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Alignment Overview

Query: NF0451Ase13 (Length: 394)

Name: NF0451Ase13
Description: NF0451
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0451Ase13
NF0451Ase13
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (10-388)||(38445566-38445944)
chr3 (10-388)||(39032581-39032962)
chr3 (10-388)||(39039594-39039974)
chr3 (11-388)||(41272885-41273248)
chr3 (160-388)||(32280764-32280992)
chr3 (160-388)||(32285708-32285936)
chr3 (160-388)||(3469772-3470000)
chr3 (160-388)||(31112300-31112528)
chr3 (159-388)||(19240505-19240734)
chr3 (170-388)||(29960923-29961141)
chr3 (170-388)||(30010128-30010346)
chr3 (242-388)||(11172085-11172231)
chr3 (160-388)||(50158095-50158323)
chr3 (160-388)||(45677878-45678107)
chr3 (190-338)||(10626311-10626459)
chr3 (169-335)||(46611791-46611957)
chr3 (171-302)||(11458138-11458269)
chr3 (306-388)||(11457254-11457334)
chr3 (106-232)||(39350935-39351053)
chr3 (45-100)||(10626167-10626222)
chr3 (96-160)||(10626239-10626303)
chr3 (328-388)||(10657252-10657309)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (10-388)||(24515206-24515570)
chr1 (54-388)||(41140794-41141117)
chr1 (167-381)||(39574422-39574636)
chr1 (156-388)||(47858028-47858260)
chr1 (186-388)||(9764993-9765195)
chr1 (111-349)||(12017681-12017910)
chr1 (10-206)||(24522988-24523179)
chr1 (170-317)||(9758362-9758509)
chr1 (292-388)||(39580431-39580527)
chr1 (167-291)||(39581061-39581185)
chr1 (237-333)||(24523172-24523268)
chr1 (292-388)||(47854644-47854740)
chr1 (256-312)||(38278927-38278983)
chr1 (10-78)||(47858339-47858407)
chr1 (262-315)||(38279884-38279937)
chr1 (352-388)||(24526361-24526397)
chr1 (45-83)||(9758231-9758269)
chr1 (45-83)||(9764847-9764885)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (106-388)||(43097366-43097640)
chr5 (186-388)||(36950149-36950351)
chr5 (160-388)||(22729753-22729981)
chr5 (160-388)||(35941110-35941330)
chr5 (165-363)||(11339770-11339968)
chr5 (237-388)||(10491116-10491267)
[»] scaffold0502 (2 HSPs)
scaffold0502 (160-388)||(8857-9085)
scaffold0502 (160-344)||(4201-4385)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (160-388)||(267734-267962)
chr7 (156-388)||(48853520-48853752)
chr7 (171-388)||(26450921-26451134)
chr7 (163-388)||(32517038-32517263)
chr7 (235-388)||(278876-279029)
chr7 (187-388)||(40771658-40771857)
chr7 (249-383)||(40771165-40771297)
chr7 (176-338)||(5172840-5173002)
chr7 (168-350)||(29148714-29148895)
chr7 (322-383)||(21910446-21910509)
chr7 (344-388)||(29148917-29148961)
chr7 (10-66)||(32517360-32517416)
chr7 (330-387)||(5172457-5172510)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (160-388)||(18338033-18338261)
chr6 (160-388)||(23848560-23848788)
chr6 (167-388)||(32932312-32932526)
chr6 (10-388)||(9972694-9973057)
chr6 (160-388)||(7553407-7553633)
chr6 (160-388)||(22958073-22958292)
chr6 (160-388)||(23830100-23830319)
chr6 (160-290)||(27101520-27101650)
chr6 (160-290)||(27143342-27143472)
chr6 (171-388)||(15121532-15121742)
chr6 (170-279)||(19543490-19543599)
chr6 (10-114)||(22957904-22958008)
chr6 (10-114)||(23830384-23830488)
chr6 (328-388)||(19543418-19543478)
chr6 (326-388)||(27101453-27101515)
chr6 (326-388)||(27143275-27143337)
chr6 (10-114)||(23848420-23848518)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (159-388)||(44626043-44626272)
chr8 (160-388)||(32038097-32038325)
chr8 (51-384)||(1262244-1262574)
chr8 (163-388)||(26005532-26005757)
chr8 (160-388)||(45266123-45266338)
chr8 (172-301)||(17497514-17497643)
chr8 (237-364)||(18324738-18324865)
chr8 (160-388)||(38143806-38144028)
chr8 (171-388)||(39517268-39517480)
chr8 (160-280)||(34548083-34548204)
chr8 (321-388)||(34548216-34548283)
chr8 (160-223)||(18324934-18324996)
chr8 (10-66)||(26005379-26005435)
chr8 (266-337)||(45272805-45272876)
chr8 (160-222)||(38151014-38151076)
chr8 (346-388)||(17497648-17497690)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (160-388)||(35904980-35905208)
chr4 (160-388)||(42567637-42567865)
chr4 (170-388)||(6262125-6262343)
chr4 (171-388)||(2228777-2228994)
chr4 (160-389)||(24423195-24423424)
chr4 (186-388)||(36048810-36049012)
chr4 (160-388)||(13393668-13393896)
chr4 (160-388)||(13396807-13397035)
chr4 (160-388)||(18891097-18891324)
chr4 (186-388)||(33366675-33366880)
chr4 (220-388)||(54256164-54256330)
chr4 (174-375)||(44160724-44160927)
chr4 (218-388)||(33361559-33361729)
chr4 (271-388)||(43444825-43444942)
chr4 (10-114)||(6262351-6262449)
chr4 (284-374)||(18888167-18888257)
chr4 (324-388)||(123458-123520)
chr4 (11-67)||(33361854-33361910)
chr4 (10-66)||(33367000-33367056)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (167-388)||(3949921-3950142)
chr2 (160-388)||(40113329-40113563)
chr2 (156-388)||(23888383-23888615)
chr2 (156-388)||(23892459-23892691)
chr2 (171-388)||(18341573-18341790)
chr2 (186-388)||(39190029-39190231)
chr2 (160-388)||(24138305-24138533)
chr2 (186-388)||(669933-670135)
chr2 (160-352)||(41826520-41826706)
chr2 (163-318)||(15144258-15144413)
chr2 (159-338)||(662751-662926)
chr2 (169-388)||(17527310-17527532)
chr2 (156-294)||(14661277-14661415)
chr2 (222-341)||(25336147-25336266)
chr2 (171-388)||(17530028-17530258)
chr2 (207-381)||(33425851-33426024)
chr2 (214-288)||(4840581-4840654)
chr2 (345-388)||(4840923-4840966)
chr2 (321-388)||(14661208-14661275)
chr2 (346-388)||(25335771-25335813)
chr2 (10-105)||(39190300-39190393)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (156-388)||(15-247)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (160-388)||(67695-67923)
scaffold0040 (160-388)||(60219-60447)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (171-388)||(30003-30220)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (171-388)||(134550-134767)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (171-388)||(40145-40362)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38445944 - 38445566
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38445944 ggatcagtagatacaagttatagcatatcaacattagtatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaaggataactgccatga 38445845  T
Q  110 gaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38445844 gaggaatgattaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctgatgagatgacgtttaaatagctaaacga 38445745  T
Q  210 ccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaatta 309  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38445744 ccgagggcagagacctctaattggacttagctaaatggttcaacccatcacggttcatttagaaaaaatagttcaatcacacatattcatcaactaatta 38445645  T
Q  310 gtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38445644 atgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaacattgtcaatccataattaatta 38445566  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Original strand, 39032581 - 39032962
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39032581 ggatcagtagatacaagttatagcatatcagtatcagtatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaaggataactgccatga 39032680  T
Q  110 gagga--------atgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagttt-aaccgtctaatgagatgacgtttaaata 200  Q
    |||||        ||||||||||||||||| |||||     |||||   || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39032681 gaggatgagagggatgactaccctcattccctttag-----caccagaatgttcagaattcagaatagttttaaccgtctgatgggatgacgtttaaata 39032775  T
Q  201 gttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatc 300  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  39032776 gctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccaatcacacatattcatc 39032875  T
Q  301 aactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39032876 aactaattagtgcttaacagaatagaccataa-ttatattatgacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 39032962  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Original strand, 39039594 - 39039974
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39039594 ggattagtagatacaagttatagcatatcagtatcagtatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaaggataactgccatga 39039693  T
Q  110 gagga--------atgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagttt-aaccgtctaatgagatgacgtttaaata 200  Q
    |||||        || |||||||||||||| |||||     ||||    || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39039694 gaggatgagagggataactaccctcattccctttag-----cacctgaatgttcagaattcagaatagttttaaccgtctgatgcgatgacgtttaaata 39039788  T
Q  201 gttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatc 300  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  39039789 gctaaacgactgagggcagg-acctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccaatcacacatattcatc 39039887  T
Q  301 aactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39039888 aactaattagtgtttaacagaatagaccataa-ttatattatgacattaacttataataactgattattgtcaatccataattgatta 39039974  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41273248 - 41272885
Alignment:
Q  11 gatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatgag 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||      || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41273248 gatcagtagatacaaggtataacatatcag------taacaaggaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaaggataactgccatgag 41273155  T
Q  111 aggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  41273154 aggaatgactaccctcattccgtctaggtttgcaccatgctggtcagaat--------gtttaaccgtctaatgggatgacgtttaaatagataaacggc 41273063  T
Q  211 cgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattag 310  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41273062 tgagggcagggacctctcattaaacttagctaaatggttcaacctatcatggtccatttagaaagaatagcacaatcatacatattcatcaactaattag 41272963  T
Q  311 tgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41272962 tgcttaacacaatagaccataatttatattataacattttataataataattgattattgtcaatccataattgatta 41272885  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 32280764 - 32280992
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280764 ttcagaatagtttaaccgtatgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggtagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 32280863  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32280864 cggtccatttagaaagaatagtcaaatcacacatgttcatcaactaattagtgcttaatagaatagaccataatttatattatgacattaacttataata 32280963  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32280964 attgattattgtcaatccataattgatta 32280992  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 32285708 - 32285936
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32285708 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaattgttaaacggctgagggcagagacctctcattaggcttagctaaatggtccaacccatca 32285807  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32285808 cggtccatttaagaaaaataattcaatcacacatattcatcaactaattagtgtttaacagaataaaccataatttatattatgacattaacttataata 32285907  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32285908 attgattattgtcaatccataattgatta 32285936  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3470000 - 3469772
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3470000 ttcagagtagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttcgctaaatggtccaaaccatca 3469901  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3469900 cggtccatttagaaagaatagcccaatcacacatattcatcaattaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttatgata 3469801  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3469800 attgattattgtcaattcataattgatta 3469772  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31112528 - 31112300
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31112528 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacggctaagggcatggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 31112429  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31112428 cggtccatttagaaagaatagcccaatcacacttattcatcaactaattagtacttaacacaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 31112329  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  31112328 attgattattgtagatccataatttatta 31112300  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 159 - 388
Target Start/End: Original strand, 19240505 - 19240734
Alignment:
Q  159 attcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19240505 attcataatagtttaaccgtctgatgggataacgtttaaatagttaaacggatgagggcagggacctctcattaggcttagctaaatggtccaatccatc 19240604  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    ||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19240605 acggtccatttagaaagaatatctcaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaacacaatataccataatttatattataacattaacttataat 19240704  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19240705 aattgattattgtcaatccataattgatta 19240734  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Original strand, 29960923 - 29961141
Alignment:
Q  170 tttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29960923 tttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagagacctctcattgggtttagctaaatggtccaacccatcacggtccattt 29961022  T
Q  270 agaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatatt 369  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29961023 agaaagaatagtccaatcacacatattcatcaactaattaatgcttaacacaatagaccataatttttattatgacattaacttataataattgattatt 29961122  T
Q  370 gtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  29961123 gtcaatccagaattaatta 29961141  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Original strand, 30010128 - 30010346
Alignment:
Q  170 tttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30010128 tttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagagacctctcattgggtttagctaaatggtccaacccatcacggtccattt 30010227  T
Q  270 agaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatatt 369  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30010228 agaaagaatagtccaatcacacatattcatcaactaattaatgcttaacacaatagaccataatttttattatgacattaacttataataattgattatt 30010327  T
Q  370 gtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  30010328 gtcaatccagaattaatta 30010346  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 11172085 - 11172231
Alignment:
Q  242 aaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatatta 341  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11172085 aaatgttccaacccatcacggtccatttagaaagaatagttcaatcacacatattcatcaactaattagtgcttatcagaatagaccataatttatatta 11172184  T
Q  342 tgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11172185 tgacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 11172231  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50158323 - 50158095
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||| | ||||||| | |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  50158323 ttcagaatagtttaaccgtctgatgtgatcacatttaaatagccaaacggctgagggcatgaacctttcattgaacttagttaaatggtccaacccatca 50158224  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||    
T  50158223 cggtccatttagaaataatagcacaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacagtagaccatattataaattataatattaatttataata 50158124  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50158123 attgattattgtcaatccataattgatta 50158095  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 45677878 - 45678107
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagat-gacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45677878 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggattgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttaggtaaatggtccaacccatc 45677977  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    |||||  ||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| |||||||    
T  45677978 acggtctatttaaaaagaatagttcaatcatacattttcatcaactaataaacgcataatacaatagaccatattataaattataacattaatttataat 45678077  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45678078 aattgattattgccaatccataattgatta 45678107  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Original strand, 10626311 - 10626459
Alignment:
Q  190 acgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcac 289  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  10626311 acgtttaaatagctaaacggctgagggcagggaccactcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccaatcac 10626410  T
Q  290 acatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttata 338  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10626411 acatatccatctactaattagtgcttaacacaatagaccataatttata 10626459  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46611957 - 46611791
Alignment:
Q  169 gtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatt 268  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  46611957 gtttaaccgtctgatggcatgacgtttaaataactaaacggctgagggcagtgacctcttattgggcttagctaaatggtccaactcatcacgatccatc 46611858  T
Q  269 tagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataattt 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  46611857 tagaaagaatagttcaatcacacatatttatcatctaattagtgcttaacacaatagactataattt 46611791  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11458269 - 11458138
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11458269 ttaaccgtctgatggtatgacgtttaaatagctaaacggctaagggcatggacctctcattgggcttagttaaatggtcaaatccatcacggtccattta 11458170  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaa 302  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  11458169 gaaacaatagtccagttacacatattcatcaa 11458138  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11457334 - 11457254
Alignment:
Q  306 attagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11457334 attagtgcttaacatagtagaccataatttatatta--atattaacttataataattgattattttcaatccataattgatta 11457254  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39351053 - 39350935
Alignment:
Q  106 atgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaa 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||        | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  39351053 atgagagggatgactaccctcattccatttaggtttgcaccatgtcagtaagaa--------aatttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaa 39350962  T
Q  206 acgaccgagggcagggacctctcattg 232  Q
    |||   |||||||||||||||||||||    
T  39350961 acggttgagggcagggacctctcattg 39350935  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Original strand, 10626167 - 10626222
Alignment:
Q  45 agtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10626167 agtatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaatgataa 10626222  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 10626239 - 10626303
Alignment:
Q  96 gataaccgccatgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaat 160  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10626239 gataactgtcatgacacgaatgactaccctcattccgtctaggtttgcaccatgctggtcagaat 10626303  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 388
Target Start/End: Original strand, 10657252 - 10657309
Alignment:
Q  328 cataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||| | |||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10657252 cataatttatattataacatt---ttatcataattgattattgtcaatccataattgatta 10657309  T

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Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Original strand, 24515206 - 24515570
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataac---cgcca 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  24515206 ggatcactagatacaagttatagcatatcaa------tatcaaagaaggaagaagaatttgtataccttgaattatgttgatgaatgataactgccgcca 24515299  T
Q  107 tgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||        |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24515300 tgagaggaatgactaccctcattccgtctagctttgcatcatgctggtcagaat--------gtttaaccgtattatgggatgacgtttaaatagctaaa 24515391  T
Q  207 cgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaa 306  Q
     | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24515392 tggctgagggcagagacctctcattggacttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccgatcacacatattcatcaactaa 24515491  T
Q  307 ttagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24515492 ttagtgcttaacacaatagaccataatttatattataacatt---ttataataattgattattgtcaatccataattgatta 24515570  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41141117 - 41140794
Alignment:
Q  54 gaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttgg 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  41141117 gaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttga---aggataactgtcatgagaggaatgactaccctcattccgtctaggtttgcaccatgctgg 41141021  T
Q  154 tcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaac 253  Q
    |||||||        || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41141020 tcagaat--------gtctaaccgtctaatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcatcaggcttagctaaatggtccaac 41140929  T
Q  254 ccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaactt 353  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||   |     
T  41140928 ccatcacggtccatttaaaaagaatagaccaatcatacatattcatcaactaattaatgcttaacataatagaccataatttatattataacattttata 41140829  T
Q  354 ataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41140828 ataataattgattattgtcaatccataattgatta 41140794  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 167 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 39574636 - 39574422
Alignment:
Q  167 tagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttca 266  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39574636 tagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctaagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtcca 39574537  T
Q  267 tttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaat 366  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39574536 tttagaaagaatagcccaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataataattgatt 39574437  T
Q  367 attgtcaatccataa 381  Q
    | ||||||| |||||    
T  39574436 actgtcaattcataa 39574422  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47858260 - 47858028
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47858260 agaattcacaatagtttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 47858161  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttat 355  Q
    || ||| |  ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||    
T  47858160 attacgatcaatttagaaagaatagctcaatcatacatattcatcaactaatgagtgtttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttat 47858061  T
Q  356 aataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
      ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47858060 tttaattgattattgtcaatctataattgatta 47858028  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Original strand, 9764993 - 9765195
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||    
T  9764993 gatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttataaagaatagcccaa 9765092  T
Q  286 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattga 385  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  9765093 tcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacagtagaccatattataaattataacattaatttataataattgattattgaaaatccataattga 9765192  T
Q  386 tta 388  Q
    |||    
T  9765193 tta 9765195  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 349
Target Start/End: Original strand, 12017681 - 12017910
Alignment:
Q  111 aggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgac 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |        ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12017681 aggaatgactaccttcattccgtttatgtttgcaccatattggtcatagtgc--------ttaactgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacggc 12017772  T
Q  211 cgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaa-aatagtacaatcacacatattcatcaactaatta 309  Q
     ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12017773 tgagggcagggacctt--attggacttagctaaatggtccaactcatcacggtccatttagaaaagaataattcaatcagacatattcatcaactaatta 12017870  T
Q  310 gtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatatta 349  Q
    ||| |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  12017871 gtgtttaacacaatagatcataatttataatataatatta 12017910  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 24522988 - 24523179
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataa---ccgcca 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  24522988 ggatcactagatacaagttatagcatatcaatatcaatatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaatgataactgccgcca 24523087  T
Q  107 tgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||        |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24523088 tgagaggaatgactaccctcattccgtctagctttgcatcatgctggtctgaat--------gtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaa 24523179  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 9758362 - 9758509
Alignment:
Q  170 tttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9758362 tttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaatggctgaaggcagtgacctctcattgggcttagctaaatgttccaacccatcacggtccattt 9758461  T
Q  270 agaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaa 317  Q
    ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9758462 agaaagaatagcccaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaa 9758509  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39580527 - 39580431
Alignment:
Q  292 atattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39580527 atattcatcaactaattagtacttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 39580431  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39581185 - 39581061
Alignment:
Q  167 tagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttca 266  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||    
T  39581185 tagtttaaccgtttgattggatgacgtttaaatagctaaacgactgagggcagggacctctcattgggcttagctaaattgttcaactcatcacggtcca 39581086  T
Q  267 tttagaaaaaatagtacaatcacac 291  Q
    |||||||| |||| | |||||||||    
T  39581085 tttagaaagaatatttcaatcacac 39581061  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Original strand, 24523172 - 24523268
Alignment:
Q  237 tagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24523172 tagctaaatggtccaacccatcacggtccatttaaaaagaatagaccaatcacacatattcatcaattaattagtgcttaacacaatagaccataat 24523268  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47854740 - 47854644
Alignment:
Q  292 atattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47854740 atattcatcaactaatgagtgtttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttattttaattgattattgtcaatccataattgatta 47854644  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38278983 - 38278927
Alignment:
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtg 312  Q
    |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38278983 atcacggtccattcagagacaatagtccaatcacacatattcatcaactaattagtg 38278927  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47858407 - 47858339
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtacctt 78  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  47858407 ggatcattagatacaaattataacatatcatcagtagtaacaaagaaggaataagaaattgtgtacctt 47858339  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38279937 - 38279884
Alignment:
Q  262 gttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgctt 315  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38279937 gttcatttaaagacaatagaacaatcacacatattcatgaactaattagtgctt 38279884  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 388
Target Start/End: Original strand, 24526361 - 24526397
Alignment:
Q  352 ttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24526361 ttataataattgattattgtcaatccataattgatta 24526397  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 9758231 - 9758269
Alignment:
Q  45 agtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaatt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9758231 agtaacaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttcaatt 9758269  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 9764847 - 9764885
Alignment:
Q  45 agtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaatt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9764847 agtaacaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttcaatt 9764885  T

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Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43097640 - 43097366
Alignment:
Q  106 atgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaa 205  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||        |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  43097640 atgagagggatgactaacctcattccgtttaggtttgccccatactgatcagaat--------gtttaaccgtctgatgggatgacatttaaatagctaa 43097549  T
Q  206 acgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaacta 305  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43097548 acggctgagggcagggacctttcattgggcttagctaaatggtccaactcatcacggttcatttaaaaagaatagtccaatcacacatattcatcaacta 43097449  T
Q  306 attagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43097448 actagtgcttaactcaatagaccataatttatattataatattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 43097366  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Original strand, 36950149 - 36950351
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||    
T  36950149 gatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttataaagaatagctcaa 36950248  T
Q  286 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36950249 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaacacaataaaccataatttatattatgacattaacttataataattgattattgtcaatccataattga 36950348  T
Q  386 tta 388  Q
    |||    
T  36950349 tta 36950351  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22729981 - 22729753
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22729981 ttcagaatagtttaaccttccgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattggacttagctaaatggtccaacccatca 22729882  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    | || |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22729881 cagtccatttagaaagaatagcccgatcacacatattcatcaactaattagtgcttaacacaatagatcataatttatattatgacattaacttataata 22729782  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22729781 attgattattgtcaatccatgattgatta 22729753  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 35941110 - 35941330
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35941110 ttcagaatagtttaaccgtctgatga-atgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagcgaaatggtccaacccatca 35941208  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35941209 cagtccatttagaaagaatagtccaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaac-------acaataatttatattatgacattaacttataata 35941301  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35941302 attgattattatcaatctataattgatta 35941330  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11339968 - 11339770
Alignment:
Q  165 aatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtt 264  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11339968 aatagtttaaccttctgatgcgatgatgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggtttagctaaatggtccaacccatcacggtc 11339869  T
Q  265 catttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattg 363  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  11339868 catttagaaagaatagtccaatcacatatattcattaactaatcagtgcttaatacaatagaccataatttatattataacattaatttataataattg 11339770  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10491267 - 10491116
Alignment:
Q  237 tagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataattta 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     
T  10491267 tagctaaacggtccaacccatcacggtccatttagtaagaatagcccaatcactcatattcattaactaattagtgcctaacacaatagaccataatttg 10491168  T
Q  337 tattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10491167 tattataatataaacttataataattgattattgtcgatccataattgatta 10491116  T

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Target: scaffold0502 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9085 - 8857
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9085 ttcagaatggtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatca 8986  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8985 cggtccatttagaaagaatagatcaatcacacatattcataaactaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgactttaacttataata 8886  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8885 attgattattgtcaatccataattgatta 8857  T

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Target: scaffold0502; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4385 - 4201
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4385 ttcagaatggtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctgaacggttgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatca 4286  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatga 344  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4285 cggtccatttagaaagaatagtccaatcacacatattcataaactaattagtgtttaacacaatagaccataatttatattatga 4201  T

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Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 267734 - 267962
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  267734 ttcagaatagtttaaccgtttgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtcaaacccatca 267833  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  267834 cggtccatttagaaagaatagcccaatcagacatattcatcaactaattagtgcttaacgcaatagaccataatttatattatgacatcaacttataata 267933  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  267934 attgattattgtcaatccataattgatta 267962  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 156 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48853752 - 48853520
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48853752 agaattcacaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 48853653  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttat 355  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||    
T  48853652 atcacggtccatttagaaagaatagtccaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttat 48853553  T
Q  356 aataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48853552 aataattgattattgtcaatccataattgatta 48853520  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 26450921 - 26451134
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26450921 ttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggaagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacagtccattta 26451020  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    |||    |||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26451021 gaa----tagcccaatcacaaatattcatcatctaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataataattgattattg 26451116  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26451117 tcaatccataattgatta 26451134  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 163 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32517263 - 32517038
Alignment:
Q  163 agaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgg 262  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517263 agaatactttaaccgtctaatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcatggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgg 32517164  T
Q  263 ttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataatt 362  Q
    |  |||||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  32517163 tcaatttagtaagaatagcccaatcatacatattcatcaactaataagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataataatt 32517064  T
Q  363 gaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  32517063 gattattgtcaatccataattgatta 32517038  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 388
Target Start/End: Original strand, 278876 - 279029
Alignment:
Q  235 cttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  278876 cttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccaatcagacatattcatcaactaattagtgcttaacgcaatagaccataatt 278975  T
Q  335 tatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278976 tatattatgacatcaatttataataattgattattgtcaatccataattgatta 279029  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 388
Target Start/End: Original strand, 40771658 - 40771857
Alignment:
Q  187 atgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaat 286  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  40771658 atgatgtttaaatagctaaacggctgagggcaaggacctctcattgagcttagctaaatgagtcaattcatcacggtccatttagaaacaatagctcaat 40771757  T
Q  287 cacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgat 386  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||    
T  40771758 cacacatattcactagctaattagtgctcaacacaatagaccataatttatatta--agattaacttataataattgattgtcgtcaatccataattcat 40771855  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40771297 - 40771165
Alignment:
Q  249 ccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatatt 348  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||| |||    
T  40771297 ccaacctatcacgttccatttagaaacaatagcccaatcacacatattcatcaactaattagtgtttaacacaatagaccataatttatat--tgagatt 40771200  T
Q  349 aacttataataattgaatattgtcaatccataatt 383  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40771199 aacttataataattgattatcgtcaatccataatt 40771165  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5173002 - 5172840
Alignment:
Q  176 cgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaa 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||  |||||||||     
T  5173002 cgtctaatgggatgacgtttaaatagctaaacggttgagggcaagaacctctcattgtgcttaggtaaatagttcaacccatcatggtcaatttagaaac 5172903  T
Q  276 aatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttata 338  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  5172902 aataatccaatcacatatattcatcaactaattagtgcttaatacaatagatcataatttata 5172840  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 350
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148895
Alignment:
Q  168 agtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcat 267  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  29148714 agtttaaacgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagg-acctctcattggacttagctaaatgttccaaccaatcaccgtccat 29148812  T
Q  268 ttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaa 350  Q
    ||||||| |||| |  || || ||||||||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  29148813 ttagaaagaataatcgaaacatacatattcatcaactaattagtgtttaataccatagactataatttattatataatattaa 29148895  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21910509 - 21910446
Alignment:
Q  322 atagaccataatttatattatgatattaactt--ataataattgaatattgtcaatccataatt 383  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910509 atagagcataatttatattataatattaacttttataataattgattattgtcaatccataatt 21910446  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Original strand, 29148917 - 29148961
Alignment:
Q  344 atattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  29148917 atattaacttataataattaattattgtcaattcataattgatta 29148961  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32517416 - 32517360
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaa 66  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  32517416 ggatcaatagatacaagttatagcatatgagtatcagtatcaaagaaggaataagaa 32517360  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5172510 - 5172457
Alignment:
Q  330 taatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatt 387  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||    
T  5172510 taatttatattataaaattaacttataatcatt----attgtcaatccataattgatt 5172457  T

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Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18338261 - 18338033
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18338261 ttcagaatggtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatca 18338162  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18338161 cggtccatttagaaagaatagatcaatcacacatattcataaactaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgactttaacttataata 18338062  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18338061 attgattattgtcaatccataattgatta 18338033  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 23848560 - 23848788
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23848560 ttcagaatagtttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctaagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatca 23848659  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23848660 cggtccatttagaaagaatagtccaatcacacatattcatcaattaattagtgctttacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataata 23848759  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23848760 attgattattgtcaatccataaatgatta 23848788  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Original strand, 32932312 - 32932526
Alignment:
Q  167 tagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttca 266  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |  ||    
T  32932312 tagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacgactgagggcagagatctctcattgggctcaactaaatggtccaacacatcacagccca 32932411  T
Q  267 tttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaat 366  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |    
T  32932412 tttagaaagaatagctcaatcacacatattcatcaattaattagtgtttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataat-------t 32932504  T
Q  367 attgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32932505 attgtcaatccataattgatta 32932526  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9973057 - 9972694
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaat---tatgttgatgaaggataaccgcca 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||  | ||||||||  ||   || ||| |||||||||            
T  9973057 ggatcagtagatacaagttatagcatatcagtatcagtatcacagaaggaataagaaattatgtaccttgtatgtttaggttcatgaaggat-------- 9972966  T
Q  107 tgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgcaccatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaa 206  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  9972965 -gagagggatgactaccctcattccgtttag-----caccagaatgttcagaa----gaatagtttaaccgtctgatgggataacgtttaaatagctaaa 9972876  T
Q  207 cgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaa 306  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  9972875 cggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatcacggtccatttagttagaatagcccaatcatacatattcatcaactaa 9972776  T
Q  307 ttagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    | | || ||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9972775 tgaatgtttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataataattgattattgtcaatctataattgatta 9972694  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 7553407 - 7553633
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7553407 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgatgtttaaataactaaacggccgagggcagggacttctcactgggtttagctaaatggtccaacccatca 7553506  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    || | |||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7553507 cgatccatttaaaaagaatagcccaatcgcacatattcatc-attaattaatgcttaacaccatagaccataatttatattatgacattaacttataata 7553605  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7553606 attgattattgtcaa-ccatatttgatta 7553633  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 22958073 - 22958292
Alignment:
Q  160 ttcagaatagttt-aaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22958073 ttcagaatagttttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaatcggctgagggcagggacttctcattgggcttaactaaatggttcaacccatc 22958172  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    ||||| |||||| ||| ||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||          |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22958173 acggtccatttaaaaagaataacctaatcacacattttcatcaattaattagtgctt----------accatagtttatattatgacattaacttataat 22958262  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22958263 aattgattattgtcaatccataattgatta 22958292  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23830319 - 23830100
Alignment:
Q  160 ttcagaatagttt-aaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23830319 ttcagaatagttttaaccatctgatgggatgacgtttaaatagctaatcggctgagggcagggacttctcattgggcttaactaaatggttcaacccatc 23830220  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    ||||| |||||| ||| ||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||          |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23830219 acggtccatttaaaaagaataacctaatcacacattttcatcaattaattagtgctt----------accatagtttatattatgacattaacttataat 23830130  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23830129 aattgattattgtcaatccataattgatta 23830100  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27101650 - 27101520
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27101650 ttcagagtagtttaaccgtctgatgggataaagtttaaatagctaaacgactgagggcagggacatctcattgggcttaactaaatggttcaacccatca 27101551  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcaca 290  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  27101550 cggtccatttagaaagaatagtcaaatcaca 27101520  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27143472 - 27143342
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27143472 ttcagagtagtttaaccgtctgatgggataaagtttaaatagctaaacgactgagggcagggacatctcattgggcttaactaaatggttcaacccatca 27143373  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcaca 290  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  27143372 cggtccatttagaaagaatagtcaaatcaca 27143342  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 15121532 - 15121742
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||||       | ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  15121532 ttaaccgtatgatgagatgacatttaaatagttaaactgctgagggcagagacct-------gacttagttaaatcgtccaaccgatcacagtccattta 15121624  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
     ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||   | || |||||||||||||||| |||||    
T  15121625 taaacaataactcaatcacacatattcatcaactaattagttattaacacaatataccataatttatattgaaagatgaacttataataattgattattg 15121724  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| | |||||||||    
T  15121725 tcaatctacaattgatta 15121742  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19543599 - 19543490
Alignment:
Q  170 tttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19543599 tttaaccgtctgataggatgacgtttaaatagctaaacggctaagggcagggacctctcattcggcttagttaaatggtccaacccatcacggcccattt 19543500  T
Q  270 agaaaaaata 279  Q
    | ||| ||||    
T  19543499 aaaaagaata 19543490  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Original strand, 22957904 - 22958008
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22957904 ggatcagtagatacatgttatagcatatcagtatcaatatcaaatgaggaagaagaatttgtgtatcttgaattaggttgatgaaggataacagccatga 22958003  T
Q  110 gagga 114  Q
    |||||    
T  22958004 gagga 22958008  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23830488 - 23830384
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23830488 ggatcagtagatacatgttatagcatatcagtatcaatatcaaatgaggaagaagaatttgtgtatcttgaattaggttgatgaaggataacagccatga 23830389  T
Q  110 gagga 114  Q
    |||||    
T  23830388 gagga 23830384  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19543478 - 19543418
Alignment:
Q  328 cataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19543478 cataatttatattatgacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 19543418  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27101515 - 27101453
Alignment:
Q  326 accataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101515 accataatttatattataacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 27101453  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27143337 - 27143275
Alignment:
Q  326 accataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27143337 accataatttatattataacattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 27143275  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Original strand, 23848420 - 23848518
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  23848420 ggatcagtggatacaagttatagcatatcag------tatcaaagaaggacgaagaatttgtgtaccttaaattaggttgatgaatgatgactgccatga 23848513  T

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Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 159 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44626272 - 44626043
Alignment:
Q  159 attcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44626272 attcagaatagtttaaccgtctgatgagatgacgtttaaatagctaaacggctgaaggcagagacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 44626173  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44626172 acggtccatttagaaagaatagctcaattagacatattcatcaactaattagtgcttaacacaataaaccataatttatattatgacatcaacttataat 44626073  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44626072 aattgattattgtcaatccataattgatta 44626043  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 32038097 - 32038325
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32038097 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 32038196  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||    
T  32038197 cggtccatttagaaagaatagtccaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataata 32038296  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32038297 attgattattgtcaatccataattgatta 32038325  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1262574 - 1262244
Alignment:
Q  51 aaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgcca-------tgagaggaatgactaccctcattccgtttaggtttgc 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1262574 aaagaaggaataagaatttgtgtaccttgaattatgttgatggaggataactgccaatagatatgagagggatgactaccctcattc-gtttaggtttgc 1262476  T
Q  144 accatgttggtcagaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaa 243  Q
    |||||  |||||||||| |       |||||||||   | ||  |||||||||||| | |||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  1262475 accatactggtcagaatac-------tttaaccgtgggagga--tgacgtttaaatggctaaacggctgagggcatggatctctcattaggcttagctaa 1262385  T
Q  244 atggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatg 343  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||      
T  1262384 atggtcaaactcatcacggtccatttagaaagaatagcccaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaacacaatagatcataatttatattaga 1262285  T
Q  344 atattaacttataataattgaatattgtcaatccataattg 384  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1262284 acattaacttataataattgattattctcaatccataattg 1262244  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 163 - 388
Target Start/End: Original strand, 26005532 - 26005757
Alignment:
Q  163 agaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgg 262  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26005532 agaatagtttaaccgtatgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggtagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacag 26005631  T
Q  263 ttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataatt 362  Q
    | ||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  26005632 tccatttagtaagaatagcccaatcatacatattcatcaattaatgagtgcttaatataataaaccatattataaattataatattaatttataataatt 26005731  T
Q  363 gaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  26005732 gattattgtcaatccataattgatta 26005757  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 45266123 - 45266338
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||             ||||||||    
T  45266123 ttcaaaatagtttaaccgtctgatggaatgacgtttaaatagctaaacgactgagggcagtgatctctcattgggctta-------------acccatca 45266209  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    || | |||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45266210 cgatccatttagaaagaatagcccaatcacccatatttatcaactaattagtgcttaatacaatatactataatttatattatgacattaacttataata 45266309  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45266310 atttattattgtcaatccataattgatta 45266338  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Original strand, 17497514 - 17497643
Alignment:
Q  172 taaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17497514 taaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacgactgagggcagggacctctcattgggtttggctaaatggtccaacccatcacggtccatttag 17497613  T
Q  272 aaaaaatagtacaatcacacatattcatca 301  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  17497614 aaagaataacccaatcacacatattcatca 17497643  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18324865 - 18324738
Alignment:
Q  237 tagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataattta 336  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18324865 tagctaaatgattcaacccatcacggtccatttagaaagaatagttcaatcgcacttattcatcaactaattagtgcttaacacaatagaccataattta 18324766  T
Q  337 tattatgatattaacttataataattga 364  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  18324765 taatataatattaacttataataattga 18324738  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38144028 - 38143806
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgaggg--cagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccat 257  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38144028 ttcagaatagtttaaccgtatgatgggatgaggtttaaatagctaaacggctgagggggcagggacctctcattgggcttggataaatggtccaacccat 38143929  T
Q  258 cacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataa 357  Q
    || |||||||||| ||| ||||   ||||||         |||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||    
T  38143928 catggttcatttaaaaagaatatcccaatca--------tatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataa 38143837  T
Q  358 taattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  38143836 taattgattattgtcaatctatagttgatta 38143806  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39517480 - 39517268
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgaga-tgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| || || |||||    
T  39517480 ttaaccgtctgatgggaatgatgtttaaatagctaaacgactgaaagcagagacctctcattgaactcagctaaattgtcaaacccattacagtccattt 39517381  T
Q  270 agaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatatt 369  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||      ||||| |  ||||||||||||||| || ||||    
T  39517380 aataacaatagttcaatcacacatattcatcgactaattagtgcttaacacaatatatcata------attataacgttaacttataataatcgattatt 39517287  T
Q  370 gtcaatccataattgatta 388  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  39517286 gtcgatccataattgatta 39517268  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 34548083 - 34548204
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagat--gacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccat 257  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  34548083 ttcagaattgtttaaccgtctgatgcgatatgacgtttaa-tagctaaacggctgagggcaaggacctctcattgagcttagctaaatggtctaatccat 34548181  T
Q  258 cacggttcatttagaaaaaatag 280  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  34548182 cacggtccatttagaaagaatag 34548204  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Original strand, 34548216 - 34548283
Alignment:
Q  321 aatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34548216 aatagaccataatttatattatatcattaatttataataattgattattgtcaatccataattgatta 34548283  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18324996 - 18324934
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggac 223  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18324996 ttcagaat-gtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacgactgagggcagggac 18324934  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 26005379 - 26005435
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  26005379 ggatcagtagatacaagttatagcatatcagtatcagtatcaaagaaggaataagaa 26005435  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Original strand, 45272805 - 45272876
Alignment:
Q  266 atttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttat 337  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||    
T  45272805 atttagaaagaatagtccaattacacatattcatcaactaattagtgtttaacacgatagaccatagtttat 45272876  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38151076 - 38151014
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcaggga 222  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38151076 ttcataatagtttaaccgtctgatggggtgacgtttaaatagctaaacgactgagggcaggga 38151014  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 388
Target Start/End: Original strand, 17497648 - 17497690
Alignment:
Q  346 attaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17497648 attaacttataataattgattattatcaatccataattgatta 17497690  T

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Target: chr4 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 35904980 - 35905208
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35904980 ttcagaatagtttaactgtctgatgagatgacgtttaaatagctaaacggctaagggcagagacctctcattgggcttagctaaatggttcaacccatca 35905079  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35905080 cggtccatttagaaagaatagttcaatcacccatattcatcaactaattagtgcttaacacaatagaccataatttacattatgatatttacttataata 35905179  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35905180 attgattattgtgaatccataattgatta 35905208  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 42567637 - 42567865
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42567637 ttcataatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacagctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaactcatca 42567736  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42567737 cggtccatttaaaaagaatagcccaatcagacatattcatcaactaattaatgcttaacgcaatagaccataatttatattatgacatcaacttataata 42567836  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42567837 attgattattgtcaatccataattgatta 42567865  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6262343 - 6262125
Alignment:
Q  170 tttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattt 269  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6262343 tttaaccgtctgatgggataacgtttaaatagctaaacggctaagggcagacacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgatccattt 6262244  T
Q  270 agaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatatt 369  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6262243 agaaagaatagtccaatcacacatattcgtcaattaattagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgacattaacttataataattgattatt 6262144  T
Q  370 gtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6262143 gtcaatccataattgatta 6262125  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2228994 - 2228777
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2228994 ttaaccgtctgatgagatgacgtttaaatagttaaacggttgagggctgagacctctaattgggcttagttaaatggttcaacccatcacggtccattta 2228895  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2228894 gaaagaatagctcaatcacacatattcatcaactaattagtgctcaactcaatagaccataatttatattataatattaacttataataattgattattg 2228795  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    || |||||||||| ||||    
T  2228794 tcgatccataattaatta 2228777  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Original strand, 24423195 - 24423424
Alignment:
Q  160 ttcagaatagttt-aaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24423195 ttcagaatagttttaaccgtctgatgagatgacatttaaatagctaaacgactgagggaagggacctctcattgggcttagttaaatggtccaacccatt 24423294  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataat 358  Q
    ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  24423295 acgatccatttagaaagaatagtccaatcacacatattcatc-attaattagtgcttaacacaatataccataatttatataataacattaacttataat 24423393  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgattag 389  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24423394 aattgattattgtcaatccataattgattag 24423424  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36049012 - 36048810
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  36049012 gatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagagacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaatagcccaa 36048913  T
Q  286 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattga 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36048912 tcacacatattcatcatctaattagtgtttaacacaaaagaccataatttatattatgaaattaacttataataattgattattgtcaaaccataattga 36048813  T
Q  386 tta 388  Q
    |||    
T  36048812 tta 36048810  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 13393668 - 13393896
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13393668 ttcagaat-gtttaaccgtctgatgagatgaagtttaaatagctaaatggctgagggaaaggacctctcattgggcttagctaaatggtccaactcatca 13393766  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatatt-aacttataat 358  Q
    |||| |||||| ||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    
T  13393767 cggtccatttaaaaagaatagcttaatcacgcatattcatcaactaattagtgtttaactcaatagaccataatttatattataatattgcttttataat 13393866  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13393867 aattgattattgtcaatccataattgatta 13393896  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 13396807 - 13397035
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13396807 ttcagaat-gtttaaccgtctgatgagatgaagtttaaatagctaaatggctgagggaaaggacctctcattgggcttagctaaatggtccaactcatca 13396905  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatatt-aacttataat 358  Q
    |||| |||||| ||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    
T  13396906 cggtccatttaaaaagaatagcttaatcacgcatattcatcaactaattagtgtttaactcaatagaccataatttatattataatattgcttttataat 13397005  T
Q  359 aattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13397006 aattgattattgtcaatccataattgatta 13397035  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 18891097 - 18891324
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18891097 ttcataatagtttaactgt-tgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttaactaaatggtctaacccatca 18891195  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    | || |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||| | || ||||| | ||||| ||||||||    
T  18891196 cagtccattcaaaaagaatagtccaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatataccatattataaattataacattaatttataata 18891295  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18891296 attgattattgtcaatccataattgatta 18891324  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33366880 - 33366675
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||   |||    
T  33366880 gatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgatccatttagaaagaataacccaa 33366781  T
Q  286 tcacacatattcatcaac---taattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataat 382  Q
    ||| ||||||||||||||   |||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33366780 tcatacatattcatcaactaataatgagtgcttaatacaatagaccatactataaattataacattaatttataataattgattattgtcaatccataat 33366681  T
Q  383 tgatta 388  Q
    ||||||    
T  33366680 tgatta 33366675  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 54256330 - 54256164
Alignment:
Q  220 ggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaact 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||     
T  54256330 ggacctctcattgagcttagctaaatggttcaaccgatcacggtccatttagaaagaatagttcaatcaca--tattcatcaattaattagtgcttaaca 54256233  T
Q  320 gaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54256232 caatagatcataatttatattatgacattaacatataataattgattattgtcaatccataattgatta 54256164  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 375
Target Start/End: Original strand, 44160724 - 44160927
Alignment:
Q  174 accgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaa 273  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||    
T  44160724 accgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggccgagggcaaggatctctcgttgggcttagctaaatggttcaacccaccac-gtccatttaaaa 44160822  T
Q  274 aaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataattt---atattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  44160823 agaatagctcaatcacacatattcatcaactaatttgtacttaacacaatagaccataatttataatataataatattaacttataataactgataattg 44160922  T
Q  371 tcaat 375  Q
    |||||    
T  44160923 tcaat 44160927  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33361729 - 33361559
Alignment:
Q  218 agggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaa 317  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33361729 agggacctctcattagacttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagaaagaataacccaatcatacatatttatcaactaatgagtgcttaa 33361630  T
Q  318 ctgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
       |||||  |||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33361629 tacaataggtcatactataaattataacattaatttataataattgattattgtcaatccataattgatta 33361559  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 271 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43444942 - 43444825
Alignment:
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  43444942 gaaagaatagtctaatcgcacatattcatcaactaatgagtgtttaacacaatagaccataatttataatataatattaacctataataattgactattg 43444843  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43444842 tcaatccataattgatta 43444825  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6262449 - 6262351
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttcaattatgttgatgaaggataaccgccatga 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6262449 ggatcagtagatacaacttatagcatatcag------tatcaaagaaggaagaagaatttgtgtaccttgaattatgttgatgaaggataactgtcatga 6262356  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 374
Target Start/End: Original strand, 18888167 - 18888257
Alignment:
Q  284 aatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaa 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18888167 aatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataataattgattattgtcaa 18888257  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 123520 - 123458
Alignment:
Q  324 agaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  123520 agaccataatttatatca--aaattaatttataataattgattattatcaatccataattgatta 123458  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33361910 - 33361854
Alignment:
Q  11 gatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaat 67  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  33361910 gatcactagatacaaattatagcatatcatcatgagtaacaaagaaggaataagaat 33361854  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 33367056 - 33367000
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaa 66  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  33367056 ggatcactagatacaaattatagcatatcatcagtagtaacaaagaaggaataagaa 33367000  T

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Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3950142 - 3949921
Alignment:
Q  167 tagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttca 266  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3950142 tagtttatccgtctcatgggatgacgtttaaatagttaaacggctgagggcaaggacctctcattgggcttagctaaatggtctaacccatcacggtcca 3950043  T
Q  267 tttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaat 366  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3950042 tttagaaagaatagttcaatcacacatatttatcaattaattagtgcttgacacaatagactataatttatattatgacattaacttataataattgatt 3949943  T
Q  367 attgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3949942 attgtcaatccataattgatta 3949921  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40113563 - 40113329
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatga----gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    ||||||||||||||||||| | |||     |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40113563 ttcagaatagtttaaccgtttgatgcatgggatgacgtttaaatagctaaacagctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 40113464  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaat--tagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaactt 353  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40113463 atcacggtccatttaaaaagaatagctcaatcacacatattcatcaactaattatagtgcttaacacaatagaccataatttatattatgacattaactt 40113364  T
Q  354 ataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40113363 ataataattaattattgtcaatccataattgatta 40113329  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 388
Target Start/End: Original strand, 23888383 - 23888615
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23888383 agaattcacaatagtttaaccgtctggtgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggattagctaaatggtccaaccc 23888482  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttat 355  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||    
T  23888483 atcacggtccatttagaaagaatagtccgatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttat 23888582  T
Q  356 aataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23888583 aataattgattattgtcaatccataattgatta 23888615  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 388
Target Start/End: Original strand, 23892459 - 23892691
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23892459 agaattcacaatagtttaaccgtctggtgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggattagctaaatggtccaaccc 23892558  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttat 355  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||    
T  23892559 atcacggtccatttagaaagaatagtccgatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttat 23892658  T
Q  356 aataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23892659 aataattgattattgtcaatccataattgatta 23892691  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 18341573 - 18341790
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18341573 ttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacagttgaaggcagggacctctcattgagcttagctaaatggtccaacccatcacggtccatata 18341672  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  18341673 gaaagaatagctcaatcacacatattcatcatctaattagtgcttaacacaatagatcataatttatattatgacattaacttataataattaattattg 18341772  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    | ||||||||||||||||    
T  18341773 tgaatccataattgatta 18341790  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39190231 - 39190029
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||    
T  39190231 gatgacgtttacatagctaaacggctgagggcagggacctctcattggacttagctaaatggtccaacccatcacggtccatttagtaacaatagcccaa 39190132  T
Q  286 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattga 385  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39190131 tcactcatattcatcaactaattaatgtttaacacaatagaccataatttatattataagattaactcataataattgattattgtcaatccataattga 39190032  T
Q  386 tta 388  Q
    |||    
T  39190031 tta 39190029  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24138533 - 24138305
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24138533 ttcagaatattttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattggacttaactaaatggtccaacccatca 24138434  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||    
T  24138433 cggtccatttaaaaagaataactcaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataata 24138334  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24138333 attgattattgtcaatccataattgatta 24138305  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 670135 - 669933
Alignment:
Q  186 gatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaa 285  Q
    |||||||||||||||| | |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  670135 gatgacgtttaaatagctgaacggctgagggcatgaacctctcattgggcttagctaaatggtctaacccatcacggtccatttagaaagaatagatcaa 670036  T
Q  286 tcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattga 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  670035 tcacacatattcatcaagtaattagtgcttaacacaatagaccacaatttataaaataatattaatttataataattgattattgtcaatccataattga 669936  T
Q  386 tta 388  Q
    |||    
T  669935 tta 669933  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41826706 - 41826520
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41826706 ttcagagtagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacg------ggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 41826613  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaact 352  Q
    |||| |||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  41826612 cggtccatttaaaaagaatagctcaatcaaacatattcatcaactaattagtgcttaacacaatagaccataatttatactataacattaact 41826520  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 318
Target Start/End: Original strand, 15144258 - 15144413
Alignment:
Q  163 agaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacgg 262  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15144258 agaatagtttaaccatctgatgggatgacatttaaatagctaaacggctgagggcagggatctctcattgggcttagttaaatggtccaactcatcacgg 15144357  T
Q  263 ttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaac 318  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144358 tccatttagaaagaatagcacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaac 15144413  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 662926 - 662751
Alignment:
Q  159 attcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatc 258  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  662926 attcagaatagtttaaccgt----tgggatgacgtttaaatagctgaacgactgagggcagtgacctctcattggacttagctaaatggtccaacccatc 662831  T
Q  259 acggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttata 338  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||    
T  662830 acggtccatttagaaagaatagctcaatcacacatattcatcaagtaattagtgtttaacacaataaaccacaatttata 662751  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Original strand, 17527310 - 17527532
Alignment:
Q  169 gtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatt 268  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17527310 gtttaaccgtctgacgcgataacgtttaaatagctaaactgttgagagcagggacctctcattgggcttagctaaatagtccaacccatcacggtccatt 17527409  T
Q  269 tagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagt---gcttaactgaatagacc-ataatttatattatgatattaacttataataattga 364  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17527410 tagaaagaatggcccaatcacacatattcatcaactaattagtagtgcttaacacaataaacccataaat-ataatataatattaacttataataattga 17527508  T
Q  365 atattgtcaatccataattgatta 388  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17527509 ttattgtcaatccatatttgatta 17527532  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14661415 - 14661277
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14661415 agaattcacaataatttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagagcagggacctcccattgagcttagctaaatggtccaaccc 14661316  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacata 294  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  14661315 atcacggtccatttaaaaagaatagtccaatcatacata 14661277  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25336266 - 25336147
Alignment:
Q  222 acctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactga 321  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25336266 acctctcattagacttaactaaatggttcaacccatcacggtccatttagaaagaatagttcaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaacaca 25336167  T
Q  322 atagaccataatttatatta 341  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  25336166 acagaccatagtttatatta 25336147  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 17530028 - 17530258
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggtt---cat 267  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  17530028 ttaaccgtctgatgggatgacgttgaaatagctaaacggctgagcgcagtgacctctcattgggtttagctaaatggtccaacccatcacggtggtccat 17530127  T
Q  268 ttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaac--------taattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaactta---ta 356  Q
    ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||   ||    
T  17530128 ttaaaaagaatgacacaatcacacatattcatcaactaattagttaattagtgcttaacacaatagaccataa-atataatataatattaacttatacta 17530226  T
Q  357 ataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17530227 ataattgattattatcaatccgtaattgatta 17530258  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33426024 - 33425851
Alignment:
Q  207 cgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | | ||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  33426024 cgactgagggtagggacctctcattgagcttagctaaatagtcaaacctatcatgatccatttagaaactataacacaattacacatattcatcatctaa 33425925  T
Q  307 ttagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataa 381  Q
    || ||| |||||  |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33425924 ttcgtgtttaacacaatacatcataatttatattaaaagattaac-tataataattgattattgtcaatccataa 33425851  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 288
Target Start/End: Original strand, 4840581 - 4840654
Alignment:
Q  214 gggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcatttagaaaaaatagtacaatca 288  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  4840581 gggcagggacctctctttgagcttagctaaatggtccaactcatcac-gttcatttagaaagaataatccaatca 4840654  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 388
Target Start/End: Original strand, 4840923 - 4840966
Alignment:
Q  345 tattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4840923 tattaacttataataattgattattgtcaatccataattgatta 4840966  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14661275 - 14661208
Alignment:
Q  321 aatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14661275 aatagaccatattataaattataacattaatttataataattgattattgtcaatccataattgatta 14661208  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25335813 - 25335771
Alignment:
Q  346 attaacttataataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25335813 attaacttataataattgattattgtcaatccataagtgatta 25335771  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39190393 - 39190300
Alignment:
Q  10 ggatcagtagatacaagttataacatatcagcattagtatcaaagaaggaagaagaatctgtgtaccttc-aattatgttgatgaaggataaccgcc 105  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || ||   |||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39190393 ggatcactagatacaaattatagcatatcatcaataata---aagaaggaaggagaaattgtgtacctttgaattaggttgatgaaggataaccgcc 39190300  T

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Target: scaffold1634 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 388
Target Start/End: Original strand, 15 - 247
Alignment:
Q  156 agaattcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaaccc 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15 agaattcacaatagtttaatcgtctgatgggatgacgtttaaatagttaaacggctgagggcagggacctctcatttggcttagctaaatggtccaaccc 114  T
Q  256 atcacggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttat 355  Q
    |||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||    
T  115 atcacgatccatttagaaagaatagtccaatcatacatattcatcaactaatgagtgcttaatacaatagaccatattataaattataacattaatttat 214  T
Q  356 aataattgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
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T  215 aataattgattattgtcaatccataattaatta 247  T

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Target: scaffold0040 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 67923 - 67695
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67923 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 67824  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||    
T  67823 cggtccatttagaaagaatagcccaatcatacatattcatcaactaatgagtgttcaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataata 67724  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67723 attgattattgtcaatccataattgatta 67695  T

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Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 60447 - 60219
Alignment:
Q  160 ttcagaatagtttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60447 ttcagaatagtttaaccgtctgatgggatgacgtttaaatagctaaacggctgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatca 60348  T
Q  260 cggttcatttagaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataata 359  Q
    |||| ||||||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||   ||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||    
T  60347 cggtccatttagtaagaatagcccaatcatacatattcatcaactaatgagtgttcaatacaatagaccatattataaattataacattaatttataata 60248  T
Q  360 attgaatattgtcaatccataattgatta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60247 attgattattgtcaatccataattgatta 60219  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30220 - 30003
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
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T  30220 ttaaccgtctgatggaatgacgtttaaatagctaaacggctgaaggtagagacctctcattggacttagctaaatggttcaatccatcacggtccattta 30121  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30120 gaaagaatagctcaatcacacatattcatcaactaattagtgtttaacacaatagatcataatttataatataatattaacttataataattgattattg 30021  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30020 tcaatccataattgatta 30003  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 134550 - 134767
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  134550 ttaaccgtctgatggaatgacgtttaaatagctaaacgactgaggctagggacctctcattgggcttatctaaatggttcaacccatcacggtccattta 134649  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
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T  134650 gtaacaatagtccaatcactcgtattcatcaactaatcagtgtttaacagaatataccataatttatattataagattaacttataataaattattatta 134749  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||||||||    
T  134750 tcaatccataattgatta 134767  T

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Target: scaffold0062 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 40145 - 40362
Alignment:
Q  171 ttaaccgtctaatgagatgacgtttaaatagttaaacgaccgagggcagggacctctcattgggcttagctaaatggtccaacccatcacggttcattta 270  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  40145 ttaaccgtctgatgggatgacggttaaatagcttaacggctgagggcaatgacctctcatcgggcttagctaaatggtccaactcagcacggtccattta 40244  T
Q  271 gaaaaaatagtacaatcacacatattcatcaactaattagtgcttaactgaatagaccataatttatattatgatattaacttataataattgaatattg 370  Q
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T  40245 aaaagaataactcaatcacacatattcatcaactaattagtgcttagcacagtagaccataatttataatataatattaacttataataattgattattg 40344  T
Q  371 tcaatccataattgatta 388  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  40345 tcaatccataattaatta 40362  T

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