View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0440_1D_low_2 (Length: 616)

Name: NF0440_1D_low_2
Description: NF0440_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0440_1D_low_2
NF0440_1D_low_2
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (1-596)||(2320419-2321014)
chr2 (1-596)||(2302718-2303313)
chr2 (1-596)||(2309430-2310031)
chr2 (1-596)||(2293099-2293700)
chr2 (1-562)||(2330022-2330583)
chr2 (1-557)||(2326312-2326868)
chr2 (1-596)||(2350288-2350889)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (10-551)||(41126345-41126883)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2321014 - 2320419
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2321014 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactctaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 2320915  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2320914 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 2320815  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2320814 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaacagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 2320715  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcagattccgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  2320714 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaatacagcataacgaaagtgagaaacgaccgtaatagaatcctcagattccgatg 2320615  T
Q  401 cagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2320614 cagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacg 2320515  T
Q  501 acggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctctggggcgatc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2320514 acggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctacggggcgatc 2320419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2303313 - 2302718
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2303313 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactctagaagagtatctgcatacgaaacaacagtattaacattgt 2303214  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2303213 tcaatttactctccttaacttgtttcctcgctcttatcagcggaagtagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactccttccatcggttacg 2303114  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2303113 caacaaaatccttgtaactttcggccagaaattcagtatattgaatctgccgatatttaacataattgtcatttgcacacgctcaatatcactgatattc 2303014  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcagattccgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2303013 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaagctaaacatagcataacgaaagggagaaacaaccgtgacagaatctgcagattccgatg 2302914  T
Q  401 cagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacg 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2302913 cggttttgagacggttgatgagagtgtgtaacacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggaaggatgaagtatctcggaagcaaggttacg 2302814  T
Q  501 acggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctctggggcgatc 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2302813 acggagggtacgccatgttgggccataaaaaccggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattttggaagtaggaaaagctttagggcgatc 2302718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2310031 - 2309430
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  2310031 caaagattaaccatttcattctcactcagcttccgtttctcctcaggctactctaactctaaaagagtatctgcatatgaaacaacagtattaacattgt 2309932  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2309931 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccattggttacg 2309832  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2309831 cgacaaaatccttgtaactttcggccagaaattcagtttattgaatctgccaaaatttaacataatcttcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 2309732  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatc------tgcagatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    ||||| |  | |||| ||| ||||||      | | ||||    
T  2309731 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaagagaacatagcatatttgaagtgtggcataaccttaatagaatccgttggttccgatt 2309632  T
Q  395 ccgatgcagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaag 494  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2309631 ctgatgcagttttgagacggttgatgagagtgcgtaagacccacttctgaatttctgagaacgatttgagtttggatggatgaagcatctcgaaagcaag 2309532  T
Q  495 gttacgacggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctctggggcga 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2309531 gttacgacggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggtgttgatgttgtgttggttgctggacaacattttggaagtaggaagagctgtagggcga 2309432  T
Q  595 tc 596  Q
    ||    
T  2309431 tc 2309430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2293700 - 2293099
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  2293700 caaagattaaccatttcattctcactcagcttccgtttctcctcaggccactctaactctaagagagtatctgcatatgaaacaacagtattaatattgt 2293601  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2293600 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccattggttacg 2293501  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2293500 caacaaaatccttgtaactttcggccagaagttcagtttattgaatctgccaaaatttaacataatcttcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 2293401  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatc------tgcagatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    ||||| |  | |||| ||| ||||||      | | ||||    
T  2293400 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaagagaacatagcatatttgaagtgtggcataaccttaatagaatccgttagttccgatt 2293301  T
Q  395 ccgatgcagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaag 494  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2293300 ctgatgcagttttgagacgattgatgagagtgcgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttgagtttggatggatgaagcatctcggaagcaag 2293201  T
Q  495 gttacgacggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctctggggcga 594  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2293200 gttacgacgaagggtacgccatgttgggccataataagcggtgttgatgttgtgttggttgctggacaacattttggaagtaggaagagctgtagggcga 2293101  T
Q  595 tc 596  Q
    ||    
T  2293100 tc 2293099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2330583 - 2330022
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||    
T  2330583 caaagactaatcatttcatcctcactcaatttccgtttctcctgaggcaactccaactccataagagtatctacatacgaaacaacagtattaatattgt 2330484  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||||| |||||||| |||||    
T  2330483 tcaatctactctccttaacatgcttcctcgctcttatcagcggaagcagaacatcttcttgatctttaagcaacttcgccaactcatcccatcgtttacg 2330384  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  2330383 caacaaaatccttgtaactttcggccagaaattcagtatattaaatctgctaaaattcaacagaatcgtcctttgtacacgctcaatatcgttaattttc 2330284  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcagattccgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2330283 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaatacagcataacgaaagtgagaaacgaccgtaacagaatcctcagattccgatg 2330184  T
Q  401 cagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2330183 cagttttgagacggttgatgagagtctgcagaacccacttccgaatttcagagaatgatttgatcttagatggatgaagcatctcggaggcgaggttacg 2330084  T
Q  501 acggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggaca 562  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2330083 acggagagtacgccatgttggtccataaaaagcggagctgatattgtgctggttgctggaca 2330022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2326868 - 2326312
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||   |||||||||||||  ||||| |||||  | || |||||||| |||||| ||||||    
T  2326868 caaagactaaccatttcatcctcagtcaacttccgtttttccattggcaactccaactccaaaagtgtatccacgtaggaaacaacagtattagcattgt 2326769  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || | ||| |||| || ||||||||| | |||||    
T  2326768 tcaatttagtctccttaacttgcttcctccctcttatcagcggaagcaaaacatcttcttgatctctacgcaacatcaacaattcctcccattgtttacg 2326669  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  2326668 caacaaaatccatgcaacttttggccagaaatgcagtatattgaatctgctaaccttcaacaaaagtgtcctttgtacacgctcaatatcattaattttt 2326569  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcagattccgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  2326568 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacagaacatagcataatgaaagtgtggaataactgtaacataatctgtagattctgatg 2326469  T
Q  401 cagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacg 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  2326468 caattttgagacggttgatgagagtgtgtagaacccacttccgaatttcagagaatgatttgatcttggatggatgaagcatctcagaggcgaggttacg 2326369  T
Q  501 acggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgct 557  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2326368 acggagggtacaccatgttgggccataaaaagcggcgctgatgttgtgctggttgct 2326312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2350889 - 2350288
Alignment:
Q  1 caaagattaaccatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| || |  ||| ||||||    
T  2350889 caaagactaaccatttcatcttcactcaatttccgtttctcatcaggcaactccaactccaaaagagtatccacatacgaaactacagggttaacattgt 2350790  T
Q  101 tcaatttactctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacg 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || |     
T  2350789 tcaatctactctctttaacttgcttcctcgctctaatcagcggaagcaaaacatcttcttgatcctttcgtaacttcaacaactcttcccatcgtttgca 2350690  T
Q  201 caacaaaatccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 300  Q
     ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| | |||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2350689 aaacaaaatccgagtaacttttggccagaaatttattatattgaatttgttaacactcaacagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttc 2350590  T
Q  301 tcatcgttaactctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcag------att 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    ||||| |  | |||  ||| | |||| || |      |||    
T  2350589 tcatcattaactctttcaccaaaacacatgaaaacaagtaaacagaacatagcatagttgaagtgtggcataactttaatataatcagctgtttccaatt 2350490  T
Q  395 ccgatgcagttttgagacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaag 494  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2350489 cggatgcagttttgagacggttgatgagagtgtgtaggacccacttacggatttctgagaaagatttgatcttagatggatgaagcatctcagaagcaag 2350390  T
Q  495 gttacgacggagggtacgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggacaacattatggaagtaggaagagctctggggcga 594  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||| ||||||    
T  2350389 gtttcgacggagggcacgccatgttgcaccataaaaagcggagctgatgttgtgttggttgctggagatgattttggcggtgggaagagctctagggcga 2350290  T
Q  595 tc 596  Q
    ||    
T  2350289 tc 2350288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41126883 - 41126345
Alignment:
Q  10 accatttcattctcactcaactttcgtttctcctcgggcaactccaactttaaaagagtatctgcatacgaaacaactgtattatcattgttcaatttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||| ||||| | |    
T  41126883 accatttcatcttcactcagcttgcgtttctcctcgggcaactccaattccaaaagagtatctgcataggaaacaac---attgtttttgctcaatctcc 41126787  T
Q  110 tctccttaacttgcttccttgctcttatcagcggaagcagaacatcctcttgatccttaagtaacttcaaaaactcctcccatcggttacgcaacaaaat 209  Q
    | |||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  41126786 tttccttggcttccttcctcgctcttattagcggaagtagaacatcttcttgatcttttcgcaacttcaacaattcctcccatcgtttacggaataaaat 41126687  T
Q  210 ccttgtacctttcggccaaaaattcagtatattgaatctgctaatattcaatagaattgtcctttgtacacgctcaatatcactgattttctcatcgtta 309  Q
    ||  ||  |||| ||  | | |||||  || |||||| || | | |   |  |||| || |||||||||| | || || || |||||||| ||||| |||    
T  41126686 ccgagtcactttgggaaagatattcaaaatgttgaatttgttgagacctatcagaagtgccctttgtacaagttcgatgtcgctgattttatcatcatta 41126587  T
Q  310 actctttcaccaaaacacataaaaacaagtaaacaaaacatagcataacgaaagtgagaaacaaccgtaacagaatctgcagattccgatgcagttttga 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||| |||   ||||||  | |  ||||| |  ||||| || |    ||| |    
T  41126586 actcgttcaccaaaacacataaaaacgagtaagcaaaacattgcatattgaaggtggtcaacaactttgatcgaatcagtggattctgaagataatttaa 41126487  T
Q  410 gacggttgatgagagtgtgtaagacccacttccgaatttctgagaacgatttggttttggatggatgaagcatctcggaagcaaggttacgacggagggt 509  Q
    |||||| || ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||     ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  41126486 gacggtcgaggagggtttgcaagacccacttgcgaatttcggagaaggacttggcacgagatgggtgaagcatctcagcggcaaggttacgacgtagggt 41126387  T
Q  510 acgccatgttgggccataaaaagcggagctgatgttgtgttg 551  Q
    ||||||||| |  |||||| |||| | | ||||| |||||||    
T  41126386 acgccatgtagctccataagaagcagtgttgatggtgtgttg 41126345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University