View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0538_low_2 (Length: 766)

Name: NF0538_low_2
Description: NF0538
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0538_low_2
NF0538_low_2
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (97-766)||(18200737-18201407)
chr3 (164-764)||(26950510-26951113)
chr3 (164-766)||(36091934-36092539)
chr3 (100-533)||(36091495-36091931)
chr3 (100-533)||(26951116-26951552)
chr3 (100-271)||(18256107-18256278)
chr3 (106-270)||(49562482-49562646)
chr3 (100-270)||(35716184-35716354)
chr3 (100-256)||(31487113-31487269)
chr3 (100-256)||(36087657-36087813)
chr3 (100-252)||(36947224-36947375)
chr3 (106-252)||(38655996-38656142)
chr3 (100-256)||(18198592-18198748)
chr3 (100-256)||(52418862-52419017)
chr3 (100-174)||(12825171-12825245)
chr3 (97-174)||(13454947-13455024)
chr3 (97-174)||(16651391-16651468)
chr3 (97-208)||(16066870-16066981)
chr3 (100-173)||(4594084-4594157)
chr3 (100-166)||(854554-854620)
chr3 (100-174)||(12260798-12260872)
chr3 (100-174)||(26947819-26947893)
chr3 (109-245)||(16725940-16726076)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (97-766)||(3590589-3591259)
chr6 (100-271)||(25971107-25971278)
chr6 (100-254)||(25975547-25975701)
chr6 (100-256)||(2280821-2280977)
chr6 (97-231)||(34265224-34265358)
chr6 (100-174)||(33045848-33045922)
chr6 (184-253)||(17905868-17905937)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (100-766)||(2045316-2045985)
chr1 (375-766)||(35595295-35595686)
chr1 (97-383)||(35593930-35594216)
chr1 (97-271)||(23086259-23086433)
chr1 (100-254)||(37891602-37891756)
chr1 (100-256)||(39513323-39513479)
chr1 (100-256)||(29245330-29245486)
chr1 (100-255)||(45503600-45503755)
chr1 (100-256)||(38211061-38211217)
chr1 (100-256)||(50708751-50708907)
chr1 (100-256)||(48650894-48651050)
chr1 (100-255)||(13926369-13926520)
chr1 (100-174)||(49787424-49787498)
chr1 (100-174)||(2047567-2047641)
chr1 (100-174)||(36866978-36867052)
chr1 (100-174)||(7480470-7480544)
chr1 (100-174)||(9533846-9533920)
chr1 (100-174)||(42496554-42496628)
chr1 (97-156)||(26211630-26211689)
chr1 (97-248)||(23480959-23481110)
chr1 (151-253)||(5429244-5429346)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (100-766)||(41859940-41860609)
chr4 (164-766)||(52681721-52682326)
chr4 (100-533)||(52682329-52682765)
chr4 (97-271)||(36895718-36895891)
chr4 (100-256)||(30388097-30388253)
chr4 (100-254)||(21382528-21382682)
chr4 (100-256)||(16908941-16909097)
chr4 (100-256)||(28389279-28389435)
chr4 (97-183)||(41944072-41944158)
chr4 (141-256)||(29359311-29359426)
chr4 (100-174)||(19515295-19515369)
chr4 (100-174)||(21581685-21581759)
chr4 (304-400)||(23004567-23004660)
chr4 (97-147)||(37062400-37062452)
chr4 (109-245)||(4882107-4882243)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (100-766)||(32674260-32674929)
chr5 (97-271)||(16678829-16679002)
chr5 (97-254)||(38095575-38095732)
chr5 (300-484)||(8795897-8796082)
chr5 (100-174)||(20105161-20105235)
chr5 (97-174)||(3608003-3608080)
chr5 (97-174)||(30090418-30090495)
chr5 (100-174)||(12655177-12655251)
chr5 (100-174)||(23183962-23184036)
chr5 (100-174)||(23188229-23188303)
chr5 (100-174)||(34761223-34761297)
chr5 (100-174)||(39878057-39878131)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (100-766)||(40604732-40605401)
chr2 (164-766)||(13907250-13907855)
chr2 (164-766)||(26454895-26455500)
chr2 (100-533)||(26455503-26455939)
chr2 (100-533)||(13907858-13908293)
chr2 (100-256)||(35432242-35432398)
chr2 (100-256)||(207623-207779)
chr2 (100-256)||(5013634-5013791)
chr2 (106-252)||(1512653-1512799)
chr2 (100-174)||(13905287-13905361)
chr2 (100-174)||(2300779-2300853)
chr2 (100-174)||(6123670-6123744)
chr2 (100-174)||(184091-184165)
chr2 (100-174)||(976151-976225)
chr2 (100-174)||(2449325-2449399)
chr2 (97-135)||(23455759-23455797)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (100-766)||(14994547-14995216)
chr8 (97-271)||(37589444-37589618)
chr8 (100-256)||(22729954-22730110)
chr8 (100-256)||(23827644-23827800)
chr8 (100-256)||(19961504-19961660)
chr8 (100-174)||(406231-406305)
chr8 (100-174)||(18266066-18266140)
chr8 (100-173)||(41376488-41376561)
chr8 (300-352)||(36238570-36238622)
chr8 (100-174)||(18275079-18275153)
chr8 (112-245)||(9885678-9885811)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (164-766)||(7892744-7893349)
chr7 (164-766)||(22005968-22006573)
chr7 (100-533)||(7893352-7893788)
chr7 (100-533)||(22006576-22007011)
chr7 (366-635)||(3595667-3595936)
chr7 (97-301)||(3595461-3595666)
chr7 (629-766)||(3598843-3598986)
chr7 (100-256)||(45115705-45115861)
chr7 (100-256)||(32660102-32660258)
chr7 (106-271)||(26168704-26168869)
chr7 (97-246)||(35102862-35103010)
chr7 (100-174)||(17696872-17696946)
chr7 (100-174)||(27715901-27715975)
chr7 (100-174)||(16719857-16719931)
chr7 (100-174)||(31100097-31100171)
chr7 (100-174)||(7888824-7888898)
chr7 (100-173)||(29956435-29956508)
chr7 (100-158)||(32038416-32038474)
chr7 (300-339)||(16805970-16806009)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (106-254)||(51990-52138)
scaffold0097 (100-174)||(40512-40586)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (100-174)||(3356-3430)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (100-174)||(13268-13342)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (100-174)||(25639-25713)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (100-158)||(45550-45608)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (184-253)||(104606-104675)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 18201407 - 18200737
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18201407 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaaccctttatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacac 18201308  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201307 caacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacagaaattgctttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 18201208  T
Q  297 ctaaccc-gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 395  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201207 ttaaccccgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 18201108  T
Q  396 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201107 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 18201008  T
Q  496 tcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201007 tcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 18200908  T
Q  596 aatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 695  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200907 aatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 18200808  T
Q  696 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200807 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 18200737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 26951113 - 26950510
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  26951113 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 26951014  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951013 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 26950914  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950913 tcacataaaaaccataaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 26950814  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  26950813 gttaatggtaagttaaacatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 26950714  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26950713 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacatagtcacatcagtataatcaaccacca 26950614  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26950613 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 26950514  T
Q  761 gata 764  Q
    ||||    
T  26950513 gata 26950510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Original strand, 36091934 - 36092539
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||       
T  36091934 catgtgaaaaaacaggagaagatagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataatgg 36092033  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092034 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 36092133  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092134 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 36092233  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  36092234 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 36092333  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  36092334 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacagcttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacaatcacattagtataatcaaccacca 36092433  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36092434 ctgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 36092533  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  36092534 gatagc 36092539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Original strand, 36091495 - 36091931
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36091495 tcattaatcaatatttttaaaacacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 36091594  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091595 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 36091694  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091695 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 36091794  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36091795 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 36091894  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36091895 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 36091931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26951552 - 26951116
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26951552 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 26951453  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951452 catgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcactgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 26951353  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951352 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 26951253  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26951252 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 26951153  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26951152 catatggttagatagatccttattcagccaatagaat 26951116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18256278 - 18256107
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18256278 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacaccaa 18256179  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    ||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  18256178 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 18256107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 49562482 - 49562646
Alignment:
Q  106 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  49562482 atcaatatttttaaaccaccccttgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 49562581  T
Q  206 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgcctt 270  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49562582 ctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaattgcctt 49562646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35716354 - 35716184
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  35716354 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 35716255  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgcctt 270  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35716254 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaattgcctt 35716184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31487269 - 31487113
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  31487269 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 31487170  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487169 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 31487113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 36087657 - 36087813
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  36087657 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtaaaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 36087756  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36087757 catgttctagcgactgacccggactcttgttaatagtgattgcaaatgagacagata 36087813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Original strand, 36947224 - 36947375
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  36947224 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtg-aaaaacaggagacggtaggtagacaccaa 36947322  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 252  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36947323 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 36947375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 252
Target Start/End: Original strand, 38655996 - 38656142
Alignment:
Q  106 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  38655996 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 38656095  T
Q  206 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 252  Q
     || ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38656096 ctagcgactaaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 38656142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18198748 - 18198592
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  18198748 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtagcccgtgatagtgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 18198649  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18198648 catgttctagcgactgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaaagata 18198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 52418862 - 52419017
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||| || |||||||    
T  52418862 tcattaatcaatatctttaaaacacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcaatgtg-aaaaataggaaacggtaggtagacaccaa 52418960  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    ||| || || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418961 catattctagcgactgaccctgacccttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 52419017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12825245 - 12825171
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12825245 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12825171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 13454947 - 13455024
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13454947 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13455024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16651468 - 16651391
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16651468 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16651391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16066981 - 16066870
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  16066981 tcataatttatcaagatcttcaaaccatctcttaaaataacccttgatattacaacatacaattgtccatgtgaaaaaacaggagaaggtaaatagacac 16066882  T
Q  197 caacatgtttta 208  Q
    |||||| |||||    
T  16066881 caacatttttta 16066870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4594157 - 4594084
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4594157 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtctatgtgaaaa 4594084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 854620 - 854554
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccat 166  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  854620 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccat 854554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12260872 - 12260798
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12260872 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12260798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26947893 - 26947819
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  26947893 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 26947819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 245
Target Start/End: Original strand, 16725940 - 16726076
Alignment:
Q  109 aatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtttta 208  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| | | | || || | ||| || ||||||||||| |    
T  16725940 aatatcttcaaaccttctcttgaagtaacccttgacaaagccacatacaattgaccatgagaaaagataggcgatggcaaatatacgccaacatgtttca 16726039  T
Q  209 acgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 245  Q
    | ||||||||  |||| || || ||||||||||||||    
T  16726040 aagattgaccttgacttttctttatagtcattgcaaa 16726076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 3591259 - 3590589
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3591259 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagatggtagataaacac 3591160  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3591159 caacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacggaaattgctttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 3591060  T
Q  297 ctaaccc-gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3591059 ctaaccccgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 3590960  T
Q  396 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590959 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatacttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 3590860  T
Q  496 tcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590859 tcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 3590760  T
Q  596 aatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 695  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590759 aatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 3590660  T
Q  696 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590659 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 3590589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 271
Target Start/End: Original strand, 25971107 - 25971278
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  25971107 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacaggagatggtagatagacaccaa 25971206  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    ||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  25971207 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacagaaactgccttc 25971278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 25975547 - 25975701
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  25975547 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacagtagatggtagatagacaccaa 25975646  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 254  Q
    ||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25975647 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 25975701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2280977 - 2280821
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  2280977 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 2280878  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280877 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 2280821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 34265224 - 34265358
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  34265224 tcatcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcaatattgcgacgtacaattgtccatgtcaaaaaacaggagacgttagatagacac 34265323  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgtta 231  Q
    |||||| ||  || || |||||| |||||||||||    
T  34265324 caacattttacaaagactgaccctgactcttgtta 34265358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 33045848 - 33045922
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  33045848 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 33045922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 253
Target Start/End: Original strand, 17905868 - 17905937
Alignment:
Q  184 ggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacag 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17905868 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 17905937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 552; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 766
Target Start/End: Original strand, 2045316 - 2045985
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2045316 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 2045415  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045416 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 2045515  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045516 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 2045615  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045616 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 2045715  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 596  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2045716 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaactta 2045815  T
Q  597 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 696  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045816 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 2045915  T
Q  697 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045916 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 2045985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 375 - 766
Target Start/End: Original strand, 35595295 - 35595686
Alignment:
Q  375 taaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagtt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595295 taaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagtt 35595394  T
Q  475 aagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgat 574  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35595395 aagcatattttgaagacaaaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgat 35595494  T
Q  575 atgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatc 674  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595495 ataaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatc 35595594  T
Q  675 accgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35595595 accgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaggagatgataataaattagatagc 35595686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 97 - 383
Target Start/End: Original strand, 35593930 - 35594216
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35593930 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacac 35594029  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594030 caacatgtttcaacgactgactctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 35594129  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaa 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35594130 ctaacctgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaatcgtaaattaaa 35594216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Original strand, 23086259 - 23086433
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23086259 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaaccatcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacac 23086358  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  23086359 caacatttttcaaagattgaccccaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 23086433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 37891602 - 37891756
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  37891602 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacagaagacggtagatagacaccaa 37891701  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 254  Q
    ||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37891702 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 37891756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 39513323 - 39513479
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  39513323 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 39513422  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39513423 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 39513479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29245486 - 29245330
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  29245486 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 29245387  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29245386 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgaggcagata 29245330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 45503600 - 45503755
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  45503600 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 45503699  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 255  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503700 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 45503755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 38211061 - 38211217
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||    
T  38211061 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaa 38211160  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38211161 catgttctagcgattgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 38211217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50708907 - 50708751
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  50708907 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgatgtaacacgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 50708808  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50708807 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 50708751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48651050 - 48650894
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||    
T  48651050 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcaaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaa 48650951  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48650950 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 48650894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 13926369 - 13926520
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||       
T  13926369 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtgcatgtg-aaaaataggagacggtagatagacac--- 13926464  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 255  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13926465 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 13926520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 49787424 - 49787498
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49787424 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 49787498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 2047567 - 2047641
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2047567 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 2047641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 36866978 - 36867052
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36866978 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 36867052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7480544 - 7480470
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7480544 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 7480470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9533920 - 9533846
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  9533920 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 9533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42496628 - 42496554
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42496628 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 42496554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26211689 - 26211630
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtac 156  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26211689 tcatcattaatcaatatcttttaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtac 26211630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 248
Target Start/End: Original strand, 23480959 - 23481110
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||| |||||||||||||||  || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | |  |||||||| ||||    
T  23480959 tcatcagtgatcaatatctttagtccttctctggatgtaactcttgaaatagcaacatacaactgtccttgagaaaatacaggtgttggtagatatacac 23481058  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatga 248  Q
    |||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23481059 caacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatga 23481110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5429346 - 5429244
Alignment:
Q  151 acgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgaga 250  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5429346 acgtacaactgtctatgagaaaatacaggtgttggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgata 5429247  T
Q  251 cag 253  Q
    |||    
T  5429246 cag 5429244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 766
Target Start/End: Original strand, 41859940 - 41860609
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41859940 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattacgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 41860039  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860040 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 41860139  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860140 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 41860239  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41860240 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 41860339  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 596  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860340 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 41860439  T
Q  597 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 696  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860440 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 41860539  T
Q  697 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860540 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 41860609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 52682326 - 52681721
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  52682326 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 52682227  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682226 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 52682127  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682126 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 52682027  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  52682026 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 52681927  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52681926 attaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 52681827  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52681826 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaatctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 52681727  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  52681726 gatagc 52681721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52682765 - 52682329
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  52682765 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacacgaa 52682666  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682665 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattacaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 52682566  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682565 ctaactcgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 52682466  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52682465 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 52682366  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52682365 catatgcttagatagatccttattcatccaatagaat 52682329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Original strand, 36895718 - 36895891
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36895718 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagttaccctcgatattgcgacgtacaattggccatgtg-aaaaacaggagacggtagatagacac 36895816  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    |||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  36895817 caacatttttcaaagattgaccctgaatcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 36895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 30388097 - 30388253
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  30388097 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 30388196  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388197 catgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 30388253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21382682 - 21382528
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  21382682 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 21382583  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 254  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382582 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 21382528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16909097 - 16908941
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  16909097 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 16908998  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908997 catgttctagcgaccgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 16908941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28389435 - 28389279
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  28389435 tcattaatcaatattttaaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 28389336  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389335 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 28389279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 41944072 - 41944158
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41944072 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagac 41944158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 29359311 - 29359426
Alignment:
Q  141 tgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcatt 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29359311 tgatattgcgacgtacaactgtccatatgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctcactcttgttaatagtcatt 29359410  T
Q  241 gcaaatgagacagata 256  Q
    ||||||||||||||||    
T  29359411 gcaaatgagacagata 29359426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 19515295 - 19515369
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19515295 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 19515369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 21581685 - 21581759
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21581685 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 21581759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 400
Target Start/End: Original strand, 23004567 - 23004660
Alignment:
Q  304 gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatata 400  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23004567 gtgctatcgcacgggtcaatattaagcacaatatattagcaatttaggactacaacatcacatgaaaa---taaactaaaacaacgtgaaatatata 23004660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37062452 - 37062400
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccat--cccttgaagtaacccttgatatt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  37062452 tcatcattgatcaatatctttaaactatatcccttgaagtaacccttgatatt 37062400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 245
Target Start/End: Original strand, 4882107 - 4882243
Alignment:
Q  109 aatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtttta 208  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| || || | | | || || | ||| |||||||||||||| |    
T  4882107 aatatcttcaaaccttctcttgaagtaacccttgacaaagccacatacaattgaccatgagagaagataggcgatggcaaatatacaccaacatgtttca 4882206  T
Q  209 acgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 245  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4882207 aagattgaccttgacttttgtttatagtcattgcaaa 4882243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 32674929 - 32674260
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32674929 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccttgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 32674830  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674829 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 32674730  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674729 ctaacccgtgctaccacacgagtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 32674630  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674629 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 32674530  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 596  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674529 catatgattagatagatctttattcaaccaatagaatatcacaagaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 32674430  T
Q  597 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 696  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674429 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 32674330  T
Q  697 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674329 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 32674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Original strand, 16678829 - 16679002
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16678829 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacc-tcgatattgcaacgtacaattgtccatgtaaaaaaacaggagacggtagatagacac 16678927  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    |||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16678928 caacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacgaaaactgccttc 16679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Original strand, 38095575 - 38095732
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38095575 tcatcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacatacaattgtccatgtgaaaaaacaagagacggtagatagacac 38095674  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 254  Q
    ||| || ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38095675 caatatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 38095732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8796082 - 8795897
Alignment:
Q  300 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccg-taaattaaaataacatgaaata-t 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||| ||  | ||||| |    
T  8796082 acccgtgctatcgcacgggtcaata-tgagctcaacaaattaaaaatttaggagtccaacatcacatgaaagacgataaattaaaacaatgtaaaatact 8795984  T
Q  398 atagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattt 484  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||||||    
T  8795983 atagctatattatctaggataagtatggtttataatttatgttttgcaatgatcatgcttgtagataatgataaactaaccatattt 8795897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 20105161 - 20105235
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20105161 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 20105235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 3608003 - 3608080
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3608003 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3608080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 30090418 - 30090495
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30090418 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgcgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 30090495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12655251 - 12655177
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  12655251 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 12655177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23184036 - 23183962
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23184036 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 23183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23188303 - 23188229
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23188303 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 23188229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34761297 - 34761223
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  34761297 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 34761223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39878131 - 39878057
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39878131 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 39878057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 40605401 - 40604732
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40605401 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 40605302  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605301 catgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 40605202  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605201 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 40605102  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605101 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 40605002  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40605001 catatgcttagatagatccttattcaaccaatagaatatcaaatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaactta 40604902  T
Q  597 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 696  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40604901 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 40604802  T
Q  697 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40604801 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 40604732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 13907855 - 13907250
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  13907855 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 13907756  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907755 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 13907656  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907655 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 13907556  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13907555 gttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 13907456  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13907455 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacattcacatcagtataatcaaccacca 13907356  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13907355 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 13907256  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  13907255 gatagc 13907250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 26455500 - 26454895
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  26455500 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 26455401  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455400 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 26455301  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455300 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 26455201  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  26455200 gttaatggtaagttaagcatatcttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 26455101  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26455100 attaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttttagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 26455001  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26455000 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 26454901  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  26454900 gatagc 26454895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26455939 - 26455503
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26455939 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 26455840  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455839 catgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 26455740  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455739 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 26455640  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26455639 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 26455540  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26455539 aatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 26455503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13908293 - 13907858
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13908293 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 13908194  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13908193 catgtttcaacgat-gaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 13908095  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13908094 ctaacccgtgctaccacacgggttaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaatcgtaaattaaaataacatgaaata 13907995  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907994 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaat 13907895  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13907894 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 13907858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 35432242 - 35432398
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  35432242 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 35432341  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35432342 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 35432398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 207779 - 207623
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  207779 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 207680  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  207679 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacagata 207623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 5013634 - 5013791
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgt-gaaaaaacatgagacggtagataaacacca 198  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  5013634 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtagaaaaaataggagacggtaggtagacacca 5013733  T
Q  199 acatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5013734 acatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgaaaatgagacagata 5013791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1512799 - 1512653
Alignment:
Q  106 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  1512799 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 1512700  T
Q  206 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 252  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512699 ctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 1512653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13905361 - 13905287
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13905361 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13905287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2300853 - 2300779
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  2300853 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgccatgtacaactgtccatgtgaaaaa 2300779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6123744 - 6123670
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6123744 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 6123670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 184165 - 184091
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  184165 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 184091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 976151 - 976225
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  976151 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 976225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2449399 - 2449325
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  2449399 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 2449325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 135
Target Start/End: Original strand, 23455759 - 23455797
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455759 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagta 23455797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 766
Target Start/End: Original strand, 14994547 - 14995216
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | || |||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14994547 tcattaatcaatattttaaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtcacgtacgactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 14994646  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994647 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 14994746  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14994747 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacaggaaata 14994846  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14994847 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaaacatattttgaagacataat 14994946  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 596  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994947 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 14995046  T
Q  597 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 696  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14995047 atttgtagtttgcatagctcaggggatatcaaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccacgagggccttcttgcaac 14995146  T
Q  697 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995147 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 14995216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37589618 - 37589444
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  37589618 tcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccatcgatattgcaacatacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagatac 37589519  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
    |||||| ||| |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37589518 caacatttttcatagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgtcttc 37589444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 22729954 - 22730110
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  22729954 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatttgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 22730053  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22730054 catgttctagcgactgaccctgactcttgttagtagtcattgcaaatgagacagata 22730110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23827800 - 23827644
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  23827800 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 23827701  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827700 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 23827644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19961660 - 19961504
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  19961660 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgatgtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 19961561  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961560 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 19961504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 406231 - 406305
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  406231 tcattaatcaatatctttaaaccatccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 406305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 18266066 - 18266140
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18266066 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Original strand, 41376488 - 41376561
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  41376488 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgcccatgtaaaaa 41376561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 352
Target Start/End: Original strand, 36238570 - 36238622
Alignment:
Q  300 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttagga 352  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36238570 acccgtgctatcgcacgggtcaatattgagcacaatatattagtaatttagga 36238622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 18275079 - 18275153
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  18275079 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgttatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18275153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 9885678 - 9885811
Alignment:
Q  112 atctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacg 211  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||| | || || | |||||| || |||||||| |  |    
T  9885678 atcttcaaaccttctcttgaagtaactcttgacaatgccacatacaattgaccatgagaaaaaacaggcgatggcaaataaactcccacatgtttaagag 9885777  T
Q  212 attgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 245  Q
    | || ||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  9885778 actggccttgacttttgttaatagtcactgcaaa 9885811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 7893349 - 7892744
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  7893349 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 7893250  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893249 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 7893150  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893149 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 7893050  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  7893049 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 7892950  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7892949 attaaatcaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 7892850  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7892849 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 7892750  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  7892749 gatagc 7892744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 22006573 - 22005968
Alignment:
Q  164 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  22006573 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 22006474  T
Q  261 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006473 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 22006374  T
Q  361 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006373 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 22006274  T
Q  461 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  22006273 gttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatgctt 22006174  T
Q  561 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22006173 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 22006074  T
Q  661 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22006073 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 22005974  T
Q  761 gatagc 766  Q
    ||||||    
T  22005973 gatagc 22005968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 7893788 - 7893352
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7893788 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 7893689  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893688 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 7893589  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893588 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 7893489  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7893488 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 7893389  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7893388 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 7893352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22007011 - 22006576
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22007011 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 22006912  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 296  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006911 catgtttcaacgat-gaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 22006813  T
Q  297 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22006812 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacgtcacataaaaatcgtaaattaaaataacatgaaata 22006713  T
Q  397 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006712 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaat 22006613  T
Q  497 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006612 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 22006576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 366 - 635
Target Start/End: Original strand, 3595667 - 3595936
Alignment:
Q  366 taaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaa 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3595667 taaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaagatatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaa 3595766  T
Q  466 tggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaa 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  3595767 tggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacctgaagcattgggccaatccttattga 3595866  T
Q  566 aacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacaca 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3595867 aacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcagaggacatctaagacaca 3595936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 301
Target Start/End: Original strand, 3595461 - 3595666
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatat-ctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaaca 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  3595461 tcatcattgatcaatatactttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgatgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacagtagatagata 3595560  T
Q  196 ccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataattt 295  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3595561 ccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgccttgatgtcaagaaaaacctcataattt 3595660  T
Q  296 gctaac 301  Q
    ||||||    
T  3595661 gctaac 3595666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 629 - 766
Target Start/End: Original strand, 3598843 - 3598986
Alignment:
Q  629 agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctcct------tct 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  3598843 agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcatcgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagatct 3598942  T
Q  723 agaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagc 766  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3598943 agaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagc 3598986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45115861 - 45115705
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  45115861 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 45115762  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45115761 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 45115705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32660258 - 32660102
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  32660258 tcattaatcaatatttttaaactacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 32660159  T
Q  200 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 256  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660158 catgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 32660102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26168869 - 26168704
Alignment:
Q  106 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  26168869 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 26168770  T
Q  206 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 271  Q
     || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  26168769 ctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcagaaactgccttc 26168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35103010 - 35102862
Alignment:
Q  97 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35103010 tcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggaga-agtagataaacac 35102912  T
Q  197 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaat 246  Q
    |||||| ||| ||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35102911 caacatttttcaaaaactaaccttgactcttgttaatagtcattgcaaat 35102862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17696946 - 17696872
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17696946 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 17696872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27715975 - 27715901
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27715975 tcattaatcaatatatttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 27715901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16719931 - 16719857
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16719931 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16719857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31100171 - 31100097
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31100171 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccatgatattgcgacgtacaactctccatgtgaaaaa 31100097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7888898 - 7888824
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7888898 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 7888824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29956508 - 29956435
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 173  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29956508 tcattaattaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactatccatgtgaaaa 29956435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32038474 - 32038416
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaa 158  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32038474 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaa 32038416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 339
Target Start/End: Original strand, 16805970 - 16806009
Alignment:
Q  300 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatat 339  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16805970 acccgtgctatcgcacgggtcaatattgagcacaatatat 16806009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Original strand, 51990 - 52138
Alignment:
Q  106 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  51990 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 52089  T
Q  206 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 254  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52090 ctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 52138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 40512 - 40586
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  40512 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 40586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3430 - 3356
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3430 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13342 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 25639 - 25713
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25639 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 25713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45608 - 45550
Alignment:
Q  100 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaa 158  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45608 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaa 45550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 104675 - 104606
Alignment:
Q  184 ggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacag 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  104675 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 104606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1210 times since January 2019
Visitors: 3665