View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0539_low_2 (Length: 824)

Name: NF0539_low_2
Description: NF0539
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0539_low_2
NF0539_low_2
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (77-635)||(25191297-25191854)
chr3 (81-443)||(21995-22357)
chr3 (77-442)||(52138718-52139084)
chr3 (81-443)||(5168750-5169117)
chr3 (82-440)||(47233596-47233955)
chr3 (77-442)||(28245355-28245721)
chr3 (157-440)||(35033145-35033428)
chr3 (77-443)||(51447714-51448073)
chr3 (77-443)||(54278938-54279304)
chr3 (84-443)||(53519511-53519865)
chr3 (77-441)||(54128296-54128662)
chr3 (79-443)||(43694768-43695127)
chr3 (191-443)||(48508268-48508520)
chr3 (77-341)||(33272122-33272392)
chr3 (161-440)||(38850123-38850403)
chr3 (275-443)||(12096702-12096870)
chr3 (158-440)||(45289091-45289375)
chr3 (312-443)||(53262295-53262426)
chr3 (157-306)||(38060430-38060579)
chr3 (77-332)||(45728064-45728324)
chr3 (296-443)||(52156081-52156228)
chr3 (165-405)||(48953454-48953697)
chr3 (158-442)||(19676079-19676362)
chr3 (123-440)||(54424959-54425289)
chr3 (81-439)||(26490239-26490596)
chr3 (93-440)||(48734147-48734481)
chr3 (327-443)||(311306-311422)
chr3 (174-405)||(39235154-39235384)
chr3 (98-443)||(49503565-49503897)
chr3 (77-227)||(27917490-27917639)
chr3 (123-363)||(3186733-3186973)
chr3 (312-440)||(49042090-49042219)
chr3 (302-440)||(38060858-38060996)
chr3 (162-443)||(42510013-42510292)
chr3 (158-441)||(50960636-50960915)
chr3 (123-438)||(39600683-39600999)
chr3 (89-430)||(19757829-19758158)
chr3 (336-443)||(47555329-47555436)
chr3 (125-440)||(54364976-54365290)
chr3 (160-376)||(38430850-38431066)
chr3 (81-430)||(19736918-19737255)
chr3 (333-443)||(2133609-2133719)
chr3 (319-440)||(48712075-48712196)
chr3 (312-440)||(15296061-15296189)
chr3 (341-440)||(40106620-40106719)
chr3 (358-440)||(31566161-31566243)
chr3 (77-235)||(36820166-36820323)
chr3 (358-443)||(40273202-40273287)
chr3 (351-443)||(7895877-7895969)
chr3 (359-441)||(31454224-31454306)
chr3 (326-443)||(29601060-29601177)
chr3 (356-441)||(45486848-45486933)
chr3 (352-443)||(48532151-48532243)
chr3 (161-438)||(30294125-30294403)
chr3 (352-443)||(52927845-52927936)
chr3 (355-437)||(32170602-32170684)
chr3 (341-443)||(39208791-39208893)
chr3 (317-440)||(54422837-54422966)
chr3 (81-221)||(23534787-23534929)
chr3 (326-440)||(36304134-36304248)
chr3 (77-154)||(38850012-38850089)
chr3 (350-443)||(45374474-45374567)
chr3 (375-443)||(45834597-45834665)
chr3 (369-440)||(7278675-7278746)
chr3 (341-440)||(14415260-14415358)
chr3 (356-443)||(20208196-20208283)
chr3 (345-440)||(30797822-30797917)
chr3 (351-442)||(33271908-33271999)
chr3 (162-361)||(52678929-52679124)
chr3 (81-226)||(2340928-2341074)
chr3 (159-265)||(41842686-41842792)
chr3 (158-227)||(3987047-3987116)
chr3 (242-363)||(19162664-19162785)
chr3 (77-219)||(29817422-29817565)
chr3 (129-226)||(31454441-31454537)
chr3 (372-437)||(41529975-41530040)
chr3 (328-401)||(41842562-41842635)
chr3 (312-437)||(49841770-49841895)
chr3 (363-443)||(27893294-27893374)
chr3 (365-440)||(24778609-24778684)
chr3 (100-179)||(33307087-33307165)
chr3 (341-440)||(40991614-40991713)
chr3 (362-441)||(46148232-46148311)
chr3 (77-112)||(47542041-47542076)
chr3 (158-228)||(344923-344993)
chr3 (385-439)||(21862742-21862796)
chr3 (351-429)||(24541343-24541421)
chr3 (342-440)||(31337560-31337658)
chr3 (328-430)||(40116348-40116450)
chr3 (327-440)||(11284157-11284270)
chr3 (312-405)||(17022707-17022800)
chr3 (158-266)||(21200550-21200656)
chr3 (392-441)||(39512777-39512826)
chr3 (387-443)||(344769-344825)
chr3 (359-443)||(3987535-3987619)
chr3 (387-443)||(31146928-31146984)
chr3 (357-417)||(37351606-37351666)
chr3 (326-382)||(37779045-37779101)
chr3 (158-226)||(44134044-44134112)
chr3 (81-153)||(45236778-45236850)
chr3 (367-438)||(659734-659805)
chr3 (367-442)||(31260965-31261039)
chr3 (341-440)||(42026536-42026635)
chr3 (388-443)||(50249607-50249662)
chr3 (169-226)||(29600910-29600968)
chr3 (387-441)||(37083291-37083345)
chr3 (367-437)||(46367390-46367460)
chr3 (364-442)||(50631879-50631957)
chr3 (81-154)||(30345445-30345518)
chr3 (387-440)||(52882662-52882715)
[»] chr7 (137 HSPs)
chr7 (83-443)||(43281600-43281959)
chr7 (77-443)||(12841272-12841639)
chr7 (77-443)||(11593878-11594245)
chr7 (77-442)||(37617862-37618229)
chr7 (80-440)||(34869341-34869702)
chr7 (124-443)||(29650349-29650669)
chr7 (81-443)||(45836479-45836840)
chr7 (77-442)||(49029194-49029559)
chr7 (77-433)||(35906208-35906565)
chr7 (77-443)||(33349803-33350170)
chr7 (81-443)||(39906369-39906730)
chr7 (77-443)||(44855171-44855536)
chr7 (77-381)||(13859067-13859372)
chr7 (79-443)||(36651914-36652277)
chr7 (77-438)||(46355858-46356219)
chr7 (81-443)||(38606927-38607277)
chr7 (124-443)||(6374833-6375153)
chr7 (82-439)||(35558994-35559353)
chr7 (77-363)||(31005141-31005428)
chr7 (159-443)||(31682599-31682883)
chr7 (157-443)||(2885719-2886005)
chr7 (81-443)||(43491230-43491593)
chr7 (77-306)||(33072872-33073100)
chr7 (161-443)||(22349623-22349905)
chr7 (197-443)||(32631615-32631849)
chr7 (156-443)||(36869234-36869528)
chr7 (216-443)||(24598185-24598411)
chr7 (168-443)||(15682184-15682459)
chr7 (84-381)||(23404343-23404640)
chr7 (275-440)||(40979928-40980093)
chr7 (275-443)||(38900074-38900241)
chr7 (212-441)||(7273154-7273383)
chr7 (82-440)||(36136687-36137046)
chr7 (315-441)||(27648937-27649063)
chr7 (231-438)||(31681022-31681226)
chr7 (123-262)||(46014359-46014498)
chr7 (81-265)||(7272961-7273146)
chr7 (301-440)||(48919255-48919394)
chr7 (161-437)||(28627936-28628212)
chr7 (303-441)||(21078062-21078200)
chr7 (77-223)||(36514424-36514569)
chr7 (280-443)||(9210701-9210864)
chr7 (345-443)||(28208325-28208423)
chr7 (330-439)||(34035155-34035264)
chr7 (81-265)||(25579252-25579431)
chr7 (81-200)||(32630517-32630636)
chr7 (161-443)||(12966025-12966301)
chr7 (334-441)||(33073105-33073212)
chr7 (326-443)||(36101774-36101891)
chr7 (81-381)||(47848596-47848896)
chr7 (281-437)||(45601599-45601755)
chr7 (326-443)||(27893560-27893677)
chr7 (77-154)||(36869576-36869653)
chr7 (94-400)||(8492276-8492580)
chr7 (81-265)||(19262609-19262791)
chr7 (341-440)||(33732017-33732114)
chr7 (312-448)||(44951309-44951445)
chr7 (312-439)||(14057632-14057759)
chr7 (312-439)||(14367660-14367787)
chr7 (367-438)||(24777170-24777241)
chr7 (159-443)||(26741891-26742177)
chr7 (362-441)||(31869101-31869180)
chr7 (330-443)||(42969870-42969983)
chr7 (312-443)||(42187595-42187726)
chr7 (333-441)||(47652722-47652830)
chr7 (278-441)||(1011167-1011329)
chr7 (176-443)||(38135210-38135476)
chr7 (158-224)||(7189442-7189508)
chr7 (280-397)||(35922376-35922492)
chr7 (158-235)||(40169649-40169726)
chr7 (84-227)||(43282330-43282477)
chr7 (158-226)||(27021906-27021974)
chr7 (321-440)||(8519046-8519165)
chr7 (352-439)||(24177628-24177714)
chr7 (320-440)||(40415169-40415295)
chr7 (385-443)||(31005432-31005490)
chr7 (77-226)||(5335840-5335988)
chr7 (78-147)||(24598440-24598509)
chr7 (302-439)||(34745891-34746028)
chr7 (158-235)||(42187470-42187547)
chr7 (315-442)||(28355322-28355450)
chr7 (387-443)||(29318792-29318848)
chr7 (312-403)||(36239833-36239924)
chr7 (84-226)||(39811882-39812025)
chr7 (376-443)||(40630652-40630719)
chr7 (367-441)||(7220965-7221039)
chr7 (356-442)||(25891086-25891172)
chr7 (326-440)||(37976403-37976517)
chr7 (355-440)||(20158671-20158756)
chr7 (326-443)||(33103094-33103211)
chr7 (158-223)||(38920794-38920859)
chr7 (77-228)||(40830146-40830293)
chr7 (336-437)||(47852265-47852366)
chr7 (378-438)||(6263479-6263539)
chr7 (359-443)||(14593953-14594037)
chr7 (359-443)||(16013476-16013560)
chr7 (387-443)||(28708610-28708666)
chr7 (387-443)||(29312218-29312274)
chr7 (370-442)||(31840442-31840514)
chr7 (160-228)||(36101977-36102045)
chr7 (278-381)||(1531420-1531523)
chr7 (326-440)||(28541943-28542058)
chr7 (345-440)||(30814125-30814220)
chr7 (329-400)||(31859046-31859117)
chr7 (359-441)||(19119423-19119505)
chr7 (385-443)||(30144982-30145040)
chr7 (84-265)||(48736074-48736256)
chr7 (387-444)||(5418303-5418360)
chr7 (181-258)||(6420672-6420749)
chr7 (122-219)||(27893769-27893865)
chr7 (358-443)||(33281087-33281171)
chr7 (158-227)||(35713695-35713764)
chr7 (359-440)||(45558531-45558611)
chr7 (371-443)||(1523856-1523928)
chr7 (77-228)||(14593679-14593835)
chr7 (159-227)||(18605359-18605427)
chr7 (159-227)||(18637563-18637631)
chr7 (159-227)||(18650997-18651065)
chr7 (387-443)||(20525049-20525105)
chr7 (158-226)||(28020964-28021032)
chr7 (312-403)||(44401164-44401253)
chr7 (164-227)||(7220750-7220813)
chr7 (77-112)||(16013202-16013237)
chr7 (210-269)||(33139206-33139265)
chr7 (341-440)||(34341395-34341494)
chr7 (344-415)||(34926547-34926618)
chr7 (395-441)||(21244282-21244328)
chr7 (312-394)||(21517426-21517508)
chr7 (355-405)||(26332908-26332958)
chr7 (369-447)||(28021146-28021224)
chr7 (158-224)||(45558362-45558428)
chr7 (357-443)||(48515370-48515456)
chr7 (362-443)||(4604751-4604832)
chr7 (366-439)||(34029677-34029750)
chr7 (367-440)||(40138948-40139021)
chr7 (340-437)||(40149016-40149112)
chr7 (385-442)||(41483714-41483771)
[»] chr2 (122 HSPs)
chr2 (81-443)||(38429806-38430168)
chr2 (77-443)||(3865990-3866357)
chr2 (81-440)||(11992108-11992466)
chr2 (81-443)||(45367622-45367984)
chr2 (81-443)||(41197224-41197588)
chr2 (81-440)||(41763043-41763401)
chr2 (81-443)||(12734623-12734985)
chr2 (77-438)||(8180698-8181060)
chr2 (77-447)||(36183369-36183740)
chr2 (77-439)||(3243654-3244015)
chr2 (77-440)||(38452686-38453053)
chr2 (130-443)||(25834650-25834963)
chr2 (77-443)||(4807510-4807880)
chr2 (157-444)||(2610587-2610874)
chr2 (88-440)||(18424378-18424728)
chr2 (179-443)||(451645-451909)
chr2 (81-414)||(23997539-23997858)
chr2 (200-443)||(7326157-7326400)
chr2 (215-443)||(39029638-39029872)
chr2 (229-441)||(28508749-28508961)
chr2 (165-441)||(24583630-24583907)
chr2 (275-443)||(35643065-35643233)
chr2 (85-443)||(6237750-6238110)
chr2 (272-440)||(31959635-31959803)
chr2 (316-443)||(30306190-30306317)
chr2 (338-443)||(3635320-3635425)
chr2 (158-443)||(12141544-12141829)
chr2 (329-443)||(227360-227474)
chr2 (278-439)||(45543074-45543234)
chr2 (81-234)||(16097192-16097350)
chr2 (81-440)||(38434873-38435234)
chr2 (326-443)||(9496034-9496151)
chr2 (312-440)||(9996623-9996754)
chr2 (319-443)||(38328367-38328489)
chr2 (158-439)||(18958907-18959192)
chr2 (312-443)||(12882042-12882173)
chr2 (157-228)||(43238305-43238376)
chr2 (362-443)||(15025698-15025779)
chr2 (282-443)||(43573127-43573287)
chr2 (158-443)||(43751944-43752229)
chr2 (326-437)||(19336896-19337007)
chr2 (315-441)||(30743686-30743812)
chr2 (352-443)||(9531597-9531688)
chr2 (356-442)||(12520060-12520146)
chr2 (77-154)||(2610446-2610523)
chr2 (367-440)||(12474927-12475000)
chr2 (370-443)||(17670680-17670753)
chr2 (356-441)||(19863432-19863517)
chr2 (356-441)||(19867764-19867849)
chr2 (356-441)||(19872665-19872750)
chr2 (286-443)||(33287549-33287706)
chr2 (313-443)||(35755242-35755376)
chr2 (286-438)||(13149460-13149612)
chr2 (343-439)||(39709202-39709298)
chr2 (312-424)||(41545559-41545671)
chr2 (151-443)||(44437718-44438010)
chr2 (312-443)||(8197538-8197669)
chr2 (312-443)||(8202298-8202429)
chr2 (369-443)||(43832309-43832383)
chr2 (302-443)||(12489799-12489940)
chr2 (367-440)||(17429259-17429332)
chr2 (370-443)||(17626284-17626357)
chr2 (77-227)||(7825276-7825429)
chr2 (85-443)||(9556366-9556724)
chr2 (326-437)||(45077895-45078008)
chr2 (319-443)||(6219126-6219250)
chr2 (77-235)||(9647814-9647969)
chr2 (123-265)||(11017280-11017421)
chr2 (315-440)||(11412865-11412992)
chr2 (359-405)||(19334187-19334233)
chr2 (197-443)||(42543274-42543520)
chr2 (158-265)||(3481144-3481248)
chr2 (362-443)||(15015149-15015230)
chr2 (81-201)||(19337089-19337209)
chr2 (355-436)||(33504421-33504502)
chr2 (357-438)||(34931631-34931712)
chr2 (77-133)||(451930-451986)
chr2 (355-443)||(3481351-3481439)
chr2 (158-222)||(6218967-6219031)
chr2 (353-441)||(13443907-13443995)
chr2 (326-402)||(36650610-36650686)
chr2 (171-227)||(41858744-41858800)
chr2 (77-225)||(42092437-42092584)
chr2 (77-227)||(4598775-4598928)
chr2 (360-443)||(42549834-42549917)
chr2 (77-143)||(24583904-24583970)
chr2 (369-443)||(25384680-25384754)
chr2 (378-440)||(36993755-36993816)
chr2 (125-225)||(41545372-41545474)
chr2 (362-439)||(624687-624764)
chr2 (364-433)||(4598569-4598638)
chr2 (359-440)||(5758995-5759076)
chr2 (394-443)||(8560803-8560852)
chr2 (387-440)||(10516749-10516802)
chr2 (158-235)||(11412721-11412798)
chr2 (387-440)||(16521007-16521060)
chr2 (342-447)||(17581643-17581748)
chr2 (81-210)||(30743545-30743674)
chr2 (359-443)||(12470894-12470978)
chr2 (158-210)||(12882270-12882322)
chr2 (387-443)||(15775842-15775898)
chr2 (357-441)||(28960210-28960294)
chr2 (325-441)||(32402667-32402783)
chr2 (367-443)||(33393319-33393394)
chr2 (284-445)||(37470124-37470289)
chr2 (160-224)||(41330131-41330195)
chr2 (342-437)||(186135-186230)
chr2 (388-443)||(14444899-14444954)
chr2 (77-227)||(23714474-23714622)
chr2 (77-227)||(24102146-24102294)
chr2 (366-439)||(887065-887139)
chr2 (326-364)||(4682253-4682291)
chr2 (368-442)||(14197205-14197279)
chr2 (159-217)||(19024181-19024239)
chr2 (359-440)||(33594272-33594354)
chr2 (326-380)||(36616856-36616910)
chr2 (157-194)||(227321-227358)
chr2 (174-227)||(13240958-13241011)
chr2 (410-443)||(14530532-14530565)
chr2 (367-416)||(19224990-19225039)
chr2 (387-440)||(32706472-32706525)
chr2 (387-436)||(45482989-45483038)
[»] chr1 (144 HSPs)
chr1 (81-442)||(696191-696554)
chr1 (82-443)||(4001452-4001814)
chr1 (77-443)||(1210663-1211030)
chr1 (77-443)||(30202127-30202494)
chr1 (77-442)||(34792347-34792713)
chr1 (77-443)||(8671838-8672203)
chr1 (77-442)||(9592652-9593018)
chr1 (77-440)||(49347393-49347757)
chr1 (77-443)||(22090012-22090381)
chr1 (84-443)||(51601983-51602341)
chr1 (81-443)||(15085856-15086207)
chr1 (77-441)||(51440764-51441129)
chr1 (81-443)||(32082753-32083105)
chr1 (81-416)||(8391694-8392030)
chr1 (77-439)||(43240380-43240745)
chr1 (80-397)||(32230997-32231315)
chr1 (176-443)||(25979228-25979495)
chr1 (84-443)||(38807668-38808031)
chr1 (157-443)||(4029121-4029407)
chr1 (240-443)||(37311752-37311955)
chr1 (273-440)||(52921195-52921362)
chr1 (221-443)||(39318193-39318413)
chr1 (81-438)||(37462878-37463231)
chr1 (77-405)||(9509236-9509565)
chr1 (123-437)||(39140484-39140794)
chr1 (278-442)||(4415469-4415633)
chr1 (81-440)||(18469082-18469440)
chr1 (159-442)||(32404525-32404807)
chr1 (77-402)||(9599432-9599758)
chr1 (188-439)||(52561590-52561841)
chr1 (90-443)||(27847797-27848155)
chr1 (322-440)||(46423216-46423331)
chr1 (312-441)||(32079176-32079303)
chr1 (158-443)||(48431396-48431688)
chr1 (322-443)||(4707218-4707338)
chr1 (320-443)||(10200303-10200426)
chr1 (312-443)||(41560383-41560514)
chr1 (158-440)||(2544599-2544875)
chr1 (330-443)||(24020264-24020377)
chr1 (326-442)||(43375596-43375712)
chr1 (351-442)||(44941774-44941865)
chr1 (372-442)||(3777258-3777328)
chr1 (350-440)||(21769711-21769801)
chr1 (312-401)||(16142019-16142108)
chr1 (350-443)||(28090691-28090784)
chr1 (351-440)||(42337749-42337838)
chr1 (315-443)||(19936617-19936745)
chr1 (351-443)||(44751677-44751769)
chr1 (367-442)||(29577461-29577536)
chr1 (312-442)||(52532614-52532744)
chr1 (325-442)||(6025772-6025889)
chr1 (367-440)||(28533676-28533749)
chr1 (339-440)||(40568410-40568511)
chr1 (312-439)||(29128937-29129065)
chr1 (87-227)||(43423645-43423788)
chr1 (173-443)||(478695-478966)
chr1 (158-228)||(1661430-1661500)
chr1 (355-441)||(8796406-8796492)
chr1 (341-443)||(34444539-34444641)
chr1 (362-443)||(51584948-51585029)
chr1 (161-265)||(35828725-35828829)
chr1 (312-443)||(3818853-3818984)
chr1 (161-440)||(36339804-36340082)
chr1 (355-442)||(50846759-50846846)
chr1 (341-443)||(6084158-6084260)
chr1 (123-441)||(36623884-36624184)
chr1 (77-222)||(14226047-14226191)
chr1 (354-439)||(22175341-22175426)
chr1 (355-440)||(25715326-25715411)
chr1 (342-443)||(31274398-31274499)
chr1 (357-442)||(38869081-38869166)
chr1 (367-443)||(5113952-5114028)
chr1 (161-265)||(5338727-5338831)
chr1 (327-437)||(15438800-15438906)
chr1 (368-440)||(38877343-38877415)
chr1 (387-443)||(43481795-43481851)
chr1 (355-443)||(50636278-50636366)
chr1 (388-443)||(37430417-37430472)
chr1 (77-227)||(40419557-40419708)
chr1 (313-392)||(44905404-44905483)
chr1 (169-224)||(44905548-44905603)
chr1 (352-438)||(1290033-1290119)
chr1 (385-443)||(4318842-4318900)
chr1 (158-228)||(13827929-13827999)
chr1 (215-401)||(27520246-27520428)
chr1 (81-339)||(34827205-34827462)
chr1 (385-443)||(41165509-41165567)
chr1 (158-227)||(52073675-52073745)
chr1 (326-443)||(5338881-5338998)
chr1 (312-381)||(7762496-7762565)
chr1 (326-403)||(48865744-48865821)
chr1 (355-440)||(50257767-50257852)
chr1 (138-443)||(52832026-52832330)
chr1 (367-443)||(1704836-1704912)
chr1 (367-443)||(10569068-10569144)
chr1 (331-435)||(19908040-19908144)
chr1 (355-423)||(29808053-29808121)
chr1 (388-443)||(2914120-2914175)
chr1 (320-443)||(11941577-11941700)
chr1 (157-264)||(13827746-13827853)
chr1 (169-228)||(27704021-27704080)
chr1 (81-226)||(4379927-4380081)
chr1 (278-376)||(8628150-8628248)
chr1 (358-444)||(16272818-16272903)
chr1 (393-443)||(38758017-38758067)
chr1 (161-235)||(40416374-40416448)
chr1 (356-442)||(45510831-45510917)
chr1 (355-436)||(27072491-27072572)
chr1 (371-440)||(33560858-33560927)
chr1 (387-439)||(4590533-4590585)
chr1 (387-443)||(7133299-7133355)
chr1 (343-443)||(12930308-12930408)
chr1 (362-438)||(15437130-15437206)
chr1 (77-228)||(26016355-26016507)
chr1 (387-443)||(26299297-26299353)
chr1 (367-443)||(32111986-32112062)
chr1 (80-112)||(39140434-39140466)
chr1 (388-440)||(43898439-43898491)
chr1 (353-429)||(48801625-48801700)
chr1 (359-442)||(14224286-14224368)
chr1 (173-228)||(16822234-16822289)
chr1 (357-428)||(30445304-30445375)
chr1 (184-219)||(31274578-31274613)
chr1 (341-440)||(35828562-35828661)
chr1 (355-446)||(52633166-52633257)
chr1 (388-443)||(52814291-52814346)
chr1 (188-226)||(7762651-7762689)
chr1 (166-224)||(7921843-7921901)
chr1 (158-228)||(8343070-8343140)
chr1 (312-405)||(8676897-8676993)
chr1 (367-437)||(16943364-16943434)
chr1 (359-417)||(28528556-28528614)
chr1 (326-436)||(29577147-29577256)
chr1 (158-224)||(37263331-37263397)
chr1 (135-224)||(38868858-38868948)
chr1 (82-155)||(51234537-51234611)
chr1 (102-179)||(52561872-52561950)
chr1 (312-397)||(11331247-11331332)
chr1 (312-397)||(11489268-11489353)
chr1 (410-443)||(22930645-22930678)
chr1 (358-423)||(26113456-26113521)
chr1 (387-444)||(42539208-42539265)
chr1 (386-439)||(44008806-44008859)
chr1 (355-440)||(50806864-50806949)
[»] chr4 (157 HSPs)
chr4 (77-440)||(31959814-31960178)
chr4 (77-440)||(48622543-48622905)
chr4 (77-443)||(436147-436514)
chr4 (77-443)||(52569512-52569879)
chr4 (81-440)||(27450180-27450533)
chr4 (77-443)||(48174090-48174457)
chr4 (77-441)||(56375208-56375573)
chr4 (77-441)||(1777016-1777379)
chr4 (77-443)||(33227127-33227494)
chr4 (77-443)||(4440773-4441138)
chr4 (77-442)||(33190846-33191212)
chr4 (77-443)||(53707712-53708079)
chr4 (77-443)||(43433836-43434209)
chr4 (81-441)||(27983122-27983476)
chr4 (90-443)||(37797783-37798136)
chr4 (81-443)||(39100533-39100893)
chr4 (77-440)||(23906297-23906665)
chr4 (177-441)||(32479057-32479321)
chr4 (80-405)||(37773486-37773811)
chr4 (77-443)||(46582823-46583188)
chr4 (77-445)||(28236103-28236469)
chr4 (77-442)||(47265193-47265566)
chr4 (77-414)||(50286889-50287217)
chr4 (159-439)||(26037506-26037786)
chr4 (159-433)||(39708434-39708708)
chr4 (182-443)||(8286455-8286724)
chr4 (146-437)||(20192022-20192311)
chr4 (81-437)||(1793382-1793741)
chr4 (286-443)||(21528416-21528573)
chr4 (81-443)||(45204837-45205208)
chr4 (93-441)||(51421666-51422013)
chr4 (253-443)||(21236953-21237143)
chr4 (286-443)||(6957726-6957883)
chr4 (84-443)||(1211389-1211747)
chr4 (134-393)||(20591353-20591607)
chr4 (77-202)||(12494668-12494794)
chr4 (286-443)||(12494791-12494948)
chr4 (84-423)||(20601669-20602003)
chr4 (276-440)||(51811280-51811442)
chr4 (84-376)||(41009414-41009707)
chr4 (286-435)||(7947065-7947214)
chr4 (242-390)||(50679588-50679736)
chr4 (77-226)||(31458946-31459098)
chr4 (89-397)||(16002857-16003165)
chr4 (276-439)||(4548140-4548303)
chr4 (196-443)||(20821001-20821251)
chr4 (330-443)||(19154860-19154973)
chr4 (335-443)||(19969358-19969466)
chr4 (278-443)||(35690391-35690556)
chr4 (326-443)||(55007914-55008031)
chr4 (312-440)||(28550455-28550583)
chr4 (81-180)||(35690226-35690326)
chr4 (312-443)||(31043226-31043357)
chr4 (216-441)||(28351617-28351842)
chr4 (189-439)||(53518325-53518571)
chr4 (352-443)||(883357-883448)
chr4 (312-443)||(31961263-31961394)
chr4 (358-443)||(19061932-19062017)
chr4 (123-235)||(44047553-44047666)
chr4 (365-441)||(49939733-49939809)
chr4 (279-365)||(50862764-50862851)
chr4 (341-443)||(2589255-2589357)
chr4 (77-443)||(56224983-56225353)
chr4 (326-443)||(25574992-25575109)
chr4 (77-217)||(49987346-49987487)
chr4 (355-443)||(13805262-13805350)
chr4 (315-443)||(31459151-31459279)
chr4 (331-443)||(34208266-34208378)
chr4 (123-227)||(51252674-51252777)
chr4 (80-227)||(54470128-54470276)
chr4 (77-191)||(10775671-10775786)
chr4 (355-442)||(12443292-12443379)
chr4 (364-443)||(32633403-32633482)
chr4 (77-226)||(33709837-33709992)
chr4 (376-443)||(50238612-50238679)
chr4 (376-443)||(50238698-50238765)
chr4 (359-437)||(13262413-13262491)
chr4 (302-444)||(26024846-26024988)
chr4 (162-228)||(29398822-29398888)
chr4 (159-228)||(35555859-35555928)
chr4 (312-437)||(37042667-37042792)
chr4 (359-444)||(50869876-50869961)
chr4 (355-443)||(6958236-6958323)
chr4 (363-443)||(7066496-7066575)
chr4 (77-265)||(25257756-25257943)
chr4 (387-443)||(30634103-30634159)
chr4 (159-227)||(42639233-42639301)
chr4 (355-443)||(51438642-51438730)
chr4 (326-438)||(55388213-55388325)
chr4 (312-443)||(37488245-37488376)
chr4 (388-443)||(45209202-45209257)
chr4 (369-440)||(47372915-47372986)
chr4 (341-443)||(5306479-5306581)
chr4 (158-440)||(46372024-46372306)
chr4 (81-262)||(50662311-50662492)
chr4 (281-443)||(53540413-53540575)
chr4 (390-443)||(46153940-46153993)
chr4 (387-443)||(1328611-1328667)
chr4 (79-265)||(25755237-25755424)
chr4 (355-443)||(29399001-29399089)
chr4 (359-443)||(35622673-35622757)
chr4 (388-440)||(38017319-38017371)
chr4 (359-443)||(42285700-42285784)
chr4 (361-441)||(44360289-44360369)
chr4 (392-444)||(56130404-56130456)
chr4 (158-265)||(28497490-28497596)
chr4 (326-441)||(41192229-41192344)
chr4 (388-443)||(44719358-44719413)
chr4 (282-369)||(55809061-55809148)
chr4 (158-228)||(10209034-10209104)
chr4 (387-441)||(15665330-15665384)
chr4 (77-228)||(17900398-17900550)
chr4 (165-227)||(26356626-26356688)
chr4 (339-381)||(41729509-41729551)
chr4 (168-258)||(42285882-42285972)
chr4 (289-443)||(42293262-42293416)
chr4 (357-443)||(54935348-54935434)
chr4 (362-439)||(3979124-3979201)
chr4 (341-438)||(22873601-22873698)
chr4 (359-440)||(31897428-31897509)
chr4 (158-235)||(41192836-41192913)
chr4 (158-227)||(44360087-44360155)
chr4 (387-443)||(4879106-4879162)
chr4 (387-443)||(15661869-15661925)
chr4 (355-443)||(20105515-20105603)
chr4 (117-201)||(28467242-28467324)
chr4 (158-226)||(30621418-30621486)
chr4 (367-443)||(32339768-32339844)
chr4 (341-433)||(34233031-34233123)
chr4 (88-227)||(38570960-38571099)
chr4 (312-376)||(41009283-41009347)
chr4 (163-227)||(46715585-46715649)
chr4 (172-228)||(47611741-47611797)
chr4 (388-440)||(49738550-49738602)
chr4 (124-228)||(50471493-50471596)
chr4 (387-435)||(50862860-50862908)
chr4 (355-438)||(1095642-1095725)
chr4 (388-439)||(4136744-4136795)
chr4 (367-438)||(34585691-34585762)
chr4 (357-440)||(36799657-36799740)
chr4 (170-213)||(38841811-38841854)
chr4 (320-402)||(36198977-36199059)
chr4 (165-262)||(50680746-50680844)
chr4 (387-441)||(50967027-50967081)
chr4 (158-224)||(55768717-55768783)
chr4 (158-224)||(55832973-55833039)
chr4 (159-228)||(1427496-1427565)
chr4 (410-443)||(3601416-3601449)
chr4 (162-227)||(7092433-7092498)
chr4 (367-440)||(8284348-8284421)
chr4 (359-443)||(10209237-10209319)
chr4 (359-443)||(10775468-10775550)
chr4 (85-154)||(25967554-25967623)
chr4 (328-381)||(26510558-26510611)
chr4 (82-139)||(40933198-40933255)
chr4 (158-235)||(49738809-49738886)
chr4 (165-226)||(55579040-55579100)
[»] chr8 (119 HSPs)
chr8 (77-443)||(36545065-36545434)
chr8 (81-443)||(42854001-42854364)
chr8 (77-442)||(36565239-36565605)
chr8 (77-443)||(40813240-40813609)
chr8 (77-439)||(36394949-36395314)
chr8 (125-443)||(11523720-11524040)
chr8 (77-392)||(39946775-39947091)
chr8 (160-437)||(12491141-12491418)
chr8 (81-441)||(18125097-18125454)
chr8 (77-423)||(2796473-2796818)
chr8 (131-437)||(8932676-8932982)
chr8 (232-443)||(42469724-42469935)
chr8 (189-443)||(21121177-21121430)
chr8 (81-320)||(18751996-18752233)
chr8 (81-443)||(37077687-37078034)
chr8 (285-443)||(14742079-14742234)
chr8 (81-440)||(45419161-45419517)
chr8 (259-443)||(2027631-2027815)
chr8 (216-436)||(12025847-12026058)
chr8 (178-397)||(26904950-26905168)
chr8 (123-440)||(8879446-8879758)
chr8 (319-443)||(15215409-15215533)
chr8 (312-441)||(25473402-25473531)
chr8 (328-440)||(44529395-44529507)
chr8 (331-443)||(44047529-44047641)
chr8 (202-440)||(29520694-29520931)
chr8 (312-439)||(25288918-25289045)
chr8 (312-439)||(25300253-25300380)
chr8 (326-443)||(490503-490620)
chr8 (83-251)||(6510617-6510784)
chr8 (167-443)||(32930970-32931245)
chr8 (161-405)||(43904700-43904947)
chr8 (77-160)||(12492123-12492206)
chr8 (281-443)||(35643605-35643765)
chr8 (312-441)||(45041315-45041443)
chr8 (312-443)||(30559847-30559983)
chr8 (128-246)||(12796894-12797011)
chr8 (79-224)||(13171865-13172011)
chr8 (77-235)||(30748377-30748534)
chr8 (91-443)||(32043522-32043872)
chr8 (77-441)||(39953263-39953628)
chr8 (281-440)||(2216411-2216568)
chr8 (388-442)||(39967497-39967551)
chr8 (326-443)||(42584527-42584643)
chr8 (367-443)||(27556299-27556375)
chr8 (362-446)||(30689939-30690023)
chr8 (312-440)||(35914601-35914729)
chr8 (355-443)||(41031417-41031505)
chr8 (355-443)||(41031523-41031611)
chr8 (351-443)||(8255528-8255622)
chr8 (280-443)||(28169514-28169676)
chr8 (368-442)||(1928585-1928659)
chr8 (157-235)||(2776434-2776512)
chr8 (368-442)||(10668495-10668569)
chr8 (169-227)||(35643814-35643872)
chr8 (158-235)||(9695631-9695708)
chr8 (81-154)||(15215558-15215631)
chr8 (326-443)||(21425214-21425331)
chr8 (341-442)||(23492217-23492318)
chr8 (361-446)||(36042401-36042486)
chr8 (119-258)||(7046294-7046434)
chr8 (312-439)||(14459049-14459177)
chr8 (77-172)||(25288820-25288916)
chr8 (77-172)||(25300155-25300251)
chr8 (330-443)||(31715992-31716107)
chr8 (367-443)||(32276894-32276970)
chr8 (367-443)||(32569707-32569783)
chr8 (355-439)||(36143538-36143622)
chr8 (160-228)||(44681251-44681319)
chr8 (158-226)||(45512709-45512777)
chr8 (359-442)||(30812814-30812897)
chr8 (81-194)||(13986416-13986530)
chr8 (357-439)||(18473973-18474055)
chr8 (158-219)||(41444547-41444608)
chr8 (359-443)||(7531641-7531725)
chr8 (388-440)||(12611727-12611779)
chr8 (160-228)||(13589488-13589556)
chr8 (388-436)||(26055651-26055699)
chr8 (378-442)||(35323993-35324057)
chr8 (287-439)||(35362651-35362803)
chr8 (323-443)||(41444336-41444456)
chr8 (159-227)||(41971991-41972058)
chr8 (362-442)||(43733410-43733490)
chr8 (341-437)||(44699649-44699745)
chr8 (355-442)||(10824187-10824274)
chr8 (359-434)||(16351578-16351653)
chr8 (100-191)||(25985462-25985552)
chr8 (325-440)||(26363655-26363768)
chr8 (341-444)||(30198262-30198365)
chr8 (393-443)||(1064955-1065005)
chr8 (161-227)||(18474173-18474239)
chr8 (82-179)||(29520583-29520681)
chr8 (358-436)||(39702154-39702232)
chr8 (361-444)||(41212064-41212149)
chr8 (345-438)||(2518400-2518493)
chr8 (390-443)||(16921451-16921504)
chr8 (77-118)||(30456534-30456575)
chr8 (367-440)||(35646930-35647003)
chr8 (160-265)||(36143367-36143472)
chr8 (81-154)||(37256004-37256077)
chr8 (359-444)||(38901815-38901900)
chr8 (399-443)||(32978115-32978159)
chr8 (82-228)||(10080119-10080264)
chr8 (327-438)||(16917352-16917462)
chr8 (312-363)||(25439479-25439530)
chr8 (165-228)||(29645044-29645107)
chr8 (287-414)||(38391919-38392046)
chr8 (387-442)||(39651026-39651081)
chr8 (367-437)||(1313773-1313843)
chr8 (189-227)||(9905094-9905132)
chr8 (388-442)||(11129951-11130004)
chr8 (326-405)||(12966347-12966428)
chr8 (341-443)||(14903744-14903846)
chr8 (345-423)||(16035744-16035822)
chr8 (158-228)||(25985812-25985881)
chr8 (158-228)||(29700276-29700346)
chr8 (158-227)||(2518605-2518674)
chr8 (121-221)||(30113416-30113517)
chr8 (330-439)||(36069774-36069883)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (77-443)||(28085294-28085661)
chr6 (85-443)||(5258145-5258506)
chr6 (77-443)||(32755837-32756206)
chr6 (81-439)||(608081-608442)
chr6 (81-440)||(9706698-9707052)
chr6 (81-440)||(35043441-35043801)
chr6 (82-400)||(5631741-5632064)
chr6 (81-443)||(20427633-20427996)
chr6 (81-437)||(30031178-30031535)
chr6 (121-405)||(21351872-21352155)
chr6 (77-443)||(14030724-14031080)
chr6 (131-443)||(12890556-12890860)
chr6 (81-306)||(10099993-10100217)
chr6 (81-441)||(9593709-9594072)
chr6 (169-442)||(30679417-30679680)
chr6 (160-397)||(33496963-33497198)
chr6 (281-443)||(34143762-34143924)
chr6 (281-443)||(34156378-34156540)
chr6 (321-443)||(3206456-3206578)
chr6 (77-371)||(28026896-28027189)
chr6 (331-443)||(31819004-31819116)
chr6 (329-440)||(34934830-34934941)
chr6 (223-401)||(5080905-5081083)
chr6 (207-335)||(7133795-7133923)
chr6 (207-335)||(7136718-7136846)
chr6 (164-440)||(2689646-2689915)
chr6 (280-440)||(5095956-5096116)
chr6 (359-443)||(30789071-30789155)
chr6 (312-443)||(10098893-10099022)
chr6 (281-443)||(34502-34664)
chr6 (355-443)||(4245869-4245957)
chr6 (166-405)||(24665818-24666058)
chr6 (320-442)||(5897619-5897741)
chr6 (81-191)||(5080777-5080888)
chr6 (312-440)||(31818685-31818813)
chr6 (88-405)||(6055806-6056123)
chr6 (77-228)||(33083976-33084128)
chr6 (319-438)||(7492550-7492669)
chr6 (354-440)||(12119642-12119729)
chr6 (367-440)||(1615223-1615296)
chr6 (355-443)||(579615-579703)
chr6 (161-221)||(8364575-8364635)
chr6 (369-441)||(12133901-12133973)
chr6 (367-442)||(9109507-9109582)
chr6 (341-443)||(6293389-6293491)
chr6 (326-399)||(14389202-14389275)
chr6 (368-437)||(21886314-21886383)
chr6 (387-440)||(33730194-33730247)
chr6 (77-154)||(33998291-33998368)
chr6 (363-443)||(38976-39056)
chr6 (81-145)||(2689578-2689642)
chr6 (281-441)||(8364679-8364839)
chr6 (160-228)||(14389380-14389447)
chr6 (159-226)||(2079341-2079408)
chr6 (389-448)||(6906819-6906878)
chr6 (367-437)||(21089606-21089676)
chr6 (410-443)||(3127273-3127306)
chr6 (410-443)||(4878294-4878327)
chr6 (77-114)||(6293696-6293733)
[»] chr5 (108 HSPs)
chr5 (81-440)||(3301766-3302126)
chr5 (85-443)||(4496308-4496669)
chr5 (77-443)||(28976856-28977221)
chr5 (77-441)||(24178428-24178793)
chr5 (77-443)||(12492381-12492751)
chr5 (124-433)||(38684932-38685242)
chr5 (77-443)||(1275183-1275549)
chr5 (81-440)||(16347380-16347738)
chr5 (77-441)||(1287578-1287953)
chr5 (77-438)||(2075475-2075838)
chr5 (77-443)||(10639215-10639587)
chr5 (119-443)||(14665670-14665997)
chr5 (161-439)||(20456776-20457054)
chr5 (247-442)||(13561384-13561579)
chr5 (77-442)||(34272940-34273297)
chr5 (216-443)||(2915493-2915719)
chr5 (90-443)||(26884686-26885040)
chr5 (253-443)||(14911267-14911457)
chr5 (289-443)||(29816513-29816667)
chr5 (302-440)||(16913882-16914021)
chr5 (77-400)||(36215418-36215730)
chr5 (331-441)||(5558314-5558424)
chr5 (319-443)||(2393038-2393161)
chr5 (198-436)||(38501422-38501660)
chr5 (81-409)||(32516480-32516806)
chr5 (123-393)||(14749271-14749542)
chr5 (123-235)||(15168756-15168869)
chr5 (338-443)||(30213755-30213860)
chr5 (278-441)||(28002-28165)
chr5 (312-443)||(28276392-28276523)
chr5 (350-441)||(18855799-18855890)
chr5 (129-228)||(33667188-33667286)
chr5 (320-443)||(39040918-39041041)
chr5 (321-443)||(418031-418153)
chr5 (341-443)||(32442123-32442224)
chr5 (158-231)||(31636129-31636202)
chr5 (81-209)||(27816-27944)
chr5 (158-265)||(79513-79620)
chr5 (326-440)||(43557833-43557947)
chr5 (369-442)||(408492-408565)
chr5 (77-218)||(11002645-11002785)
chr5 (326-443)||(14667939-14668056)
chr5 (312-428)||(9235201-9235316)
chr5 (359-438)||(3442873-3442952)
chr5 (160-442)||(7359259-7359539)
chr5 (312-442)||(11675683-11675814)
chr5 (82-225)||(21952274-21952424)
chr5 (321-440)||(31220546-31220664)
chr5 (355-437)||(7640510-7640592)
chr5 (80-376)||(17340500-17340798)
chr5 (158-235)||(18351112-18351190)
chr5 (341-443)||(20367076-20367178)
chr5 (320-441)||(2090575-2090696)
chr5 (332-441)||(36551320-36551429)
chr5 (329-394)||(42504293-42504358)
chr5 (119-224)||(418201-418307)
chr5 (165-440)||(1525651-1525923)
chr5 (355-443)||(6859578-6859666)
chr5 (281-441)||(7678601-7678760)
chr5 (367-443)||(28411885-28411961)
chr5 (387-443)||(42576239-42576295)
chr5 (368-435)||(2713146-2713213)
chr5 (341-436)||(8081967-8082059)
chr5 (362-437)||(11002424-11002499)
chr5 (355-441)||(2645187-2645273)
chr5 (77-147)||(20318905-20318970)
chr5 (79-141)||(36200702-36200764)
chr5 (367-441)||(38132545-38132619)
chr5 (158-227)||(6888993-6889062)
chr5 (363-440)||(9121078-9121155)
chr5 (159-228)||(28676596-28676665)
chr5 (326-423)||(30588615-30588712)
chr5 (158-226)||(15489706-15489774)
chr5 (355-443)||(21193649-21193737)
chr5 (161-265)||(43475243-43475347)
chr5 (359-442)||(5860035-5860118)
chr5 (188-446)||(23979976-23980232)
chr5 (367-442)||(32366187-32366262)
chr5 (171-266)||(42199299-42199394)
chr5 (312-378)||(2552936-2553002)
chr5 (158-228)||(2712944-2713014)
chr5 (378-440)||(9234106-9234168)
chr5 (158-227)||(10082952-10083021)
chr5 (315-443)||(14725675-14725803)
chr5 (387-440)||(27386569-27386622)
chr5 (366-443)||(27800036-27800113)
chr5 (90-226)||(31906592-31906729)
chr5 (368-441)||(42272687-42272760)
chr5 (159-256)||(43558011-43558108)
chr5 (158-210)||(14667763-14667815)
chr5 (341-405)||(18350937-18351001)
chr5 (82-154)||(34039960-34040032)
chr5 (367-443)||(41200343-41200419)
chr5 (355-442)||(9400708-9400795)
chr5 (360-435)||(28985285-28985360)
chr5 (326-441)||(38684648-38684763)
chr5 (341-416)||(41808105-41808180)
chr5 (312-402)||(6889147-6889237)
chr5 (387-440)||(3000968-3001021)
chr5 (158-235)||(4026540-4026617)
chr5 (382-443)||(4653476-4653537)
chr5 (392-441)||(5303681-5303730)
chr5 (158-227)||(6859381-6859450)
chr5 (367-442)||(9917458-9917530)
chr5 (326-439)||(12576861-12576974)
chr5 (79-112)||(27998343-27998376)
chr5 (367-440)||(28186782-28186855)
chr5 (315-364)||(36200886-36200935)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (77-443)||(31386-31753)
scaffold0018 (158-228)||(44080-44150)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (123-443)||(945-1264)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (81-440)||(82643-83000)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (79-443)||(4277-4634)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (81-443)||(86606-86967)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (272-440)||(16692-16860)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (228-443)||(4706-4921)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (286-443)||(25529-25686)
scaffold0157 (77-202)||(25683-25809)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (77-226)||(11810-11962)
scaffold0113 (200-443)||(11546-11787)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (312-441)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (312-443)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (350-443)||(28886-28979)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (138-438)||(7422-7720)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (281-443)||(58223-58385)
scaffold0050 (158-224)||(45644-45710)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (312-443)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (312-439)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (352-438)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (355-441)||(6771-6857)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (162-226)||(11802-11866)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (390-443)||(19149-19202)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 635
Target Start/End: Original strand, 25191297 - 25191854
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25191297 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatgggg-gtagcacctatagtag 25191395  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  25191396 aaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggt 25191495  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191496 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaaca 25191595  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgata 476  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191596 ctatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtcgttgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgata 25191695  T
Q  477 gcgagataatttaatattttattttaagtaaattttactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagtacatagatagattctcgtacttaccc 576  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191696 gcgagataatttaatatttgattttaagtaaattttactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagtacatagatagattctcgtacttaccc 25191795  T
Q  577 tttgagcaaagacaacaacaacaaaaaagagttaccctttgagcacaacaaaattacaa 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25191796 tttgagcaaagacaacaacaacaaaaaagagttaccctttgagcacaccaaaattacaa 25191854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22357
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||  | ||||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 52138718 - 52139084
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52138718 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  || |    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169117
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  |    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233596
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 28245355 - 28245721
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  28245355 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28245454  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||  || |    
T  28245455 gaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaag 28245554  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||    
T  28245555 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaac 28245654  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245655 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 157 - 440
Target Start/End: Original strand, 35033145 - 35033428
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  35033145 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaagaagagtaaat 35033244  T
Q  257 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 356  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35033245 caaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 35033344  T
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033345 atatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 51448073 - 51447714
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  51448073 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtagggtagcacctatagtag 51447974  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  51447973 aaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 51447874  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||||       ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  51447873 taaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 51447781  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447780 ctatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 54278938 - 54279304
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  54278938 agcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 84 - 443
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519865
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctata------gtag 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Original strand, 54128296 - 54128662
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54128296 agcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||| ||||||   |  |||     
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatt-tgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    |  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43695127 - 43694768
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatga-----taggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||     |||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||    
T  43695127 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgacag----agagagagtggggggtagcacctatag 43695032  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  |||||||||| ||  |||       
T  43695031 tagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaag--gaa--- 43694937  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||   ||||| |||||||    
T  43694936 -gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgataga 43694838  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694837 acaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 443
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  191 aatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 290  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  291 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 390  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  391 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 77 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33272392 - 33272122
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctata- 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||     
T  33272392 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatat 33272293  T
Q  173 ---gtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 269  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | | ||||||||||| |||    
T  33272292 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggaga 33272194  T
Q  270 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 341  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272193 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 359  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  360 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45289375 - 45289091
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 255  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||| ||  ||||||   || |||||||||| |||    
T  45289375 ggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtaga 45289276  T
Q  256 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 355  Q
    ||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  45289275 tcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcca 45289176  T
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289175 aatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Original strand, 38060430 - 38060579
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38060430 gggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagat 38060529  T
Q  257 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 306  Q
     |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060530 taaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Original strand, 45728064 - 45728324
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaa-agagagtg-gggggtagcacctatagt 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||   |||||||||| ||||||| |||| | |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  45728064 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagt 45728163  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaagaagag--aagatcaaatggagaagaac 271  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||   | ||||||||||| |||      
T  45728164 agaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagt 45728263  T
Q  272 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 332  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728264 catgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  296 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 395  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  396 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  264 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||| | | |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| | |||| |||||||| |||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgaggtatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtagggag 54425190  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 315  Q
    |||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||     
T  54425189 aagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagagg 54425090  T
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatcca 409  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || ||     
T  54425089 gaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccc 54424990  T
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54424989 acttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |||||| ||||||  ||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgagg-tagcacctatagtagaaaa 26490337  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| |||||| || ||| |||| ||  ||| |    
T  26490338 gatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattaga 26490437  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
     |||| || ||||||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| || |||   |||||| | |||    
T  26490438 tgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattat 26490537  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    | | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490538 ggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  93 ttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtgttgggg-tagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaa 48734383  T
Q  193 tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 292  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||| |||||||  |   || | |||||||||||||||    
T  48734382 taggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagga 48734283  T
Q  293 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 392  Q
    ||  |            |||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | ||||    
T  48734282 aggcc------------ttgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttga 48734195  T
Q  393 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734194 tccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  327 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 426  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  427 ttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 405
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503565
Alignment:
Q  98 ttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatg 196  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  197 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 296  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||   ||  ||  || || |||||| ||||||  ||  | | ||| |||| |||||||||||     
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  297 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 396  Q
    |||              ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | ||||||||||    
T  49503697 cta--------------gaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  397 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 27917490 - 27917639
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||  |||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27917490 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttgggg-tagcacctatagtag 27917588  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27917589 aaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 363
Target Start/End: Original strand, 3186733 - 3186973
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || || | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3186733 gataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggct-agatgatttgggcatgtagaga 3186831  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    |||||   ||||||  | ||||||||| |  |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| ||  || ||| |||    
T  3186832 gaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcat 3186931  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 363  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186932 tagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 410  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 440
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  402 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  162 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 261  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  262 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 361  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39600999 - 39600683
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||| | |||||| |||    
T  39600999 gataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaaga 39600900  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    ||||||| |||||| | || |  || |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||    
T  39600899 gaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 39600800  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || || | || |||| ||| |||    
T  39600799 taagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggat 39600700  T
Q  422 aatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  39600699 aagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 430
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758158
Alignment:
Q  89 gatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatt--aaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||| |||||| | ||| | ||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  187 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggt 286  Q
    |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggt 19758027  T
Q  287 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 386  Q
    ||||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||  ||     
T  19758028 agaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtata 19758115  T
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758116 atttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  336 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  436 gttgttgt 443  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 54365290 - 54364976
Alignment:
Q  125 taggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagaga- 223  Q
    ||||||||| ||||| |  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  54365290 taggattagaaatgaaaatattagagagagttgggg-tagcacctatagtagaaaatatggcggaaaata-gcttaggtggtttgggcatgtagagagag 54365193  T
Q  224 -agacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
     | ||| |||||| |  || |||| |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| |||    
T  54365192 aatacctgtagattctattataaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatt 54365093  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    || ||||| || ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||    
T  54365092 aggaaagacttggagattaatgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggata 54364994  T
Q  423 atgcttggttgttgttgt 440  Q
    | |||||| |||||||||    
T  54364993 aggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  260 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 359  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  360 tggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 430
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737255
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg--gggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||| |||||| | ||| | ||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    ||| |||||||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |    
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatca 19737117  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||| |||| |||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||| |    
T  19737118 aaa-aggttgaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacatt 19737204  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    |||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737205 atggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 333 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  333 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 432  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  433 gttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  419 gataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36820323 - 36820166
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| || | ||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  36820323 agcaaagataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttgggg-tagcacctatattag 36820225  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
     |||| |||| |||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820224 caaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 443
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 437
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  317 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 410  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23534929 - 23534787
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || |||||| | |   |||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  23534929 gagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagagagagttgggggtagcatttatagtaaaaaa 23534830  T
Q  181 gttggtagaaaatat--gcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    | ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  23534829 gatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga 23534787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 440
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  426 cttggttgttgttgt 440  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 38850012 - 38850089
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  38850012 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagag 38850089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  350 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 440
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 443
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  345 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  162 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340928
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||| |||  |||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    || |||| ||||||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||    
T  2340974 agatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaaga 2340928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  259 aatggag 265  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 3987047 - 3987116
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3987047 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  242 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 341  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  342 atgagttagatccaaatatggt 363  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 219
Target Start/End: Original strand, 29817422 - 29817565
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta--aagagagtggggggtagcacctatagt 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||  ||||||||||||||   ||  || ||| | || | |||||||||||||    
T  29817422 agcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtg-tagcacctatagt 29817520  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtaga 219  Q
    ||||||| | ||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  29817521 agaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454441
Alignment:
Q  129 attaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgttggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaaga 31454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 437
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  328 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 437
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 443
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  363 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  365 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  100 ggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttgggg-tagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 362 - 441
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47542076 - 47542041
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542076 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 47542041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 344993 - 344923
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| ||||    
T  344993 ggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacc 344923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  342 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  328 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 427  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  428 tgg 430  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  327 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 426  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  427 ttggttgttgttgt 440  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 266
Target Start/End: Original strand, 21200550 - 21200656
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |  ||||| |||| |||||    
T  21200550 ggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatc 21200647  T
Q  258 aaatggaga 266  Q
    | |||||||    
T  21200648 acatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  392 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 417
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 382
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 382  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Original strand, 45236778 - 45236850
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagaga 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  45236778 gagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 29600910 - 29600968
Alignment:
Q  169 tatagtagaaaagttggtagaaaatatgctt-agatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29600910 tatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagagagaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  364 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 30345445 - 30345518
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30345445 gagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagag 30345518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 137)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 443
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281959
Alignment:
Q  83 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaaagt 43281698  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  43281699 tggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaag 43281798  T
Q  283 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43281799 aggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgg 43281898  T
Q  383 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43281899 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12841639 - 12841272
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  12841639 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 11593878 - 11594245
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  11593878 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 37617862 - 37618229
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  37617862 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaa-tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 274  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 440
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869702
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||  || ||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 124 - 443
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650669
Alignment:
Q  124 ataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  423 atgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836479
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||     
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggttat 45836641  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
      |||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45836640 --gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 49029194 - 49029559
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  49029194 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||| |||  || |    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 77 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35906565 - 35906208
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  35906565 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||| |||  || |    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 433  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33350170 - 33349803
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  33350170 agcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906369
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagt--caagttaa 39906533  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44855536 - 44855171
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatagta 175  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  44855536 agcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 77 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13859372 - 13859067
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  13859372 agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  376 actatg 381  Q
    ||||||    
T  13859072 actatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 79 - 443
Target Start/End: Original strand, 36651914 - 36652277
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||| | |||||||||    
T  36651914 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggtagggg-tggcatccatagtagaa 36652012  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |  || ||||    
T  36652013 aagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagtta 36652112  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||    
T  36652113 aaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacact 36652212  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652213 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46356219 - 46355858
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||    
T  46356219 agcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagta 46356121  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  46356120 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 46356021  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  46356020 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaac 46355921  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355920 actatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607277
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaa-agagagtggggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaa 38607025  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  || ||||     
T  38607026 ggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttag 38607125  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||| ||||||||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38607126 aagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38607213  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | || ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607214 tggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 124 - 443
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375153
Alignment:
Q  124 ataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    |||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  423 atgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacct-atagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 77 - 363
Target Start/End: Original strand, 31005141 - 31005428
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  31005141 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 159 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 157 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2886005 - 2885719
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  2886005 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaagagtagat 2885906  T
Q  257 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 356  Q
    || |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  2885905 cagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagttggacccaa 2885806  T
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885805 atatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491593
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  | |   |||| |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||  ||||| ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Original strand, 33072872 - 33073100
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33072872 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtag 33072970  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||    
T  33072971 aaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagt 33073070  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33073071 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 443
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 443
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  197 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  297 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 396  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  397 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 36869528 - 36869234
Alignment:
Q  156 ggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| |||    
T  36869528 ggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtaga 36869429  T
Q  256 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 355  Q
    |||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36869428 tcaaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattca 36869329  T
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869328 aatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 216 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  216 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 315  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  416 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 443
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  168 ctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  268 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 367  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 381
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404640
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 282  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  283 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  212 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 311  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 440
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137046
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| || | |   |||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 36136786  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | ||||||||||||  ||||| | |||||| ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| | | |    
T  36136787 gatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcaga 36136886  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36136887 agaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattat 36136986  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
        | |||||||  || || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36136987 agggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  415 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  231 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 330  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  431 ttgttgtt 438  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 262  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273146
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || | ||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||   ||| ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 301 - 440
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  301 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 400  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  401 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 441
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  303 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 402  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  403 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36514569 - 36514424
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||| || |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36514569 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagagttgggg-tagcacctatagtag 36514471  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagaga 223  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36514470 aaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  345 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  430 gttgttgttg 439  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579252
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |     ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatacta-----gataggattagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagcagaaaa 25579337  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
      |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||| | ||||||    
T  25579336 aatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 200
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  180 agttggtagaaaatatgctta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 443
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    || ||    || ||  | |||    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaag----actag--tcaaatcactagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 441
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  334 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  434 ttgttgtt 441  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 381
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848896
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||  |||||||| || | ||| | ||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    || |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| || | ||  |||| |||| |||||| |||||| | |  | | | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| | |||||||| | | | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactatt-ggaaagatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  380 tg 381  Q
    ||    
T  47848895 tg 47848896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 437
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36869653 - 36869576
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36869653 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 36869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492276
Alignment:
Q  94 tgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag-tggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 192  Q
    |||||||||||||||| || || | ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  193 tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 292  Q
    || ||| || ||||||| || |||||||| |||||  ||||||   || |||  ||||| |||||| |||||| ||    || ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  293 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 392  Q
    || || | |||||  |||  |  |||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  8492380 ag-accacgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  393 tccatgta 400  Q
    || |||||    
T  8492283 tcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19262791 - 19262609
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||| || | |||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  19262791 gagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagagttgggg-tagcacctattgtagaaaa 19262693  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    | ||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| ||||||    
T  19262692 gatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 448
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 448  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 356  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 362 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 443
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  430 gttgttgttgttgt 443  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 410  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  333 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 432  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  433 gttgttgtt 441  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135210
Alignment:
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||| ||| | ||||| |||||| | |  |||     
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggagata-gatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    | |  ||||| ||| ||||| |||  ||||  ||  ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || ||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||| | | ||||||||||| |||| || || |||| ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7189508 - 7189442
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7189508 ggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 397
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  380 tgacatcatttgatccat 397  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 40169649 - 40169726
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169649 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282477
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaa---agagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||  | | |||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||| ||| |||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27021974 - 27021906
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27021974 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 420  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  421 taatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 440
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  414 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 443
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 5335840 - 5335988
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||  ||   ||||| ||||| | ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  5335840 agcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagagttgggg-tagcatctatagtag 5335938  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
     |||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  5335939 gaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598440
Alignment:
Q  78 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccatta 24598440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 439
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  402 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 42187470 - 42187547
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187470 ggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 442
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 413  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  414 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 403  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812025
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| || | || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||||||  |||||||      
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaa 39811981  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||  ||| |  |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39811982 tggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaaga 39812025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 443
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 442
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 440
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  426 cttggttgttgttgt 440  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagaga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 40830146 - 40830293
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||  || |||||  | ||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||| |||  |||||||||| | ||    
T  40830146 agcagagataaggatgttgtgttgaatg--tgctaaaagtagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagttggg--tagcacctattgaag 40830241  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40830242 aaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagacc 40830293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 437
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  336 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  436 gt 437  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 438
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 442
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36102045 - 36101977
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  36102045 ggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  378 tatg 381  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 424  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  425 gcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  345 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 400
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  329 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 400  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 443
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48736074
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    ||| ||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| || |||   || || || |||| |||||||||||||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 444
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420672
Alignment:
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatca 6420672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27893865 - 27893769
Alignment:
Q  122 tgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtaga 219  Q
    |||||||||||| || ||||  |||| ||||||| | || || |||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  27893865 tgataggattagaaacgacaatattagagagagttgagg-taacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 35713695 - 35713764
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||| || |||||| |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35713695 ggggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 35713764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 443
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  371 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 14593679 - 14593835
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||   |  | ||||| ||||||| ||||| |||||| |      |||||  |||||||    
T  14593679 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 14593778  T
Q  172 agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||  ||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  14593779 agtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 28020964 - 28021032
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28020964 ggggtagcacttatcgtagaaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 403  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 227
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  164 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 112
Target Start/End: Original strand, 16013202 - 16013237
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16013202 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaa 16013237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 269
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  210 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  344 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 415  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  395 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 394  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 447  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 45558362 - 45558428
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  45558362 ggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 443
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  366 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  340 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 122)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430168
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 3865990 - 3866357
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3865990 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||      
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992108
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtgaggg-tagcacctatagtagaaaa 11992368  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||  | |||||||    
T  11992367 gttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaa 11992268  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11992267 agaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattat 11992168  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    | | | |||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11992167 ggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367622
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 45367885  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |  ||||||    
T  45367884 gttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaa 45367785  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45367784 agaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactat 45367685  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367684 gacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197224
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  280 aaga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtaacacctatagtagaaaa 41763302  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41763301 gttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 41763202  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||       
T  41763201 aaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccg 41763103  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763102 ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734985
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaaa 12734721  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  12734722 attggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 12734821  T
Q  281 aga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12734822 agagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 12734921  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12734922 tggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 8180698 - 8181060
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8180698 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 447
Target Start/End: Original strand, 36183369 - 36183740
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  36183369 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 447  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 3244015 - 3243654
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  3244015 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtggggg-tagcacctatagtaa 3243917  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||  || ||    
T  3243916 aaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagt 3243817  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||    
T  3243816 taaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaaca 3243717  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3243716 ctatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38453053 - 38452686
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctat 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |     |||||||||| ||||    
T  38453053 agcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctat 38452954  T
Q  172 agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| | |      
T  38452953 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagata-gatcaaatggaggaaagt 38452855  T
Q  272 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||    
T  38452854 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 38452755  T
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
     |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452754 aaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 130 - 443
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834963
Alignment:
Q  130 ttaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  227 cccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaa 326  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  327 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 426  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  427 ttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 4807510 - 4807880
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |     |||||||||||||||    
T  4807510 agcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctat 4807609  T
Q  172 agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 271  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||| || |||      
T  4807610 agtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagt 4807708  T
Q  272 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||    
T  4807709 caagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgata 4807808  T
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807809 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 157 - 444
Target Start/End: Original strand, 2610587 - 2610874
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  2610587 gggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaagaagagtagat 2610686  T
Q  257 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 356  Q
    ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2610687 caaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 2610786  T
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    || |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610787 atttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424378
Alignment:
Q  88 ggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggta 187  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg-tagcatctatagtagaaaagttggta 18424630  T
Q  188 gaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||    
T  18424629 gaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggta 18424530  T
Q  288 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 387  Q
    ||||||||  || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18424529 gaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtca 18424430  T
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424429 tttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 414
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997858
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||| || ||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    || | | ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326157
Alignment:
Q  200 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  300 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 399  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  400 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 443
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  215 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 314  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  409 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 229 - 441
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  229 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 328  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  329 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  429 ggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  265 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 363  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  364 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237750
Alignment:
Q  85 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaa-agagagtggggggtagcacctatagta--gaaaag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||    ||||||||| |  |  || |||    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgggagagagtggaca-tagcacctaaaaaaaagataag 6238012  T
Q  182 ttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || ||||    
T  6238011 ttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaa 6237912  T
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6237911 gaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T
Q  382 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
      || |||||||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237811 ggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 272 - 440
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  272 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 316 - 443
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  416 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 338 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  338 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  438 tgttgt 443  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 443
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  329 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  429 ggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097192
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |   |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtaga 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||  || | |||||| ||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttaga-tggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    || |||| |||| ||  ||| |  |||||||| |||||| |||||||||  |||||| |  | ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
      ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| ||| |||| |||| |||||| |||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  412 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  419 gataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 439
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttgga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  254 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 353  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  354 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43238376 - 43238305
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43238376 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 282 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  382 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43752229 - 43751944
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||   || ||| | |||| |||||    
T  43752229 ggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtagggagagtagatc 43752130  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||    
T  43752129 agatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggaccgaaa 43752030  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752029 gatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  426 cttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  415 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 356 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 2610446 - 2610523
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2610446 agcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagag 2610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 443
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 441
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 441
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 441
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  313 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 408  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  409 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 438
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  343 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 424
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  412 ttagtgtgataat 424  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44438010 - 44437718
Alignment:
Q  151 agagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaaga 250  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||     
T  44438010 agagttgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagt 44437911  T
Q  251 gaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttag 350  Q
      |||| | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| |    
T  44437910 atagatgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttgg 44437811  T
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437810 agaaaaacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 443
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  402 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 443
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 7825276 - 7825429
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg---gggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||  |||| |||||| |||||||| |||| |||||| | |   | |||||||||||||    
T  7825276 agcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatag 7825375  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    | | |||  ||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  7825376 ttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 7825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556366
Alignment:
Q  85 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagtt 183  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |  | ||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |  |||||| ||| |||||||||||| |     
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat- 9556626  T
Q  184 ggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga 283  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||| |||||| | |  ||   ||  |||    
T  9556625 ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactaga 9556526  T
Q  284 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 383  Q
    || | ||||||| ||   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| || |      
T  9556525 ggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggt 9556426  T
Q  384 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556425 gtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  424 tgcttggttgttgt 437  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 443
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  419 gataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9647969 - 9647814
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |  ||||| |||||| |||| || ||||| ||||     |||| || |||||||||||    
T  9647969 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacattatagag---ttggggcagtacctatagtag 9647873  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||| | |||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  9647872 aaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagacctgtagat 9647814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 265
Target Start/End: Original strand, 11017280 - 11017421
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | || |||| |  |||||  ||||||||  |||| |||||    
T  11017280 gataagattaggaatgaaaatattaaagagagttgagg-tagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagag 11017378  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    |||||||||||||   || || ||||| | |||||||||||||    
T  11017379 aagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaaatggag 11017421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 443
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543520
Alignment:
Q  197 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 296  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||| | || || || |||| |||||||||||||  ||  ||| | |  |||||||| || |||     
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  297 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 396  Q
    |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |  || ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  397 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Original strand, 3481144 - 3481248
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||| |||| |||||    
T  3481144 ggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatc 3481240  T
Q  258 aaatggag 265  Q
    | ||||||    
T  3481241 agatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337089
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaa-catgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |  || ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagagttgggg-tagcacctatagtagtaa 19337111  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttag 201  Q
    || |||| ||||||| ||||||    
T  19337110 agatggtggaaaataagcttag 19337089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 436
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 438
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 451986 - 451930
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattag 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  451986 agcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Original strand, 6218967 - 6219031
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6218967 ggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  353 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 402
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 402  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 227
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  171 tagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 42092437 - 42092584
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| || | ||  |||| |||||| |||||||   ||| ||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  42092437 agcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagagttgggg-tagcgcctatactag 42092535  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaag 225  Q
    ||||| ||||||||| || | |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  42092536 aaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaag 42092584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4598928 - 4598775
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg---gggtagcacctatag 173  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||  ||||| |||   ||||||  ||||| |||||| | |   |||||||||||||||    
T  4598928 agcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatag 4598829  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||| |||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  4598828 tagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 360 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  360 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24583970 - 24583904
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacacc 143  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24583970 agcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 443
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 440
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 225
Target Start/End: Original strand, 41545372 - 41545474
Alignment:
Q  125 taggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaaa-gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| | | ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||    
T  41545372 taggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaag 41545471  T
Q  223 aag 225  Q
    |||    
T  41545472 aag 41545474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  364 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 433  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  394 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 11412721 - 11412798
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  11412721 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtagat 11412798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  342 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  442 gtcgtc 447  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743674
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||| || | ||  ||||||||| |||||| |||| |||   |||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtggggtagcacttatggtagaaaa 30743644  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttgg 210  Q
     |||||||||| ||   |||||||||||||    
T  30743645 attggtagaaattagaattagatggtttgg 30743674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12882322 - 12882270
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttgg 210  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12882322 ggggcagcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgg 12882270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 441
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  325 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 424  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  425 gcttggttgttgttgtt 441  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  284 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 383  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  384 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 445  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  342 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23714622 - 23714474
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || | |||  |||||||||  ||||||  ||||| | ||||| |||  |||||| ||||||||    
T  23714622 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg--tagcacatatagtag 23714525  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||| |||| |||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  23714524 aaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24102294 - 24102146
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || | |||  |||||||||  ||||||  ||||| | ||||| |||  |||||| ||||||||    
T  24102294 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg--tagcacatatagtag 24102197  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||| |||| |||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  24102196 aaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  366 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 364  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 19024181 - 19024239
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgta 217  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  19024181 gggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 380
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 194
Target Start/End: Original strand, 227321 - 227358
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  227321 gggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaata 227358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13241011 - 13240958
Alignment:
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13241011 tagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 13240958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 416  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 144)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696554
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  380 -tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
     || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 82 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001452
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 1210663 - 1211030
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1210663 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30202494 - 30202127
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  30202494 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  || |    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 34792713 - 34792347
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  34792713 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 8671838 - 8672203
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8671838 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtag 8671936  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  8671937 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 8672036  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  8672037 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 8672136  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||  | ||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8672137 ctatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 9592652 - 9593018
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9592652 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 49347757 - 49347393
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  49347757 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagta 49347658  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  49347657 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 49347558  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  49347557 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49347458  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347457 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 22090012 - 22090381
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||    
T  22090012 agcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 22090111  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  ||    
T  22090112 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 22090211  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  22090212 agttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 22090311  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090312 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 84 - 443
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602341
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtgaggg-tagcacctatagtagaaaagtt 51602081  T
Q  184 ggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  51602082 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 51602181  T
Q  284 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 383  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |    
T  51602182 ggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggc 51602281  T
Q  384 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51602282 gtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086207
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 51441129 - 51440764
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  51441129 agcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||  || |    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| | | ||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082753
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  380 tgaca-tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 81 - 416
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392030
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  || |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 416  Q
    || | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 43240745 - 43240380
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |   |||||||||||||||||    
T  43240745 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 43240646  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||   |    
T  43240645 tagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtta 43240546  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  43240545 agttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 43240446  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240445 acactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230997
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  379 atgacatcatttgatccat 397  Q
    |||   | |||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 176 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 84 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38808031 - 38807668
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||||||||||||    
T  38808031 atgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaa 38807933  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| || |||||| |||  ||| | |    
T  38807932 aagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatca 38807833  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38807832 aaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 38807733  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807732 atggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 157 - 443
Target Start/End: Original strand, 4029121 - 4029407
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  4029121 gggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagat 4029220  T
Q  257 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 356  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4029221 caaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaa 4029320  T
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029321 atttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 240 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  240 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  340 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  440 ttgt 443  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 273 - 440
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  273 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  373 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 443
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  221 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 320  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  421 taatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagt-tggggtagcacctatagtagaaaa 37463133  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt-taa 279  Q
    |   |||||||||| |||||| |||||||| |   || |||| ||||  |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | |  ||    
T  37463132 gacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaa 37463036  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||  | |||  ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||    
T  37463035 aagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacatta 37462937  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    || | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37462936 tggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 9509236 - 9509565
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  9509236 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| || |  | |||   |||| |||||| |||||| |||  ||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    | |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 437
Target Start/End: Original strand, 39140484 - 39140794
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  39140484 gataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagaga 39140583  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    |||||||  || ||   || ||| |||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||   ||  ||||||| ||    
T  39140584 gaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactat 39140678  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  39140679 taggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggat 39140778  T
Q  422 aatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||||||||    
T  39140779 aatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469082
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagagt-tggggtaacacctatagtagagaa 18469342  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | || ||||||||| | |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| |||||| | |||| ||||||||||  | | | |||    
T  18469341 gatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaa 18469242  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||| |||||  ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  18469241 agaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattat 18469142  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |   | ||||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469141 ggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9599758 - 9599432
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |  || ||| |||||||||||    
T  9599758 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  ||||| |||||| |||||| |||  |||     
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    | | |||||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagc 402  Q
      |||| | | ||||||||||||||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  188 gaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 287  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  288 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 387  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847797
Alignment:
Q  90 atgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaagttggtag 188  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 288  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  ||| | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  289 aggaagaactaag-aaaaccatttgagaaaccattagaaa----agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 383  Q
    ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||| | ||  ||    |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  384 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  422 aatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt-------caatgagttag 350  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  422 aatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 320 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 419  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  420 ataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 440
Target Start/End: Original strand, 2544599 - 2544875
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  2544599 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaaggagagtagatc 2544698  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||| || | |||    
T  2544699 agatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagttggagcgaaa 2544792  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544793 tatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  430 gttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  426 cttggttgttgttgttg 442  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  350 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  350 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 440
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  415 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 443
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 442
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  325 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 424  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  425 gcttggttgttgttgttg 442  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  339 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  439 gt 440  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 410  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 43423645 - 43423788
Alignment:
Q  87 aggatgttgcgttggatgagtggt--aaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagtt 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || || | ||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423645 aggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagat 43423744  T
Q  184 ggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43423745 ggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 443
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478966
Alignment:
Q  173 gtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 272  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||| |||| ||  |||||| | || |||||||||| |||||| ||| |  |||       
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaa-aagcttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  273 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 372  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||  || ||||| || ||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatgg-ttatgatag 478891  T
Q  373 aacactatgaca-----tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |||||||||     | |||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  478892 aatactatgacataatttgatttgatctatttagccaatcc-acttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 478966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 1661430 - 1661500
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1661430 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  261 tggag 265  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36340082 - 36339804
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||   || |||||  | |  ||||| |    
T  36340082 gtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaaggcgggttgatcaga 36339983  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    ||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||| ||    
T  36339982 tggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagttggacagaaacat 36339884  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339883 ggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 442
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623884
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |  |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttgg-catgtcgaga 36624086  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    ||||||  |||  ||     ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | | | |||||||||||||||| |||            ||||||| ||    
T  36624085 gaagactggtatgta-----gtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagaccta------------gagaaactat 36624003  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || |||||||| |||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctacttagtgggat 36623904  T
Q  422 aatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    || |||| ||||| ||||||    
T  36623903 aaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14226191 - 14226047
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||| |  | ||||||||||  |||    
T  14226191 agcagatacgaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcag-tagcacctatcatag 14226093  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14226092 aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 439
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  354 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  342 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 442
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  261 tggag 265  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  327 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 426  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  427 ttggttgttgt 437  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 227
Target Start/End: Original strand, 40419557 - 40419708
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| | |   ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||| || |||||||    
T  40419557 agcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagta 40419656  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||| || |||||| || ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40419657 gaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 40419708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  313 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 392  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  169 tatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13827999 - 13827929
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13827999 ggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  215 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 312  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  313 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827205
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||   ||| |||||| ||||||     |  ||||||| |||| |||| | ||||| || |||    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgactattatgtagagagttgggg-tagcgcatatagaagtaaa 34827364  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |  | ||||||| || |||| | |||||| |||   |||||| |    
T  34827363 gatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttaga 34827264  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 339  Q
    | |  || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34827263 aaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 443
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 403  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 440
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 443
Target Start/End: Original strand, 52832026 - 52832330
Alignment:
Q  138 gacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatac 237  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| |||||||| |||||  ||||||||||  |||||      
T  52832026 gacatcattaaagagagttgggg-tagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgt 52832124  T
Q  238 cgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 337  Q
     ||||||   |||| |||| | |||||| |||  |   ||| || ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||    
T  52832125 tgttgtacagagagtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagag 52832224  T
Q  338 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||   |||||||||||    
T  52832225 gttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgt 52832324  T
Q  438 tgttgt 443  Q
    ||||||    
T  52832325 tgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  431 ttgtt 435  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 419  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  420 ataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13827853 - 13827746
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| || | | || ||||||||||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||    
T  13827853 gggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagat 13827754  T
Q  257 caaatgga 264  Q
    || |||||    
T  13827753 catatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 27704021 - 27704080
Alignment:
Q  169 tatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27704021 tatagtagaaaagatggtggaaaacatgcttatgtggtttggacatgtagagaaaagacc 27704080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg---------gggtagcacctat 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | | | |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |         |||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  172 agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 376
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  393 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Original strand, 40416374 - 40416448
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416374 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  356 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  371 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  343 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 26016355 - 26016507
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||  ||||  ||| |   ||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |    
T  26016355 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatga 26016454  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||| ||||||||| ||   |||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26016455 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacc 26016507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 112
Target Start/End: Original strand, 39140434 - 39140466
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39140434 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 39140466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  353 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 442
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16822289 - 16822234
Alignment:
Q  173 gtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16822289 gtagacaagatggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 16822234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 428
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  184 ggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtaga 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 446  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762651
Alignment:
Q  188 gaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaaga 7762651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  166 acctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8343140 - 8343070
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  8343140 ggggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagacc 8343070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  426 cttggttgttg 436  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||   |||||||| |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38868948
Alignment:
Q  135 aatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||  |||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 38868948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 51234537 - 51234611
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaa-catgataggattaggaatgacaccattaaagagagt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  51234537 agatgaggatgttgtgttggacgtgtggtaagactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagagt 51234611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561872
Alignment:
Q  102 atgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||| || | ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaa 52561872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 397  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 397  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 439
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 440
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 157)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31960178 - 31959814
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  31960178 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48622905 - 48622543
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  48622905 agcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggggg-tagcacccatagtag 48622807  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||    
T  48622806 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagt 48622707  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  48622706 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaaca 48622607  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48622606 ctatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 436147 - 436514
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  436147 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52569879 - 52569512
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52569879 agcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450180
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagagtggggg-tagcacctatagtagaaaa 27450439  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27450438 gttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaa 27450339  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27450338 agaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacactat 27450240  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27450239 ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 48174457 - 48174090
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  48174457 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 48174358  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  48174357 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 48174258  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||    
T  48174257 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaac 48174158  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174157 attatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Original strand, 56375208 - 56375573
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||    
T  56375208 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1777379 - 1777016
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||     
T  1777379 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggaaa-tagcacctatagtaa 1777281  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1777280 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1777181  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  1777180 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 1777081  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777080 gtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 33227127 - 33227494
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33227127 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 4440773 - 4441138
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4440773 agcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggc-agcacctatagtag 4440871  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  4440872 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 4440971  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  4440972 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 4441071  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441072 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33191212 - 33190846
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33191212 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||  || |    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 53707712 - 53708079
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta--aagagagtggggggtagcacctatagt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  53707712 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggagg-tagcacctatagt 53707810  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| | |  ||     
T  53707811 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaa 53707910  T
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  53707911 gttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 53708010  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53708011 cactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 43433836 - 43434209
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-------gggggtagcacct 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |       |||||||||||||    
T  43433836 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 43433935  T
Q  170 atagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  43433936 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggaga 43434035  T
Q  270 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 369  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || | |  ||    
T  43434036 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtagga 43434135  T
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434136 tagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983476
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    |||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||    
T  27983222 agttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 90 - 443
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798136
Alignment:
Q  90 atgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaagttggtag 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  289 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 388  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100533
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggggg-tagcacctatagaagaaaa 39100795  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||  | |  |||||||||    
T  39100794 gttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaa 39100696  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  39100695 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattat 39100596  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | | || | |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39100595 ggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23906665 - 23906297
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-------gggggtagcacct 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |       |||||||||||||    
T  23906665 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 23906566  T
Q  170 atagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||    
T  23906565 atagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggaga 23906468  T
Q  270 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 369  Q
      || ||||||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||    
T  23906467 gtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 23906368  T
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906367 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 177 - 441
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773486
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaa 37773712  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||  ||  ||||    
T  37773711 agtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaa 37773612  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  37773611 aagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacacta 37773512  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||| |||||||| || |||||||    
T  37773511 tgacataatttgatctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 46583188 - 46582823
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  46583188 agcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagta 46583089  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  46583088 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 46582991  T
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  46582990 gttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 46582891  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582890 ccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 445
Target Start/End: Original strand, 28236103 - 28236469
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28236103 agcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtag 28236201  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| | |||| || ||    
T  28236202 aaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagt 28236301  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  28236302 taaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaata 28236400  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcg 445  Q
     ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28236401 ttatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47265566 - 47265193
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47265566 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagta 47265467  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 268  Q
    |||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||    
T  47265466 gaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggag 47265367  T
Q  269 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 368  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||    
T  47265366 attctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatg 47265267  T
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47265266 atagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 414
Target Start/End: Original strand, 50286889 - 50287217
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||        |||||||||||    
T  50286889 agcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagggg--------acctatagtag 50286980  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  || ||    
T  50286981 aaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagt 50287080  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | | ||||||||||    
T  50287081 taaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaaca 50287180  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    |||||    |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50287181 ctatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 159 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26037786 - 26037506
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||    
T  26037786 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaagaagagtagatca 26037687  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
     |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26037686 gatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagttggatccaaat 26037587  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037586 atggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 433
Target Start/End: Original strand, 39708434 - 39708708
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39708434 gggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaagagtagatca 39708533  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
     |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39708534 gatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 39708633  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 433  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708634 atggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 182 - 443
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  182 ttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  282 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 437
Target Start/End: Original strand, 20192022 - 20192311
Alignment:
Q  146 taaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  20192022 taaagagagtgggg-gtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaa 20192120  T
Q  246 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 345  Q
    |||||| | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  20192121 gaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgg 20192220  T
Q  346 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||| ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192221 gttggatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 437
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793741
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| || |||||| ||||||  ||  |   | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggag--gagtcgtatcaa 1793579  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204837
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaa--agagagtggggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgctt--agatggtttggacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 269  Q
    ||| ||||||||||||  |||  || |||||||  || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |||||| |||||| |||||| |||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  270 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 369  Q
     | || | ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  45205008 gc-agatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  370 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| || | | | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 441
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  93 ttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 192  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||  |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||  || || |||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtgttgggg-tagcacatatagtagattagatgatagaaaa 51421764  T
Q  193 tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 292  Q
    || |||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||||||||||      ||| | |||||||||||||||    
T  51421765 taggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagga 51421864  T
Q  293 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 392  Q
    |||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  51421865 agatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttga 51421964  T
Q  393 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421965 tccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 443
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  253 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 352  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  353 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211389
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagtt 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagt-gggagcagcacctatagtaaacaagtt 1211649  T
Q  184 ggtag--aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
    |||||  || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||    
T  1211648 ggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaa 1211549  T
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    ||| ||||||||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||| |    
T  1211548 gagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaa-aattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaag 1211452  T
Q  382 acat-catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | |  ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211451 gcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20591607 - 20591353
Alignment:
Q  134 gaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgta 232  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  20591607 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcata 20591508  T
Q  233 gataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 332  Q
    |||  || ||||||||||| | |||| |||||| |||  || ||    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||    
T  20591507 gatgtcg-tgtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatt 20591413  T
Q  333 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 393  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20591412 tagaggtcaatgagttggattcaaatatgg-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Original strand, 12494668 - 12494794
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  12494668 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttaga 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601669
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| || | ||||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||| | || | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 282  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| |||  ||||| |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  283 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 382  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  383 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    | | ||||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  84 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagaga-gtggggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  183 tggt-agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||| |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    | |||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 286 - 435
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 390
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  242 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 341  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  342 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 390  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 31458946 - 31459098
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    | ||||||||||||||    
T  31458946 agcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatag 31459045  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  31459046 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 397
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003165
Alignment:
Q  89 gatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatagtagaaaagttggta 187  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || | ||   |||||||||||||||||||||||| |||| | | | || | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgata 16002956  T
Q  188 gaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 287  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| |||||  | |   | || ||||||  ||    
T  16002957 gaaaatagtcttagatggtt-gaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaata 16003055  T
Q  288 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 387  Q
    |||||| | |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16003056 gaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaa 16003155  T
Q  388 tttgatccat 397  Q
    ||| ||||||    
T  16003156 tttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 439
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20821251 - 20821001
Alignment:
Q  196 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 295  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  20821251 gcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatgaaga 20821152  T
Q  296 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatcatttg 391  Q
     ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| ||| |    
T  20821151 cctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataattcg 20821053  T
Q  392 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821052 atccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  430 gttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 335 - 443
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  335 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  435 tgttgttgt 443  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 443
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690326
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 35690325  T
Q  180 a 180  Q
    |    
T  35690326 a 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 441
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  216 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 315  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 415  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  416 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518325
Alignment:
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 288  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||| | || ||| |||||| |||||| |||||||     ||  | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggagagt---caaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  289 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 388  Q
    ||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44047666 - 44047553
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||     
T  44047666 gatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagt 44047567  T
Q  222 gaagacccgtagat 235  Q
     |||||| ||||||    
T  44047566 taagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  365 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 365
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 365  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 56224983 - 56225353
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaacc---aaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    | |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||  ||  ||||||||    
T  56224983 agcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttggga-taatacctatag 56225081  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||   | |||||   || ||| | |||| | |||| |||||| |||  |     
T  56225082 tataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtct 56225181  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaa--aaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
      | || | || ||||| |||| |||| ||  ||| ||  | | ||| ||||  |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| |||    
T  56225182 aatcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttata 56225281  T
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  56225282 gaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 217
Target Start/End: Original strand, 49987346 - 49987487
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |   ||||  |||||||||||    
T  49987346 agcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgta 217  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  415 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  431 ttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51252777 - 51252674
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  51252777 gataggattagaaatgactacattagagagagttgggg-tagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagag 51252679  T
Q  223 aagac 227  Q
    |||||    
T  51252678 aagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470276
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |   |||| |||| | ||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||| |||| |||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10775786 - 10775671
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  10775786 agcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  176 gaaaagttggtagaaa 191  Q
    |||||| |||||||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaa 10775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 442
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  364 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 33709837 - 33709992
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacat-----gataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcaccta 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||     ||||||||||| |||| || ||||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  33709837 agcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  171 tagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||||||||| |||| |||| || | |||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 437
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  402 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Original strand, 29398822 - 29398888
Alignment:
Q  162 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29398822 tagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacc 29398888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  363 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25257943 - 25257756
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| || |||| || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| | || || |||||| | ||     
T  25257943 agcaaagatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgagg-taacacctacaatat 25257845  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    ||||| ||||||||  ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  || | |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25257844 aaaagatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggag 25257756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  426 cttggttgttgtt 438  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 440
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 440
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 262
Target Start/End: Original strand, 50662311 - 50662492
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||| || | |   ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||||||||||||    
T  50662311 gagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagagtttgggcaa-cacctatagtagaaaa 50662409  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatgg-tttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 262  Q
    | |||| |||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  50662410 gatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatg 50662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  390 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Original strand, 25755237 - 25755424
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta-aagagagtggggggtagcacctatagtaga 177  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| || | |||||||| |||| | ||||| | || || || ||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  25755237 cagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaatagaaaagagttgggg-tagcacctatcttaga 25755335  T
Q  178 aaagtt-ggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    ||||   ||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||   |||||||| |||| |||||||||||||    
T  25755336 aaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggag 25755424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 441
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 444
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  392 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Original strand, 28497490 - 28497596
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||||| |||| |||||    
T  28497490 ggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatc 28497588  T
Q  258 aaatggag 265  Q
    | ||||||    
T  28497589 agatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  426 cttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 369  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 10209034 - 10209104
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10209034 ggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 17900398 - 17900550
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaaga--gagtggggggtagcacctatagt 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  17900398 agcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttgggg-tagcacctatagt 17900496  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||  |||||||| ||  || |  |||||||| || ||||||||||||||    
T  17900497 agaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  339 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  168 ctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  289 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 388  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 443
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 439
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 41192836 - 41192913
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192836 ggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 44360087 - 44360155
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  44360087 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaacta-gattaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Original strand, 28467242 - 28467324
Alignment:
Q  117 aaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttag 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  28467242 aaacatgataggattacaaatgaaaccattaaagagag-atgaggtagcacctatagtagaaaa-atggtggaaaataagcttag 28467324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 433  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38571099 - 38570960
Alignment:
Q  88 ggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggt 186  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | | | ||| ||||||||| | ||||||| ||||  |||||| |  |||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38571099 ggatgttgtgttggatgtgtggtaca-ctagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagt 38571001  T
Q  187 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
     |||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38571000 ggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46715649 - 46715585
Alignment:
Q  163 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  46715649 agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611797
Alignment:
Q  172 agtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 47611797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 50471493 - 50471596
Alignment:
Q  124 ataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagaga 223  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||| |||| || | |||  |||||||| ||||||||||||    
T  50471493 ataggattagagatgacaacattagagagactcgggg-tagcactaatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagaga 50471591  T
Q  224 agacc 228  Q
    |||||    
T  50471592 agacc 50471596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 435
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 438
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38841854 - 38841811
Alignment:
Q  170 atagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggaca 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38841854 atagtagaaaagttgatagaaaatatacttagatagtttggaca 38841811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 402  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 262
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttg-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 262  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1427565 - 1427496
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1427565 gggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacc 1427496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7092498 - 7092433
Alignment:
Q  162 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7092498 tagcacctatagtagaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagac 7092433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967554
Alignment:
Q  85 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagag 25967554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 381
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  328 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40933255 - 40933198
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatga 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  40933255 agatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| || ||||  | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 55579040 - 55579100
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  55579040 cacctatagt-gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaaga 55579100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 119)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 36545065 - 36545434
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||    
T  36545065 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatag 36545164  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  ||    
T  36545165 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 36545264  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  36545265 agttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 36545364  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545365 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854001
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36565605 - 36565239
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  36565605 agcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || |    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 40813240 - 40813609
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||    
T  40813240 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 40813339  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  40813340 tagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 40813439  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  40813440 agttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgataga 40813539  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813540 acactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36395314 - 36394949
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  36395314 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgctt-agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  ||     
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  375 cacta---tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||   || |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcat--tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523720
Alignment:
Q  125 taggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgctt-agatggtttggacatgtagagag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  423 atgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 392
Target Start/End: Original strand, 39946775 - 39947091
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  39946775 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  376 actatgacatcatttga 392  Q
     ||||| | ||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 160 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  260 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 359  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  360 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125454
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  || || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaaa 18125195  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  | |||| ||    
T  18125196 gttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aa 18125294  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18125295 agaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactat 18125394  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |   | |||||||| |||||| | | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18125395 ggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 423
Target Start/End: Original strand, 2796473 - 2796818
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaa--catgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatag 173  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  2796473 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatag 2796572  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    | |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||  ||    
T  2796573 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 2796668  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  2796669 tgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgataga 2796768  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    ||| |||| | | ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796769 acagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 131 - 437
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  131 taggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8932676 taggaatgacaccattagagagagtggggg-tagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccg 8932774  T
Q  231 t-agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaag 329  Q
    | | || || |||||||||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8932775 ttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaag 8932874  T
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||    
T  8932875 atttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagcttg 8932974  T
Q  430 gttgttgt 437  Q
    ||||||||    
T  8932975 gttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 232 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  232 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 331  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  332 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  432 tgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 189 - 443
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  289 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 388  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751996
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtg-ggggtagcacctatagtagaaaa 18752135  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| || |   || |||||    
T  18752134 gttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaa 18752036  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 320  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752035 agaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37078034
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta--aagagagtggggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||             |||||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgaggg-------------tagaa 37077773  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 278  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  | ||| |    
T  37077774 aagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtca 37077871  T
Q  279 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    ||||||||||     
T  37077872 aaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac- 37077970  T
Q  379 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077971 -tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  285 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  385 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 45419161 - 45419517
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | |   |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  45419161 gagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaattgggg-tagcacctatagtagaaaa 45419259  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | ||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  |  | ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| |   |    
T  45419260 gatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctga 45419357  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  45419358 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattat 45419457  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45419458 ggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 443
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 216 - 436
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  216 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 315  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 412  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  413 tagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  178 aaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  378 tatgacatcatttgatccat 397  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8879758 - 8879446
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||    
T  8879758 gataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagaga 8879659  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    |||||||||    | |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||  |||||| | |||| |||  || |||||| ||  ||||||||||    
T  8879658 gaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccat 8879563  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 421  Q
    || ||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| |  |||    
T  8879562 taaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggat 8879465  T
Q  422 aatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || ||||||||||||||||    
T  8879464 aaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 319 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  419 gataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  328 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  428 tggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  431 ttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 440
Target Start/End: Original strand, 29520694 - 29520931
Alignment:
Q  202 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||  |||      
T  29520694 atggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagc-ctaga 29520792  T
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||| ||  |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  29520793 aaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 29520892  T
Q  402 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || | || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520893 cccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510617
Alignment:
Q  83 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagt 182  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | |   |||| |||||| |||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||| |||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg-tagcacctataatagaaaagt 6510686  T
Q  183 tggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 251  Q
    |||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510685 tggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 443
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  167 cctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 266  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  267 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 366  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatat---gcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||  |||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  258 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 357  Q
    | |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||  |||  | |||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12492206 - 12492123
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12492206 agcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatggggg 12492123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 406  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  407 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796894
Alignment:
Q  128 gattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagagtggagg-taacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagac 12796913  T
Q  228 ccgtagataccgttgtaag 246  Q
     ||| ||| |||| |||||    
T  12796912 tcgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171865
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtaga 177  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || | ||  ||||||||||| |||||||  |||| |||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  178 aaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 235
Target Start/End: Original strand, 30748377 - 30748534
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || | |||||  ||||||    
T  30748377 agcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagagttgtgg-tcgcaccagtagtag 30748475  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||||| |||| |||   | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30748476 aaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagat 30748534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043872
Alignment:
Q  91 tgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | ||  ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  190 aaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 289  Q
    || ||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||   || ||||| |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  290 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 389  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | ||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtt 32043819  T
Q  390 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043820 tgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39953628 - 39953263
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||| ||| |   ||||| |||||| |  ||| |||||||||||  |    
T  39953628 agcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatga 39953529  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||| ||||||||| ||   |||| |||||| | |||||||||||  ||||  | |||   || ||||| |||| |||||| ||| ||  ||| |||     
T  39953528 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcaga 39953429  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   ||| |||||||||||| | ||    
T  39953428 tcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggac 39953329  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953328 actatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 388 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 446
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 446  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  351 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 443
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2776512 - 2776434
Alignment:
Q  157 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776512 gggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643814
Alignment:
Q  169 tatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 35643814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 9695631 - 9695708
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  9695631 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15215631 - 15215558
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15215631 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagag 15215558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 442
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  441 tg 442  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 446
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 258
Target Start/End: Original strand, 7046294 - 7046434
Alignment:
Q  119 acatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgta 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||| || ||||||||| |||| |||  |  |||||| |||||||| ||||||    
T  7046294 acatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggtttgggcatgta 7046393  T
Q  218 gagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    ||||||| || ||||| | | || ||||| |||| ||||||    
T  7046394 gagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 410  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Original strand, 25288820 - 25288916
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctata 172  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || | |   |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25288820 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Original strand, 25300155 - 25300251
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctata 172  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || | |   |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25300155 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 443
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 427  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  428 tggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44681319 - 44681251
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  44681319 ggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986530
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag-tggggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| || | ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  180 agttggtagaaaata 194  Q
    |  ||||||||||||    
T  13986516 atatggtagaaaata 13986530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  357 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtaga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 13589488 - 13589556
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  13589488 ggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagacc 13589556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 436
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 442
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  287 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 386  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  423 atgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41972058 - 41971991
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41972058 gggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 442
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 437
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 434
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985552
Alignment:
Q  100 ggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 191  Q
    ||||| ||||||| || | ||| ||||| ||||| || |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagagttgggg-tagcacctatagtagaaaagatggtagaaa 25985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 440
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  325 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 424  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  425 gcttggttgttgttgt 440  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  441 tgtc 444  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 443
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  393 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520681
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaa 29520681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 436
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  358 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 444
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  345 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  390 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30456575 - 30456534
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30456575 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagaccaa 30456534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143472
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 259  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||  ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  260 atggag 265  Q
    ||||||    
T  36143467 atggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37256077 - 37256004
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37256077 gagatgatgatgttgcgttgaatgagtggttaaactaaatgagatagaattagaaatgacaccattaaatagag 37256004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 444  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  399 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10080119
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||| || | ||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |  | ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    | |||| |||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacc 10080119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 438
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  327 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 426  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  427 ttggttgttgtt 438  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 363  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645107
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagacc 29645107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  287 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 386  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaactta 414  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9905094
Alignment:
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9905094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  345 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985812
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||  |||||||  ||| |||||||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagacc 25985812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 29700276 - 29700346
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |  |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29700276 ggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagacc 29700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2518674 - 2518605
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  2518674 ggggtagcacctcaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagac 2518605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30113517 - 30113416
Alignment:
Q  121 atgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtaga 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| ||| ||||    
T  30113517 atgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatataga 30113418  T
Q  220 ga 221  Q
    ||    
T  30113417 ga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 439
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  430 gttgttgttg 439  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 28085294 - 28085661
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  28085294 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5258506 - 5258145
Alignment:
Q  85 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatagtagaaaag 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  5258506 tgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 5258407  T
Q  182 ttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||    
T  5258406 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaa 5258307  T
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5258306 gaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatg 5258207  T
Q  382 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     | |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258206 gcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 32755837 - 32756206
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg---gggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||    
T  32755837 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 32755936  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32755937 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32756036  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  32756037 agttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 32756136  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756137 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgaggg-tatcacctatagtagaaaa 608179  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||    
T  608180 gttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaa 608279  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaa----gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||| || ||||| ||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  608280 agaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaata 608379  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  608380 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707052
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043441
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 82 - 400
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |     ||||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgta 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427633
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||  |||||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 443  Q
    || |  ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 437
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||  ||||||||||| |||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    || | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 121 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21352155 - 21351872
Alignment:
Q  121 atgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagag 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21352155 atgataggattaggaataacatcgttagagagagtggagg-tagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagag 21352057  T
Q  221 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 320  Q
    |||||||| || ||| || |||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21352056 agaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaacca 21351957  T
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  21351956 ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 14030724 - 14031080
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaa-accaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagt 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  14030724 agcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 274  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||  | |    
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  275 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||| || ||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 131 - 443
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890860
Alignment:
Q  131 taggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagaccc 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||         |||    
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------ccc 12890646  T
Q  230 gtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaag 329  Q
     ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  12890647 atagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  330 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  430 gttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099993
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtggggg-tcgcacatatagtagaaaa 10100119  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||    
T  10100118 gttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaa 10100019  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaac 306  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100018 agaggtagaggaagacctaggaaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593709
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-------gtagcacctatag 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||       ||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 273  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  274 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 373  Q
      |   |||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  374 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||| ||||   | ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 442
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  169 tatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  269 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 368  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 397
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  259 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 397  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  421 taatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28027189 - 28026896
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |    |||||||||||||||||  | ||| | ||||   |||||||||||||||||||    
T  28027189 agcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatggggtagcacctatagtag 28027090  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    ||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  ||| |    
T  28027089 aaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagat 28026991  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||    
T  28026990 tagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  431 ttgttgttgttgt 443  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  329 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  429 ggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 401
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  207 ttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  307 catttgagaaaccattagaaaagatttag 335  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  207 ttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  307 catttgagaaaccattagaaaagatttag 335  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 440
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  164 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  264 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 363  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  364 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 440
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 405
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666058
Alignment:
Q  166 acctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtaga-taccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 264  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   || ||||| |||| |||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  265 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 364  Q
    | | |  | | | |  ||||| ||||||||   ||  | ||| |   ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  365 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    | |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 442
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 419  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  420 ataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaaga--gagtggggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagt-gggggtatcacctatagtagaa 5080875  T
Q  179 aagttggtagaaa 191  Q
    |||||||||||||    
T  5080876 aagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055806
Alignment:
Q  88 ggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagt-tggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | | |||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||   |  |    
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttgggg-taacacctatagtagaaaaaaattat 6056025  T
Q  187 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggt 286  Q
    || ||||| | ||   |||||||  |||||||||||||||   ||||||   || ||   || || |||||| |||||  |||  ||  | |||| ||||    
T  6056024 aggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggt 6055925  T
Q  287 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 386  Q
    ||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||| || ||| |     
T  6055924 agaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgta 6055825  T
Q  387 atttgatccatgtagccga 405  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6055824 atttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 33083976 - 33084128
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg-ggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |   ||||| ||||| ||||||   |||| |||||| |  |||||||||||||| |||    
T  33083976 agcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggta 33084075  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  33084076 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 438
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  419 gataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  354 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 399  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 437
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33998368 - 33998291
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |  |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  33998368 agcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagag 33998291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 443
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  363 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 2689578 - 2689642
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccat 145  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2689578 gagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14389447 - 14389380
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14389447 ggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaaa-cttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||| |  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  410 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6293733 - 6293696
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6293733 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaa 6293696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 108)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 3301766 - 3302126
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  3301766 gagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaa 3301865  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| |||  ||||||||    
T  3301866 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaa 3301965  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301966 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 3302065  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
     | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302066 cggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496669
Alignment:
Q  85 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacat--gataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  182 ttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 281  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  282 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 381  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  382 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28977221 - 28976856
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28977221 agcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggggg-tagcacctatagtag 28977123  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || ||    
T  28977122 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagt 28977023  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28977022 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 28976923  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28976922 ctatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Original strand, 24178428 - 24178793
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  24178428 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12492751 - 12492381
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcaccta---ta 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||   ||    
T  12492751 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  173 gtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  273 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 372  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  373 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 433
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  124 ataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  423 atgcttggttg 433  Q
    | |||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 1275183 - 1275549
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1275183 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtagcacctatagtag 1275282  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1275283 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1275382  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1275383 taacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaaca 1275482  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275483 ttatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347380
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||| |||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1287953 - 1287578
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----------gggggtagc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |           |||||||||    
T  1287953 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagc 1287854  T
Q  166 acctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1287853 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggag 1287754  T
Q  266 aagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 365  Q
     |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1287753 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 1287654  T
Q  366 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
     |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287653 atgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2075838 - 2075475
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  2075838 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  375 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
     |||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 10639215 - 10639587
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacctatag-- 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||      
T  10639215 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  174 -----tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 268  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag 10639414  T
Q  269 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 368  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||    
T  10639415 t--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 443
Target Start/End: Original strand, 14665670 - 14665997
Alignment:
Q  119 acatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggaca 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14665670 acatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggaca 14665769  T
Q  214 tgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||    
T  14665770 tgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattaga 14665869  T
Q  314 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 413  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| |||||||||| || ||||    
T  14665870 gaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 14665967  T
Q  414 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665968 agtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 439
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  261 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 360  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  361 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  247 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 346  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  347 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Original strand, 34272940 - 34273297
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-----------gggggtagc 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||     ||||||||||||||||||||| |||||| |           |||||||||    
T  34272940 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagc 34273034  T
Q  166 acctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga-tcaaatgga 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||         
T  34273035 acctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagaggagagtcaa----- 34273129  T
Q  265 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 364  Q
              ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  34273130 ----------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 34273219  T
Q  365 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273220 tatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  216 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 315  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  316 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 415  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  416 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884686
Alignment:
Q  90 atgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta--aagagagtggggggtagcacctatagtag-aaaagttggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgaggg-tagcacctatagcaggaaaagttggt 26884942  T
Q  187 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggt 286  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||    
T  26884941 agaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggt 26884842  T
Q  287 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||| || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||      
T  26884841 agaggatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgc 26884744  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884743 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 443
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  253 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 352  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  353 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 289 - 443
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  289 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 388  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  389 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  302 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 401  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  402 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 400
Target Start/End: Original strand, 36215418 - 36215730
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggg-ggtagcacctatagta 175  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| | | |||||| ||||| |||||||  |||||  ||||| | || ||||||| ||||||||    
T  36215418 agcagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||||| |||||  |||||| |||  ||||    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    | |||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||  || |||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtagag----------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgta 400  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 441
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  331 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 430  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  431 ttgttgttgtt 441  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 319 - 443
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  319 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  419 gataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  198 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  298 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 397  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  398 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 409
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516806
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || | ||| |||||  |||| ||||||| ||||| ||||||| || | || ||| ||||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggag-taacacttatagtagaaaa 32516578  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||| || ||  |||||| | || ||| | |||| |||||  ||| || | || ||| ||| |    
T  32516579 gatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattaca 32516678  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||  |||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  32516679 agaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattat 32516777  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatcca 409  Q
    ||| | |||||||| || || ||||||||    
T  32516778 gacgtaatttgatcgatataaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 393
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  222 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 321  Q
    ||||||| || ||| | |||||||| ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  322 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 393  Q
     |  || ||| ||||| | || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 15168756 - 15168869
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagt-ggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagaga 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  15168756 gataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T
Q  222 gaagacccgtagat 235  Q
     | |||| ||||||    
T  15168856 aatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 443
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  338 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  438 tgttgt 443  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 377  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  350 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Original strand, 33667188 - 33667286
Alignment:
Q  129 attaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33667188 attagaaatgacaacattaacgagagttgggg-tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 443
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  420 ataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 420  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  421 taatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31636202 - 31636129
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31636202 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 27816 - 27944
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatt--aaagagagtggggggtagcacctatagtagaa 178  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  27816 gagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaa-ctaacaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagt-tagggtagcacctatagtagaa 27913  T
Q  179 aagttggtagaaaatatgcttagatggtttg 209  Q
    ||| || | ||||||| |||||| |||||||    
T  27914 aagatgatggaaaataggcttaggtggtttg 27944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Original strand, 79513 - 79620
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||| ||||  ||||    
T  79513 ggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaaggagagtcgatc 79612  T
Q  258 aaatggag 265  Q
    ||||||||    
T  79613 aaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  426 cttggttgttgttgt 440  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  369 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11002785 - 11002645
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtag 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | |   ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  11002785 agcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttcggg-tagcacctacagtag 11002687  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtag 218  Q
    ||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  11002686 aaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  426 cttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 428
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  412 ttagtgtgataatgctt 428  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  160 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 259  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  260 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 358  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 410  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  411 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952424
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgg---ggggta----gcacctatagt 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||   ||||||     ||||||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  175 agaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaag 225  Q
    ||||||| ||| ||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  321 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 420  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  421 taatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340500
Alignment:
Q  80 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtgggggg-tagcacct-atagtaga 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    ||  |||||||||||||||||||| |||||| |  | | || ||| | ||||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtaga 17340699  T
Q  178 aaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 277  Q
    ||  ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| || || ||||   || ||| |||||| |||||| |||||| |||  |||||     
T  17340698 aacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtc 17340599  T
Q  278 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    ||||  |||||| |||||  ||  ||||  ||    | ||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340598 aaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggaca-tgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  320 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 419  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  420 ataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 441
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  332 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 431  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  432 tgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  329 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 394  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 418307 - 418201
Alignment:
Q  119 acatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttaga--tggtttggacatgt 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||    
T  418307 acatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgggg-tagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctggtttgggcatgt 418209  T
Q  217 agagagaa 224  Q
    ||||||||    
T  418208 agagagaa 418201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  165 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 264  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  265 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 364  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  365 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 435
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  362 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 20318905 - 20318970
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccatta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20318905 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta-----agactggataggattaggaatgacaccatta 20318970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 36200702 - 36200764
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| ||||||||||||||    
T  36200702 cagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 6888993 - 6889062
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6888993 ggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  363 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 423
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 423  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15489774 - 15489706
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15489774 ggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 15489706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  161 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  261 tggag 265  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 442
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  359 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 446
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980232
Alignment:
Q  188 gaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 287  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| |  | |||||||||| |||||| || || |||   ||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagatagaaaagt--catattacaagaggta 23980073  T
Q  288 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 387  Q
     ||| ||| |||  | ||| ||  ||||||| |||   || |||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatat 23980173  T
Q  388 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 446  Q
    ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||    
T  23980174 ttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgttgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 266
Target Start/End: Original strand, 42199299 - 42199394
Alignment:
Q  171 tagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 266  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  42199299 tagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 378  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 2712944 - 2713014
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2712944 ggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 440
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  378 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10083021 - 10082952
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  10083021 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 413  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  414 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 443
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  366 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  90 atgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtag 188  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| | ||   |||||||||||||||||| |||||  ||||| | | | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  189 aaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
     |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 441
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  368 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43558108 - 43558011
Alignment:
Q  159 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 256  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | |  |||||||||| ||||    
T  43558108 gggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaagagtagat 43558011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 14667763 - 14667815
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  14667763 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttgg 14667815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 405  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 154
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040032
Alignment:
Q  82 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagag 34040032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 442
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  360 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 435  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  426 cttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 416
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  341 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 416  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 402
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 402  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  387 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4026617 - 4026540
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 235  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4026617 ggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagat 4026540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  382 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  392 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 6859381 - 6859450
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagac 227  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6859381 ggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagagaagac 6859450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 442  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  326 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 425  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  426 cttggttgttgttg 439  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998376
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaa 27998376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  367 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  315 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 364  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 77 - 443
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31753
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  31386 agcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  276 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 375  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  376 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 123 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1264 - 945
Alignment:
Q  123 gataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagag 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1264 gataggattatgaatgacaccattagagagagtgaggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagag 1166  T
Q  223 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 322  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  1165 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 1066  T
Q  323 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | |||||| ||||    
T  1065 aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggata 966  T
Q  423 atgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  965 aggcttggttgttgttgttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83000
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaa 179  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  180 agttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 279  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||| | | ||||||||||| |||    ||||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  280 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 379  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  380 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4634 - 4277
Alignment:
Q  79 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggg--gggtagcacctatagtag 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |  |||| |||||||||||||    
T  4634 cagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag 4535  T
Q  177 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 276  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||    
T  4534 aaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagt 4435  T
Q  277 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 376  Q
    |||||||||||          || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||    
T  4434 taaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaaca 4345  T
Q  377 ctatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4344 ctatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86606
Alignment:
Q  81 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| | | |  || |   | |||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagagag-agagagagtagaaaa 86869  T
Q  181 gttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 280  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  86868 gttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 86769  T
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  86768 agaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactat 86669  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86668 gacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 272 - 440
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  272 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  372 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 440  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 228 - 443
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  228 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 327  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  328 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 427  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  428 tggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  286 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 385  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  386 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25683
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagagtg-gggggtagcacctatagta 175  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  25809 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  176 gaaaagttggtagaaaatatgcttaga 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11962 - 11810
Alignment:
Q  77 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaaaccaaacatgataggattaggaatgacaccattaaagagag---tggggggtagcacctatag 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||     |||||||||||||||||    
T  11962 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatag 11863  T
Q  174 tagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11862 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  200 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 299  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  300 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 399  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  400 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 350 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  350 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7720
Alignment:
Q  138 gacaccattaaagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatac 237  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||      
T  7422 gacaccattagagagagtctggg-tagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgt 7520  T
Q  238 cgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 337  Q
    | |  ||||||||| | |||| |||||| |||   | || ||||||| |  |  ||||  ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| ||||    
T  7521 cttcataagaagagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagag 7619  T
Q  338 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttg 436  Q
    |||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7620 gtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttg 7718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  281 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 380  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  381 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45710 - 45644
Alignment:
Q  158 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaa 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  45710 ggggtatcacctatagtagaaaagacggtggaaaacatacttaggttgtttgaacatgtagagagaa 45644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  312 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 411  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  412 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 439  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  352 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  355 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 441  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  162 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaaga 226  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  390 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 443  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 488 times since January 2019
Visitors: 3651