View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0500_low_15 (Length: 347)

Name: NF0500_low_15
Description: NF0500
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0500_low_15
NF0500_low_15
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (193-334)||(12143072-12143213)
chr1 (194-334)||(19274559-19274699)
chr1 (193-334)||(7553016-7553157)
chr1 (193-334)||(23767414-23767555)
chr1 (193-334)||(38473626-38473767)
chr1 (193-334)||(41106016-41106157)
chr1 (193-334)||(46825531-46825672)
chr1 (193-334)||(19315640-19315781)
chr1 (193-334)||(28425363-28425504)
chr1 (193-334)||(33325727-33325868)
chr1 (193-330)||(49094711-49094848)
chr1 (193-332)||(25988271-25988410)
chr1 (193-334)||(7651662-7651803)
chr1 (193-334)||(36157678-36157818)
chr1 (193-332)||(49814302-49814441)
chr1 (193-330)||(45350717-45350852)
chr1 (193-330)||(26069896-26070033)
chr1 (193-334)||(26549388-26549529)
chr1 (193-334)||(33674017-33674158)
chr1 (193-334)||(46051450-46051591)
chr1 (193-334)||(16705870-16706011)
chr1 (193-334)||(18892329-18892470)
chr1 (193-334)||(23228194-23228335)
chr1 (193-334)||(50689943-50690084)
chr1 (194-334)||(50533383-50533523)
chr1 (193-332)||(36781172-36781311)
chr1 (196-334)||(24204474-24204612)
chr1 (193-330)||(45670486-45670623)
chr1 (193-334)||(7608766-7608907)
chr1 (193-330)||(9878784-9878921)
chr1 (193-330)||(9962755-9962892)
chr1 (193-330)||(48669396-48669533)
chr1 (193-329)||(5400876-5401011)
chr1 (193-330)||(8141486-8141623)
chr1 (193-330)||(34971084-34971221)
chr1 (193-330)||(37216900-37217037)
chr1 (193-334)||(46095075-46095216)
chr1 (193-334)||(48802331-48802472)
chr1 (195-330)||(41982237-41982372)
chr1 (193-334)||(6711440-6711581)
chr1 (193-334)||(17983898-17984039)
chr1 (193-330)||(21965069-21965206)
chr1 (193-334)||(43396675-43396816)
chr1 (193-334)||(52146993-52147134)
chr1 (193-334)||(52349924-52350065)
chr1 (193-334)||(52067651-52067792)
chr1 (193-334)||(40721342-40721484)
chr1 (213-330)||(9974846-9974963)
chr1 (230-334)||(12964646-12964750)
chr1 (214-334)||(33194672-33194792)
chr1 (193-329)||(33714361-33714495)
chr1 (214-330)||(48319067-48319183)
chr1 (194-334)||(18917524-18917664)
chr1 (193-329)||(21929526-21929667)
chr1 (193-330)||(18782089-18782226)
chr1 (193-330)||(25800648-25800782)
chr1 (214-330)||(16506809-16506925)
chr1 (214-334)||(30281631-30281751)
chr1 (256-334)||(50099220-50099298)
chr1 (193-294)||(44978768-44978868)
chr1 (286-334)||(44979281-44979329)
chr1 (290-334)||(32373650-32373694)
chr1 (290-332)||(17989864-17989906)
chr1 (304-334)||(49973942-49973972)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (193-334)||(47281124-47281265)
chr7 (193-334)||(1469493-1469634)
chr7 (193-334)||(47271981-47272122)
chr7 (193-334)||(48628805-48628946)
chr7 (194-334)||(44544409-44544549)
chr7 (194-334)||(47219145-47219285)
chr7 (193-334)||(30876259-30876400)
chr7 (193-334)||(31684134-31684275)
chr7 (193-334)||(35600122-35600263)
chr7 (193-334)||(38427563-38427704)
chr7 (193-334)||(47294291-47294432)
chr7 (193-334)||(8162712-8162853)
chr7 (193-334)||(11476556-11476697)
chr7 (193-334)||(23842305-23842446)
chr7 (193-334)||(27364339-27364480)
chr7 (193-334)||(30798368-30798509)
chr7 (193-334)||(40851274-40851415)
chr7 (194-330)||(33884323-33884459)
chr7 (193-330)||(37393998-37394135)
chr7 (193-334)||(41113377-41113518)
chr7 (193-321)||(2960640-2960768)
chr7 (193-334)||(42979338-42979479)
chr7 (193-334)||(43752776-43752917)
chr7 (198-330)||(4923220-4923352)
chr7 (193-330)||(11050261-11050398)
chr7 (193-334)||(43968259-43968400)
chr7 (193-334)||(45723491-45723632)
chr7 (193-334)||(41139408-41139553)
chr7 (193-311)||(221298-221416)
chr7 (193-334)||(30971941-30972082)
chr7 (193-330)||(44800410-44800547)
chr7 (193-329)||(7336065-7336200)
chr7 (193-334)||(47119991-47120134)
chr7 (214-334)||(3797544-3797664)
chr7 (194-334)||(29248342-29248482)
chr7 (193-334)||(47579086-47579228)
chr7 (193-330)||(18353148-18353285)
chr7 (214-334)||(27774108-27774228)
chr7 (214-330)||(37354284-37354400)
chr7 (241-334)||(40520918-40521011)
chr7 (276-334)||(39034062-39034120)
chr7 (193-246)||(42888937-42888990)
chr7 (193-249)||(5106127-5106182)
chr7 (291-334)||(43025112-43025155)
chr7 (285-334)||(29739781-29739829)
chr7 (283-322)||(12583313-12583352)
chr7 (290-334)||(29739670-29739713)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (193-334)||(6739955-6740096)
chr5 (193-334)||(8215900-8216041)
chr5 (193-334)||(3352002-3352143)
chr5 (193-334)||(6251972-6252113)
chr5 (193-330)||(14717609-14717746)
chr5 (193-334)||(27457197-27457338)
chr5 (193-334)||(30297749-30297890)
chr5 (193-334)||(31710282-31710423)
chr5 (193-334)||(39824556-39824697)
chr5 (193-334)||(40074950-40075091)
chr5 (193-332)||(39002025-39002164)
chr5 (193-334)||(4015874-4016015)
chr5 (193-330)||(6600136-6600273)
chr5 (193-334)||(11000728-11000869)
chr5 (193-334)||(16095960-16096100)
chr5 (193-334)||(20079258-20079399)
chr5 (193-334)||(33760470-33760611)
chr5 (193-334)||(38964114-38964254)
chr5 (194-334)||(30863253-30863393)
chr5 (194-334)||(41282342-41282482)
chr5 (193-334)||(8689572-8689713)
chr5 (193-330)||(14952328-14952465)
chr5 (193-334)||(26593280-26593421)
chr5 (193-334)||(35342180-35342321)
chr5 (193-339)||(23128913-23129059)
chr5 (193-334)||(11692147-11692288)
chr5 (193-334)||(19659501-19659642)
chr5 (193-330)||(20408537-20408674)
chr5 (193-334)||(42993518-42993659)
chr5 (193-334)||(43166269-43166410)
chr5 (193-334)||(30208402-30208543)
chr5 (193-326)||(1052541-1052674)
chr5 (193-330)||(27116099-27116236)
chr5 (193-334)||(28078405-28078546)
chr5 (193-330)||(19398193-19398330)
chr5 (214-334)||(16752116-16752236)
chr5 (193-330)||(11935450-11935586)
chr5 (214-334)||(26035367-26035487)
chr5 (232-334)||(6331377-6331479)
chr5 (193-334)||(8694866-8695007)
chr5 (193-334)||(27509978-27510112)
chr5 (214-326)||(444962-445074)
chr5 (193-237)||(6332873-6332917)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (193-334)||(33151696-33151837)
chr3 (193-334)||(1017044-1017185)
chr3 (193-330)||(1687655-1687792)
chr3 (193-334)||(20813441-20813582)
chr3 (193-334)||(21564496-21564637)
chr3 (193-334)||(21656518-21656659)
chr3 (193-330)||(35346471-35346608)
chr3 (193-334)||(38446476-38446617)
chr3 (193-334)||(51562162-51562303)
chr3 (193-329)||(21890175-21890311)
chr3 (193-329)||(42016878-42017014)
chr3 (193-334)||(20086314-20086455)
chr3 (193-334)||(20760071-20760212)
chr3 (193-334)||(31122662-31122803)
chr3 (193-334)||(36314972-36315113)
chr3 (193-330)||(50287570-50287707)
chr3 (193-330)||(10618480-10618617)
chr3 (201-334)||(12748391-12748524)
chr3 (193-334)||(26455582-26455723)
chr3 (193-334)||(37247956-37248097)
chr3 (193-334)||(41250886-41251027)
chr3 (193-334)||(42107099-42107240)
chr3 (193-334)||(47329175-47329316)
chr3 (198-334)||(19664541-19664677)
chr3 (194-334)||(29677476-29677616)
chr3 (199-334)||(22851996-22852131)
chr3 (193-330)||(32650820-32650957)
chr3 (193-334)||(44798268-44798408)
chr3 (193-334)||(48651248-48651389)
chr3 (193-334)||(53196014-53196155)
chr3 (193-334)||(19268521-19268668)
chr3 (193-332)||(3697148-3697287)
chr3 (193-334)||(35608131-35608272)
chr3 (193-334)||(52821049-52821190)
chr3 (193-334)||(1448735-1448873)
chr3 (193-334)||(27070739-27070880)
chr3 (193-330)||(40922165-40922302)
chr3 (193-334)||(53925979-53926120)
chr3 (193-332)||(20913754-20913893)
chr3 (193-332)||(20921872-20922011)
chr3 (193-334)||(33473239-33473380)
chr3 (193-334)||(55164115-55164256)
chr3 (214-332)||(50977866-50977984)
chr3 (214-332)||(51080998-51081116)
chr3 (214-334)||(50364908-50365028)
chr3 (214-330)||(51475267-51475383)
chr3 (193-334)||(39069726-39069867)
chr3 (193-334)||(45380260-45380401)
chr3 (234-334)||(28699685-28699785)
chr3 (214-332)||(34019462-34019580)
chr3 (193-319)||(38923998-38924124)
chr3 (257-334)||(44152700-44152777)
chr3 (270-334)||(47473230-47473294)
chr3 (228-303)||(42641213-42641288)
chr3 (193-235)||(44152772-44152814)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (193-334)||(3408189-3408330)
chr6 (194-334)||(6503718-6503858)
chr6 (193-334)||(8178249-8178390)
chr6 (193-332)||(2390267-2390406)
chr6 (193-334)||(1915343-1915484)
chr6 (193-334)||(2707459-2707600)
chr6 (193-334)||(9382519-9382660)
chr6 (193-334)||(10256237-10256378)
chr6 (193-334)||(26230932-26231073)
chr6 (193-330)||(30379021-30379158)
chr6 (193-334)||(12626636-12626777)
chr6 (193-330)||(17428272-17428409)
chr6 (193-334)||(29050272-29050413)
chr6 (193-330)||(17943040-17943177)
chr6 (193-330)||(26393009-26393146)
chr6 (193-334)||(3258807-3258948)
chr6 (193-334)||(11133873-11134015)
chr6 (193-330)||(16193314-16193451)
chr6 (193-323)||(2598099-2598229)
chr6 (193-330)||(1077241-1077378)
chr6 (193-334)||(6785101-6785239)
chr6 (193-330)||(26196321-26196458)
chr6 (214-334)||(26936607-26936727)
chr6 (213-319)||(35223919-35224025)
chr6 (193-330)||(10931148-10931288)
chr6 (194-330)||(25820550-25820686)
chr6 (193-280)||(31375971-31376058)
chr6 (193-251)||(12612971-12613029)
chr6 (193-272)||(12612848-12612927)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (193-334)||(4544985-4545126)
chr4 (193-334)||(12196469-12196610)
chr4 (193-334)||(42273802-42273943)
chr4 (193-334)||(5227390-5227531)
chr4 (193-334)||(28264643-28264784)
chr4 (193-334)||(33807780-33807921)
chr4 (193-332)||(26017425-26017564)
chr4 (193-330)||(23135006-23135143)
chr4 (193-334)||(31591076-31591216)
chr4 (193-334)||(31973591-31973732)
chr4 (193-330)||(32317957-32318094)
chr4 (193-334)||(35930040-35930180)
chr4 (193-334)||(48707733-48707874)
chr4 (193-334)||(55517185-55517326)
chr4 (194-334)||(40988633-40988773)
chr4 (193-329)||(49118616-49118752)
chr4 (193-332)||(24458631-24458770)
chr4 (193-331)||(48149502-48149640)
chr4 (193-334)||(11795154-11795295)
chr4 (193-334)||(19496102-19496243)
chr4 (193-334)||(28159953-28160094)
chr4 (193-334)||(28812287-28812427)
chr4 (193-329)||(44490324-44490460)
chr4 (193-332)||(2055280-2055419)
chr4 (193-332)||(8882013-8882152)
chr4 (194-333)||(33174021-33174160)
chr4 (193-334)||(14564796-14564937)
chr4 (193-334)||(15985010-15985151)
chr4 (193-334)||(17847096-17847236)
chr4 (193-334)||(39995167-39995308)
chr4 (194-334)||(32118714-32118854)
chr4 (193-334)||(9339123-9339267)
chr4 (194-332)||(37381848-37381986)
chr4 (193-330)||(25734223-25734360)
chr4 (193-330)||(30467003-30467140)
chr4 (195-334)||(10588580-10588719)
chr4 (193-334)||(30141108-30141249)
chr4 (193-334)||(39700045-39700186)
chr4 (193-330)||(48551764-48551901)
chr4 (193-334)||(17993017-17993158)
chr4 (193-330)||(23553069-23553205)
chr4 (193-334)||(33693333-33693474)
chr4 (193-332)||(50276138-50276274)
chr4 (193-334)||(50542354-50542495)
chr4 (193-334)||(51371047-51371188)
chr4 (214-334)||(24623148-24623268)
chr4 (193-334)||(31208748-31208885)
chr4 (193-334)||(22298517-22298659)
chr4 (214-334)||(19168816-19168936)
chr4 (193-330)||(25730244-25730381)
chr4 (214-334)||(42549643-42549762)
chr4 (256-334)||(56555203-56555281)
chr4 (193-274)||(20534225-20534306)
chr4 (193-228)||(56555165-56555200)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (193-334)||(16246193-16246334)
chr2 (193-334)||(27328584-27328725)
chr2 (193-334)||(921022-921163)
chr2 (193-334)||(12759750-12759890)
chr2 (193-334)||(28650426-28650567)
chr2 (193-334)||(33865267-33865408)
chr2 (193-334)||(40854609-40854750)
chr2 (199-334)||(771981-772116)
chr2 (193-334)||(11949426-11949567)
chr2 (193-334)||(34253142-34253283)
chr2 (193-334)||(41500502-41500643)
chr2 (193-334)||(7378963-7379104)
chr2 (193-334)||(9276574-9276715)
chr2 (193-330)||(37838301-37838438)
chr2 (194-334)||(17134229-17134369)
chr2 (193-331)||(2056929-2057067)
chr2 (193-334)||(1106559-1106700)
chr2 (193-334)||(2456010-2456151)
chr2 (193-334)||(19180422-19180562)
chr2 (193-334)||(33106969-33107110)
chr2 (193-334)||(37732193-37732334)
chr2 (198-334)||(36211046-36211182)
chr2 (194-334)||(36444229-36444369)
chr2 (193-332)||(7297234-7297373)
chr2 (200-334)||(3430631-3430765)
chr2 (193-330)||(25087796-25087933)
chr2 (193-334)||(42629962-42630103)
chr2 (193-334)||(43249412-43249553)
chr2 (194-334)||(38751048-38751188)
chr2 (193-332)||(2314975-2315114)
chr2 (193-334)||(2094410-2094551)
chr2 (193-334)||(8899682-8899822)
chr2 (193-334)||(29737748-29737889)
chr2 (193-330)||(17484550-17484687)
chr2 (214-334)||(8396572-8396692)
chr2 (193-333)||(45124120-45124260)
chr2 (218-330)||(37654112-37654224)
chr2 (233-334)||(41178059-41178160)
chr2 (214-334)||(19916008-19916128)
chr2 (193-285)||(14630663-14630755)
chr2 (193-333)||(9331757-9331897)
chr2 (193-283)||(23671811-23671901)
chr2 (278-334)||(23672958-23673014)
chr2 (193-232)||(28216964-28217003)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (193-334)||(114-255)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (193-334)||(2533272-2533413)
chr8 (193-334)||(3875908-3876049)
chr8 (193-329)||(15847117-15847253)
chr8 (193-334)||(513308-513448)
chr8 (193-334)||(1293486-1293627)
chr8 (193-334)||(36400070-36400211)
chr8 (193-330)||(37933646-37933783)
chr8 (193-332)||(35884430-35884569)
chr8 (193-334)||(35443311-35443452)
chr8 (193-330)||(38107103-38107240)
chr8 (193-334)||(9056338-9056479)
chr8 (193-334)||(22683988-22684129)
chr8 (193-334)||(28496355-28496495)
chr8 (193-334)||(28707446-28707587)
chr8 (193-334)||(38633710-38633851)
chr8 (193-334)||(43806533-43806674)
chr8 (193-334)||(23972295-23972437)
chr8 (193-330)||(259982-260118)
chr8 (193-330)||(440844-440981)
chr8 (193-330)||(655803-655939)
chr8 (193-330)||(841538-841674)
chr8 (193-319)||(41536527-41536653)
chr8 (193-334)||(24430571-24430712)
chr8 (214-334)||(7434886-7435006)
chr8 (193-330)||(38208756-38208894)
chr8 (193-334)||(33651841-33651982)
chr8 (198-334)||(39513344-39513480)
chr8 (193-334)||(12010549-12010693)
chr8 (193-330)||(40301893-40302030)
chr8 (193-334)||(42988227-42988367)
chr8 (214-334)||(23935233-23935353)
chr8 (193-330)||(4649154-4649291)
chr8 (193-334)||(13797089-13797229)
chr8 (193-330)||(36218781-36218917)
chr8 (214-334)||(29485287-29485406)
chr8 (214-332)||(6016207-6016325)
chr8 (256-334)||(24193356-24193433)
chr8 (194-254)||(24193131-24193191)
chr8 (269-328)||(8137180-8137239)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (193-334)||(218885-219027)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (193-334)||(252438-252579)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (193-329)||(47967-48103)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (193-330)||(5027-5164)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (193-330)||(5190-5326)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (214-334)||(1994-2114)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (194-330)||(11362-11498)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (193-330)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (193-330)||(59608-59745)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (193-274)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (193-274)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (193-274)||(3371-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (193-274)||(1877-1958)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (281-334)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (284-334)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143072
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274559
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553157
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767555
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473767
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106016
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825531
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315640
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425504
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325727
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094848
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988410
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651662
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157818
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 36157776  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157777 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814302
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350852
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069896
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549388
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674017
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051450
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705870
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892329
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228335
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689943
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533383
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781311
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204612
Alignment:
Q  196 tcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaatta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  296 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670623
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608907
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878921
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 9878921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962755
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669533
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatg 48669533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400876
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141623
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971084
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216900
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095216
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802472
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 330
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  195 atcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaatt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  295 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711440
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984039
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965069
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396675
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146993
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350065
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 52067651 - 52067792
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52067651 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 52067750  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52067751 ttattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721342
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacaccc-acttaaa 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974846
Alignment:
Q  213 tattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
Q  313 gacaaatggtggataatg 330  Q
    |  |||||||||||||||    
T  9974863 ggtaaatggtggataatg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 230 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964646
Alignment:
Q  230 ttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  330 gctct 334  Q
    |||||    
T  12964650 gctct 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194792
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  33194772 gcgaatggtggttaatgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714495
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||| | |    
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-aca 33714458  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  314 acaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929526
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaac-------tcatttttggtaccaaatctggctactaacaccca 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  286 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782226
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800648
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttt----tggtaccaaatctggctactaacacccactt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||      ||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactt 25800690  T
Q  289 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25800689 aaaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
Q  314 acaaatggtggataatg 330  Q
     ||||||||||||||||    
T  16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281631
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
      |||||||||||||||||||    
T  30281651 taaaatggtggataatgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  256 tttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  293 tt 294  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  286 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  290 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 332
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  290 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49973972 - 49973942
Alignment:
Q  304 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973972 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 49973942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281265
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469634
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271981
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628805
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544409
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219145
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876259
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684275
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600263
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427704
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294432
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162853
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476697
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842305
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364480
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798509
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851274
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884323
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394135
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113377
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979479
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752917
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 198 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923220
Alignment:
Q  198 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  298 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050398
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968400
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723632
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139553
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata----gttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccactt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  289 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221298
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  293 ttagtcatctttttaggca 311  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972082
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800547
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336065
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaaca-gttctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119991
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata--gttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  291 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797664
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
      |||||||||||||||||||    
T  3797644 ttaaatggtggataatgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248342
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 47579086 - 47579228
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaatt-gcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47579086 gaattgtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaa 47579185  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579186 attaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353148
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774108
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  27774128 gcaaatggtggataatgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354400
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
Q  314 acaaatggtggataatg 330  Q
     ||||||||||||||||    
T  37354384 gcaaatggtggataatg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  241 ttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39034120 - 39034062
Alignment:
Q  276 ctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39034120 ctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5106182 - 5106127
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaa 249  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5106182 gaatcgtttcaaacat-tcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 5106127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025112
Alignment:
Q  291 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctct 43025112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  285 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  283 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29739713 - 29739670
Alignment:
Q  290 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739713 aaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740096
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215900
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352143
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251972
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717609
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457338
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297890
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710282
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824556
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074950
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002164
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016015
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600273
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000869
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096100
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079399
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760611
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964254
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863253
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282342
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689572
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952328
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593421
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342180
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 339
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129059
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctctgct 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgct 23129059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692288
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659642
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408537
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993518
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166410
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208543
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052541
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 326  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116236
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078546
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398330
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935450
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatcttt-gaaccaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035487
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26035467 acaaatggtggataatgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331377
Alignment:
Q  232 ggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  332 tct 334  Q
    |||    
T  6331379 tct 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694866
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509978
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataa-catagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||       ||||| |   |||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgta-ataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa------aactaa-aaggacttaaa 27510021  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510020 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444962
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
Q  314 acaaatggtggat 326  Q
     ||||||||||||    
T  444974 gcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6332917 - 6332873
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6332917 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagaatagttggtaat 6332873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151696
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017044
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687655
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813582
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564496
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656518
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346608
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446476
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562162
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890175
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016878
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086455
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760212
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122662
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315113
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287570
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618617
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748391
Alignment:
Q  201 tcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  301 ctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455582
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247956
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250886
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107240
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329316
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664541
Alignment:
Q  198 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  298 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851996
Alignment:
Q  199 tttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtc 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  299 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 32650820 - 32650957
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32650820 gaatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 32650919  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32650920 ttagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798268
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651248
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196014
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19268668 - 19268521
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataaca------tagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccac 286  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19268668 gaatcgttttaaacaagtcctaatgtagataacaataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccac 19268569  T
Q  287 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268568 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697148
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608272
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821190
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 1448735 - 1448873
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1448735 gaatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1448831  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1448832 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070880
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922302
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatg 40922302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 53925979 - 53926120
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  53925979 gaatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaa 53926078  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53926079 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913893
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922011
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473380
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164256
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977866
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
Q  314 acaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50977884 acaaatggtggataatgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51080998
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
Q  314 acaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51081016 acaaatggtggataatgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
Q  314 acaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||    
T  51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069726
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380401
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttgg-taattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699685
Alignment:
Q  234 taattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctc 28699686  T
Q  334 t 334  Q
    |    
T  28699685 t 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019462
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
Q  314 acaaatggtggataatgct 332  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34019480 tcaaatggtggataatgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924124
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  | || |||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 319  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152700
Alignment:
Q  257 ttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473230
Alignment:
Q  270 tggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 42641213 - 42641288
Alignment:
Q  228 agttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641213 agttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44152814 - 44152772
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggta 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44152814 gaatcgtttcaaacaagtcatattatagataacatagttggta 44152772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408189
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503718
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178390
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390267
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915484
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707459
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382519
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256237
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231073
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379021
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626636
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428409
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050272
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943040
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393146
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258948
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaa 3258905  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133873
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcctt-gaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16193451 - 16193314
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16193451 gaatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 16193352  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16193351 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 323
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077241
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785239
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196458
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaa 291  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaa 26196419  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936607
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26936627 acaaatggtggataatactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 213 - 319
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224025
Alignment:
Q  213 tattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
Q  313 gacaaat 319  Q
    | |||||    
T  35224019 gtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 10931148 - 10931288
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  10931148 gaatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaa 10931246  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatg----acaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||    
T  10931247 ttagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataatg 10931288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820686
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatg 25820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 272
Target Start/End: Original strand, 12612848 - 12612927
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgg 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12612848 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctgg 12612927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545126
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196469
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273802
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227390
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264643
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807921
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017425
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135143
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatg 23135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591076
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973591
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317957
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930040
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707874
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517326
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118616
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458770
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149502
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795295
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11795295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496243
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160094
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812427
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 28812385  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490324
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055280
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882152
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 333
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174160
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564796
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985010
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847236
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995308
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118714
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339267
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatt---tttggtaccaaatctggctactaacacccactta 289  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  290 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381848
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734360
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467140
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  195 atcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaatt 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  295 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141249
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700045
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551901
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993158
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553069
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 23553107  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693474
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276274
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542495
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371188
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623148
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24623168 acaaatggtggataatgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208748
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||    ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31208785 ttagtcatc----taaacatgataaatggtggataatgctct 31208748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298517
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  293 ttagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168936
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19168916 acaaatggtggataatgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730244
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549762
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  42549743 acaaa-ggtggaaaatgctct 42549762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 56555203 - 56555281
Alignment:
Q  256 tttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555203 tttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534225
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Original strand, 56555165 - 56555200
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555165 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246334
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328584
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921022
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759890
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcct-ctaacacccacttaaaa 12759848  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650567
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865408
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854609
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 199 - 334
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772116
Alignment:
Q  199 tttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  299 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949567
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253142
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500643
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378963
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276574
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 9276574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838301
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134229
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056929
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 331  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106700
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2456010
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180422
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct-ctaacacccacttaaaa 19180464  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107110
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732334
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211046
Alignment:
Q  198 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  298 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444369
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297373
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430765
Alignment:
Q  200 ttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  300 tctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087933
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629962
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43249412 - 43249553
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43249412 gaatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43249511  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249512 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315114
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094551
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899682
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737748
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484687
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396692
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8396672 acaaatggtggataatgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124120
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654112
Alignment:
Q  218 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  318 atggtggataatg 330  Q
    ||| || ||||||    
T  37654124 atgatgaataatg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 334
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178160
Alignment:
Q  233 gtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  333 ct 334  Q
    ||    
T  41178159 ct 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916128
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  19916108 acaaattgtggataatgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacaccca 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||  | || || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 333  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacc 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 334
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  278 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Original strand, 28216964 - 28217003
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttg 232  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28216964 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttg 28217003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 114
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533272
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875908
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847117
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513308
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293486
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400211
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933646
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884569
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443311
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107103
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056479
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684129
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496495
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaa 28496453  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707587
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633851
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806674
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972437
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgac-aaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactct 23972437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259982
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440844
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655939
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841674
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536653
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430712
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208756
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  293 ttagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651841
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 334
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513480
Alignment:
Q  198 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagt 297  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  298 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12010693 - 12010549
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtag---ataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccactta 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12010693 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccactta 12010594  T
Q  290 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12010593 aaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302030
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988367
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935233
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23935253 gcaaatggtggataatgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649154
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797089
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatttt-ggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctct 13797089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218917
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016207
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||  ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
Q  314 acaaatggtggataatgct 332  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6016225 acaaatggtggataatgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  256 tttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 254
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193191
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcat 24193191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8137239 - 8137180
Alignment:
Q  269 ctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 328  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137239 ctggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218885
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaaca-cccacttaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  292 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252579
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47967
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5164
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5190
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 5228  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2114
Alignment:
Q  214 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
Q  314 acaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2094 acaaatggtggataatgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11362
Alignment:
Q  194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaat 293  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13099
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59745
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctactaacacccacttaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 599
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1994
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 3371 - 3452
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 274  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3371 gaatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1877
Alignment:
Q  193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 334
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  281 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  284 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University