View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0486_high_11 (Length: 490)

Name: NF0486_high_11
Description: NF0486
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0486_high_11
NF0486_high_11
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (34-442)||(26143519-26143927)
chr6 (34-442)||(25580373-25580781)
chr6 (30-442)||(25483710-25484122)
chr6 (30-442)||(25539194-25539606)
chr6 (30-442)||(26056573-26056985)
chr6 (30-442)||(26076543-26076955)
chr6 (30-442)||(26656616-26657028)
chr6 (30-442)||(26762587-26762999)
chr6 (30-442)||(26647130-26647542)
chr6 (30-442)||(26753098-26753510)
chr6 (30-442)||(26862231-26862643)
chr6 (34-442)||(26884721-26885129)
chr6 (30-442)||(27337214-27337626)
chr6 (30-442)||(27397954-27398366)
chr6 (30-442)||(27530420-27530832)
chr6 (30-345)||(25511640-25511955)
chr6 (31-442)||(25492439-25492850)
chr6 (30-442)||(27215103-27215515)
chr6 (46-442)||(27717634-27718030)
chr6 (46-442)||(27610255-27610651)
chr6 (30-437)||(27592140-27592547)
chr6 (46-442)||(28786889-28787285)
chr6 (46-442)||(28793010-28793406)
chr6 (30-442)||(31285210-31285622)
chr6 (46-440)||(26623924-26624318)
chr6 (46-440)||(26729901-26730295)
chr6 (30-442)||(27697705-27698117)
chr6 (30-437)||(27676739-27677146)
chr6 (46-442)||(28781752-28782148)
chr6 (49-437)||(26803102-26803490)
chr6 (30-437)||(27426731-27427138)
chr6 (30-437)||(27679606-27680013)
chr6 (49-430)||(27603842-27604223)
chr6 (93-437)||(27705586-27705930)
chr6 (30-442)||(26824470-26824882)
chr6 (391-442)||(25511589-25511640)
chr6 (250-333)||(28140295-28140378)
chr6 (243-325)||(28097775-28097857)
chr6 (256-332)||(26937790-26937866)
chr6 (31-127)||(28326444-28326540)
chr6 (31-127)||(28504080-28504176)
chr6 (31-104)||(29477185-29477258)
chr6 (279-344)||(26849461-26849526)
chr6 (262-350)||(28243538-28243626)
chr6 (40-127)||(28182084-28182171)
chr6 (262-325)||(28227720-28227783)
chr6 (262-325)||(28235333-28235396)
chr6 (243-350)||(28297072-28297179)
chr6 (243-350)||(28514894-28515001)
chr6 (242-312)||(26724349-26724419)
chr6 (243-325)||(26950511-26950593)
chr6 (49-181)||(2185738-2185870)
chr6 (279-344)||(26975700-26975765)
chr6 (73-126)||(28490718-28490771)
chr6 (73-126)||(29803128-29803181)
chr6 (262-334)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (30-442)||(28126794-28127206)
chr1 (34-440)||(28163499-28163904)
chr1 (30-442)||(267459-267871)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (31-442)||(18698516-18698927)
chr4 (31-442)||(18678676-18679087)
chr4 (46-437)||(18730635-18731026)
chr4 (31-437)||(18654593-18654999)
chr4 (30-437)||(18074417-18074824)
chr4 (31-437)||(18723201-18723607)
chr4 (30-164)||(5090069-5090203)
chr4 (242-350)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (46-442)||(8138-8534)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (46-442)||(12810-13206)
scaffold0277 (49-442)||(3850-4243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (46-442)||(2674-3070)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (30-437)||(60225-60632)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (46-442)||(29272973-29273369)
chr8 (31-118)||(35984274-35984361)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (243-342)||(3280410-3280509)
chr2 (243-348)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (243-342)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (262-350)||(43700-43788)
scaffold0038 (262-325)||(28218-28281)
scaffold0038 (262-325)||(35495-35558)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (40-127)||(57423-57510)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (45-116)||(3468258-3468329)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26143927 - 26143519
Alignment:
Q  34 ctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagata 133  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143927 ctgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagata 26143828  T
Q  134 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143827 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggtt 26143728  T
Q  234 attatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143727 attatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 26143628  T
Q  334 atgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacag 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26143627 atgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacag 26143528  T
Q  434 ggtatttgg 442  Q
    |||||||||    
T  26143527 ggtatttgg 26143519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25580781 - 25580373
Alignment:
Q  34 ctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagata 133  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580781 ctgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagata 25580682  T
Q  134 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||||||  |  ||||||||||||| |||    
T  25580681 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaactattattaaaaggagataataatggagatgtttcaagtt 25580582  T
Q  234 attatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 333  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580581 attaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 25580482  T
Q  334 atgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacag 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580481 atgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacag 25580382  T
Q  434 ggtatttgg 442  Q
    |||||||||    
T  25580381 ggtatttgg 25580373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25484122 - 25483710
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25484122 gactctgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaacaatcaaaagaatcttctttcta 25484023  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttc 228  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||  ||||||||| || || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25484022 gatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcatcttt-tggagatgtttc 25483924  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25483923 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaagaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatt 25483824  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483823 tacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 25483724  T
Q  429 aacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||||    
T  25483723 aacagggtatttgg 25483710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25539606 - 25539194
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25539606 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttta 25539507  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||  ||||||||| || || ||||||| |  |  |||||||||||||    
T  25539506 gatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttttggagatgtttca 25539407  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25539406 agttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaacaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgattt 25539307  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25539306 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagcaatttcacttgttctattggggactgtaatcca 25539207  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  25539206 acagggtatttgg 25539194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26056985 - 26056573
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26056985 gactctgcttccaagaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttcta 26056886  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||| |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  26056885 gatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttca 26056786  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26056785 agttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgattt 26056686  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26056685 acccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatcca 26056586  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26056585 acagggtatttgg 26056573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26076955 - 26076543
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26076955 gactctgcttccaagaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttcta 26076856  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| || ||| || |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  26076855 gatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttca 26076756  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26076755 agttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgattt 26076656  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26076655 acccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatcca 26076556  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26076555 acagggtatttgg 26076543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26657028 - 26656616
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26657028 gactctgcttccacaaccgaaccaatcaagtcctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 26656929  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||| | |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26656928 gatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttca 26656829  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26656828 aattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgattt 26656729  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  26656728 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatcca 26656629  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26656628 acagggtatttgg 26656616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26762999 - 26762587
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26762999 gactctgcttccacaaccgaaccaatcaagtcctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 26762900  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||| | |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26762899 gatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttca 26762800  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26762799 aattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgattt 26762700  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  26762699 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatcca 26762600  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26762599 acagggtatttgg 26762587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26647542 - 26647130
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26647542 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 26647443  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  26647442 catagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttca 26647343  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26647342 agttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgattt 26647243  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26647242 acccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatcca 26647143  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26647142 acagggtatttgg 26647130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26753510 - 26753098
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26753510 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 26753411  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  26753410 catagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttca 26753311  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26753310 agttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgattt 26753211  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26753210 acccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatcca 26753111  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26753110 acagggtatttgg 26753098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26862643 - 26862231
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26862643 gactctacttccatgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattcta 26862544  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
      |||||||||||| || | || ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||    
T  26862543 tttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtttttaaaagaagctccttctggagatgtttca 26862444  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26862443 agctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 26862344  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26862343 ccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatcca 26862244  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  26862243 acagggtatttgg 26862231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26885129 - 26884721
Alignment:
Q  34 ctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagata 133  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26885129 ctgcttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccattttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgta 26885030  T
Q  134 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggtt 233  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  26885029 gtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagtt 26884930  T
Q  234 attatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 333  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26884929 attatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaacataattataaattgcttttgcaagtgttgatttaccc 26884830  T
Q  334 atgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacag 433  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | || | |||  || | |||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  26884829 aagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacag 26884730  T
Q  434 ggtatttgg 442  Q
    |||||||||    
T  26884729 ggtatttgg 26884721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 27337214 - 27337626
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27337214 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttccta 27337313  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||  ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  27337314 catagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttca 27337413  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337414 agtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 27337513  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27337514 tcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatcca 27337613  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  27337614 acagggtatttgg 27337626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 27397954 - 27398366
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27397954 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttccta 27398053  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||  ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  27398054 catagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttca 27398153  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27398154 agtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 27398253  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27398254 tcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatcca 27398353  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||    
T  27398354 acagggtatttgg 27398366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 27530420 - 27530832
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530420 gactctactcccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaggcctctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 27530519  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||    
T  27530520 catagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttca 27530619  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |||||    | | |||||| |||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27530620 agttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 27530719  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||       |||||| ||  |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  27530720 acctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgccctttcacatgttgtactcgggactgtaatcca 27530819  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    ||||| |||||||    
T  27530820 acaggatatttgg 27530832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25511955 - 25511640
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25511955 gactctgcttccaggaccgaaccagtcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttcta 25511856  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| || ||| || |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  25511855 gatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttca 25511756  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25511755 agttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgattt 25511656  T
Q  330 acccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25511655 acccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 25492439 - 25492850
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctag 130  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  25492439 actccgcttccacgaccgaaccaatcaagtccttcagccaaatcctctagctgctccagtctgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctac 25492538  T
Q  131 atagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcag 230  Q
    |||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||  ||| ||||  || |  ||||||| | ||||||||||| |||||     
T  25492539 atagtccttgttttatgattgcaattccctcactaacacttcttaacttaatgtctaatctaaccattttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaa 25492638  T
Q  231 gttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattta 330  Q
    |||  |  || ||||||||||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  25492639 gtttcttggagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaagttatagattgattttgcaagtgttgattta 25492738  T
Q  331 cccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   || |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  25492739 cctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaagcaatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaa 25492838  T
Q  431 cagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||    
T  25492839 cagggtatttgg 25492850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27215515 - 27215103
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27215515 gactctacttccaccaccaaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttga 27215416  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     ||||  |||  || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| | | |||||  | |||||| || |||||||    
T  27215415 catagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccgttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttca 27215316  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     ||||||   | ||||||||||| | ||||  |  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27215315 agttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaatgaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgattt 27215216  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||    
T  27215215 acccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatcca 27215116  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    ||||||| |||||    
T  27215115 acagggtgtttgg 27215103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Original strand, 27717634 - 27718030
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |    
T  27717634 ccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttccttta 27717733  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttg 244  Q
    |    | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | ||| ||||||||||  |||||   | |||    
T  27717734 tataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttg 27717832  T
Q  245 aattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 344  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27717833 aattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagt 27717932  T
Q  345 accataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27717933 accataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattgg 27718030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Original strand, 27610255 - 27610651
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |    
T  27610255 ccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttccttta 27610354  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttg 244  Q
    |    | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||   | |||    
T  27610355 tataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttg 27610453  T
Q  245 aattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 344  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27610454 aattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagt 27610553  T
Q  345 accataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| ||||||||| || || | | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27610554 accataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattgg 27610651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Original strand, 27592140 - 27592547
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27592140 gactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcca 27592239  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaa-tttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttc 228  Q
      ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||| ||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | |||||||| ||||    
T  27592240 tgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaactta-atttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttc 27592338  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    | ||||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27592339 aagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaagttataaattgctttcgcaagtgttgatt 27592438  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27592439 ttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatcc 27592538  T
Q  429 aacagggta 437  Q
    |||||||||    
T  27592539 aacagggta 27592547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28787285 - 28786889
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| |    
T  28787285 ccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttccttta 28787186  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||   |  |||    
T  28787185 tataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctga 28787086  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28787085 attctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagta 28786986  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28786985 ccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattgg 28786889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28793406 - 28793010
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |    
T  28793406 ccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttccttta 28793307  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||   ||||   |  |||    
T  28793306 tataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctga 28793207  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    | ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28793206 actctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagta 28793107  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28793106 ccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattgg 28793010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31285622 - 31285210
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31285622 gactctgcttccacggccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgattcatattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 31285523  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||   | ||||  || |||| | |||||||| |  || |||||||||||||    
T  31285522 catagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattgttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttca 31285423  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  31285422 agttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaataaaattatagattgctcttgcaagtgttgattt 31285323  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | ||| | |  | ||   || | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||    
T  31285322 acccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagcaatttcacttgttgtattcgaaacttaaatcca 31285223  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||| ||||    
T  31285222 acagggtaattgg 31285210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26624318 - 26623924
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||   |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26624318 ccgaaccaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaa 26624219  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||   | ||||  |  |||| | |||||||| |  || ||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  26624218 tgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctga 26624119  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |     
T  26624118 attctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatc 26624019  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtattt 440  Q
    ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  26624018 ccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtattt 26623924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26730295 - 26729901
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||   |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26730295 ccgaaccaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaa 26730196  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||   | ||||  |  |||| | |||||||| |  || ||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  26730195 tgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctga 26730096  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |     
T  26730095 attctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatc 26729996  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtattt 440  Q
    ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  26729995 ccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtattt 26729901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 27697705 - 27698117
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27697705 gactctgcttccaggaccaaaccaatcgagtcctccagccaaagcctgtagctgatccagtttgtcaacatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttcta 27697804  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    |||| |||   | | ||  |  |||| | |||||||| |  || |||||||||| ||    
T  27697805 catagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgttcca 27697904  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |||||| | |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  27697905 agttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaaccaaattatagattgctcttgcaagtgttgattt 27698004  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
     |||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | |||||||   ||||||||  || || | | ||||||||||||    
T  27698005 tcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaattgatttcactctttgtacttgagactgtaatcca 27698104  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    |||||||| ||||    
T  27698105 acagggtaattgg 27698117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Original strand, 27676739 - 27677146
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27676739 gactctgcttccaggaccaaaccaatcgagtcttccagccaaagcctctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcca 27676838  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaa-tttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttc 228  Q
      ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||| ||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | |||||||| ||||    
T  27676839 tgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaactta-atttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttc 27676937  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    | ||||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27676938 aagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgatt 27677037  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||    
T  27677038 ttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatcc 27677137  T
Q  429 aacagggta 437  Q
    |||||||||    
T  27677138 aacagggta 27677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28782148 - 28781752
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| |    
T  28782148 ccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttccttta 28782049  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || || | |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  |||    
T  28782048 tataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgcttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctga 28781949  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28781948 attctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaattaagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagta 28781849  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||  ||| | ||     |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28781848 ccataaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattgg 28781752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 26803490 - 26803102
Alignment:
Q  49 aaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatga 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |    
T  26803490 aaccaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataa 26803391  T
Q  149 ttgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaatt 248  Q
    ||| ||| ||||||| ||||    |||||||    ||||||  |  |||| ||| ||| || |  || ||||||||||||| |||||| |||  ||||||    
T  26803390 ttggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaatt 26803291  T
Q  249 ctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 348  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  26803290 ctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatccca 26803191  T
Q  349 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 437  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| ||||||||| || || ||| || || ||||||||||||||    
T  26803190 taaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggta 26803102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Original strand, 27426731 - 27427138
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27426731 gactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 27426830  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttc 228  Q
     | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | |||||    
T  27426831 cacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttc 27426929  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    | | ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  27426930 aagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatt 27427029  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    ||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27427030 tacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatcc 27427129  T
Q  429 aacagggta 437  Q
    |||||||||    
T  27427130 aacagggta 27427138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27680013 - 27679606
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27680013 gactctgcttccacatccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgcttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 27679914  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    ||||||||   | |||      |||| |||||||||| |  || ||||||| |||||    
T  27679913 cataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttgtttttaaaaggagcttctcttggagatatttca 27679814  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||    
T  27679813 agttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaacaaaattatagatttgtcttgcaagtgttgattt 27679714  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
     ||||  |||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || || |||   ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  27679713 ccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatcca 27679614  T
Q  430 acagggta 437  Q
    ||||||||    
T  27679613 acagggta 27679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 430
Target Start/End: Original strand, 27603842 - 27604223
Alignment:
Q  49 aaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatga 148  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |   || |||||||| ||      
T  27603842 aaccaatcaggttctcctgccaaagcctgtagttgccccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatat 27603941  T
Q  149 ttgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaat 247  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  |||||    
T  27603942 gagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaat 27604040  T
Q  248 tctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacc 347  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27604041 tctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtacc 27604140  T
Q  348 ataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||  |||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  27604141 ataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagagatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaa 27604223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 437
Target Start/End: Original strand, 27705586 - 27705930
Alignment:
Q  93 gtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattta 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || ||| ||||||| ||||    |||||||    ||| ||  |    
T  27705586 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatcca 27705685  T
Q  193 actgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcag 292  Q
      |||| ||| ||| || |  || ||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27705686 gttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcag 27705785  T
Q  293 caacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaag 392  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   |||||    
T  27705786 caacaaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaag 27705885  T
Q  393 aagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 437  Q
    |||  |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27705886 aagtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27705930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26824882 - 26824470
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  26824882 gactctgctgccattaccgaaccaatcaaatcctccagccaaagcatctagttgctccagtttgtcaatgtcatcgagaatcagaagaactttctttctg 26824783  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
      |||||| || || ||||||  ||| || | |||||||||||||||||||   |    |  || |||| |||||||||| |  || ||||||| || ||    
T  26824782 cgtagtctatcttttatgatttgaataccttgactaacacctcctaacttaatttcttctccaattgtttttaaaaggagttgctcttggagattttcca 26824683  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
     |  ||  | |  |||||||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  26824682 agccatgcttagctgaattctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgattt 26824583  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    ||| |  |||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |  | ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26824582 acctaaacctccaataccgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatcca 26824483  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    || ||||||||||    
T  26824482 accgggtatttgg 26824470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 391 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511589
Alignment:
Q  391 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttgg 25511589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  250 tctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 325
Target Start/End: Original strand, 28097775 - 28097857
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28097775 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26937866 - 26937790
Alignment:
Q  256 acattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacc 332  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26937866 acattatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28326540 - 28326444
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttc 127  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28326540 actctactgccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttc 28326444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28504176 - 28504080
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttc 127  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28504176 actctactgccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttc 28504080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 29477185 - 29477258
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatc 104  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  29477185 actctgctaccaggaccaaaccaatcaagtcctccagccaaagcctccatttgctctagtctgtccacatcatc 29477258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  279 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 344  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28243626 - 28243538
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 350  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28243626 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28243538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28182171 - 28182084
Alignment:
Q  40 ccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttc 127  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28182171 ccaggaccaaaccaatcaattcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatctagaatcaatagaaccttctttc 28182084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28227783 - 28227720
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28227783 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28227720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28235396 - 28235333
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28235396 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttg 28235333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Original strand, 28297072 - 28297179
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 342  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| || |   |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||    
T  28297072 tgaattttcccttacattgtgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccatccctcca 28297171  T
Q  343 gtaccata 350  Q
    || |||||    
T  28297172 gtcccata 28297179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28515001 - 28514894
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 342  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| || |   |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||    
T  28515001 tgaattttcccttacattgtgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccatccctcca 28514902  T
Q  343 gtaccata 350  Q
    || |||||    
T  28514901 gtcccata 28514894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26724419 - 26724349
Alignment:
Q  242 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgct 312  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26724419 ttgaattttctctcacattgtgaaggaaacacaacccttcaaattgatcagcaatcaaatcataaactgct 26724349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26950593 - 26950511
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  26950593 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2185870 - 2185738
Alignment:
Q  49 aaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctt-tctagatagtctttccttaatg 147  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | | | |||||||||||| |||    
T  2185870 aaccaattaagatctccagccaaagccttcagctggtctggttggtcaacatcatcaagaatcaacaaaaccttcttctgttg-tagtctttcctttatg 2185772  T
Q  148 attgaaattccctcactaacacctcctaacttat 181  Q
    | |  |||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  2185771 aattgaattccctcactgacatgtcctagcttat 2185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26975765 - 26975700
Alignment:
Q  279 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 344  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  26975765 ttcaaattgattagcaatcaaattataaactgcttgagcaagtgttgtcttacccattcccccagt 26975700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 126
Target Start/End: Original strand, 28490718 - 28490771
Alignment:
Q  73 gcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttt 126  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28490718 gcctctaattgctccaaattgtcaacatcatctagaagcaaaagaatcttcttt 28490771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 126
Target Start/End: Original strand, 29803128 - 29803181
Alignment:
Q  73 gcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttt 126  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29803128 gcctctaattgctccaaattgtcaacatcatctagaagcaaaagaatcttcttt 29803181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 29843338 - 29843410
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccca 334  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  29843338 tgaagaaaacacaaacattcaaatttatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccca 29843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 28126794 - 28127206
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28126794 gactttgcttccacgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctg 28126893  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  28126894 catagcctttgttttatgattgcaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaactgttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttca 28126993  T
Q  230 ggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattt 329  Q
      ||||   || ||||| ||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28126994 aattatatggagttgaaatctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 28127093  T
Q  330 acccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcca 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||||| |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  28127094 acccaagcctccaataccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatcca 28127193  T
Q  430 acagggtatttgg 442  Q
    ||||| |||||||    
T  28127194 acaggatatttgg 28127206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 440
Target Start/End: Original strand, 28163499 - 28163904
Alignment:
Q  34 ctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagata 133  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||    
T  28163499 ctgcttccacgaccgaaccaatcgagtcctccagccaaagcctccagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgta 28163598  T
Q  134 gtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggtt 233  Q
    | ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28163599 gcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaactgtt-tcaaaaagagctcttcctggagatgtttcaagtt 28163697  T
Q  234 attatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 333  Q
         || ||||||||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28163698 ggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttaccc 28163797  T
Q  334 atgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacag 433  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || ||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  28163798 aagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacag 28163897  T
Q  434 ggtattt 440  Q
    | |||||    
T  28163898 gatattt 28163904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 267459 - 267871
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  || |  |  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  267459 gactctgcttccatagccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgcaattgttttatatcgttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 267558  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca 229  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||   | ||||  |  |||| |||||||||| |  || |||||||||||||    
T  267559 catagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagttgtttttaaaaggagcttctcttggagatgtttca 267658  T
Q  230 ggtta-ttatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
     |||| ||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  267659 agttacttatagct-gaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaataaaattatagattgctcttgcaagggttgatt 267757  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||| || | | |||  ||||||    
T  267758 tacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagcaatttcacttgttgtacttgagaccataatcc 267857  T
Q  429 aacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||| ||||    
T  267858 aacagggtaattgg 267871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 18698516 - 18698927
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctag 130  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18698516 actctgcttccacagccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtat 18698615  T
Q  131 atagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcag 230  Q
      || |||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |   | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  18698616 gcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaa 18698715  T
Q  231 gttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattta 330  Q
     | |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18698716 ttgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgattta 18698815  T
Q  331 cccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||  | |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  18698816 cccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagcgctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaa 18698915  T
Q  431 cagggtatttgg 442  Q
    ||||||| ||||    
T  18698916 cagggtaattgg 18698927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 18678676 - 18679087
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctag 130  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  || || ||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18678676 actctgcttccacaaccgaaccaatcacgtcctccggccaaagcatgcagttgttccaaattgtgcacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtat 18678775  T
Q  131 atagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcag 230  Q
     ||| |||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  18678776 gtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaa 18678875  T
Q  231 gttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattta 330  Q
     | |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18678876 ttgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttaattta 18678975  T
Q  331 cccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  18678976 cccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaa 18679075  T
Q  431 cagggtatttgg 442  Q
    ||||||| ||||    
T  18679076 cagggtaattgg 18679087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 437
Target Start/End: Original strand, 18730635 - 18731026
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |    
T  18730635 ccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttccttta 18730734  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |   | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  | |||   |  |||    
T  18730735 tatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctga 18730834  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18730835 attctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaata 18730934  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18730935 ccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18731026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Original strand, 18654593 - 18654999
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctag 130  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18654593 actctgcttccacaaccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagtggttccaaattgtccacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtat 18654692  T
Q  131 atagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcag 230  Q
     ||| |||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  18654693 gtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaa 18654792  T
Q  231 gttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattta 330  Q
     | |||   |  |||||| ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||     
T  18654793 ttgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaatacaattattaattgattttgcaagtgttgatttt 18654892  T
Q  331 cccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| ||  | ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||    
T  18654893 cccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaa 18654992  T
Q  431 cagggta 437  Q
    |||||||    
T  18654993 cagggta 18654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18074824 - 18074417
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18074824 gactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 18074725  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttc 228  Q
     | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | |||||    
T  18074724 cacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttc 18074626  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    | | ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  18074625 aagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatt 18074526  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    ||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  18074525 tacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatcc 18074426  T
Q  429 aacagggta 437  Q
    |||||||||    
T  18074425 aacagggta 18074417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Original strand, 18723201 - 18723607
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctag 130  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |  || || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18723201 actctgcttccagagccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgcagttgtttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtat 18723300  T
Q  131 atagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcag 230  Q
     ||| |||| ||| ||    | ||||| |||||||||||||||||| |||   |||| |  || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  18723301 gtagccttttctttatataaggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaa 18723400  T
Q  231 gttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgattta 330  Q
     | |||   |  |||||||||||| || || | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  18723401 ttgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattccttttgcaagtgttgatttt 18723500  T
Q  331 cccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaa 430  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||    
T  18723501 cccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaa 18723600  T
Q  431 cagggta 437  Q
    |||||||    
T  18723601 cagggta 18723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Original strand, 5090069 - 5090203
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||| || |||| |||||| ||| ||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  5090069 gactctgctgccaagaccaaaccaatcaggttctccggccaaaacctgtagttgtttcagtttgtcaatatcatcgagaatcaaaagaactttctttctt 5090168  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcact 164  Q
      ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5090169 tgtagccttttctttatgattggaattccctcact 5090203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 350
Target Start/End: Original strand, 5090284 - 5090392
Alignment:
Q  242 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcc 341  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5090284 ttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctcc 5090383  T
Q  342 agtaccata 350  Q
    ||| |||||    
T  5090384 agtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8534 - 8138
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| |    
T  8534 ccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttccttta 8435  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||| ||||||||||   |||  || || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  |||    
T  8434 tataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctga 8335  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8334 attctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagta 8235  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8234 ccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattgg 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Original strand, 12810 - 13206
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| |    
T  12810 ccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttccttta 12909  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    |    | ||||||||||||||||| ||||||||||   |||  || || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  |||    
T  12910 tataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctga 13009  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13010 attctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagta 13109  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13110 ccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattgg 13206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 442
Target Start/End: Original strand, 3850 - 4243
Alignment:
Q  49 aaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatga 148  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |   || |||||||| ||      
T  3850 aaccaatcaggttctcctgccaaagcctgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatat 3949  T
Q  149 ttgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaat 247  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  |||||    
T  3950 gagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaat 4048  T
Q  248 tctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacc 347  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4049 tctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtacc 4148  T
Q  348 ataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    |||||||||||||||| || |  |||  ||||| ||    ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4149 ataaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattgg 4243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Original strand, 2674 - 3070
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |    
T  2674 ccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttccttta 2773  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttg 244  Q
    |    | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||  |||||   |  ||    
T  2774 tataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctg 2872  T
Q  245 aattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 344  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2873 aattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagt 2972  T
Q  345 accataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||| ||||    
T  2973 accataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattgg 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 60632 - 60225
Alignment:
Q  30 gactctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttcta 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60632 gactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttcta 60533  T
Q  130 gatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttc 228  Q
     | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | |||||    
T  60532 cacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttc 60434  T
Q  229 aggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatt 328  Q
    | | ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  60433 aagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatt 60334  T
Q  329 tacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatcc 428  Q
    ||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  60333 tacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatcc 60234  T
Q  429 aacagggta 437  Q
    |||||||||    
T  60233 aacagggta 60225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 442
Target Start/End: Original strand, 29272973 - 29273369
Alignment:
Q  46 ccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| |    
T  29272973 ccgaaccaatcatgtcctccagccaaagcatgtagttgcttcaaattatcaacatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctccttta 29273072  T
Q  146 tgattgaaattccctcactaacacctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttga 245  Q
    | |||| ||| ||||||||||||    ||||||||   | ||||  |  |||| |||||||||| |  || ||||||||||||| |||||| | |  |||    
T  29273073 taattggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatccagttgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctga 29273172  T
Q  246 attctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 345  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| |     
T  29273173 attctctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaaaaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatc 29273272  T
Q  346 ccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 442  Q
    ||||||| ||| |||||  ||| | |||| ||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29273273 ccataaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaagaagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttgg 29273369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35984361 - 35984274
Alignment:
Q  31 actctgcttccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaa 118  Q
    |||||||| |||| ||| | ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35984361 actctgctgccagaaccaagccaatcaaaccctccaaccaaggcctctagctgttctattttgtcaacatcatctagaatcaaaagaa 35984274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3280509 - 3280410
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 342  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  3280509 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 348
Target Start/End: Original strand, 17992547 - 17992652
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 342  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||   || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| || |||    
T  17992547 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacacttacattgaaattgattagcaaccaaattataaactgcttgagcaagagttgtcttgcccattccacca 17992646  T
Q  343 gtacca 348  Q
    ||||||    
T  17992647 gtacca 17992652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16691717 - 16691618
Alignment:
Q  243 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||||    
T  16691717 tgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43788 - 43700
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 350  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  43788 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28281 - 28218
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28281 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35558 - 35495
Alignment:
Q  262 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 325  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35558 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttg 35495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 57423 - 57510
Alignment:
Q  40 ccagtaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttc 127  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| | || ||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  57423 ccaggaccaaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgtaattgcttcagctcgtgaacatcatcgagaatcaacaaaaccttctttc 57510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Original strand, 3468258 - 3468329
Alignment:
Q  45 accgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || || |  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3468258 accgaaccaatcacgtcctccggctaatgcttgaatctgttccaatttgtcaacatcatcaagaatcaaaag 3468329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 484 times since January 2019
Visitors: 3478