View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0486_low_27 (Length: 338)

Name: NF0486_low_27
Description: NF0486
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0486_low_27
NF0486_low_27
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (29-330)||(29433511-29433812)
chr8 (29-329)||(19247584-19247884)
chr8 (29-329)||(19320768-19321068)
chr8 (29-330)||(45293791-45294092)
chr8 (29-330)||(41907330-41907630)
chr8 (29-330)||(23626558-23626859)
chr8 (29-330)||(39204103-39204404)
chr8 (29-330)||(41156111-41156412)
chr8 (29-330)||(12250413-12250709)
chr8 (29-330)||(39444498-39444794)
chr8 (29-330)||(41976931-41977232)
chr8 (60-330)||(23966734-23967004)
chr8 (60-330)||(6300831-6301101)
chr8 (60-330)||(44939945-44940215)
chr8 (29-330)||(14079044-14079345)
chr8 (60-330)||(37029341-37029611)
chr8 (29-330)||(33424472-33424773)
chr8 (29-330)||(12759948-12760248)
chr8 (29-330)||(41628363-41628664)
chr8 (29-330)||(30825923-30826224)
chr8 (60-330)||(42061008-42061278)
chr8 (29-330)||(42811150-42811450)
chr8 (72-330)||(22333335-22333593)
chr8 (29-330)||(6477707-6478007)
chr8 (29-330)||(38961647-38961942)
chr8 (29-330)||(38991991-38992286)
chr8 (93-330)||(19395777-19396014)
chr8 (178-330)||(22947016-22947168)
chr8 (145-330)||(23522856-23523041)
chr8 (30-172)||(44383312-44383454)
chr8 (33-98)||(36597985-36598050)
chr8 (29-70)||(22342286-22342327)
chr8 (32-80)||(20663408-20663456)
chr8 (32-80)||(30548771-30548819)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (29-330)||(3839612-3839913)
chr4 (29-330)||(1944238-1944540)
chr4 (31-330)||(35707869-35708168)
chr4 (29-330)||(47720310-47720611)
chr4 (29-330)||(40621895-40622195)
chr4 (60-330)||(740651-740921)
chr4 (29-330)||(26870530-26870826)
chr4 (31-330)||(574388-574686)
chr4 (60-330)||(15520494-15520764)
chr4 (29-330)||(33503239-33503540)
chr4 (29-330)||(54331884-54332185)
chr4 (29-330)||(17739787-17740088)
chr4 (32-330)||(55998938-55999236)
chr4 (29-330)||(34056804-34057105)
chr4 (31-330)||(37701840-37702139)
chr4 (29-330)||(14829752-14830053)
chr4 (29-330)||(39742987-39743288)
chr4 (32-330)||(38007594-38007892)
chr4 (29-330)||(23478657-23478958)
chr4 (29-329)||(19831639-19831939)
chr4 (29-330)||(17698923-17699224)
chr4 (29-330)||(36856835-36857136)
chr4 (29-330)||(13627799-13628100)
chr4 (33-330)||(35495784-35496081)
chr4 (101-330)||(41984474-41984703)
chr4 (29-329)||(28135308-28135608)
chr4 (29-330)||(53342157-53342457)
chr4 (29-330)||(7644033-7644326)
chr4 (70-330)||(8530618-8530864)
chr4 (29-330)||(5272516-5272797)
chr4 (145-330)||(2776155-2776340)
chr4 (145-330)||(22116281-22116466)
chr4 (145-330)||(21352961-21353147)
chr4 (246-330)||(47557666-47557750)
chr4 (29-76)||(19590582-19590629)
chr4 (277-330)||(53991488-53991541)
chr4 (32-80)||(10259814-10259862)
chr4 (32-80)||(21564593-21564641)
chr4 (32-80)||(24077883-24077931)
chr4 (32-80)||(43332114-43332162)
chr4 (32-80)||(51452181-51452229)
chr4 (32-80)||(26924753-26924801)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (29-330)||(17037032-17037333)
chr2 (29-330)||(17091540-17091841)
chr2 (29-330)||(17025355-17025656)
chr2 (29-330)||(4811312-4811612)
chr2 (29-330)||(16883687-16883988)
chr2 (29-330)||(17041377-17041678)
chr2 (31-330)||(9916917-9917216)
chr2 (29-330)||(1515218-1515519)
chr2 (49-330)||(10821432-10821713)
chr2 (78-330)||(28380231-28380483)
chr2 (29-330)||(26821383-26821684)
chr2 (29-330)||(45205246-45205547)
chr2 (60-330)||(1993283-1993553)
chr2 (60-330)||(28501945-28502215)
chr2 (29-330)||(18092950-18093242)
chr2 (60-330)||(6343071-6343341)
chr2 (60-330)||(14323555-14323825)
chr2 (78-330)||(45398554-45398806)
chr2 (60-330)||(14752976-14753246)
chr2 (29-330)||(33664023-33664324)
chr2 (33-330)||(36633314-36633611)
chr2 (29-330)||(16724577-16724878)
chr2 (29-330)||(19167871-19168172)
chr2 (29-330)||(21097462-21097763)
chr2 (29-330)||(30567093-30567394)
chr2 (29-330)||(30570778-30571079)
chr2 (29-329)||(42885154-42885454)
chr2 (148-330)||(35286568-35286750)
chr2 (29-147)||(11448129-11448247)
chr2 (32-80)||(3710661-3710709)
chr2 (32-80)||(11866707-11866755)
chr2 (32-80)||(35358100-35358148)
chr2 (29-57)||(10822427-10822455)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (29-330)||(30223-30524)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (29-330)||(9226451-9226752)
chr7 (29-330)||(27735279-27735580)
chr7 (29-330)||(42245086-42245387)
chr7 (29-330)||(9149093-9149394)
chr7 (29-330)||(38434780-38435081)
chr7 (29-330)||(33638905-33639206)
chr7 (31-330)||(3795244-3795543)
chr7 (29-330)||(47163783-47164083)
chr7 (37-330)||(47174216-47174508)
chr7 (29-330)||(42996185-42996481)
chr7 (60-330)||(47573683-47573953)
chr7 (29-324)||(23299956-23300251)
chr7 (29-330)||(17477621-17477922)
chr7 (29-330)||(17575292-17575593)
chr7 (29-330)||(23766669-23766970)
chr7 (29-330)||(33030528-33030829)
chr7 (60-330)||(6911705-6911975)
chr7 (29-330)||(17482068-17482369)
chr7 (29-330)||(17570845-17571146)
chr7 (29-330)||(42687284-42687585)
chr7 (79-330)||(42827605-42827856)
chr7 (32-330)||(8926121-8926419)
chr7 (29-310)||(14308662-14308943)
chr7 (29-330)||(5962431-5962729)
chr7 (163-330)||(4481617-4481784)
chr7 (29-194)||(19520898-19521063)
chr7 (29-147)||(42917582-42917700)
chr7 (211-330)||(42917708-42917827)
chr7 (145-330)||(17469594-17469780)
chr7 (145-330)||(17583434-17583620)
chr7 (157-330)||(11499718-11499891)
chr7 (253-330)||(19521082-19521159)
chr7 (32-80)||(19034136-19034184)
chr7 (32-80)||(20720452-20720500)
chr7 (32-80)||(29490692-29490740)
chr7 (32-80)||(34282585-34282633)
chr7 (32-80)||(33230442-33230490)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (29-330)||(55295005-55295306)
chr3 (29-330)||(48521248-48521549)
chr3 (29-330)||(8242427-8242728)
chr3 (29-330)||(40827261-40827562)
chr3 (29-330)||(54793191-54793492)
chr3 (31-330)||(22477437-22477736)
chr3 (32-330)||(16495621-16495918)
chr3 (29-330)||(51248088-51248389)
chr3 (29-330)||(31369243-31369544)
chr3 (31-330)||(11951201-11951500)
chr3 (60-330)||(5252600-5252870)
chr3 (29-330)||(54512508-54512806)
chr3 (29-330)||(11598190-11598491)
chr3 (29-330)||(52840759-52841060)
chr3 (29-329)||(23193189-23193489)
chr3 (78-329)||(32755262-32755513)
chr3 (60-330)||(39796699-39796969)
chr3 (29-330)||(35088064-35088365)
chr3 (29-330)||(50771473-50771774)
chr3 (79-330)||(36165237-36165488)
chr3 (29-330)||(50741080-50741381)
chr3 (29-330)||(48976412-48976712)
chr3 (29-330)||(6104352-6104653)
chr3 (29-330)||(49112802-49113094)
chr3 (32-296)||(2845117-2845381)
chr3 (29-330)||(52853668-52853969)
chr3 (29-330)||(21699799-21700097)
chr3 (29-314)||(11325886-11326169)
chr3 (101-330)||(52463158-52463387)
chr3 (29-228)||(19893699-19893896)
chr3 (68-180)||(35436662-35436774)
chr3 (187-324)||(11383004-11383140)
chr3 (29-121)||(11382896-11382988)
chr3 (231-330)||(35436768-35436867)
chr3 (40-235)||(23936884-23937078)
chr3 (29-76)||(36167933-36167978)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (29-330)||(15314986-15315287)
chr1 (29-330)||(51965946-51966247)
chr1 (29-330)||(52309570-52309871)
chr1 (29-330)||(12714213-12714514)
chr1 (31-330)||(10763120-10763419)
chr1 (32-330)||(13662619-13662916)
chr1 (60-330)||(18111353-18111623)
chr1 (60-330)||(43254898-43255168)
chr1 (60-330)||(50395312-50395582)
chr1 (29-330)||(34687323-34687624)
chr1 (31-329)||(42682128-42682422)
chr1 (31-330)||(29840900-29841199)
chr1 (29-330)||(18813955-18814256)
chr1 (29-326)||(28565936-28566233)
chr1 (78-330)||(16031818-16032070)
chr1 (29-330)||(31619425-31619726)
chr1 (29-330)||(48340065-48340366)
chr1 (41-330)||(50560790-50561079)
chr1 (78-330)||(17671092-17671343)
chr1 (29-330)||(34691851-34692152)
chr1 (78-330)||(36681029-36681281)
chr1 (29-330)||(41830262-41830563)
chr1 (29-330)||(52521781-52522082)
chr1 (78-330)||(45004518-45004770)
chr1 (29-330)||(41963143-41963444)
chr1 (29-284)||(38845483-38845738)
chr1 (148-330)||(12246054-12246236)
chr1 (158-330)||(24294394-24294566)
chr1 (145-330)||(44406227-44406412)
chr1 (234-330)||(39760363-39760459)
chr1 (254-330)||(47135361-47135437)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (29-330)||(9701946-9702247)
chr5 (31-329)||(12588505-12588803)
chr5 (29-330)||(3210424-3210723)
chr5 (31-330)||(21029804-21030103)
chr5 (60-330)||(31295898-31296168)
chr5 (29-330)||(1852154-1852455)
chr5 (29-330)||(3397362-3397663)
chr5 (33-330)||(20996168-20996465)
chr5 (60-330)||(19395081-19395351)
chr5 (29-330)||(2194859-2195160)
chr5 (29-330)||(3150828-3151129)
chr5 (29-330)||(7285371-7285672)
chr5 (41-330)||(10513325-10513614)
chr5 (29-330)||(20349617-20349918)
chr5 (30-330)||(19447698-19447998)
chr5 (76-330)||(41780569-41780823)
chr5 (29-330)||(4881967-4882267)
chr5 (29-330)||(33611364-33611665)
chr5 (29-330)||(26321299-26321600)
chr5 (29-330)||(30689003-30689304)
chr5 (148-330)||(33929607-33929789)
chr5 (52-330)||(3028468-3028749)
chr5 (37-275)||(27065602-27065838)
chr5 (29-180)||(290302-290453)
chr5 (145-330)||(38934287-38934472)
chr5 (145-330)||(17996390-17996575)
chr5 (145-330)||(20757771-20757956)
chr5 (81-184)||(287344-287447)
chr5 (231-330)||(290447-290546)
chr5 (246-330)||(33707003-33707087)
chr5 (32-80)||(37464081-37464129)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (29-330)||(64860-65162)
scaffold0006 (29-330)||(152381-152681)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (29-330)||(14831197-14831498)
chr6 (29-330)||(33321687-33321988)
chr6 (33-330)||(34320808-34321105)
chr6 (60-330)||(13457078-13457348)
chr6 (29-330)||(1073497-1073798)
chr6 (29-330)||(18599220-18599521)
chr6 (29-330)||(34855667-34855968)
chr6 (29-330)||(14888171-14888472)
chr6 (29-330)||(15275370-15275671)
chr6 (31-330)||(17939236-17939535)
chr6 (29-330)||(22374075-22374376)
chr6 (29-330)||(11934914-11935215)
chr6 (29-330)||(4424199-4424499)
chr6 (29-330)||(2520875-2521177)
chr6 (29-266)||(1931745-1931975)
chr6 (78-251)||(28228824-28228997)
chr6 (187-330)||(25539943-25540086)
chr6 (145-330)||(18311635-18311819)
chr6 (145-330)||(35040936-35041121)
chr6 (214-329)||(4425404-4425519)
chr6 (29-148)||(7219280-7219399)
chr6 (29-98)||(7222456-7222525)
chr6 (32-80)||(249627-249675)
chr6 (32-80)||(12580280-12580328)
chr6 (29-76)||(33978674-33978721)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (29-330)||(13157-13458)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (29-329)||(119768-120068)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (29-330)||(1067-1363)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (29-276)||(49779-50024)
scaffold0051 (272-330)||(61267-61325)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (29-330)||(26586-26887)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-330)||(9656-9957)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (29-330)||(146-447)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (149-330)||(4405-4586)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (78-251)||(29322-29495)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (172-330)||(10836-10994)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (174-330)||(53194-53345)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (210-330)||(100509-100629)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (39-178)||(12436-12575)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 29433511 - 29433812
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29433511 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcgagctatgaaaaatacttgggtgggcaatgg 29433610  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29433611 ttcaatttctgcagagaacgtgtaatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaagtcaccgaagaatttccacgttcgagttgttccaaagt 29433710  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29433711 agatctttgctgctgaactatttaaacttctactattttggcgtatcgctttcgactgtaatcataaattatcttgactttgggatgccatttgttcttt 29433810  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  29433811 tc 29433812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 19247584 - 19247884
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19247584 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattactgccgaaatagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatga 19247683  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  19247684 ttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagt 19247783  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19247784 agatctttgctgctgaattatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 19247883  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  19247884 t 19247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 19320768 - 19321068
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19320768 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattactgccgaaatagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatga 19320867  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  19320868 ttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagt 19320967  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19320968 agatctttgctgctgaattatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 19321067  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  19321068 t 19321068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45294092 - 45293791
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  45294092 aacaatcactctcattgatgatcagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtga 45293993  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  45293992 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatagaagaaagtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcactaaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 45293893  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45293892 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 45293793  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  45293792 tc 45293791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 41907330 - 41907630
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  41907330 aacattcactctcattgatgacgagacacagacaaagtataattgtcgcctcattactgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtagtgg 41907429  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41907430 ttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 41907529  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41907530 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatc-tgactttgggatgccatttgttcttt 41907628  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41907629 tc 41907630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23626859 - 23626558
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||     
T  23626859 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggaagggcagtgg 23626760  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23626759 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatagaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 23626660  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23626659 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatggctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 23626560  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  23626559 tc 23626558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 39204103 - 39204404
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  39204103 aacaataactctcattgatgaccaaacacagagaaagtataagtgtcgcctcattgccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 39204202  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  39204203 ttcaatttctgtagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttgcaaaat 39204302  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39204303 agatctttgttgctaaactatttgaacttctattattttggcgcatcgccttggactgtaatcgtaatctatcttgactttgggatgccatttgttcttt 39204402  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  39204403 tc 39204404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 41156111 - 41156412
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  41156111 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 41156210  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
     |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41156211 ctcaatttctgtaaagaacgtgtgttgaaagaaggtggtaagctcatttttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 41156310  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41156311 agatctatgttgctgaaatatttgaacttctactattttgacgcatcgttttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 41156410  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41156411 tc 41156412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12250709 - 12250413
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  12250709 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 12250610  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| |    
T  12250609 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaat 12250515  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12250514 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 12250415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 39444498 - 39444794
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  39444498 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 39444597  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| |    
T  39444598 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaat 39444692  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39444693 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 39444792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 41976931 - 41977232
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||     
T  41976931 aacaatcgctctcattgatgaccagatacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagataaagttatgaaaaatacctgggtgggtagtgg 41977030  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  41977031 ttcaatttctgcaaaggacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagt 41977130  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  41977131 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgtgacgccatttgttcttt 41977230  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41977231 tc 41977232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23967004 - 23966734
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23967004 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 23966905  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  23966904 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 23966805  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23966804 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 23966734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6301101 - 6300831
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6301101 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 6301002  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  6301001 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 6300902  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6300901 actattttgacgtatcgctttggtctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 6300831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 44939945 - 44940215
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  44939945 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctacagagaacgtgtgatgatag 44940044  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  44940045 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 44940144  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44940145 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 44940215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14079345 - 14079044
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  14079345 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 14079246  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  14079245 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 14079146  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14079145 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 14079046  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  14079045 tc 14079044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 37029341 - 37029611
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37029341 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 37029440  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  37029441 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttct 37029540  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37029541 actattttgacgtatcgttttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 37029611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33424773 - 33424472
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  33424773 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatatcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcggtga 33424674  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33424673 ttcaatttctacagataacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 33424574  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33424573 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 33424474  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33424473 tc 33424472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 12759948 - 12760248
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  | ||     
T  12759948 aacaatcactctcattgatgaccagacacggagaaaatataagtaccgcctcattacggccgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggcggc-agtgg 12760046  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  12760047 ttcaatttctgcaaagaacctgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagt 12760146  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12760147 agatctttgttgctgaactatttgaacttatactattttgacgcattgttttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccgtttgttcttt 12760246  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  12760247 tc 12760248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 41628363 - 41628664
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  41628363 aacaatcactctcattgatgaccagacagagagacggtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtgg 41628462  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  41628463 ttcaatttctgcagattacgagagatggaagaaggtggtaagctcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 41628562  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |  | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41628563 agatctttgttattgaactatttgaacttttactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttt 41628662  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41628663 tc 41628664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 30825923 - 30826224
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||     
T  30825923 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataactgtcatttcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtgg 30826022  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  30826023 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 30826122  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  30826123 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttattt 30826222  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  30826223 tc 30826224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42061278 - 42061008
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||   ||||||||||||||||||  ||    
T  42061278 agaaagtataagtgtcgcctcattatcgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaataaatgcagagaacgtgtgatgatag 42061179  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  42061178 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttct 42061079  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42061078 aataaattgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 42061008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42811450 - 42811150
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||     
T  42811450 aacaatcactctcattgatgaccatacacagagacaatataattgtcacctcattatcgccgttagagcaagctatgaaaattacttgcgtgggcagtgg 42811351  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  42811350 ttcaatttc-gcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatatcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagt 42811252  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  42811251 agatctttgttgttgaattatttgaacttctactattttgacgtatcactttggattgtagtcgtaaactatcttcactttgggatgtcatttgttcttt 42811152  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  42811151 tc 42811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22333593 - 22333335
Alignment:
Q  72 tgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagc 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22333593 tgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaaaaaggtggtaaac 22333494  T
Q  172 ttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcg 271  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||| | |||| || | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  22333493 tcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagttatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacg 22333394  T
Q  272 tatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22333393 tatcactttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 22333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6478007 - 6477707
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||| || |||| |||| | ||     
T  6478007 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagcataactgtcatctcattaccaccgataaagcaagctatgaaaattatttggatgggcagtgg 6477908  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||| ||||  || | |||    
T  6477907 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaaaaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcaagtt-atctatagt 6477809  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6477808 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttt 6477709  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  6477708 tc 6477707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 38961647 - 38961942
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||     
T  38961647 aacaatcactctcattgatgaccagacagagagacagtataactgtcaccttattaccgttgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtgg 38961746  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||  ||| | || ||  ||||||||||||||||||    
T  38961747 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagt 38961846  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||      | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38961847 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 38961940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 38991991 - 38992286
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||     
T  38991991 aacaatcactctcattgatgaccagacagagagacagtataactgtcaccttattaccgttgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtgg 38992090  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||  ||| | || ||  ||||||||||||||||||    
T  38992091 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagt 38992190  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||      | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38992191 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 38992284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19396014 - 19395777
Alignment:
Q  93 agagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagt 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19396014 agagcaagctatgaaaatttctttggtggggagtggttcaatttctacaaataacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagt 19395915  T
Q  193 caccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatca 292  Q
    ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||     
T  19395914 cacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttaaacttctaccattttgacgcatcgctttggactgtagtcg 19395815  T
Q  293 taaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  19395814 taaactatcttaactttgggatatcatttgttcttttc 19395777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22947168 - 22947016
Alignment:
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22947168 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatctactattttgacgtatcgc 22947069  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  22947068 tttgcactgtaatcgtaaactatattgactttgggaagccatttgttcttttc 22947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23523041 - 23522856
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| || | |    
T  23523041 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttga 23522942  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23522941 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcaagactttgggatgtcatttgttcttttc 23522856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44383454 - 44383312
Alignment:
Q  30 acaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      | |    
T  44383454 acaatcactttcattgatgaccagacacagagaaaaaataagtgtcgcttcattaccgccgaaagagaaagatatgaaaaatacttgggtgaacgggggt 44383355  T
Q  130 tcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagct 172  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383354 tcaatttctgcaaaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagct 44383312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36598050 - 36597985
Alignment:
Q  33 atcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36598050 atcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagca 36597985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22342327 - 22342286
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataa 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22342327 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagatagtataa 22342286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20663456 - 20663408
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  20663456 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 20663408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30548819 - 30548771
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||    
T  30548819 aatcactctcattgatgaacaaacatggagaaagtataagtgtcgcctc 30548771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3839913 - 3839612
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  3839913 aacaatcactctcattgattatcagacacaaagaaagcataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 3839814  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  3839813 ttcaatttctgcagagagcgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaattcaccgaaaaacttccacgttcgagttgttccaaagt 3839714  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3839713 agatctttgctgctgaactatttaaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccatttgttcttt 3839614  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  3839613 tc 3839612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 1944238 - 1944540
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||     
T  1944238 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatactttggttggcagtgg 1944337  T
Q  129 ttcaattt-ctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaag 227  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||     
T  1944338 ttcaattttctgcagaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaa 1944437  T
Q  228 tagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1944438 tagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 1944537  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  1944538 ttc 1944540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35708168 - 35707869
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  35708168 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 35708069  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  35708068 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtatgctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 35707969  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35707968 atctttgctggtgaaatatttgaacttttactattttgacgcatcactttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 35707869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47720611 - 47720310
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||     
T  47720611 aacaatcactatcattgatgaccagacatagagaaaatataagtgtcgccccattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggatggacagtgg 47720512  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  47720511 ttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcatcaaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagt 47720412  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47720411 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttagcgtatcgctttggattgttatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 47720312  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  47720311 tc 47720310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 40621895 - 40622195
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||     
T  40621895 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagttatgaaaaatacttgggtggacagtgt 40621994  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40621995 ttcaatttctgcacagaacatgtgatggaagaaggtggtaa-ctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 40622093  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  40622094 agatctttgctgctgaactatttgaactttttctattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgagtttgggatgtcatttgttcttt 40622193  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  40622194 tc 40622195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 740921 - 740651
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  740921 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 740822  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  740821 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtaaatatttgctgctgaactatttgaacttct 740722  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  740721 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 740651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26870826 - 26870530
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  26870826 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 26870727  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||     ||| |    
T  26870726 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacattcgagtt-----aaaat 26870632  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26870631 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 26870532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 574686 - 574388
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  574686 caatcactctcattgatgaccagacatagagaaaatataagtgtcgtctcat-atcgccgaaatagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 574588  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  574587 caatttctgcaaagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 574488  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  574487 atctttgctggtgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatatcatttgttcttttc 574388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 15520494 - 15520764
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15520494 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 15520593  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  15520594 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttct 15520693  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15520694 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 15520764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33503540 - 33503239
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||     
T  33503540 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctacgaaaattacttgggtgggcagtgg 33503441  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33503440 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 33503341  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  33503340 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttt 33503241  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33503240 tc 33503239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 54332185 - 54331884
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  54332185 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 54332086  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  54332085 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 54331986  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54331985 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 54331886  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  54331885 tc 54331884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17739787 - 17740088
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||     
T  17739787 aacaatcactctcattgatgaccagatacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaagctatgaaaaatacttgg-tggatagtgg 17739885  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  17739886 ttcaatttctgcaaagaatgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctggaaaagtcaccgaagaacatgcatgttcgagttgttccaaagt 17739985  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttg-actttgggatgctatttgttctt 327  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  17739986 atatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatctctttggaatgtaatcgtaaactatcttgaatttttggatgccatttgttctt 17740085  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  17740086 ttc 17740088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 55999236 - 55998938
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||    
T  55999236 aatcactctcattgatgaccagacacagagacattataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttc 55999137  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  55999136 aatttctgcagataacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaga 55999037  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| || | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  55999036 tctttgttgttgaactatttcaacttctactagtttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaattatcttgactttgggatgtcatttgctcttttc 55998938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34057105 - 34056804
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  34057105 aacaatcactctcattgataaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 34057006  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  34057005 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 34056906  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34056905 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 34056806  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  34056805 tc 34056804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37702139 - 37701840
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||    
T  37702139 caatcactctcattaatgaccagacatagagacaatataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtggtt 37702040  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  37702039 caatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtag 37701940  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37701939 atctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtattgctttggactgtagccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 37701840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14830053 - 14829752
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  14830053 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataattgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 14829954  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14829953 ttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagt 14829854  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14829853 agatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 14829754  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  14829753 tc 14829752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39743288 - 39742987
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||     
T  39743288 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagttatgaaaattacttaggtgggcagtgg 39743189  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||  ||||||||||||||    
T  39743188 ttcaatttctgcagataacgagtggtggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaatttaagttgttccaaagt 39743089  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39743088 agatctttgttgttgaactgtttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 39742989  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  39742988 tc 39742987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Original strand, 38007594 - 38007892
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  38007594 aatcactctcattgatgaccagatacagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttggatgggcagcgattc 38007693  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  38007694 aatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaga 38007793  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  38007794 tctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatctctctgtactgtagtcgtaaactatcttaacttagggatgtcatttgttcttttc 38007892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 23478657 - 23478958
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | ||     
T  23478657 aacaatcattctcattgatgaccagacacagagacagtataaatgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgagcagtgg 23478756  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  23478757 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 23478856  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  23478857 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgttcttt 23478956  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  23478957 tc 23478958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19831939 - 19831639
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  19831939 aacaatcactatcattgatgatcagacacagggacagtataattgtcacctcattaccgtcgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 19831840  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  19831839 ttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 19831740  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | ||||||| || | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19831739 aaatctttgttgttgaactatttgaacttcttctattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 19831640  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  19831639 t 19831639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17698923 - 17699224
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  17698923 aacaatcaatctcattgatgaccagacacagagaccgtataactgtcacctcattacggccgataaagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 17699022  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |  ||  ||||||||||||||||||    
T  17699023 ttcaatttctgcagataacgagtgatagaagaaggtagtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaactagcaaattcgagttgttccaaagt 17699122  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17699123 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 17699222  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17699223 tc 17699224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 36856835 - 36857136
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  36856835 aacaatcactctcattgatgacctgacacagagtcagtataactgccacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 36856934  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  36856935 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatatcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 36857034  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  36857035 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcactttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtactttgttcttt 36857134  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  36857135 tc 36857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 13627799 - 13628100
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||     
T  13627799 aacaatcactctcattaatgaccagacacagagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttaggtgggcggtgg 13627898  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||| ||    
T  13627899 ttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaggt 13627998  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  13627999 agatctttgttcttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttaagatgtcatttgttcttt 13628098  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  13628099 tc 13628100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35496081 - 35495784
Alignment:
Q  33 atcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattca 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  35496081 atcactctcattgatgactagacacagagacggtataactgtcacctcattaccgacgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtggttca 35495982  T
Q  133 atttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagat 232  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  35495981 atttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcaaaagtagat 35495882  T
Q  233 ctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||| || | || ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35495881 ctttgttgttgaactatttaaacatctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 35495784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41984703 - 41984474
Alignment:
Q  101 ctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  41984703 ctatgaaacatacttgggtgggcagtggttcaatttctgcagagaaagtgtgaaggaagaaggtagtaagctcatcattgatcttgaaaagtcaccgatg 41984604  T
Q  201 aattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattat 300  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41984603 aacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgctttggactgtaatcataaactat 41984504  T
Q  301 cttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41984503 cttgacttttggatgccatttgttcttttc 41984474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28135608 - 28135308
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||| | ||     
T  28135608 aacaatcactctcaatgatgaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccgtcgatagaacaagctatgaaagttacttaggtgggcagtgg 28135509  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  28135508 ttcaatttctgcatataacgagtgatggaagaagttggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttacaaattcgagttgttccaaagt 28135409  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  28135408 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtattgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtttttt 28135309  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  28135308 t 28135308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 53342157 - 53342457
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||     
T  53342157 aacaatcactctcattgatgaccatacacagagacagtataactgtcacctcattaccgacgatag--caagctaagaaaattacttgggtgggcagtgg 53342254  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  53342255 ttcaatttccgcagataacgagtgatggaagaaggaggtaagctcatctttgatctcgagaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 53342354  T
Q  229 agatctttg-ctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    |||||||||  |  | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53342355 agatctttgttttttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctt 53342454  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  53342455 ttc 53342457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7644326 - 7644033
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  7644326 aacagtcactctcattgatgatcagacacagagacagtataactgtcacttcattacctctgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 7644227  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||        ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7644226 tt--------gcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 7644135  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  7644134 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgcgatgtcatctgttcttt 7644035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 330
Target Start/End: Original strand, 8530618 - 8530864
Alignment:
Q  70 agtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaa 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8530618 agtgtcgcctcattaccgtcgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaagtggtaa 8530717  T
Q  170 gcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttgg 269  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||     
T  8530718 gttcatctttgatctcgaaaattcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgc--------------aacttctactattttga 8530803  T
Q  270 cgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8530804 cgcatcgctttggactgtaatcgtaaacaatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 8530864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5272797 - 5272516
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                 
T  5272797 aacaatcactctcatcgatgaccagacaca------gtataactgtcatcttattaccgccgatagagcaagctatgaaaattactt------------- 5272717  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
     |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  5272716 -tcaatttctgcagataacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 5272618  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5272617 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 5272518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 2776155 - 2776340
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  2776155 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 2776254  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2776255 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 2776340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22116466 - 22116281
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  22116466 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttga 22116367  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22116366 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 22116281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 21352961 - 21353147
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaa-gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgcta 243  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21352961 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagcccatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttg 21353060  T
Q  244 aattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21353061 aactatttgaaattctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 21353147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47557750 - 47557666
Alignment:
Q  246 ttatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47557750 ttattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 47557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Original strand, 19590582 - 19590629
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19590582 aacaatcactctcattgatgaccagacatagagaaagtataagtgtcg 19590629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53991541 - 53991488
Alignment:
Q  277 ctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  53991541 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgattttggaatgccatttgttcttttc 53991488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10259862 - 10259814
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  10259862 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 10259814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 21564593 - 21564641
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  21564593 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 21564641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24077931 - 24077883
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24077931 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 24077883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 43332114 - 43332162
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  43332114 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 43332162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 51452181 - 51452229
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  51452181 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 51452229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26924801 - 26924753
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||    
T  26924801 aatcactctcattgatgaacaaacatggagaaagtataagtgtcgcctc 26924753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17037032 - 17037333
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  17037032 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 17037131  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  17037132 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 17037231  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17037232 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 17037331  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17037332 tc 17037333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17091540 - 17091841
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  17091540 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 17091639  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  17091640 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 17091739  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17091740 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 17091839  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17091840 tc 17091841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17025355 - 17025656
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  17025355 aacaaacattcttattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 17025454  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  17025455 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 17025554  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17025555 agatctttgctgctgaacnatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 17025654  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17025655 tc 17025656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 4811312 - 4811612
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggg-tgggtaatg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4811312 aacaatcactctcattgatgaccagacacg--gaaagtataaatgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggggtgggcaatg 4811409  T
Q  128 attcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaag 227  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4811410 attcaatttctacatagaacgtgcgatggaagaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaag 4811509  T
Q  228 tagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4811510 tagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctt 4811609  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  4811610 ttc 4811612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 16883687 - 16883988
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  16883687 aacaatcactctcattgattaccagacatagagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcattgg 16883786  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |    
T  16883787 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaat 16883886  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  16883887 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttcttt 16883986  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  16883987 tc 16883988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17041377 - 17041678
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  17041377 aacaatcactctcattgattaccagacatagagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcattgg 17041476  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |    
T  17041477 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaat 17041576  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  17041577 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttcttt 17041676  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17041677 tc 17041678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9917216 - 9916917
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9917216 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattactgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 9917117  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  9917116 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 9917017  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9917016 atctttgctggtgaagtatttgaacttttactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaggatgccatttgttcttttc 9916917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1515519 - 1515218
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  1515519 aacattcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 1515420  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  1515419 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagt 1515320  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1515319 agatctttgctgctgaactatttgaacttatactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgttatttgttcttt 1515220  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  1515219 tc 1515218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10821713 - 10821432
Alignment:
Q  49 accagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  10821713 accagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttaggttggcagtggttcaatttctgcagagaacg 10821614  T
Q  149 tgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaatta 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  10821613 tgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaaatagatctttgctgctgaacta 10821514  T
Q  249 tttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10821513 tttgaacttctactatgttggcgtatcgctttggactataatcgtaaattatcttgactctgggatgtcatttgttcttttc 10821432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28380483 - 28380231
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  28380483 ctcattatcaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaaagtgtgatggaagaaggtggtacgctcaact 28380384  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28380383 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 28380284  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28380283 attggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttttc 28380231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 26821383 - 26821684
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  26821383 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 26821482  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  26821483 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaagtcgagttgttccaaagt 26821582  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26821583 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 26821682  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  26821683 tc 26821684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45205547 - 45205246
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||     
T  45205547 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactatcgccacattacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtgg 45205448  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  45205447 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcgcgttcgagttgttccaaagt 45205348  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45205347 agatctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 45205248  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  45205247 tc 45205246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1993553 - 1993283
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1993553 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 1993454  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  1993453 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 1993354  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1993353 actattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 1993283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 28501945 - 28502215
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28501945 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 28502044  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  28502045 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 28502144  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28502145 attattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 28502215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18093242 - 18092950
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  18093242 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaaatataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 18093143  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||         ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18093142 ttcaatttctgcaaagaac---------aagaaggtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 18093052  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18093051 agatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgttttggactgtaatcataaactatcttgacttcgggatgccatttgttcttt 18092952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6343341 - 6343071
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6343341 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 6343242  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  6343241 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgttgaactatttgaacttct 6343142  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6343141 actattttgacgtatcgctttgggctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 6343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14323825 - 14323555
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  14323825 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttttgcagagaacgtgtgatgatag 14323726  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  14323725 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtatatatttgctgctgaactatttgaacttct 14323626  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  14323625 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgtgatgtcatttgttcttttc 14323555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 45398554 - 45398806
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  45398554 ctcattatcaccgacagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtacgctcaact 45398653  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  45398654 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttctagtattttgatgtatcgc 45398753  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45398754 tttggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttttc 45398806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 14752976 - 14753246
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  | || ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  14752976 agaaagtataagtgtcgcttcattaccgccgaaagagcaagctatgaaatttatttgggtggacagtggttcaatttcagcagagaactagtgatggaag 14753075  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14753076 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtaaatctttgttgctgaactatttgaacttct 14753175  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  14753176 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttttc 14753246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33664324 - 33664023
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  33664324 aacaatcactttcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgccaataaagcaagctatgaaaattacttgggtgggcaatgg 33664225  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33664224 ttcaatttctacagagaacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 33664125  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33664124 agatctttgctgttgaactatttgaacttctactattttgacgaatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 33664025  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33664024 tc 33664023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36633611 - 36633314
Alignment:
Q  33 atcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattca 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |    
T  36633611 atcactcttattgatgaccagacacatagacaatataattgtcacctcattactgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtggttta 36633512  T
Q  133 atttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagat 232  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36633511 atttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagat 36633412  T
Q  233 ctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36633411 ctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgatgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttattttc 36633314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16724878 - 16724577
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  16724878 aacaatcactctcattgatgaccagacatagagacagtataactgtcatctcattatcgcagatagagcaagctatgaaaattacttggttgggcagtgg 16724779  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  16724778 ttcaatttctgcagataatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 16724679  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16724678 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 16724579  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  16724578 tc 16724577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19168172 - 19167871
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  19168172 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaagtacttgggtgggcagtgg 19168073  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  19168072 ttcaatttatgcagataacgagtgacagaagaaggtggtaagctcatatttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 19167973  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||  || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19167972 agatctttattgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgctcttt 19167873  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  19167872 tc 19167871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 21097462 - 21097763
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  21097462 aacaatcactctcattaatgaccagacacagagacaatataactgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtgg 21097561  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  21097562 ttcaaattctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 21097661  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21097662 agatctttgttgttgaagtattttaacttctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatctttactttgggatgtcatttgttcttt 21097761  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  21097762 tc 21097763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30567394 - 30567093
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  30567394 aacaatcactctcattgatgaccagacatagagacaatataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 30567295  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  30567294 ttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 30567195  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||  || | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  30567194 agatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgttcttt 30567095  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  30567094 tc 30567093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30571079 - 30570778
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  30571079 aacaatcactctcattgatgaccagacatagagacaatataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 30570980  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  30570979 ttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 30570880  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||  || | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  30570879 agatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgttcttt 30570780  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  30570779 tc 30570778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 42885154 - 42885454
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||     
T  42885154 aacaataactctcattgatgaccagacacaaagatagtataatcgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtgg 42885253  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||| |||||    
T  42885254 ttcaatttcggcagataacgagtgatggaagatggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttctaaagt 42885353  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  42885354 agatctttgttgtcgaactatctgaacttctactattttgacgtatcactttgcaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtttttt 42885453  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  42885454 t 42885454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35286750 - 35286568
Alignment:
Q  148 gtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |    
T  35286750 gtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacggaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaact 35286651  T
Q  248 atttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35286650 atttgaacatcttttattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 35286568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 11448129 - 11448247
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||     
T  11448129 aacaatcactctcattgatgaccagacaccgagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatatttaggtgggcagtgg 11448228  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaac 147  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  11448229 ttcaatttatgccgagaac 11448247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 3710661 - 3710709
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3710661 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 3710709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11866755 - 11866707
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  11866755 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 11866707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35358148 - 35358100
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  35358148 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 35358100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10822455 - 10822427
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacac 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822455 aacaatcactctcattgatgaccagacac 10822427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30524 - 30223
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  30524 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcacctcattaccgccaaaagagcaagctatgaaaaatacttggatgggcagtga 30425  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  30424 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatcttgaaaagtcaccaaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagt 30325  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30324 agatctttactgctaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 30225  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  30224 tc 30223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9226752 - 9226451
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  9226752 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtga 9226653  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9226652 ttcaatttcagtagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaaagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 9226553  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9226552 agatctttgttgcagaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 9226453  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  9226452 tc 9226451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27735580 - 27735279
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  27735580 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtga 27735481  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27735480 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 27735381  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27735380 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgccatttgttcttt 27735281  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  27735280 tc 27735279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42245387 - 42245086
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  42245387 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 42245288  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42245287 ttcaatttctgcagagaacgtctaatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctggaaaagtcaccgaagaacttccacgttcgagttgttccaaagt 42245188  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42245187 agatctttgttgttgaactatttgaacttctaatattttagcgtatctttttggattgtaattgtaaattatcttgactttgggatgccatttgttcttt 42245088  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  42245087 tc 42245086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 9149093 - 9149394
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  9149093 aacaatcactctcattgatgatcagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgtaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 9149192  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  9149193 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 9149292  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9149293 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 9149392  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  9149393 tc 9149394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38435081 - 38434780
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  38435081 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcacctcattaacgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 38434982  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  38434981 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 38434882  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38434881 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatagctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 38434782  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  38434781 tc 38434780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33639206 - 33638905
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||    
T  33639206 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattgccaccgaaagagaaatctatgaaaaatacttgggtgggcagtga 33639107  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33639106 ttcaatttctacaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgccgaagaatttacatgttcgagttgttccaaagt 33639007  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33639006 agatctttgctgctgaactatttgaacttctattattttgacgcatcgctttgaactataatcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 33638907  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33638906 tc 33638905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 3795244 - 3795543
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3795244 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 3795343  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||    
T  3795344 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcattttcgagttgttccaaaatag 3795443  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3795444 atctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 3795543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47164083 - 47163783
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||     
T  47164083 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtatcaactaattaccgtcgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggttgacagtgg 47163984  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  47163983 ttcaatt-ctgcagagaacgtctgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcctcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 47163885  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47163884 agatctttgctgctaaactatttgaacttcaactattttggcgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 47163785  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  47163784 tc 47163783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Original strand, 47174216 - 47174508
Alignment:
Q  37 ctctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaattt 136  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||| |||||    
T  47174216 ctctaattgatgaccagacacggagaaagtataagtgtcgcctcattaccgcagaaagagcaagctatgaaaaatgcttaggtggc-agtgatttaattt 47174314  T
Q  137 ctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatcttt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47174315 ctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaaaaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatcttt 47174414  T
Q  237 gctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||  | || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47174415 gctattgaactatttaaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 47174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 42996185 - 42996481
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  42996185 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 42996284  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| |    
T  42996285 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaat 42996379  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42996380 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 42996479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47573953 - 47573683
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47573953 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 47573854  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  47573853 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 47573754  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47573753 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 47573683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23300251 - 23299956
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||     
T  23300251 aacaatcactctcattgatgaccagacacggagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggagggcagtgg 23300152  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  23300151 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttcgaaagt 23300052  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgtt 324  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| | |||||| | |||||||||| |||||||    
T  23300051 agatctttgatgctgaactatttgaacttcaactattttgacgcatcgctttggattgtaaccatatactatcttaagtttgggatgccatttgtt 23299956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17477621 - 17477922
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  17477621 aacaatcactctcattgatgaccagatatagagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtgg 17477720  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17477721 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 17477820  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17477821 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 17477920  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17477921 tc 17477922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17575593 - 17575292
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  17575593 aacaatcactctcattgatgaccagatatagagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtgg 17575494  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17575493 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 17575394  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17575393 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 17575294  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17575293 tc 17575292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23766970 - 23766669
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||     
T  23766970 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagtaagctatgaaatttacttgggtgggcagtgg 23766871  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  23766870 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 23766771  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23766770 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 23766671  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  23766670 tc 23766669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 33030528 - 33030829
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  33030528 aacaatcactctcattgattaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 33030627  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33030628 ttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 33030727  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33030728 agatctttgttgttgaactaattgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaatcatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 33030827  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33030828 tc 33030829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6911975 - 6911705
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  6911975 agaaagtataagtgttgcctcattactgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatgactgcagagaacgtgtgatgatag 6911876  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  6911875 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 6911776  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6911775 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 6911705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 17482068 - 17482369
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  17482068 aacaatcactctcattgatgaccagatatagagacagtataactgtcacctcattaccgtcaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 17482167  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17482168 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 17482267  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17482268 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 17482367  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17482368 tc 17482369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17571146 - 17570845
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  17571146 aacaatcactctcattgatgaccagatatagagacagtataactgtcacctcattaccgtcaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 17571047  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17571046 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 17570947  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17570946 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 17570847  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  17570846 tc 17570845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 42687284 - 42687585
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||     
T  42687284 aacaatcactctcattgatgactagacacagagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctataaaaattacttaggtgggcagtgg 42687383  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  42687384 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagt 42687483  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42687484 agatctttgttgttgaactatttgaacttctaccattttgacgtatcgctttggacagtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 42687583  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  42687584 tc 42687585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42827856 - 42827605
Alignment:
Q  79 tcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctt 178  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42827856 tcattaccaccgaaacagcaagctatgaaaaatacttgggtggacaattgttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtgataagctcatctt 42827757  T
Q  179 tgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgct 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42827756 tgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgct 42827657  T
Q  279 ttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42827656 ttgaactgtaatcgtaaactatattgactttgagatgccatttgttcttttc 42827605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8926419 - 8926121
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  8926419 aatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattactgccgatagagcaagctatgaaaattacttggatgggtagtggttc 8926320  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||||    
T  8926319 aatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttcaaagtaga 8926220  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8926219 tctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 8926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Original strand, 14308662 - 14308943
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| | ||     
T  14308662 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataattgtcatctcattaccgccgatagagaaatctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 14308761  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  14308762 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 14308861  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttg 310  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  14308862 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttg 14308943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 5962431 - 5962729
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||     
T  5962431 aacaatcattctcattgatgaccagacaca--gtcagtataaatgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggttggcagtgg 5962528  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||| ||||    
T  5962529 ttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcatagaagaagttgtaaattcgagttgttcc-aagt 5962627  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5962628 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 5962727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4481784 - 4481617
Alignment:
Q  163 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  4481784 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttgttgctgaactatttgaacttctatt 4481685  T
Q  263 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4481684 attttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 4481617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 19520898 - 19521063
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  19520898 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataaatgtcaactcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggccagtga 19520997  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtca 194  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  19520998 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtca 19521063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 42917582 - 42917700
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  42917582 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagcgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttggttgggcagtga 42917681  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaac 147  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42917682 ttcaatttctgcagagaac 42917700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 211 - 330
Target Start/End: Original strand, 42917708 - 42917827
Alignment:
Q  211 ttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42917708 ttcgagttcttccaaagtagatctttgctgctgaagtatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcacaaactatcttgactttg 42917807  T
Q  311 ggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  42917808 ggatgacatttgttcttttc 42917827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 17469594 - 17469780
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaa-gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgcta 243  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  17469594 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttg 17469693  T
Q  244 aattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17469694 aactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttc 17469780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17583620 - 17583434
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaa-gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgcta 243  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  17583620 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttg 17583521  T
Q  244 aattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17583520 aactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttc 17583434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 330
Target Start/End: Original strand, 11499718 - 11499891
Alignment:
Q  157 aagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaact 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||    
T  11499718 aagaaggtggtaagctcgtctttgatctcgaaaggtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 11499817  T
Q  257 tctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | |||| |  |||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  11499818 tctactattttgacgtatcgatttgcattgtagtggtaaactattttgactttgggatctcatttgttcttttc 11499891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 330
Target Start/End: Original strand, 19521082 - 19521159
Alignment:
Q  253 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19521082 aacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 19521159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19034184 - 19034136
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  19034184 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 19034136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 20720452 - 20720500
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  20720452 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 20720500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 29490692 - 29490740
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  29490692 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 29490740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34282633 - 34282585
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  34282633 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 34282585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33230490 - 33230442
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||    
T  33230490 aatcactctcattgatgaacaaacatagaaaaagtataagtgtcgcctc 33230442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 55295306 - 55295005
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  55295306 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaaatataagtgtcgcctcattaccgctgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 55295207  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  55295206 ttcaatttctgcaaagaacgtgcgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 55295107  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55295106 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 55295007  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  55295006 tc 55295005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 48521549 - 48521248
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||     
T  48521549 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccaaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggatagtgg 48521450  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  48521449 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 48521350  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48521349 agatctttactactgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 48521250  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  48521249 tc 48521248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 8242427 - 8242728
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  8242427 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataggtgtcgcctcattaccgctaaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 8242526  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8242527 ttcaatttctgcagagaacgtgtaatggaagagggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 8242626  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
     ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8242627 ggatcttttctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcggtttggactgtaatcgtaaacaatcttgcctttgggatgccatttgttcttt 8242726  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  8242727 tc 8242728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40827562 - 40827261
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  40827562 aacaatcactctcattgatgaccaaacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 40827463  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40827462 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaatgtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 40827363  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  40827362 agatctttgctgctgaactatttgaactttttctattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgatttttggatgtcatttgttcttt 40827263  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  40827262 tc 40827261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 54793492 - 54793191
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||     
T  54793492 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagaacaagctatgaaaaatacttaggtgcgcagtgg 54793393  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  54793392 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaat 54793293  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | || |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54793292 atatatttgttgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaatctatattgactttgggatgccatttgtgcttt 54793193  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  54793192 tc 54793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 22477437 - 22477736
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22477437 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 22477536  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22477537 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtatgctcctctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 22477636  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22477637 atctttgctggtgaactatttgaacttttattattttgacgcatcactttggactgtaaccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 22477736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Original strand, 16495621 - 16495918
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | || ||     
T  16495621 aatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtggttt 16495719  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || |    
T  16495720 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatata 16495819  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  16495820 tctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttttc 16495918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 51248088 - 51248389
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  51248088 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 51248187  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51248188 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaatgtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaactttcacattcgagttgttccaaagt 51248287  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||  | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51248288 agatctttgtcgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 51248387  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  51248388 tc 51248389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31369544 - 31369243
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  31369544 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtgg 31369445  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  31369444 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 31369345  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31369344 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 31369245  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  31369244 tc 31369243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11951500 - 11951201
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  11951500 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagcgtcgtctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatactttggtgggcagtgatt 11951401  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  11951400 caatttctgcaaagaacgtgtgatgaaagaagttggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagttg 11951301  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  11951300 atctttgctggtgtactatttgaacttctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttc 11951201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5252870 - 5252600
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  5252870 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacatgtgatgatag 5252771  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  5252770 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttct 5252671  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5252670 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 5252600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 54512508 - 54512806
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54512508 aacaatcattctcattgatgaccagacaca--gacggtataactgtcgcctcattaccgccgatagagcaggctatgaaaaatacttgggtgggtagtgg 54512605  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  54512606 ttcaatttctgcagagaacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaggt 54512705  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  54512706 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactatttt-gcgtatcgctttggactgtagtcaaaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttt 54512804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11598491 - 11598190
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  11598491 aacaattaccctcattgatgaccagacatagagaaaatataagtgtcgcctcattactgccgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggtggaaagtgg 11598392  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||| |||||    
T  11598391 ttcaatttctgcaaagaacgtgtaatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagtacttgcatgttcgagttgttcaaaagt 11598292  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11598291 agatcttttctactaaactatttgaacttctactattttgacgcattgctttggactgttatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 11598192  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  11598191 tc 11598190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52841060 - 52840759
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  52841060 aacaatcactctcattgatgaccagacatagaggcagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtag 52840961  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  52840960 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaatctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 52840861  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  52840860 agatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 52840761  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  52840760 tc 52840759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 23193189 - 23193489
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  23193189 aacaatcactctcattgatgactagacacaaagacagtataaatgtcgcctcattacagccgatcgagcaagttatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 23193288  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23193289 ttcaatttctatagagaacgagcgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 23193388  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23193389 agatctttgatgttgaacaatttgaccttctactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtttttt 23193488  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  23193489 t 23193489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 329
Target Start/End: Original strand, 32755262 - 32755513
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  32755262 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgattcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatat 32755361  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32755362 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtacatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 32755461  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 329  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32755462 tttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttttttt 32755513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39796969 - 39796699
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  39796969 agaaagtataagtgttgcctcattaccgccgaaagagcaggctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttatgcagagaacgtgtgatgatag 39796870  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  39796869 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 39796770  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39796769 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 39796699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35088365 - 35088064
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  35088365 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 35088266  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  35088265 ttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 35088166  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35088165 agatatttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 35088066  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  35088065 tc 35088064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50771774 - 50771473
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  50771774 aacaatcactctcattgatgaccagatataaagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 50771675  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  50771674 ttcaatttctgcagagaatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 50771575  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50771574 agatctttgttgttgaattatttaaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 50771475  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  50771474 tc 50771473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36165488 - 36165237
Alignment:
Q  79 tcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctt 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36165488 tcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtagtggttcaattttagcatagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctt 36165389  T
Q  179 tgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgct 278  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36165388 tgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaacgatttgaacttctactattttggtgtatcgct 36165289  T
Q  279 ttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36165288 ttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgttcttttc 36165237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 50741080 - 50741381
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  50741080 aacaatcactctcattgatgaccagatataaagacagtataactgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 50741179  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  50741180 ttcaatttctgcagataatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaattcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 50741279  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50741280 agatctttgttgttgaattatttaaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 50741379  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  50741380 tc 50741381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 48976412 - 48976712
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | |      
T  48976412 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaggacaatataattgtcaccttattaccgccgatagagcaggctatgaaaattacttgggtgggcagtcg 48976511  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  48976512 ttcaatttctgcaga-aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaagttgcaaattcgagttgttccaaagt 48976610  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  48976611 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttt 48976710  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  48976711 tc 48976712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6104653 - 6104352
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  6104653 aacaatcactctcattgataaccagatacagagacagtagaactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 6104554  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  6104553 ttcaatttctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 6104454  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6104453 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 6104354  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  6104353 tc 6104352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 49112802 - 49113094
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||     
T  49112802 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggacagtgg 49112901  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  49112902 ttcaacttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 49113001  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| ||         | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  49113002 agatctttgttg---------tcgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 49113092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2845381 - 2845117
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | || |||    
T  2845381 aatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattacccccgatagagcaagctatgaaaaaaacttggatgggcagtggttc 2845282  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |    
T  2845281 aatttctgtcgagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccgaagaacttgcacgatcgagttgttcaaaagtata 2845182  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaa 296  Q
    |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  2845181 tcttttgtgctgaactatttgaacttctactattttgatgtataactttggactgtaatcgtaaa 2845117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52853969 - 52853668
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||     
T  52853969 aacaatcactctctttgatgggcagacacagagacagtataactgtcacctcattacagccgatagagcaagccatgaaaattacttgggtgggcagtgg 52853870  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  52853869 ttcaatttctacagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 52853770  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52853769 agatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 52853670  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  52853669 tc 52853668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21700097 - 21699799
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  21700097 aacaatcactctcattgatgaccagacttagagacagtataactgtcacctctttaccgc-gatagggcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtgg 21699999  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  21699998 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtgg--agctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 21699901  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21699900 agatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttt 21699801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11326169 - 11325886
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||     
T  11326169 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaacaa--tataactatcacctcattaccgtcgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggaagtgg 11326072  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||  |||||    
T  11326071 ttcaatttcagcagataacgagtgatggaagaaggtgataagcttatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttgaaagt 11325972  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggat 314  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  11325971 agatctttgttgttgaactatttgaacttctattattttgacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgacgttgggat 11325886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52463387 - 52463158
Alignment:
Q  101 ctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | || |    
T  52463387 ctatgaaaaatacttgggtggacagtggttcaatttctgcaaagaaagtgtgaaggaagaaggtggtaagctcattattgatctcgaaaagtcgctgatg 52463288  T
Q  201 aattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattat 300  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  52463287 aacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactat 52463188  T
Q  301 cttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52463187 cttgacttagggatgccatttgttcttttc 52463158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19893896 - 19893699
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||     
T  19893896 aacaatcactctcattgatgaccagacaca--gaaaatataagtgtcgcctcattaccaccgaaagagaaagctatgaagaatacttgggtggacagtgg 19893799  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19893798 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaactttcatgttcgagttgttccaaagt 19893699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 180
Target Start/End: Original strand, 35436662 - 35436774
Alignment:
Q  68 taagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436662 taagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggtagtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggt 35436761  T
Q  168 aagcttatctttg 180  Q
    ||||| |||||||    
T  35436762 aagctcatctttg 35436774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 324
Target Start/End: Original strand, 11383004 - 11383140
Alignment:
Q  187 aaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactg 286  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11383004 aaaaatcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttactgctgaactatttgaccttctactattttggcgtatcgc-ttggattg 11383102  T
Q  287 taatcataaattatcttgactttgggatgctatttgtt 324  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  11383103 taatcctaaactatcttgaccttgagatgtcatttgtt 11383140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 11382896 - 11382988
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgg 121  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382896 aacaatcaacctaattgatgaccagacataaagaaaatataagtgtcgcagcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgg 11382988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Original strand, 35436768 - 35436867
Alignment:
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  35436768 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcctgactttgggatgtcatttgttcttttc 35436867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Original strand, 23936884 - 23937078
Alignment:
Q  40 tcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctg 139  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || |     
T  23936884 tcatcgatgaccaaactcaaaggaagtataagtgtcgcttgattaccgcggagagagcaagtcatgaaaagtacttaggtggccaatggttcaaattttt 23936983  T
Q  140 cagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctt 235  Q
    | ||| || |||| | |  |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23936984 ccgag-acatgtgttagtggtcggtggtaaactaatctttgatctggaaaagccacctaaaaacatgcacgttcaagttgttcccaaatagatctt 23937078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 36167978 - 36167933
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  36167978 aacaatcactctcattgatgaccag--acagagaaagtataagtgtcg 36167933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 15314986 - 15315287
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  15314986 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcgtcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttaggtgggcattgg 15315085  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15315086 ttcaatttctacagagaacgtgtgatggaagaaggtggaaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaatttgcacgttcgagttgttccaaaat 15315185  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15315186 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcggtttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 15315285  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  15315286 tc 15315287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51966247 - 51965946
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttggg-tgggtaatg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  51966247 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttggggtgggcagtg 51966148  T
Q  128 attcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaag 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  51966147 gttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaa-aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcatgttcgagtttttccaaag 51966049  T
Q  228 tagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51966048 tagatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcactttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctt 51965949  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  51965948 ttc 51965946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 52309570 - 52309871
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  52309570 aacaatcactctcgttgatgaccagacacaaagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgt 52309669  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  52309670 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 52309769  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
     ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |  |||||||||||    
T  52309770 tgatatttgctgatgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaagaagtcatttgttcttt 52309869  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  52309870 tc 52309871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 12714213 - 12714514
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||     
T  12714213 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctttgaaaaatacttaggtgcgcagtgg 12714312  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  12714313 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaatttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaat 12714412  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12714413 atatctttgatgctgaactatttgaacttctactattttttcgtattgctttgggatgtaatcgtaacttatcttgactttgggatgccattttttcttt 12714512  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  12714513 tc 12714514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 10763120 - 10763419
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  10763120 caatcactctaattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatactcgggtgggcagtgatt 10763219  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  10763220 caatttctacaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 10763319  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10763320 atctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcattttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 10763419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13662916 - 13662619
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | || ||     
T  13662916 aatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtggttt 13662818  T
Q  132 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || |    
T  13662817 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatata 13662718  T
Q  232 tctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  13662717 tctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttttc 13662619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 18111353 - 18111623
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18111353 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 18111452  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  18111453 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 18111552  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18111553 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 18111623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43255168 - 43254898
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43255168 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 43255069  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  43255068 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 43254969  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43254968 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 43254898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50395582 - 50395312
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  50395582 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 50395483  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  50395482 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 50395383  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50395382 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 50395312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 34687323 - 34687624
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  34687323 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 34687422  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  34687423 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 34687522  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34687523 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 34687622  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  34687623 tc 34687624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 329
Target Start/End: Original strand, 42682128 - 42682422
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  42682128 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 42682227  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  42682228 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctca----tgattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 42682323  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 329  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42682324 atctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttttttt 42682422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29841199 - 29840900
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  29841199 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgtcgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 29841100  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  29841099 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 29841000  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||  | || ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  29840999 atctttgctagtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactattttgactttggtatgtcatttgttcttttc 29840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 18813955 - 18814256
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  18813955 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 18814054  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  18814055 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 18814154  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18814155 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 18814254  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  18814255 tc 18814256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28566233 - 28565936
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| | | ||     
T  28566233 aacaatcactctcattgatgaccagacacagaaaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagatcaagctatgaaaaataattaggtgtgcagtgg 28566134  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  28566133 ttcagtttcttcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttattgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaat 28566034  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttct 326  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28566033 atatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatctctttggactataatcgtaacctatcttgactttgggatgccatttgttct 28565936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16032070 - 16031818
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16032070 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggcgagcaatggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatct 16031971  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16031970 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatcttttctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 16031871  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16031870 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 16031818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 31619425 - 31619726
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  31619425 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataattgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 31619524  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  31619525 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagt 31619624  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31619625 agatctttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttt 31619724  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  31619725 tc 31619726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 48340065 - 48340366
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||     
T  48340065 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcgccacattacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtgg 48340164  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  48340165 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgtttcaaagt 48340264  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||| | || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48340265 agatcttagttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 48340364  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  48340365 tc 48340366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Original strand, 50560790 - 50561079
Alignment:
Q  41 cattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgc 140  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  50560790 cattaatgatcagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattacccccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgagtgggcagtggttcaatttctgc 50560889  T
Q  141 agagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctg 240  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50560890 aaagaacgtgtgatggaagaagatggtaaactcatctttgatctcgaaaattcagcgaagaacttgcatgtccgagttgttctaaagtagatctttgctg 50560989  T
Q  241 ctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    || || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50560990 ctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 50561079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 17671092 - 17671343
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  17671092 ctcattaacaccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcaatggttcaatttca-cagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcacat 17671190  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17671191 tttatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgc 17671290  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17671291 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 17671343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 34691851 - 34692152
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  34691851 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccaccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggaagtgg 34691950  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  34691951 ttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 34692050  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34692051 agatctttgttgttgaactattttaacttctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 34692150  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  34692151 tc 34692152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 36681029 - 36681281
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  36681029 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatagttgggtgggcaatggttcaatttctacggagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatct 36681128  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  36681129 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttctactattttgatgtatctc 36681228  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  36681229 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttggaatgtcatttgttcttttc 36681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41830563 - 41830262
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | |      
T  41830563 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatacagcaagctatgaaaattacttgggtgggcactag 41830464  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  41830463 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 41830364  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  41830363 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcactttggtctgtagtcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttt 41830264  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41830263 tc 41830262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52522082 - 52521781
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  52522082 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtgtaactgtcatctcattaccaccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 52521983  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  52521982 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggcaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 52521883  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  52521882 agatctttgttgttgaactattataacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttattt 52521783  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  52521782 tc 52521781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 45004518 - 45004770
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  45004518 ctcattaccaccgaaagagcaagctatgaaaaatagttgggtggacaatggttcaatttctacagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatct 45004617  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 277  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  ||||| |    
T  45004618 ttgatctcgaaaagtcaccaaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttctactcttttgatgtatctc 45004717  T
Q  278 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45004718 tttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgtcatttgttcttttc 45004770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41963444 - 41963143
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||     
T  41963444 aacaatcactctcattgataaccagacatatagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaaactatgaaaattacttgggtgggcagtgg 41963345  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||    
T  41963344 ttcaatttctgcagataaagagtgatggaagaaggagttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgatttgttccaaagt 41963245  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41963244 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 41963145  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  41963144 tc 41963143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38845738 - 38845483
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||     
T  38845738 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagactgtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctataaaaattacttgggtgggaagtgg 38845639  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||    
T  38845638 ttcaatttctgcagatagcgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttattccaaagt 38845539  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggac 284  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38845538 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggac 38845483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12246236 - 12246054
Alignment:
Q  148 gtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |    
T  12246236 gtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaact 12246137  T
Q  248 atttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12246136 atttgaacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 12246054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 24294394 - 24294566
Alignment:
Q  158 agaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaactt 257  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  24294394 agaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaactt 24294493  T
Q  258 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  24294494 ctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 24294566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 44406227 - 44406412
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  44406227 aacgagtgatggaagaacgtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 44406326  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44406327 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 44406412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39760459 - 39760363
Alignment:
Q  234 tttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  39760459 tttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 39760363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 47135361 - 47135437
Alignment:
Q  254 acttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47135361 acttgtactattttgacgcatcgctttggaccgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttattcttttc 47135437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 9701946 - 9702247
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  9701946 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccaaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 9702045  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  9702046 ttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaagatggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaat 9702145  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9702146 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 9702245  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  9702246 tc 9702247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12588803 - 12588505
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12588803 caatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagaaaactatgaaaaatacttgggtgggcagtgatt 12588704  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  12588703 caatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtag 12588604  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 329  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12588603 atctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctttt 12588505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3210723 - 3210424
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  3210723 aacaatcactctcattgatgaccaaacacagagaaagtataagtgtcgcctcattgccgctgaaagagtaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 3210624  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  3210623 ttcaatttctgcagagaacatg--atggaagaatgtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgtcccaaaat 3210526  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3210525 agatctttgctgctaaactatttgaacttctattattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 3210426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 21029804 - 21030103
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  21029804 caatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccaccgatagtgcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtggtt 21029903  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21029904 caatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtag 21030003  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21030004 atctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 21030103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31296168 - 31295898
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31296168 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 31296069  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  31296068 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 31295969  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31295968 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 31295898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1852455 - 1852154
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  1852455 aacaatcactctcattgatggccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgctgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtga 1852356  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1852355 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 1852256  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  1852255 agatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctt 1852156  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  1852155 tc 1852154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3397663 - 3397362
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||     
T  3397663 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataacggtcacctcattaccaccgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggcagtgg 3397564  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  3397563 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 3397464  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3397463 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 3397364  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  3397363 tc 3397362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20996465 - 20996168
Alignment:
Q  33 atcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | || ||||    
T  20996465 atcactctcattgatgaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccgccaatagagcaaactatgaaaattacttaggtgggcagtggttca 20996366  T
Q  133 atttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagat 232  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20996365 atttctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagat 20996266  T
Q  233 ctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20996265 ctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaaccatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 20996168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 19395081 - 19395351
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  19395081 agaaagtataagcgtcgcctcattaccgcagaaagagcaagctatggaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcaaagcacgtgtgatgatag 19395180  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19395181 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttct 19395280  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19395281 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 19395351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 2194859 - 2195160
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  2194859 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattatcgccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggtagtgg 2194958  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||| ||||    
T  2194959 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccgaagt 2195058  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2195059 agatctttattgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 2195158  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  2195159 tc 2195160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3151129 - 3150828
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  3151129 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataatcgtcacctcattaccgccgatggagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 3151030  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  3151029 ttcaatttctgcagataaagagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 3150930  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  3150929 agatctttgttgttgaactatttgaacttctaccattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatatcatttgttcttt 3150830  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  3150829 tc 3150828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 7285371 - 7285672
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  7285371 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataacagtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 7285470  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7285471 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 7285570  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7285571 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcactttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 7285670  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  7285671 tc 7285672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10513614 - 10513325
Alignment:
Q  41 cattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgc 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||    
T  10513614 cattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgccaagagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtggttcaatttttgc 10513515  T
Q  141 agagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10513514 agagaacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttg 10513415  T
Q  241 ctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
     | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  10513414 ttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgttcttttc 10513325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 20349617 - 20349918
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  20349617 aacaatcactctcattgatgaccagatatagagacaatataattgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 20349716  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || ||||||||||||| |    
T  20349717 ttcaatttctgcagagaacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaaat 20349816  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20349817 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttgcactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 20349916  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  20349917 tc 20349918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 330
Target Start/End: Original strand, 19447698 - 19447998
Alignment:
Q  30 acaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |    
T  19447698 acaatcactctcattgatgacccgacacagagacagtataactgccacctcattaccgccgatagagcaagctatcaaaattacttgggtgggcagtggt 19447797  T
Q  130 tcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagta 229  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  19447798 tcaatttcggcagataacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagta 19447897  T
Q  230 gatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 329  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  19447898 gatctttgttgttgaactatttgaacttctattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaattttgggatgccatttgttctttt 19447997  T
Q  330 c 330  Q
    |    
T  19447998 c 19447998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 330
Target Start/End: Original strand, 41780569 - 41780823
Alignment:
Q  76 gcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttat 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41780569 gcctcattaccaccgaaagagcaaactatgaaaaatactttggtggacaatggttcaatttctggagagagcgtgtgatggaataaggtggtaagctcat 41780668  T
Q  176 ctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatc 275  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41780669 cttttatctcgaaaagtcatcgaagaactagcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgatactgaactatttgaacttctactattttgacgtatc 41780768  T
Q  276 gctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41780769 gctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 41780823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 4881967 - 4882267
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  4881967 aacaatcactctcattgacgaccagacacagagacaatataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggtcaatgg 4882066  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |  |||||||||||||||| |    
T  4882067 ttcgatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaatt 4882166  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||| ||   |||||||||||    
T  4882167 agatctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgg-ctgtagtcgtaaactatcttgaatttggaatatcatttgttcttt 4882265  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  4882266 tc 4882267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33611665 - 33611364
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  33611665 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccaccaatagagcaagctatgaaaattacttggatgggcagtgg 33611566  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33611565 ttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 33611466  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33611465 agatctttgttgttgaactattttaacttctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 33611366  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33611365 tc 33611364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26321600 - 26321299
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||| | ||     
T  26321600 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagtgcacgctatgaaaattatttgggtgggcagtgg 26321501  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||||    
T  26321500 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcccgaaaagtcatagaagaacttggaaattcgagttgttccaaagt 26321401  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26321400 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttt 26321301  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  26321300 tc 26321299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 30689003 - 30689304
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||     
T  30689003 aacaatcactcttattgatgaccagacacagagacagtacaactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtggtcagtgg 30689102  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||    
T  30689103 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaaagtgcaaattcgagttgttccaaagt 30689202  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  30689203 agatatttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgaagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttt 30689302  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  30689303 tc 30689304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Original strand, 33929607 - 33929789
Alignment:
Q  148 gtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |    
T  33929607 gtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaact 33929706  T
Q  248 atttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33929707 atttgaacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 33929789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 330
Target Start/End: Original strand, 3028468 - 3028749
Alignment:
Q  52 agacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgt 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| ||    
T  3028468 agacacatagacagtataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagttatgaaaattacttgggtggggagtggttcaatttttgcagataacgagt 3028567  T
Q  152 gatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagat----ctttgctgctaaatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||     |||| || | || |    
T  3028568 gatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaag-cacagaagaacttgcaaattcgagttgttacaaagtagatattaatttgttgttgaact 3028666  T
Q  248 atttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  3028667 atttgaacttctactattttgtcgtatcgttttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttc 3028749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Original strand, 27065602 - 27065838
Alignment:
Q  37 ctctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaattt 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||    
T  27065602 ctctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattatcaccgataaagcaagctacgaaaattacttgggtggacagtggttcaattt 27065701  T
Q  137 ctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatcttt 236  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27065702 ctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagc--atctttgatctcgaaaagtcacagaagaatttacaaattcgagttgttgcaaagtagatcttt 27065799  T
Q  237 gctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatc 275  Q
    | || | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27065800 gttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatc 27065838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 180
Target Start/End: Original strand, 290302 - 290453
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  290302 aacaagcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtggccagtgg 290401  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttg 180  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  290402 ttcaatttcagcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttg 290453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 38934287 - 38934472
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  38934287 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcatagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 38934386  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38934387 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 38934472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 17996390 - 17996575
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  17996390 aacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 17996489  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17996490 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 17996575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 20757771 - 20757956
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  20757771 aacgagtgatgaaagaaggtggtaagatcatatttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 20757870  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20757871 actatttgaacttctactattttggcgtactgctttggactgtagtcgcaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 20757956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 287447 - 287344
Alignment:
Q  81 attaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttg 180  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  287447 attaccgacgaaagagaaagctatgaaaaatatttgggagggcagtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttg 287348  T
Q  181 atct 184  Q
    ||||    
T  287347 atct 287344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Original strand, 290447 - 290546
Alignment:
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  290447 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctttc 290546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33707087 - 33707003
Alignment:
Q  246 ttatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33707087 ttattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 33707003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 37464081 - 37464129
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||    
T  37464081 aatcactctcattgatgaacaaacatagaaaaagtataagtgtcgcctc 37464129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 65162 - 64860
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||     
T  65162 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatactttggttggcagtgg 65063  T
Q  129 ttcaattt-ctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaag 227  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||     
T  65062 ttcaattttctgcagaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaa 64963  T
Q  228 tagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  64962 tagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 64863  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  64862 ttc 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 152681 - 152381
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||     
T  152681 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatactaggg-gcgcagtgg 152583  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  152582 tttaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaat 152483  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  152482 atatctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 152383  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  152382 tc 152381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 14831197 - 14831498
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  14831197 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcacctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 14831296  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14831297 ttcaatttcttcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 14831396  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14831397 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 14831496  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  14831497 tc 14831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33321988 - 33321687
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  33321988 aacaatcactctcattgatgaccagacacatagaaaatataagtgtcgcctcattatcgtcgaatgagaaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 33321889  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  33321888 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgagaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 33321789  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  33321788 agatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcataaactatcttgagtttgggatgtcatttgttcttt 33321689  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  33321688 tc 33321687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 330
Target Start/End: Original strand, 34320808 - 34321105
Alignment:
Q  33 atcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  34320808 atcactctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgtctcattaccgccgaaagagcatgctgtgaaaaatacttggaagggcaatgattca 34320907  T
Q  133 atttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagat 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  34320908 atttctgcatagaatgtgtgatggaagaaggtgataatctcatctttgatctcgaaaaatcaccaaagaacttgcatgttcgagttgttccatagtagat 34321007  T
Q  233 ctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34321008 ctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgatatttgttcttttc 34321105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13457348 - 13457078
Alignment:
Q  60 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13457348 agaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggctatggatcaatttctgcagagaacgtgtgatgatag 13457249  T
Q  160 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 259  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  13457248 aaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttct 13457149  T
Q  260 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13457148 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 13457078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1073798 - 1073497
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  1073798 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 1073699  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1073698 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 1073599  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1073598 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 1073499  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  1073498 tc 1073497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18599521 - 18599220
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  18599521 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 18599422  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  18599421 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 18599322  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18599321 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 18599222  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  18599221 tc 18599220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 34855667 - 34855968
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  34855667 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 34855766  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  34855767 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcattttttatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 34855866  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34855867 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 34855966  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  34855967 tc 34855968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14888472 - 14888171
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  14888472 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 14888373  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  14888372 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 14888273  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14888272 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggattttattcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 14888173  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  14888172 tc 14888171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 15275370 - 15275671
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||     
T  15275370 aacaatcactctcattgatgatcagacacagagacattataattgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgggtgagcagtgg 15275469  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || ||||||||| |||||    
T  15275470 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatatttgagttgttcgaaagt 15275569  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15275570 agatctttgttgttgaactatttgaacttatattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 15275669  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  15275670 tc 15275671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 17939236 - 17939535
Alignment:
Q  31 caatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgatt 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | | || ||    
T  17939236 caatcactatcattgatgaccagacacagatacagtataattgtcacctcattaccgccaatagagcaagctatgaaaattacttgggtgagcagtggtt 17939335  T
Q  131 caatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||||    
T  17939336 caatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtag 17939435  T
Q  231 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17939436 atctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttggactttagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 17939535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22374376 - 22374075
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||     
T  22374376 aacagtcattctcattgatgaccagatacagagacagtataactgtcacctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaaatacttgcgcgggcagtgg 22374277  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  22374276 ttcattttcagcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagt 22374177  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||  || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22374176 agatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 22374077  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  22374076 tc 22374075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11935215 - 11934914
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | ||     
T  11935215 aacaatcactctcattgatgatcagacacagagacattttaactgtcatctcattacctccgatagagcaagctattaaaattacttgggtggtcattgg 11935116  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  11935115 ttctatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 11935016  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | ||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11935015 aaatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 11934916  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  11934915 tc 11934914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 4424199 - 4424499
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  4424199 aacaatcattctcaatgatgaccagacacagagacagtatcactgtcac-tcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 4424297  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  4424298 ttcaatttctgcatataacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctccaaaagttacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 4424397  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4424398 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgatttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 4424497  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  4424498 tc 4424499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 2520875 - 2521177
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  2520875 aacaatcactctcattgatgatcagacacagagacagtataactgtcatctcattaccaccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 2520974  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||||| |    
T  2520975 ttcaatttctacagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaaat 2521074  T
Q  229 agatc-tttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctt 327  Q
    ||||| |||| || | || ||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2521075 agatcttttgttgttgaactattttaacttctattattttgatgtatcgttttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 2521174  T
Q  328 ttc 330  Q
    |||    
T  2521175 ttc 2521177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Original strand, 1931745 - 1931975
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||     
T  1931745 aacaatcactctcattggtgacaagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattacctccgaaagagcaagctatgaaaaatatttgggtgggcagtgg 1931844  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||       | |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  1931845 ttcaatttcagcagagaacatgtgatagaagaaggtggtaagc-------tcatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagt 1931937  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattt 266  Q
    ||||||||  || | || ||||||||||||||||||||    
T  1931938 agatctttattgttgaactatttgaacttctactattt 1931975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28228997 - 28228824
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28228997 ctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacaatagttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatct 28228898  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattattt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  28228897 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 28228824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 330
Target Start/End: Original strand, 25539943 - 25540086
Alignment:
Q  187 aaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactg 286  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25539943 aaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaactttttaaacttctactattttgacacatcgctttggactg 25540042  T
Q  287 taatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25540043 taatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 25540086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 18311635 - 18311819
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  18311635 aacgagtgatggaagaaggtggta-gctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 18311733  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18311734 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 18311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Original strand, 35040936 - 35041121
Alignment:
Q  145 aacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaa 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  35040936 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcagagaagaacttgcaaatccgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 35041035  T
Q  245 attatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35041036 actatttgaacttctactattttgacataccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 35041121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 329
Target Start/End: Original strand, 4425404 - 4425519
Alignment:
Q  214 gagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttggga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4425404 gagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaactattactattttggcgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttggga 4425503  T
Q  314 tgctatttgttctttt 329  Q
    ||  ||||||||||||    
T  4425504 tgtcatttgttctttt 4425519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7219399 - 7219280
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  7219399 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacatcatcacagccgatcgagcaagctatgaaaaatacttgggtgggcagtgg 7219300  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7219299 ttcaatttctgcagagaacg 7219280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Original strand, 7222456 - 7222525
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  7222456 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcacctcattaccgtcgatagagca 7222525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 249627 - 249675
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  249627 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 249675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12580328 - 12580280
Alignment:
Q  32 aatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctc 80  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  12580328 aatcactctcattgatgaacaaacatagagaaagtataagtgtcgcctc 12580280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Original strand, 33978674 - 33978721
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcg 76  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  33978674 aacaatcactctcattgatgactagacatagagaaaatataagtgtcg 33978721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13458 - 13157
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |      
T  13458 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagaaaatataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtgagcagttg 13359  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13358 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 13259  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13258 agatctttgttgctgaactatttgagcttctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 13159  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  13158 tc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 119768 - 120068
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  119768 aacaatcactctcattaatgacctgacacagagaaagtataagtgtcacctcattaccgcagaaagagcaagctatgaaaaatgcttgggtgggcagtgg 119867  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  119868 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagt 119967  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    | || |||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  119968 aaatttttgctactgaactatttgaacttctactattttaacgtatcgctttggaatctaatcgtaaactatcttgactttgggatgccgtttgttcttt 120067  T
Q  329 t 329  Q
    |    
T  120068 t 120068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1363
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||     
T  1067 aacaaacattctcattgatgaccagacacagagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcatgctatgaaaaatacttggatgggcagtgg 1166  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| |    
T  1167 ttcaatttctgtagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaat 1261  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1262 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 276
Target Start/End: Original strand, 49779 - 50024
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  49779 aacaatcactctcattgatgaccagacaca--gaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtggacagtgg 49876  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  49877 ttcaatttcagcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtaatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagt 49976  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcg 276  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49977 agatctttattgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcg 50024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Original strand, 61267 - 61325
Alignment:
Q  272 tatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  61267 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 61325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26887 - 26586
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  26887 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataattgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 26788  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26787 ttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagt 26688  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26687 agatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 26588  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  26587 tc 26586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 9656 - 9957
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  9656 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacagtataactgtcatctcattatcgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 9755  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  9756 ttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagt 9855  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    |||| |||| || | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9856 agatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 9955  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  9956 tc 9957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Original strand, 146 - 447
Alignment:
Q  29 aacaatcactctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  146 aacaatcactctcattgatgaccagacacagagacaatataactgtcatctcattaccgccgatagagcaagctatgaaaattacttgggtgggcagtgg 245  T
Q  129 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |  ||||||||||| ||||||    
T  246 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgaaaattcgagttgtttcaaagt 345  T
Q  229 agatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttt 328  Q
    ||||||||| || | || | ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  346 agatctttgttgttgaactgttttaacttctactattttgatatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttt 445  T
Q  329 tc 330  Q
    ||    
T  446 tc 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4586 - 4405
Alignment:
Q  149 tgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaatta 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  4586 tgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaacta 4487  T
Q  249 tttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4486 tttgaacttttactattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgttcttttc 4405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29495 - 29322
Alignment:
Q  78 ctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatct 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29495 ctcattaccaccgaaagagaaagctatgaaaaatacttgggtggacaatagttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatct 29396  T
Q  178 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattattt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  29395 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 29322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10994 - 10836
Alignment:
Q  172 ttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcg 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||    
T  10994 ttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttacatattcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttaacg 10895  T
Q  272 tatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10894 catcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 10836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53345 - 53194
Alignment:
Q  174 atctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgta 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  53345 atctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcata 53251  T
Q  274 tcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 330  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53250 ccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttc 53194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 330
Target Start/End: Original strand, 100509 - 100629
Alignment:
Q  210 gttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgacttt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  100509 gttcgagttgtttgaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatattgacttt 100608  T
Q  310 gggatgctatttgttcttttc 330  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  100609 gggatgcgatttgttcttttc 100629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 12436 - 12575
Alignment:
Q  39 ctcattgatgaccagacacaaagaaagtataagtgtcgcctcattaccgccgaaagagcaagctatgaaaaatacttgggtgggtaatgattcaatttct 138  Q
    |||||||||||||| || ||||  | ||||| ||||||| | |||||||| || |||||||   ||||||| |||||||||||  |||| ||||| || |    
T  12436 ctcattgatgaccaaactcaaacgaggtataggtgtcgcttgattaccgcggagagagcaaatcatgaaaactacttgggtggtcaatggttcaactttt 12535  T
Q  139 gcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctt 178  Q
    |  ||||||||||| | || | ||||||||| || |||||    
T  12536 gtcgagaacgtgtgttagaggtaggtggtaaactaatctt 12575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 86 times since January 2019
Visitors: 3464