View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0520_high_15 (Length: 297)

Name: NF0520_high_15
Description: NF0520
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0520_high_15
NF0520_high_15
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (32-286)||(38925464-38925718)
chr1 (32-286)||(17324619-17324876)
chr1 (32-286)||(47906311-47906568)
chr1 (32-286)||(50307528-50307787)
chr1 (32-282)||(10399815-10400068)
chr1 (32-286)||(12302488-12302745)
chr1 (32-282)||(15294821-15295074)
chr1 (32-286)||(15823587-15823844)
chr1 (32-286)||(39462560-39462817)
chr1 (32-282)||(51750080-51750333)
chr1 (36-286)||(18307154-18307407)
chr1 (36-286)||(50076655-50076908)
chr1 (32-286)||(6995683-6995940)
chr1 (32-286)||(2949215-2949471)
chr1 (32-286)||(16428694-16428952)
chr1 (32-286)||(14097952-14098210)
chr1 (32-282)||(28840721-28840973)
chr1 (32-279)||(24325704-24325954)
chr1 (36-286)||(28207051-28207302)
chr1 (32-277)||(13215122-13215375)
chr1 (32-286)||(41646961-41647218)
chr1 (32-286)||(31424998-31425259)
chr1 (32-286)||(18839628-18839886)
chr1 (32-282)||(39932114-39932368)
chr1 (32-282)||(2510312-2510564)
chr1 (32-282)||(31735508-31735761)
chr1 (32-282)||(46431693-46431947)
chr1 (36-286)||(31489958-31490210)
chr1 (32-280)||(2617557-2617808)
chr1 (32-286)||(3579600-3579856)
chr1 (32-286)||(28998236-28998493)
chr1 (32-286)||(29003952-29004209)
chr1 (30-286)||(50078803-50079063)
chr1 (32-280)||(6823056-6823306)
chr1 (32-286)||(25127913-25128171)
chr1 (38-286)||(27336923-27337173)
chr1 (37-286)||(25251257-25251510)
chr1 (32-286)||(11457458-11457715)
chr1 (32-282)||(13761878-13762130)
chr1 (32-286)||(50248553-50248812)
chr1 (32-286)||(6756568-6756826)
chr1 (32-286)||(9241068-9241326)
chr1 (32-286)||(17186110-17186368)
chr1 (32-282)||(20302500-20302752)
chr1 (32-284)||(4131360-4131619)
chr1 (32-286)||(17324104-17324360)
chr1 (33-286)||(17318935-17319185)
chr1 (32-286)||(27339114-27339370)
chr1 (32-282)||(28842536-28842788)
chr1 (32-282)||(51752406-51752657)
chr1 (37-286)||(16432440-16432694)
chr1 (32-282)||(16226208-16226461)
chr1 (82-286)||(16429048-16429256)
chr1 (32-284)||(40133985-40134241)
chr1 (32-282)||(47179754-47180006)
chr1 (32-233)||(21948225-21948427)
chr1 (58-280)||(25248540-25248766)
chr1 (32-206)||(48665218-48665393)
chr1 (32-282)||(20291498-20291750)
chr1 (32-282)||(9459404-9459657)
chr1 (32-282)||(9463231-9463484)
chr1 (32-282)||(47177403-47177655)
chr1 (32-278)||(31422851-31423114)
chr1 (51-286)||(15669375-15669613)
chr1 (71-286)||(6115085-6115304)
chr1 (51-270)||(42922292-42922514)
chr1 (32-265)||(47451689-47451919)
chr1 (87-270)||(23785935-23786121)
chr1 (51-285)||(14183574-14183811)
chr1 (72-286)||(49495193-49495411)
chr1 (83-282)||(51757623-51757824)
chr1 (58-282)||(16231630-16231856)
chr1 (132-286)||(23816027-23816184)
chr1 (32-190)||(6823926-6824091)
chr1 (69-243)||(8347298-8347476)
chr1 (32-286)||(8349034-8349289)
chr1 (70-205)||(18800640-18800775)
chr1 (70-270)||(16561545-16561751)
chr1 (71-268)||(30790401-30790602)
chr1 (52-205)||(13125525-13125677)
chr1 (73-243)||(30738653-30738830)
chr1 (73-245)||(155788-155963)
chr1 (73-286)||(26613222-26613440)
chr1 (33-270)||(27916539-27916780)
chr1 (51-286)||(28279326-28279567)
chr1 (71-180)||(26520205-26520321)
chr1 (216-282)||(13358800-13358867)
chr1 (163-270)||(15916562-15916674)
chr1 (91-273)||(21353342-21353525)
chr1 (80-241)||(43104248-43104414)
chr1 (73-205)||(14353047-14353178)
chr1 (73-148)||(26332613-26332688)
chr1 (88-150)||(4144804-4144865)
chr1 (91-273)||(2393277-2393461)
chr1 (88-150)||(2232597-2232658)
chr1 (88-150)||(14997040-14997101)
chr1 (241-282)||(13447260-13447301)
chr1 (91-150)||(2401342-2401400)
chr1 (91-150)||(9526469-9526527)
chr1 (91-150)||(25134074-25134132)
chr1 (33-115)||(26332719-26332798)
chr1 (199-267)||(13598402-13598471)
chr1 (73-183)||(49959129-49959241)
chr1 (91-150)||(9521718-9521776)
chr1 (87-129)||(10115880-10115922)
chr1 (199-269)||(9526578-9526650)
[»] chr3 (145 HSPs)
chr3 (32-286)||(1313430-1313687)
chr3 (32-286)||(4308260-4308517)
chr3 (32-286)||(53917643-53917900)
chr3 (32-286)||(53915475-53915732)
chr3 (32-284)||(18099151-18099406)
chr3 (32-286)||(45882960-45883218)
chr3 (32-282)||(38890061-38890314)
chr3 (32-286)||(42990325-42990582)
chr3 (32-286)||(43423442-43423699)
chr3 (32-286)||(3314705-3314963)
chr3 (32-286)||(1626662-1626919)
chr3 (32-286)||(43228312-43228569)
chr3 (32-286)||(43421394-43421651)
chr3 (32-282)||(1321500-1321753)
chr3 (32-286)||(9604586-9604843)
chr3 (32-286)||(18096879-18097136)
chr3 (32-286)||(27101160-27101417)
chr3 (32-286)||(30005862-30006119)
chr3 (32-286)||(43226106-43226361)
chr3 (32-282)||(10956010-10956263)
chr3 (32-282)||(25533463-25533716)
chr3 (32-286)||(28101981-28102238)
chr3 (32-286)||(18162684-18162941)
chr3 (32-286)||(53468432-53468692)
chr3 (32-282)||(10084372-10084625)
chr3 (32-282)||(11170425-11170678)
chr3 (32-286)||(39715490-39715743)
chr3 (32-282)||(51726990-51727242)
chr3 (32-284)||(5926746-5927000)
chr3 (32-286)||(880430-880688)
chr3 (33-286)||(6484381-6484638)
chr3 (32-286)||(51943392-51943648)
chr3 (32-282)||(5191674-5191925)
chr3 (37-282)||(5522610-5522857)
chr3 (32-286)||(24979728-24979986)
chr3 (32-282)||(4103879-4104131)
chr3 (32-282)||(10958306-10958559)
chr3 (33-286)||(32219106-32219363)
chr3 (32-286)||(36011848-36012105)
chr3 (33-282)||(7606571-7606822)
chr3 (37-286)||(51674745-51674997)
chr3 (32-282)||(3859549-3859801)
chr3 (32-286)||(32264017-32264275)
chr3 (32-282)||(25388927-25389179)
chr3 (32-286)||(48361650-48361907)
chr3 (62-286)||(25688139-25688367)
chr3 (37-267)||(53591210-53591442)
chr3 (32-282)||(746778-747031)
chr3 (32-286)||(4666535-4666792)
chr3 (32-282)||(22114288-22114541)
chr3 (32-286)||(12267954-12268201)
chr3 (32-286)||(47148874-47149131)
chr3 (32-282)||(10621513-10621766)
chr3 (32-270)||(10191305-10191545)
chr3 (32-282)||(26720569-26720821)
chr3 (59-286)||(6231849-6232078)
chr3 (36-286)||(15780896-15781157)
chr3 (32-282)||(28413014-28413268)
chr3 (32-282)||(458305-458558)
chr3 (51-286)||(23633498-23633731)
chr3 (32-282)||(455928-456181)
chr3 (32-282)||(6063429-6063682)
chr3 (32-282)||(6065779-6066032)
chr3 (32-282)||(50494020-50494273)
chr3 (32-205)||(6561831-6562005)
chr3 (51-285)||(28761407-28761646)
chr3 (32-230)||(29956707-29956907)
chr3 (32-259)||(889779-890009)
chr3 (72-284)||(5886261-5886474)
chr3 (72-284)||(5899734-5899947)
chr3 (32-282)||(38210391-38210644)
chr3 (32-286)||(54691553-54691810)
chr3 (75-282)||(11168165-11168375)
chr3 (32-265)||(35917944-35918185)
chr3 (51-286)||(17795301-17795537)
chr3 (51-286)||(19103741-19103977)
chr3 (32-286)||(31151369-31151623)
chr3 (32-286)||(42992307-42992548)
chr3 (32-176)||(35777442-35777587)
chr3 (51-243)||(13420208-13420400)
chr3 (84-286)||(27635637-27635830)
chr3 (89-286)||(3306839-3307038)
chr3 (32-270)||(561769-562010)
chr3 (32-166)||(28100143-28100277)
chr3 (51-270)||(25635423-25635644)
chr3 (138-284)||(47701652-47701801)
chr3 (33-205)||(54884177-54884348)
chr3 (32-171)||(28181043-28181182)
chr3 (51-188)||(23637065-23637200)
chr3 (51-270)||(1674014-1674227)
chr3 (33-159)||(28137415-28137541)
chr3 (32-205)||(53597260-53597430)
chr3 (117-270)||(24181486-24181644)
chr3 (32-270)||(36871295-36871535)
chr3 (154-285)||(25634030-25634164)
chr3 (55-205)||(4560355-4560497)
chr3 (73-206)||(14634504-14634638)
chr3 (73-243)||(1620483-1620657)
chr3 (204-286)||(41849254-41849337)
chr3 (204-282)||(35919098-35919177)
chr3 (32-103)||(41849173-41849244)
chr3 (216-282)||(53894040-53894107)
chr3 (91-273)||(29913949-29914132)
chr3 (91-273)||(47878165-47878350)
chr3 (227-286)||(42992605-42992664)
chr3 (73-150)||(7768632-7768709)
chr3 (32-115)||(24177300-24177380)
chr3 (73-150)||(11066652-11066731)
chr3 (33-147)||(13419904-13420015)
chr3 (91-150)||(27762107-27762165)
chr3 (88-150)||(10094195-10094256)
chr3 (88-150)||(10201075-10201136)
chr3 (32-78)||(11163171-11163217)
chr3 (88-150)||(16462203-16462264)
chr3 (88-150)||(22626105-22626166)
chr3 (88-150)||(47883003-47883064)
chr3 (100-205)||(11007587-11007683)
chr3 (91-269)||(54188512-54188692)
chr3 (91-150)||(54193229-54193287)
chr3 (96-150)||(4535622-4535675)
chr3 (88-150)||(10100212-10100273)
chr3 (88-150)||(10208121-10208182)
chr3 (199-286)||(10612761-10612848)
chr3 (88-150)||(11079517-11079578)
chr3 (88-150)||(16996875-16996936)
chr3 (88-150)||(27544273-27544334)
chr3 (104-282)||(46966633-46966816)
chr3 (55-100)||(7606828-7606873)
chr3 (206-259)||(28181185-28181238)
chr3 (88-136)||(6303310-6303358)
chr3 (91-273)||(10897008-10897193)
chr3 (32-115)||(25633944-25634024)
chr3 (51-113)||(31021300-31021361)
chr3 (251-286)||(8183113-8183148)
chr3 (91-150)||(20031439-20031497)
chr3 (199-267)||(1736319-1736388)
chr3 (199-267)||(18552897-18552966)
chr3 (72-150)||(23941821-23941902)
chr3 (32-65)||(27635830-27635863)
chr3 (199-267)||(30709804-30709873)
chr3 (254-286)||(880219-880251)
chr3 (88-136)||(7418064-7418112)
chr3 (199-273)||(10595028-10595104)
chr3 (88-148)||(38002869-38002928)
chr3 (199-273)||(48390296-48390372)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (32-286)||(20137090-20137347)
chr7 (32-286)||(44724630-44724887)
chr7 (32-286)||(443646-443904)
chr7 (32-282)||(38394037-38394290)
chr7 (32-282)||(48457704-48457957)
chr7 (32-286)||(13099455-13099714)
chr7 (32-286)||(24748645-24748903)
chr7 (32-286)||(21592124-21592381)
chr7 (32-286)||(4295915-4296173)
chr7 (51-282)||(7092198-7092431)
chr7 (32-286)||(21990201-21990458)
chr7 (32-285)||(20626089-20626345)
chr7 (32-285)||(20629980-20630236)
chr7 (32-285)||(20642399-20642655)
chr7 (32-286)||(42330978-42331237)
chr7 (32-282)||(20299510-20299764)
chr7 (32-286)||(27306213-27306468)
chr7 (32-286)||(31435027-31435285)
chr7 (32-282)||(7470007-7470260)
chr7 (32-282)||(7471965-7472218)
chr7 (32-282)||(40946379-40946632)
chr7 (33-282)||(35681-35933)
chr7 (32-282)||(20297413-20297666)
chr7 (32-282)||(40836728-40836980)
chr7 (32-286)||(9679110-9679367)
chr7 (32-286)||(9680870-9681128)
chr7 (32-282)||(1850032-1850285)
chr7 (32-282)||(3878628-3878881)
chr7 (32-286)||(11355309-11355566)
chr7 (33-282)||(44616-44868)
chr7 (32-280)||(1046912-1047162)
chr7 (32-286)||(39145967-39146225)
chr7 (32-282)||(18345592-18345845)
chr7 (32-282)||(28487604-28487857)
chr7 (32-282)||(43253502-43253754)
chr7 (32-281)||(3035772-3036027)
chr7 (32-280)||(1049283-1049533)
chr7 (32-280)||(28485617-28485867)
chr7 (32-283)||(37412109-37412366)
chr7 (32-286)||(42223208-42223466)
chr7 (51-282)||(7094445-7094678)
chr7 (32-286)||(21678117-21678372)
chr7 (32-286)||(21680078-21680338)
chr7 (32-280)||(25542581-25542830)
chr7 (32-273)||(27832631-27832871)
chr7 (32-282)||(7351637-7351890)
chr7 (32-282)||(31155896-31156149)
chr7 (32-286)||(25276192-25276438)
chr7 (32-206)||(11757280-11757455)
chr7 (32-286)||(24258514-24258776)
chr7 (59-282)||(38396713-38396938)
chr7 (32-282)||(7349262-7349511)
chr7 (70-232)||(20091583-20091745)
chr7 (87-270)||(2935374-2935560)
chr7 (32-286)||(24813479-24813733)
chr7 (87-282)||(22137184-22137381)
chr7 (87-282)||(40552211-40552408)
chr7 (87-282)||(22108173-22108370)
chr7 (87-282)||(40549933-40550130)
chr7 (32-232)||(24817389-24817588)
chr7 (32-228)||(22828672-22828871)
chr7 (87-270)||(1606486-1606671)
chr7 (32-174)||(26804620-26804765)
chr7 (135-286)||(22393876-22394031)
chr7 (87-270)||(9027191-9027376)
chr7 (32-205)||(22251611-22251780)
chr7 (51-205)||(7188611-7188763)
chr7 (126-273)||(26295592-26295743)
chr7 (73-270)||(24465629-24465829)
chr7 (111-205)||(6348912-6349006)
chr7 (83-270)||(6332321-6332514)
chr7 (42-286)||(11081569-11081818)
chr7 (73-270)||(16297018-16297222)
chr7 (32-99)||(18567664-18567731)
chr7 (73-150)||(11084467-11084544)
chr7 (216-282)||(11759364-11759431)
chr7 (51-128)||(22392534-22392608)
chr7 (121-243)||(6046633-6046759)
chr7 (230-286)||(26804762-26804818)
chr7 (42-205)||(6048932-6049094)
chr7 (80-179)||(40281468-40281568)
chr7 (88-273)||(25351353-25351539)
chr7 (88-273)||(25357047-25357233)
chr7 (88-273)||(25410130-25410318)
chr7 (88-150)||(21369642-21369703)
chr7 (88-287)||(7069780-7069980)
chr7 (73-150)||(26210631-26210710)
chr7 (91-273)||(44512520-44512704)
chr7 (88-150)||(2120899-2120960)
chr7 (88-150)||(3320171-3320232)
chr7 (88-150)||(3324919-3324980)
chr7 (88-150)||(7074787-7074848)
chr7 (88-150)||(25405393-25405454)
chr7 (88-150)||(42006663-42006724)
chr7 (91-150)||(30246973-30247031)
chr7 (88-150)||(8378625-8378686)
chr7 (88-150)||(15541116-15541177)
chr7 (199-264)||(55955-56020)
chr7 (97-282)||(6067183-6067373)
chr7 (88-129)||(12310157-12310198)
chr7 (249-282)||(22251570-22251603)
chr7 (199-273)||(7464513-7464589)
chr7 (199-273)||(34546874-34546950)
chr7 (91-139)||(44143997-44144045)
chr7 (91-150)||(34546984-34547042)
chr7 (219-267)||(9190052-9190101)
chr7 (204-271)||(42006780-42006849)
chr7 (199-267)||(46516334-46516403)
chr7 (219-273)||(2075247-2075303)
chr7 (216-267)||(20284093-20284145)
chr7 (216-267)||(33332491-33332543)
[»] chr4 (131 HSPs)
chr4 (32-286)||(38928158-38928416)
chr4 (32-282)||(14633414-14633666)
chr4 (32-286)||(40637169-40637426)
chr4 (32-286)||(24880546-24880804)
chr4 (32-286)||(24879084-24879342)
chr4 (32-286)||(22800843-22801100)
chr4 (32-286)||(24888891-24889148)
chr4 (32-286)||(48486414-48486671)
chr4 (33-286)||(40091396-40091652)
chr4 (36-282)||(47274825-47275073)
chr4 (32-282)||(8631404-8631657)
chr4 (37-286)||(17662226-17662478)
chr4 (32-282)||(37089357-37089609)
chr4 (32-286)||(19095977-19096235)
chr4 (36-286)||(36921474-36921728)
chr4 (32-282)||(9148348-9148600)
chr4 (32-286)||(12395826-12396083)
chr4 (32-282)||(22802719-22802972)
chr4 (32-282)||(24348313-24348566)
chr4 (32-286)||(33415469-33415725)
chr4 (36-286)||(16453408-16453662)
chr4 (30-286)||(619429-619687)
chr4 (32-286)||(12400788-12401045)
chr4 (32-282)||(22046671-22046923)
chr4 (32-282)||(26085962-26086214)
chr4 (36-286)||(36919565-36919819)
chr4 (32-282)||(5198515-5198768)
chr4 (32-282)||(18847248-18847500)
chr4 (32-282)||(22044376-22044628)
chr4 (32-282)||(11435050-11435302)
chr4 (32-273)||(14787423-14787669)
chr4 (32-280)||(47868496-47868747)
chr4 (32-282)||(38409300-38409552)
chr4 (32-282)||(51015341-51015593)
chr4 (46-282)||(6764953-6765192)
chr4 (32-286)||(36378387-36378645)
chr4 (32-263)||(56030539-56030770)
chr4 (32-282)||(2484858-2485110)
chr4 (32-282)||(7941416-7941671)
chr4 (30-285)||(37313047-37313306)
chr4 (32-282)||(11006222-11006475)
chr4 (32-270)||(41997587-41997828)
chr4 (50-285)||(16455354-16455591)
chr4 (32-286)||(36380444-36380702)
chr4 (32-282)||(11008553-11008804)
chr4 (32-270)||(22134615-22134853)
chr4 (32-282)||(31849584-31849837)
chr4 (32-270)||(22132389-22132628)
chr4 (32-286)||(27499140-27499394)
chr4 (32-247)||(13544054-13544272)
chr4 (32-282)||(44599823-44600076)
chr4 (32-206)||(3824634-3824808)
chr4 (32-206)||(5637529-5637703)
chr4 (32-286)||(19322791-19323047)
chr4 (32-282)||(16934128-16934381)
chr4 (32-282)||(22780358-22780611)
chr4 (32-282)||(22782723-22782976)
chr4 (32-282)||(18709149-18709401)
chr4 (36-280)||(9176461-9176708)
chr4 (32-282)||(9174131-9174384)
chr4 (32-282)||(16931774-16932027)
chr4 (80-286)||(2891434-2891644)
chr4 (85-286)||(13547302-13547506)
chr4 (32-270)||(18409344-18409585)
chr4 (114-284)||(4215483-4215656)
chr4 (32-270)||(18537470-18537710)
chr4 (32-282)||(53405225-53405481)
chr4 (132-282)||(5635461-5635614)
chr4 (32-263)||(47210756-47210978)
chr4 (32-270)||(38890221-38890461)
chr4 (131-282)||(11437557-11437710)
chr4 (32-270)||(18534828-18535068)
chr4 (51-286)||(30136665-30136902)
chr4 (32-192)||(52942537-52942684)
chr4 (138-286)||(5101130-5101280)
chr4 (32-286)||(8756232-8756488)
chr4 (72-270)||(12102221-12102425)
chr4 (86-232)||(15032584-15032733)
chr4 (32-165)||(3937314-3937447)
chr4 (32-155)||(6132967-6133090)
chr4 (73-270)||(28453818-28454020)
chr4 (72-270)||(31983524-31983727)
chr4 (73-286)||(25357772-25357995)
chr4 (88-270)||(16185831-16186018)
chr4 (87-243)||(3982200-3982362)
chr4 (73-205)||(47150959-47151092)
chr4 (185-286)||(47563009-47563113)
chr4 (33-270)||(9863805-9864049)
chr4 (157-286)||(24446635-24446754)
chr4 (73-203)||(40999017-40999148)
chr4 (33-261)||(10112966-10113198)
chr4 (204-273)||(14789422-14789494)
chr4 (32-98)||(24446756-24446822)
chr4 (73-232)||(9022438-9022603)
chr4 (229-286)||(52942469-52942526)
chr4 (199-286)||(6133101-6133189)
chr4 (91-270)||(31300427-31300608)
chr4 (159-274)||(49088791-49088911)
chr4 (33-98)||(38270158-38270223)
chr4 (88-283)||(5336764-5336964)
chr4 (91-273)||(15316961-15317145)
chr4 (232-286)||(3937255-3937309)
chr4 (214-267)||(54867188-54867241)
chr4 (91-270)||(16489352-16489533)
chr4 (91-150)||(25699752-25699810)
chr4 (88-150)||(4570094-4570155)
chr4 (88-150)||(7050378-7050439)
chr4 (88-150)||(11853549-11853610)
chr4 (32-73)||(5101092-5101133)
chr4 (91-273)||(8529270-8529455)
chr4 (87-201)||(54906737-54906852)
chr4 (249-284)||(3824593-3824628)
chr4 (91-150)||(4556180-4556238)
chr4 (91-150)||(4558314-4558372)
chr4 (91-150)||(18586969-18587027)
chr4 (88-286)||(55822265-55822465)
chr4 (51-115)||(10114443-10114505)
chr4 (199-273)||(4884986-4885062)
chr4 (91-273)||(16688934-16689119)
chr4 (199-267)||(31985658-31985726)
chr4 (91-150)||(15831144-15831202)
chr4 (87-150)||(29609591-29609654)
chr4 (125-160)||(38270120-38270155)
chr4 (91-150)||(47566496-47566554)
chr4 (88-146)||(16638827-16638884)
chr4 (199-267)||(10047383-10047452)
chr4 (199-267)||(39245998-39246067)
chr4 (94-149)||(3760105-3760161)
chr4 (91-123)||(4884877-4884909)
chr4 (219-273)||(18587098-18587154)
chr4 (199-273)||(36769591-36769667)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (32-282)||(183626-183878)
scaffold0005 (32-273)||(52061-52307)
scaffold0005 (204-273)||(50236-50308)
[»] chr5 (101 HSPs)
chr5 (32-286)||(18511193-18511450)
chr5 (32-282)||(25804066-25804318)
chr5 (32-286)||(21948067-21948324)
chr5 (32-275)||(10529091-10529337)
chr5 (32-286)||(658337-658591)
chr5 (36-284)||(6745114-6745364)
chr5 (32-286)||(16092180-16092438)
chr5 (32-286)||(39854524-39854781)
chr5 (37-286)||(695924-696176)
chr5 (32-286)||(2818316-2818574)
chr5 (32-286)||(1189588-1189847)
chr5 (32-286)||(18509299-18509556)
chr5 (32-282)||(25921458-25921711)
chr5 (32-286)||(40221563-40221821)
chr5 (32-286)||(24126897-24127154)
chr5 (32-286)||(25904144-25904401)
chr5 (69-286)||(20505824-20506042)
chr5 (32-284)||(17818475-17818728)
chr5 (32-282)||(2174960-2175212)
chr5 (32-282)||(4236670-4236922)
chr5 (32-286)||(10474304-10474561)
chr5 (32-282)||(18466725-18466978)
chr5 (32-286)||(26097774-26098029)
chr5 (32-282)||(27910491-27910744)
chr5 (32-282)||(38882147-38882399)
chr5 (32-282)||(18469052-18469303)
chr5 (32-286)||(17072924-17073182)
chr5 (32-281)||(18596686-18596939)
chr5 (32-286)||(36402309-36402566)
chr5 (32-286)||(6756535-6756790)
chr5 (32-286)||(31472593-31472851)
chr5 (32-283)||(16776199-16776452)
chr5 (38-284)||(6747353-6747600)
chr5 (32-282)||(27912577-27912830)
chr5 (38-286)||(2954463-2954714)
chr5 (58-287)||(41585724-41585956)
chr5 (32-282)||(34477038-34477292)
chr5 (32-273)||(37705774-37706018)
chr5 (32-282)||(34479403-34479657)
chr5 (32-286)||(39397974-39398231)
chr5 (33-282)||(10586873-10587126)
chr5 (32-282)||(31545121-31545374)
chr5 (32-282)||(21684437-21684689)
chr5 (32-286)||(31465970-31466216)
chr5 (53-286)||(2723964-2724191)
chr5 (32-282)||(15552286-15552539)
chr5 (32-270)||(31179368-31179609)
chr5 (32-282)||(31542776-31543028)
chr5 (70-282)||(39798126-39798341)
chr5 (58-282)||(4410090-4410316)
chr5 (32-286)||(21288805-21289059)
chr5 (32-286)||(12555904-12556161)
chr5 (32-205)||(34530731-34530904)
chr5 (87-274)||(10749796-10749986)
chr5 (72-286)||(36208656-36208873)
chr5 (87-274)||(10757273-10757462)
chr5 (87-282)||(23665140-23665337)
chr5 (87-282)||(23793250-23793447)
chr5 (87-282)||(15354560-15354757)
chr5 (87-282)||(15356836-15357033)
chr5 (87-282)||(3373122-3373320)
chr5 (87-282)||(38960117-38960314)
chr5 (32-270)||(6661181-6661421)
chr5 (94-282)||(23741844-23742034)
chr5 (51-286)||(9020280-9020518)
chr5 (32-153)||(20045051-20045172)
chr5 (51-286)||(20053905-20054135)
chr5 (32-149)||(20043091-20043208)
chr5 (33-205)||(17413232-17413402)
chr5 (73-270)||(15143547-15143750)
chr5 (32-142)||(26098379-26098489)
chr5 (179-286)||(26098269-26098380)
chr5 (117-206)||(42770936-42771025)
chr5 (88-270)||(15445263-15445453)
chr5 (91-205)||(4897828-4897943)
chr5 (205-286)||(20043206-20043288)
chr5 (73-270)||(34033563-34033768)
chr5 (87-271)||(23667415-23667601)
chr5 (73-231)||(2144599-2144763)
chr5 (92-159)||(42770867-42770934)
chr5 (33-150)||(4754198-4754312)
chr5 (87-145)||(29748443-29748502)
chr5 (88-150)||(1170811-1170872)
chr5 (88-150)||(31782578-31782639)
chr5 (88-150)||(35385573-35385634)
chr5 (88-149)||(16093413-16093473)
chr5 (91-150)||(25452498-25452556)
chr5 (88-150)||(2298122-2298183)
chr5 (88-150)||(10627364-10627425)
chr5 (32-73)||(20507659-20507700)
chr5 (93-150)||(25445501-25445557)
chr5 (87-150)||(32520533-32520597)
chr5 (73-205)||(35430259-35430394)
chr5 (199-273)||(42238372-42238448)
chr5 (91-150)||(28786407-28786465)
chr5 (88-150)||(1240428-1240489)
chr5 (199-283)||(26406451-26406536)
chr5 (199-267)||(17003984-17004053)
chr5 (161-205)||(20045210-20045254)
chr5 (219-273)||(22672966-22673022)
chr5 (219-273)||(25445628-25445684)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (32-284)||(19007657-19007912)
chr2 (32-286)||(6258798-6259053)
chr2 (32-286)||(6264129-6264387)
chr2 (32-286)||(42923490-42923747)
chr2 (32-286)||(21520674-21520931)
chr2 (33-282)||(19501996-19502248)
chr2 (32-282)||(45279969-45280222)
chr2 (32-286)||(22287317-22287574)
chr2 (32-286)||(28196654-28196909)
chr2 (32-286)||(40032034-40032296)
chr2 (32-282)||(23452222-23452475)
chr2 (51-282)||(42452817-42453050)
chr2 (36-286)||(34979558-34979813)
chr2 (35-286)||(11739540-11739795)
chr2 (57-286)||(43623561-43623793)
chr2 (32-282)||(19504331-19504583)
chr2 (32-282)||(27104816-27105067)
chr2 (32-286)||(17849134-17849391)
chr2 (65-286)||(5375327-5375550)
chr2 (32-286)||(17848460-17848714)
chr2 (32-282)||(42064532-42064785)
chr2 (32-282)||(13910030-13910282)
chr2 (36-286)||(14837294-14837542)
chr2 (32-286)||(44289048-44289306)
chr2 (51-286)||(18800294-18800530)
chr2 (42-244)||(45239000-45239206)
chr2 (32-286)||(28459171-28459428)
chr2 (32-282)||(35217948-35218201)
chr2 (32-282)||(35215571-35215824)
chr2 (32-286)||(3022180-3022446)
chr2 (32-192)||(15539553-15539713)
chr2 (87-282)||(36558849-36559047)
chr2 (87-282)||(36561126-36561324)
chr2 (32-282)||(24162208-24162450)
chr2 (32-271)||(31732772-31733003)
chr2 (128-286)||(22407435-22407596)
chr2 (32-286)||(22874151-22874405)
chr2 (70-270)||(11578104-11578309)
chr2 (32-270)||(17897242-17897480)
chr2 (73-270)||(20146604-20146806)
chr2 (87-282)||(45332166-45332364)
chr2 (71-270)||(40699429-40699634)
chr2 (151-286)||(22707732-22707872)
chr2 (51-200)||(27136195-27136343)
chr2 (88-205)||(20589763-20589881)
chr2 (181-286)||(22163003-22163111)
chr2 (58-157)||(38414194-38414291)
chr2 (141-264)||(7462950-7463077)
chr2 (150-286)||(23870951-23871090)
chr2 (73-286)||(35107351-35107570)
chr2 (33-172)||(38020220-38020349)
chr2 (32-112)||(22163106-22163185)
chr2 (87-205)||(15693974-15694094)
chr2 (100-270)||(37962938-37963109)
chr2 (33-205)||(43139395-43139564)
chr2 (32-88)||(22407591-22407647)
chr2 (87-243)||(17921769-17921927)
chr2 (88-150)||(28458949-28459011)
chr2 (88-150)||(2740941-2741002)
chr2 (72-148)||(26345661-26345738)
chr2 (33-232)||(35028595-35028795)
chr2 (74-130)||(27583479-27583535)
chr2 (243-286)||(15539510-15539553)
chr2 (73-150)||(34575230-34575308)
chr2 (88-150)||(2736205-2736266)
chr2 (87-148)||(10942634-10942696)
chr2 (87-148)||(10948503-10948565)
chr2 (88-150)||(17462436-17462497)
chr2 (88-150)||(20054886-20054947)
chr2 (88-150)||(22712637-22712698)
chr2 (88-150)||(22717346-22717407)
chr2 (88-150)||(39686983-39687044)
chr2 (88-150)||(45567409-45567470)
chr2 (111-202)||(13828411-13828503)
chr2 (91-273)||(17943540-17943723)
chr2 (91-273)||(27517633-27517818)
chr2 (91-150)||(12781342-12781400)
chr2 (91-150)||(17932637-17932695)
chr2 (91-150)||(30478997-30479055)
chr2 (87-199)||(30720684-30720796)
chr2 (204-273)||(38191129-38191200)
chr2 (32-70)||(5377629-5377667)
chr2 (87-148)||(7502990-7503052)
chr2 (77-148)||(41303155-41303228)
chr2 (182-267)||(14699016-14699100)
chr2 (91-150)||(37170873-37170931)
chr2 (229-267)||(17057369-17057407)
chr2 (229-267)||(17085352-17085390)
chr2 (97-150)||(27248021-27248075)
chr2 (88-150)||(39680045-39680106)
chr2 (199-286)||(39680156-39680244)
chr2 (224-273)||(42288105-42288154)
chr2 (88-120)||(20050172-20050204)
chr2 (219-273)||(20054759-20054815)
chr2 (199-267)||(21629948-21630016)
chr2 (219-273)||(30479126-30479182)
chr2 (91-123)||(33674552-33674584)
chr2 (199-243)||(37170778-37170822)
chr2 (88-136)||(38190997-38191045)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (32-286)||(30480484-30480741)
chr8 (32-286)||(15072807-15073065)
chr8 (32-282)||(3874107-3874360)
chr8 (32-282)||(32339406-32339659)
chr8 (32-286)||(27911111-27911367)
chr8 (32-286)||(27957530-27957786)
chr8 (32-286)||(14807848-14808115)
chr8 (32-286)||(27106878-27107135)
chr8 (32-286)||(14419171-14419429)
chr8 (32-275)||(608831-609077)
chr8 (32-286)||(28251548-28251805)
chr8 (34-286)||(1225265-1225521)
chr8 (32-281)||(15068078-15068330)
chr8 (32-282)||(28283206-28283457)
chr8 (32-282)||(22684638-22684894)
chr8 (32-282)||(15809316-15809568)
chr8 (32-282)||(27829394-27829646)
chr8 (33-282)||(43530213-43530465)
chr8 (32-282)||(27827083-27827335)
chr8 (32-286)||(41384841-41385098)
chr8 (32-282)||(4424115-4424368)
chr8 (32-282)||(36865635-36865887)
chr8 (32-282)||(43079699-43079952)
chr8 (32-282)||(18810805-18811057)
chr8 (32-283)||(13858469-13858722)
chr8 (36-286)||(25952621-25952875)
chr8 (32-282)||(44720940-44721193)
chr8 (32-282)||(5372161-5372416)
chr8 (32-286)||(15956058-15956312)
chr8 (33-282)||(18812980-18813231)
chr8 (32-282)||(43082070-43082323)
chr8 (32-286)||(41382770-41383016)
chr8 (36-286)||(15185695-15185944)
chr8 (51-270)||(21482429-21482649)
chr8 (32-270)||(24873178-24873419)
chr8 (51-261)||(21480621-21480832)
chr8 (32-286)||(33541391-33541626)
chr8 (36-181)||(14477377-14477522)
chr8 (69-270)||(31162343-31162551)
chr8 (73-273)||(3005624-3005829)
chr8 (58-232)||(181622-181798)
chr8 (73-270)||(31578273-31578476)
chr8 (70-270)||(31035252-31035459)
chr8 (32-153)||(37214317-37214429)
chr8 (33-202)||(31573794-31573961)
chr8 (141-270)||(2468126-2468259)
chr8 (32-131)||(5622877-5622976)
chr8 (36-112)||(26775302-26775378)
chr8 (157-286)||(35872434-35872553)
chr8 (87-243)||(17847677-17847830)
chr8 (218-286)||(37214245-37214314)
chr8 (32-98)||(35872555-35872621)
chr8 (88-186)||(13985163-13985262)
chr8 (88-286)||(6376141-6376343)
chr8 (32-115)||(2468261-2468340)
chr8 (87-205)||(3895972-3896092)
chr8 (204-282)||(14477521-14477601)
chr8 (155-268)||(16833769-16833886)
chr8 (88-150)||(9021228-9021289)
chr8 (88-150)||(16752643-16752704)
chr8 (88-150)||(16757388-16757449)
chr8 (88-150)||(28327908-28327969)
chr8 (88-150)||(28895502-28895563)
chr8 (88-150)||(30423212-30423274)
chr8 (251-286)||(181798-181833)
chr8 (91-150)||(590797-590855)
chr8 (91-150)||(33032657-33032715)
chr8 (88-150)||(4812608-4812669)
chr8 (73-149)||(13985933-13986011)
chr8 (88-150)||(28332631-28332692)
chr8 (91-148)||(29554908-29554964)
chr8 (199-273)||(17799418-17799494)
chr8 (32-107)||(31035166-31035238)
chr8 (91-150)||(3276347-3276405)
chr8 (88-123)||(17799571-17799606)
chr8 (91-150)||(25684646-25684704)
chr8 (88-150)||(2267144-2267205)
chr8 (219-286)||(4812470-4812538)
chr8 (87-150)||(33839043-33839105)
chr8 (219-273)||(9021101-9021157)
chr8 (229-273)||(10930193-10930237)
chr8 (224-264)||(18106084-18106124)
chr8 (219-273)||(23179555-23179611)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (32-286)||(11983010-11983267)
chr6 (32-286)||(13039830-13040088)
chr6 (32-286)||(13057270-13057528)
chr6 (32-286)||(9020002-9020259)
chr6 (32-286)||(3629846-3630102)
chr6 (32-282)||(1230234-1230487)
chr6 (32-282)||(28241306-28241559)
chr6 (32-287)||(3390455-3390714)
chr6 (32-286)||(32280072-32280330)
chr6 (32-286)||(3631920-3632176)
chr6 (32-282)||(14458752-14459003)
chr6 (32-282)||(4816216-4816469)
chr6 (32-282)||(14507161-14507413)
chr6 (32-282)||(30967277-30967530)
chr6 (32-286)||(15541121-15541378)
chr6 (32-286)||(25477350-25477615)
chr6 (32-284)||(26065062-26065312)
chr6 (32-284)||(26085031-26085281)
chr6 (36-286)||(3233706-3233965)
chr6 (32-280)||(30034590-30034841)
chr6 (36-275)||(15532674-15532915)
chr6 (32-282)||(19704552-19704807)
chr6 (32-282)||(2628871-2629123)
chr6 (32-272)||(20915351-20915594)
chr6 (32-286)||(30728805-30729066)
chr6 (80-286)||(1069699-1069909)
chr6 (32-225)||(15530166-15530360)
chr6 (55-270)||(5273213-5273431)
chr6 (32-282)||(26932546-26932800)
chr6 (32-282)||(12195500-12195753)
chr6 (30-286)||(24338429-24338688)
chr6 (32-286)||(12161539-12161793)
chr6 (33-286)||(14466399-14466657)
chr6 (87-282)||(26066109-26066307)
chr6 (51-270)||(15719740-15719961)
chr6 (72-286)||(12186052-12186271)
chr6 (87-282)||(26068380-26068578)
chr6 (87-282)||(29754694-29754892)
chr6 (87-282)||(33308988-33309185)
chr6 (51-286)||(15367129-15367364)
chr6 (36-205)||(22490720-22490889)
chr6 (32-270)||(3027848-3028089)
chr6 (87-282)||(33311257-33311454)
chr6 (71-270)||(16455421-16455625)
chr6 (32-164)||(19227514-19227646)
chr6 (71-270)||(26945258-26945463)
chr6 (51-203)||(17012137-17012287)
chr6 (131-270)||(15346522-15346664)
chr6 (73-270)||(19696556-19696759)
chr6 (74-206)||(28037794-28037927)
chr6 (73-286)||(25078539-25078755)
chr6 (42-270)||(22857949-22858181)
chr6 (199-286)||(10584241-10584329)
chr6 (88-242)||(12937219-12937376)
chr6 (51-229)||(20526902-20527081)
chr6 (151-286)||(25465572-25465710)
chr6 (87-201)||(7542452-7542567)
chr6 (73-148)||(11138423-11138499)
chr6 (91-273)||(17694846-17695030)
chr6 (132-205)||(30445699-30445773)
chr6 (88-242)||(12911471-12911629)
chr6 (199-273)||(3577484-3577559)
chr6 (32-78)||(1072069-1072115)
chr6 (96-150)||(5165936-5165989)
chr6 (88-150)||(13878727-13878788)
chr6 (88-150)||(13883475-13883536)
chr6 (88-150)||(16785919-16785980)
chr6 (88-150)||(26887345-26887406)
chr6 (88-150)||(31248835-31248896)
chr6 (88-150)||(35201447-35201508)
chr6 (88-150)||(3577636-3577696)
chr6 (199-273)||(13467461-13467536)
chr6 (91-150)||(17036058-17036116)
chr6 (155-205)||(28078261-28078310)
chr6 (36-84)||(13870608-13870656)
chr6 (199-273)||(25941781-25941857)
chr6 (95-150)||(12166267-12166321)
chr6 (91-150)||(22351973-22352031)
chr6 (161-205)||(3833481-3833526)
chr6 (91-148)||(19701985-19702041)
chr6 (94-150)||(25941650-25941704)
chr6 (91-171)||(26643179-26643259)
chr6 (91-171)||(26749145-26749225)
chr6 (199-286)||(30443533-30443622)
chr6 (219-286)||(35201309-35201377)
chr6 (91-150)||(13467585-13467642)
chr6 (51-101)||(15346477-15346524)
chr6 (32-64)||(17852618-17852650)
chr6 (219-273)||(22342795-22342851)
chr6 (199-267)||(22963704-22963772)
chr6 (199-267)||(23824621-23824689)
chr6 (32-83)||(32447502-32447554)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (36-282)||(4050-4298)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (32-286)||(11454-11711)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (32-282)||(69277-69529)
scaffold0025 (32-86)||(73207-73261)
scaffold0025 (47-97)||(73160-73210)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (32-286)||(14365-14620)
scaffold0131 (36-286)||(15073-15324)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (32-282)||(41468-41721)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (32-286)||(79235-79492)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (49-282)||(1438-1673)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (32-286)||(79909-80166)
scaffold0004 (88-150)||(188363-188424)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (32-282)||(6249-6502)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (32-282)||(29221-29473)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (32-282)||(91-344)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (32-282)||(2930-3182)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (32-286)||(85280-85538)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (34-233)||(2094-2294)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (51-270)||(1638-1860)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (51-270)||(15817-16039)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (87-282)||(22221-22418)
scaffold0140 (87-282)||(24496-24693)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (32-205)||(16716-16886)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (32-162)||(35689-35819)
scaffold0011 (204-286)||(35818-35901)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (83-205)||(4911-5034)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (216-280)||(4666-4731)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (88-202)||(57497-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (233-279)||(1439-1485)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (88-150)||(224819-224880)
scaffold0006 (199-267)||(5687-5756)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (91-150)||(16328-16386)
[»] scaffold0209 (2 HSPs)
scaffold0209 (219-273)||(16980-17036)
scaffold0209 (91-123)||(17133-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38925718 - 38925464
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  38925718 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 38925619  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38925618 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtaaaacggagggctgctctctccc 38925519  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38925518 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 38925464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17324876 - 17324619
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17324876 atagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 17324777  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  17324776 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 17324677  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324676 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17324619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 47906311 - 47906568
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47906311 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 47906410  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||     
T  47906411 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 47906510  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906511 ccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 47906568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50307787 - 50307528
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50307787 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 50307688  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  50307687 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 50307588  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50307587 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctct 50307528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10400068 - 10399815
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10400068 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 10399969  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  10399968 gactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10399869  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399868 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12302745 - 12302488
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12302745 atagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 12302646  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  12302645 gactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 12302546  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302545 ccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 12302488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15295074 - 15294821
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15295074 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 15294975  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||     
T  15294974 gactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 15294875  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294874 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 15823587 - 15823844
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  15823587 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctga 15823686  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||     
T  15823687 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 15823786  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823787 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 15823844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 39462560 - 39462817
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39462560 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 39462659  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||     
T  39462660 gactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctc 39462759  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462760 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 39462817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 51750080 - 51750333
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  51750080 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 51750179  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  51750180 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 51750279  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750280 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 18307154 - 18307407
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc 18307353  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18307354 agactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctct 18307407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50076908 - 50076655
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50076908 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaat 50076809  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | | |||||||||||||    
T  50076808 ttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 50076709  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076708 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 50076655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6995940 - 6995683
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6995940 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgg 6995841  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6995840 ggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 6995741  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995740 ctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6995683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2949471 - 2949215
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  2949471 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgg 2949372  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  2949371 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 2949272  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949271 ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 2949215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 16428694 - 16428952
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16428694 atagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 16428793  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca---tagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  16428794 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctct 16428893  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16428894 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 16428952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14098210 - 14097952
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14098210 atagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattag 14098111  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14098110 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14098011  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098010 cccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 14097952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 28840721 - 28840973
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  28840721 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28840820  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  28840821 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 28840919  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840920 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 279
Target Start/End: Original strand, 24325704 - 24325954
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  24325704 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgt 24325803  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||     
T  24325804 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctc 24325903  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 279  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325904 ccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28207302 - 28207051
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  28207302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggct 28207203  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 234  Q
    |||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28207202 ttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 28207103  T
Q  235 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207102 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 28207051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 13215122 - 13215375
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13215122 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 13215221  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  13215222 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgct 13215321  T
Q  225 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215322 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 41646961 - 41647218
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  41646961 atagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgc 41647060  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41647061 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 41647160  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41647161 catcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctct 41647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31425259 - 31424998
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaaaaga 127  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||    
T  31425259 atagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagaga 31425160  T
Q  128 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||    
T  31425159 ttgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgct 31425060  T
Q  225 ctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425059 ctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 31424998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 18839628 - 18839886
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||     
T  18839628 atagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatga 18839727  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||| |    
T  18839728 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctcttt 18839827  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839828 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctct 18839886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 39932114 - 39932368
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||     
T  39932114 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactga 39932213  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  39932214 gactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctctt 39932313  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932314 cccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2510564 - 2510312
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  2510564 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttg 2510465  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  2510464 gactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 2510366  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510365 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31735761 - 31735508
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  31735761 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgg 31735662  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  31735661 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 31735562  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735561 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46431947 - 46431693
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  46431947 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgg 46431848  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  46431847 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 46431749  T
Q  229 --ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431748 ccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 31489958 - 31490210
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31489958 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagact 31490057  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccca 233  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  31490058 ttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctcccccca 31490157  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31490158 gactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 31490210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Original strand, 2617557 - 2617808
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2617557 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2617656  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  2617657 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2617756  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2617757 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3579856 - 3579600
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  3579856 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattgg 3579757  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tagtgaaacgaagggctgctctctcc 230  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  3579756 ggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagtgaaacggatgattgctctctcc 3579657  T
Q  231 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3579656 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 3579600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28998493 - 28998236
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28998493 atagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 28998394  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||     
T  28998393 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 28998294  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998293 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 28998236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29004209 - 29003952
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29004209 atagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 29004110  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||     
T  29004109 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 29004010  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004009 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 29003952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50079063 - 50078803
Alignment:
Q  30 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50079063 gcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatt 50078964  T
Q  130 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| |||  | |||||||||    
T  50078963 tggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctct 50078864  T
Q  227 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50078863 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctct 50078803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Original strand, 6823056 - 6823306
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6823056 atagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 6823154  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  6823155 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 6823254  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823255 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 25127913 - 25128171
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25127913 atagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattga 25128012  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25128013 gacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctct 25128112  T
Q  229 c-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128113 ctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 25128171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27337173 - 27336923
Alignment:
Q  38 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggacttt 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  27337173 tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgacttt 27337074  T
Q  138 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||    
T  27337073 gggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 27336975  T
Q  235 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336974 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 27336923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25251510 - 25251257
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25251510 gtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactt 25251411  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc- 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  25251410 tgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccca 25251311  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251310 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 25251257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11457715 - 11457458
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11457715 atagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgg 11457616  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||     
T  11457615 gggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctc 11457516  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457515 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctct 11457458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 13761878 - 13762130
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  13761878 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgt 13761977  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||| ||||||     
T  13761978 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctc 13762076  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762077 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50248812 - 50248553
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |     
T  50248812 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcga 50248713  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctg--ctctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  | || ||  |||||    
T  50248712 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctc 50248613  T
Q  228 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248612 tcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 50248553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 6756568 - 6756826
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||    
T  6756568 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattg 6756665  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | | ||||||||    
T  6756666 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctc 6756765  T
Q  228 t--ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6756766 tccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctct 6756826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9241326 - 9241068
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9241326 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctct 9241068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17186368 - 17186110
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17186368 atagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttg 17186269  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||| || |||| || ||||||||||    
T  17186268 aactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctct 17186169  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17186168 cccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 17186110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 20302500 - 20302752
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  20302500 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactag 20302599  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||| || ||||||     
T  20302600 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctc 20302698  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302699 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4131619 - 4131360
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |    
T  4131619 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-g 4131521  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgct 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  4131520 gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 4131421  T
Q  225 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4131420 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 17324104 - 17324360
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||    
T  17324104 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattgg 17324203  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| | ||||| |||||    
T  17324204 aactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctct 17324303  T
Q  229 cccca-gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17324304 ccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 17324360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 17318935 - 17319185
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17318935 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattggg 17319028  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17319029 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctc 17319128  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319129 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27339370 - 27339114
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||     
T  27339370 atagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctga 27339271  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| |||||     
T  27339270 gactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctc 27339172  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339171 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 27339114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 28842536 - 28842788
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||     
T  28842536 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctga 28842635  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  |||||     
T  28842636 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctc 28842734  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842735 ccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 51752406 - 51752657
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  51752406 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctga 51752504  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  51752505 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctc 51752603  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752604 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432694
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc- 232  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  || |||||||||||||     
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  233 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctct 16432694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 16226208 - 16226461
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16226208 atagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 16226307  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  16226308 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 16226406  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16226407 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 286
Target Start/End: Original strand, 16429048 - 16429256
Alignment:
Q  82 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16429048 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 16429147  T
Q  182 ctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429148 ctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgt 16429247  T
Q  278 gttctctct 286  Q
    |||||||||    
T  16429248 gttctctct 16429256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 40133985 - 40134241
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  40133985 atagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 40134084  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||    
T  40134085 ggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct 40134184  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40134185 cccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 47179754 - 47180006
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47179754 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 47179853  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  47179854 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47179952  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47179953 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21948427 - 21948225
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  21948427 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgg 21948329  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  21948328 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T
Q  230 ccca 233  Q
    ||||    
T  21948228 ccca 21948225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  158 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  254 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Original strand, 48665218 - 48665393
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  48665218 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctg 48665317  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665318 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 48665393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 20291498 - 20291750
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |    
T  20291498 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactag 20291597  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||| | || |||| || |||||     
T  20291598 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctc 20291696  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20291697 ccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9459657 - 9459404
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9459657 atagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattg 9459558  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  9459557 agactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 9459459  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459458 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9463484 - 9463231
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9463484 atagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattg 9463385  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  9463384 agactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 9463286  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463285 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 47177403 - 47177655
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47177403 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattg 47177502  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  47177503 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47177601  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47177602 ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31423114 - 31422851
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaac-aaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31423114 atagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattg 31423015  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---------------agtgaaacga 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||                |||||||      
T  31423014 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacag 31422915  T
Q  216 agggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31422914 agggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15669613 - 15669375
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15669613 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 15669516  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca-at 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||   |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  15669515 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtcagtt 15669416  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  15669415 ttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctct 15669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115085
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 170  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  267 aattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttctctct 6115085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 42922292 - 42922514
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42922292 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 42922389  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat- 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |     
T  42922390 cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtg 42922489  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  42922490 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Original strand, 47451689 - 47451919
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451689 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 47451782  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||     
T  47451783 ggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctc 47451882  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47451883 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 270
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14183811 - 14183574
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  14183811 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattagg 14183714  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-at 245  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  14183713 cggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtt 14183614  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183613 ttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495193
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaa 49495212  T
Q  268 attcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||| ||| ||| ||||    
T  49495211 attcttatgtattccctct 49495193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 282
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  83 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  183 tcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 279  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757723 tcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  280 tct 282  Q
    |||    
T  51757822 tct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  157 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  254 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 286
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816184
Alignment:
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || | || |||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 23816184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Original strand, 6823926 - 6824091
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaaa 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||     
T  6823926 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaag 6824025  T
Q  125 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6824026 agattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8347476 - 8347298
Alignment:
Q  69 agggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347476 agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgt 8347377  T
Q  169 aacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8347376 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8349289 - 8349034
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |    
T  8349289 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattag 8349193  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||   |||| || |||||    
T  8349192 gactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctct 8349093  T
Q  229 cccca-gactaggtcaattt-agaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  8349092 ccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 8349034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18800775 - 18800640
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 169  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18800775 gggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgta 18800676  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18800675 tcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18800640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  169 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtca 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  264 acaaatt 270  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| || | | | ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 30790404  T
Q  266 aaa 268  Q
    |||    
T  30790403 aaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13125677 - 13125525
Alignment:
Q  52 acaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg- 150  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13125677 acaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggt 13125580  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
      | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13125579 ttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738653
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtca 243  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtca 30738653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 245
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat 245  Q
    |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613222
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    || ||||||||||||||| || |||||   |||| |||||| |||  || ||| |||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  267 aattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctct 26613222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 27916539 - 27916780
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| |    
T  27916539 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtg 27916635  T
Q  133 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    ||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  27916636 actttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctct 27916734  T
Q  227 ct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    || ||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  27916735 ctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279567
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag 149  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattag 28279423  T
Q  150 g-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc--agactaggtca 243  Q
    |   | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||   || | || ||| |||||  |||||||||||    
T  28279424 gtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtca 28279523  T
Q  244 at-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     | ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  28279524 gtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctct 28279567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26520321 - 26520205
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac------gggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  26520321 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttatt 26520222  T
Q  164 cttgtaacccattgata 180  Q
    |||||||||||||||||    
T  26520221 cttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 13358800 - 13358867
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358800 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 270
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  163 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaa-tttagaccgaact 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  258 gggtcaacaaatt 270  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 21353431  T
Q  190 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Original strand, 43104248 - 43104414
Alignment:
Q  80 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatt-cttgtaacccattg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| | ||||  ||||||||||||||||||   || || || || |||||||||| |||    
T  43104248 accttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccctttg 43104347  T
Q  178 atatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||    
T  43104348 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctcctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353178
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 170  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||| |||| |  |||||||||| |||| |||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcat 14353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393277
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggactt-gggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 2393367  T
Q  190 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||    
T  2393366 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 2393277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  241 tcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332719
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 115  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13598471 - 13598402
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  13598471 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 170  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  171 cccattgatatct 183  Q
    ||| |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 10115880 - 10115922
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10115880 gaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaaaagatt 10115922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Original strand, 9526578 - 9526650
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaat 269  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  9526578 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 145)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 1313430 - 1313687
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1313430 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgg 1313529  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  1313530 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 1313629  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313630 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 1313687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4308517 - 4308260
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4308517 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 4308418  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4308417 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 4308318  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308317 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 4308260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53917900 - 53917643
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53917900 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 53917801  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  53917800 gattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 53917701  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917700 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 53917643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53915732 - 53915475
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53915732 atagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 53915633  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||     
T  53915632 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctc 53915533  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915532 ccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 53915475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18099406 - 18099151
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18099406 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 18099307  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  18099306 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 18099207  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099206 ccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 45882960 - 45883218
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  45882960 atagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 45883059  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  45883060 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 45883159  T
Q  230 ccc--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883160 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 45883218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 38890061 - 38890314
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38890061 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 38890160  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  38890161 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 38890260  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890261 ccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 42990325 - 42990582
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  42990325 atagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 42990424  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||     
T  42990425 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctc 42990524  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990525 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 42990582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43423699 - 43423442
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43423699 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 43423600  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||    
T  43423599 ggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctc 43423500  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423499 cctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 43423442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 3314705 - 3314963
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3314705 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 3314804  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  3314805 ggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 3314904  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314905 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 3314963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1626919 - 1626662
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1626919 atagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgg 1626820  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1626819 gactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 1626720  T
Q  230 -cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626719 gcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 1626662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 43228312 - 43228569
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  43228312 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43228411  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  43228412 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 43228511  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43228512 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 43228569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43421651 - 43421394
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421651 atagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 43421552  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||     
T  43421551 ggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctc 43421452  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421451 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 43421394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 1321500 - 1321753
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  1321500 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 1321599  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  1321600 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 1321699  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321700 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9604843 - 9604586
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  9604843 atagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttga 9604744  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  9604743 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 9604644  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604643 ccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 9604586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18097136 - 18096879
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18097136 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 18097037  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||    
T  18097036 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctc 18096937  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18096936 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctct 18096879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27101417 - 27101160
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27101417 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgg 27101318  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||     
T  27101317 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 27101218  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27101217 ccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 27101160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 30005862 - 30006119
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||    
T  30005862 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgg 30005961  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  30005962 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 30006061  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006062 ccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 30006119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 43226106 - 43226361
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  43226106 atagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43226205  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  43226206 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 43226305  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43226306 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 43226361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10956263 - 10956010
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  10956263 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 10956164  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  10956163 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 10956064  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956063 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 25533463 - 25533716
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||     
T  25533463 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctga 25533562  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  25533563 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 25533662  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533663 ccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28102238 - 28101981
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28102238 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 28102139  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  28102138 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctc 28102039  T
Q  230 cccaga-ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102038 cccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 28101981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 18162684 - 18162941
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18162684 atagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18162783  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  18162784 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 18162883  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18162884 cccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctct 18162941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53468692 - 53468432
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  53468692 atagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgg 53468593  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct-c 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53468592 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctac 53468493  T
Q  228 tccccag--actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468492 cccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 53468432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10084625 - 10084372
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||    
T  10084625 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgg 10084526  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  10084525 gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10084426  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084425 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 11170425 - 11170678
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  11170425 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgg 11170524  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  11170525 gactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 11170624  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11170625 ccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 39715490 - 39715743
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39715490 atagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 39715589  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||    
T  39715590 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatagtgaaacagatggttgctctc-ccc 39715688  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715689 catactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 39715743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51727242 - 51726990
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||     
T  51727242 atagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctga 51727144  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||     
T  51727143 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 51727044  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727043 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5927000 - 5926746
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5927000 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 5926901  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | | ||||||||||    
T  5926900 gacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctc 5926801  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5926800 ccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 880688 - 880430
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  880688 atagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattg 880589  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||    
T  880588 gggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctct 880489  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880488 cccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 880430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 6484381 - 6484638
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6484381 tagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattgg 6484480  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  6484481 ggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 6484580  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484581 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6484638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 51943392 - 51943648
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51943392 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 51943491  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  51943492 ggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 51943590  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51943591 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctct 51943648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 5191674 - 5191925
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5191674 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 5191773  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| | |  ||||||| ||||||    
T  5191774 gactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctc 5191872  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191873 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5522857 - 5522610
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  5522857 gtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 5522758  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-ca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||||| ||    
T  5522757 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgca 5522659  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522658 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24979728 - 24979986
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  24979728 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattga 24979827  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  24979828 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 24979927  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979928 cccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 24979986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4104131 - 4103879
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  4104131 atagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 4104032  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||| |||     
T  4104031 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctc 4103933  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103932 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10958559 - 10958306
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||     
T  10958559 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 10958460  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  10958459 cactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctc 10958360  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10958359 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219363
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 32219305  T
Q  230 -cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219306 tcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 32219363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 36011848 - 36012105
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  36011848 atagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgt 36011947  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-t 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| |    
T  36011948 gactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctt 36012047  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36012048 cttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 36012105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||  |||||| | || ||||||||||||| |    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 51674997 - 51674745
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  51674997 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattt 51674898  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccca 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  51674897 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccca 51674798  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674797 taccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctct 51674745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 3859549 - 3859801
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  3859549 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 3859648  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  3859649 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctc 3859747  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859748 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32264275 - 32264017
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  32264275 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 32264176  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||    
T  32264175 aactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 32264076  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32264075 tcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctct 32264017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 25388927 - 25389179
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25388927 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 25389025  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  25389026 ggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 25389124  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25389125 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48361907 - 48361650
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48361907 atagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgg 48361808  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||     
T  48361807 ggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctc 48361708  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361707 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 48361650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 62 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688139
Alignment:
Q  62 gggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  162 ttcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  258 gggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctct 25688139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 267
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591442
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctccccag 53591409  T
Q  235 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  53591410 actaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 746778 - 747031
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  746778 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 746877  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||| |||||||||    
T  746878 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctct 746976  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  746977 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666792
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ct 4666732  T
Q  227 ctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4666733 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 4666792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22114541 - 22114288
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22114541 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22114442  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||| || ||||||    
T  22114441 gattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctc 22114342  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| | || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114341 ccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12268201 - 12267954
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12268201 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12268102  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  12268101 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 12268013  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268012 cccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 12267954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47149131 - 47148874
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaa-caaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47149131 atagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 47149033  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  47149032 ggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctct 47148933  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  47148932 cccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctct 47148874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10621766 - 10621513
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621766 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 10621667  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  10621666 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 10621568  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10621567 cccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10191545 - 10191305
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  | |    
T  10191545 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-g 10191447  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  10191446 gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10191347  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10191346 cctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 26720569 - 26720821
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  26720569 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgg 26720667  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| | | ||||||||||    
T  26720668 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctc 26720767  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720768 ccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 286
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232078
Alignment:
Q  59 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  159 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  255 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6232078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 15780896 - 15781157
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||    
T  15780896 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 15780995  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgtta---ctcatcatagtgaaacgaaggg---ctgctc 225  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||    |||| |||||| |||||||||   ||||||    
T  15780996 ttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctc 15781095  T
Q  226 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15781096 tctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctct 15781157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28413268 - 28413014
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28413268 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattg 28413169  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  28413168 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 28413070  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413069 cccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 458305 - 458558
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  458305 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 458404  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  458405 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 458503  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  458504 cccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 23633498 - 23633731
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23633498 aacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 23633593  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaattt 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23633594 cggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctccccagactaggtcaattt 23633692  T
Q  248 agaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23633693 agaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 23633731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 455928 - 456181
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  455928 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 456027  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  456028 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 456126  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  456127 cccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6063682 - 6063429
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 6063484  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063483 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6066032 - 6065779
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6066032 atagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6065933  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | | |||||||||||    
T  6065932 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctct 6065834  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065833 cccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 50494020 - 50494273
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  50494020 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattg 50494119  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  50494120 ggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 50494218  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50494219 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Original strand, 6561831 - 6562005
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6561831 atagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 6561930  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  6561931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcat 6562005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28761646 - 28761407
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  28761646 aacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattagg 28761547  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaa-t 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  28761546 cgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatt 28761447  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28761446 ttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 29956707 - 29956907
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||    
T  29956707 atagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgg 29956806  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  29956807 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 29956906  T
Q  230 c 230  Q
    |    
T  29956907 c 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 890009 - 889779
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  890009 atagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttg 889911  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||    
T  889910 gggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttct 889811  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgg 259  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  889810 cccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 268  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  269 ttcttttgtgttctct 284  Q
    ||||||||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 268  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  269 ttcttttgtgttctct 284  Q
    ||||||||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 38210391 - 38210644
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38210391 atagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 38210490  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | || ||||||||||    
T  38210491 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctct 38210589  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38210590 cccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 54691810 - 54691553
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| |    
T  54691810 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattag 54691711  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54691710 ggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctc 54691611  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  54691610 ccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctct 54691553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 282
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  75 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  175 ttgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  272 ttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35918185 - 35917944
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  35918185 atagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaaga 35918086  T
Q  126 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgc 223  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || |||||    
T  35918085 gactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgc 35917986  T
Q  224 tctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35917985 tctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 17795301 - 17795537
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  17795301 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 17795397  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17795398 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 17795497  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17795498 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctct 17795537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 19103741 - 19103977
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  19103741 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 19103837  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19103838 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 19103937  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19103938 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctct 19103977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 31151369 - 31151623
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31151369 atagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgg 31151465  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca---tcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||| |||| |||||||||||||    
T  31151466 gactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  229 -ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctct 31151623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 42992307 - 42992548
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  42992307 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtgg 42992406  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
     |||||||||||               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||||||||    
T  42992407 -actttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctc 42992490  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42992491 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctct 42992548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 176
Target Start/End: Original strand, 35777442 - 35777587
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35777442 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 35777541  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777542 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13420400 - 13420208
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13420400 aacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 13420304  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   || ||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13420303 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctcaccagactaggtca 13420208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27635830 - 27635637
Alignment:
Q  84 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 183  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27635830 tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatct 27635743  T
Q  184 cttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635742 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 27635643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 286
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307038
Alignment:
Q  89 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  189 gtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctctc 3307037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 562010 - 561769
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  562010 atagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattga 561914  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  561913 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct 561814  T
Q  229 cc--ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||  |||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  561813 ccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28100277 - 28100143
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28100277 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgg 28100178  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 166  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100177 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 25635423 - 25635644
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25635423 aacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 25635520  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || |||||||  |||| ||||||||||||  | ||||| |||||    
T  25635521 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctaggccaatt 25635620  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    | |||| ||||| || ||||||||    
T  25635621 tggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701652
Alignment:
Q  138 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  235 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 54884177 - 54884348
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||      
T  54884177 tagagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaa 54884276  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54884277 actttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Original strand, 28181043 - 28181182
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28181043 atagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgg 28181142  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181143 gactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Original strand, 23637065 - 23637200
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  23637065 aacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattagg 23637162  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637163 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 1674014 - 1674227
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  1674014 aacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaataga 1674111  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-tta 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||      |  || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  1674112 cgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac------ttttggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtatta 1674205  T
Q  249 gaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  1674206 gaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagact 159  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Original strand, 53597260 - 53597430
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||     
T  53597260 atagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattga 53597356  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  53597357 gattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcat 53597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 270
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  117 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  214 gaagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    | | | ||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36871535 - 36871295
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  36871535 atagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgg 36871439  T
Q  132 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||    
T  36871438 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctc 36871340  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||    
T  36871339 tcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  154 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttag 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||      
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  250 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  55 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  155 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
       |||    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca 243  Q
    || |||||||||| |||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 286
Target Start/End: Original strand, 41849254 - 41849337
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849254 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 41849337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35919177 - 35919098
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919177 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 41849173 - 41849244
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41849173 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53894107 - 53894040
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894107 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  190 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 47878256  T
Q  190 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 286
Target Start/End: Original strand, 42992605 - 42992664
Alignment:
Q  227 ctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42992605 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctct 42992664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Original strand, 24177300 - 24177380
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 115  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177300 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 13419904 - 13420015
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||       
T  13419904 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaa 13420000  T
Q  133 actttgggtagaatt 147  Q
    | |||||||||||||    
T  13420001 attttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 11163171 - 11163217
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11163171 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgatt 11163217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007587
Alignment:
Q  100 gattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact 199  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 54188606  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaat 269  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  54188607 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  96 ttaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100212
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10612848 - 10612761
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10612848 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctctct 10612761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079578
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544334
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966633
Alignment:
Q  104 gagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca 201  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |  |||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctcttt-gtaaagaaactca 46966718  T
Q  202 tcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||   |||| |||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||    
T  46966717 tcattatagtggaacagagagctgccctctccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttct 46966633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  55 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattagg 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181238
Alignment:
Q  206 agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgg 259  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccctagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 10897102  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Original strand, 25633944 - 25634024
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 115  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633944 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 113  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8183148 - 8183113
Alignment:
Q  251 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183148 ccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 8183113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 1736319 - 1736388
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1736319 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 18552897 - 18552966
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  18552897 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Original strand, 23941821 - 23941902
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttggg-aaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23941821 gttgatttaccttgaataaatactattaggcttaagtctctttggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattagg 23941902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27635863 - 27635830
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 65  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635863 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 30709804 - 30709873
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  30709804 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 880251 - 880219
Alignment:
Q  254 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880251 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 880219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418112
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10595104 - 10595028
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10595104 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48390372 - 48390296
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48390372 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 48390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20137347 - 20137090
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20137347 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgg 20137248  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  20137247 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 20137148  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137147 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 20137090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 44724630 - 44724887
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  44724630 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgg 44724729  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  44724730 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 44724829  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724830 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 44724887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 443646 - 443904
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  443646 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 443745  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  443746 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctc 443845  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443846 ccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 443904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 38394037 - 38394290
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  38394037 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 38394136  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  38394137 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 38394236  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394237 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 48457704 - 48457957
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  48457704 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 48457803  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  48457804 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 48457903  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457904 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13099714 - 13099455
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13099714 atagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgg 13099615  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099614 ggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc 13099515  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099514 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 13099455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24748645 - 24748903
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24748645 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgg 24748744  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  24748745 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 24748844  T
Q  229 cc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24748845 cctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 24748903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21592381 - 21592124
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21592381 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgg 21592282  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  21592281 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 21592182  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592181 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 21592124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4296173 - 4295915
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4296173 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 4296074  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||    
T  4296073 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatct 4295974  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4295973 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctct 4295915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 7092232  T
Q  249 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092231 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 21990201 - 21990458
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21990201 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattga 21990300  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||    
T  21990301 ggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 21990400  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990401 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 21990458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Original strand, 20626089 - 20626345
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  20626089 atagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 20626188  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  20626189 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20626288  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626289 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Original strand, 20629980 - 20630236
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  20629980 atagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 20630079  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  20630080 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20630179  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630180 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Original strand, 20642399 - 20642655
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  20642399 atagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 20642498  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  20642499 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20642598  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642599 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42331237 - 42330978
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaaaagatt 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42331237 atagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagatt 42331138  T
Q  130 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||  ||||    
T  42331137 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctc 42331038  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331037 tcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 42330978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 20299510 - 20299764
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20299510 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 20299609  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||| ||||||||    
T  20299610 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctct 20299709  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299710 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27306468 - 27306213
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27306468 atagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27306369  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  27306368 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 27306269  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27306268 ccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 27306213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31435285 - 31435027
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  31435285 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 31435186  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  31435185 aactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 31435086  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435085 cccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 31435027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7470260 - 7470007
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  7470260 atagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| ||     
T  7470160 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7472218 - 7471965
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  7472218 atagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || | |||||||||||     
T  7472118 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 40946379 - 40946632
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  40946379 atagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgg 40946478  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||     
T  40946479 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctc 40946578  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946579 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 35681 - 35933
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  35681 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 35780  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||| |||||    
T  35781 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcc 35880  T
Q  231 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35881 cctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 20297413 - 20297666
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20297413 atagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 20297512  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  20297513 ggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 20297612  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297613 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40836980 - 40836728
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  40836980 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 40836881  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  40836880 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 40836782  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836781 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 9679110 - 9679367
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9679110 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattg 9679208  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc- 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||     
T  9679209 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctct 9679308  T
Q  228 tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9679309 ttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 9679367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 9680870 - 9681128
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9680870 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 9680969  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  9680970 agactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctct 9681069  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9681070 cccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctct 9681128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 1850032 - 1850285
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||    
T  1850032 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgg 1850131  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  1850132 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 1850231  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850232 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 3878628 - 3878881
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  3878628 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 3878727  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  3878728 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 3878827  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878828 ccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 11355309 - 11355566
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  11355309 atagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattga 11355408  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||  || |||||||||||    
T  11355409 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctc 11355508  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11355509 ccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctct 11355566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 44616 - 44868
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  44616 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttggg 44715  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 229  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||| ||| |    
T  44716 actttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcc 44815  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44816 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1047162 - 1046912
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  1047162 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 1047063  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  1047062 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 1046964  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046963 ccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39146225 - 39145967
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39146225 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 39146126  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc-tc 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  ||||||||| |     
T  39146125 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttt 39146026  T
Q  228 tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146025 tccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 39145967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 18345592 - 18345845
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||     
T  18345592 atagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctga 18345691  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||| |||||     
T  18345692 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctc 18345791  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345792 ccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 28487604 - 28487857
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28487604 atagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 28487703  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||     
T  28487704 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctc 28487803  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28487804 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43253754 - 43253502
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||     
T  43253754 atagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctga 43253656  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||    
T  43253655 gactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 43253556  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43253555 cctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 3035772 - 3036027
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa-aagat-- 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  3035772 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggc 3035871  T
Q  129 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||    
T  3035872 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 3035971  T
Q  227 ctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035972 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1049533 - 1049283
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  1049533 atagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 1049434  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  1049433 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 1049335  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049334 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Original strand, 28485617 - 28485867
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28485617 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 28485716  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |  |||| |||||||||    
T  28485717 ggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctc 28485816  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485817 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37412366 - 37412109
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  37412366 atagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactg 37412267  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||    
T  37412266 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 37412167  T
Q  227 ctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 283  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37412166 ctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctc 37412109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 42223208 - 42223466
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42223208 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 42223307  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||    
T  42223308 gagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctct 42223407  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42223408 cccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctct 42223466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  248 agaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 21678117 - 21678372
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  21678117 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgg 21678216  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  21678217 gactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctc 21678316  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21678317 ccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctct 21678372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 21680078 - 21680338
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21680078 atagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgg 21680177  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||     
T  21680178 gactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctc 21680277  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21680278 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctct 21680338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Original strand, 25542581 - 25542830
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  25542581 atagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgg 25542679  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || || |||||||||||    
T  25542680 gactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctc 25542778  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542779 ccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27832871 - 27832631
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27832871 atagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 27832772  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||| ||||||    
T  27832771 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctct 27832672  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
     |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832671 cccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7351890 - 7351637
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7351890 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 7351791  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  7351790 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 7351692  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7351691 cccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31156149 - 31155896
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31156149 atagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattg 31156050  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| |  | |||||||||||||    
T  31156049 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctct 31155951  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31155950 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 25276192 - 25276438
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25276192 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 25276291  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||            ||    
T  25276292 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg-----------gct 25276380  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25276381 ccccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctct 25276438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Original strand, 11757280 - 11757455
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11757280 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 11757379  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11757380 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11757455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24258514 - 24258776
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24258514 atagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattga 24258613  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------atagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| |||| ||||||||||    
T  24258614 gactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctc 24258713  T
Q  226 tctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||   |||||||||||||||| ||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24258714 tctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctct 24258776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 282
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  59 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 158  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  159 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaa 255  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  256 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7349511 - 7349262
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7349511 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 7349412  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  7349411 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 7349313  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||  ||||||||||    
T  7349312 cccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20091745 - 20091583
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091745 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20091646  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20091645 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 270
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24813733 - 24813479
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  24813733 atagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgg 24813638  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| | || | ||||||| |||    
T  24813637 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttct 24813538  T
Q  229 -ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  24813537 cccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 24813479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22137281  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137282 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40552308  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40552309 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22108270  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22108271 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40550030  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40550031 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24817588 - 24817389
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  24817588 atagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 24817493  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||    
T  24817492 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 24817393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22828871 - 22828672
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  22828871 atagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattga 22828772  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   || ||||||||||  |||||||||||||    
T  22828771 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 270
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 26804620 - 26804765
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactag---ggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  26804620 atagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 26804719  T
Q  129 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804720 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 135 - 286
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394031
Alignment:
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  232 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 22394031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22251780 - 22251611
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22251780 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattga 22251689  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22251688 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 7188611 - 7188763
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  7188611 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaag 7188708  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  7188709 cgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcat 7188763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Original strand, 26295592 - 26295743
Alignment:
Q  126 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctg 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | | |||    
T  26295592 gattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactg 26295691  T
Q  223 ctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295692 ctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 24465629 - 24465829
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 172  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  24465629 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaact 24465728  T
Q  173 cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 268  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||   ||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||    
T  24465729 cattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaa 24465827  T
Q  269 tt 270  Q
    ||    
T  24465828 tt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  111 ttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 270
Target Start/End: Original strand, 6332321 - 6332514
Alignment:
Q  83 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatat 181  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||    
T  6332321 ttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatat 6332420  T
Q  182 ctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  6332421 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Original strand, 11081569 - 11081818
Alignment:
Q  42 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  11081569 tctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgt 11081666  T
Q  142 agaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 234  Q
    | |||||||   | ||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||   | | || |||| | || |||||||| ||||||    
T  11081667 aaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccag 11081766  T
Q  235 actaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  11081767 actaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 11081818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  172 cc-attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    ||  || |||||||||||| || ||||||||||   |||||  |||| || |||||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  266 aaatt 270  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 18567664 - 18567731
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567664 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 128
Target Start/End: Original strand, 22392534 - 22392608
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 128  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22392534 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 243
Target Start/End: Original strand, 6046633 - 6046759
Alignment:
Q  121 gaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| || |||    
T  6046633 gaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaa 6046731  T
Q  217 gggctgctctct-ccccagactaggtca 243  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6046732 gagctgctctctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804818
Alignment:
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 26804818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 205
Target Start/End: Original strand, 6048932 - 6049094
Alignment:
Q  42 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 140  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||     
T  6048932 tctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttgga 6049029  T
Q  141 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  6049030 tagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40281568 - 40281468
Alignment:
Q  80 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattga 178  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  40281568 accttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga 40281469  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  40281468 t 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  187 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||| |  |||||||   |||||| | || || |||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  187 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||| |  |||||||   |||||| | ||||| | || ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25410224  T
Q  187 ttgtaacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069980
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7069874  T
Q  187 ttgtaacg----ttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    |||||| |    | | |||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tattttgtgtt 7069973  T
Q  281 ctctctg 287  Q
    || ||||    
T  7069974 ctttctg 7069980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512520
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 44512610  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||| | |||| || ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44512609 taaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120960
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 56020 - 55955
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  56020 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067183
Alignment:
Q  97 taggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||   || |||| |||||||||| ||  ||||||||||||   || |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  196 tactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||| ||||   ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12310198 - 12310157
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12310198 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22251603 - 22251570
Alignment:
Q  249 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251603 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7464589 - 7464513
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7464589 tcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34546950 - 34546874
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34546950 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 267
Target Start/End: Original strand, 9190052 - 9190101
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9190052 gctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 271
Target Start/End: Original strand, 42006780 - 42006849
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattc 271  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||    
T  42006780 atagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc 42006849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 46516334 - 46516403
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  46516334 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 2075247 - 2075303
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2075247 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20284145 - 20284093
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  20284145 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 267
Target Start/End: Original strand, 33332491 - 33332543
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  33332491 agggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 131)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38928416 - 38928158
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928416 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 38928317  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  38928316 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctct 38928217  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928216 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 38928158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 14633414 - 14633666
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14633414 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgg 14633512  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633513 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 14633612  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633613 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 40637169 - 40637426
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  40637169 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattga 40637268  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||     
T  40637269 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 40637368  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637369 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 40637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24880546 - 24880804
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24880546 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24880645  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  24880646 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24880745  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24880746 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctct 24880804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24879084 - 24879342
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24879084 atagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24879183  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  24879184 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24879283  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24879284 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctct 24879342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22801100 - 22800843
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||     
T  22801100 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctga 22801001  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||     
T  22801000 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 22800901  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800900 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 22800843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24888891 - 24889148
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  24888891 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactag 24888990  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  24888991 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctc 24889090  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24889091 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 24889148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 48486414 - 48486671
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48486414 atagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 48486513  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  48486514 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 48486613  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48486614 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctct 48486671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40091652 - 40091396
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  40091652 tagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 40091553  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  40091552 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 40091453  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091452 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 40091396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 282
Target Start/End: Original strand, 47274825 - 47275073
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  47274825 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 47274924  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47274925 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccca 47275024  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47275025 gactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8631657 - 8631404
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  8631657 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 8631558  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  8631557 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 8631458  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631457 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17662478 - 17662226
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  17662478 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 17662379  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  17662378 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 17662279  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662278 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17662226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37089609 - 37089357
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||    
T  37089609 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgg 37089510  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  37089509 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 37089411  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089410 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 19095977 - 19096235
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19095977 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatta 19096076  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  19096077 gagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctct 19096176  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096177 cccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 19096235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36921728 - 36921474
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  36921728 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 36921629  T
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  36921628 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 36921529  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921528 cagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 36921474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 9148348 - 9148600
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  9148348 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 9148447  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  9148448 gactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 9148546  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148547 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12396083 - 12395826
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12396083 atagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 12395984  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||     
T  12395983 gactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctc 12395884  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12395883 ccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctct 12395826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22802972 - 22802719
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22802972 atagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22802873  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||     
T  22802872 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctc 22802773  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802772 ccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 24348313 - 24348566
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  24348313 atagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 24348412  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  24348413 gactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 24348512  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348513 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33415725 - 33415469
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  33415725 atagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattga 33415627  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33415626 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 33415527  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33415526 cctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctct 33415469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 16453408 - 16453662
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16453408 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggact 16453507  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | || |||||||| |||    
T  16453508 ttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccc 16453607  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  16453608 cagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctct 16453662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 619687 - 619429
Alignment:
Q  30 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  619687 gcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagatt 619588  T
Q  130 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||    
T  619587 gggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctc 619488  T
Q  228 tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  619487 tcccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctct 619429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12401045 - 12400788
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12401045 atagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgt 12400946  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||     
T  12400945 gactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctc 12400846  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12400845 ccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctct 12400788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22046923 - 22046671
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22046923 atagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22046824  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  22046823 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 22046725  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046724 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26086214 - 26085962
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26086214 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 26086115  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || | ||||||||||||    
T  26086114 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggctgctctctc 26086016  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086015 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36919819 - 36919565
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  36919819 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 36919720  T
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||   | |||||||||||||||    
T  36919719 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccc 36919620  T
Q  233 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919619 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 36919565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 5198515 - 5198768
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5198515 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgg 5198614  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  5198615 ggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 5198714  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198715 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 18847248 - 18847500
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18847248 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattg 18847347  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  18847348 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 18847446  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847447 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22044628 - 22044376
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22044628 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22044529  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  22044528 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 22044430  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044429 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 11435050 - 11435302
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  | |    
T  11435050 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctag 11435149  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  11435150 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11435248  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435249 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14787669 - 14787423
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 14787570  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  14787569 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 14787470  T
Q  229 --ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14787469 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Original strand, 47868496 - 47868747
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  47868496 atagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 47868595  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| | |||||||||||     
T  47868596 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 47868695  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868696 ccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 38409300 - 38409552
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  38409300 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 38409399  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  38409400 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 38409498  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409499 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 51015341 - 51015593
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  51015341 atagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 51015440  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || ||| ||||||||||    
T  51015441 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctc 51015539  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015540 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 6764953 - 6765192
Alignment:
Q  46 tttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  6764953 tttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaa 6765052  T
Q  146 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtc 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765053 ttaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 6765152  T
Q  243 aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765153 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 36378387 - 36378645
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  36378387 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgg 36378486  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  36378487 gactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 36378586  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36378587 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctct 36378645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 56030539 - 56030770
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56030539 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattgg 56030638  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  56030639 agctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata-tgaaacggagggctgctctctccc 56030737  T
Q  232 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtca 263  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56030738 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2485110 - 2484858
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2485110 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2484912  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484911 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 7941416 - 7941671
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  7941416 atagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 7941515  T
Q  130 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||    
T  7941516 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 7941615  T
Q  228 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941616 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37313306 - 37313047
Alignment:
Q  30 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 129  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37313306 gcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 37313207  T
Q  130 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  37313206 gggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 37313107  T
Q  227 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
     | |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37313106 ttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11006475 - 11006222
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11006475 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctg 11006376  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  11006375 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11006277  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006276 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Original strand, 41997587 - 41997828
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41997587 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattga 41997686  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41997687 gattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct 41997786  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41997787 ccccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455591
Alignment:
Q  50 gaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  150 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 285  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 36380444 - 36380702
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||     
T  36380444 atagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattga 36380543  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| |||  || ||||||||||    
T  36380544 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctct 36380643  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36380644 cccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 36380702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11008804 - 11008553
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11008804 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctg 11008705  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| | |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  11008704 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct---ttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 11008608  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008607 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22134853 - 22134615
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  22134853 atagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgg 22134755  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  22134754 gacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 22134656  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22134655 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31849837 - 31849584
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  31849837 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctg 31849738  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  31849737 agactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 31849639  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849638 cccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22132628 - 22132389
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22132628 atagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22132530  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  22132529 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 22132431  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22132430 ccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 27499140 - 27499394
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||     
T  27499140 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattga 27499239  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |    
T  27499240 ggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgctcttt 27499336  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499337 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 27499394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 13544054 - 13544272
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13544054 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattg 13544152  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc- 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||     
T  13544153 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctct 13544252  T
Q  228 tccccagactaggtcaattt 247  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13544253 ttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44600076 - 44599823
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44600076 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 44599977  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  44599976 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 44599878  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  44599877 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3824808 - 3824634
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  3824808 atagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgg 3824709  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3824708 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 3824634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5637703 - 5637529
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5637703 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 5637604  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637603 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 5637529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 19322791 - 19323047
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  19322791 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 19322887  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||| ||||||||    
T  19322888 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctct 19322987  T
Q  229 -ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  19322988 cccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctct 19323047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16934381 - 16934128
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16934381 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 16934282  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  16934281 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 16934183  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934182 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22780611 - 22780358
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780611 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 22780512  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  22780511 ggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctct 22780413  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22780412 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22782976 - 22782723
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782976 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 22782877  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  22782876 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctct 22782778  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  22782777 cccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18709401 - 18709149
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  18709401 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgc 18709302  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||    
T  18709301 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctc 18709203  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709202 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9176708 - 9176461
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggac 134  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9176708 agtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 9176609  T
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||    
T  9176608 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 9176510  T
Q  233 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176509 cagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9174384 - 9174131
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9174384 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattg 9174285  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||| |||||    
T  9174284 agactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctct 9174186  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174185 gccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16932027 - 16931774
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16932027 atagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 16931928  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  16931927 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 16931829  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931828 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Original strand, 2891434 - 2891644
Alignment:
Q  80 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2891434 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgat 2891533  T
Q  180 atctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2891534 atctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 2891633  T
Q  276 gtgttctctct 286  Q
    |||||||||||    
T  2891634 gtgttctctct 2891644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 286
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547506
Alignment:
Q  85 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  185 ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  282 tctct 286  Q
    |||||    
T  13547502 tctct 13547506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18409585 - 18409344
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||     
T  18409585 atagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattga 18409486  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||  || | ||||||||    
T  18409485 gacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctct 18409387  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  18409386 ccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 284
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  114 gttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaa 211  Q
    |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  212 acgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18537710 - 18537470
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  18537710 atagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 18537614  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  18537613 gacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 18537514  T
Q  229 -ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
     ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537513 cccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 53405225 - 53405481
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||     
T  53405225 atagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctga 53405323  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 223  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||  || |||||    
T  53405324 gactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctgc 53405423  T
Q  224 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53405424 tctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635461
Alignment:
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47210978 - 47210756
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  47210978 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgg 47210891  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  47210890 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 47210791  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtca 263  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  47210790 ccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38890461 - 38890221
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  38890461 atagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattga 38890365  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||  |||||||||||||    
T  38890364 gactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctct 38890265  T
Q  229 cccc-agactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38890264 ccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437710
Alignment:
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18535068 - 18534828
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  18535068 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattga 18534972  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctct-c 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   || |||||| |||| |||| |||||| |    
T  18534971 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcc 18534872  T
Q  228 tccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
     ||||||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18534871 cccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 30136665 - 30136902
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  30136665 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattagg 30136762  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatt 246  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||  | ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  30136763 cggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatt 30136862  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30136863 tggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctct 30136902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52942684 - 52942537
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  52942684 atagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg---------- 52942595  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 192  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942594 ---tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 286
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101280
Alignment:
Q  138 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctccccaga 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctccccaga 5101229  T
Q  236 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101230 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 5101280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8756488 - 8756232
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  8756488 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||| |||| | || |||||||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctc 8756292  T
Q  228 tcc-ccagactaggtc-aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||   ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  8756291 tcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 8756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  266 aaatt 270  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15032733 - 15032584
Alignment:
Q  86 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15032733 ggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctct 15032634  T
Q  186 tttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15032633 tttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccc 15032584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3937447 - 3937314
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  3937447 atagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattga 3937348  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattct 165  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937347 ggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 6132967 - 6133090
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6132967 atagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 6133066  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcggga 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6133067 gactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454020
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 172  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  173 cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||  || |||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  268 att 270  Q
    |||    
T  28454018 att 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||||| ||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaaca 31983528  T
Q  267 aatt 270  Q
    ||||    
T  31983527 aatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357995
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttg 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  168 taacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtc 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||  |||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  263 aacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctct 25357995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||||| || |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  187 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||||| ||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982200
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctc 3982263  T
Q  185 ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtca 243  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  3982262 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150959
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcat 47150959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563113
Alignment:
Q  185 ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccca-gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  282 tctct 286  Q
    |||||    
T  47563109 tctct 47563113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 9863805 - 9864049
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  9863805 tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgag 9863901  T
Q  133 actttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------atagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    ||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||      |||||| |||| || |||||||    
T  9863902 actttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctc 9864000  T
Q  226 tct---ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||   |||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  9864001 tctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446635
Alignment:
Q  157 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccga 254  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||            |||| ||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 24446667  T
Q  255 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446666 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 24446635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40999017
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 203  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 261
Target Start/End: Original strand, 10112966 - 10113198
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  10112966 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattag 10113062  T
Q  132 gactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    ||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||   |||| |||||| || | || ||||||||    
T  10113063 gactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctct 10113161  T
Q  227 ctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggt 261  Q
    |||||| ||||||||| | | || |||||||||||||    
T  10113162 ctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14789494 - 14789422
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14789494 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24446822 - 24446756
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24446822 atagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022603
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 170  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  171 ccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9022538 cctctattgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccc 9022603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52942526 - 52942469
Alignment:
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52942526 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 52942469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 286
Target Start/End: Original strand, 6133101 - 6133189
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133101 tcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6133189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 270
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 31300521  T
Q  190 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  159 ttattcttgtaacccattgatatc-tcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttagaccg 253  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||  || ||||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  254 aactgggtcaacaaattcttt 274  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38270223 - 38270158
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 98  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38270223 tagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336764
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  187 ttgtaacg---ttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    |   || |   ||  |||| |||||| |||| || |||||||||||||| | | ||||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T
Q  282 tc 283  Q
    ||    
T  5336765 tc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317145
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 15317055  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3937309 - 3937255
Alignment:
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937309 cagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctct 3937255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54867241 - 54867188
Alignment:
Q  214 gaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  54867241 gaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 270
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489533
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16489446  T
Q  190 taacgttactcat-----catagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16489447 taaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Original strand, 5101092 - 5101133
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 73  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101092 atagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529455
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 8529364  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 54906737 - 54906852
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||   |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  54906737 gaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctc 54906836  T
Q  185 ttttgtaacgttactca 201  Q
     ||||||| ||||||||    
T  54906837 -tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3824628 - 3824593
Alignment:
Q  249 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824628 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 286
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822465
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||   |||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 55822360  T
Q  187 ttgtaacgttactcatc----atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaat-tcttttgtgtt 280  Q
    | |||| |  ||||||     |||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||    
T  55822361 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 55822459  T
Q  281 ctctct 286  Q
    ||||||    
T  55822460 ctctct 55822465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114505
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 115  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 4884986 - 4885062
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4884986 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16689025  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 31985658 - 31985726
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31985658 tcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||| ||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38270155 - 38270120
Alignment:
Q  125 agattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270155 agattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10047452 - 10047383
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  10047452 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39246067 - 39245998
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  39246067 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  94 tattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaattag 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884909
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 4884909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 18587098 - 18587154
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18587098 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 36769591 - 36769667
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||    
T  36769591 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 183878 - 183626
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  183878 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgg 183780  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  183779 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 183680  T
Q  230 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183679 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Original strand, 52061 - 52307
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 52160  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  52161 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 52260  T
Q  229 --ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52261 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 50236 - 50308
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50236 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 101)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18511450 - 18511193
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18511450 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18511351  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18511350 gactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 18511251  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511250 ccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 18511193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 25804066 - 25804318
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25804066 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 25804165  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  25804166 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 25804265  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25804266 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 21948067 - 21948324
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  21948067 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 21948166  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  21948167 gactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 21948266  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948267 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 21948324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10529337 - 10529091
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10529337 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 10529238  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||     
T  10529237 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctc 10529138  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529137 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 658591 - 658337
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||    
T  658591 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgg 658492  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  |||||    
T  658491 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctg--ctctc 658394  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658393 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 658337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 284
Target Start/End: Original strand, 6745114 - 6745364
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6745114 agtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggact 6745212  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  6745213 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 6745312  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745313 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16092438 - 16092180
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16092438 atagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 16092339  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||    
T  16092338 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctct 16092239  T
Q  229 cc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092238 cctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 16092180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 39854524 - 39854781
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  39854524 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgg 39854623  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  39854624 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 39854723  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854724 ccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 39854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Original strand, 695924 - 696176
Alignment:
Q  37 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  695924 gtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 696022  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  696023 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctct 696176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2818574 - 2818316
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt-gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2818574 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctg 2818475  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2818474 ggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctct 2818375  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818374 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctct 2818316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1189847 - 1189588
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  1189847 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattga 1189748  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||| |||| ||||||||    
T  1189747 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctct 1189648  T
Q  229 c--cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189647 cctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 1189588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18509556 - 18509299
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18509556 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgg 18509457  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  18509456 gactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctc 18509357  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509356 ccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 18509299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25921711 - 25921458
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  25921711 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 25921612  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||     
T  25921611 gactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctc 25921512  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921511 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 40221563 - 40221821
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40221563 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 40221662  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||    
T  40221663 gacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 40221762  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40221763 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctct 40221821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 24126897 - 24127154
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24126897 atagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgg 24126996  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  24126997 gactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 24127096  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127097 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 24127154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 25904144 - 25904401
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25904144 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattag 25904243  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||||||     
T  25904244 ggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctc 25904343  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25904344 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctct 25904401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 69 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505824
Alignment:
Q  69 agggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  169 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T
Q  267 aattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20505843 aattcttttgtgttctctct 20505824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17818728 - 17818475
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17818728 atagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattga 17818629  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat--agtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||  |||||| ||||| |    
T  17818628 ggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggcttctctc-c 17818530  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818529 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 2174960 - 2175212
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2174960 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2175059  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||| | || |||||||||||||     
T  2175060 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2175158  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175159 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 4236670 - 4236922
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  4236670 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 4236769  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  4236770 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 4236869  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236870 ccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10474561 - 10474304
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  10474561 atagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgg 10474462  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  10474461 gactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 10474362  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474361 ccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 10474304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 18466725 - 18466978
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || |||| || ||||||||||     
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctc 18466924  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466925 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 26097774 - 26098029
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  26097774 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgg 26097872  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||| ||||||||||    
T  26097873 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagg-ctgctctctc 26097971  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097972 ctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 26098029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 27910491 - 27910744
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||     
T  27910491 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgt 27910590  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || |||| || ||||||||||     
T  27910591 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctc 27910690  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910691 ccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 38882147 - 38882399
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  38882147 atagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 38882246  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  38882247 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 38882345  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882346 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 18469052 - 18469303
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18469052 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 18469151  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||     
T  18469152 gactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctct- 18469250  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18469251 cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 17072924 - 17073182
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17072924 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattgg 17073023  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17073024 ggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct 17073123  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17073124 cccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctct 17073182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 18596686 - 18596939
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18596686 atagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18596785  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||    
T  18596786 gactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 18596885  T
Q  229 cc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18596886 cctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36402566 - 36402309
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  36402566 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattgg 36402467  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | | |||||||||     
T  36402466 aactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctc 36402367  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402366 ccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 36402309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 6756535 - 6756790
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  6756535 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattga 6756634  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6756635 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaacg-agggctgctctct 6756731  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6756732 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctct 6756790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31472851 - 31472593
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31472851 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgg 31472752  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||    
T  31472751 gacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctct 31472652  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472651 cccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 31472593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 16776199 - 16776452
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16776199 atagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 16776298  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| | || ||||||||| |||     
T  16776299 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctc 16776397  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 283  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776398 ccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 284
Target Start/End: Original strand, 6747353 - 6747600
Alignment:
Q  38 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggacttt 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6747353 tttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggacttt 6747451  T
Q  138 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||| | || |||||||||||||| | |||    
T  6747452 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcag 6747550  T
Q  235 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747551 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 27912577 - 27912830
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||     
T  27912577 atagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctga 27912676  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  ||  ||||||||||    
T  27912677 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctc 27912776  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912777 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Original strand, 2954463 - 2954714
Alignment:
Q  38 tttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  2954463 tttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactt 2954562  T
Q  137 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccca 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  2954563 tgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctccccca 2954661  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954662 aactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 2954714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585724
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  158 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccga 254  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  255 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctg 41585724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34477292 - 34477038
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34477292 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattg 34477193  T
Q  131 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||    
T  34477192 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 34477094  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34477093 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37706018 - 37705774
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  37706018 atagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 37705919  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||     
T  37705918 ggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctc 37705819  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37705818 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34479657 - 34479403
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34479657 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattg 34479558  T
Q  131 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||    
T  34479557 agactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 34479459  T
Q  228 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479458 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39398231 - 39397974
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39398231 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattg 39398133  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||||| ||||| | |||||||||||    
T  39398132 gaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctct 39398033  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  39398032 cccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctct 39397974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587126
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||     
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10587071  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587072 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 31545121 - 31545374
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  31545121 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattg 31545220  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  31545221 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 31545319  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31545320 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21684689 - 21684437
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21684689 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 21684590  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  21684589 ggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 21684491  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684490 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31466216 - 31465970
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31466216 atagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttg 31466117  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctc-tcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||  ||    
T  31466116 gactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcata--------tagggctgctctcaccc 31466026  T
Q  231 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31466025 ccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctct 31465970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 286
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724191
Alignment:
Q  53 caaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcg 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  153 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttag 249  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  250 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 2724191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 15552286 - 15552539
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15552286 atagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattg 15552385  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  15552386 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 15552484  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15552485 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31179609 - 31179368
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31179609 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 31179510  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  31179509 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 31179411  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31179410 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 31542776 - 31543028
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31542776 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 31542875  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  31542876 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 31542973  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31542974 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  267 aattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 157  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  158 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccga 254  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | || |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  255 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 21288805 - 21289059
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt------tgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21288805 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaaga 21288903  T
Q  126 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 223  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  21288904 gattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgc 21288995  T
Q  224 tctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21288996 tctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctct 21289059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12556161 - 12555904
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |    
T  12556161 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagatt-g 12556063  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||| |||    
T  12556062 gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatct 12555963  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12555962 cccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctct 12555904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34530904 - 34530731
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  34530904 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattag 34530805  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34530804 gactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208873
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 36208855  T
Q  268 attcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  36208856 attcttttgt-ttctctct 36208873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23665237  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23665238 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23793350  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23793349 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15354660  T
Q  186 tttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15354659 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15356936  T
Q  186 tttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15356935 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373122
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  186 tttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3373220 tt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 38960217  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38960216 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6661421 - 6661181
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     
T  6661421 atagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattga 6661325  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   || |||||| |||| | | |||||||||    
T  6661324 gattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctct 6661225  T
Q  229 ccc-cagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6661224 ccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741844
Alignment:
Q  94 tattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa 23741937  T
Q  193 cgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 9020280 - 9020518
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  9020280 aacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattagg 9020377  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtc-aat 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| | || | ||||||||||||| ||| | ||||||   |    
T  9020378 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgtt 9020477  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  9020478 ttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctct 9020518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 20045051 - 20045172
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20045051 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgg 20045150  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20045151 gactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 20053905 - 20054135
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     |||||||||||||  |||||||||||    
T  20053905 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattagg 20053997  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtca-at 245  Q
     ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  20053998 tgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagtt 20054094  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20054095 ttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctct 20054135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 20043091 - 20043208
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20043091 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 20043190  T
Q  132 gactttgggtagaattag 149  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20043191 gactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413232
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  133 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17413232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  267 aatt 270  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26098489 - 26098379
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26098489 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattgg 26098390  T
Q  132 gactttgggta 142  Q
    |  ||||||||    
T  26098389 ggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098269
Alignment:
Q  179 tatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  275 tgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||    
T  26098280 tatgttctctct 26098269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  117 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445263
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatct 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||     ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| |||||||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  184 cttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 205
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  190 taacgttactcatcat 205  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 286
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043288
Alignment:
Q  205 tagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 20043288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033563
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  170 acccatt-gatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    ||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||| ||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctcccctgactaggtcagtattggatcgaactgggtaaa 34033569  T
Q  265 caaatt 270  Q
    ||||||    
T  34033568 caaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 271
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | || |||||||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  186 tttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 271  Q
    || ||||||| ||||||||  || || | || ||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  23667514 tt-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 169  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  170 acc-cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
    |||   || ||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Original strand, 42770867 - 42770934
Alignment:
Q  92 actattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770867 actattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 150
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  133 actttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4754295 actttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Original strand, 29748443 - 29748502
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748443 gaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20507700 - 20507659
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507700 atagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  93 ctattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430394
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  170 a-cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |  |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35430359 attcttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 35430394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 42238372 - 42238448
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42238372 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26406536 - 26406451
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 283  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26406536 tcattatagtggaacgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaactaggtaaacaaattc-tttgtgttctc 26406451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 17003984 - 17004053
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17003984 tcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045254
Alignment:
Q  161 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcat 20045254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 22672966 - 22673022
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22672966 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 25445628 - 25445684
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25445628 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 19007657 - 19007912
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19007657 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattgg 19007756  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  19007757 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctc 19007856  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007857 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6259053 - 6258798
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6259053 atagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg--aagattgg 6258956  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||    
T  6258955 ggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct 6258856  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258855 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6258798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6264387 - 6264129
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  6264387 atagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattgg 6264288  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  6264287 ggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 6264188  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264187 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 6264129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42923747 - 42923490
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 42923648  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923647 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctc 42923548  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923547 ccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 42923490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21520931 - 21520674
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |    
T  21520931 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctag 21520832  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  21520831 gactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 21520732  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21520731 ccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctct 21520674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19502248 - 19501996
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  19502248 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 19502149  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |    
T  19502148 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcc 19502049  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502048 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45280222 - 45279969
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  45280222 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22287574 - 22287317
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  22287574 atagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattga 22287475  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22287474 cacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctc 22287375  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287374 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 22287317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 28196654 - 28196909
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  28196654 atagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattga 28196753  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  28196754 ggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctc 28196853  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196854 ccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 28196909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40032296 - 40032034
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |    
T  40032296 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttag 40032197  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgct 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| ||||| |||    
T  40032196 gactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgct 40032097  T
Q  225 ctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40032096 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctct 40032034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23452475 - 23452222
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  23452475 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 23452376  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  23452375 gactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 23452276  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452275 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 42452817 - 42453050
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  42452817 aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 42452916  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42452917 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 42453016  T
Q  249 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42453017 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34979813 - 34979558
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34979813 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggact 34979714  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct--ctcc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||||  | ||    
T  34979713 ttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctcccccc 34979614  T
Q  231 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979613 ccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 34979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11739795 - 11739540
Alignment:
Q  35 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  231 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 11739540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43623793 - 43623561
Alignment:
Q  57 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 156  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623793 cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 43623694  T
Q  157 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  43623693 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 43623594  T
Q  254 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623593 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 43623561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19504583 - 19504331
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  19504583 atagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgg 19504485  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||| |||     
T  19504484 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctc 19504385  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504384 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 27104816 - 27105067
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27104816 atagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27104914  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  27104915 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27105013  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105014 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 17849134 - 17849391
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  17849134 atagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattga 17849233  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||    
T  17849234 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg-ggggctgctctct 17849332  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| || ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849333 cccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17849391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375327
Alignment:
Q  65 tttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  165 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  262 caacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctct 5375327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 17848460 - 17848714
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17848460 atagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 17848559  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||    
T  17848560 aggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctct 17848655  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848656 cccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17848714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 42064532 - 42064785
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  42064532 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 42064631  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  42064632 gactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 42064730  T
Q  229 ccccagactaggtc-aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064731 ccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13910282 - 13910030
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13910282 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgg 13910183  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| | |  | ||||||||||||    
T  13910182 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctc 13910084  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910083 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 14837294 - 14837542
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||| ||||    
T  14837294 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagact 14837387  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 231  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | || |||||||| |||    
T  14837388 ttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccc 14837487  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14837488 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 14837542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44289306 - 44289048
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44289306 atagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgg 44289207  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||  | || |||||| |    
T  44289206 gacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctcttt 44289107  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289106 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 44289048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18800530 - 18800294
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18800530 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattagg 18800434  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-att 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||    
T  18800433 agggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctccccagaccaggtcagttt 18800334  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18800333 tggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctct 18800294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45239206 - 45239000
Alignment:
Q  42 tctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  45239206 tctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttgg 45239107  T
Q  141 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagact 237  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45239106 tagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 45239007  T
Q  238 aggtcaa 244  Q
    |||||||    
T  45239006 aggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28459428 - 28459171
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28459428 atagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttgg 28459329  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  28459328 ggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctct 28459229  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     || ||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  28459228 acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctct 28459171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35218201 - 35217948
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35218201 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 35218102  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  35218101 ggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 35218003  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35218002 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35215824 - 35215571
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  35215824 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttg 35215725  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  35215724 ggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 35215626  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35215625 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 3022180 - 3022446
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  3022180 atagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattga 3022279  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------------atagtgaaacgaaggg 219  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||            ||| ||||||  | ||    
T  3022280 ggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatgg 3022378  T
Q  220 ctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022379 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 3022446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15539713 - 15539553
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  15539713 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattga 15539614  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15539613 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24162450 - 24162208
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          |||    
T  24162450 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgg 24162361  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||| |  | | ||||||||||||    
T  24162360 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctc 24162262  T
Q  230 cccag-actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162261 ccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31733003 - 31732772
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||            |||    
T  31733003 atagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgg 31732916  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||| ||| |||||||||    
T  31732915 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctct 31732816  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 271  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31732815 cccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407435
Alignment:
Q  128 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  226 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctct 22407435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 22874151 - 22874405
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||     
T  22874151 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattga 22874246  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  || ||||||||||    
T  22874247 ggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctct 22874346  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22874347 ccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctct 22874405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11578309 - 11578104
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578309 gggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 11578210  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||    
T  11578209 actcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaa 11578110  T
Q  265 caaatt 270  Q
    ||||||    
T  11578109 caaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17897480 - 17897242
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||     
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattga 17897385  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||  |||| | |||||||||||    
T  17897384 gattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct 17897285  T
Q  229 ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||    
T  17897284 ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20146806 - 20146604
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 172  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20146806 ttgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 20146707  T
Q  173 cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||| |    
T  20146706 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacga 20146607  T
Q  268 att 270  Q
    |||    
T  20146606 att 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332166
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||  |||| |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  265 caaatt 270  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707732
Alignment:
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct---ccccagactaggtcaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 22707732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136195
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  151 -cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc 200  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  187 ttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163003
Alignment:
Q  181 tctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  278 gttctctct 286  Q
    |||||||||    
T  22163011 gttctctct 22163003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 157  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  141 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagact 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  238 aggtcaa-tttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871090
Alignment:
Q  150 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | || | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctct 23871090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107570
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaa 170  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa 35107450  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaac 265  Q
     || ||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | || || |||| | |||||||||||||| | || ||||||| | ||| |||    
T  35107451 -cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaac 35107549  T
Q  266 aaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  35107550 aaatatttttgtgttctctct 35107570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 172
Target Start/End: Original strand, 38020220 - 38020349
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gg 131  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||    
T  38020220 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt-----------attggg 38020308  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020309 ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22163185 - 22163106
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163185 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694094
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15693974 gaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc 15694073  T
Q  185 ttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15694074 ttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37963109 - 37962938
Alignment:
Q  100 gattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact 199  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| |||| |    
T  37963109 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttatt 37963013  T
Q  200 catc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||   ||||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37963012 catcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139564
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  133 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43139492 actttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22407647 - 22407591
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttggga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22407647 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921927
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||     | ||| ||||||| ||||| |||||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  185 ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca 243  Q
    |||  ||| |||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 148  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 232
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028795
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||      
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  133 actttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||| |   | | ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||   |||| |||| || ||||||||||    
T  35028692 actttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctct 35028791  T
Q  229 cccc 232  Q
    ||||    
T  35028792 cccc 35028795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  74 tgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539510
Alignment:
Q  243 aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 15539510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaaa-gattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828411
Alignment:
Q  111 ttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 202  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcat 13828411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943723
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  190 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | |  || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517633
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27517724  T
Q  190 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30720796 - 30720684
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |||| |  ||    
T  30720796 gaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgaaa--tc 30720699  T
Q  185 ttttgtaacgttact 199  Q
    |||||||| ||||||    
T  30720698 ttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 38191129 - 38191200
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191129 atagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 5377667 - 5377629
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377667 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503052
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaatta 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41303228 - 41303155
Alignment:
Q  77 tttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41303228 tttaccttggagaaaaattattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Original strand, 14699016 - 14699100
Alignment:
Q  182 ctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  14699016 ctcttttgtaacctt--tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17057407 - 17057369
Alignment:
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17057407 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17085390 - 17085352
Alignment:
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17085390 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  97 taggattgagtctcttggttacgggaaaagat-tgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  || ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 286
Target Start/End: Original strand, 39680156 - 39680244
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  39680156 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tatcttgtgttctctct 39680244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42288154 - 42288105
Alignment:
Q  224 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  42288154 tctctccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatttctt 42288105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050172
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 20050172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20054815 - 20054759
Alignment:
Q  219 gctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054815 gctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21630016 - 21629948
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21630016 tcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 30479126 - 30479182
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30479126 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674552
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 33674552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37170822 - 37170778
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca 243  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37170822 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30480741 - 30480484
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  30480741 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 30480642  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | | |||||||||||     
T  30480641 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctc 30480542  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480541 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 30480484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 15072807 - 15073065
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa-aagattg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  15072807 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttg 15072906  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat--agtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  15072907 ggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctct 15073006  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15073007 cccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctct 15073065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 3874107 - 3874360
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  3874107 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgg 3874206  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  3874207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 3874306  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874307 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 32339406 - 32339659
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32339406 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 32339505  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  32339506 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 32339605  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339606 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 27911111 - 27911367
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27911111 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 27911210  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  27911211 gactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctc 27911310  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27911311 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27911367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 27957530 - 27957786
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27957530 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 27957629  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  27957630 gactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctc 27957729  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27957730 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27957786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 14807848 - 14808115
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  14807848 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14807947  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  14807948 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 14808047  T
Q  229 ----------ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
              ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808048 cccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 14808115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27107135 - 27106878
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27107135 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 27107036  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27107035 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctc 27106936  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27106935 ctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctct 27106878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14419429 - 14419171
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14419429 atagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgg 14419330  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||    
T  14419329 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctct 14419230  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419229 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 14419171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Original strand, 608831 - 609077
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  608831 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 608930  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  608931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 609030  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 275  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  609031 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28251805 - 28251548
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  28251805 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28251706  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  28251705 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 28251606  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251605 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 28251548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 1225265 - 1225521
Alignment:
Q  34 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  134 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  1225365 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctcc 1225464  T
Q  231 c-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225465 ctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 1225521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 15068078 - 15068330
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || |||     
T  15068078 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttga 15068177  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||     
T  15068178 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctc 15068277  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068278 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28283457 - 28283206
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28283457 atagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattgg 28283358  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  28283357 ggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 28283259  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283258 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22684894 - 22684638
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22684894 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22684795  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  22684794 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 22684695  T
Q  227 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684694 ctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 15809316 - 15809568
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |    
T  15809316 atagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactag 15809414  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||||     
T  15809415 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctt 15809514  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809515 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 27829394 - 27829646
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27829394 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27829493  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  27829494 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27829592  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829593 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530465
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||| ||||     
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 27827083 - 27827335
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  27827083 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 27827182  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  27827183 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27827281  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827282 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 41384841 - 41385098
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41384841 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 41384940  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
      |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||     
T  41384941 agctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41385040  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41385041 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctct 41385098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 4424115 - 4424368
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4424115 atagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4424214  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||    
T  4424215 agctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 4424314  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424315 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 36865635 - 36865887
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||    
T  36865635 atagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattgg 36865731  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||    
T  36865732 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctct 36865831  T
Q  229 cccc--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36865832 cccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 43079699 - 43079952
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43079699 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 43079798  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  43079799 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 43079897  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43079898 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 18810805 - 18811057
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18810805 atagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgg 18810904  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  18810905 gactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 18811003  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811004 ccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13858722 - 13858469
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13858722 atagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattgg 13858623  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  13858622 ggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctct 13858524  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 283  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858523 cccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 25952621 - 25952875
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||     
T  25952621 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagaca 25952720  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 231  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  25952721 ttgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 25952820  T
Q  232 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952821 cagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 25952875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 44720940 - 44721193
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  44720940 atagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 44721039  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | || ||||||||||    
T  44721040 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctct 44721138  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44721139 cccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5372416 - 5372161
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5372416 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 5372317  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||    
T  5372316 gactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctct 5372217  T
Q  229 --ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  5372216 ccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttct 5372161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 15956058 - 15956312
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15956058 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgg 15956153  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||    
T  15956154 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctct 15956253  T
Q  229 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15956254 ccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctct 15956312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813231
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  133 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 18813178  T
Q  231 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813179 cccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 43082070 - 43082323
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43082070 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 43082169  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  43082170 ggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 43082268  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43082269 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 41382770 - 41383016
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||           |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41382770 atagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 41382858  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||     
T  41382859 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41382958  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382959 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 41383016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15185944 - 15185695
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaaaagattggga 133  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||        
T  15185944 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatt---- 15185849  T
Q  134 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc 230  Q
       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15185848 ---tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcc 15185752  T
Q  231 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15185751 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctct 15185695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 21482429 - 21482649
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21482429 aacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg 21482525  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagt---gaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 246  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21482526 cgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatt 21482625  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  21482626 tggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24873419 - 24873178
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24873419 atagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattg 24873320  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  24873319 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 24873221  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||| | |||||||||  || ||||||| || |||||||||||    
T  24873220 cccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Original strand, 21480621 - 21480832
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||    
T  21480621 aacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattagg 21480717  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21480718 cgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 21480817  T
Q  247 tagaccgaactgggt 261  Q
    | || ||||||||||    
T  21480818 tggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33541626 - 33541391
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33541626 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgg 33541527  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||||                      |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  33541526 gacttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctc 33541449  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33541448 ccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctct 33541391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 14477377 - 14477522
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14477377 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 14477476  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477477 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 31162343 - 31162551
Alignment:
Q  69 agggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31162343 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgt 31162442  T
Q  169 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct---ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31162443 aactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 31162542  T
Q  262 caacaaatt 270  Q
     ||||||||    
T  31162543 aaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005624
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 172  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  173 cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T
Q  268 attctt 273  Q
    ||||||    
T  3005629 attctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181798
Alignment:
Q  58 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggg 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  155 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaattta-gaccgaactgggtcaaca 266  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  267 aatt 270  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  70 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  169 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagac--taggtcaat-ttagaccgaactgggt 261  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  262 caacaaatt 270  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37214429 - 37214317
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  37214429 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattgg 37214339  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgg 153  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  37214338 aactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 132  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  133 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 202  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  141 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagac 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||   |||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  237 taggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5622976 - 5622877
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5622976 atagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Original strand, 26775302 - 26775378
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872434
Alignment:
Q  157 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccga 254  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||            |||| ||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 35872466  T
Q  255 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872465 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 35872434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847830
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-cctttgatatctct 17847775  T
Q  186 tttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca 243  Q
    |||||||    | |||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17847776 tttgtaa----aatcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214245
Alignment:
Q  218 ggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctct 37214245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35872621 - 35872555
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35872621 atagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985163
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaatctctt 13985163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 286
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376343
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  |||||||||| |    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-t 6376239  T
Q  187 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 281  Q
    |||||| ||||||||||   |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  || |||||||| || |||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt-ttgtgtgttc 6376338  T
Q  282 tctct 286  Q
    |||||    
T  6376339 tctct 6376343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2468340 - 2468261
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 115  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468340 atagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Original strand, 3895972 - 3896092
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgtaacccat-tgatatctc 184  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||   || | || ||||||||||| | | |||||||||    
T  3895972 gaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctc 3896071  T
Q  185 ttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3896072 ttttgtaaagttactcatcat 3896092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 282
Target Start/End: Original strand, 14477521 - 14477601
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14477521 atagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttct 14477601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 268
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  155 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact---catcatagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttaga 250  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  251 ccgaactgggtcaacaaa 268  Q
     |||||||||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 286
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181833
Alignment:
Q  251 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 181833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattag 149  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17799494 - 17799418
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17799494 tcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 31035166 - 31035238
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt 107  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799571
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 17799571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684704
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267144
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4812538 - 4812470
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccca-gactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  4812538 gctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaa-tatcttgtgttctctct 4812470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33839105 - 33839043
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  33839105 gaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9021157 - 9021101
Alignment:
Q  219 gctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9021157 gctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10930237 - 10930193
Alignment:
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  10930237 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18106124 - 18106084
Alignment:
Q  224 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18106124 tctctccccagaataggtcaagttggaccgaactgggtcaa 18106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23179611 - 23179555
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23179611 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11983267 - 11983010
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  11983267 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 11983168  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  11983167 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11983068  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983067 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 11983010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 13039830 - 13040088
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  13039830 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattga 13039929  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  13039930 gactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13040029  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040030 cccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 13040088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 13057270 - 13057528
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13057270 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgg 13057369  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13057370 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctct 13057469  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057470 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctct 13057528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 9020002 - 9020259
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  9020002 atagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgg 9020101  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||     
T  9020102 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctc 9020201  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020202 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 9020259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3630102 - 3629846
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3630102 atagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattgg 3630003  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||  ||||||||||||||    
T  3630002 ggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctc 3629903  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629902 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 3629846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1230487 - 1230234
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||    
T  1230487 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgg 1230388  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||     
T  1230387 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctc 1230288  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230287 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28241559 - 28241306
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  28241559 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28241460  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||     
T  28241459 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 28241360  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241359 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 3390455 - 3390714
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3390455 atagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgg 3390554  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  3390555 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctct 3390654  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctg 287  Q
     ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3390655 cccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctctg 3390714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 32280072 - 32280330
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32280072 atagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 32280171  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32280172 gacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctct 32280271  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32280272 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctct 32280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3632176 - 3631920
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  3632176 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgg 3632077  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |    
T  3632076 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt 3631977  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3631976 -cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 3631920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14459003 - 14458752
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  14459003 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14458906  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||    
T  14458905 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 14458806  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458805 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4816469 - 4816216
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  4816469 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 4816370  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||    
T  4816369 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 4816270  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816269 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14507413 - 14507161
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  14507413 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14507314  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||  |||||||| || |||||||||||||     
T  14507313 gactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 14507215  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 30967277 - 30967530
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  30967277 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 30967376  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||||||||     
T  30967377 aactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctc 30967476  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967477 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15541378 - 15541121
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15541378 atagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgg 15541279  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |  |||||||||||    
T  15541278 gactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctc 15541179  T
Q  230 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541178 ctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 15541121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 25477350 - 25477615
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  25477350 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgg 25477449  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac----------tcatcatagtgaaacgaagggct 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||  ||||||    
T  25477450 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggct 25477549  T
Q  222 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25477550 gctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctct 25477615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 26065062 - 26065312
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  26065062 atagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 26065158  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   |||||| | || ||||||||||||||    
T  26065159 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctc 26065257  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26065258 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 26085031 - 26085281
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  26085031 atagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 26085127  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   |||||| | || ||||||||||||||    
T  26085128 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctc 26085226  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26085227 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3233965 - 3233706
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  3233965 agtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 3233866  T
Q  135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3233865 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccc 3233766  T
Q  232 cagactaggtcaatttagacc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233765 cacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 3233706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30034841 - 30034590
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||  |||    
T  30034841 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgg 30034742  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | | || ||||||||||||||    
T  30034741 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctc 30034642  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034641 ccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15532915 - 15532674
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15532915 agtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggact 15532816  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccca 233  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  15532815 tttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctatcccta 15532716  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 275  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532715 gactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19704807 - 19704552
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19704807 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 19704708  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct-tttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||    
T  19704707 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 19704608  T
Q  228 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19704607 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2629123 - 2628871
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2629123 atagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 2629024  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  2629023 gactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2628925  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628924 ccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20915594 - 20915351
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20915594 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattg 20915495  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  20915494 ggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 20915396  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20915395 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30729066 - 30728805
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||    
T  30729066 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctgg 30728967  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactc--atcatagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||  || |||||| |||| | ||||||||    
T  30728966 ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctc 30728867  T
Q  226 tctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30728866 tctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 30728805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1069909 - 1069699
Alignment:
Q  80 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069909 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 1069810  T
Q  180 atctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1069809 atctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattctttt 1069710  T
Q  276 gtgttctctct 286  Q
     ||||||||||    
T  1069709 atgttctctct 1069699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15530360 - 15530166
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15530360 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 15530261  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  15530260 ggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  55 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgg 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  154 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttaga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  251 ccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26932800 - 26932546
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26932800 atagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 26932701  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||| ||||||||    
T  26932700 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctct 26932602  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26932601 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12195753 - 12195500
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12195753 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 12195654  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  12195653 ggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 12195555  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12195554 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24338688 - 24338429
Alignment:
Q  30 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 128  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||    
T  24338688 gcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagat 24338589  T
Q  129 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 225  Q
    |  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  24338588 taagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 24338489  T
Q  226 tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  24338488 tc-ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctct 24338429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12161793 - 12161539
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||     
T  12161793 atagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattga 12161696  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||    
T  12161695 gactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctctc 12161596  T
Q  230 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  12161595 cctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctct 12161539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466657
Alignment:
Q  33 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||| || | | ||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctct 14466657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066109
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 15719740 - 15719961
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719740 aacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 15719836  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc--tctccccagactaggtcaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  || | |||||  || ||||| |||||||||||    
T  15719837 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaat 15719936  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  15719937 ttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186052
Alignment:
Q  72 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  267 aattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctct 12186052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068380
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309185
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 286
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367364
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctg--ctctctccccagactaggtcaatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatt 15367325  T
Q  247 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15367326 tggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 15367364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Original strand, 22490720 - 22490889
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22490720 agtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggact 22490819  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22490820 ttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3028089 - 3027848
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  3028089 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc--t 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||  |    
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctcttt 3027893  T
Q  227 ctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027892 ccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311454
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33311354  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33311355 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16455625 - 16455421
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455625 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 16455526  T
Q  171 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaac 265  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||| || |||    
T  16455525 ccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaac 16455426  T
Q  266 aaatt 270  Q
    |||||    
T  16455425 aaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19227646 - 19227514
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  19227646 atagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 19227547  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227546 gactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  71 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 169  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  170 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct-ctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 264  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||||||||| ||||| | ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  265 caaatt 270  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 203
Target Start/End: Original strand, 17012137 - 17012287
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||   |||| ||||||||||||    
T  17012137 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattagg 17012234  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17012235 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 270
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696759
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | || |||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 266  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| |||  |  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  267 aatt 270  Q
    ||||    
T  19696756 aatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  74 tgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  173 cattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 206  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078539
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 171  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| || |||||| || |||  |||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  172 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 25078557  T
Q  268 attcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  25078556 att-ttgtgtgttctctct 25078539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857949
Alignment:
Q  42 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||| |||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  142 agaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccaga 235  Q
    ||| |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  236 ctaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    |||||||| | || |||||||||| || ||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 286
Target Start/End: Original strand, 10584241 - 10584329
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10584241 tcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctct 10584329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || |||||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  187 ttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtc 242  Q
    | |||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  151 -cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
       | ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| || |||||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465572
Alignment:
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat- 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctct 25465572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542452
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc 7542468  T
Q  185 ttttgtaacgttactca 201  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7542467 -tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  73 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694846
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17694936  T
Q  190 taacgttac----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    ||| |  ||    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445773
Alignment:
Q  132 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 30445773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  187 ttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtc 242  Q
    | |||| ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3577559 - 3577484
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3577559 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1072115 - 1072069
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1072115 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgatt 1072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  96 ttaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13467536 - 13467461
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13467536 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattctt 13467461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078261
Alignment:
Q  155 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28078261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13870656 - 13870608
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacctt 84  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13870656 agtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 25941781 - 25941857
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25941781 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  95 attaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833526
Alignment:
Q  161 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt-actcatcat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcat 3833526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  94 tattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 171
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 171
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 286
Target Start/End: Original strand, 30443533 - 30443622
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  30443533 tcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttttctct 30443622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35201377 - 35201309
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccca-gactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  35201377 gctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaa-tatcttgtgttctctct 35201309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Original strand, 15346477 - 15346524
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattagga 101  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15346477 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Original strand, 17852618 - 17852650
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 64  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852618 atagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22342851 - 22342795
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22342851 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22963772 - 22963704
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  22963772 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 23824621 - 23824689
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  23824621 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 32447554 - 32447502
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgatttacct 83  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  32447554 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 282
Target Start/End: Original strand, 4050 - 4298
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  4050 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 4149  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4150 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccca 4249  T
Q  234 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4250 gactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11711 - 11454
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11711 atagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 11612  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |  | || |||||||||||    
T  11611 gactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctc 11512  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 11454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 69529 - 69277
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  69529 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 69430  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||||||||     
T  69429 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctc 69331  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69330 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 73261 - 73207
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  73261 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  47 ttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatt 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14620 - 14365
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||     
T  14620 atagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctga 14521  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  14520 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 14421  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14420 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Original strand, 15073 - 15324
Alignment:
Q  36 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  15073 agtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagact 15172  T
Q  136 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| | ||||||| ||| ||||    
T  15173 ttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctccccc 15272  T
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  15273 atgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttctctct 15324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41721 - 41468
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  41721 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 41622  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||     
T  41621 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 41522  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41521 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 79235 - 79492
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  79235 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 79334  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  79335 gaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 79434  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  79435 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctct 79492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  49 ggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  149 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 79909 - 80166
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  79909 atagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattg 80008  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  80009 gggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 80107  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  80108 cccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctct 80166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 6249 - 6502
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6249 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattg 6348  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  6349 ggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctct 6447  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6448 cccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 29221 - 29473
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29221 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 29320  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 228  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  29321 ggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 29419  T
Q  229 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29420 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 91 - 344
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  91 atagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattg 190  T
Q  131 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  191 agactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 289  T
Q  229 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  290 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 2930 - 3182
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  2930 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttg 3029  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||| ||||    
T  3030 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctc 3128  T
Q  230 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3129 cccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Original strand, 85280 - 85538
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||     
T  85280 atagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgt 85379  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 228  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| |||| | | |||||||||    
T  85380 gactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 85479  T
Q  229 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
     |||||||||||||||||||  || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85480 cccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctct 85538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 2094 - 2294
Alignment:
Q  34 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 133  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2094 agagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctggga 2192  T
Q  134 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||| |||||||||    
T  2193 ctttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctccc 2292  T
Q  232 ca 233  Q
    ||    
T  2293 ca 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1638
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1763  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-at 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  1762 cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtt 1663  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  1662 tttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16039 - 15817
Alignment:
Q  51 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16039 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 15942  T
Q  151 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat- 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |     
T  15941 cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtg 15842  T
Q  246 ttagaccgaactgggtcaacaaatt 270  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  15841 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 22318  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22319 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  87 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 24593  T
Q  186 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24594 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16886 - 16716
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||     
T  16886 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattga 16790  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16789 gactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 35689 - 35819
Alignment:
Q  32 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  35689 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgg 35788  T
Q  132 gactttgggtagaattaggcgggagacttat 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35789 gactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 286
Target Start/End: Original strand, 35818 - 35901
Alignment:
Q  204 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 286  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35818 atagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctct 35901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 205
Target Start/End: Original strand, 4911 - 5034
Alignment:
Q  83 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4911 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatc 5010  T
Q  183 tc-ttttgtaacgttactcatcat 205  Q
    || |||||||| | ||||||||||    
T  5011 tctttttgtaaagatactcatcat 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4731 - 4666
Alignment:
Q  216 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4731 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57497
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||   | |||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  186 tttgtaacgttactcat 202  Q
    ||||||| |||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcat 57497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1439
Alignment:
Q  233 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  88 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5756 - 5687
Alignment:
Q  199 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5756 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17036 - 16980
Alignment:
Q  219 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17036 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17133
Alignment:
Q  91 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 17133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 396 times since January 2019
Visitors: 3650