View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0476_low_1 (Length: 1589)

Name: NF0476_low_1
Description: NF0476
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0476_low_1
NF0476_low_1
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (35-1589)||(48106334-48107897)
chr1 (1272-1589)||(48062699-48063016)
chr1 (1287-1585)||(48066792-48067090)
chr1 (102-349)||(48063919-48064166)
chr1 (1272-1586)||(48099736-48100050)
chr1 (76-348)||(48101173-48101445)
chr1 (461-641)||(48068321-48068498)
chr1 (461-638)||(48063660-48063834)
chr1 (106-348)||(48068576-48068818)
chr1 (454-638)||(48100903-48101084)
chr1 (937-1033)||(48063228-48063324)
chr1 (936-1036)||(48067188-48067288)
chr1 (937-1029)||(48100243-48100335)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 1340; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 1340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 1589
Target Start/End: Complemental strand, 48107897 - 48106334
Alignment:
Q  35 tgacacatcttttaatatgattattaattcttaaacattatattgcataaactttcttgtgttgtcaatgccttgaaataaaacagtgtatgaaagaacc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48107897 tgacacatcttttaatatgattattaattcttaaacatt-----gcataaattttcttgtgttgtcaatgccttggaataaaacagtgtatgaaagaacc 48107803  T
Q  135 tcaaagagcacaatatggagggggaattataataaattccggatttgatcacaacatagagggttggacagtatttggaaatggaacaattgaggaacgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48107802 tcaaagagcacaatatggagggggaattatagtaaattccggatttgatcacaacatagagggttggacagtatttggaaatggaacaattgaggaacgt 48107703  T
Q  235 atatcaaatgatggaaatagattcattgttgccagcaaaagaacacaatcattagatagtttttcacaaacggttcagctagagaaaggattgatataca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48107702 atatcaaatgatggaaatagattcattgttgccagcaaaagaacacaatcattagatagtttttcacaaacggttcagctagagaaaggattgatatata 48107603  T
Q  335 ctttttcaggtaactaacttatgtttctctctcagtcactaacattcatcaaatgaatgtaaattatcatattgatcgttaattcatttgttttataaaa 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48107602 ctttttcaggtaactaacttatgtttctc----agtcactaacattcatcaaatgaatgtaaattatcatattgatcgttaattcatttgttttataaaa 48107507  T
Q  435 catattttgattgattttatttccacattcagcttggcttcagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaacaaatggaagtgatcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48107506 catattttgattgattttatttccacattcagcttggcttcagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaacaaatggaagtgatcaa 48107407  T
Q  535 ctggtgcatggtggccatgtgatagcaaagcatggatgttggtctcttctaaaaggtggcatagtcgcaaacttctcgagccctgctgagattcttttcg 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48107406 ctggtgcatggtggccatgtgatagcaaagcatggatgttggtctcttctaaaaggtggcatagttgcaaacttctcgagccctgctgagattcttttcg 48107307  T
Q  635 aggttaactgcattcttctttgagtcaaatatgtttttattgaataannnnnnnngtagagacttaataccaaaacacgtaattttaagccgattgaaaa 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48107306 aggttaactgcattcttctttgagtcaaatatgtttttattgaat-attttttttgtagagacttaataccaaaacacgtaattttaagccgattgaaaa 48107208  T
Q  735 catatttaacccttcttcttttattgaagcaagaaaagaaagttcttatctaaaatttttacatgtactttttggaccttgtactctttctgaattggtc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48107207 catatttaacccttcttcttttattgaagcaagaaaagaaagttcttatctaaaatttttacatgtactttttggaccttgtactttttctgaattggtc 48107108  T
Q  835 ctaattatttctgaattcttatctaaaatgaaatctgttatgtaacnnnnnnngttggtaaatgaaattgactaagaatgcattgcagagcaataattca 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48107107 ctaattatttctgaattcttatctaaaatgaaatctgttatgtagcaaaaaaagttggtaaatgaaattgactaagaatgcattgtagagcaataattca 48107008  T
Q  935 agtgtggaaatatgggctgatagtgtgtccttgcaaccatttactaaaaaggaatggagatcacaccaagacaacaacattgaaagggtaagctaatgca 1034  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48107007 agtgtggaaatatgggctgatagtgtgtccttgcaaccatttactaaaaaggaatggagatcacaccaagacaacaatattgaaagggtaagctaatgca 48106908  T
Q  1035 atacgaaacttgcattattcttctatgcttactatctttgtgatactaccaacttgaggaacaaaatccatagtaagcaaaccaattttatactcaaaag 1134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106907 atacgaaacttgcattattcttctatgcttactatctttgtgatactaccaactcgaggaacaaaatccatagtaagcaaaccaattttatactcaaaag 48106808  T
Q  1135 caatactaaaattagaacggataataaagacgtggttgggagtggagactccact-----------------aaatttatgcatacttcgtaccaataac 1217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106807 caatactaaaattagaacggataataaagacgtggttgggagtggagactccactaaatttatgcgtcgacaaaatttatgcatacttcgtaccaataac 48106708  T
Q  1218 atggttccaa--nnnnnnnnnnngtaacaaaaaatataagaatagtaaccggtaattgatttataacttgtaggtacgtaagagtagagtgagattccat 1315  Q
    ||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106707 atggttccaaattttttttttttgtaacaaaaaatataagaatagtaaccggtaattgatttataacttgtaggtacgtaagagtagagtgagattccat 48106608  T
Q  1316 gtaagtaatgtaaatgaaacagcattggaaggagcaacagttgtgataacacaaacaaaggcagatttcccatttggatgtgggatgaaccatcatatac 1415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106607 gtaagtaatgtaaatgaaacagcattggaaggagcaacagttgtgataacacaaacaaaggcagatttcccatttggatgtgggatgaaccatcatatac 48106508  T
Q  1416 tcacaaacattgactaccaggaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttcaccaatgaaatgaaatggtatagtacagaaataattccaggcca 1515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106507 tcacaaacattgactaccaggaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttcaccaatgaaatgaaatggtatagtacagaaataattccaggcca 48106408  T
Q  1516 agaaaactacactatctcagatacaatgttagaatttgctaaagataatggaatttctgtcagaggtcataaca 1589  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48106407 agaaaactacactatctcagatgcaatgttagaatttgctaaagataatggaatttctgtcagaggtcataaca 48106334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1272 - 1589
Target Start/End: Complemental strand, 48063016 - 48062699
Alignment:
Q  1272 tgatttataacttgtaggtacgtaagagtagagtgagattccatgtaagtaatgtaaatgaaacagcattggaaggagcaacagttgtgataacacaaac 1371  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  48063016 tgatttataacctacaggtacgtaagagcagggtgagattccaggtaactcatccaaatgaaacagtgttggaaggagcaacagttgttattaaacaaac 48062917  T
Q  1372 aaaggcagatttcccatttggatgtgggatgaaccatcatatactcacaaacattgactaccaggaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttc 1471  Q
    || |||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48062916 aagggcaaattttccatatggatgtgcgatgaaccgtcatatcctcacaaacagtgactaccagaaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttc 48062817  T
Q  1472 accaatgaaatgaaatggtatagtacagaaataattccaggccaagaaaactacactatctcagatacaatgttagaatttgctaaagataatggaattt 1571  Q
    || || || ||||| |||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| | ||| |  |||||||||| || ||||| || |    
T  48062816 actaacgagatgaagtggtatagtacagagaaaatccaaggccatgaaaactatactatcccagatgccatgctgaaatttgctaaggaaaatggcatat 48062717  T
Q  1572 ctgtcagaggtcataaca 1589  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48062716 ctgtcagaggtcataaca 48062699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1287 - 1585
Target Start/End: Complemental strand, 48067090 - 48066792
Alignment:
Q  1287 aggtacgtaagagtagagtgagattccatgtaagtaatgtaaatgaaacagcattggaaggagcaacagttgtgataacacaaacaaaggcagatttccc 1386  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||| |||| | || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  48067090 aggtacgtaagagcaaggtgacattccaagtaaatcatctaaacgaaacatcattggaaggagcaacggttgtcatcaaacaaacaaaggcagatttccc 48066991  T
Q  1387 atttggatgtgggatgaaccatcatatactcacaaacattgactaccaggaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttcaccaatgaaatgaaa 1486  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||     
T  48066990 attcggatgtgggatgaactatcacatcctcacaaacattgagtaccagaaatggtttgtgtcaagattcaagtacacaactttcactaatgagatgaag 48066891  T
Q  1487 tggtatagtacagaaataattccaggccaagaaaactacactatctcagatacaatgttagaatttgctaaagataatggaatttctgtcagaggtcat 1585  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||  | ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48066890 tggtatagtacagagaaaattcaaggccaggaaaactatactattcctgatgccatgctgaaatttgccaaagaaaatggcatttctgtcagaggtcat 48066792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48064166 - 48063919
Alignment:
Q  102 atgccttgaaataaaacagtgtatgaaagaacctcaaagagcacaatatggagggggaattataataaattccggatttgatcacaacatagagggttgg 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48064166 atgccttgaaataaagcagtgtgtgacagaacctaagagggcacaatatggaggaggcattatagtaaatccaggatttgatcacaacataaagggttgg 48064067  T
Q  202 acagtatttggaaatggaacaattgaggaacgtatatcaaatgatggaaatagattcattgttgccagcaaaagaacacaatcattagatagtttttcac 301  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||    
T  48064066 agagtgtttggaaatggaacaatcgaggaacgaatatcaaatgatgaaaatagattcattgttgctagcaacagaagacaaacattggatggtttctcac 48063967  T
Q  302 aaacggttcagctagagaaaggattgatatacactttttcaggtaact 349  Q
    | | ||| || ||  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  48063966 agaaggtccaactgaagaaaggaatgatatacatgttttctggtaact 48063919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1272 - 1586
Target Start/End: Complemental strand, 48100050 - 48099736
Alignment:
Q  1272 tgatttataacttgtaggtacgtaagagtagagtgagattccatgtaagtaatgtaaatgaaacagcattggaaggagcaacagttgtgataacacaaac 1371  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| |  |||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| || |||| || | ||||||    
T  48100050 tgatttataaactgcaggtacgcaagagcaaggtgagattccatgtaactcatctaaacaaaacagaaatggaaggagcatcaattgtcatcaaacaaac 48099951  T
Q  1372 aaaggcagatttcccatttggatgtgggatgaaccatcatatactcacaaacattgactaccaggaatggtttgtgtcaagattcaaatacacaactttc 1471  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  48099950 aaaggcaaatttcccacttggatgtgggatgaaccattacatccttacaaactttgagtaccagagatggtttgtgtcaagattcaagtacacagctttt 48099851  T
Q  1472 accaatgaaatgaaatggtatagtacagaaataattccaggccaagaaaactacactatctcagatacaatgttagaatttgctaaagataatggaattt 1571  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| | ||| |  |||| || ||||| ||||| ||||    
T  48099850 actaatgagatgaagtggtatagtacagagagatttcaaggccaggaaaactatactatcccagatgccatgatgaaattcgccaaagaaaatggcattt 48099751  T
Q  1572 ctgtcagaggtcata 1586  Q
    |||||||||||||||    
T  48099750 ctgtcagaggtcata 48099736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48101445 - 48101173
Alignment:
Q  76 attgcataaactttcttgtgttgtcaatgccttgaaataaaacagtgtatgaaagaacctcaaagagcacaatatggagggggaattataataaattccg 175  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||| ||||||| | || ||||||||||| || || |||| | ||||| | |    
T  48101445 attgcacaaacttacttgtgttgccaatgcctataaacaaagcagtgtgtgacagaacctaagagggcacaatatgggggaggcattacagtaaatccag 48101346  T
Q  176 gatttgatcacaacatagagggttggacagtatttggaaatggaacaattgaggaacgtatatcaaatgatggaaatagattcattgttgccagcaaaag 275  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48101345 gatttgatcacaacataaatggctggaaagtgtttggaaatggaacaatcgaggaacgagtatcaaacaacggaaatagattcattgttgccagcaacag 48101246  T
Q  276 aacacaatcattagatagtttttcacaaacggttcagctagagaaaggattgatatacactttttcaggtaac 348  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  48101245 aacacaaccattggatagtttttcacagaaggtccaactgaagaaaggaatgatatatactttttctggtaac 48101173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 461 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 48068498 - 48068321
Alignment:
Q  461 attcagcttggcttcagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaacaaatggaagtgatcaactggtgcatggtggccatgtgatagc 560  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  | |||||||||||||||||    
T  48068498 attcagcttggttccagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaataaatggaagtga---attggtaaaaggtggccatgtgatagc 48068402  T
Q  561 aaagcatggatgttggtctcttctaaaaggtggcatagtcgcaaacttctcgagccctgctgagattcttttcgaggttaa 641  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  48068401 aaaatatggatgttggtctcttctaaaaggaggcatagttgcaaaattttcaagccctgctgaaatcctttttgaggttaa 48068321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 461 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 48063834 - 48063660
Alignment:
Q  461 attcagcttggcttcagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaacaaatggaagtgatcaactggtgcatggtggccatgtgatagc 560  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | || || |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  48063834 attcagcttggtttcagctcagtgaaggaagtgacattgtgtcagttgtatttaaaagaaatggaagtga---actggtgcatggtggccatgtgatagc 48063738  T
Q  561 aaagcatggatgttggtctcttctaaaaggtggcatagtcgcaaacttctcgagccctgctgagattcttttcgaggt 638  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  48063737 caaacatggatgttggtcgctgctaaaaggcggtatagttgcaaacttttcaagccctgctgagattctttttgaggt 48063660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48068818 - 48068576
Alignment:
Q  106 cttgaaataaaacagtgtatgaaagaacctcaaagagcacaatatggagggggaattataataaattccggatttgatcacaacatagagggttggacag 205  Q
    ||||||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  48068818 cttgaaataaaccagtgtgtcccagaacctcagagagcacaatatggaggtggcattatagtaaatccaggatttgatcacaacattaaggattggacgg 48068719  T
Q  206 tatttggaaatggaacaattgaggaacgtatatcaaatgatggaaatagattcattgttgccagcaaaagaacacaatcattagatagtttttcacaaac 305  Q
    | ||||   ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  48068718 tgtttgagcatggaacaatcaaggaacgaacatcaaatgatggaaatacatttattgttgtcagcaacagaacacaaccattagatagtttatcacaaaa 48068619  T
Q  306 ggttcagctagagaaaggattgatatacactttttcaggtaac 348  Q
     || || || ||||||| | ||||||| | |||||| ||||||    
T  48068618 agtccaactggagaaagaaatgatatatattttttctggtaac 48068576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 454 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 48101084 - 48100903
Alignment:
Q  454 tttccacattcagcttggcttcagctgagtgaaggaagtgacacaatttctgtggtatttaaaacaaatggaagtgatcaactggtgcatggtggccatg 553  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     | || || |||||||||| ||||||||||||   | | || |  ||||| ||||    
T  48101084 tttccacattcagcttggtttcagttgagtgaaggaagtgagtttgtatcagttgtatttaaaataaatggaagtga---atttgtacgaggtggtcatg 48100988  T
Q  554 tgatagcaaagcatggatgttggtctcttctaaaaggtggcatagtcgcaaacttctcgagccctgctgagattcttttcgaggt 638  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  48100987 tgatagcaaagcatggatgctggtctcttctaaaaggtggcatagttgccaacttttcaagccctgctgagattctttttgaggt 48100903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 937 - 1033
Target Start/End: Complemental strand, 48063324 - 48063228
Alignment:
Q  937 tgtggaaatatgggctgatagtgtgtccttgcaaccatttactaaaaaggaatggagatcacaccaagacaacaacattgaaagggtaagctaatgc 1033  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||||||| || | | || ||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  48063324 tgtggaattatgggttcatagtgtctccttacaaccattcaccagagagcaatggaggtcacaccaagatagcagcattgagagggtaagctaatgc 48063228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 936 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 48067288 - 48067188
Alignment:
Q  936 gtgtggaaatatgggctgatagtgtgtccttgcaaccatttactaaaaaggaatggagatcacaccaagacaacaacattgaaagggtaagctaatgcaa 1035  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |  ||||   |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  48067288 gtgtggaattatggactgatagtgtctctttacaaccattcaacaaaacacaatggagatcacaccaagccgacagcattgagagggtaagctaatccaa 48067189  T
Q  1036 t 1036  Q
    |    
T  48067188 t 48067188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 937 - 1029
Target Start/End: Complemental strand, 48100335 - 48100243
Alignment:
Q  937 tgtggaaatatgggctgatagtgtgtccttgcaaccatttactaaaaaggaatggagatcacaccaagacaacaacattgaaagggtaagcta 1029  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||||| |||||| | | | |||| |||||||||||    
T  48100335 tgtggaactatgggctgatagtgtctccttacaaccattcaccaagaaacaatggagatcacagcaagacgatagcgttgagagggtaagcta 48100243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University