccaactaatcgctgtgccataaagagtaaacacaaaac 33334948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 14742090 - 14741443
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||  || |  |||  |||||||    
T  14742090 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacgaccact-tgaaatcgtgtc 14741993  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14741992 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 14741893  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14741892 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggc 14741793  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgc-ttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14741792 aatgacttggtgaacacatccgccgaattatcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgtattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcga 14741693  T
Q  398 atgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattc 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14741692 atgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcctcacacattcttgagtaattc 14741593  T
Q  498 ctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14741592 ctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattg 14741493  T
Q  598 ttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14741492 ttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaac 14741443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 241 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 24435351 - 24434939
Alignment:
Q  241 gaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgcc 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||    
T  24435351 gaattactcttcaacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggtaatgacttggtaaacatatccgccggactttcttccgatgcc 24435252  T
Q  341 actttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttg 440  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||      
T  24435251 actttttccaccacaatctcttttgattcaatcatgtttctatcaaagttaaagcgaatgtcaatgtgcttagtcctctcatgatgcacttgatgattct 24435152  T
Q  441 ccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcac 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24435151 ccaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcttcacacattctcgagtaattcctaactcaccaatcattcctttcaactatatggcctctttcac 24435052  T
Q  541 accttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaac 640  Q
     | ||  ||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24435051 ccttttaacaagggcaatgtactccgcttggattgtaggtaatgccaccacgaattgttgatttgccttccaactaatagttgtgccataaagagtaaac 24434952  T
Q  641 accaaactcgata 653  Q
    || |||| |||||    
T  24434951 acaaaacccgata 24434939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13883030 - 13882680
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  13883030 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 13882931  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13882930 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 13882831  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  13882830 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 13882731  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  13882730 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 13882680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 35201953 - 35202303
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  35201953 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 35202052  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35202053 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 35202152  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  35202153 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 35202252  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  35202253 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 35202303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 263 - 576
Target Start/End: Original strand, 31249341 - 31249654
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  31249341 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 31249440  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31249441 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 31249540  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || |||||     
T  31249541 atcacaatgtatcttcacacatccttgaataatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttaaacaagggctatgtat 31249640  T
Q  563 tccgcttgagttgt 576  Q
    ||||||||||||||    
T  31249641 tccgcttgagttgt 31249654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 11857403 - 11857660
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||| |  |||  |||||||    
T  11857403 acttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacggccact-tgaaatcgtgtc 11857500  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11857501 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 11857600  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaa 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857601 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaa 11857660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 16839166 - 16839324
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  16839166 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 16839265  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16839266 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 16839324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33330097 - 33329939
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  33330097 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 33329998  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33329997 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 33329939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 6005842 - 6006000
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||||||||||    
T  6005842 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcatggcatctccgatcgtgtcac 6005941  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6005942 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaatt 6006000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 22344890 - 22345240
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  22344890 atcaagtccatgcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattttcttccgttgccactttctccaccatgatctcct 22344989  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  22344990 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaatgaatgtcaatgtgttttgttctttcatgatatacctgatgatttgacaaatgaatgacactttggct 22345089  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||    || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  | ||||||    
T  22345090 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccgtttctccaatcatacatttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaaggactatgtac 22345189  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  22345190 tctgcttgagttgttgaaagagctacaacagattgttgatttgccttccaa 22345240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5343900 - 5344064
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5343900 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgctttcagaagacttggctcacttcctccctgatcgtgtcac 5343999  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    ||   | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5344000 gatgaccaaatcgtgacacgatttctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattccaaca 5344064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 641
Target Start/End: Original strand, 99789 - 100239
Alignment:
Q  191 gtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttg 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||  | ||| | ||||||| ||||| || ||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  99789 gtggtgatgtcaatttaacaatcaatcgccttgctgctccttgcaatatggaattaatcttcaacgaaactgatcgagttcaagcattgcttgaaccttg 99888  T
Q  291 atcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtg 390  Q
    |||  |||||||||||||||||||||   | |  ||| |  || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||    
T  99889 atctgggcaatgacttggtgaacacaaatgtcatattttattcggatgcaactttatcaaccataatctcttatgattcaatcatgtatttaataaagtg 99988  T
Q  391 caggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttga 490  Q
    || || || ||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||   ||||| | || ||||||| |||| |||||    
T  99989 caagcaaacgtcaatgtgttttatcctcacatgatacgcttgatgattcgccaaatggatgacacttttgttatcatagtgcatcttcatacatacttga 100088  T
Q  491 gtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccacca 590  Q
    |||| | ||| |||||||||  |   ||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||     
T  100089 gtaacttctagctcaccaattgtatatttcaaccatatggattccttcattcgttcaacaagggcaatgtactctgcttgagttgtaaataaagccaccg 100188  T
Q  591 cggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaaca 641  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||    
T  100189 tggattgttgatctgccttccaactaataatcgtgtcatagagagaaaaca 100239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 6438919 - 6439083
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||    
T  6438919 acttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattatgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcac 6439018  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || | |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  6439019 gattccaaaatcgtgtcacgatttctatgttcttccagaccataaatttgaagccaatttcaaca 6439083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30517543 - 30517337
Alignment:
Q  260 ttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatct 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| ||||    
T  30517543 ttgatcatgtccaagcaatgcttgaaccttgatctagataatgacttagtgaacacatccgccggattttttgccgctacaactttctcaaccacaatct 30517444  T
Q  360 cttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttg 459  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| | | ||  |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  30517443 ctttttatacaatcatgtctctaacaaaatacaaacgaatgtcaacgtgctttgttctcttatgatacacttgatgattcaccaaatgaatgacactttg 30517344  T
Q  460 actatca 466  Q
     ||||||    
T  30517343 gctatca 30517337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 567 - 653
Target Start/End: Original strand, 24713928 - 24714014
Alignment:
Q  567 cttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24713928 cttgtgttgtagataatgtcaccacggattgttgatttgccttccaactaatagtcgtgccataaagagtaaacacaaaactcgata 24714014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28155235 - 28155134
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  28155235 acttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacttggctcacggcatctcagatcgtgtcac 28155136  T
Q  101 ga 102  Q
    ||    
T  28155135 ga 28155134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34166831 - 34166610
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  34166831 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 34166732  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34166731 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 34166632  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  34166631 ccactttaaccatcaaccacca 34166610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30125182 - 30125025
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  30125182 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 30125084  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30125083 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 30125025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22010353 - 22010196
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |  || || |||  | ||  ||||||||    
T  22010353 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-taacttacggcc-acttgaaatcgtgtc 22010256  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22010255 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 22010196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 494 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 30517337 - 30517199
Alignment:
Q  494 attcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacgg 593  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||      
T  30517337 attcctaactcacca-tcatacctttcaacaacatggcttcctttaccccttcaacaagtgtaatgcactccacttaagttgtagatagagccaccacaa 30517239  T
Q  594 attgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaag 633  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30517238 attgttgatttgctttccaactaatagccgtgccataaag 30517199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16554528 - 16554398
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttg 190  Q
    ||||||||||||   ||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16554528 atcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttg 16554429  T
Q  191 gtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16554428 gcgatgatgccactttaaccatcaaccacca 16554398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16631084 - 16630954
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttg 190  Q
    ||||||||||||   ||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16631084 atcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttg 16630985  T
Q  191 gtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16630984 gcgatgatgccactttaaccatcaaccacca 16630954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6136383 - 6136540
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    || |||| | | |||||| || |||   |||||||| |    
T  6136383 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattttcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtctc 6136482  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6136483 gattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 6136540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16652773 - 16652660
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  16652773 aaatcgtgtcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttcaaatttggtgatgatgccacttta 16652674  T
Q  208 accatcaaccacca 221  Q
    ||||||||||||||    
T  16652673 accatcaaccacca 16652660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 5266516 - 5266579
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  5266516 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 5266579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14737230 - 14737159
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14737230 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 14737159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24435465 - 24435380
Alignment:
Q  146 aattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctc 233  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24435465 aattgaagtcaaatacaacatt-ctccaccttgacttataatt-ggtgatgatgtcaatataaccatcaaccaccatgctgctctctc 24435380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16578937 - 16579094
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  || || ||| | |||||| || | ||   |||||||||    
T  16578937 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgattttgcaccctgc-aacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 16579035  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  16579036 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 16579094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16616443 - 16616286
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  || |||| || | ||||| ||  |||  | ||||||||    
T  16616443 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtca 16616345  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  16616344 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 16616286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5674394 - 5674238
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   ||| |||||    
T  5674394 acttaacgagcaagtttcaaaatcgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcatgtca 5674296  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5674295 cgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 5674238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 2171939 - 2171995
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2171939 acttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 2171995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6026998 - 6026942
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  6026998 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgattt 6026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22709480 - 22709536
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22709480 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 22709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5017026 - 5016975
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5017026 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 5016975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31086003 - 31085952
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31086003 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttctaaaccacaaatttgaagccaatt 31085952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 5266596 - 5266646
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5266596 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 5266646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14737142 - 14737092
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14737142 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 14737092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 33342523 - 33342681
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttccca-agatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   |||| |||     
T  33342523 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgcgtcg 33342622  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33342623 cgatcccaaaatcgtgtcacgatttccatgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 33342681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27647632 - 27647480
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  || || ||| | |||||| || | ||   |||||||||    
T  27647632 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttctcacaatcgtgccacgattttgcaccctgc-aacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 27647534  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   || ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27647533 cgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 27647480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5757116 - 5757060
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5757116 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgattt 5757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23896792 - 23896848
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  23896792 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgattt 23896848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 24714938 - 24714990
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaa-ttgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24714938 aaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaaatttgaagccaatt 24714990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28155130 - 28155090
Alignment:
Q  125 ctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28155130 ctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaattccaaca 28155090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 153
Target Start/End: Original strand, 23896882 - 23896944
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23896882 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaag 23896944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11138144 - 11138091
Alignment:
Q  182 tctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctcca 235  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11138144 tctaaatttgtgatgatgtcaatttaaccatcaaccaccttgttgctctctcca 11138091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13151014 - 13150957
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13151014 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt 13150957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16568649 - 16568577
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16568649 ttgaaggcagtttcaacatttctccgccttgacttctaa-ttggtgatgatgccactttaaccgtcaaccacca 16568577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25420961 - 25420804
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  25420961 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 25420862  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  25420861 ggtcccaaaattgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 25420804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34164609 - 34164552
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34164609 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgacacgattt 34164552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17759320 - 17759257
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgct 225  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17759320 caacaattctccaccttgact-ctaaatttgtgttgatgccaatttaaccatcaaccaccttgct 17759257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 33768607 - 33769254
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  33768607 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 33768706  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33768707 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 33768806  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768807 tcaatttaaccatcaaccactatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 33768906  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33768907 atgacttggtgaacacatcctccagattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgtttcaatcatgtctctgacaaagtgcaggcgaat 33769006  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33769007 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttggctatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 33769106  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33769107 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgtgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 33769206  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33769207 gatttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 33769254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 31401511 - 31400864
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  31401511 acttaagcagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctctccgatcgtgtcac 31401412  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31401411 gattgccaaatcgtgacacgattcctctattctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 31401312  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401311 tcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaaattgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 31401212  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31401211 atgacttggtgaacacatccgccggattttcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaat 31401112  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31401111 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgctaagtgaatggcactttgactatcacaatgcatcctcacacattcttgagtaattcct 31401012  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31401011 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacagattgtt 31400912  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31400911 gatttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 31400864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 28807240 - 28806594
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  28807240 acttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacttggctcacggcatctcagatcgtgtcac 28807141  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28807140 gattgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccataaatttgaagccaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 28807041  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807040 cagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaatggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 28806941  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28806940 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttttcaaccacgatctctttggtttcaatcatgtcactgacaaagtgcaggcgaatg 28806841  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28806840 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 28806741  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28806740 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatatactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 28806641  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28806640 atttgccttccaactaatcgccgtgccatagagagtaaacacaaaac 28806594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 37561111 - 37560465
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa-cttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| || || | ||||||||||    
T  37561111 acttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt-gcctccatcaaaacttggctcacggcatctcagatcgtgtca 37561013  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    ||| |   |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37561012 cgattatcaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaattcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 37560913  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560912 tcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 37560813  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37560812 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgtttcaatcatgtctctgacaaagtgcaggcgaat 37560713  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560712 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgattttccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 37560613  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560612 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcaatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 37560513  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37560512 gatttgccttccaactaatcgtcgtgccataaagagtaaacacaaaac 37560465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 43592708 - 43593342
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||| || |||             
T  43592708 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacggcccccttga--------- 43592797  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
            ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43592798 --------aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 43592889  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43592890 cagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggcaa 43592989  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43592990 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatg 43593089  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43593090 tcgatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 43593189  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43593190 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 43593289  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43593290 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 43593342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 27445402 - 27446044
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||| || |||  |||||||    
T  27445402 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 27445499  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27445500 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttctagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 27445599  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27445600 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggc 27445699  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27445700 aatgacttggggaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaa 27445799  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  27445800 tgtcgatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgaattgccaagtgaatggcactttgac----------tatcttcacacattcttgagtaattcc 27445889  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445890 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 27445989  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27445990 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 27446044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 125 - 653
Target Start/End: Original strand, 43625608 - 43626136
Alignment:
Q  125 ctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgc 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43625608 ctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgc 43625707  T
Q  225 tactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccgg 324  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43625708 tgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggcaatgacttggtgaacacatccgccgg 43625807  T
Q  325 attctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatga 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43625808 attctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatgtcgatgtgctttgtcctttcatga 43625907  T
Q  425 tacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaacc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43625908 tacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaacc 43626007  T
Q  525 atatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgt 624  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43626008 atatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgt 43626107  T
Q  625 gccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43626108 gccataaagagtaaacacaaaacccgata 43626136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 649
Target Start/End: Original strand, 28832776 - 28833276
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| | ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28832776 ttgaagtcaatttcaacatttctccaccttgacttctaatt-ggtgataatgttagtttaaccattagccaccatgccgctctctccaaaagggaattac 28832874  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  28832875 tcttcaacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgaattggtaaacacatccgccagattctcttccgatgccacttttt 28832974  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28832975 ccaccacaatctcttttgattcaatcatgtctcgaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtg 28833074  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcc 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  28833075 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcattcctttcaaccacatggcctctttcactccttca 28833174  T
Q  548 acaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28833175 acaagtgcaatgtactccgcttgagtggtagataatgtcaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgttccataaagagtaaacacaaaac 28833274  T
Q  648 tc 649  Q
    ||    
T  28833275 tc 28833276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 187 - 597
Target Start/End: Original strand, 19589048 - 19589466
Alignment:
Q  187 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19589048 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcagccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcatcaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaac 19589147  T
Q  287 cttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctc----aaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctcta 382  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19589148 cttgatctaggaaatgacttggtaaacacatccgccggattctctttcaatgccactttttccacgcaccacaatctcttttgattcaatcatgtctcta 19589247  T
Q  383 acatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgcc----aagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttc 478  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19589248 acaaagtgcaagtgaatgtcaatgtgcttagtcccctcatgatacacttgatgattagccaattaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcttc 19589347  T
Q  479 acacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtag 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| || |||||||||| |    
T  19589348 acacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatacctttcaaccatatggcctctttcaccccttcaacaagggaaatgtacgccccttgagttgttg 19589447  T
Q  579 ataatgccaccacggattg 597  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19589448 ataatgccaccacggattg 19589466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25452048 - 25451698
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25452048 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 25451949  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25451948 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 25451849  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| |||| || |  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  25451848 atcacaatgtatcttcaaacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaatcatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 25451749  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  25451748 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 25451698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 2785798 - 2785956
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  2785798 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 2785897  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2785898 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 2785956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 33791739 - 33791897
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  33791739 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 33791838  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33791839 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 33791897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 263 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40222317 - 40222016
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  40222317 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattttcttccgttgccactttctccaccatgatctcct 40222218  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40222217 ttgtctcaatcatgtctctgacgaaatgcaaacgaatgtcaatgtgttttgttctttcatgatatacctgatgatttgtcaaatgaatggcactttgact 40222118  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  40222117 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 40222018  T
Q  563 tc 564  Q
    ||    
T  40222017 tc 40222016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31396654 - 31396496
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  31396654 acttaaccaacaagtgtctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctctccgatcgtgtcac 31396555  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31396554 gattgccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaatt 31396496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 167 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22828779 - 22828311
Alignment:
Q  167 ttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatca 266  Q
    |||||||||||| || |||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||  |  |||||||||||| ||||| || || |    
T  22828779 ttctccaccttgact-ctaaattggcgataatgttaatttaaccatcaaccaccttgttgctctctccattaaagaattactcttcaacaaaatttatta 22828681  T
Q  267 agtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgc 366  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||  |||||||| |||| || ||| || | | |||||||||||| ||||||||       
T  22828680 agtccaaaaaatgcttgaacgttgatctcggcaatgactcagtgaatgcatccgccagattttcttccaatacaattttctcaaccacaatctctttaaa 22828581  T
Q  367 ttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatca 466  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||   |||||    
T  22828580 ttcaatcatgtctctaacaatgtgcaggtgaatgtcaatgtcctctatcctctcatgatacacttgatgattcaccaaatggaggacactttacatatca 22828481  T
Q  467 caatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccg 566  Q
    |||| ||||   |||| | ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||| | ||| || |||||| |      
T  22828480 caatatatcagtacacttactgtaataattcttaactcaccaatcatacctttcaaccatatgg----cttcaccccttcaagaagggcaatgtacgctt 22828385  T
Q  567 cttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaac 640  Q
    |||||||||||| ||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| | |||||||    
T  22828384 cttgagttgtaggtagatccatcacgggttgttgatttaccttccagctaatagttgtgccatataaagtaaac 22828311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 15045124 - 15045272
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacgactgcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| || || |  |||||||||||| | |||    
T  15045124 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tggctcacggcatctcaaatcgtgtcacgattccaa 15045222  T
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15045223 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaagccaat 15045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 43599153 - 43599311
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  43599153 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcccccttgaaatcgtgtc 43599251  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43599252 acgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 43599311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 43604645 - 43604803
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  43604645 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcccccttgaaatcgtgtc 43604743  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43604744 acgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 43604803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 43610137 - 43610295
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  43610137 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcccccttgaaatcgtgtc 43610235  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43610236 acgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 43610295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16546380 - 16546161
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||  || |||| | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  16546380 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcacgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctccaatcgtgtcac 16546281  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  16546280 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgc 16546181  T
Q  201 caatttaaccatcaaccacc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16546180 cactttaaccatcaaccacc 16546161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37556289 - 37556133
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa-cttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| || || | ||||||||||    
T  37556289 acttaaccagcaagtttctagatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgccacgattt-gcctccatcaaaacttggctcacggcatctcagatcgtgtca 37556191  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37556190 cgattaccaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 37556133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 27450245 - 27450402
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  27450245 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 27450342  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27450343 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 27450402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16409152 - 16409021
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaattt 189  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16409152 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttctaattt 16409053  T
Q  190 ggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16409052 ggtggtgatgtcactttaaccatcaaccacca 16409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40382053 - 40381834
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||  || |||| | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  40382053 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcacgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctccaatcgtgtcac 40381954  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || | |||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  40381953 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgc 40381854  T
Q  201 caatttaaccatcaaccacc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  40381853 cactttaaccatcaaccacc 40381834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1456802 - 1456645
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  1456802 acttaacaagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgtaaac-tagctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 1456705  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1456704 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 1456645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26177631 - 26177430
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  26177631 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccatgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacgaaatcgtgtca 26177533  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26177532 cgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 26177433  T
Q  199 gtc 201  Q
    |||    
T  26177432 gtc 26177430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 30631784 - 30631941
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| || |  |   |||||||||    
T  30631784 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaac-tggctcacggcacctcgaaatcgtgtca 30631882  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30631883 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 30631941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29402714 - 29402557
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||| || |  | ||  |||||| |    
T  29402714 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctca-tggccacttgaaatcgtgcc 29402617  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29402616 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 29402557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29722227 - 29722096
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaattt 189  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29722227 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacatttctccaccttgacttctaattt 29722128  T
Q  190 ggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29722127 ggtgatgatgccactttaaccatcaaccacca 29722096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 31180685 - 31180756
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31180685 acttaacgagaaagtctctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 31180756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16544158 - 16544001
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||  || | || | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  16544158 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcacgaatttgcaccctgtaaccctagctcacagcacctccaatcgtgtcac 16544059  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16544058 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 16544001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40379842 - 40379685
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||  || |||| | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  40379842 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcacgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctccaatcgtgtcac 40379743  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || | |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  40379742 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 40379685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3885918 - 3885668
Alignment:
Q  359 tcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcacttt 458  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||  | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |  || || |||| ||||     
T  3885918 tcttttgattaaatcacgtctttaacaaagtgcaaacaaatatcaatgtgttttatcctttcatgatacacttgacaattagaaaaatggatggaacttc 3885819  T
Q  459 gactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgat 558  Q
    |  |||||| |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||| |||  |||| ||| | |||| |||| ||||| |  |||||||||||    ||    
T  3885818 ggttatcaccatgtatctttgcacattcttgagtgact-ctaactcatcaactatccatttaatccatgtggcttccttgatgccttccacaaggataat 3885720  T
Q  559 gtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttc 610  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||    
T  3885719 gtacccctcttgagttttagataatgtcagtacaaattgttgattttccttc 3885668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 14520796 - 14520847
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14520796 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 14520847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 321
Target Start/End: Original strand, 25785274 - 25785443
Alignment:
Q  151 aagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactct 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||  |||||||||||||||||   | || | |||| ||  |  |||||| | |    
T  25785274 aagccaattttaacatttctccaccttgact-ctaaattagtggtgatgcaaatttaaccatcaaccagtttactgccctctacatcaacgaattattgt 25785372  T
Q  251 tcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgc 321  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  25785373 tcaacaaatttgatcaagtcaaaacattgattgaaccttgatctaggtaatgatttggtgaatacatccgc 25785443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10593007 - 10592851
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  || |||| ||   ||||| ||  ||   ||||||||||    
T  10593007 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacctat-ctcacggcacccggaatcgtgtcac 10592909  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  10592908 gataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 10592851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16407806 - 16407650
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  16407806 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacaaaatcgtgtca 16407708  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16407707 cgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 16407650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 24136319 - 24136475
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||| | |||||| || || |   || ||||||    
T  24136319 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-tagctcacggcatcacgaaattgtgtca 24136417  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24136418 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctgtgttcttccagaccacaaatttgaaaccaa 24136475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25077870 - 25077814
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  25077870 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattt 25077814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25135839 - 25135783
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  25135839 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattt 25135783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22536688 - 22536845
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || || ||| | |||||| || | ||   |||||||||    
T  22536688 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaattgtgccacgattttgcaccctgc-aacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 22536786  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   || ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22536787 cgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 22536845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 31180773 - 31180823
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31180773 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 31180823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9352972 - 9352916
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  9352972 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacagaatcgtgccacgattt 9352916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36931903 - 36931855
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagc 154  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36931903 caaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagc 36931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 38219865 - 38219921
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38219865 acttaacaagcaagtttgaaaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgtcacgattt 38219921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25767341 - 25767275
Alignment:
Q  151 aagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaacca 218  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25767341 aagccaattttaacatttttccaccttgact-ctaaattagtggtgatgccaatttaaccatcaacca 25767275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9352882 - 9352816
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9352882 atcgtgtcacgatgccacaatcgcgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaa 9352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12083708 - 12083658
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12083708 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaatttaaagccaat 12083658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 15465050 - 15465116
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15465050 atcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaa 15465116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 9789644 - 9789796
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  9789644 acttaacgagcaagttttcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 9789742  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9789743 cgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 9789796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11916502 - 11916453
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11916502 aaattgtgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaa 11916453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18442068 - 18442124
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18442068 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgattt 18442124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 532; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 19344845 - 19345492
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||    
T  19344845 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtatcac 19344944  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19344945 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatg 19345044  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19345045 tcaatttaaccatcaaccactatgcagctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaaacaatgcttgaatcttgatcgaggca 19345144  T
Q  300 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19345145 atgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgtttcaatcatgtctctgacaaagtgcaggcgaat 19345244  T
Q  400 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcct 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19345245 gtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttggctatcacagtgtatcttcacacattcttgagtaattcct 19345344  T
Q  500 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19345345 aactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgtt 19345444  T
Q  600 gatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19345445 gatttgccttccaactaatcgtcgtgctataaagagtaaacacaaaac 19345492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 655
Target Start/End: Original strand, 39483443 - 39483989
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39483443 aaatcgtgtcacaatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaataaacaacatt-ctccaccttgacttctaatt-ggtggtgatgtcaattt 39483540  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39483541 aaccatcaaccaccatgctcctctctccaaaagggaattactcttcaataaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgactt 39483640  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39483641 ggtgaacacatccgccggattctcttccgatgccaccttttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatg 39483740  T
Q  407 tgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcac 506  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39483741 tgcttagttctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcac 39483840  T
Q  507 caatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgc 606  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  39483841 caatcatacctttcaaccatatggtctctttcaccccttcaacaagggcaatgtactccgcttgagttgttgataatgctaccacagattgttgatttgt 39483940  T
Q  607 cttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||| |||| |||||||    
T  39483941 cttccaactaatagttgagccatagagaataaacacaaaacccgataga 39483989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 161 - 655
Target Start/End: Original strand, 31056688 - 31057181
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 260  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31056688 caacatttctccaccttgact-ctaaattggtggtgatgtcaatttaatcatcaaccacctttctgctctcttcaaaagggaattactcttcaacaaact 31056786  T
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctc 360  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  31056787 tgattaggtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgacttggtaaacacatatgccggattctcttccaatgccactttttccaccacaatctc 31056886  T
Q  361 ttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttga 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31056887 ttttgattcaatcatgtctctaacaaagtggaagcgaatgtcaatgtgcttaatcctttcatgatacacttgatggttcgccaagtgaatggcactttga 31056986  T
Q  461 ctatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgt 560  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  31056987 ctatcacaatgtatcttcatacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatacccttcaaccatatggtctctttcaccccttcaacaagggcaatgt 31057086  T
Q  561 actccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  31057087 actccgctagagttgttgataatgccaccatggattgttgattagcctttcaactaatagccgtgccatagagagtaaacacaaaacccgataga 31057181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2740496 - 2740146
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  2740496 atcaagtccaagcaatgcttgaactttgctcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 2740397  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  2740396 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatggtttgccaaatgaatggcactttggct 2740297  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||    
T  2740296 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctgtgtac 2740197  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  2740196 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 2740146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17943112 - 17942762
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  17943112 atcaagtccaagcaatgcttgaatctcgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattctcttccgatgccactttctccaccatgatctcct 17943013  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  17943012 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatgacactttggct 17942913  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  17942912 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatgacttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 17942813  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  17942812 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 17942762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 22713124 - 22713474
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  22713124 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 22713223  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22713224 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 22713323  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  22713324 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 22713423  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  22713424 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 22713474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 39686538 - 39686188
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  39686538 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgagctcct 39686439  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39686438 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 39686339  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  39686338 atcacaatgtatcttcacacatccttaactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 39686239  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  39686238 tttgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 39686188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 20050652 - 20051002
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  20050652 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtcttctggattttcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 20050751  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20050752 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgttctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 20050851  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  20050852 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 20050951  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  20050952 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 20051002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 263 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 30478568 - 30478222
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  30478568 atcaagtccaagcaatgcttgaaccgtgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattttcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 30478469  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30478468 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 30478369  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  30478368 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 30478269  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcctt 609  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||    
T  30478268 tctgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgcctt 30478222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 19349703 - 19349861
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  19349703 acttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 19349802  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19349803 gattgccaaattgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaaaccaatt 19349861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 14291961 - 14292118
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |  ||||||||||    
T  14291961 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgagatcgtgtca 14292059  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14292060 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 14292118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39811641 - 39811484
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || | |  | ||  ||||||||    
T  39811641 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactt-gcttacggtc-acttgaaatcgtgtc 39811544  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39811543 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 39811484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9296018 - 9295869
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtcacgactgc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||||||   |    
T  9296018 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcatcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtcacgatgcc 9295921  T
Q  107 aaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9295920 aaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 9295869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Original strand, 32247230 - 32247345
Alignment:
Q  43 atcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaacca 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32247230 atcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcatctcaaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagacca 32247329  T
Q  143 caaaattgaagccaat 158  Q
    |||| |||||||||||    
T  32247330 caaatttgaagccaat 32247345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11098551 - 11098394
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  11098551 acttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 11098454  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || |   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11098453 actatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 11098394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3492212 - 3492368
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  3492212 acttaacgagcaagtttcagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcgtgtca 3492310  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  3492311 cgatgccaaattcgtgtcacaatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaa 3492368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 12647803 - 12647960
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  12647803 acttaacgagcaagtttatggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 12647902  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  12647903 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 12647960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25410101 - 25410257
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||    ||||| || || |   |||||||||    
T  25410101 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-catctcacggcatcacaaaatcgtgtca 25410199  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25410200 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 25410257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30833086 - 30832930
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  30833086 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 30832988  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30832987 cgatgtcaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 30832930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44310545 - 44310478
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44310545 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 44310478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8389681 - 8389631
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8389681 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaat 8389631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36757477 - 36757424
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36757477 caaaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 36757424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28258729 - 28258678
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28258729 caaaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaa 28258678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33528155 - 33528104
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33528155 aaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 33528104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10706783 - 10706733
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10706783 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaagccaat 10706733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Original strand, 14634393 - 14634458
Alignment:
Q  155 caattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14634393 caatttcaacatttctccaccttgacttctaa-ttggcgatgatgtcactttaaccatcagccacca 14634458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Original strand, 20522797 - 20522839
Alignment:
Q  117 cacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20522797 cacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 20522839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 21630511 - 21630561
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21630511 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaagccaat 21630561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32289223 - 32289157
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32289223 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 32289157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 13828839 - 13828894
Alignment:
Q  167 ttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatg 223  Q
    |||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828839 ttctccaccttgact-ctaaatttgtgatgatgtcaatttaaccatcaaccaccatg 13828894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28258815 - 28258759
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  28258815 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtgccacgattt 28258759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 4484758 - 4484910
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||  || ||||||| | ||||| || ||  |||  |||||||    
T  4484758 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattccttaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaactag-ctcacggcatca-tgaaatcgtgtc 4484855  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    ||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4484856 acgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 4484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23078002 - 23077952
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  23078002 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccaaaattttgaagccaat 23077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 40739382 - 40739448
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40739382 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttgtctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 40739448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12550703 - 12550626
Alignment:
Q  242 aattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatcc 319  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| ||||    
T  12550703 aattattctttgacaaaatttatcatgtccaagcaatggttgaatgttgatctaggtagtgacttgatgaacaaatcc 12550626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 28462941 - 28463026
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctc 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || | | |||||||||||||    
T  28462941 atcaagtccaaacaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatctctgctggattttctttcaatgccactttctc 28463026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 557 - 625
Target Start/End: Original strand, 20056359 - 20056427
Alignment:
Q  557 atgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtg 625  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  20056359 atgtacttcacttaagtggtagataatgccaccatagattgttgatttatcttccaattaatagtcgtg 20056427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 527; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Original strand, 18856145 - 18856791
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||    
T  18856145 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcttgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcac 18856244  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18856245 gattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgc 18856344  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18856345 caatttaaccatcaaccaccttgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggtaa 18856444  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18856445 tgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcagacgaatg 18856544  T
Q  401 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856545 tcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattccta 18856644  T
Q  501 actcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 600  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856645 actcaccaatcatcccttttaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcaatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttg 18856744  T
Q  601 atttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18856745 atttgccttccaactaattgtcgtgccataaagagtaaacacaaaac 18856791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9228850 - 9228198
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | ||||| ||| |  |||  |||||||    
T  9228850 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacgag-ctcacggccact-tgaaatcgtgtc 9228753  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9228752 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgat 9228653  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9228652 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaatttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggc 9228553  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9228552 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaactacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaa 9228453  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9228452 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 9228353  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9228352 taactcaccaatcatccctttcaaccatatagcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacagattgt 9228253  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9228252 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 9228198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 16628403 - 16627870
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat-tccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16628403 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatatacaacatt-ctccacctcgacttctaatttggtggtgatgtcaattt 16628305  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16628304 aaccatcaaccaccatgctgctctctctaaaagggaattactcttcaatgaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggtaatgactt 16628205  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatg 406  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16628204 ggtaaacacatccgccagattctcttccgatgccactttttccaccacaatatcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagtgaatgtcaatg 16628105  T
Q  407 tgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcac 506  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16628104 tgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcatacattcttgagtaattcctaactcac 16628005  T
Q  507 caatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgc 606  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16628004 caatcatacctttcaaacatatggcctctttcaccccttcaacaagggcaatatactccgcttgagttgttgataatgccaccatggattgttgatttgc 16627905  T
Q  607 cttccaactaatagccgtgccataaagagtaaaca 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16627904 cttccaactaatagccatgccatagagagaaaaca 16627870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 161 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3792490 - 3791996
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 260  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3792490 caacatttctccaccttgact-ctaaattagtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccttgctgctctctccaaaagggaattactcttcaaaaaact 3792392  T
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  || || |||||    
T  3792391 tgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaattacttggtaaacacatccaccagattctcttccgatgccacttttttcactacaatctc 3792292  T
Q  361 ttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttga 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3792291 ttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcaaatgtcaatgtgcttagtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatggcactttga 3792192  T
Q  461 ctatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttca-caccttccacaagtgcgatg 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |  ||     
T  3792191 ctatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatatctttcaaccatatggcctctttcacccccttcaacaagggaaata 3792092  T
Q  560 tactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  3792091 tactccgcttgagttgttgataatgccaccacagattgttgattagccttccaactaatagtcgtgccatagagagtagacacaaaacccgataga 3791996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 109 - 619
Target Start/End: Original strand, 3778116 - 3778618
Alignment:
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat-tccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3778116 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatatacaacatt-ctccaccttgacttctaatt-ggtggtgatgtcaattta 3778213  T
Q  208 accatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttg 307  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  3778214 accatcaaccaccatgatgctctctccaaaagggaattaatcttcaatgaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggtaatcacttg 3778313  T
Q  308 gtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgt 407  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  3778314 gtaaacacatccgccggattatcttccgatgccactttttccaccacaatctcttttgattcaatcatatctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgc 3778413  T
Q  408 gctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3778414 gctttgtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 3778513  T
Q  508 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 607  Q
    |||||| ||||||||||||||       ||||| ||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3778514 aatcatacctttcaaccatat-------ttcaccccttcaacaagggcaatatactctgattgagttgttgataatgccaccacgaattgttgatttgcc 3778606  T
Q  608 ttccaactaata 619  Q
    ||||||||||||    
T  3778607 ttccaactaata 3778618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 108 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6742946 - 6742583
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6742946 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaatttgaagccaatttacaacatt-ctccaccttgacttctaatttg-tggtgatgtcatttt 6742849  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6742848 aaccatcatccaccatgctgctctttccaaaagggaattactcttcaataaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgactt 6742749  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatg 406  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6742748 ggtaaacacatccgccagattctcttccaatgacaaattttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatg 6742649  T
Q  407 tgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgt 472  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742648 tgcttagtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgt 6742583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 434
Target Start/End: Original strand, 5143805 - 5144135
Alignment:
Q  104 tgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtca 202  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  5143805 tgcaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacatttctccaccttgactactaatt-ggtggtgatgtta 5143903  T
Q  203 atttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatg 302  Q
     |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5143904 gtttacccatcaaccaccttgctgctttctccaaaagggaattactcttcaacgaacttgatcaatttcaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatg 5144003  T
Q  303 acttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtc 402  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5144004 atttggtaaacacatccgtcggattctctttcgatgccacctttaccaccacgatatcttttgatttaaccatgtctctgacaaagtgcaagcgaatgtc 5144103  T
Q  403 aatgtgctttgtcctttcatgatacacttgat 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5144104 aatgtgctttgtcctctcatgatacacttgat 5144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 263 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15316532 - 15316264
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||| |  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||| |    
T  15316532 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaaaatgtctgctggattttcttccgatgccactttctctaccttgatctcct 15316433  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15316432 ttgtctcaatcatgtctcttacgaagtgcaaacgaatgttaatgtgctttgttctttcatgatatatctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 15316333  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggc 531  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15316332 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggc 15316264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45347481 - 45347323
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  45347481 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcatctctaatcgtgtcac 45347382  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || | |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  45347381 gattccaaaatcgtgtcacgatttctttgttcttccagaccacaaatttgaagccaatt 45347323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 335 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16638380 - 16638102
Alignment:
Q  335 gatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgat 434  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  16638380 gatgccactttctccaccatgatctcctttgtctcgatcatgtctctaacaaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgttctttcttgatatacctgat 16638281  T
Q  435 gatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctc 534  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16638280 gatttgccaaatggatggcactctggctatcacaatgtatcttcacacactcttgactaatccacatctctccaatcatacctttcaaacatatggcttc 16638181  T
Q  535 cttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    ||| || ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||||  | |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16638180 cttgaccccttcaacaagggaaatgtattatgcttgagttgtttaaagagctacaactgattgttggtttgccttccaa 16638102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4569626 - 4569284
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||        |||||||||  || || ||||| || || ||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  4569626 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttgg--------tggtgaacatgtctgctggattttcttctgatgccaatttctccaccatgatctcct 4569535  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  ||||| |||||||| ||  ||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  4569534 ttgtctcaattatgtctctgacgaagtgcaaatgaatgtcaatgtgttttgttctttcatgatatacctgatgatttgtcaaatgaatggcactttggct 4569435  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||| || |  || |||||||| |||||||| |||| | | ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  4569434 atcacaatgtatcttcacacacccttgtttaatccccatttctccaatcatacctttcaatcatacgacttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 4569335  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || |  |||||||||||||||||||||    
T  4569334 tctgcttgagttgttgaaagagctacaattgattgttgatttgccttccaa 4569284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7124653 - 7124434
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  7124653 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 7124554  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  7124553 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttgaagacaaactcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgc 7124454  T
Q  201 caatttaaccatcaaccacc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  7124453 cactttaaccatcaaccacc 7124434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 45356962 - 45356861
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  45356962 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcatctcaaatcgtgtcac 45356863  T
Q  101 ga 102  Q
    ||    
T  45356862 ga 45356861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8395355 - 8395136
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || | ||||||| |||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  8395355 acttaacgagcaagtttctggattgtgtcacgattttcccaaatcgtgctacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 8395256  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  8395255 gataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatgc 8395156  T
Q  201 caatttaaccatcaaccacc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8395155 cactttaaccatcaaccacc 8395136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9224063 - 9223906
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| |||  | ||  ||||||||    
T  9224063 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcc-acttgaaatcgtgtc 9223966  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9223965 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 9223906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 51520886 - 51521043
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| ||| || ||  ||||||||    
T  51520886 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcc-ccttgaaatcgtgtc 51520983  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51520984 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 51521043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 56141676 - 56141509
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttt-gcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||  || | ||  ||||||||    
T  56141676 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttggcgtcctgcaaac-tagctcacgacccctccaaatcgtgtc 56141578  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatt 167  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  56141577 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatt 56141509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 24742413 - 24742570
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  24742413 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 24742511  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24742512 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 24742570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5138040 - 5137819
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  5138040 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgacacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 5137941  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatg 199  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5137940 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttgacttctaatttggtgatgatg 5137841  T
Q  200 tcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  5137840 ccactttaaccatcaaccacca 5137819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 5733082 - 5733240
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||  |||| || |  |   |||||||||    
T  5733082 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttcacggcaccacgaaatcgtgtca 5733181  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5733182 cgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaat 5733240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 18860403 - 18860521
Alignment:
Q  47 tgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18860403 tgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaa 18860502  T
Q  147 attgaagccaattccaaca 165  Q
     |||||||||||| |||||    
T  18860503 tttgaagccaatttcaaca 18860521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 3814442 - 3814598
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||| || | |  | ||  ||||||||    
T  3814442 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgacacgatttggcgtcttgcaaactt-gcttacggtc-acttgaaatcgtgtc 3814538  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3814539 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 3814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18712419 - 18712348
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18712419 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 18712348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 29761094 - 29761165
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29761094 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 29761165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7122431 - 7122279
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  7122431 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 7122332  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7122331 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttgaag 7122279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8393146 - 8392989
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  8393146 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 8393047  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  8393046 gataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 8392989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8689096 - 8689043
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8689096 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 8689043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 43708115 - 43708052
Alignment:
Q  468 aatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43708115 aatgtatcttcacacattcttaagtaacttctaactccccaatcatacccttcaaccatatggc 43708052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38151968 - 38151918
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38151968 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaat 38151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13992714 - 13992870
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  || ||||||  | |||||  | || |  | ||||||||    
T  13992714 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacgacatcacgaaatcgtgtca 13992812  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13992813 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 13992870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28468142 - 28467986
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   ||||||| |    
T  28468142 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcgtgtta 28468044  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28468043 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaagccaa 28467986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 5148243 - 5148295
Alignment:
Q  107 aaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5148243 aaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 5148295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5268750 - 5268698
Alignment:
Q  107 aaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5268750 aaaatcctgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 5268698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 10047932 - 10047982
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10047932 aaatcgtgtcacgatttatctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaat 10047982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16622824 - 16622774
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16622824 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaattttaagccaat 16622774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 54867745 - 54867796
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54867745 aaatcgtgtcacgacttctctattcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 54867796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5135814 - 5135656
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   |||| ||||    
T  5135814 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgacacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgcgtca 5135715  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5135714 cgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaatttgaagacaat 5135656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 154
Target Start/End: Original strand, 29761182 - 29761228
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagc 154  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29761182 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagc 29761228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 31495737 - 31495889
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||    
T  31495737 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 31495835  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31495836 cgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 31495889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47566136 - 47566095
Alignment:
Q  195 tgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47566136 tgatgccaatttaaccatcaatcaccatgctgctctctccaa 47566095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 56141750 - 56141714
Alignment:
Q  21 aatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56141750 aatcgtgccacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 56141714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 647
Target Start/End: Original strand, 41391030 - 41391667
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacgactgcaa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| || || |  |||||||||||| | |||    
T  41391030 agcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact-ggctcacggcatctcaaatcgtgtcacgattccaa 41391128  T
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaa 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41391129 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaaatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagtttaa 41391228  T
Q  209 ccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttgg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41391229 ccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttgg 41391328  T
Q  309 tgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtg 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41391329 tgaacacatccgccagattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaatgtcaatgtg 41391428  T
Q  409 ctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacca 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41391429 ctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacca 41391528  T
Q  509 atcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcct 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41391529 atcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagtagtagataatgccaccacggattgttgatttgcct 41391628  T
Q  609 tccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41391629 tccaactaatagtcgtgccataaagaataaacacaaaac 41391667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19361077 - 19360428
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  19361077 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacaaaatcgtgtca 19360979  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19360978 cgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttataatttggtggtgat 19360879  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19360878 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgattgaaacttgatctaggc 19360779  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  19360778 aatgacttggtgaacacatccgccggattatcatccgatgccactttatcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagggaa 19360679  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19360678 tgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacgtgatgattttccaagtgaatgacactttgactatcacaatgtatcttcgcacattcttgagtaattcc 19360579  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19360578 taactcaacaatcatccctttcaaccatatggcatctttcaccccttcaacaagggcaatgtactccgcttgagtggtagataatgccaccacggattgt 19360479  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactc 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19360478 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaactc 19360428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 161 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 47703391 - 47702900
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaact 260  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47703391 caacatttatccaccttgact-ctaaattggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccttgctgctctctccaaaagggaattactcttccacaaact 47703293  T
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctc 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| |||||    
T  47703292 tgatcaagtccaaacaatgcttgaaccttgatttaggcaatgacttggtaaacacatccgccggattctcttccgatgcc--tttttccaccacaatctc 47703195  T
Q  361 ttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttga 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  47703194 ttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgcttagtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatgacactttgg 47703095  T
Q  461 ctatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgt 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  47703094 ctatcacaatgtatcttcacacatttttgagcaattcctaacacaccaatcatatctttcaaccatatggcctctttcaccccttcaacaagagcaatat 47702995  T
Q  561 actccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  47702994 actctgcttgagttgttgataatgccaccacggattgttgattagccttcaaactaatagtcgtgccatagagagtaaacacaaaacccgataga 47702900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 47102350 - 47101981
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47102350 ttgaagtcaatttcaacatttctccaccttgacttctaatt-ggtgatgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgttgctctctccaaaagggaattac 47102252  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  47102251 tcttcaacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggcaatgacttggtaaacacattcgcctgattctcttccgatgccacttttt 47102152  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47102151 ccaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgtaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgattcaccaagtg 47102052  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctt 518  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47102051 aatgacactttgactatcaaaatgtatcttcacgcattcttgagtaattcctcactcaccaatcattcctt 47101981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25444756 - 25444436
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  25444756 acttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctacaaacttggctcacggcatctcaaatcgtgtcac 25444657  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || | | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25444656 gattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaattccaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgt 25444557  T
Q  201 caatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444556 cagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaa 25444457  T
Q  301 tgacttggtgaacacatccgc 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25444456 tgacttggtgaacacatccgc 25444436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 389 - 653
Target Start/End: Original strand, 13599200 - 13599464
Alignment:
Q  389 tgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 488  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599200 tgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgattttccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 13599299  T
Q  489 gagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccac 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13599300 gagtaattcctaactcaccaatcatacctttcaaccatatggcctatttcaccccttcaacaagggcaatggactccgcttgagttgttgataatgccac 13599399  T
Q  589 cacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  13599400 cacggattgttgatttgccttccaactaatagtcgtgccatatagagtaaacacaaaacccgata 13599464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9526019 - 9525669
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  9526019 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 9525920  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9525919 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 9525820  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  9525819 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 9525720  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  9525719 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 9525669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 2393909 - 2394259
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || | ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  2393909 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctgaattttcttccgatgccactttctccaccatgatctcct 2394008  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2394009 ttgtctcaatcatgtctctaacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgttctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 2394108  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  2394109 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 2394208  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||| ||||||||    
T  2394209 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgattttccttccaa 2394259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Original strand, 13598967 - 13599188
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13598967 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattaacaacatt-ctccaccttgacttctaatt-ggtggtgatgtcaattt 13599064  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  13599065 aaccagcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcaataaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaagcaatgactt 13599164  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctc 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  13599165 ggtaaacacatccgccggattctc 13599188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44023541 - 44023339
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||    
T  44023541 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcac 44023442  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgt 200  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44023441 gattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaacatttctccaccttgaattctaatttggtggtgatgt 44023342  T
Q  201 caa 203  Q
    |||    
T  44023341 caa 44023339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43988113 - 43987955
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43988113 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttaccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctctctgatcgtgtcac 43988014  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43988013 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgctctcccaaaccacaaatttgaagccaatt 43987955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25439563 - 25439399
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  25439563 acttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctgcaaacttggctcacggcatctcaaatcgtgtcac 25439464  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || | | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25439463 gattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaattccaaca 25439399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1054678 - 1054513
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||  | |  ||||| ||||    
T  1054678 acttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctcacggcacctccaatcgtatcac 1054579  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacat 166  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1054578 gattccaaaatcgtgacacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaacat 1054513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 39445918 - 39446082
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  39445918 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctcacggcatctcaaatcgtgtcac 39446017  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  39446018 gattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaaca 39446082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 542 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 47101984 - 47101884
Alignment:
Q  542 ccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaaca 641  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47101984 ccttcaacaagtgcaatgtactccgcttgagtggtagataatgccaccacagattgttgattagccttccaactaatagccgtgtcatagagagtaaaca 47101885  T
Q  642 c 642  Q
    |    
T  47101884 c 47101884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24786989 - 24786918
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  24786989 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 24786918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24793811 - 24793740
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  24793811 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 24793740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 41398685 - 41398777
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcacga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| || || |  ||||||||||||    
T  41398685 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tggctcacggcatctcaaatcgtgtcacga 41398777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44203382 - 44203225
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     || |||| | | |||||| ||  | |  ||||||||||    
T  44203382 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcacctccaatcgtgtcac 44203283  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    || | |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  44203282 gattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 44203225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21536170 - 21536121
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21536170 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 21536121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26644433 - 26644380
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26644433 caaaatcgtatcacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttaaagccaatt 26644380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41360530 - 41360471
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41360530 caacatttctccaccttgact-ctaatttgatggtgatgtcaa-ttaaccatcaaccaccat 41360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19365931 - 19365781
Alignment:
Q  3 ttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtcacg 101  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   |||||||||||    
T  19365931 ttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacg 19365833  T
Q  102 actgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19365832 atgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaag 19365781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 37070334 - 37070385
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37070334 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaaaccaatt 37070385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Original strand, 4650765 - 4650843
Alignment:
Q  241 gaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatcc 319  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  4650765 gaattattgttcaacaaaattgatcaagtccaaacaatgtttgaaccttgatctaagcaatgatttgatgaacacatcc 4650843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24202326 - 24202260
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24202326 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 24202260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24793723 - 24793673
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24793723 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 24793673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13604152 - 13604091
Alignment:
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttc 169  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  13604152 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctcaacatttc 13604091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51765155 - 51764999
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  51765155 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacgaaatcgtgtca 51765057  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  51765056 cgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttaaagccaa 51764999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9986950 - 9986894
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9986950 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgattt 9986894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 20622656 - 20622712
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20622656 acttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgattt 20622712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9036077 - 9036010
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  9036077 atcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 9036010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 776851 - 776791
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  776851 caacatttctccaccttgact-ctaaattgatggtgatggaactttaaccatcaaccaccat 776791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Original strand, 3282273 - 3282322
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3282273 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttcctaaccacaaatttgaagccaa 3282322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Original strand, 50167733 - 50167793
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  50167733 caacatttctccaccttgact-ctaaattgatggtgatgaaactttaaccatcaaccaccat 50167793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6483677 - 6483625
Alignment:
Q  241 gaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatc 293  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  6483677 gaattacacttcaacaaaattgatcaagtctaagcaacacttgaatcttgatc 6483625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 33037443 - 33036810
Alignment:
Q  9 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtcacgactgca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||  | |  | |||||||||||   ||    
T  33037443 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgcca 33037345  T
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33037344 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagttta 33037245  T
Q  208 accatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttg 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33037244 accatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaatttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggtaatgacttg 33037145  T
Q  308 gtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33037144 gtgaacacatccgccggattctcttccgatgccactttttcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgt 33037045  T
Q  408 gctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037044 gctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 33036945  T
Q  508 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33036944 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccacttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 33036845  T
Q  608 ttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacac 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33036844 ttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacac 33036810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 18870185 - 18869536
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||  | ||  |||  |||||||    
T  18870185 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag-ctcacgacatct-tgaaatcgtgtc 18870088  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgat 198  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||    
T  18870087 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccacattgacttctaatttggtg---at 18869991  T
Q  199 gtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18869990 gtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaatttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatctaggt 18869891  T
Q  299 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18869890 aatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaggcgaa 18869791  T
Q  399 tgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18869790 tgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcc 18869691  T
Q  499 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18869690 taactcaccaatcatccctttcaaccatatggtctccttcacaccttcaacaagtgcgttgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgt 18869591  T
Q  599 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18869590 tgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 18869536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 647
Target Start/End: Original strand, 35741124 - 35741604
Alignment:
Q  167 ttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatca 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35741124 ttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccactatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatca 35741223  T
Q  267 agtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  35741224 agtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgt 35741323  T
Q  367 ttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatca 466  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35741324 ttcaatcatgtctctgacaaagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttggctatca 35741423  T
Q  467 caatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccg 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35741424 caatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccg 35741523  T
Q  567 cttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35741524 cttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 35741604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 10688675 - 10688136
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattta 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10688675 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatatcaacatttctccaccttgacttctaatttggtggtgatgtcagttta 10688576  T
Q  208 accatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttg 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10688575 accatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacgaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatttaggtaatgacttg 10688476  T
Q  308 gtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  10688475 gtgaacacatccgttggattctcctccgatgccacttttttaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcagtctaatgtctatgt 10688376  T
Q  408 gctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10688375 gctttgtcctttcatgatacacttgatgattttccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcacc 10688276  T
Q  508 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10688275 aatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcc 10688176  T
Q  608 ttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10688175 ttccaactaatcgccgtgccataaagagtaaacacaaaac 10688136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 653
Target Start/End: Original strand, 26297138 - 26297603
Alignment:
Q  187 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26297138 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgtttgaat 26297237  T
Q  287 cttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26297238 cttgatctaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcttccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaa 26297337  T
Q  387 agtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattc 486  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26297338 agtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattc 26297437  T
Q  487 ttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgcc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26297438 ttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctctttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagtggtagataacgcc 26297537  T
Q  587 accacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26297538 accacggattgttgatttg-cttccaactaatagtcgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 26297603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 653
Target Start/End: Original strand, 26310395 - 26310860
Alignment:
Q  187 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26310395 tttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgtttgaat 26310494  T
Q  287 cttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26310495 cttgatctaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcttccgatgccactttctcaaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaacaa 26310594  T
Q  387 agtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattc 486  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26310595 agtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattc 26310694  T
Q  487 ttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgcc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26310695 ttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctctttcacaccttcaacaagtgcgatgtactccgcttgagtggtagataacgcc 26310794  T
Q  587 accacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26310795 accacggattgttgatttg-cttccaactaatagtcgtgccataaagagtaaacacaaaacccgata 26310860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 19751905 - 19751402
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19751905 ttgaagtcaattacaacatttctccaccttgacttctaatt-ggtgacgatgtcagtttaaccatcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattac 19751807  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19751806 tcttcaatgaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaggtaatgacttggtaaacacatccgccggattctcttccgatgccacttttt 19751707  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19751706 ccaccataatctctcttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtgctctcatgatacacttgatgatttgccaagtg 19751607  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcc 547  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  19751606 aatggcac-ttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatacctttcaaccatatggcttctttcaccccttca 19751508  T
Q  548 acaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19751507 acaagggcaatatactccgcttgagttgttgataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacacaaaac 19751408  T
Q  648 tcgata 653  Q
     |||||    
T  19751407 ccgata 19751402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 162 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26402681 - 26402319
Alignment:
Q  162 aacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaactt 261  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26402681 aacatttctccaccttgact-ctaaattggtggtgatgtaaatttaaccatcaaccaccttgctgctctctccaaaaggggattactcttcaacaaactt 26402583  T
Q  262 gatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctct 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| ||  ||    
T  26402582 gatcaagtccaagcaatacttgaaccttgatctaggcaatgacttggtaaacacatccgccagattctctttcgatgccactttttccaccacaattact 26402483  T
Q  362 tttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgac 461  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26402482 tttgattcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacatttgatgattcgccaagtgaatgacactttgac 26402383  T
Q  462 tatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaacca 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26402382 tatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatacccttcaacca 26402319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 303 - 655
Target Start/End: Original strand, 34586846 - 34587198
Alignment:
Q  303 acttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtc 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  34586846 acttggtaaacacatccgccggattctcttccgatgccattttttccaccacaatctcttttgattcaatcatgtctctaataaagtgcaagcgaatgtc 34586945  T
Q  403 aatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaac 502  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34586946 aatgtgcttagtcctctcatgatacacttgatgattcgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacatattcttgagtaattcctaac 34587045  T
Q  503 tcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgat 602  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34587046 tcaccaatcatacctttcaaccatatggcatctttcaccccttctacaaaggcaatgtactccgcttgagttgttgataatgtcaccacggattgttgat 34587145  T
Q  603 ttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  34587146 ttgccttccaactaatagtcgtgccatagagagtaaacacaaaacccgataga 34587198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 4813116 - 4813466
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  4813116 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 4813215  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4813216 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 4813315  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  4813316 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 4813415  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  4813416 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 4813466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Original strand, 16753150 - 16753500
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  16753150 atcaagtctaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 16753249  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16753250 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 16753349  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  16753350 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 16753449  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  16753450 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 16753500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28332186 - 28331836
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  28332186 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 28332087  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | |  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28332086 tagtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 28331987  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  28331986 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtac 28331887  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  28331886 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 28331836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25684198 - 25683848
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25684198 atcaagtccaagcaatgcttgaattttgttcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 25684099  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25684098 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 25683999  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  25683998 atcacaatgtatcttcacacatccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 25683899  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  25683898 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgccttccaa 25683848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 263 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 28895055 - 28894709
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  28895055 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 28894956  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||| ||| | ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28894955 ttgtctcaatcatatctttgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 28894856  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  28894855 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccccttcaacaagggctatgtat 28894756  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgcctt 609  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||    
T  28894755 tctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatttgcctt 28894709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 341 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 33494462 - 33494186
Alignment:
Q  341 actttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttg 440  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  33494462 actttttcagccacaatttcttttgactcaatcatgtctctaataaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgtcctctaatgatacacttgatgatttt 33494363  T
Q  441 ccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccc-tttcaaccatatggcctccttca 539  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||  |    
T  33494362 ccatgtggatgacactttgactatca-aatgtatcttcacacattcttgagcaattcctaattcaccagtcatcccttttcaactatatggctttctgta 33494264  T
Q  540 caccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaa 617  Q
    | ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  33494263 cccctttaacaagggcaatctactccgcttgagttgtagataatgtcaccacaaattgttgatttgtcttccaactaa 33494186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 35745814 - 35745972
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  35745814 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccaacaaacttggctcacggcatctccgatcgtgtcac 35745913  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35745914 gattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 35745972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 590368 - 590100
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||| || |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  590368 atcaagtccaagcaatgcttgaactttgatcttggtaatgatttagtgaacatgtctactggattgtcttccgatgccactttctctaccatgatctcct 590269  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  590268 ttgtctcaatcatgtctctgacgaagtgcaaacgaatgtcaatgtgttttgtcctttcatgatatacctgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 590169  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggc 531  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  590168 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttctccaatcatacctttcaaccatatggc 590100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 395 - 642
Target Start/End: Original strand, 14602405 - 14602651
Alignment:
Q  395 cgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaa 494  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||||| ||| |   || ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  14602405 cgaatgtcaatgtatttcgtcctttcatgatacatttaatgatttgtcaaattgctgacac-ttgactatcacaatgtatcttcgcacatgtttgagaaa 14602503  T
Q  495 ttcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacgga 594  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||    
T  14602504 ttcctaactcaccaataatccctttcaacaatatggcttccttcaccccttcaacaagggcaatgtactccgcttgaattatagatagagccaccacaga 14602603  T
Q  595 ttgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacac 642  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14602604 ttgttgatttatcttccatctaatagtcgtgccataaagagtcaacac 14602651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 483
Target Start/End: Original strand, 26268881 - 26269101
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||  || || | ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  26268881 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctcggtaatgattcggtgaacatgtctgctgaattttcttccgatgccactttctccaccatgatctcct 26268980  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26268981 tagtttcaatcatgtctctaacaaagtgcaagcgaatgtcaatgtgttttgttctttcatgatgtacatgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 26269080  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacaca 483  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26269081 atcgcaatgtatcttcacaca 26269101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39784489 - 39784325
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||    
T  39784489 acttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcac 39784390  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  39784389 gattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaaca 39784325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 15949179 - 15948803
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaatt-actcttcgacaaac 259  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||  ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||      ||| ||||||| |  ||     
T  15949179 caacatttctccaccttgact-ctaaattggcgatgataccaatttaaccatcaatcactttgctgctctctccaatccttcatttactcttcaatgaag 15949081  T
Q  260 ttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatct 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||  || |  | ||| || |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  15949080 ttgatcaagtacaagcaatgcttgaaccttgatcttggcaatgatttgatgaacatgtctgttgtattttcttttgatgccactttctcaaccatgatct 15948981  T
Q  360 cttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttg 459  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||| ||| |  |||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  15948980 cctttgtttctatcatgtctctaacaaagtgcaatcatatgtcaatgtgttttattttttcatgatatacctgatgatttgccaaatggatggaactctg 15948881  T
Q  460 actatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctcctt 537  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | |  || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  15948880 gctatcacaatgtatcttcacacacccttgactaatctccatttctccaatcatacctttaagccatatggcttcctt 15948803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10683903 - 10683746
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  10683903 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 10683806  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10683805 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 10683746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 30656118 - 30656275
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  30656118 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 30656215  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30656216 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 30656275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6311771 - 6311928
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  6311771 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 6311868  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6311869 acgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 6311928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18852791 - 18852634
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| | | || ||  ||||||||    
T  18852791 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcac-ggcaccttgaaatcgtgtc 18852694  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18852693 acgatgccaaaatcgtatcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 18852634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4759698 - 4759541
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  4759698 acttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 4759600  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4759599 cgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 4759541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 36979850 - 36980007
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgc-ctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||| || |  |   |||||||||    
T  36979850 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 36979948  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36979949 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 36980007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25327828 - 25327671
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| | |||||| |||  | ||  |||||| |    
T  25327828 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgatttggcgtcctgcaaac-tagctcacagcc-acttgaaatcgtgcc 25327731  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25327730 acgaagccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 25327671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 567 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 26402301 - 26402213
Alignment:
Q  567 cttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgataga 655  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  26402301 cttgagatgttgataatgccaccacggattgttgattagccttccaactaatagtcgtgccatatagagtaaacacaaaacccgataga 26402213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7289592 - 7289434
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccct---gatcgtgt 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||||| || ||||||    |||||||    
T  7289592 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaac-tagctca-tggctcccttgaaatcgtgt 7289495  T
Q  98 cacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  7289494 cacgatgccaaaatcgtgtcactatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaat 7289434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 6367176 - 6367341
Alignment:
Q  242 aattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgcca 341  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||  || |    
T  6367176 aattattcttcaacaaatttaatcaagttcaagcaatccttgaaccttgatatagacaataacttggtgaacacatctgtcggattttcttccgtagcaa 6367275  T
Q  342 ctttctcaaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgt 407  Q
    ||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  6367276 ctttctcaatcataatctatttcgattcaatcatgtctctaacgaagtgcaagcgaatgtcaatgt 6367341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10688763 - 10688692
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  10688763 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 10688692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3275855 - 3275737
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  3275855 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgattttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattttcctccgatgccactttctccaccatgatctcct 3275756  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctct 381  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  3275755 ttgtctcaatcatgtctct 3275737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3439251 - 3439085
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || | ||||| ||  |||  | ||||||||    
T  3439251 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaacctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtca 3439154  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacattt 168  Q
    |||   || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  3439153 cgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaatctcaacattt 3439085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1261579 - 1261423
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||| | |||||| || || |   |||||||||    
T  1261579 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-tagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 1261481  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1261480 cgatgccaaattcgtgtcgcgatttctgtgttcttccaaaccacaaatttgaaaccaa 1261423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5702009 - 5701958
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5702009 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 5701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 153
Target Start/End: Original strand, 7412877 - 7412939
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7412877 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 7412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Original strand, 19492251 - 19492310
Alignment:
Q  161 caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19492251 caacatttctccaccttgact-ctaatttgatggtgatgtcaa-ttaaccatcaaccaccat 19492310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19175283 - 19175233
Alignment:
Q  107 aaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19175283 aaaatcgtgacacgatttttctgttcttccaaaccgcaaatttgaagccaa 19175233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 42575744 - 42575902
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgattt-cccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     || |||| | |  ||||| || |||   ||||||||     
T  42575744 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgacacgatttgcacccctgcaaccctaactcacggcatccgaaatcgtgtcg 42575843  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42575844 cgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 42575902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Original strand, 4456575 - 4456624
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4456575 aaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 4456624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2627483 - 2627427
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2627483 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgattt 2627427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Original strand, 6367398 - 6367446
Alignment:
Q  455 ctttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaact 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6367398 ctttggctatcacaatgtatcttcacacatatttgagcaattcctaact 6367446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15290202 - 15290150
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15290202 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 15290150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15470571 - 15470519
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15470571 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaat 15470519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25689705 - 25689646
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgc 60  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25689705 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtgacgatttcccacaatcgtgccacgattttgc 25689646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2627393 - 2627327
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2627393 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 2627327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25689618 - 25689568
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  25689618 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 25689568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9024676 - 9024643
Alignment:
Q  498 ctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggc 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9024676 ctaactccccaatcatccctttcaaccatatggc 9024643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15290308 - 15290251
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15290308 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt 15290251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15470677 - 15470620
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacga-tttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15470677 acttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt 15470620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 16753054 - 16753122
Alignment:
Q  167 ttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaa 236  Q
    |||||||||||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  16753054 ttctccaccttgacttcaaattag-tgatgatgtcagtttaaccatcaatcaccttgctgctctctccaa 16753122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 26288352 - 26288504
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   ||| |||||    
T  26288352 acttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcatgtca 26288450  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26288451 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 26288504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 26301609 - 26301761
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   ||| |||||    
T  26301609 acttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcatgtca 26301707  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26301708 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 26301761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26313755
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctc-cctgatcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||   |||||| || || |   ||| |||||    
T  26313603 acttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaac-cagctcacggcatcacaaaatcatgtca 26313701  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26313702 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 26313755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7289666 - 7289630
Alignment:
Q  21 aatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7289666 aatcgtgccacgatttcccaagatcgtgtcacgattt 7289630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 7412787 - 7412843
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  7412787 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtaccacgattt 7412843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 148 - 653
Target Start/End: Original strand, 32757 - 33261
Alignment:
Q  148 ttgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattac 247  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   |||||||||    
T  32757 ttgaagacaattacaatatttttccactttgactt-taaataggtgatgatgtcaatttaaccatcaaccaccttgctgctctttccattggggaattac 32855  T
Q  248 tcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttct 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  32856 tcttcaacaaacttgatcaagtctaagcaatgcttgaaccttgatctaggtaatgacttggtaaacacatccgccggattctcttctaatgcaactttct 32955  T
Q  348 caaccacgatctcttttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtg 447  Q
    | ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  32956 ctaccacaatctctttcgattcaatcatgtctcttacaaagtgcaattgaatgtcaattgtctttgtcctctcgtgatacacttgatgattcgctaagtg 33055  T
Q  448 aatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttcc 547  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33056 aatggaactttggttatcacaatgtatcttcacacatgcctgagtaattcctaacttaccaatcaggtctttcaaccatatggcctccttcaccccttca 33155  T
Q  548 acaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaac 647  Q
    | ||| |  |||||||  |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33156 agaagggaaatgtactttgcttgagttgtacatagttccaccacagattgttgatttgtcttccaactaataatcgtgccaaaaagagtaaacacaaaac 33255  T
Q  648 tcgata 653  Q
     |||||    
T  33256 ccgata 33261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 389 - 653
Target Start/End: Original strand, 6485 - 6749
Alignment:
Q  389 tgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 488  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485 tgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgattttccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 6584  T
Q  489 gagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccac 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6585 gagtaattcctaactcaccaatcattcctttcaaccatatggtctttttcactccttcaacaagtgctttgtactccgcttgagttgttgataatgccac 6684  T
Q  589 cacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  6685 cacggattgttgatttgccttccaactaatagtcgtgccatatagagtaaacacaaaacccgata 6749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 389 - 653
Target Start/End: Original strand, 6997 - 7261
Alignment:
Q  389 tgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 488  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6997 tgcaagcgaatgtcaatgtgctttgtcctctcatgatacacttgatgattttccaagtgaatggcactttgactatcacaatgtatcttcacacattctt 7096  T
Q  489 gagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccac 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7097 gagtaattcctaactcaccaatcattcctttcaaccatatggtctttttcactccttcaacaagtgctttgtactccgcttgagttgttgataatgccac 7196  T
Q  589 cacggattgttgatttgccttccaactaatagccgtgccataaagagtaaacaccaaactcgata 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  7197 cacggattgttgatttgccttccaactaatagtcgtgccatatagagtaaacacaaaacccgata 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6473
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaatttggtggtgatgtcaattt 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6252 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattaacaacatt-ctccaccttgacttctaatt-ggtggtgatgtcaattt 6349  T
Q  207 aaccatcaaccaccatgctactctctccaaaagggaattactcttcgacaaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgactt 306  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  6350 aaccagcaaccaccatgctgctctctccaaaagggaattactcttcaataaacttgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaagcaatgactt 6449  T
Q  307 ggtgaacacatccgccggattctc 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  6450 ggtaaacacatccgccggattctc 6473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Original strand, 6916 - 6985
Alignment:
Q  261 tgatcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6916 tgatcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatctaagcaatgacttggtaaacacatccgccggattctc 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 3060 - 3111
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3060 aaatcgtgtcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 132809 - 132748
Alignment:
Q  109 aatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttc 169  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  132809 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctcaacatttc 132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1764 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1764
Description:

Target: scaffold1764; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 263 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1010 - 660
Alignment:
Q  263 atcaagtccaagcaatgcttgaatcttgatcgaggcaatgacttggtgaacacatccgccggattctcctccgatgccactttctcaaccacgatctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  1010 atcaagtccaagcaatgcttgaaccttgatcttggtaatgatttggtgaacatgtctgctggattgtcttctgatgccactttctctaccatgatctcct 911  T
Q  363 ttgcttcaatcatgtctctaacatagtgcaggcgaatgtcaatgtgctttgtcctttcatgatacacttgatgatttgccaagtgaatggcactttgact 462  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  910 ttgtctcaatcatgtctctgactaagtgcaaacgaatgtcaatgtgctttgttctttcatgatatacttgatgatttgccaaatgaatggcactttggct 811  T
Q  463 atcacaatgtatcttcacacattcttgagtaattcctaactcaccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtac 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||    
T  810 atcacaatgtatcttcacacacccttgactaatccccatttttccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccctttcaacaagggctatgtac 711  T
Q  563 tccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatttgccttccaa 613  Q
    || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||    
T  710 tctgcttgagttgttgaaagggctacaactgattgttgatttgccttccaa 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 148608 - 148443
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  148608 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccccgatcgtgtcac 148509  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacat 166  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  148508 gattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaagtcaattccaacat 148443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 176614 - 176450
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  176614 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctcactgcctccctgatcgtgtcac 176515  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  176514 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaagtcaataccaaca 176450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 781 - 945
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||    
T  781 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaatcgtgtcac 880  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  881 gattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaagccaatttcaaca 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 9233 - 9364
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattc-caacatttctccaccttgccttctaattt 189  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9233 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacatttctccaccttgacttctaattt 9332  T
Q  190 ggtggtgatgtcaatttaaccatcaaccacca 221  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9333 gatggtgatgtcactttaaccatcaaccacca 9364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 11589 - 11744
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga--tcgtgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || ||  |||  |||||||    
T  11589 acttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatca-tgaaatcgtgtc 11685  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  11686 acgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaattttgaagccaa 11744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 4146 - 4338
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     || |||| | | |||||| ||  |    ||||||||||    
T  4146 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcacctaaaatcgtgtcac 4245  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaacatttctccaccttgccttctaatttggtg 193  Q
    || | |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4246 gattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaatctcaacatttctccaccttaacttctaatttggtg 4338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3501 - 3344
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctg--atcgtgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| | |||||| |||  | ||  ||||||||    
T  3501 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtccttcaaac-tagctcacggcc-acttgaaatcgtgtc 3404  T
Q  99 acgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3403 acgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctcttttcttccagaccacaaatttgaagccaat 3344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34718 - 34662
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34718 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 34662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34613 - 34561
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34613 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 34561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 8128 - 8199
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  8128 acttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaact 8199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8266
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8216 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaat 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 3021 - 3178
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctgatcgtgtcac 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     || |||| | | |||||| || |||   ||||||||||    
T  3021 acttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgatttgcacccctgcaaccctagctcacggcatccgaaatcgtgtcac 3120  T
Q  101 gactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  3121 gatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1783 - 1709
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaattccaaca 165  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  1783 atcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaatttcaaca 1709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1107 - 998
Alignment:
Q  504 caccaatcatccctttcaaccatatggcctccttcacaccttccacaagtgcgatgtactccgcttgagttgtagataatgccaccacggattgttgatt 603  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |  || || || |||||||||||    
T  1107 caccaatcatacctttcaaccatatggcttccttgaccgcttcaacaagggctatgtactctgcttgagttgttgaaagagctacaactgattgttgatt 1008  T
Q  604 tgccttccaa 613  Q
    ||||||||||    
T  1007 tgccttccaa 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17596 - 17440
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctcactgcctccctga-tcgtgtca 99  Q
    ||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||  | ||||| || || |  | ||||||||    
T  17596 acttaacgagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccag-ctcacggcatcacgaaatcgtgtca 17498  T
Q  100 cgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17497 cgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaa 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22104 - 22033
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaact 72  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  22104 acttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaact 22033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5866
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaat 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  5933 atcgtgtcacgactccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaat 5866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Original strand, 45744 - 45795
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45744 caaaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaa 45795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 45658 - 45714
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  45658 acttagccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacagaatcgtgccacgattt 45714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36384 - 36331
Alignment:
Q  106 caaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaatt 159  Q
    |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36384 caaaatcgtatcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43509 - 43434
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagcc-aattccaaca 165  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  43509 atcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccataaatttgaagccaaattccaaca 43434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43599 - 43543
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  43599 acttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgattt 43543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1192
Alignment:
Q  1 acttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattt 57  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  1248 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgattt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1096
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaag 153  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1158 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaag 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Original strand, 86153 - 86224
Alignment:
Q  108 aaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaa-ttgaagccaat-tccaacatttctccaccttg 178  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  86153 aaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccacaaaatttgaagccaatatacaaca-ttctccaccttg 86224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7986 - 7920
Alignment:
Q  91 atcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaaattgaagccaa 157  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  7986 atcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaa 7920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2 times since January 2019
Visitors: 3251