View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0447-Insertion-20 (Length: 805)

Name: NF0447-Insertion-20
Description: NF0447
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0447-Insertion-20
NF0447-Insertion-20
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (368-800)||(52040681-52041108)
chr3 (370-800)||(53228911-53229336)
chr3 (370-800)||(46297521-46297945)
chr3 (8-337)||(887581-887909)
chr3 (364-799)||(4015447-4015875)
chr3 (367-804)||(37157698-37158129)
chr3 (497-800)||(22622477-22622780)
chr3 (368-799)||(33378545-33378967)
chr3 (367-800)||(37203057-37203485)
chr3 (383-795)||(11357145-11357535)
chr3 (368-799)||(26941020-26941445)
chr3 (387-801)||(3362262-3362673)
chr3 (361-798)||(39282637-39283067)
chr3 (368-800)||(40552018-40552444)
chr3 (368-799)||(48354932-48355357)
chr3 (479-797)||(42505837-42506155)
chr3 (495-796)||(33698265-33698566)
chr3 (479-774)||(44891593-44891888)
chr3 (368-765)||(22450959-22451350)
chr3 (368-759)||(7327282-7327668)
chr3 (429-799)||(2007985-2008355)
chr3 (496-799)||(32373583-32373885)
chr3 (384-799)||(21193613-21194023)
chr3 (501-792)||(1089811-1090102)
chr3 (368-801)||(11466815-11467228)
chr3 (405-797)||(47481550-47481937)
chr3 (479-767)||(24707907-24708197)
chr3 (479-799)||(21009561-21009882)
chr3 (400-798)||(22445826-22446217)
chr3 (383-801)||(29099361-29099765)
chr3 (479-801)||(25579835-25580157)
chr3 (398-736)||(34132956-34133288)
chr3 (492-800)||(36012246-36012557)
chr3 (479-759)||(24488762-24489042)
chr3 (391-767)||(44186308-44186663)
chr3 (492-793)||(54505916-54506218)
chr3 (479-774)||(3654984-3655282)
chr3 (479-769)||(4761438-4761729)
chr3 (494-800)||(14586439-14586735)
chr3 (479-774)||(29163914-29164193)
chr3 (492-799)||(43975652-43975955)
chr3 (479-730)||(46994490-46994741)
chr3 (367-698)||(45174493-45174821)
chr3 (383-801)||(40935997-40936391)
chr3 (494-681)||(43348368-43348555)
chr3 (569-800)||(11356917-11357140)
chr3 (479-736)||(38591794-38592051)
chr3 (492-714)||(54828546-54828768)
chr3 (479-753)||(27480164-27480459)
chr3 (540-797)||(20373025-20373263)
chr3 (587-799)||(51212537-51212743)
chr3 (485-698)||(11835494-11835702)
chr3 (368-638)||(35844317-35844581)
chr3 (593-764)||(50475021-50475199)
chr3 (367-585)||(51212955-51213167)
chr3 (165-362)||(31879613-31879805)
chr3 (479-615)||(53176150-53176286)
chr3 (713-799)||(35844577-35844663)
chr3 (366-555)||(20373300-20373483)
chr3 (588-696)||(53811597-53811701)
chr3 (365-447)||(44891495-44891576)
chr3 (737-798)||(34133312-34133373)
chr3 (491-526)||(53811695-53811730)
chr3 (725-767)||(43348556-43348598)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (368-799)||(16415641-16416067)
chr1 (383-796)||(4330290-4330699)
chr1 (405-801)||(32216088-32216478)
chr1 (368-799)||(2959744-2960169)
chr1 (366-796)||(27266959-27267378)
chr1 (384-799)||(27532737-27533144)
chr1 (383-800)||(47279200-47279612)
chr1 (367-793)||(38823209-38823629)
chr1 (492-799)||(19899523-19899831)
chr1 (368-799)||(34012137-34012557)
chr1 (367-799)||(7078818-7079255)
chr1 (479-797)||(15168197-15168515)
chr1 (479-799)||(8222229-8222549)
chr1 (369-800)||(14758038-14758454)
chr1 (479-766)||(27227273-27227560)
chr1 (368-800)||(15382929-15383356)
chr1 (389-801)||(9902807-9903213)
chr1 (368-799)||(10181762-10182188)
chr1 (368-798)||(30254420-30254843)
chr1 (365-799)||(15752022-15752450)
chr1 (368-801)||(32267030-32267457)
chr1 (367-799)||(47682249-47682674)
chr1 (479-799)||(22170812-22171132)
chr1 (479-771)||(51128960-51129250)
chr1 (389-800)||(10922744-10923149)
chr1 (479-800)||(23999448-23999770)
chr1 (479-793)||(27563666-27563980)
chr1 (492-799)||(46931525-46931831)
chr1 (494-805)||(37451401-37451712)
chr1 (479-755)||(25160733-25161010)
chr1 (383-771)||(28564566-28564946)
chr1 (479-754)||(30326751-30327027)
chr1 (394-767)||(238300-238666)
chr1 (383-800)||(11742122-11742515)
chr1 (368-801)||(1547283-1547694)
chr1 (492-801)||(28769766-28770074)
chr1 (361-759)||(42721028-42721417)
chr1 (368-798)||(39393379-39393804)
chr1 (492-793)||(27763071-27763373)
chr1 (383-800)||(3534943-3535345)
chr1 (366-759)||(3309142-3309535)
chr1 (367-774)||(31621328-31621734)
chr1 (400-771)||(40884841-40885207)
chr1 (479-800)||(33725365-33725675)
chr1 (570-801)||(48353735-48353965)
chr1 (370-774)||(41926161-41926552)
chr1 (479-740)||(18422752-18423006)
chr1 (368-754)||(37618705-37619076)
chr1 (570-749)||(1359740-1359919)
chr1 (383-656)||(48620648-48620906)
chr1 (615-804)||(31962853-31963043)
chr1 (609-774)||(21289831-21289996)
chr1 (497-681)||(38759652-38759836)
chr1 (710-800)||(48620921-48621011)
chr1 (734-801)||(38759846-38759913)
chr1 (383-521)||(21289676-21289815)
chr1 (752-801)||(47555092-47555141)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (368-800)||(3879697-3880123)
chr6 (369-799)||(20768087-20768507)
chr6 (365-799)||(7234791-7235221)
chr6 (494-799)||(6090941-6091247)
chr6 (370-759)||(21016917-21017294)
chr6 (368-798)||(1945833-1946260)
chr6 (368-800)||(4318574-4319007)
chr6 (368-801)||(5627391-5627819)
chr6 (368-791)||(8513233-8513638)
chr6 (367-774)||(33892796-33893187)
chr6 (370-774)||(29182165-29182561)
chr6 (370-764)||(6088910-6089286)
chr6 (370-663)||(30353253-30353540)
chr6 (366-771)||(33618832-33619230)
chr6 (384-643)||(15491631-15491884)
chr6 (635-797)||(7054533-7054696)
chr6 (479-634)||(7055139-7055294)
chr6 (383-505)||(18498448-18498565)
chr6 (700-755)||(33724062-33724117)
chr6 (752-800)||(6613656-6613704)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (368-800)||(16446640-16447066)
chr8 (368-799)||(38643977-38644402)
chr8 (383-801)||(37970283-37970695)
chr8 (368-767)||(27082636-27083029)
chr8 (368-800)||(34894966-34895387)
chr8 (368-800)||(36694731-36695157)
chr8 (366-767)||(6098311-6098711)
chr8 (383-800)||(11727038-11727450)
chr8 (367-800)||(5299711-5300138)
chr8 (368-800)||(43643360-43643786)
chr8 (479-801)||(1149396-1149718)
chr8 (368-799)||(1204926-1205351)
chr8 (500-799)||(4132452-4132750)
chr8 (398-796)||(465871-466253)
chr8 (479-804)||(7890718-7891043)
chr8 (478-799)||(33906315-33906634)
chr8 (479-793)||(1953760-1954076)
chr8 (398-799)||(12876138-12876534)
chr8 (479-799)||(16222967-16223290)
chr8 (394-771)||(40862444-40862816)
chr8 (365-767)||(23854229-23854625)
chr8 (479-801)||(30654347-30654669)
chr8 (479-793)||(39098891-39099205)
chr8 (497-799)||(8803582-8803885)
chr8 (369-798)||(31933653-31934076)
chr8 (479-774)||(35459502-35459797)
chr8 (479-774)||(44869601-44869896)
chr8 (398-736)||(9864177-9864509)
chr8 (367-799)||(10554970-10555394)
chr8 (367-680)||(13307621-13307927)
chr8 (604-796)||(34951826-34952018)
chr8 (604-800)||(35859163-35859359)
chr8 (609-774)||(12587816-12587981)
chr8 (483-659)||(41910895-41911070)
chr8 (530-794)||(18259238-18259498)
chr8 (556-759)||(24823200-24823395)
chr8 (569-729)||(1149756-1149912)
chr8 (630-801)||(33198057-33198228)
chr8 (497-645)||(43025824-43025972)
chr8 (684-798)||(41362731-41362845)
chr8 (368-580)||(1150090-1150296)
chr8 (368-567)||(41362517-41362707)
chr8 (398-568)||(34952028-34952192)
chr8 (687-759)||(43025986-43026058)
chr8 (575-651)||(7998478-7998554)
chr8 (482-568)||(7998401-7998488)
chr8 (609-696)||(34463708-34463792)
chr8 (364-451)||(33906219-33906306)
chr8 (556-612)||(12585297-12585353)
chr8 (737-798)||(9864533-9864594)
chr8 (727-800)||(13307931-13308004)
chr8 (384-436)||(24823395-24823447)
chr8 (479-521)||(33197953-33197995)
chr8 (747-797)||(34686107-34686156)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (367-799)||(15612520-15612945)
chr7 (366-799)||(5657241-5657669)
chr7 (367-799)||(37109846-37110274)
chr7 (368-800)||(18797304-18797728)
chr7 (366-801)||(8861258-8861687)
chr7 (366-799)||(10358975-10359402)
chr7 (368-799)||(17842345-17842772)
chr7 (369-797)||(24211717-24212140)
chr7 (368-800)||(30055501-30055928)
chr7 (491-799)||(6546611-6546919)
chr7 (504-796)||(9355590-9355882)
chr7 (368-801)||(21991611-21992029)
chr7 (383-796)||(23111180-23111589)
chr7 (361-798)||(27283712-27284145)
chr7 (368-759)||(32820854-32821239)
chr7 (479-793)||(31578831-31579145)
chr7 (383-799)||(41764839-41765249)
chr7 (479-798)||(32432532-32432851)
chr7 (367-801)||(4582893-4583321)
chr7 (507-783)||(46480906-46481182)
chr7 (383-767)||(22687229-22687599)
chr7 (384-799)||(48928058-48928466)
chr7 (367-774)||(37346996-37347396)
chr7 (507-801)||(37703257-37703551)
chr7 (491-799)||(15672518-15672831)
chr7 (370-792)||(25691311-25691729)
chr7 (368-804)||(7334769-7335198)
chr7 (493-783)||(10481699-10481989)
chr7 (551-799)||(35353260-35353508)
chr7 (491-800)||(44598758-44599067)
chr7 (398-800)||(26980328-26980707)
chr7 (479-754)||(11071286-11071558)
chr7 (393-799)||(29173540-29173922)
chr7 (383-800)||(31520501-31520894)
chr7 (398-730)||(12165757-12166074)
chr7 (369-705)||(33688117-33688446)
chr7 (528-800)||(26587852-26588116)
chr7 (398-799)||(12390410-12390786)
chr7 (368-681)||(43686016-43686322)
chr7 (479-759)||(43925182-43925455)
chr7 (479-670)||(38258625-38258816)
chr7 (369-655)||(48928469-48928748)
chr7 (591-796)||(44411304-44411509)
chr7 (604-800)||(37704387-37704583)
chr7 (495-771)||(32592996-32593254)
chr7 (483-629)||(37704241-37704387)
chr7 (400-627)||(27421313-27421533)
chr7 (687-799)||(38258867-38258979)
chr7 (612-769)||(34361967-34362126)
chr7 (408-588)||(44413351-44413525)
chr7 (575-689)||(38053637-38053751)
chr7 (725-799)||(12166215-12166289)
chr7 (368-521)||(26524366-26524513)
chr7 (366-471)||(34362232-34362336)
chr7 (365-416)||(23402371-23402422)
chr7 (368-451)||(31579172-31579255)
chr7 (642-718)||(27421207-27421283)
chr7 (368-416)||(40381940-40381988)
chr7 (734-800)||(33688052-33688118)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (383-799)||(22980808-22981218)
chr5 (370-783)||(699152-699559)
chr5 (368-800)||(19119859-19120285)
chr5 (400-801)||(38527985-38528379)
chr5 (368-783)||(8741651-8742062)
chr5 (366-800)||(35511231-35511654)
chr5 (368-798)||(12910350-12910779)
chr5 (366-800)||(40133383-40133811)
chr5 (366-799)||(23115980-23116399)
chr5 (394-800)||(22255207-22255608)
chr5 (367-801)||(36866761-36867189)
chr5 (389-774)||(5837576-5837955)
chr5 (365-798)||(31786397-31786824)
chr5 (383-799)||(33908248-33908657)
chr5 (370-799)||(25500676-25501099)
chr5 (368-800)||(27330306-27330730)
chr5 (383-800)||(22019647-22020049)
chr5 (383-799)||(27318238-27318647)
chr5 (494-799)||(31705362-31705667)
chr5 (368-798)||(39572819-39573235)
chr5 (400-795)||(36860455-36860845)
chr5 (479-800)||(35934000-35934322)
chr5 (479-788)||(15992301-15992610)
chr5 (479-771)||(35504470-35504762)
chr5 (493-799)||(17157781-17158087)
chr5 (368-793)||(22973838-22974257)
chr5 (494-799)||(42342851-42343146)
chr5 (494-774)||(7208639-7208919)
chr5 (368-759)||(35826276-35826658)
chr5 (368-798)||(9200233-9200648)
chr5 (400-797)||(32563181-32563563)
chr5 (383-759)||(30969114-30969484)
chr5 (514-796)||(5830032-5830314)
chr5 (367-774)||(7693229-7693621)
chr5 (383-799)||(8436981-8437390)
chr5 (479-800)||(23954551-23954859)
chr5 (400-800)||(24886136-24886513)
chr5 (523-800)||(2888194-2888471)
chr5 (366-800)||(14409090-14409503)
chr5 (528-795)||(25669740-25669997)
chr5 (363-767)||(15724485-15724881)
chr5 (496-797)||(13956116-13956415)
chr5 (479-801)||(43308408-43308722)
chr5 (368-774)||(14919314-14919704)
chr5 (588-800)||(25889584-25889796)
chr5 (479-759)||(21088559-21088836)
chr5 (407-800)||(28416300-28416663)
chr5 (426-701)||(6824329-6824598)
chr5 (389-774)||(8466766-8467126)
chr5 (383-725)||(1428983-1429305)
chr5 (383-643)||(26268089-26268343)
chr5 (673-799)||(43254154-43254280)
chr5 (368-616)||(5112247-5112488)
chr5 (639-801)||(26269074-26269236)
chr5 (568-619)||(11898148-11898199)
chr5 (405-521)||(25668687-25668796)
chr5 (749-800)||(34853844-34853895)
chr5 (368-449)||(13956439-13956520)
chr5 (744-800)||(1428922-1428978)
chr5 (370-450)||(11898004-11898084)
chr5 (756-799)||(11898197-11898240)
chr5 (752-795)||(27579363-27579406)
chr5 (365-445)||(16004474-16004555)
chr5 (368-449)||(35933902-35933983)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (370-800)||(17167715-17168139)
chr4 (370-800)||(17173292-17173716)
chr4 (366-799)||(28002772-28003199)
chr4 (368-799)||(19089239-19089664)
chr4 (370-800)||(36493474-36493897)
chr4 (366-799)||(49375964-49376392)
chr4 (368-799)||(25700842-25701268)
chr4 (368-800)||(35020816-35021246)
chr4 (479-773)||(33341504-33341797)
chr4 (366-799)||(55240891-55241317)
chr4 (368-800)||(25184113-25184539)
chr4 (361-801)||(47253742-47254167)
chr4 (384-796)||(7703533-7703931)
chr4 (479-800)||(37663526-37663847)
chr4 (365-757)||(34947923-34948311)
chr4 (394-797)||(46887946-46888342)
chr4 (362-799)||(19440434-19440866)
chr4 (368-800)||(34361276-34361702)
chr4 (368-801)||(29583984-29584409)
chr4 (363-759)||(55477717-55478111)
chr4 (368-799)||(879334-879759)
chr4 (389-800)||(23761093-23761497)
chr4 (368-801)||(32912363-32912791)
chr4 (384-800)||(33816301-33816728)
chr4 (479-799)||(6864140-6864460)
chr4 (368-799)||(32579444-32579871)
chr4 (496-798)||(3042741-3043043)
chr4 (482-759)||(1815409-1815686)
chr4 (400-798)||(37775701-37776082)
chr4 (494-774)||(50697361-50697642)
chr4 (383-797)||(50764747-50765143)
chr4 (494-800)||(17272084-17272390)
chr4 (370-797)||(27396618-27397037)
chr4 (507-799)||(30002427-30002710)
chr4 (369-799)||(4597994-4598407)
chr4 (398-793)||(32592123-32592503)
chr4 (383-799)||(5047752-5048161)
chr4 (368-800)||(37287733-37288155)
chr4 (479-801)||(42199834-42200157)
chr4 (479-783)||(9139350-9139636)
chr4 (571-774)||(7152015-7152218)
chr4 (405-774)||(4934023-4934375)
chr4 (368-673)||(38011854-38012153)
chr4 (609-801)||(4205219-4205411)
chr4 (604-793)||(39400238-39400427)
chr4 (572-800)||(26896285-26896514)
chr4 (645-800)||(23431826-23431981)
chr4 (636-773)||(35025379-35025515)
chr4 (523-767)||(46883932-46884170)
chr4 (507-651)||(35025530-35025674)
chr4 (393-651)||(54499172-54499425)
chr4 (684-801)||(38012572-38012689)
chr4 (361-580)||(39397911-39398115)
chr4 (615-678)||(56050171-56050234)
chr4 (368-450)||(7152235-7152317)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (370-798)||(11908-12332)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (368-802)||(4166922-4167350)
chr2 (479-799)||(41960945-41961265)
chr2 (405-798)||(43648024-43648411)
chr2 (368-797)||(31570514-31570937)
chr2 (368-799)||(19424420-19424831)
chr2 (370-797)||(3176941-3177362)
chr2 (383-800)||(4763643-4764058)
chr2 (491-797)||(44913780-44914090)
chr2 (368-800)||(2325155-2325573)
chr2 (479-799)||(29241923-29242236)
chr2 (398-800)||(33660154-33660541)
chr2 (400-794)||(33709015-33709403)
chr2 (365-759)||(33550801-33551192)
chr2 (398-799)||(19289101-19289496)
chr2 (479-774)||(41465606-41465901)
chr2 (479-800)||(18494058-18494378)
chr2 (367-801)||(26357576-26358004)
chr2 (483-801)||(31861961-31862279)
chr2 (479-800)||(11366157-11366479)
chr2 (400-800)||(43770623-43771010)
chr2 (500-799)||(35959023-35959317)
chr2 (368-796)||(39167150-39167566)
chr2 (479-771)||(37905813-37906108)
chr2 (400-801)||(27349729-27350109)
chr2 (368-727)||(4263926-4264280)
chr2 (369-768)||(13711465-13711853)
chr2 (428-774)||(5881599-5881929)
chr2 (405-726)||(4478406-4478717)
chr2 (366-713)||(19313850-19314186)
chr2 (370-706)||(44285951-44286281)
chr2 (479-679)||(45327825-45328025)
chr2 (491-792)||(7006723-7007007)
chr2 (569-766)||(19500726-19500923)
chr2 (370-679)||(36641988-36642293)
chr2 (492-668)||(17071646-17071822)
chr2 (390-648)||(41463779-41464031)
chr2 (492-668)||(17054005-17054181)
chr2 (515-666)||(18258198-18258349)
chr2 (392-627)||(33902092-33902319)
chr2 (616-797)||(41051083-41051260)
chr2 (712-800)||(45328028-45328115)
chr2 (659-774)||(18257341-18257456)
chr2 (684-798)||(33902324-33902439)
chr2 (655-759)||(41463408-41463512)
chr2 (479-557)||(19501760-19501837)
chr2 (730-801)||(4263685-4263756)
chr2 (703-748)||(17053960-17054005)
chr2 (703-748)||(17071601-17071646)
chr2 (367-444)||(41465508-41465585)
chr2 (383-451)||(18494388-18494456)
chr2 (367-432)||(31861894-31861959)
chr2 (368-416)||(6177775-6177823)
chr2 (479-519)||(41051263-41051303)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (370-800)||(7889-8313)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (398-800)||(43987-44382)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (398-800)||(154405-154800)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (494-765)||(408223-408494)
scaffold0002 (368-759)||(134-513)
scaffold0002 (615-799)||(93861-94044)
scaffold0002 (388-607)||(94335-94548)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (370-800)||(145774-146199)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (479-799)||(267389-267701)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (368-451)||(42348-42431)
scaffold0009 (652-719)||(100993-101058)
scaffold0009 (595-632)||(100948-100985)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (366-417)||(12137-12188)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 52041108 - 52040681
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52041108 ggaaaattctgaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtg 52041009  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  52041008 gcatca-----aaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata 52040914  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52040913 ccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 52040814  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040813 ttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 52040714  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  52040713 gtcagttgtatgactgcagcgtagaagctccct 52040681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 53229336 - 53228911
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||    
T  53229336 aaaattttaaggtgaagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgc 53229237  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || |     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  53229236 atca-----aaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactcc 53229142  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  53229141 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgtt 53229042  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53229041 gcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaaat 53228942  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53228941 cagttgcctgactgcaccgtagaagctccct 53228911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297521
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||| || | |||||||| | ||||    
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacacc-actgtttgtacaatggc 46297847  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
     | ||||     |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46297846 gtcaaaa-----gttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 46297752  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  46297751 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgtt 46297652  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46297651 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 46297552  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  46297551 cagttttttgactgcaccgtagaagctccct 46297521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 887581 - 887909
Alignment:
Q  8 ttggtgtcaacagctttatctatgaaggataagataatgatttttgacaacgagagaaagcaaattggatgggtccctgacgattgtactaaacttcccc 107  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  887581 ttggtgtcaacagctctctctatgagagataagataatgatttttgacaacgagaaaaagcagattggatgggttccagacgattgtactaaacttcccc 887680  T
Q  108 agcatcgttggtcgcttgaggcttaagaggaaggatatggataatggcaagattgaataaaatagatacacttcttgcattgtactagccttaaataaat 207  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  887681 cacatcgttgatcgattgaggcttaagagggaggatatggataatggcaagattgaataaaatagatacacttcttgtattttactagccttaaataaat 887780  T
Q  208 tgcattccccctcaaaagaattaacattataatatatgataatagaatttcaataaatatttgattgttgagttatttcttcatttttctctattctaat 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  887781 tgcattcctcctcaaaagaattaacattataatatatgataatagaatttcaataaatattttattgttgagttatttcttcatttttctctattctaat 887880  T
Q  308 aatccaactcatcacttgtgttgagtgtat 337  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  887881 aat-caactcgccacttgtgttgagtgtat 887909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 364 - 799
Target Start/End: Original strand, 4015447 - 4015875
Alignment:
Q  364 atatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtat 463  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||     
T  4015447 atatggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccca-actgtttgtag 4015545  T
Q  464 agtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgt 563  Q
    |||| ||| ||||     ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015546 agtgacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgt 4015640  T
Q  564 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4015641 aacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaa 4015739  T
Q  664 gatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaa 763  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4015740 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaa 4015839  T
Q  764 aaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  4015840 aaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 4015875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 367 - 804
Target Start/End: Original strand, 37157698 - 37158129
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| |||  ||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  37157698 tggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacacccc-actgtt-gtacagt 37157795  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| ||||     ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  37157796 ggcatcaaaa-----gttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaac 37157890  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactct-gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  37157891 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaata 37157990  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37157991 tgtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaa 37158090  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccctactt 804  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37158091 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccctactt 37158129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 497 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622477
Alignment:
Q  497 tatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  597 acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactatt 696  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 22622581  T
Q  697 gatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22622580 gatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtaaaagct 22622481  T
Q  797 ccct 800  Q
    ||||    
T  22622480 ccct 22622477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 33378967 - 33378545
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||    
T  33378967 ggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtacccc-aatatttgtacggtg 33378872  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33378871 acatcaaaa-----gttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 33378777  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33378776 ccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatg 33378677  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  33378676 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaa 33378577  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33378576 gtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 33378545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 367 - 800
Target Start/End: Original strand, 37203057 - 37203485
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| || | ||| | |||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  37203057 tggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacacccc-actgtttgtacagt 37203155  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| |     |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  37203156 ggcatca-----aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatc 37203250  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaact-ctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  37203251 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaata 37203350  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    | | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37203351 tatcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaa 37203450  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37203451 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 37203485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 383 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 11357535 - 11357145
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||     |    
T  11357535 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaa-----g 11357441  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||                  
T  11357440 ttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac-------------- 11357355  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
       ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11357354 ---ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 11357258  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11357257 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgtctgact 11357158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 26941445 - 26941020
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| | || ||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  26941445 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacacccc-actgtttgtataatg 26941347  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |    
T  26941346 acatca-----aaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaata 26941252  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26941251 cctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 26941152  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26941151 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 26941052  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26941051 gtcagttttctgactgcaccgtagaagctccc 26941020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 387 - 801
Target Start/End: Original strand, 3362262 - 3362673
Alignment:
Q  387 ttatgagaataacttttct-ggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttc 485  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||  |||| || | |||||||||||| ||| | | |||||| |||||||| ||||     ||||    
T  3362262 ttatgaaaataactttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatccc-actatttgtacagtggcatcaaaa-----gttc 3362355  T
Q  486 agtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaact--taatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    | ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3362356 actcctcatggtatcatcaattcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaac 3362455  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttc 683  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||||      
T  3362456 acttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactgg 3362555  T
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3362556 atgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactg 3362655  T
Q  784 taccgtagaagctcccta 801  Q
     ||| |||||||||||||    
T  3362656 caccatagaagctcccta 3362673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 361 - 798
Target Start/End: Original strand, 39282637 - 39283067
Alignment:
Q  361 tttatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| |||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||     
T  39282637 tttataaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaatacccc-actgttta 39282734  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || |||||||| ||||     |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39282735 tacagtggcatcaaaa-----gttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaag 39282829  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||    
T  39282830 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatc 39282929  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttc 760  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  39282930 caaaatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 39283029  T
Q  761 caaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39283030 caaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 39283067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 40552444 - 40552018
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| || |  ||||||| | ||    
T  40552444 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactcc-accgtttgtacaatg 40552346  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||    
T  40552345 acatcaaaa-----gttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaaca 40552251  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
     ||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40552250 tcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatg 40552151  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40552150 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 40552051  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40552050 gtcagtttccagactgcaccgtagaagctccct 40552018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 48354932 - 48355357
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  48354932 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacacccc-attgtttgtacaatg 48355030  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  48355031 gcatcaaaa-----gttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaaca 48355125  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  48355126 taccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatg 48355225  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48355226 ttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 48355325  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||| || ||| |||| ||| |||||||||||    
T  48355326 gtcaatttcctaactgcaccatagaagctccc 48355357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 479 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 42506155 - 42505837
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  42506155 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagt 42506056  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42506055 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 42505956  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  42505955 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcct 42505856  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  42505855 gactgcaccgtagaagctc 42505837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 495 - 796
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698566
Alignment:
Q  495 agtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  595 tcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattacta 694  Q
    || ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaata 33698464  T
Q  695 ttgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaag 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | | || ||||||||||    
T  33698465 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataaatgcaccgtagaag 33698564  T
Q  795 ct 796  Q
    ||    
T  33698565 ct 33698566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Original strand, 44891593 - 44891888
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44891593 aaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagt 44891692  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  44891693 gtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcatt 44891792  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  44891793 actagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 44891888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 368 - 765
Target Start/End: Original strand, 22450959 - 22451350
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||    
T  22450959 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctc-actgtttgtatggtg 22451057  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22451058 gcatca-----aaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaaca 22451152  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||  |||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22451153 ccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 22451252  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22451253 ttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 22451350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 368 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 7327668 - 7327282
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaa-cataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | | |||||| |||    
T  7327668 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactcc-attatttgtacagt 7327570  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| || |||  ||||||||    
T  7327569 gacatcaaaa-----gttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaac 7327475  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7327474 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagat 7327375  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  7327374 gttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaactttt 7327282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 429 - 799
Target Start/End: Original strand, 2007985 - 2008355
Alignment:
Q  429 aaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaa 528  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |     |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |    
T  2007985 aaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatca-----aaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaagaatata 2008078  T
Q  529 cttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaa 628  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  2008079 cttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa 2008177  T
Q  629 agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattag-------taatcaacaatt 721  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||       ||||||||||||    
T  2008178 agatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaatcattaatcaacaatt 2008277  T
Q  722 taaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  2008278 taaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgattgcaccgtaaaagctccc 2008355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 496 - 799
Target Start/End: Original strand, 32373583 - 32373885
Alignment:
Q  496 gtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 595  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32373583 gtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactat 32373682  T
Q  596 cacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactat 695  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  32373683 cacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatttctat 32373782  T
Q  696 tgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  32373783 tgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcacgactgtaccgtagaagc 32373881  T
Q  796 tccc 799  Q
    ||||    
T  32373882 tccc 32373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 384 - 799
Target Start/End: Original strand, 21193613 - 21194023
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |   ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |     |||||    
T  21193613 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtagagtgacatca-----aaagt 21193706  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||    
T  21193707 tcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaaggataac 21193806  T
Q  584 actt-aagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||     
T  21193807 acttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattacta 21193906  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  21193907 aatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgact 21194006  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
    | |||||||||||||||    
T  21194007 gcaccgtagaagctccc 21194023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 501 - 792
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1090102
Alignment:
Q  501 atcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    ||||||| ||||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgat 1090009  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  1090010 cattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactacaccgtaga 1090102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Original strand, 11466815 - 11467228
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||| |||  |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  11466815 ggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 11466913  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11466914 gcatca-----aaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata 11467008  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  11467009 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatg 11467108  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||       |  |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  11467109 ttgcaa-------tagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaa 11467194  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  11467195 gtcagtttgatgactgcaccgtagaagctcccta 11467228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 405 - 797
Target Start/End: Original strand, 47481550 - 47481937
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     ||| || |  |||||||||||||    
T  47481550 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtagaatgacatcaaaa-----gtttagccctcatagtatcatca 47481643  T
Q  505 attcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 604  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| || || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47481644 attcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 47481743  T
Q  605 tcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcatt 703  Q
    |||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  47481744 tcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcatt 47481843  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47481844 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgtaccgtagaagctc 47481937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 479 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 24708197 - 24707907
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaactta--atctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaa 576  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24708197 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaa 24708098  T
Q  577 gtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagca 676  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24708097 gtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagca 24707998  T
Q  677 ttacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||| |  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  24707997 ttattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 24707907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 21009882 - 21009561
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||  |||||| | |||||||    
T  21009882 aaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagt 21009783  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21009782 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcatt 21009683  T
Q  679 acttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  21009682 actagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagtttcc 21009583  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  21009582 tgactgcaccgtagaaactccc 21009561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 400 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 22446217 - 22445826
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcac-catagta 498  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| ||||     |||||  | | |||||||    
T  22446217 ttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacacccc--acttttgtacagtggcatcaaaa-----gttcaaaccctcatagta 22446125  T
Q  499 tcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 598  Q
    |||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||     
T  22446124 tcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-acaatgtataacactcaagactatcat 22446026  T
Q  599 ataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattga 698  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  22446025 ataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactattga 22445926  T
Q  699 tcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  22445925 tcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcactatagaagctcc 22445826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 383 - 801
Target Start/End: Original strand, 29099361 - 29099765
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||| |||      |||||    
T  29099361 gaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatc-----taaag 29099454  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099455 ttcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 29099554  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |         | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||     
T  29099555 c---------tttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattacta 29099645  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaaaaagtcagttgcctgac 781  Q
     ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||    
T  29099646 gatgaattaccattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaaagtcagtttcatgac 29099745  T
Q  782 tgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    || |||||||||||||||||    
T  29099746 tgcaccgtagaagctcccta 29099765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 479 - 801
Target Start/End: Original strand, 25579835 - 25580157
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25579835 aaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagt 25579934  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25579935 gtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaagcatt 25580034  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||| || |      
T  25580035 actagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttttaaaaaagtcaatttcaa 25580134  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| || |||||| |||||||    
T  25580135 gactgcactgtagaaactcccta 25580157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 398 - 736
Target Start/End: Original strand, 34132956 - 34133288
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     |||||||| ||||| |    
T  34132956 acttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtccccataat 34133049  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133050 atcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 34133149  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34133150 cataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactagta 34133249  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 736  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133250 atcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 492 - 800
Target Start/End: Original strand, 36012246 - 36012557
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36012246 cataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaag 36012345  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactct-gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat 689  Q
    ||||||| || | |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||||||||  ||||||    
T  36012346 actatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatgaat 36012445  T
Q  690 tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa-ttaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccg 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  36012446 tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccg 36012545  T
Q  789 tagaagctccct 800  Q
    ||||||||||||    
T  36012546 tagaagctccct 36012557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 24489042 - 24488762
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24489042 aaagttcagtccccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggt 24488943  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  24488942 gtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcatt 24488843  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24488842 actagatgcattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttt 24488762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 391 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 44186663 - 44186308
Alignment:
Q  391 gagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtca 490  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| || |||| ||| ||||     ||||||||     
T  44186663 gagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgc-tgtttatacagtgacatcaaaa-----gttcagtcc 44186570  T
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||                   
T  44186569 ccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaa--------------- 44186485  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  44186484 -ctatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaatt 44186386  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaaaaa 767  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  44186385 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttcgaaaaaa 44186308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 492 - 793
Target Start/End: Original strand, 54505916 - 54506218
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54505916 catagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaaga 54506015  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-t 690  Q
    ||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||  |||||| |    
T  54506016 ctatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatat 54506115  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  54506116 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgta 54506215  T
Q  791 gaa 793  Q
    |||    
T  54506216 gaa 54506218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3655282 - 3654984
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||| |    
T  3655282 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaat 3655183  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3655182 gtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcatt 3655083  T
Q  679 act--tcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3655082 actagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagtt 3654984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 479 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 4761729 - 4761438
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc-acaaag 577  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  4761729 aaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaag 4761630  T
Q  578 tgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||  | || |||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||    
T  4761629 tataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacat 4761530  T
Q  678 tacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  4761529 taccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagt 4761438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 494 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14586735 - 14586439
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  14586735 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact------- 14586643  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
      |  || | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  14586642 --cgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattact 14586546  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || || ||| |||||    
T  14586545 actgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcacgagtgcaccatagaa 14586446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Original strand, 29163914 - 29164193
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29163914 aaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagt 29164013  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||         |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29164014 gtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcatt 29164104  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  29164105 actagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtt 29164193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 492 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 43975955 - 43975652
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||         
T  43975955 cataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact----- 43975861  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtt---tgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
      ||| ||||| |||| ||||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    
T  43975860 --atcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaa 43975763  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccg 788  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  43975762 ttaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccg 43975663  T
Q  789 tagaagctccc 799  Q
    ||||| |||||    
T  43975662 tagaaactccc 43975652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 479 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 46994741 - 46994490
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  46994741 aaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccacaaaat 46994642  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  46994641 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcatt 46994542  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatga 730  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46994541 actagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 367 - 698
Target Start/End: Original strand, 45174493 - 45174821
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtg--agtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    ||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  ||||||||  | | |||||||| |    
T  45174493 tggaaaattttatggtgaagttgtgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttc-actgtttgtaca 45174591  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgt 563  Q
    || |||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45174592 gtagcatcaaaa-----gttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgt 45174686  T
Q  564 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 663  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||    
T  45174687 aacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaa 45174786  T
Q  664 gatgttgcaagcattacttcatgaattactattga 698  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45174787 gatgttgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 383 - 801
Target Start/End: Original strand, 40935997 - 40936391
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| | |||||||||| | | ||||| || |||| ||| ||||     |    
T  40935997 gaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctc-attgtttatacagtgacatcaaaa-----g 40936090  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| || || |||                  ||||||||    
T  40936091 ttcagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttttttt------------------aagtgtaa 40936172  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40936173 cacttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattacta 40936272  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||   || |     
T  40936273 gataaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtcaatttgatgtcc 40936372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 494 - 681
Target Start/End: Original strand, 43348368 - 43348555
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43348368 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagact 43348467  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattact 681  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43348468 atcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattact 43348555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 569 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356917
Alignment:
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    |||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 11356949  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11356948 tcagttgtctgactgcaccgtagatgctccct 11356917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 479 - 736
Target Start/End: Original strand, 38591794 - 38592051
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||      
T  38591794 aaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaac 38591893  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  38591894 gtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcatt 38591993  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 736  Q
    | |  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591994 attaaacaaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 492 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 54828768 - 54828546
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54828768 catagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaa 54828669  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatta 691  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  54828668 ctatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaatta 54828569  T
Q  692 ctattgatcattaattagtaatc 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  54828568 ctattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 479 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 27480459 - 27480164
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc------- 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27480459 aaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccagaagtgt 27480360  T
Q  572 -aca-----aagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactct----gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtct 661  Q
     |||     |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27480359 aacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtcc 27480260  T
Q  662 aagatgttg----caagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 753  Q
    || |||||     ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27480259 aaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatta 27480164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 540 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373025
Alignment:
Q  540 tttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacg 639  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
Q  640 ataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 739  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||                   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373163 ataaaatagtacatataagtccaagatg-------------------aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T
Q  740 taagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  20373082 taaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctc 20373025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 587 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212537
Alignment:
Q  587 taagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatg 686  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
Q  687 aattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtac 786  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||    
T  51212643 aattactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcac 51212550  T
Q  787 cgtagaagctccc 799  Q
    | |||||||||||    
T  51212549 catagaagctccc 51212537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835494
Alignment:
Q  485 cagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaat-tttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaac 11835603  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttc 683  Q
    | ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||      ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||      
T  11835602 aattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcat------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaa 11835509  T
Q  684 atgaattactattga 698  Q
    |||||||||||||||    
T  11835508 atgaattactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 368 - 638
Target Start/End: Original strand, 35844317 - 35844581
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||| | | |||||||| ||||    
T  35844317 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctc-actgtttgtacagtg 35844415  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaa-ttttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
     ||| ||||     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35844416 acatcaaaa-----gtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaac 35844510  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 638  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35844511 accctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35844581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 593 - 764
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475199
Alignment:
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattag 50475120  T
Q  693 tattg-------atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    |||||       ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  50475121 tattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaatttttcaaa 50475199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 51213167 - 51212955
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| || |||| |||| |||| |||||||| | |||||||| | |    
T  51213167 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacacccc-actgtttgtacaat 51213069  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| ||||     ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51213068 ggcatcaaaa-----gttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaac 51212974  T
Q  567 accccacaaagtgtaacac 585  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51212973 accccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31879805 - 31879613
Alignment:
Q  165 taaaatagatacacttcttgcattgtactagccttaaataaattgcattccccctcaaaagaattaacattataatatatgataatagaatttcaataaa 264  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  31879805 taaaataaatacacatgttgtattgtactagccttaaataaattgtattcctcaccaaaagaattaacattct-atatatgataatagaaattcaataaa 31879707  T
Q  265 tatttgattgttgagttatttcttcatttttctctattctaataatccaactcatcacttgtgttgagtgtatttttaatacgttgtccataaaactt 362  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  || || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  31879706 tatttgtatgtggagttatttctaca-ttttctctat--taataat-caactcgccatttttgttgagtgtatctttaatacgttgtcaacaaaactt 31879613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 479 - 615
Target Start/End: Original strand, 53176150 - 53176286
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |  |||||| | |||||| |||||||||    
T  53176150 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagt 53176249  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactct 615  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  53176250 gtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactct 53176286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 713 - 799
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844663
Alignment:
Q  713 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcataactgcaccgtaaaagctccc 35844663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20373483 - 20373300
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| ||  | ||||| || ||||| | |||| |||||||||||| |  |||| ||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||| |     
T  20373483 atggaaaattttatagtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacccc-actgtttgtacaa 20373385  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgtt 555  Q
    || ||| ||||     |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20373384 tgacatcaaaa-----gttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
Q  588 aagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatga 687  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  688 attactatt 696  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Original strand, 44891495 - 44891576
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaaca 447  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44891495 tatggaaaattatacggtgaagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaaca 44891576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 737 - 798
Target Start/End: Original strand, 34133312 - 34133373
Alignment:
Q  737 cattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  34133312 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 34133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53811730 - 53811695
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaacta 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53811730 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 53811695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 725 - 767
Target Start/End: Original strand, 43348556 - 43348598
Alignment:
Q  725 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43348556 aaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 43348598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 16415641 - 16416067
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  16415641 ggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacagtg 16415740  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16415741 gcatca-----aaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata 16415835  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16415836 ccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 16415935  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16415936 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaa 16416035  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    || ||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  16416036 gttagttatttgactgcgccgtagaagctccc 16416067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 383 - 796
Target Start/End: Original strand, 4330290 - 4330699
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaa-cataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaa 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |     |||    
T  4330290 gaagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatca-----aaa 4330384  T
Q  482 gttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgta 581  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4330385 gttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgta 4330484  T
Q  582 acacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattact 681  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  4330485 acacttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattact 4330584  T
Q  682 tcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgac 781  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  4330585 agatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttccaaaaaaatcagttgtctgac 4330684  T
Q  782 tgtaccgtagaagct 796  Q
    || ||||||||||||    
T  4330685 tgcaccgtagaagct 4330699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 405 - 801
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216478
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| | |||| | ||||     ||||||||  | |||||||||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacacc-actgtttgtacaatggcgtcaaaa-----gttcagtcctcgtagtatcatca 32216181  T
Q  505 attcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 604  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216182 attcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 32216281  T
Q  605 tcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatta 704  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  32216282 tcataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcatta 32216381  T
Q  705 attagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  32216382 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctcccta 32216478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 2959744 - 2960169
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  2959744 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatccc-actgtttgtacagtg 2959842  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2959843 acatca-----aaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca 2959937  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  2959938 tcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatg 2960037  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2960038 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 2960137  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  2960138 atcagtttcctgactgcaccgtagaagatccc 2960169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 366 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 27267378 - 27266959
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  |  |||  |||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||    
T  27267378 atggaaaattatatgt-gaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtagtgagtgacacccc-actgtttgtacag 27267283  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  27267282 tggcattaaaa-----gttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaa 27267189  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27267188 caccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaaga 27267089  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27267088 tgttgcaagcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttcca-aa 27266990  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  27266989 aagtcagtttcctgaatgcaccatagaagct 27266959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 384 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 27533144 - 27532737
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||| |||||| ||| | | |||||| |||||||| |     |||||    
T  27533144 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaaccc-actctttgtacagtggcatca-----aaagt 27533051  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27533050 tcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaac 27532952  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttc 683  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  27532951 actcaagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 27532852  T
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27532851 atgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactg 27532753  T
Q  784 taccgtagaagctccc 799  Q
     |||||||||||||||    
T  27532752 caccgtagaagctccc 27532737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Original strand, 47279200 - 47279612
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||     |    
T  47279200 gaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatcgaaa-----g 47279293  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  47279294 ttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaa 47279393  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  47279394 cacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattatta 47279493  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaaaaagtcagttgcctgac 781  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||    
T  47279494 gatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaatcagttttatgac 47279593  T
Q  782 tgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || ||||||||||||||||    
T  47279594 tgcaccgtagaagctccct 47279612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 367 - 793
Target Start/End: Original strand, 38823209 - 38823629
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||| | |||||||||||| | | |||||| |||    
T  38823209 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacacccc-actatttgtacagt 38823307  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38823308 gtcatcaaaa-----gttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaac 38823402  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  38823403 acccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaat 38823502  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  38823503 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaa 38823602  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||    
T  38823603 agtcagtttcatgactgcaccgtagaa 38823629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 492 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19899831 - 19899523
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19899831 catagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga 19899732  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-t 690  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19899731 ctatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatat 19899632  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||    
T  19899631 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttcctaactgcactgta 19899532  T
Q  791 gaagctccc 799  Q
    |||||||||    
T  19899531 gaagctccc 19899523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 34012557 - 34012137
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| || ||| || |||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  34012557 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactcc-actgtttgtaaagtg 34012459  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  34012458 gcatca-----aaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaaca 34012364  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||| ||||||||     |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  34012363 ccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatg 34012269  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  34012268 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaa 34012169  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34012168 gtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 34012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 7079255 - 7078818
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccc--taa--------tg 456  Q
    ||||||||| || ||  |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||        ||    
T  7079255 tggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactg 7079156  T
Q  457 tttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttt 556  Q
    |||||| | || ||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7079155 tttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttt 7079061  T
Q  557 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgta 656  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7079060 taagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgta 7078961  T
Q  657 agtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 756  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7078960 agtctaagatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaact 7078861  T
Q  757 tttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  7078860 ttttcaaaaaaatcagtttcatgactgtaccgtaaaaactccc 7078818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 479 - 797
Target Start/End: Original strand, 15168197 - 15168515
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15168197 aaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagt 15168296  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15168297 gtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcatt 15168396  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  15168397 attagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcct 15168496  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctc 797  Q
     |||| |||||||||||||    
T  15168497 aactgcaccgtagaagctc 15168515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 8222229 - 8222549
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8222229 aaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 8222328  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8222329 gtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 8222428  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  8222429 actagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttc 8222527  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8222528 tgactgtaccgtagaagctccc 8222549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 369 - 800
Target Start/End: Original strand, 14758038 - 14758454
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||  ||||    
T  14758038 gaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacaca-actgtttgtacggtgg 14758136  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14758137 catcaaaa-----gttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 14758231  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    |||| |||         ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14758232 cccagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 14758322  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14758323 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 14758422  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  14758423 tcagtttcgtgactgcaccgtagaagctccct 14758454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 479 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 27227560 - 27227273
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227560 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagt 27227461  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  27227460 gcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 27227361  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27227360 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaacttttccaaaaa 27227273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 15382929 - 15383356
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||| | ||    
T  15382929 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatccc-accgtttgtacaatg 15383027  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15383028 tcatcaaaa-----gttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 15383122  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15383123 ccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatg 15383222  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15383223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 15383322  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  15383323 aatcaatttcctgactgaaccgtagaagctccct 15383356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 389 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9903213 - 9902807
Alignment:
Q  389 atgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagt 488  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||| ||||     ||||| |    
T  9903213 atgaaaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgc-tgtttgtacagtgacatcaaaa-----gttcaat 9903120  T
Q  489 caccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    |  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9903119 ccacatactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacactta 9903020  T
Q  589 agactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||    
T  9903019 agactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaa 9902920  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccg 788  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||    
T  9902919 ttactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaaattcttgactgcaccg 9902820  T
Q  789 tagaagctcccta 801  Q
    |||||||| ||||    
T  9902819 tagaagcttccta 9902807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10182188 - 10181762
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |   ||| || |||| | ||||| ||||||| || | |||||||| ||||    
T  10182188 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgcc-actgtttgtacagtg 10182090  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10182089 gcatca-----aaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 10181995  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta-catgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||| || ||    
T  10181994 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaat 10181895  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10181894 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaa 10181795  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  10181794 agttagtttcctgactgcaccatagaagctccc 10181762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 30254420 - 30254843
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||| || |  | |||||||| | ||    
T  30254420 ggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac--actgtttgtacaatg 30254517  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  30254518 acatcaaaa-----gttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataaca 30254612  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30254613 ccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatg 30254712  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  30254713 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaa 30254812  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  30254813 gtcagtttcctgactgcaccgtagaaactcc 30254843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 365 - 799
Target Start/End: Original strand, 15752022 - 15752450
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    |||| |||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||| | | |||||||| |    
T  15752022 tatgaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctc-actgtttgtaca 15752120  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
     |||||| ||||     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15752121 atggcatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgta 15752215  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  15752216 acaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaag 15752315  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    | |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  15752316 aagttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaa 15752415  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15752416 aaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 15752450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Original strand, 32267030 - 32267457
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  32267030 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatg 32267128  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  32267129 acatcaaaa-----gttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 32267223  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  32267224 ctccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatg 32267323  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32267324 ttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaa 32267423  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  32267424 gtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcccta 32267457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 367 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 47682674 - 47682249
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||  |  |||  |||| ||| ||||||||||| || | || ||||| |||    
T  47682674 tggaaaattttatggtgaagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagt 47682577  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    || || ||||     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  47682576 ggtatcaaaa-----gttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaac 47682482  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  47682481 acctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 47682382  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  47682381 gttgcaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaa 47682282  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  47682281 agtcagtttactgactgcaccatagaagctccc 47682249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 22170812 - 22171132
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22170812 aaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccacaaagt 22170911  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22170912 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaacatt 22171011  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||    
T  22171012 attagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttct 22171111  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccc 799  Q
     | || |||||||||||||||    
T  22171112 aattgcaccgtagaagctccc 22171132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 479 - 771
Target Start/End: Original strand, 51128960 - 51129250
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51128960 aaagttcagtcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagt 51129059  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51129060 gtaacaattaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 51129159  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  51129160 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaactttttcaaaaaagtca 51129250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 389 - 800
Target Start/End: Original strand, 10922744 - 10923149
Alignment:
Q  389 atgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagt 488  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| | || ||| ||||     ||||| |    
T  10922744 atgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagacccc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcaat 10922837  T
Q  489 caccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10922838 cctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacactta 10922937  T
Q  589 agactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  10922938 agactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaa 10923037  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccg 788  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||     
T  10923038 ttactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagttttctgactgcacca 10923137  T
Q  789 tagaagctccct 800  Q
    ||||||||||||    
T  10923138 tagaagctccct 10923149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Original strand, 23999448 - 23999770
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  23999448 aaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagt 23999547  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23999548 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 23999647  T
Q  679 acttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| || ||    
T  23999648 actagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtcaatttcc 23999747  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  23999748 tgactgcaccatagaagctccct 23999770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 479 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 27563980 - 27563666
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||     
T  27563980 aaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaaga 27563881  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27563880 ggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtatt 27563781  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27563780 actagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaaatcagtttcct 27563681  T
Q  779 gactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||| ||| |||||    
T  27563680 gactgcaccatagaa 27563666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 492 - 799
Target Start/End: Original strand, 46931525 - 46931831
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46931525 cataatatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga 46931622  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-t 690  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  46931623 ctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatat 46931722  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  46931723 attattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccttactgcaccgta 46931822  T
Q  791 gaagctccc 799  Q
    |||||||||    
T  46931823 gaagctccc 46931831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 494 - 805
Target Start/End: Original strand, 37451401 - 37451712
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37451401 tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagact 37451500  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  37451501 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattact 37451600  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || | | |||| |||||||||    
T  37451601 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttcactgcaccgtagaa 37451700  T
Q  794 gctccctactta 805  Q
     |||||| ||||    
T  37451701 tctcccttctta 37451712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 479 - 755
Target Start/End: Original strand, 25160733 - 25161010
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25160733 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagt 25160832  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25160833 ataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 25160932  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaac 755  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25160933 actatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 25161010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 383 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 28564946 - 28564566
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||  || |||||||| | || ||| ||||     |    
T  28564946 gaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacct-tactgtttgtacaatgacatcaaaa-----g 28564853  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||  |||||||||  |||||||||    
T  28564852 ttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaa 28564753  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  28564752 cacttaa--ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattacta 28564655  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28564654 gatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 28564566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 479 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30327027 - 30326751
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30327027 aaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 30326928  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30326927 gtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcatt 30326828  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaa 754  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  30326827 actagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 394 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 238666 - 238300
Alignment:
Q  394 aataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcacca 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||| |||||||||| ||  | |||||||| | || ||| ||||     |||||||| |||    
T  238666 aataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc--actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtcccca 238574  T
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238573 tagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 238474  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  238473 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 238374  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  238373 attaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttcaaaaaa 238300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11742515 - 11742122
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||     |    
T  11742515 gaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaa-----g 11742422  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||                   
T  11742421 ttcagtc-ccataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaa-------------- 11742337  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
       ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11742336 ---ttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 11742240  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||    
T  11742239 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgact 11742140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Original strand, 1547283 - 1547694
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| ||||||||||| || | |||||||  ||||    
T  1547283 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactcc-actgtttgtgcagtg 1547381  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     |||||||   |||||||||||||        ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547382 gcatcaaaa-----gttcagttctcatagtatcatca--------gattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 1547468  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1547469 ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 1547560  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  1547561 ttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaa 1547660  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||| | | | |||||||||||| |||||||    
T  1547661 gtcagtttcataattgtaccgtagaaactcccta 1547694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 492 - 801
Target Start/End: Original strand, 28769766 - 28770074
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaag 590  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28769766 catagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaag 28769865  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  28769866 actatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagatgaatt 28769965  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| || |||   ||||||| |    
T  28769966 actattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcct--atgtaccgga 28770063  T
Q  791 gaagctcccta 801  Q
    |||||||||||    
T  28770064 gaagctcccta 28770074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 361 - 759
Target Start/End: Original strand, 42721028 - 42721417
Alignment:
Q  361 tttatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| | |||| ||||||||||| |   |||  || |||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  42721028 tttatatggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacacccc-actgtttg 42721126  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || |||  ||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42721127 tacagtaacatcaaaa-----gttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag 42721221  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42721222 tgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtc 42721318  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
     ||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42721319 caagatgttgcaattattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 42721417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 39393379 - 39393804
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||||    
T  39393379 ggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttc-attgtttgtacagtg 39393477  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    |||| ||||     ||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39393478 gcatcaaaa-----gtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac 39393572  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| || |||||    
T  39393573 atcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagat 39393672  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  39393673 gttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaa 39393772  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||| || | ||||||   ||||||||||||    
T  39393773 agtcaatttcatgactgccgcgtagaagctcc 39393804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 492 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 27763373 - 27763071
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27763373 catagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaaga 27763274  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-t 690  Q
    ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |    
T  27763273 ctatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatat 27763174  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  27763173 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaatgtcaatttcctgactgtaccgta 27763074  T
Q  791 gaa 793  Q
    |||    
T  27763073 gaa 27763071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Original strand, 3534943 - 3535345
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||  |||| ||| ||||     |    
T  3534943 gaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacct-tactgtttgtgcagtgacatcaaaa-----g 3535036  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535037 ttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 3535136  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    ||||||         ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||     
T  3535137 cactta---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattacta 3535227  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||| | |||||    
T  3535228 gatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaaatcagtttcatgact 3535327  T
Q  783 gtaccgtagaagctccct 800  Q
      ||||||||||||||||    
T  3535328 acaccgtagaagctccct 3535345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 366 - 759
Target Start/End: Original strand, 3309142 - 3309535
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||    
T  3309142 atggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc--actgtttgtacag 3309239  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||| || ||||     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  3309240 tggtatcaaaa-----gttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgta 3309334  T
Q  565 acaccccacaa-----agtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt 659  Q
    ||||| ||| |     |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  3309335 acacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagt 3309434  T
Q  660 ctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tcaaaattaacttt 758  Q
    | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3309435 ccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaacttt 3309534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 367 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 31621734 - 31621328
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||||| ||||||   | ||||||  ||    
T  31621734 tggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgc-tatttgtacggt 31621636  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| |||| |     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  31621635 ggcatcaaaaat-----tcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaat 31621541  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcat-----gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtct 661  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  31621540 acccca-gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttc 31621442  T
Q  662 aagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttc 760  Q
    || ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31621441 aatatgttgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 31621342  T
Q  761 caaaaaagtcagtt 774  Q
    ||||||||||||||    
T  31621341 caaaaaagtcagtt 31621328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 400 - 771
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885207
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||| |     ||||||||||| | |||||||    
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcacccc-actgtttgtacggtggcatca-----aaagttcagtccctatagtat 40884934  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40884935 cttcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgca 40885034  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  40885035 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgat 40885134  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa-ttaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||  ||||||||||    
T  40885135 cattaattagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaaagtca 40885207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33725675 - 33725365
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33725675 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagt 33725576  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |       
T  33725575 gtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaac--- 33725479  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
             ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  33725478 ---------attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaaaatcagtttcc 33725388  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||| | |||| |||||||||    
T  33725387 tgactgcaacgtataagctccct 33725365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 570 - 801
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353965
Alignment:
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaat 48353933  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  48353934 cagtttcatgactgcaccgtagaagctcccta 48353965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 370 - 774
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926552
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || |||||||||| ||| | |||| || ||||||||| |  |||| ||||||| | |||||||||| | ||| | |||||||| ||||||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatccc-actgtttgtacagtggc 41926259  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || | ||     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41926260 atcacaa-----gttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacact 41926354  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    |||||||||||||||||||      | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  41926355 ccacaaagtgtaacactta------ttaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt 41926448  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||| |    
T  41926449 -caagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaatttttaaaaaaaaat 41926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 479 - 740
Target Start/End: Original strand, 18422752 - 18423006
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||    
T  18422752 aaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagt 18422851  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18422852 gtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 18422951  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 740  Q
     ||  |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422952 gctagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 368 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 37619076 - 37618705
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacac-ccctaatgtttgtatagt 466  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| | || ||||||| || ||| | |||||||| | |    
T  37619076 ggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaaat 37618977  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat--catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    | ||| ||||     |||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  37618976 gacatcaaaa-----gttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcata 37618882  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    ||| |||| |||||||||||||         || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37618881 acatcccataaagtgtaacact---------catataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaag 37618791  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 754  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||    
T  37618790 atgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataatcaacaatttaaa----attcaaacattaaaatcaaaattaa 37618705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 570 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359740
Alignment:
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  || |||||    
T  1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgtt 1359820  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 749  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359819 gcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 1359740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 656
Target Start/End: Original strand, 48620648 - 48620906
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |     ||||    
T  48620648 gaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatca-----aaag 48620741  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620742 ttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 48620841  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgta 656  Q
    |||         |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  48620842 cac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 615 - 804
Target Start/End: Original strand, 31962853 - 31963043
Alignment:
Q  615 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatc 714  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  31962853 tgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatc 31962952  T
Q  715 aacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccctactt 804  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  31962953 aacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctccctactt 31963043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 609 - 774
Target Start/End: Original strand, 21289831 - 21289996
Alignment:
Q  609 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaatta 708  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  21289831 caactctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaatca 21289930  T
Q  709 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21289931 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagtt 21289996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 497 - 681
Target Start/End: Original strand, 38759652 - 38759836
Alignment:
Q  497 tatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatc 596  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38759652 tatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatc 38759751  T
Q  597 acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattact 681  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38759752 agataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattact 38759836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 710 - 800
Target Start/End: Original strand, 48620921 - 48621011
Alignment:
Q  710 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  48620921 taatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccct 48621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 734 - 801
Target Start/End: Original strand, 38759846 - 38759913
Alignment:
Q  734 aaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||    
T  38759846 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttaattgactgcaccatagaagctcccta 38759913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 521
Target Start/End: Original strand, 21289676 - 21289815
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataata------ata-tcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaa 475  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||      ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |      
T  21289676 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatca-- 21289772  T
Q  476 attaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaa 521  Q
       ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289773 ---aaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaa 21289815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 801
Target Start/End: Original strand, 47555092 - 47555141
Alignment:
Q  752 taacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  47555092 taactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccgtagaagcccccta 47555141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-142; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 3880123 - 3879697
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  3880123 ggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-tactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3880024 acatcaaaa-----gttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaaca 3879930  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3879929 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatg 3879830  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3879829 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 3879730  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  3879729 atcagtttcctgactgcaccgtagaaggtccct 3879697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 369 - 799
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768507
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||||||    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatccat--tgtttgt-tagtgg 20768183  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20768184 catcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagatta--cttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacat 20768276  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20768277 cccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgt 20768376  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20768377 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaa 20768476  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  20768477 tcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 20768507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 365 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 7235221 - 7234791
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||      
T  7235221 tatggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacccc-actgtttgtacg 7235123  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||| ||| ||||     |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7235122 gtgccatcaaaa-----gttcagtctc-atagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta 7235029  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7235028 acaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 7234929  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat---tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttcc 761  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7234928 atgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 7234829  T
Q  762 aaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| ||| || |||||||  |||||| ||||||||    
T  7234828 aaaaaaatcattttcctgactacaccgtaaaagctccc 7234791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 494 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 6091247 - 6090941
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa-gac 592  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6091247 tagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagac 6091148  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6091147 tatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 6091048  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  6091047 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttttctgactgcaccgtaga 6090948  T
Q  793 agctccc 799  Q
    |||||||    
T  6090947 agctccc 6090941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 370 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 21017294 - 21016917
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    ||||||||| || ||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||  || ||| |||| ||| |||||||||||||| | | |||||| | ||||    
T  21017294 aaaattatacggtgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacccc-attatttgtacaatggc 21017196  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21017195 atcaaaa-----gttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacacc 21017101  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  21017100 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgtt 21017007  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21017006 gcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttt 21016917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 1945833 - 1946260
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttct-ggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | |    
T  1945833 ggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtagaat 1945931  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     |||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  1945932 gacatcaaaa-----gttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaac 1946026  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1946027 accctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 1946126  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaa 764  Q
    ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1946127 gttacaagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaa 1946226  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1946227 aaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 1946260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4319007 - 4318574
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4319007 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 4318909  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
     ||| ||||     |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4318908 acatcaaaa-----gttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac 4318814  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||    
T  4318813 accctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagat 4318714  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca------ttaagatcaaaattaacttttc 760  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||      |||| || |||||||||||||     
T  4318713 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaaaattaacttttt 4318614  T
Q  761 caaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  4318613 caaaaaaatcagtttcataactgcaccgtagaagctccct 4318574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Original strand, 5627391 - 5627819
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| | || ||||||||||||| | | |||||| | ||    
T  5627391 ggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccc-actatttgtagaatg 5627489  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||    
T  5627490 acatcaaaa-----gttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataaca 5627584  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5627585 ccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 5627684  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  5627685 ttgcaagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaa 5627784  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5627785 aatcagtttcctgactgcaccgtagaagctcccta 5627819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 368 - 791
Target Start/End: Original strand, 8513233 - 8513638
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  8513233 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 8513331  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
     ||| ||||     |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||      |    
T  8513332 acatcaaaa-----gttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------c 8513420  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||    
T  8513421 accctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaat 8513520  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  8513521 cttgcaagcattactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 8513613  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtag 791  Q
    |||||||| | |||||| |||||||    
T  8513614 agtcagtttcatgactgcaccgtag 8513638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 367 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 33893187 - 33892796
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || ||  |||| || ||||||| |||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||| | |    
T  33893187 tggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actatttgtacaat 33893089  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    |  |||||||     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  33893088 gatattaaaa-----gttcagtc-ccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataac 33892995  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||         ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33892994 accccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagat 33892904  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  33892903 gttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaa 33892804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 370 - 774
Target Start/End: Original strand, 29182165 - 29182561
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| | |||  || |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||| |    
T  29182165 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttatacagtgtc 29182263  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29182264 atcaaaa-----gttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacc 29182358  T
Q  570 cc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29182359 cccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgt 29182458  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    |||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29182459 tgcaagtattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttcaaaaaag 29182555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 370 - 764
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089286
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgcccc-actgtttgtaaagtggc 6089008  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    || ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||      |||    
T  6089009 atcaaaa-----gttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cac 6089097  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
     | |||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||    
T  6089098 tctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgt 6089197  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  6089198 tgcaagcattactatatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaa 6089286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 370 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353253
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| | | | | |||||||| ||||||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctc-actgtttgtacagtggc 30353442  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    ||  | |     |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |    
T  30353441 atcgata-----gttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatc 30353347  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30353346 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 30353253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 366 - 771
Target Start/End: Original strand, 33618832 - 33619230
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||  |    
T  33618832 atggaaaattctacggtgaagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaaccc-attatttgtacgg 33618930  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| ||||     |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  33618931 tggcatcaaaa-----gttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaa 33619017  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaa-----agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    ||||| | || |||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33619018 caccctagaa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtc 33619116  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatta---attagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 757  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33619117 caatatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactt 33619216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 384 - 643
Target Start/End: Original strand, 15491631 - 15491884
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||     ||    
T  15491631 aagttatgagaatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actatttgtacagtggcatcaaaa-----gt 15491724  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15491725 tcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaac 15491824  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataa 643  Q
    |||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  15491825 acttaaaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 635 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054533
Alignment:
Q  635 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 733  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaatc 7054597  T
Q  734 aaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  7054596 aaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtaaaagctc 7054533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 479 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 7055294 - 7055139
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7055294 aaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagt 7055195  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgt 634  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  7055194 gtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagatgt 7055139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 505
Target Start/End: Original strand, 18498448 - 18498565
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||| |     ||||    
T  18498448 gaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacagtggcatca-----aaag 18498542  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaa 505  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  18498543 ttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 700 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 755  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 752 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6613704 - 6613656
Alignment:
Q  752 taacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  6613704 taactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtacaagctccct 6613656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16447066 - 16446640
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  16447066 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacacccc-actgtttgtataatg 16446968  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16446967 gcatca-----aaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca 16446873  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16446872 ccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 16446773  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16446772 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 16446673  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16446672 gtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 16446640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 38643977 - 38644402
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  38643977 ggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtctagtg 38644075  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38644076 gcatca-----aaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 38644170  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38644171 ctccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38644270  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38644271 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 38644370  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  38644371 gtcagtttcatgactgcaccgtaaaagctccc 38644402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 383 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37970695 - 37970283
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     |    
T  37970695 gaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatgccatcaaaa-----g 37970602  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37970601 ttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37970502  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37970501 cacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 37970402  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37970401 gatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcactttcctgact 37970302  T
Q  783 gtaccgtagaagctcccta 801  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  37970301 gcaccatagaagctcccta 37970283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 368 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 27083029 - 27082636
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||    
T  27083029 ggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccc-actgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||||||||     ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  27082930 gcattaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaaca 27082836  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27082835 ccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 27082736  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27082735 ttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 27082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 34894966 - 34895387
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  34894966 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactcc-actgtttgtaaagtg 34895064  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  34895065 gcatca-----aaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaaca 34895159  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||| ||||||||     |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  34895160 ccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatg 34895254  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  34895255 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaa 34895354  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  34895355 gtcaatttcctaactgcaccgtagaagctccct 34895387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 36695157 - 36694731
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  36695157 ggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatg 36695059  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36695058 acatcaaaa-----gttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 36694964  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36694963 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatg 36694864  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36694863 ttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaa 36694764  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
     |||||| | | |||| | ||||||||||||||    
T  36694763 atcagtttcttcactgcatcgtagaagctccct 36694731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 366 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6098711 - 6098311
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |  |||  ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  6098711 atggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacacccc-actgtttgtacag 6098613  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    || ||| |     ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6098612 tgacatca-----aaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaa 6098518  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacg-----ataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     ||| |||||||| ||||||||    
T  6098517 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtc 6098418  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttc 760  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6098417 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaactttcc 6098318  T
Q  761 caaaaaa 767  Q
    |||||||    
T  6098317 caaaaaa 6098311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Original strand, 11727038 - 11727450
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||| |     ||||    
T  11727038 gaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacacccc-actatttgtatagtggcatca-----aaag 11727131  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11727132 ttcagtcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaa 11727231  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11727232 cacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattacta 11727331  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa-gtcagttgcctgac 781  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||| |||| || | ||||    
T  11727332 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaatgtcaatttcatgac 11727431  T
Q  782 tgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || ||||||||||||||||    
T  11727432 tgcaccgtagaagctccct 11727450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5300138 - 5299711
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||| ||| | || |||||||| |||    
T  5300138 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactc-tactgtttgtacagt 5300040  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| ||||     ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5300039 ggcatcaaaa-----gttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaac 5299945  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5299944 accccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 5299845  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5299844 gttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 5299745  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||    
T  5299744 agtcagtttcatgactgcaccatagaagctccct 5299711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 43643786 - 43643360
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| | || |||||||| | ||    
T  43643786 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactc-tactgtttgtacaatg 43643688  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     |||  |||     ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  43643687 acatccaaa-----gttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 43643593  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43643592 cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 43643493  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43643492 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 43643393  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  43643392 gtcagttttctgactgcaccatagaagctccct 43643360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 479 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 1149718 - 1149396
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1149718 aaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 1149619  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1149618 gtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 1149519  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||    
T  1149518 actagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcct 1149419  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  1149418 gactgcaccgtagaagctcccta 1149396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 1204926 - 1205351
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||  | | |||||||| | ||    
T  1204926 ggaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatg 1205024  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1205025 acatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaaca 1205119  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1205120 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 1205219  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  1205220 ttgcaagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaa 1205319  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  1205320 gtcaattttctgactacaccgtagaagctccc 1205351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 500 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132452
Alignment:
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 4132552  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  4132551 cattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcaccatagaagctccc 4132452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 398 - 796
Target Start/End: Original strand, 465871 - 466253
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |     |||||| || ||||    
T  465871 acttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatcaaaaat-----tcagtccccttagt 465964  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  465965 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------ca 466055  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  466056 catat-atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 466154  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  466155 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagct 466253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 479 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 7891043 - 7890718
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  7891043 aaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaacgt 7890944  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7890943 gtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatt 7890844  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  7890843 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcat 7890744  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccctactt 804  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  7890743 gaccgcaccgtagaagctcccaactt 7890718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 478 - 799
Target Start/End: Original strand, 33906315 - 33906634
Alignment:
Q  478 taaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaag 577  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  33906315 taaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaag 33906414  T
Q  578 tgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33906415 tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 33906514  T
Q  678 tacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  33906515 tactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttc 33906612  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  33906613 tgactgcactgtagaagctccc 33906634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 479 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 1954076 - 1953760
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatc-atcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ccccacaaa 576  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1954076 aaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatccccacaaa 1953977  T
Q  577 gtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagca 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  1953976 gtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaagca 1953877  T
Q  677 ttacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgc 776  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |    
T  1953876 ttattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttc 1953777  T
Q  777 ctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1953776 ctgactgcaccgtagaa 1953760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 398 - 799
Target Start/End: Original strand, 12876138 - 12876534
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||  | |||||||| | || ||| ||||     ||||||||  ||||||    
T  12876138 acttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacaccca-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtcctcatagt 12876231  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa-gactatc 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12876232 atcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatc 12876331  T
Q  597 acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactatt 696  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  12876332 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatgaattactatt 12876431  T
Q  697 gatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  12876432 tatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctgattataccgtataagct 12876531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 16222967 - 16223290
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  16222967 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagt 16223066  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223067 gtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 16223166  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa---cttttccaaaaaagtcagttg 775  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||   ||||||||||||     
T  16223167 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttttttcaaaaagtcagttt 16223266  T
Q  776 cctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
     ||||||| ||| |||||||||||    
T  16223267 tctgactggaccatagaagctccc 16223290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 394 - 771
Target Start/End: Original strand, 40862444 - 40862816
Alignment:
Q  394 aataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaag-tgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcacc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||     |||||||| |     
T  40862444 aataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatggcatcaaaa-----gttcagtctc- 40862536  T
Q  493 atagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 592  Q
    || ||||||||||||  ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40862537 atggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagac 40862636  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40862637 tatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 40862736  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    ||||  |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  40862737 tatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttcaaaaaagtca 40862816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 365 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 23854625 - 23854229
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||  | |||||||  |    
T  23854625 tatggaaaagtctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccca-actgtttgtgca 23854527  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
     || ||| ||||     ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  23854526 atgacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgta 23854432  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||    
T  23854431 acaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaag 23854332  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23854331 atgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 23854232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 479 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 30654669 - 30654347
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30654669 aaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagt 30654570  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30654569 gtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 30654470  T
Q  679 acttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    |||  |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  30654469 actaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcc 30654371  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  30654370 tgactgcaccgtagaaactcccta 30654347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 479 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 39099205 - 39098891
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39099205 aaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagt 39099106  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
     | ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  39099105 atcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcatt 39099006  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| |||||| | |    
T  39099005 actagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttttaaaaaaatcagtttcat 39098906  T
Q  779 gactgtaccgtagaa 793  Q
    || || |||||||||    
T  39098905 gattgcaccgtagaa 39098891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 8803885 - 8803582
Alignment:
Q  497 tatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatc 596  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  8803885 tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatc 8803786  T
Q  597 acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaat-tactat 695  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  8803785 acataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatactat 8803686  T
Q  696 tgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| || |    
T  8803685 tgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtaaaaac 8803586  T
Q  796 tccc 799  Q
    ||||    
T  8803585 tccc 8803582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 369 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 31934076 - 31933653
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||||||| | || ||||||||||||| | | ||| || | ||     
T  31934076 gaaaattctaacgtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacacccc-actctttatacaatga 31933978  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||| ||    
T  31933977 catcaaaa-----gttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataatac 31933883  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31933882 cgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatat 31933783  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    ||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31933782 tgcagacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaag 31933683  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||| ||  |||| ||| ||||||||||    
T  31933682 tcagtttcccaactgcaccatagaagctcc 31933653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 35459797 - 35459502
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | |    
T  35459797 aaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagatt 35459698  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||    
T  35459697 ataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacatt 35459598  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35459597 actagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 35459502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Original strand, 44869601 - 44869896
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaag 577  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    ||||||||||    
T  44869601 aaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccccacaaag 44869699  T
Q  578 tgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||    
T  44869700 tgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcat 44869799  T
Q  678 tacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44869800 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 44869896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 398 - 736
Target Start/End: Original strand, 9864177 - 9864509
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     |||||||| ||||| |    
T  9864177 acttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtccccataat 9864270  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864271 atcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 9864370  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |     
T  9864371 cataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaataactagta 9864470  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 736  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864471 atcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 367 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10555394 - 10554970
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| |||||||||| || | |||||||| | |    
T  10555394 tggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactcc-actgtttgtacaat 10555296  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||    
T  10555295 gacatcaaaa-----gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaac 10555201  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  10555200 acctcacaaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagat 10555103  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaatt--actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa-cttttccaa 763  Q
     ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  10555102 attgcaagcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaa 10555006  T
Q  764 aaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||    
T  10555005 aaaagtcaattttctgaccgcaccatagaagctccc 10554970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 367 - 680
Target Start/End: Original strand, 13307621 - 13307927
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | | | |||||| |||    
T  13307621 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctc-actatttgtacagt 13307719  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  13307720 gacatcaaaa-----gttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaac 13307814  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  13307815 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagat 13307913  T
Q  667 gttgcaagcattac 680  Q
    ||||||||||||||    
T  13307914 gttgcaagcattac 13307927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 604 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 34952018 - 34951826
Alignment:
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34952018 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcatt 34951919  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  34951918 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgattgcaccgtagaagct 34951826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 604 - 800
Target Start/End: Original strand, 35859163 - 35859359
Alignment:
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  35859163 atcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 35859262  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  35859263 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactccct 35859359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 609 - 774
Target Start/End: Original strand, 12587816 - 12587981
Alignment:
Q  609 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaatta 708  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  12587816 caactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 12587915  T
Q  709 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12587916 gtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtt 12587981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 41911070 - 41910895
Alignment:
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41911070 ttcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 41910971  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt 659  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41910970 cacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagatg-caacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 530 - 794
Target Start/End: Original strand, 18259238 - 18259498
Alignment:
Q  530 ttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaa 629  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||  | |||| ||| |   |||||||||||||    
T  18259238 ttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatgttaaa 18259333  T
Q  630 gatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg 729  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18259334 aatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaatttaaaaatg 18259433  T
Q  730 aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaag 794  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||| ||||||    
T  18259434 aatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcatgactgcaccatagaag 18259498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 556 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823200
Alignment:
Q  556 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaacgataaaatagtacatgt 24823304  T
Q  656 aagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 755  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24823303 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac 24823204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 569 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149756
Alignment:
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgt 1149817  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg 729  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1149816 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 630 - 801
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198228
Alignment:
Q  630 gatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg 729  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
Q  730 aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||    
T  33198157 aatcaatcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtcaatttcatgattgcaccgtagaagctcccta 33198228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 497 - 645
Target Start/End: Original strand, 43025824 - 43025972
Alignment:
Q  497 tatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatc 596  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | || | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43025824 tatcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatc 43025923  T
Q  597 acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 645  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025924 acataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 684 - 798
Target Start/End: Original strand, 41362731 - 41362845
Alignment:
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41362731 atgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 41362830  T
Q  784 taccgtagaagctcc 798  Q
     ||| ||||||||||    
T  41362831 caccatagaagctcc 41362845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 368 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1150296 - 1150090
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||   |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |  |    
T  1150296 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatccc-actgtttgtacaacg 1150198  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1150197 acatcaaaa-----gttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 1150103  T
Q  568 ccccacaaagtgt 580  Q
    |||||||||||||    
T  1150102 ccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 368 - 567
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |  |||   ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactagcata---aaaatgtagtgagtaacacccc-actatttgtatagtg 41362612  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41362613 acatcaaaa-----gttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 34952192 - 34952028
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| |     ||||||||||| |  ||||    
T  34952192 acttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagccc-actgtttgtacagtgacatca-----aaagttcagtccctttagt 34952099  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34952098 atcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 687 - 759
Target Start/End: Original strand, 43025986 - 43026058
Alignment:
Q  687 aattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43025986 aattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 43026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 651
Target Start/End: Original strand, 7998478 - 7998554
Alignment:
Q  575 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 651  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7998478 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtac 7998554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 568
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  482 gttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaa-ttttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 609 - 696
Target Start/End: Original strand, 34463708 - 34463792
Alignment:
Q  609 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactatt 696  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34463708 caactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtc---catgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 451
Target Start/End: Original strand, 33906219 - 33906306
Alignment:
Q  364 atatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccc 451  Q
    |||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33906219 atatggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcacccc 33906306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 612
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
Q  556 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaac 612  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 737 - 798
Target Start/End: Original strand, 9864533 - 9864594
Alignment:
Q  737 cattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  9864533 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 9864594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 13307931 - 13308004
Alignment:
Q  727 atgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||||||    
T  13307931 atgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaatagtcaatttcatgattgcaccatagaagctccct 13308004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24823447 - 24823395
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgt 436  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24823447 aagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgt 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 479 - 521
Target Start/End: Original strand, 33197953 - 33197995
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaa 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33197953 aaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaa 33197995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 747 - 797
Target Start/End: Original strand, 34686107 - 34686156
Alignment:
Q  747 aaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34686107 aaaaataacttttccaaaaaagtcagtt-cctgactgcaccgtagaagctc 34686156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 367 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 15612945 - 15612520
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  15612945 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatc-aaagtgttatgagtaacacccc-agtgtttgtagagt 15612848  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| |     ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15612847 ggcatca-----aaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 15612753  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15612752 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagat 15612653  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15612652 gttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaa 15612553  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  15612552 agtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 15612520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 5657669 - 5657241
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||    
T  5657669 atggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacag 5657571  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| |     |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5657570 tggcatca-----aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaa 5657476  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657475 cagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 5657376  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  5657375 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttcaaa 5657276  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    || ||||||| | | |||| |  ||||||||||||    
T  5657275 aatgtcagtttcataactgcattgtagaagctccc 5657241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 367 - 799
Target Start/End: Original strand, 37109846 - 37110274
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||| | |    
T  37109846 tggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccc-accgtttgtacaat 37109944  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctaca--ttgttttaagtgta 564  Q
    | ||| ||||     |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| |||    
T  37109945 gacatcaaaa-----gttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgta 37110039  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37110040 acaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 37110139  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37110140 atgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaa 37110239  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||| ||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  37110240 aaaatcaatttcttgactgcaccgtagaagctccc 37110274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 18797304 - 18797728
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| || |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  18797304 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacac--taacataaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatg 18797400  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18797401 acatcaaaa-----gttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca 18797495  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18797496 cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatg 18797595  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18797596 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaa 18797695  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||  ||||||| | | || |||||||||    
T  18797696 gtcagttttctgactgcatcataaaagctccct 18797728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 366 - 801
Target Start/End: Original strand, 8861258 - 8861687
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  8861258 atggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacacccc-actgtttgtacag 8861356  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| |     |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8861357 tggcatca-----aaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaa 8861451  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8861452 caccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 8861551  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  8861552 tgttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttcaaaa 8861651  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||    
T  8861652 aagtcagtttcatcactgcaccgttgaagctcccta 8861687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10359402 - 10358975
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||||| || || | ||| || ||    
T  10359402 atggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcc-tactatttatacag 10359304  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaa-tctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    || ||| ||||     ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10359303 tgacatcaaaa-----gttcagtctg-atagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgta 10359210  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  10359209 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaag 10359110  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10359109 attttgcaagcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttcaaa 10359010  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||    
T  10359009 aaagttagtttcttaactgcaccgtagaagctccc 10358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 17842772 - 17842345
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||| | ||    
T  17842772 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccc-accgtttgtacaatg 17842674  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctaca--ttgttttaagtgtaa 565  Q
     ||| ||||     | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| ||||    
T  17842673 acatcaaaa-----gctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaa 17842579  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17842578 catcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 17842479  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17842478 tgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaa 17842379  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  17842378 aagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctccc 17842345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 369 - 797
Target Start/End: Original strand, 24211717 - 24212140
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  24211717 gaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-tactgtttatagaatgg 24211815  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||     
T  24211816 catcaaaa-----gttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacat 24211910  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  24211911 cctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgt 24212010  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24212011 tgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 24212110  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24212111 gtcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 24212140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 30055501 - 30055928
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctgg-tgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| | | |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | |    
T  30055501 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaat 30055599  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  30055600 gacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaac 30055694  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30055695 accctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 30055794  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||    
T  30055795 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaa 30055894  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  30055895 agtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccct 30055928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 491 - 799
Target Start/End: Original strand, 6546611 - 6546919
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6546611 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaat 6546710  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  6546711 attatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaatt 6546810  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  6546811 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgta 6546910  T
Q  791 gaagctccc 799  Q
    |||||||||    
T  6546911 gaagctccc 6546919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 504 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 9355882 - 9355590
Alignment:
Q  504 aattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  9355882 aattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataat 9355783  T
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  9355782 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcatt 9355683  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  9355682 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgcctgcaccatagaagct 9355590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Original strand, 21991611 - 21992029
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  21991611 ggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 21991709  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21991710 tcatca-----aaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 21991804  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21991805 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 21991904  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||||||       |||||||||||||||||    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21991905 ttgcaagca-----agatgaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttcaaaaaa 21991995  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  21991996 gtcagtttcatgattacaccgtagaagctcccta 21992029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 383 - 796
Target Start/End: Original strand, 23111180 - 23111589
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||||||||| || | | |||||| | |||||| ||||     |    
T  23111180 gaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacacc-actatttgtacaatggcatcaaaa-----g 23111273  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttat--cctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgt 580  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23111274 ttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgt 23111373  T
Q  581 aacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattac 680  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23111374 aacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattac 23111473  T
Q  681 ttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctga 780  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  23111474 tagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagttttctga 23111573  T
Q  781 ctgtaccgtagaagct 796  Q
    ||||||||||||||||    
T  23111574 ctgtaccgtagaagct 23111589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 361 - 798
Target Start/End: Original strand, 27283712 - 27284145
Alignment:
Q  361 tttatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||    
T  27283712 tttatgtggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-accgtttg 27283810  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || | ||  || ||||     ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27283811 tacaatgaaatcaaaa-----gttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataag 27283905  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27283906 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtc 27284005  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatcaaaattaa-cttt 758  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27284006 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaatcttt 27284105  T
Q  759 tccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  27284106 tcaaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 27284145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 32821239 - 32820854
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||    
T  32821239 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacacc-actgtttgtacaatg 32821141  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32821140 gcatca-----aaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaaca 32821046  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32821045 ccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 32820946  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820945 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 32820854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 479 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 31579145 - 31578831
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  31579145 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagt 31579046  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31579045 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 31578946  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31578945 actagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcct 31578846  T
Q  779 gactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||| ||| |||||    
T  31578845 gactgcaccatagaa 31578831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 41765249 - 41764839
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||| || |  |||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||| ||||     |    
T  41765249 gaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaa-----g 41765156  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41765155 tccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaa 41765056  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  41765055 cacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactg 41764956  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||    
T  41764955 gatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcccgact 41764856  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
      ||||||||| |||||    
T  41764855 ccaccgtagaaactccc 41764839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 479 - 798
Target Start/End: Original strand, 32432532 - 32432851
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  32432532 aaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaat 32432631  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32432632 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcatt 32432731  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  32432732 actagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcct 32432831  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  32432832 gactgcaccgtagaagctcc 32432851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 367 - 801
Target Start/End: Original strand, 4582893 - 4583321
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||| | |    
T  4582893 tggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actatttgtacaat 4582991  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4582992 gacatcaaaa-----gttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaac 4583086  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  |||||    
T  4583087 accccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagat 4583186  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4583187 gttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 4583286  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  4583287 agtcaattttctggctgcaccgtagaagctcccta 4583321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 507 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46480906
Alignment:
Q  507 tcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatc 606  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46481083  T
Q  607 accaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat 706  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46481082 attaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 46480983  T
Q  707 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46480982 cagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 46480906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 383 - 767
Target Start/End: Original strand, 22687229 - 22687599
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| || ||||     |    
T  22687229 gaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactcc-actgtttgtgcagtggtatcaaaa-----g 22687322  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687323 ttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 22687422  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||        || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  22687423 cactcaagactatctcatgatatcaacaactctgtt--------aaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaata 22687514  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22687515 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 22687599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 384 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928058
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||  ||| ||| ||||     ||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacccc-actatttgtacggtgccatcaaaa-----gt 48928373  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  48928372 tcagtc-ccatagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaat 48928274  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttc 683  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  48928273 gcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactag 48928174  T
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||  || ||||    
T  48928173 atgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaaagtcaattttctaactg 48928074  T
Q  784 taccgtagaagctccc 799  Q
     |||||||||||||||    
T  48928073 caccgtagaagctccc 48928058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 367 - 774
Target Start/End: Original strand, 37346996 - 37347396
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| ||| | |||| |||||||||||| |  |||  ||||||| | || ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  37346996 tggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacacccc-attgtttgtacagt 37347094  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| |     |||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37347095 gacatca-----aaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa- 37347188  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37347189 actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagat 37347288  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37347289 attgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaa 37347388  T
Q  767 agtcagtt 774  Q
    ||||||||    
T  37347389 agtcagtt 37347396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 507 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703257
Alignment:
Q  507 tcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatc 606  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatc 37703452  T
Q  607 accaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat 706  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37703451 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 37703352  T
Q  707 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  37703351 caataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttactgactgcaccatagaagctcccta 37703257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 491 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 15672831 - 15672518
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15672831 ccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaag 15672732  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataa---aatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatga 687  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  15672731 actatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatga 15672632  T
Q  688 attactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtacc 787  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  15672631 attactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacc 15672532  T
Q  788 --gtagaagctccc 799  Q
      ||||||||||||    
T  15672531 ctgtagaagctccc 15672518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 370 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 25691729 - 25691311
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||   ||  | |||||||| ||||||    
T  25691729 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggc 25691630  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || || |     |||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25691629 atcaaca-----gttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 25691535  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || |||||    
T  25691534 ccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgtt 25691435  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatt-aacttttccaaaaaag 768  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||     
T  25691434 gcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttttaaaaaaaa 25691335  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    |||||| | |||| ||||||||||    
T  25691334 tcagtttcatgaccgtaccgtaga 25691311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 368 - 804
Target Start/End: Original strand, 7334769 - 7335198
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||  ||||||| |||||| || |||||||||||  |||| || |||  |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  7334769 ggaaaattctacggtgaagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatg 7334867  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7334868 acatcaaaa-----gttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca 7334962  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||  ||||| |||||||||||  | || |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  7334963 ccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaacta-gtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatg 7335061  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7335062 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaa 7335161  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccctactt 804  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7335162 gtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccaactt 7335198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 493 - 783
Target Start/End: Original strand, 10481699 - 10481989
Alignment:
Q  493 atagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481699 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 10481798  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10481799 tatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattac 10481898  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  10481899 tattgatcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactg 10481989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 551 - 799
Target Start/End: Original strand, 35353260 - 35353508
Alignment:
Q  551 ttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta 650  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353260 ttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta 35353359  T
Q  651 catgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa 750  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35353360 catttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaa 35353459  T
Q  751 ttaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  35353460 ttaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctccc 35353508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 491 - 800
Target Start/End: Original strand, 44598758 - 44599067
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44598758 ccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaag 44598857  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||      
T  44598858 actatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaa-- 44598955  T
Q  691 actattgatcattaat---tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtacc 787  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| |||    
T  44598956 actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcacc 44599054  T
Q  788 gtagaagctccct 800  Q
    |||||| ||||||    
T  44599055 gtagaaactccct 44599067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 398 - 800
Target Start/End: Original strand, 26980328 - 26980707
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||     |||||||| ||||| |    
T  26980328 acttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-acggtttgtacagtggcatcaaaa-----gttcagtccccataat 26980421  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||                 |||||||||||||||||||    
T  26980422 atcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatca 26980504  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||    
T  26980505 catgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttg 26980604  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  26980605 atcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccttagaagctc 26980704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 479 - 754
Target Start/End: Original strand, 11071286 - 11071558
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11071286 aaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagt 11071385  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  11071386 gtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacatt 11071482  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 754  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11071483 actagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 393 - 799
Target Start/End: Original strand, 29173540 - 29173922
Alignment:
Q  393 gaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcacc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| | || ||| ||||     ||||||||  |    
T  29173540 gaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactcc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtcctc 29173633  T
Q  493 atagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 592  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||                 |||||||    
T  29173634 atagtatcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttacac-----------------ttaagac 29173716  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29173717 tatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 29173815  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  29173816 tattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcatcgtaga 29173915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31520894 - 31520501
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |  |||  ||||||| | ||||||||||||| || | |||||||| |||| ||| ||||     |    
T  31520894 gaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactcc-attgtttgtacagtgacatcaaaa-----g 31520801  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||                  
T  31520800 ttcagtc-ccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac-------------- 31520716  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
       ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31520715 ---ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactc 31520619  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  31520618 gatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaact 31520519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 398 - 730
Target Start/End: Original strand, 12165757 - 12166074
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||     ||| |||| |   |||    
T  12165757 acttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatcaaaa-----gttaagtcccttaagt 12165850  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  12165851 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------ca 12165941  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12165942 cataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 12166041  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatga 730  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12166042 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 369 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 33688446 - 33688117
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  33688446 gaaaattatatggtgaagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaaca-tcctactgtttgtccagtgg 33688349  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| |     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33688348 catca-----aaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacac 33688254  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
     ||| ||||||||||| | |||||||||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33688253 tccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 33688154  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaa 705  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33688153 tgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 528 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26588116 - 26587852
Alignment:
Q  528 acttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgtta 627  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||        |    
T  26588116 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgtt--------a 26588025  T
Q  628 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaa 727  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26588024 aagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 26587925  T
Q  728 tgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  26587924 taaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgattgcgccgtagaagctccct 26587852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 398 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 12390786 - 12390410
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||  |||| ||| ||||     |||  ||| |||||||    
T  12390786 acttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatccc-actgtttgtgcagtgacatcaaaa-----gttatgtccccatagt 12390693  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||                 ||||||||  ||    
T  12390692 attatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac-----------------ttaagact--ca 12390612  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  12390611 cataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattactattt 12390512  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  12390511 atcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgacttcaccgtagaagctc 12390412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 368 - 681
Target Start/End: Original strand, 43686016 - 43686322
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||| | ||    
T  43686016 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc--actgtttgtacaatg 43686113  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43686114 gcatcaaaa-----gttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 43686208  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  43686209 ccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 43686308  T
Q  668 ttgcaagcattact 681  Q
    ||||||||||||||    
T  43686309 ttgcaagcattact 43686322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 479 - 759
Target Start/End: Original strand, 43925182 - 43925455
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  43925182 aaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgt 43925280  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
     ||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||      ||| |||||||||||||||||    
T  43925281 ttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcatt 43925374  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43925375 actagatgaattactattaatcatgaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 43925455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 479 - 670
Target Start/End: Original strand, 38258625 - 38258816
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38258625 aaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 38258724  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38258725 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 48928748 - 48928469
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||     
T  48928748 gaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacccc-actatttgtacggtgc 48928650  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48928649 catcaaaa-----gttcagtc-ccatagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacac 48928556  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 655  Q
    | || |||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48928555 ctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 48928469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 591 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411304
Alignment:
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 44411410  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||    
T  44411409 aatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaacctttccaaaaaagttagtttcctgactgcaccata 44411310  T
Q  791 gaagct 796  Q
     |||||    
T  44411309 taagct 44411304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 604 - 800
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704583
Alignment:
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccataaaagctccct 37704583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 495 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 32593254 - 32592996
Alignment:
Q  495 agtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 594  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  32593254 agtatcatcaattcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgta-----------------acacttaagacta 32593172  T
Q  595 tcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattacta 694  Q
    || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||  || ||||||||    
T  32593171 tcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattacta 32593072  T
Q  695 ttgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32593071 tggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 32592996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 483 - 629
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704387
Alignment:
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaa 629  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 400 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 27421533 - 27421313
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| | || ||| ||||     |||||||| | ||| |||    
T  27421533 ttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactcc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtc-ctataatat 27421441  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    ||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27421440 cataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgta 27421341  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgtta 627  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||    
T  27421340 tgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 687 - 799
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258979
Alignment:
Q  687 aattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtac 786  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
Q  787 cgtagaagctccc 799  Q
    |||||||||||||    
T  38258967 cgtagaagctccc 38258979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 612 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 34362126 - 34361967
Alignment:
Q  612 ctctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagta 711  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||     
T  34362126 ctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtc 34362027  T
Q  712 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aaga-tcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  34362026 attaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaaagt 34361967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 408 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
Q  408 tgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaatt 507  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||  || ||||     |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacccc-aatgtttgtacactgaaatcaaaa-----gttcggtctccatagtatcttcaatt 44413432  T
Q  508 catcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44413431 catcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 689
Target Start/End: Original strand, 38053637 - 38053751
Alignment:
Q  575 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  38053637 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaa 38053736  T
Q  675 cattacttcatgaat 689  Q
    ||||| || ||||||    
T  38053737 cattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 725 - 799
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166289
Alignment:
Q  725 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaagctccc 12166289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26524513 - 26524366
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||| |||||| || | |||||||  ||||    
T  26524513 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactcc-attgtttgtgcagtg 26524415  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaa 521  Q
    |||| |     ||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26524414 gcatca-----aaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaa 26524366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34362336 - 34362232
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||    
T  34362336 atggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacag 34362238  T
Q  466 tggcat 471  Q
    ||||||    
T  34362237 tggcat 34362232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 365 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23402422 - 23402371
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaa 416  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23402422 tatggaaaattctatggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 23402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31579255 - 31579172
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccc 451  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  31579255 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc 31579172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 642 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421207
Alignment:
Q  642 aaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaaca 718  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||   ||||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaattaatgatcaaca 27421207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 416
Target Start/End: Original strand, 40381940 - 40381988
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaa 416  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40381940 ggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40381988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 734 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33688118 - 33688052
Alignment:
Q  734 aaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||    
T  33688118 aaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcacgactgcactgtagaagctccct 33688052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Original strand, 22980808 - 22981218
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||| ||||| | ||||||   | || ||| ||||     |    
T  22980808 gaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaatacccc-actgtttgagcaatgacatcaaaa-----g 22980901  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22980902 ttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaa 22981001  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  22981002 cacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattacta 22981101  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  22981102 gatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagtttcctgact 22981201  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
    | ||| |||||||||||    
T  22981202 gcaccatagaagctccc 22981218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 370 - 783
Target Start/End: Original strand, 699152 - 699559
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  || |||| | |||||||||||||||| | |||||||| |||| |    
T  699152 aaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgac 699250  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || |     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||     
T  699251 atca-----aaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacact 699345  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  699346 ccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgtt 699445  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699446 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 699545  T
Q  770 cagttgcctgactg 783  Q
    ||||| ||||||||    
T  699546 cagtttcctgactg 699559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 19119859 - 19120285
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  19119859 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacacccc-actgtttgtacagtg 19119957  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19119958 acatca-----aaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataaca 19120052  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19120053 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatg 19120152  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19120153 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 19120252  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||    
T  19120253 gtcagtttcatgactgcaccttagaagctccct 19120285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 38528379 - 38527985
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||     |||||||| | |||||||    
T  38528379 ttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacacccc-attgtttatacagtgacatcaaaa-----gttcagtctc-atagtat 38528287  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528286 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 38528187  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    ||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38528186 taatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 38528087  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38528086 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 38527987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 368 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8742062 - 8741651
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  8742062 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaatg 8741963  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8741962 gcatca-----aaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaaca 8741868  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat-aacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8741867 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaat 8741768  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8741767 gttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 8741668  T
Q  767 agtcagttgcctgactg 783  Q
    |||| ||| | ||||||    
T  8741667 agtctgtttcatgactg 8741651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 366 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 35511654 - 35511231
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||  || || ||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||||||| ||    
T  35511654 atggaaaatcctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactcc-actgtttgtaaag 35511556  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    || ||| |     |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  35511555 tgacatca-----aaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaa 35511461  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    ||||||||||| ||||||||     |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35511460 caccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaaga 35511366  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  35511365 tgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaa 35511266  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35511265 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 35511231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 12910350 - 12910779
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |  |||| ||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||| |||     
T  12910350 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacacccc-actgtttgtacagta 12910448  T
Q  468 gcattaaaattaaa-gttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
     || | | || ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12910449 -cagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12910548 accccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagat 12910647  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12910648 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaa 12910747  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  12910748 agtcagtttcctgactgcaccatagaagctcc 12910779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 366 - 800
Target Start/End: Original strand, 40133383 - 40133811
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||| |     
T  40133383 atggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actatttgtacaa 40133481  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| ||||     |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40133482 tggcatcaaaa-----gttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa 40133576  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  40133577 caccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaaga 40133676  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40133677 tgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaa 40133776  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40133777 aagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccct 40133811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 23116399 - 23115980
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || || || |||| ||| |||||| |  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  23116399 atggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcacccc-actgtttgtacag 23116301  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    ||| || ||||     |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23116300 tggaatcaaaa-----gttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaa 23116206  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23116205 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 23116106  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||||||||||||        | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23116105 tgttgcaagcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaa 23116014  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||| |||||    
T  23116013 aagtcattttcctgacttcaccgtagaaactccc 23115980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 394 - 800
Target Start/End: Original strand, 22255207 - 22255608
Alignment:
Q  394 aataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaag-tgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcacc 492  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| | |||||| ||||     |||||||   |    
T  22255207 aataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacacccc-accgtttgtacaatggcatcaaaa-----gttcagttctc 22255300  T
Q  493 atagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 592  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22255301 atattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaac 22255400  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22255401 tattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattac 22255500  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22255501 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcctgactgtaccgtaga 22255600  T
Q  793 agctccct 800  Q
    ||||||||    
T  22255601 agctccct 22255608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 367 - 801
Target Start/End: Original strand, 36866761 - 36867189
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| | || ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| | |    
T  36866761 tggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacacccc-actgtttgtacaat 36866859  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| |     ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36866860 ggcatca-----aaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 36866954  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  36866955 accccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagat 36867054  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  36867055 gttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaa 36867154  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  36867155 agtcaattttctgactgcaccgtagaagctcccta 36867189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 389 - 774
Target Start/End: Original strand, 5837576 - 5837955
Alignment:
Q  389 atgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagt 488  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||     |||||    
T  5837576 atgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaatt-----tcagt 5837669  T
Q  489 caccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5837670 ctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacactta 5837769  T
Q  589 agactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  5837770 agactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 5837869  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5837870 ttactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcagtt 5837955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 365 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 31786824 - 31786397
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  || |||| ||||||||| |   |||| | |||||||| |    
T  31786824 tatggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgcccc-actgtttgtaca 31786726  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||||||| ||||     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31786725 gtggcatcaaaa-----gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgta 31786631  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  31786630 acaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaag 31786531  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31786530 atgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaa 31786431  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||    
T  31786430 aaagtcagtttcctgattgcaccatagaatctcc 31786397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Original strand, 33908248 - 33908657
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||||||| |     ||||    
T  33908248 gaagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactcc-actgtttgtacggtggcatca-----aaag 33908341  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33908342 ttcagtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaa 33908441  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33908442 cacttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 33908541  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||    
T  33908542 gat-aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaact 33908640  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
    | |||||||| ||||||    
T  33908641 gcaccgtagatgctccc 33908657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 370 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500676
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||| | || |    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctc-actgtttgtacactgcc 25501001  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25501000 atcaaaa-----gttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 25500906  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25500905 ccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgtt 25500806  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  25500805 gcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaaaat 25500706  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  25500705 cagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 25500676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 27330306 - 27330730
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||  || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||  || |||||||| | ||    
T  27330306 ggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacct-tactgtttgtacaatg 27330402  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27330403 gcatcaaaa-----gttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca 27330497  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27330498 ccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 27330597  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  27330598 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaa 27330697  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  27330698 gtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccct 27330730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Original strand, 22019647 - 22020049
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||     |    
T  22019647 gaagttattagaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-attgtttgtatagtgacatcaaaa-----g 22019740  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22019741 ttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataa 22019840  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    ||||         ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22019841 cact---------cacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattacta 22019931  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  22019932 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgact 22020031  T
Q  783 gtaccgtagaagctccct 800  Q
    | |||||||||| |||||    
T  22020032 gcaccgtagaagttccct 22020049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 27318647 - 27318238
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | || ||| |||| |  ||    
T  27318647 gaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacacc-actgtttgtacaatgacatcaaaagtttag 27318549  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||  ||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27318548 ttc--tcac---agtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaa 27318454  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||     
T  27318453 cacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtaca--taagtttaagatgttgcaaacattacta 27318356  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgac 781  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  27318355 tatgaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgac 27318256  T
Q  782 tgtaccgtagaagctccc 799  Q
    || ||| ||||| |||||    
T  27318255 tgcaccatagaaactccc 27318238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 494 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 31705667 - 31705362
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  31705667 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagacc 31705568  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31705567 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 31705468  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  31705467 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaa 31705368  T
Q  794 gctccc 799  Q
     |||||    
T  31705367 tctccc 31705362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 39572819 - 39573235
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |  ||||||| |||| ||| ||||||||||| || | |||||||  ||||    
T  39572819 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactcc-actgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39572918 acatcaaaa-----gttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 39573012  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39573013 tcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 39573104  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39573105 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 39573204  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  39573205 gtcagtttcataactgcaccgtagaagctcc 39573235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 400 - 795
Target Start/End: Original strand, 36860455 - 36860845
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     |||||||| |||||||||    
T  36860455 ttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtccccatagtat 36860548  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgtttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 598  Q
    || |||||||||| | |||||| | || | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36860549 caacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcac 36860648  T
Q  599 ataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattga 698  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  36860649 ataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattaa 36860748  T
Q  699 tcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  36860749 tcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagc 36860845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Original strand, 35934000 - 35934322
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaag 577  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35934000 aaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaag 35934099  T
Q  578 tgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35934100 tgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcat 35934199  T
Q  678 tacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| |     
T  35934200 tactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttca 35934299  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    | |||| ||||||||| ||||||    
T  35934300 taactgcaccgtagaaactccct 35934322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 479 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 15992610 - 15992301
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  15992610 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatttgagtgcaacaccccacaaagt 15992511  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    || ||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15992510 gtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcatt 15992411  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  15992410 actagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcat 15992311  T
Q  779 gactgtaccg 788  Q
    ||||| ||||    
T  15992310 gactgcaccg 15992301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 479 - 771
Target Start/End: Original strand, 35504470 - 35504762
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||    
T  35504470 aaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagt 35504569  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35504570 gtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtatt 35504669  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35504670 actagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgactttttcaaaaaagtca 35504762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 493 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 17158087 - 17157781
Alignment:
Q  493 atagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 592  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17158087 atagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 17157988  T
Q  593 tatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
     ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  17157987 catcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattat 17157888  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtaga 792  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  17157887 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgtaccgtaga 17157788  T
Q  793 agctccc 799  Q
    |||||||    
T  17157787 agctccc 17157781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 22974257 - 22973838
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| | |||||||| | |     
T  22974257 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatccc-actgtttgtacaata 22974159  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||| |   |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  22974158 acatcaaaa-----gttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaaca 22974064  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22974063 cctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 22973964  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  22973963 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaa 22973864  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||    
T  22973863 atcagttttctgactgcaccatagaa 22973838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 494 - 799
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42343146
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||           
T  42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact------- 42342942  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
      ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  42342943 --cacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacc 42343040  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  42343041 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 42343140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 494 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7208919 - 7208639
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7208919 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagact 7208820  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| |    
T  7208819 atcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattatt 7208720  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  7208719 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttaaaaaaagtcagtt 7208639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 35826658 - 35826276
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |  |||| ||||||| |||| ||||||||||  | | |||||||| ||||    
T  35826658 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttc-attgtttgtacagtg 35826560  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35826559 acatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaaca 35826466  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35826465 ctccacaaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 35826368  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826367 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 35826276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 368 - 798
Target Start/End: Original strand, 9200233 - 9200648
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  9200233 ggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaca-gtttgtacagtg 9200331  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||| ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9200332 acatcaaaa-----gtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 9200426  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
      |||||||||||||||||         ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9200427 ttccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatg 9200517  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||| |||||||    
T  9200518 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaa 9200617  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
     |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  9200618 atcagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 9200648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 400 - 797
Target Start/End: Original strand, 32563181 - 32563563
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||| |||| ||| ||||     |||||||| || || |||    
T  32563181 ttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactcc-actgtctgtacagtgacatcaaaa-----gttcagtccccttaatat 32563274  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||    
T  32563275 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacact---------caca 32563365  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||    
T  32563366 tgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattattattgat 32563465  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  32563466 cattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctc 32563563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 383 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 30969484 - 30969114
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | || ||| ||||     |    
T  30969484 gaagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actatttatacaatgacatcaaaa-----g 30969391  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30969390 ttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaa 30969291  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||  |||||| |||||| ||||||     
T  30969290 cacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattacta 30969191  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30969190 gatgagttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 30969114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 514 - 796
Target Start/End: Original strand, 5830032 - 5830314
Alignment:
Q  514 attaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaact 613  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5830032 attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaact 5830131  T
Q  614 ctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaat 713  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5830132 ctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 5830231  T
Q  714 caacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  5830232 caacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttcc-aaaatgtcaattttctgactgcaccgtagaagct 5830314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 367 - 774
Target Start/End: Original strand, 7693229 - 7693621
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  7693229 tggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatccc-actgtttgtacagt 7693327  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    ||||| ||||     ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7693328 ggcatcaaaa-----gttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaac 7693422  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||         ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7693423 accccacaaagtgtaacact---------cacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagat 7693513  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||    
T  7693514 gttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaa 7693613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Original strand, 8436981 - 8437390
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||  |||   || |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||     |    
T  8436981 gaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatccc-attgtttgtacagtgacatcaaaa-----g 8437074  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||||||  |||  |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  8437075 ttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaa 8437173  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||     
T  8437174 cacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattacta 8437273  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8437274 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgact 8437373  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
    | | |||||| ||||||    
T  8437374 gcatcgtagatgctccc 8437390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23954859 - 23954551
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23954859 aaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaat 23954760  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||     | ||||    
T  23954759 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacatt 23954666  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23954665 acttgatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcct 23954573  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  23954572 gactgcaccatagaagctccct 23954551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 400 - 800
Target Start/End: Original strand, 24886136 - 24886513
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| |||||||||||| |  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||     ||||||||  ||||||||    
T  24886136 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatgacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtat 24886229  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||                 |||||||||||||||||||||    
T  24886230 catcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagt-----------------gtaacacttaagactatcaca 24886312  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24886313 taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 24886412  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||    
T  24886413 cattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccataaaagctccc 24886512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 523 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2888471 - 2888194
Alignment:
Q  523 actaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgca 622  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||    
T  2888471 actacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgca 2888372  T
Q  623 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2888371 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 2888272  T
Q  723 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  2888271 aaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagccccct 2888194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 366 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14409503 - 14409090
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||| | | ||  ||  |    
T  14409503 atggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcacccc-actcttaatacgg 14409405  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| ||||     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14409404 tggcatcaaaa-----gttcagtctc-atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaa 14409311  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |               || |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14409310 ct--------------actcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaaga 14409225  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  14409224 tgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaa 14409125  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14409124 aaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 528 - 795
Target Start/End: Original strand, 25669740 - 25669997
Alignment:
Q  528 acttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgtta 627  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||         ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  25669740 acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatgtta 25669829  T
Q  628 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaa 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25669830 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 25669929  T
Q  728 tgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  25669930 tgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagc 25669997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 363 - 767
Target Start/End: Original strand, 15724485 - 15724881
Alignment:
Q  363 tatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgta 462  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||| ||    
T  15724485 tatatggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacacccc-actgtttata 15724583  T
Q  463 tagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtg 562  Q
     | || ||| |||      |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||     
T  15724584 caatgacatcaaa------gttcagtc-ccataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagta 15724676  T
Q  563 taacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 662  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||||||| || | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  15724677 taacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtcca 15724776  T
Q  663 agatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttcca 762  Q
    | || ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  15724777 aaatattgtaagcattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttca 15724876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 496 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956116
Alignment:
Q  496 gtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
Q  596 cacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactat 695  Q
    || |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13956315 catataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat 13956216  T
Q  696 tgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || |   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||    
T  13956215 tgatcattaatcagtaatcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagctttctgactgcaccgtagaagc 13956118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 43308722 - 43308408
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  43308722 aaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagt 43308623  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||        |||| |||||||  |||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43308622 gtaacacttaagactat--------atcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcatt 43308531  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43308530 actagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcct 43308431  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
     |||| ||| | |||||||||||    
T  43308430 aactgcaccattgaagctcccta 43308408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 368 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14919704 - 14919314
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctgg-tgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||| | | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||| |    
T  14919704 ggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctc-actgtttatataat 14919606  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14919605 gacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaac 14919511  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||    |||||| |||||    
T  14919510 acctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagat 14919415  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
     |||||| ||       ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14919414 attgcaatca------gatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaa 14919322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 588 - 800
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889796
Alignment:
Q  588 aagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatga 687  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
Q  688 attactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtacc 787  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  25889684 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccagaaaagtcagtttcctgactgcatc 25889783  T
Q  788 gtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||    
T  25889784 gtagaagctccct 25889796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 479 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 21088836 - 21088559
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21088836 aaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagt 21088737  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| || ||||||||| |||||||    
T  21088736 gtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcatt 21088637  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21088636 actagatgaattactattaatcatgaataaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaattttt 21088559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 407 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416300
Alignment:
Q  407 gtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaat 506  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||     ||||| || || || ||||||||||    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatccc-actgtttgtacagtggaatcaaaa-----gttcaatctccttaatatcatcaat 28416570  T
Q  507 tcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatc 606  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| | |||    
T  28416569 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 28416479  T
Q  607 accaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat 706  Q
    | ||||||               |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28416478 agcaactc---------------gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaat 28416394  T
Q  707 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  28416393 caacaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagcttcatgactgcaccgtagaagctccct 28416300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 426 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 6824598 - 6824329
Alignment:
Q  426 atcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaact 525  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| ||| |||| |   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  6824598 atcaaaagtgttgtgagtaacactcc-actgtttgtacagtgacatcaaaagt---gttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaat 6824503  T
Q  526 aaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgt 625  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||    
T  6824502 acacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgt 6824404  T
Q  626 taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatca 701  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||    
T  6824403 taaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 774
Target Start/End: Original strand, 8466766 - 8467126
Alignment:
Q  389 atgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagt 488  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||| |||||||||   | |||||| ||||| || ||||     ||||| |    
T  8466766 atgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacaccccc--tctttgtacagtggtatcaaaa-----gttcaat 8466858  T
Q  489 caccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||                 |||    
T  8466859 ccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaacac-----------------tta 8466941  T
Q  589 agactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  8466942 agactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaa 8467040  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  8467041 ttactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaactttttaaaaaaaatcagtt 8467126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 383 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 1429305 - 1428983
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |        
T  1429305 gaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacacccc-actgtttgtacactggcatcaaaaat---- 1429211  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||                  
T  1429210 -tcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac-------------- 1429126  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
       ||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1429125 ---ttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 1429029  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaa---tcaacaatttaaa 725  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  1429028 gatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 643
Target Start/End: Original strand, 26268089 - 26268343
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||     |    
T  26268089 gaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacacccc-actgtttgtacggtgacatcaaaa-----g 26268182  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26268183 tttagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaa 26268282  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataa 643  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26268283 cacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaaggataa 26268343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 799
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254280
Alignment:
Q  673 agcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcag 772  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaa 43254253  T
Q  773 ttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||    
T  43254254 tttcctgactgcaccatagaagctccc 43254280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 368 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5112488 - 5112247
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |  |||| || |||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  5112488 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 5112390  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  5112389 gcatca-----aaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-a 5112296  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctg 616  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  5112295 ccccacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 639 - 801
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269236
Alignment:
Q  639 gataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 738  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
Q  739 ttaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  26269174 ttaagattaaaattaactttttcataaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaactcccta 26269236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 619
Target Start/End: Original strand, 11898148 - 11898199
Alignment:
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgttt 619  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11898148 ccccacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactctgttt 11898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668796
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||| |     ||||||||||| || |||||||||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgaacagtggcatca-----aaagttcagtccccttagtatcatca 25668779  T
Q  505 attcatcagattaacaa 521  Q
    |||||| ||||||||||    
T  25668780 attcattagattaacaa 25668796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 749 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34853895 - 34853844
Alignment:
Q  749 aattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  34853895 aattaacttttccaaaaaagtcagtttcccgactgcaccatagaagctccct 34853844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13956520 - 13956439
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacc 449  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13956520 ggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacc 13956439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 744 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 1428978 - 1428922
Alignment:
Q  744 atcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||    
T  1428978 atcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcatgagtgcaccatagaagctccct 1428922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 370 - 450
Target Start/End: Original strand, 11898004 - 11898084
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacaccc 450  Q
    |||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  11898004 aaaattttagggtgaagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccc 11898084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 799
Target Start/End: Original strand, 11898197 - 11898240
Alignment:
Q  756 ttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11898197 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 11898240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 795
Target Start/End: Original strand, 27579363 - 27579406
Alignment:
Q  752 taacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  27579363 taacttttccaaaaaagttagttttctgactgtaccgtagaagc 27579406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16004555 - 16004474
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaata-acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaa 445  Q
    ||||||||||| || ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16004555 tatggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 449
Target Start/End: Original strand, 35933902 - 35933983
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacc 449  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| | |||| || |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35933902 ggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacc 35933983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 17167715 - 17168139
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | || |    
T  17167715 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatgac 17167813  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167814 atcaaaa-----gttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 17167908  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167909 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 17168008  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||    
T  17168009 gcaagcatcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagt 17168108  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||| | | |||| ||||||||| ||||||    
T  17168109 cagtttctttactgcaccgtagaaactccct 17168139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 17173292 - 17173716
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| | || |    
T  17173292 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatgac 17173390  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173391 atcaaaa-----gttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 17173485  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173486 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 17173585  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||    
T  17173586 gcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagt 17173685  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  17173686 cagtttcttgactgcaccgtagaaactccct 17173716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 28003199 - 28002772
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| ||||  || || | |||||||| ||    
T  28003199 atggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactcc-actgtttgtacag 28003101  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    || ||| ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28003100 tgacatcaaaa-----gttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa 28003006  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28003005 caccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 28002906  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28002905 tgttgctaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 28002806  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  28002805 aagtcagtttcctgactgcagtgtagaagctccc 28002772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089239
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacacccc-actgtttgtataatg 19089566  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||    
T  19089565 acatca-----aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaaca 19089471  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19089470 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 19089371  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19089370 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaa 19089271  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  19089270 gtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 19089239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493474
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |  |||  ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| |||| |    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacacccc-attgtttgtacagtgac 36493799  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || |     ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  36493798 atca-----aaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-act 36493705  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  36493704 ccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatatt 36493605  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36493604 gcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagt 36493505  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  36493504 caatttcctgactgcaccatagaagctccct 36493474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Original strand, 49375964 - 49376392
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataactttt-ctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |    
T  49375964 atggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacacccc-actgcttgtaca 49376062  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||||||| |     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||| || | ||| |||||||       
T  49376063 gtggcatca-----aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttat 49376157  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49376158 acaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 49376257  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49376258 aagttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 49376357  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49376358 aaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 49376392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 25701268 - 25700842
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25701268 ggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaaca-ccctactgtttgtacagtg 25701170  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25701169 acatca-----aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 25701075  T
Q  568 -ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  25701074 tccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagat 25700975  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
     |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25700974 tttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 25700875  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||| |||||    
T  25700874 agtcaatttcctaactgcaccgtagaaactccc 25700842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 35021246 - 35020816
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||    
T  35021246 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacacc-actgtttgtacattg 35021148  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    || | ||||     |||  |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35021147 gcgtcaaaa-----gtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaaca 35021053  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||     
T  35021052 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagata 35020953  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattac----tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaa 763  Q
    |||||| |||||||  |||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35020952 ttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaa 35020853  T
Q  764 aaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  35020852 aagagtcagttttctgactacaccgtagaagctccct 35020816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 479 - 773
Target Start/End: Original strand, 33341504 - 33341797
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33341504 aaagttcagtc-ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagt 33341602  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33341603 gtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcatt 33341702  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagt 773  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33341703 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttttaaaaaagtcagt 33341797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 366 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 55241317 - 55240891
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |  ||| |||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||    
T  55241317 atggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacacccc-actgtttgtacag 55241219  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    |||||| |     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55241218 tggcatca-----aaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga-taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaa 55241125  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaga 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55241124 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 55241025  T
Q  666 tgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  55241024 tgttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttcaaaa 55240925  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||| ||||    
T  55240924 aagtcagtttcataactgcaccgtagaagttccc 55240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 25184113 - 25184539
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| | || |||||||| | ||    
T  25184113 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactc-tactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     |||  |||     ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  25184212 acatccaaa-----gttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 25184306  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25184307 cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 25184406  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25184407 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 25184506  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  25184507 gtcagttttctgactgcaccatagaagctccct 25184539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 361 - 801
Target Start/End: Original strand, 47253742 - 47254167
Alignment:
Q  361 tttatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    ||||| || |||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||     
T  47253742 tttatgtgaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacacccat--tgttta 47253839  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || |||| ||| ||||     ||||||||  |||||||||||        ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47253840 tacagtgacatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcat--------cagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaag 47253926  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  47253927 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtc 47254026  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttc 760  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  47254027 taagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 47254126  T
Q  761 caaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  47254127 caaaaaagtcagtttgatgactccaccgtagaagctcccta 47254167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 384 - 796
Target Start/End: Original strand, 7703533 - 7703931
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||     ||    
T  7703533 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacacccc-actgtttgtacggtgacatcaaaa-----gt 7703626  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 583  Q
    |||||| ||||||||||||        ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7703627 tcagtccccatagtatcat--------cagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcac 7703718  T
Q  584 acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttc 683  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||      
T  7703719 acttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactag 7703818  T
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  7703819 atgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactg 7703918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 37663847 - 37663526
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  37663847 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagt 37663748  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37663747 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 37663648  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||   |||||||||| || |||    
T  37663647 actagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaaagtcaatttcct 37663548  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37663547 gactgtaccgtagaagctccct 37663526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 365 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34948311 - 34947923
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    |||| |||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |    
T  34948311 tatgtaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtaaa 34948213  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||||||| |     |||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |    
T  34948212 gtggcatca-----aaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgca 34948118  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaac--acttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 662  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34948117 acaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtcca 34948018  T
Q  663 agatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 757  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34948017 agatgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 394 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 46888342 - 46887946
Alignment:
Q  394 aataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcacca 493  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| || ||||| ||||     |||||||| |||    
T  46888342 aataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaatacccc-actatttgtacagcggcatcaaaa-----gttcagtcccca 46888249  T
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  46888248 tactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactta-gact 46888150  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  46888149 atcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattact 46888050  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  46888049 attgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccgtagaa 46887950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 362 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19440866 - 19440434
Alignment:
Q  362 ttatatggaaaattataaggcgaa-gttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    |||||||||||||| || || ||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| |||| ||| |||||| || |  |||||    
T  19440866 ttatatggaaaattctatggtgaaagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactcc-accgtttg 19440768  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || | |||||| ||||     ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19440767 tacaatggcatcaaaa-----gttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataag 19440673  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 660  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19440672 cgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtc 19440573  T
Q  661 taagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttc 760  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19440572 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 19440473  T
Q  761 caaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19440472 taaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 19440434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34361702 - 34361276
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  34361702 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccc-actgtttgtagaatg 34361604  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||||||||     |||||| | | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  34361603 acattaaaa-----gttcagcctc-ataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca 34361510  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  34361509 ccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatg 34361410  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34361409 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 34361310  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34361309 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 34361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 29584409 - 29583984
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || |||||  || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||| | | |||||||| | ||    
T  29584409 ggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctc-actgtttgtacaatg 29584313  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  29584312 gcatcaaaa-----gttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttaca 29584218  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29584217 ccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 29584118  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  29584117 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaa 29584018  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  29584017 gtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcccta 29583984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 363 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 55478111 - 55477717
Alignment:
Q  363 tatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgta 462  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||     
T  55478111 tataaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactcc-actgtttgt- 55478014  T
Q  463 tagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtg 562  Q
    | ||   || | |   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  55478013 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtg 55477914  T
Q  563 taacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 662  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  55477913 taacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtcca 55477814  T
Q  663 agatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55477813 agatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 55477717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 879759 - 879334
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| | ||    
T  879759 ggaaaattttaaggtgaagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctc-attgtttgtacaatg 879661  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  879660 acatcaaaa-----gtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca 879566  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  879565 cctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatg 879466  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  879465 ttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaa 879366  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||  ||||||  ||| |||||||||||    
T  879365 gtcagttttctgactacaccatagaagctccc 879334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 389 - 800
Target Start/End: Original strand, 23761093 - 23761497
Alignment:
Q  389 atgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagt 488  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |     ||||||||||    
T  23761093 atgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctc-actgtttgtatagtgacatca-----aaagttcagt 23761186  T
Q  489 caccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||    
T  23761187 ccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacattta 23761285  T
Q  589 agactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaa 688  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  23761286 agactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 23761385  T
Q  689 ttactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccg 788  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||    
T  23761386 ttattattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactacaccg 23761485  T
Q  789 tagaagctccct 800  Q
     | |||||||||    
T  23761486 aataagctccct 23761497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 368 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 32912791 - 32912363
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||| || | |||||| | ||    
T  32912791 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-tagtatttgtagaatg 32912693  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcac-catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
      || ||||     |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  32912692 atatcaaaa-----gttcag-cactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaac 32912599  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32912598 accctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 32912499  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  32912498 gttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaa 32912399  T
Q  766 aagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  32912398 aagtcagtttcctgactgcaccgtaaaagctcccta 32912363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 384 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33816728 - 33816301
Alignment:
Q  384 aagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagt 483  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||| |||| | | | ||| ||  ||||||| ||||     ||    
T  33816728 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctc-actatttatacggtggcatcaaaa-----gt 33816635  T
Q  484 tcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccca----------- 572  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||               
T  33816634 tcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaat 33816535  T
Q  573 ------caaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
          |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33816534 accccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagat 33816435  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33816434 gttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 33816335  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  33816334 agtcagtttcctgactgcatcgtagaagctccct 33816301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 6864140 - 6864460
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6864140 aaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 6864239  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  6864240 gtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcatt 6864339  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6864340 actagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttct 6864439  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6864440 gactgcaccgtagaagctccc 6864460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Original strand, 32579444 - 32579871
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgt---ata 464  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||   |      
T  32579444 ggaaaattttatggtgaagttctgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcacccc-agtgtttgttgtacg 32579542  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
    ||| ||| ||||     ||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32579543 gtgccatcaaaa-----gtttagtctc-atagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta 32579636  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32579637 agacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 32579736  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaa 764  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32579737 atgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaa 32579836  T
Q  765 aaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  32579837 aaagtcagttttctaactgcaccgtagaaactccc 32579871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 496 - 798
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3043043
Alignment:
Q  496 gtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 595  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 3042840  T
Q  596 cacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactat 695  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  3042841 cacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaattagtat 3042940  T
Q  696 tgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagc 795  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  3042941 tgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagc 3043040  T
Q  796 tcc 798  Q
    |||    
T  3043041 tcc 3043043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 482 - 759
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815686
Alignment:
Q  482 gttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgta 581  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  582 acacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattact 681  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattact 1815608  T
Q  682 tcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815609 agatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 1815686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 400 - 798
Target Start/End: Original strand, 37775701 - 37776082
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||     ||||   | || ||||||    
T  37775701 ttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatcaaaa-----gttcc--ccccttagtat 37775792  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  37775793 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------caca 37775883  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37775884 tgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 37775983  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  37775984 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcc 37776082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 494 - 774
Target Start/End: Original strand, 50697361 - 50697642
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50697361 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagact 50697460  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgca-tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattac 692  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  50697461 atcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaattac 50697560  T
Q  693 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50697561 tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaagtcagtt 50697642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 383 - 797
Target Start/End: Original strand, 50764747 - 50765143
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||     |    
T  50764747 gaagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacac--taacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacggtgacatcaaaa-----g 50764838  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||    
T  50764839 ttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccacaaagtgaaa 50764928  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||| || | |||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50764929 cactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacta 50765028  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||| | ||| |    
T  50765029 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtttgtttcatgatt 50765128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 494 - 800
Target Start/End: Original strand, 17272084 - 17272390
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  17272084 tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagact 17272183  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    ||| ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17272184 atcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 17272283  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || | |||||| |||||||||    
T  17272284 attgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaataagtcaatttcatgactgcaccgtagaa 17272383  T
Q  794 gctccct 800  Q
    |||||||    
T  17272384 gctccct 17272390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 370 - 797
Target Start/End: Original strand, 27396618 - 27397037
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||  |||||||||||| || |||||||| | || |    
T  27396618 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccc-tactgtttgtacaatgac 27396716  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27396717 atcaaaa-----gtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatc 27396811  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| || |||||    
T  27396812 ccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgtt 27396911  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |    
T  27396912 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttttaaaaaat 27397009  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  27397010 cagtttcatgattgcaccgtaaaagctc 27397037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 507 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 30002710 - 30002427
Alignment:
Q  507 tcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatc 606  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| | |||    
T  30002710 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacatgatatc 30002620  T
Q  607 accaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat 706  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30002619 agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 30002520  T
Q  707 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || | | |||| |||||||||||||||    
T  30002519 cagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaagctccc 30002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 369 - 799
Target Start/End: Original strand, 4597994 - 4598407
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  4597994 gaaaattttatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgg 4598091  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     |||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4598092 catcaaaa-----gttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacac 4598185  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    ||||||||||||||||||         ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  4598186 cccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgt 4598276  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||    
T  4598277 tgcaagcattattagattaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaag 4598376  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  4598377 tcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 4598407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 398 - 793
Target Start/End: Original strand, 32592123 - 32592503
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||     |||||||| || ||||    
T  32592123 acttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactcc-actgtttgtatagtgacatcaaaa-----gttcagtccccttagt 32592216  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  32592217 atcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------ca 32592307  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
     || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32592308 tatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattg 32592407  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||    
T  32592408 atcgttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttatgactgcaccgtagaa 32592503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 383 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 5048161 - 5047752
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaag 482  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||   ||  || |     ||||    
T  5048161 gaagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccac-actgtttgtacgatgatatca-----aaag 5048068  T
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  5048067 ttcagttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccgcaaaatgtaa 5047969  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  5047968 cacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttacta 5047869  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     || ||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  5047868 gataaattattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtctgtttcctgact 5047769  T
Q  783 gtaccgtagaagctccc 799  Q
    | |||||| ||||||||    
T  5047768 gcaccgtaaaagctccc 5047752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Original strand, 37287733 - 37288155
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttct-ggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||    
T  37287733 ggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagt 37287831  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    ||||| ||||     ||||| ||  |||| |||||| |        ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  37287832 ggcatcaaaa-----gttcaatcctcataatatcataa--------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaa 37287918  T
Q  566 cacccc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37287919 cgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 37288018  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tcaaaattaacttttccaa 763  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  37288019 atgttgcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttcaa 37288118  T
Q  764 aaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||    
T  37288119 aaaagtcactttcatgactgcaccgtggaagctccct 37288155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 801
Target Start/End: Original strand, 42199834 - 42200157
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  42199834 aaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagt 42199933  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta-catgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  42199934 gtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcat 42200033  T
Q  678 tacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgc 776  Q
    ||||  |||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||| || |    
T  42200034 tactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaactttttcaaaaaggtcaatttc 42200132  T
Q  777 ctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  42200133 ctgattgcaccgtagaagctcccta 42200157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 479 - 783
Target Start/End: Original strand, 9139350 - 9139636
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9139350 aaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagt 9139449  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||        |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9139450 gtaacacttaaga--------taa--------actctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 9139533  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9139534 actagacgaattactattgatcattaatcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcct 9139631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 571 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7152218 - 7152015
Alignment:
Q  571 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 670  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7152218 cacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttg 7152119  T
Q  671 caagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtc 770  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7152118 caagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtc 7152019  T
Q  771 agtt 774  Q
    ||||    
T  7152018 agtt 7152015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 405 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934023
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||     ||||| ||  |||||||||||||    
T  4934375 tggtgaagttaacac--tagtataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaa-----gttcaatcctcatagtatcatca 4934283  T
Q  505 attcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 604  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4934282 tttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataata 4934183  T
Q  605 tcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatta 704  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |           |||||||| |||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
T  4934182 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcatta 4934094  T
Q  705 attagtaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    || ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4934093 atcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtt 4934023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 368 - 673
Target Start/End: Original strand, 38011854 - 38012153
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||  |||    
T  38011854 ggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcacccc-actgtttgtacggtg 38011952  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  38011953 ccatcaaaa-----gttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaaca 38012047  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38012048 tcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38012147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 609 - 801
Target Start/End: Original strand, 4205219 - 4205411
Alignment:
Q  609 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaatta 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| |    
T  4205219 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataa 4205318  T
Q  709 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  4205319 gtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaagctcccta 4205411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 604 - 793
Target Start/End: Original strand, 39400238 - 39400427
Alignment:
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  39400238 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatcatt 39400337  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaa 793  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  39400338 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactggaccgtagaa 39400427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896514
Alignment:
Q  572 acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtct-aagatgttg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||    
T  26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttg 26896383  T
Q  671 caagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26896384 caaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagt 26896483  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || || |||||||| |||||||||| |||||    
T  26896484 caatttcctgactgcaccgtagaagttccct 26896514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 645 - 800
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431981
Alignment:
Q  645 atagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga 744  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
Q  745 tcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  23431926 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccct 23431981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 636 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025379
Alignment:
Q  636 aacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  736 acattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagt 773  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaactttttcataaaagtcagt 35025379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 523 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 46884170 - 46883932
Alignment:
Q  523 actaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgca 622  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  || | ||||||||    
T  46884170 actacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattttgtttgca 46884073  T
Q  623 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt 722  Q
    ||||||| ||  ||| ||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46884072 tgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 46883977  T
Q  723 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||    
T  46883976 aaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaa 46883932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 507 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35025674 - 35025530
Alignment:
Q  507 tcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatc 606  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35025674 tcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 35025575  T
Q  607 accaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 651  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35025574 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 393 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 54499425 - 54499172
Alignment:
Q  393 gaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgta-tagtggcattaaaattaaagttcagtcac 491  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| || || ||| ||||     |||||||| |    
T  54499425 gaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-accgtttgtactaatgacatcaaaa-----gttcagtctc 54499332  T
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  54499331 tatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaag 54499232  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 651  Q
    |||||||||| | || |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  54499231 actatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaaa-atgccaacgataaaatggtac 54499172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 684 - 801
Target Start/End: Original strand, 38012572 - 38012689
Alignment:
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  38012572 atgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaattagtttcctgactg 38012671  T
Q  784 taccgtagaagctcccta 801  Q
     || ||| ||||||||||    
T  38012672 cactgtaaaagctcccta 38012689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 361 - 580
Target Start/End: Original strand, 39397911 - 39398115
Alignment:
Q  361 tttatatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttg 460  Q
    |||| |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  39397911 tttaaatggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacacccc-attgtttg 39398009  T
Q  461 tatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaag 560  Q
    || |||| ||| ||||     ||||||||  |  |||||||||||||         ||||| | || |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  39398010 tacagtgacatcaaaa-----gttcagtcttctcagtatcatcaatt---------aacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaag 39398095  T
Q  561 tgtaacaccccacaaagtgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39398096 tgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 615 - 678
Target Start/End: Original strand, 56050171 - 56050234
Alignment:
Q  615 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  56050171 tgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7152317 - 7152235
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacaccc 450  Q
    |||||||| || || ||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7152317 ggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacaccc 7152235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 370 - 798
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12332
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaa-taacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtat-agtg 467  Q
    |||||| || || ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    | || ||||     ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12008 gtatcaaaa-----gttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaaca 12102  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12103 ccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 12202  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  12203 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaa 12301  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  12302 gtaagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 12332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 802
Target Start/End: Original strand, 4166922 - 4167350
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  4166922 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacacccc-actgtttgtacaatg 4167020  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4167021 gcatca-----aaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 4167115  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  4167116 ccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 4167215  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4167216 ttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 4167315  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccctac 802  Q
    |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4167316 gtcaattttctgactgcaccgtagaagctccctac 4167350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 41960945 - 41961265
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41960945 aaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagt 41961044  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41961045 gtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 41961144  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  41961145 actagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcct 41961244  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  41961245 gactgcaccgtagaagctccc 41961265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 405 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648024
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||     ||||||||| |||||||||||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctc-actgtttgtataatgacatcaaaa-----gttcagtcatcatagtatcatca 43648318  T
Q  505 attcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 604  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43648317 actcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataata 43648218  T
Q  605 tcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatta 704  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43648217 tcatcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcatta 43648118  T
Q  705 attagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcc 798  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  43648117 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 43648024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 368 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 31570937 - 31570514
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||| || ||||||||||| | | ||| |||||||    
T  31570937 ggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacacccc-actatttttatagtg 31570839  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31570838 acatcaaaa-----gttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaaca 31570744  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31570743 ccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatg 31570644  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||    
T  31570643 ttgcaagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaactttttaaaaaaa 31570544  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  31570543 gtcagtttcatgactgcagtgtagaagctc 31570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19424831 - 19424420
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  19424831 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-attgtttatatagtg 19424733  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19424732 gcatcaaaa-----gtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca 19424638  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||              ||||| || ||||||||||||    
T  19424637 ccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat--------------agtacctgcaagtctaagatg 19424552  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19424551 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 19424452  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  19424451 gtcagtttgatgactgcaccgtagaagctccc 19424420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 370 - 797
Target Start/End: Original strand, 3176941 - 3177362
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||  |||||||||| |  | |||||||| | || |    
T  3176941 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgca-actgtttgtacaatgac 3177039  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3177040 atcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacacc 3177134  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3177135 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatatt 3177234  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
     |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  3177235 acaagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagt 3177334  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3177335 cagtttcctgactgcaccgtagaagctc 3177362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 383 - 800
Target Start/End: Original strand, 4763643 - 4764058
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaa---aagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaatta 479  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||   || |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |     |    
T  4763643 gaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatca-----a 4763736  T
Q  480 aagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtg 579  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4763737 aagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtg 4763836  T
Q  580 taacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatta 679  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4763837 taacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcatta 4763936  T
Q  680 cttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| |||    
T  4763937 ctagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttttaaaaagtcagtttcct 4764036  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccct 800  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  4764037 tactgcaccgtagaagctccct 4764058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 491 - 797
Target Start/End: Original strand, 44913780 - 44914090
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaa 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44913780 ccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaa 44913879  T
Q  590 gactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattact---tcatg 686  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     |||    
T  44913880 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagaaaatg 44913979  T
Q  687 aattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtac 786  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||    
T  44913980 aattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaccagtttgctgactgcac 44914079  T
Q  787 cgtagaagctc 797  Q
    |||||||||||    
T  44914080 cgtagaagctc 44914090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 368 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2325573 - 2325155
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||| || |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  2325573 ggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacacccc-attgtttgtacactg 2325475  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| ||||     ||||||||  ||||||||||||||        |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  2325474 gcatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaaca 2325388  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  2325387 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatg 2325288  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2325287 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaa 2325188  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
     ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2325187 atcaattttctgactgcaccgtagaagctccct 2325155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 29242236 - 29241923
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242236 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagt 29242137  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||       | |||    
T  29242136 gtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat-------gaatt 29242044  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  29242043 actagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaagttcagtttcct 29241944  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  29241943 gactgcaccatagaagctccc 29241923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 398 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33660541 - 33660154
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||     ||||||||  | ||||    
T  33660541 acttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccca-actgtttgtacagtggcatcaaaa-----gttcagtcctcttagt 33660448  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||    
T  33660447 atcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacc---------ca 33660357  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33660356 catgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 33660257  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  33660256 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctc 33660157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 400 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709015
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| || | |||| ||| |||| ||| ||||     |||||||| |||||||||    
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactcc-actgttagtacagtgacatcaaaa-----gttcagtccccatagtat 33709310  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||| |  |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33709309 catcaaatattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgca 33709210  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33709209 tgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 33709110  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaag 794  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  33709109 cattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaattcagtatcatgactgcaccgtagaag 33709015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 365 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 33551192 - 33550801
Alignment:
Q  365 tatggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtata 464  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  33551192 tatggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacccc-actgtttgtaca 33551094  T
Q  465 gtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgta 564  Q
     || ||| ||||     |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33551093 atgacatcaaaa-----gttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgta 33550999  T
Q  565 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaag 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  33550998 acaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaat 33550900  T
Q  665 atgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaatt----agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550899 atgttgcaagcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 33550801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 398 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19289496 - 19289101
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| || |||||||||||  |||| ||||||| | || ||||||||||||| | |||||||| | || ||| |||| | ||||||  ||||   |||    
T  19289496 acttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacacccc-attgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttc--tcac---agt 19289403  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289402 atcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatca 19289303  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19289302 cataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattg 19289203  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  19289202 atcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccatagaagctc 19289103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 479 - 774
Target Start/End: Original strand, 41465606 - 41465901
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  41465606 aaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagt 41465705  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41465706 gtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacatt 41465805  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41465806 actatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 41465901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18494378 - 18494058
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | | || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||     
T  18494378 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcacaaaga 18494280  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18494279 gtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcatt 18494180  T
Q  679 acttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcct 778  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  18494179 actagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcat 18494080  T
Q  779 gactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||||  |||||| |||||||||    
T  18494079 gactacaccgtataagctccct 18494058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 367 - 801
Target Start/End: Original strand, 26357576 - 26358004
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagt 466  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  26357576 tggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatccc-actgtttgtacagt 26357674  T
Q  467 ggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac 566  Q
    | ||| ||||     |||||||    ||||  | |||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26357675 gacatcaaaa-----gttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaac 26357769  T
Q  567 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  26357770 atcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagat 26357869  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26357870 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaa 26357969  T
Q  767 agtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    ||||| ||  || |||| |  ||||||||||||||    
T  26357970 agtcaattttctaactgcaatgtagaagctcccta 26358004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 483 - 801
Target Start/End: Original strand, 31861961 - 31862279
Alignment:
Q  483 ttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 582  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31861961 ttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaa 31862060  T
Q  583 cacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactt 682  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |  |||||||     
T  31862061 cacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattacta 31862160  T
Q  683 catgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31862161 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcccgact 31862260  T
Q  783 gtaccgtagaagctcccta 801  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  31862261 gcaccatagaagctcccta 31862279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 479 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11366479 - 11366157
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| |||   |||||||| |||||||    
T  11366479 aaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagt 11366380  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11366379 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 11366280  T
Q  679 acttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||  |    
T  11366279 actagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttc 11366180  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  11366179 tgactgcaccgtagatgctccct 11366157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 400 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 43771010 - 43770623
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||     |||||||| || || |||    
T  43771010 ttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttatacagtggcatcaaaa-----gttcagtccccttaatat 43770917  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||    
T  43770916 catcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacact---------caca 43770826  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43770825 tgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgat 43770726  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactg--taccgtagaagctc 797  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  || |||||||||||    
T  43770725 cattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgattgtatatcgtagaagctc 43770626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 500 - 799
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959317
Alignment:
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcaca 35959121  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35959122 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 35959217  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| || |||||||||||||||    
T  35959218 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttttgagtgcaccgtagaagctccc 35959317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 368 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 39167566 - 39167150
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | |||||| | |||| || ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| | | |||||||| | ||    
T  39167566 ggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctc-actgtttgtacaatg 39167468  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| ||||     ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  39167467 acatcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaaca 39167373  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
     ||||||||||||||||      |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  39167372 tcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattg 39167279  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 767  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39167278 ttgctagcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 39167179  T
Q  768 gtcagttgcctgactgtaccgtagaagct 796  Q
    |||||||  |||| || || |||||||||    
T  39167178 gtcagttttctgattgcacagtagaagct 39167150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 479 - 771
Target Start/End: Original strand, 37905813 - 37906108
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc--acaaa 576  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||    
T  37905813 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaa 37905912  T
Q  577 gtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagca 676  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37905913 gtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaa 37906012  T
Q  677 ttacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 771  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37906013 ttactggatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 37906108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 400 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27350109 - 27349729
Alignment:
Q  400 ttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtat 499  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| ||| ||||     |||||||| || ||||||    
T  27350109 ttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccac-actgtttgtacagtgacatcaaaa-----gttcagtc-ccttagtat 27350017  T
Q  500 catcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  27350016 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------caca 27349926  T
Q  600 taacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgat 699  Q
    | | ||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27349925 tgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 27349826  T
Q  700 cattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27349825 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatat-----ttaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccc 27349731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 368 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 4264280 - 4263926
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  4264280 ggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatccc-actgtttgtacagtg 4264182  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
     ||| |     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4264181 acatca-----aaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaaca 4264087  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatc-acataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||    
T  4264086 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagat 4263987  T
Q  667 gttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaa 727  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4263986 gttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 369 - 768
Target Start/End: Original strand, 13711465 - 13711853
Alignment:
Q  369 gaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtgg 468  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||     
T  13711465 gaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaca-gtttgtacagtga 13711563  T
Q  469 cattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 568  Q
    ||| ||||     ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |     ||||||||||||||||    
T  13711564 catcaaaa-----gtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcat-----gttttaagtgtaacac 13711653  T
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13711654 cccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgt 13711753  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| ||||||||    
T  13711754 tgcaaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttcaaaaaag 13711853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 428 - 774
Target Start/End: Original strand, 5881599 - 5881929
Alignment:
Q  428 caaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaa 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||     ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||     
T  5881599 caaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaa-----gttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatac 5881692  T
Q  528 acttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgtta 627  Q
    | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||         ||||| | |||| ||| | |||||||||||||    
T  5881693 atttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacact---------cacatgatatcaacaattttgtttgcatgtta 5881782  T
Q  628 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaa 727  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5881783 aagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaa 5881882  T
Q  728 tgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 774  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  5881883 tgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcataaaaatcagtt 5881929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 726
Target Start/End: Original strand, 4478406 - 4478717
Alignment:
Q  405 tggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatca 504  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||  |||||||||||||    
T  4478406 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactcc-attgtttgtacagtggcatcaaaa-----gtttagtcctcatagtatcatca 4478499  T
Q  505 attcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt-atcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 603  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  4478500 attcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgat 4478594  T
Q  604 atcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcatt 703  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4478595 atcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcatt 4478694  T
Q  704 aattagtaatcaacaatttaaaa 726  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4478695 aatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 366 - 713
Target Start/End: Original strand, 19313850 - 19314186
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatag 465  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||  || | ||| || ||    
T  19313850 atggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacct-tactatttatacag 19313948  T
Q  466 tggcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaa 565  Q
    || ||| ||||     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19313949 tgacatcaaaa-----gttcagtc-ctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 19314042  T
Q  566 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt---aagtcta 662  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  19314043 caccccacaaagtgtaacact-------atcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtcta 19314135  T
Q  663 agatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaat 713  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19314136 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 370 - 706
Target Start/End: Original strand, 44285951 - 44286281
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| | ||| || | | | | |||||||||||||||    
T  44285951 aaaattatacggtgaagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctc-actgtttgtatagtggc 44286049  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44286050 atcaaaa-----gtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacc 44286144  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44286145 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgtt 44286244  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaat 706  Q
    |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  44286245 gcaagcattgttagatgaattactattgatcattaat 44286281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 479 - 679
Target Start/End: Original strand, 45327825 - 45328025
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  45327825 aaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagt 45327924  T
Q  579 gtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatt 678  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45327925 gtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 45328024  T
Q  679 a 679  Q
    |    
T  45328025 a 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 491 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 7007007 - 7006723
Alignment:
Q  491 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 590  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||                 |||||||||    
T  7007007 ccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgta-----------------acacttaag 7006925  T
Q  591 actatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaatt 690  Q
    | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7006924 aatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 7006825  T
Q  691 actattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgta 790  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||||    
T  7006824 tctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaactttttcaaaaaagtcattttcatgattgcaccgta 7006725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 569 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500726
Alignment:
Q  569 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgt 19500824  T
Q  669 tgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaa 766  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19500823 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattattttttcaaaaaa 19500726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 370 - 679
Target Start/End: Original strand, 36641988 - 36642293
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |  |||  ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||| |||| |    
T  36641988 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctc-actgtttgtacagtgac 36642086  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaatttt--atcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    || ||||     ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  36642087 atcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaaca 36642181  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||    
T  36642182 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatg 36642281  T
Q  668 ttgcaagcatta 679  Q
    ||||||||||||    
T  36642282 ttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 492 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17071822 - 17071646
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071822 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 17071723  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17071722 ctatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 390 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41464031 - 41463779
Alignment:
Q  390 tgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtc 489  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||     ||||| ||    
T  41464031 tgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctc-actgtttgtacagtggcatcaaaa-----gttcaatc 41463938  T
Q  490 accatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 589  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||   ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  41463937 ctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaa 41463838  T
Q  590 gactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 648  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41463837 gactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 492 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17054181 - 17054005
Alignment:
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17054181 cataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaana 17054082  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 668  Q
    ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17054081 ctatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 515 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258198
Alignment:
Q  515 ttaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactc 614  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
Q  615 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagat 666  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18258249 tctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtctaagat 18258198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 392 - 627
Target Start/End: Original strand, 33902092 - 33902319
Alignment:
Q  392 agaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcac 491  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||| ||||     ||||||||      
T  33902092 agaatgacttttctggtgaagttaacac--taacataaaaaatgtagtgagtaatacccc-actgtttgtaaaatgacatcaaaa-----gttcagtcct 33902183  T
Q  492 catagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 591  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  33902184 caaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaata 33902283  T
Q  592 ctatcacataacatcaccaactctgtttgcatgtta 627  Q
     |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  33902284 gtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 616 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 41051260 - 41051083
Alignment:
Q  616 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatca 715  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  41051260 gtttgcatgttaaa-atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatca 41051162  T
Q  716 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||   ||| || | |||||| |||||||||||||    
T  41051161 acaattcaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaaa---tcattttcatgactgcaccgtagaagctc 41051083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 712 - 800
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328115
Alignment:
Q  712 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt-tctgactgcaccgtagaagctccct 45328115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 659 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18257456 - 18257341
Alignment:
Q  659 tctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 758  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||    
T  18257456 tctaagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaacttt 18257357  T
Q  759 tccaaaaaagtcagtt 774  Q
    | || |||||||||||    
T  18257356 ttcacaaaagtcagtt 18257341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 684 - 798
Target Start/End: Original strand, 33902324 - 33902439
Alignment:
Q  684 atgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-ttttccaaaaaagtcagttgcctgact 782  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||| |    
T  33902324 atgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaaagttagttttctgatt 33902423  T
Q  783 gtaccgtagaagctcc 798  Q
    | ||||||||||||||    
T  33902424 gcaccgtagaagctcc 33902439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 655 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463408
Alignment:
Q  655 taagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 754  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  || |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaa 41463413  T
Q  755 ctttt 759  Q
    |||||    
T  41463412 ctttt 41463408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 479 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 19501837 - 19501760
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgtttt 557  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19501837 aaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaac-aaactacatttaatctaattttattctactttgtttt 19501760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 730 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 4263756 - 4263685
Alignment:
Q  730 aatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctcccta 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||    
T  4263756 aatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaatcagtttcatgactgtatcgtagaaactcccta 4263685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 703 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053960
Alignment:
Q  703 taattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 748  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17053960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 703 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
Q  703 taattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 748  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 444
Target Start/End: Original strand, 41465508 - 41465585
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagta 444  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  41465508 tggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagta 41465585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 18494456 - 18494388
Alignment:
Q  383 gaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccc 451  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18494456 gaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccc 18494388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Original strand, 31861894 - 31861959
Alignment:
Q  367 tggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaa 432  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  31861894 tggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaatattatgatatcaaaa 31861959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 416
Target Start/End: Original strand, 6177775 - 6177823
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaa 416  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6177775 ggaaaattctacggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 6177823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 41051303 - 41051263
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaac 519  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051303 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8313
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | || |    
T  7889 aaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacacccc-actgtttgtacaatgac 7987  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||    
T  7988 atcaaaa-----gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacacc 8082  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8083 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 8182  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagt 769  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  8183 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagt 8282  T
Q  770 cagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  8283 caatttcctgactgcaccgtagaagctccct 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 398 - 800
Target Start/End: Original strand, 43987 - 44382
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||| | |||||| ||||     ||||||||  ||||||    
T  43987 acttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgt-tgtttgtacaatggcataaaaa-----gttcagtcctcatagt 44080  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44081 atcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatca 44179  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44180 cataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattg 44279  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||| | |||||||||||    
T  44280 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctc 44379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 398 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 154800 - 154405
Alignment:
Q  398 acttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcagtcaccatagt 497  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||| | |||||| ||||     ||||||||  ||||||    
T  154800 acttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgt-tgtttgtacaatggcataaaaa-----gttcagtcctcatagt 154707  T
Q  498 atcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 597  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  154706 atcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatca 154608  T
Q  598 cataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattg 697  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  154607 cataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattg 154508  T
Q  698 atcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctc 797  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||| | |||||||||||    
T  154507 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctc 154408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 408494 - 408223
Alignment:
Q  494 tagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  408494 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagact 408395  T
Q  594 atcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattact 693  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  408394 atcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 408295  T
Q  694 attgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaa 765  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  408294 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaa 408223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 368 - 759
Target Start/End: Original strand, 134 - 513
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtg 467  Q
    |||||||| || || ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||| ||| ||||||||||| || | |||||||| | ||    
T  134 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactcc-actgtttgtacaatg 232  T
Q  468 gcattaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 567  Q
    |||| |     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  233 gcatca-----aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaaca 327  T
Q  568 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 667  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| ||||||    
T  328 ccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatg 421  T
Q  668 ttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 759  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  422 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 615 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 94044 - 93861
Alignment:
Q  615 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatc 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  94044 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcactaatc 93945  T
Q  715 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcctgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  93944 aacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtccgtttccttactgcaccgtaaaaactccc 93861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 388 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 94548 - 94335
Alignment:
Q  388 tatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggcattaaaattaaagttcag 487  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||     |||  |    
T  94548 tatgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacacccc-actgtttgtacagtggcatcaaaa-----gtttgg 94455  T
Q  488 tcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactt 587  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94454 tccccatactatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactt 94355  T
Q  588 aagactatcacataacatca 607  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  94354 aagactattacataatatca 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 180; Significance: 9e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 146199 - 145774
Alignment:
Q  370 aaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccctaatgtttgtatagtggc 469  Q
    |||||| || || ||||| || ||||| | |||| |||| |||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||| | | |||||| | || |    
T  146199 aaaattctacggtgaagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacacccc-attatttgtagaatgac 146101  T
Q  470 attaaaattaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacc 569  Q
    || ||||     |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||    
T  146100 atcaaaa-----gttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacacc 146006  T
Q  570 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgtt 669  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  146005 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgtt 145906  T
Q  670 gcaagcattacttcatgaat-tactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 768  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  145905 gcaagcattactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaag 145806  T
Q  769 tcagttgcctgactgtaccgtagaagctccct 800  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  145805 tcaatttcctgactgcaccgtagaagctccct 145774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 799
Target Start/End: Original strand, 267389 - 267701
Alignment:
Q  479 aaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactaaacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagt 578  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  267389 aaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagt 267488  T
Q  579 gtaacactt-aagactatcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcat 677  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  267489 gtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaat 267588  T
Q  678 tacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgcc 777  Q
    ||||  ||||||||         |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  267589 tactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttct 267679  T
Q  778 tgactgtaccgtagaagctccc 799  Q
    |||||| ||| ||||| |||||    
T  267680 tgactgcaccatagaatctccc 267701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 451
Target Start/End: Original strand, 42348 - 42431
Alignment:
Q  368 ggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaacataataatatcaaaagtgtagtgagtaacacccc 451  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42348 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc 42431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 719
Target Start/End: Original strand, 100993 - 101058
Alignment:
Q  652 atgtaagtctaagatgttgcaagcattacttcatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaa 719  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  100993 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 632
Target Start/End: Original strand, 100948 - 100985
Alignment:
Q  595 tcacataacatcaccaactctgtttgcatgttaaagat 632  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 100985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12188 - 12137
Alignment:
Q  366 atggaaaattataaggcgaagttatgagaataacttttctggtgaagttaac 417  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12188 atggaaaattctatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaac 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University