View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0551_low_1 (Length: 526)

Name: NF0551_low_1
Description: NF0551
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0551_low_1
NF0551_low_1
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (41-449)||(26861375-26861782)
chr6 (79-369)||(31284126-31284416)
chr6 (79-369)||(26622814-26623104)
chr6 (79-369)||(26728792-26729082)
chr6 (41-375)||(27677632-27677969)
chr6 (41-369)||(27678784-27679115)
chr6 (41-375)||(27593038-27593375)
chr6 (41-369)||(27706420-27706751)
chr6 (41-347)||(26823700-26824009)
chr6 (41-386)||(27698512-27698860)
chr6 (41-386)||(27718397-27718745)
chr6 (41-386)||(27724863-27725211)
chr6 (41-369)||(27611020-27611351)
chr6 (41-349)||(26646337-26646648)
chr6 (41-349)||(26752305-26752616)
chr6 (41-369)||(26802280-26802611)
chr6 (41-345)||(27604723-27605030)
chr6 (41-369)||(28780977-28781308)
chr6 (41-377)||(28786108-28786447)
chr6 (41-377)||(28792229-28792568)
chr6 (73-377)||(26655819-26656123)
chr6 (73-377)||(26761790-26762094)
chr6 (39-347)||(26884023-26884336)
chr6 (79-387)||(27338124-27338432)
chr6 (79-387)||(27398864-27399172)
chr6 (100-369)||(27229070-27229339)
chr6 (79-309)||(25579617-25579847)
chr6 (89-318)||(27531266-27531495)
chr6 (79-309)||(26142763-26142993)
chr6 (79-309)||(28234462-28234692)
chr6 (79-309)||(25481640-25481870)
chr6 (79-309)||(28242702-28242932)
chr6 (79-309)||(25538438-25538668)
chr6 (79-309)||(26055824-26056054)
chr6 (79-309)||(26075794-26076024)
chr6 (79-309)||(26048743-26048973)
chr6 (79-309)||(26069912-26070142)
chr6 (77-345)||(28185228-28185496)
chr6 (73-309)||(28226848-28227084)
chr6 (79-333)||(28139415-28139669)
chr6 (79-290)||(28181031-28181242)
chr6 (86-345)||(28325343-28325602)
chr6 (86-231)||(28149914-28150058)
chr6 (73-229)||(26341987-26342143)
chr6 (231-387)||(27427814-27427970)
chr6 (89-263)||(25506978-25507146)
chr6 (79-166)||(28297772-28297859)
chr6 (79-166)||(28514214-28514301)
chr6 (186-277)||(29825957-29826048)
chr6 (61-166)||(26848701-26848809)
chr6 (79-168)||(2184327-2184416)
chr6 (77-330)||(26893528-26893781)
chr6 (215-288)||(27665312-27665385)
chr6 (79-168)||(28098428-28098517)
chr6 (86-141)||(26937160-26937215)
chr6 (74-125)||(26975134-26975185)
chr6 (175-278)||(29467756-29467859)
chr6 (79-125)||(2184980-2185026)
chr6 (303-369)||(26018770-26018836)
chr6 (303-369)||(26139474-26139540)
chr6 (260-309)||(2184186-2184235)
chr6 (73-126)||(27665170-27665223)
chr6 (247-288)||(28098596-28098637)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (79-374)||(268403-268698)
chr1 (41-377)||(28164367-28164706)
chr1 (41-346)||(28127684-28127993)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (80-377)||(18724132-18724429)
chr4 (80-369)||(18731551-18731840)
chr4 (79-369)||(18679613-18679903)
chr4 (79-377)||(18699446-18699744)
chr4 (87-369)||(18655531-18655813)
chr4 (231-387)||(17989248-17989404)
chr4 (231-387)||(18073585-18073741)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (79-369)||(29273829-29274119)
chr8 (88-288)||(31903770-31903970)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (41-386)||(3439-3788)
scaffold0349 (41-386)||(14374-14721)
scaffold0349 (280-386)||(8061-8167)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (41-377)||(4689-5028)
scaffold0277 (41-369)||(13650-13981)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (41-377)||(7355-7694)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (113-377)||(10-274)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (79-309)||(34623-34853)
scaffold0038 (79-309)||(42864-43094)
scaffold0038 (73-309)||(27346-27582)
scaffold0038 (86-345)||(116658-116917)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (79-345)||(58341-58607)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (231-387)||(59393-59549)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (73-229)||(3279666-3279822)
chr2 (186-374)||(17993850-17994038)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (303-369)||(5916-5982)
[»] scaffold0781 (1 HSPs)
scaffold0781 (260-309)||(91-140)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26861782 - 26861375
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttgcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26861782 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttgcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacag 26861683  T
Q  141 gaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattccctt 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26861682 gaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattccctt 26861583  T
Q  241 gtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaa 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26861582 gtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaa 26861483  T
Q  341 gaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaataattggatgagaaaaaatagtttgggaatgcaaactatgaacaaataagtaactg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26861482 gaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaatt-ggataaataattggatgagaaaaaatagtttaggaatgcaaactatgaacaaataagtaactg 26861384  T
Q  441 tggtctgtg 449  Q
    |||||||||    
T  26861383 tggtctgtg 26861375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31284416 - 31284126
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31284416 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 31284317  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31284316 gatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccat 31284217  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31284216 accgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccat 31284126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26623104 - 26622814
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||    
T  26623104 aatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagt 26623005  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  26623004 gatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgt 26622905  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26622904 accgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccat 26622814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26729082 - 26728792
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||    
T  26729082 aatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagt 26728983  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  26728982 gatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgt 26728883  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26728882 accgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccat 26728792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Original strand, 27677632 - 27677969
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27677632 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 27677731  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||    
T  27677732 cagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcc 27677831  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||     
T  27677832 cttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaatt 27677931  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaat 375  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27677932 gaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27679115 - 27678784
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27679115 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 27679016  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |||||| || |||||||||| |||||||||||  ||   | ||| ||||||||||  |||||    
T  27679015 caggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcc 27678916  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||     
T  27678915 cttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaatt 27678816  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27678815 gaagtggaagaggaaggtgattgcatagccat 27678784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Original strand, 27593038 - 27593375
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  ||||   |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  27593038 aaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 27593137  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |||||| || |||||||||  |||||||||||  ||   ||||| ||||||||||  |||||    
T  27593138 caggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcc 27593237  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||     
T  27593238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaatt 27593337  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaat 375  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27593338 gaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Original strand, 27706420 - 27706751
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  27706420 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaaca 27706519  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||    
T  27706520 caggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcc 27706619  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||     
T  27706620 cttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaatt 27706719  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27706720 gaagtggaagagaaaggtgattgcatagccat 27706751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26824009 - 26823700
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttgcaatt---aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26824009 aaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaaca 26823910  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26823909 caggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcc 26823810  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||      
T  26823809 cttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaact 26823710  T
Q  338 gaagaggaag 347  Q
    ||||||||||    
T  26823709 gaagaggaag 26823700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 27698512 - 27698860
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttt---tccttgcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   || | ||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  27698512 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaaca 27698611  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  27698612 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 27698711  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  27698712 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 27698811  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaata 386  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  27698812 gaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaata 27698860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 27718397 - 27718745
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  27718397 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 27718496  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  27718497 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 27718596  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |      
T  27718597 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaat 27718696  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaata 386  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  27718697 gaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaata 27718745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 27724863 - 27725211
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  27724863 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaaca 27724962  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  27724963 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 27725062  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  27725063 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 27725162  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaata 386  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||| || |||||    
T  27725163 gaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaata 27725211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Original strand, 27611020 - 27611351
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  27611020 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 27611119  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  27611120 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 27611219  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  27611220 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 27611319  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27611320 gaagaagaagaggaagctaattgcatagccat 27611351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26646648 - 26646337
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||  ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  26646648 aaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaaca 26646549  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26646548 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcc 26646449  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| || |||||  ||||||| || |||||  ||||||| ||||||||     
T  26646448 cttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaatt 26646349  T
Q  338 gaagaggaagag 349  Q
     |||||||||||    
T  26646348 aaagaggaagag 26646337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26752616 - 26752305
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||  ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  26752616 aaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaaca 26752517  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26752516 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcc 26752417  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| || |||||  ||||||| || |||||  ||||||| ||||||||     
T  26752416 cttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaatt 26752317  T
Q  338 gaagaggaagag 349  Q
     |||||||||||    
T  26752316 aaagaggaagag 26752305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26802611 - 26802280
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcctt---gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  |||   ||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  26802611 aaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaaca 26802512  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  26802511 caggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 26802412  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||      
T  26802411 cttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaat 26802312  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  26802311 gaagaggatgaggaaggagactgcatagccat 26802280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 345
Target Start/End: Original strand, 27604723 - 27605030
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  27604723 aaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaaca 27604822  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| | |   |||| | || |||||||||| |||||| |||| |||   ||||| |||||||| ||||||||    
T  27604823 caggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcc 27604922  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||      
T  27604923 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaat 27605022  T
Q  338 gaagagga 345  Q
    ||||||||    
T  27605023 gaagagga 27605030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28781308 - 28780977
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||   |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28781308 aaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaaca 28781209  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  28781208 caggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 28781109  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||      
T  28781108 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaat 28781009  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28781008 gaagaggaagaggaaggtaattgcatagccat 28780977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28786447 - 28786108
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||   |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   || | ||| ||||||| ||||||||    
T  28786447 aaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaaca 28786348  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  28786347 caggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 28786248  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  28786247 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 28786148  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  28786147 gaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 28786108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28792568 - 28792229
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||   |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   || | ||| ||||||| ||||||||    
T  28792568 aaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaaca 28792469  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  28792468 caggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 28792369  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  28792368 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 28792269  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  28792268 gaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 28792229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26656123 - 26655819
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |      
T  26656123 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctta 26656024  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaa 272  Q
     |||||||| || |||||||||| |||||  |||| |||   ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26656023 acgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaa 26655924  T
Q  273 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcag 372  Q
    |||| | ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  26655923 aaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgag 26655824  T
Q  373 aattg 377  Q
    |||||    
T  26655823 aattg 26655819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26762094 - 26761790
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |      
T  26762094 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctta 26761995  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaa 272  Q
     |||||||| || |||||||||| |||||  |||| |||   ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26761994 acgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaa 26761895  T
Q  273 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcag 372  Q
    |||| | ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  26761894 aaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgag 26761795  T
Q  373 aattg 377  Q
    |||||    
T  26761794 aattg 26761790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26884336 - 26884023
Alignment:
Q  39 caaaaacaggcaaaacgacgcgacccttt---tccttgcaattaatga--tttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaa 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   || | ||| | |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  26884336 caaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaa 26884237  T
Q  134 aacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaa 233  Q
    || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||| || |||||||    |||||| |||| | |  |||||| ||||||||||| |    
T  26884236 aatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtgga 26884137  T
Q  234 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccatagga 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  26884136 ttcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 26884037  T
Q  334 aatggaagaggaag 347  Q
    ||  ||||||||||    
T  26884036 aaatgaagaggaag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 387
Target Start/End: Original strand, 27338124 - 27338432
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||    
T  27338124 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagt 27338223  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || || ||||||| ||||||| ||| ||    ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27338224 gatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgt 27338323  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgg 378  Q
    |  |||||||| |  | || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  27338324 aaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattga 27338423  T
Q  379 gataaataa 387  Q
    || ||||||    
T  27338424 gagaaataa 27338432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 387
Target Start/End: Original strand, 27398864 - 27399172
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||    
T  27398864 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagt 27398963  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || || ||||||| ||||||| ||| ||    ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27398964 gatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgt 27399063  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgg 378  Q
    |  |||||||| |  | || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  27399064 aaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattga 27399163  T
Q  379 gataaataa 387  Q
    || ||||||    
T  27399164 gagaaataa 27399172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27229339 - 27229070
Alignment:
Q  100 caaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccct 199  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||| ||| || |||||||| | | |||||||| || ||||||| || |||    
T  27229339 caaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcct 27229240  T
Q  200 ctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctga 299  Q
    |||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || || |    
T  27229239 ctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaa 27229140  T
Q  300 aactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27229139 aactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccat 27229070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25579847 - 25579617
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| | | | |||    
T  25579847 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 25579748  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  25579747 gatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgt 25579648  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25579647 tgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaa 25579617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 318
Target Start/End: Original strand, 27531266 - 27531495
Alignment:
Q  89 acaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttga 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||  |  |||||| || |||    
T  27531266 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtga 27531365  T
Q  189 tttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||    
T  27531366 tttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtc 27531465  T
Q  289 acttcctctgaaactgaggaatacttggta 318  Q
        || || ||||||||||| ||||||||    
T  27531466 cgcgcccctaaaactgaggaacacttggta 27531495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26142993 - 26142763
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| | | | |||    
T  26142993 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 26142894  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    |    
T  26142893 gatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgt 26142794  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26142793 tgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaa 26142763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234462
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || | |||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccat 28234493  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28234492 agcgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28234462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25481870 - 25481640
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  |||||  |||||||||| ||||||||||| | | | |||    
T  25481870 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 25481771  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  25481770 gatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgt 25481671  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  25481670 tgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaa 25481640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28242932 - 28242702
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||    
T  28242932 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28242833  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  28242832 gatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccat 28242733  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28242732 aacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25538668 - 25538438
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | | | |||    
T  25538668 aatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagt 25538569  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||   |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    |    
T  25538568 gatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgt 25538469  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25538468 tgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaa 25538438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26056054 - 26055824
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | | | |||    
T  26056054 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagt 26055955  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    |||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  26055954 gatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgt 26055855  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26055854 tgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaa 26055824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26076024 - 26075794
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | | | |||    
T  26076024 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagt 26075925  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    |||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  26075924 gatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgt 26075825  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26075824 tgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaa 26075794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26048973 - 26048743
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | | | |||    
T  26048973 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagt 26048874  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
        || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||   ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  26048873 ttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgt 26048774  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26048773 tgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaa 26048743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26070142 - 26069912
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | | | |||    
T  26070142 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagt 26070043  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
        || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||   ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||   |    
T  26070042 ttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgt 26069943  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26069942 tgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaa 26069912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28185496 - 28185228
Alignment:
Q  77 ttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcga 176  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |   |    
T  28185496 ttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 28185397  T
Q  177 gtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaacc 276  Q
    |||||  | | ||||| || |||| |||||| || |  ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||  | | |||||| || |||||||     
T  28185396 gtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacg 28185297  T
Q  277 ataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagagga 345  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |  ||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  28185296 ataacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagagga 28185228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28227084 - 28226848
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  28227084 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttg 28226985  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaa 272  Q
       ||||||  | | |||||||| |||| |||||| || | |||||| | ||| |||||||||||||| | |  |||| |  |||||||||| || ||||    
T  28226984 aaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaa 28226885  T
Q  273 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  28226884 aaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaa 28226848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28139669 - 28139415
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |   |||||    
T  28139669 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagt 28139570  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||  ||   ||||| || |||| |||||| || | |||||| || || ||||| |||||   ||||  |||||| ||||||||||| || || |||||      
T  28139569 gacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccga 28139470  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccatagga 333  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| || || | |||| |||| ||||||||    
T  28139469 aacgagtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccatagga 28139415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28181242 - 28181031
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||    
T  28181242 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28181143  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    |||  | | ||||| || |||| |||||| || |  ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||  | | |||||| || ||||||||||    
T  28181142 gatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaaccat 28181043  T
Q  279 accgagtgtcac 290  Q
    | ||||||||||    
T  28181042 aacgagtgtcac 28181031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28325602 - 28325343
Alignment:
Q  86 tggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtt 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||  ||     
T  28325602 tggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtg 28325503  T
Q  186 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagt 285  Q
    | ||||| || |||| |||||| ||    ||||| ||||||||  |||||| |||   |  |||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28325502 ttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagt 28325403  T
Q  286 gtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagagga 345  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28325402 gtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28150058 - 28149914
Alignment:
Q  86 tggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||| ||     
T  28150058 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttg-agagtgatggtg 28149960  T
Q  186 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtg 231  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||    
T  28149959 tgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtg 28149914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 26341987 - 26342143
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || |  |||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  26341987 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttg 26342086  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtg 229  Q
     | |||||| || ||||||  || ||||  ||||| || | |||||| |||||||||    
T  26342087 acaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtg 26342143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 387
Target Start/End: Original strand, 27427814 - 27427970
Alignment:
Q  231 gaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccata 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||  |  || ||||||| || | |||  ||||| ||||    
T  27427814 gaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcata 27427913  T
Q  331 ggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaataa 387  Q
    |||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  27427914 ggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataa 27427970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 263
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507146
Alignment:
Q  89 acaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttga 188  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||| |||| || |||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  189 tttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 263  Q
    ||||||| |||||||  || |||| |||||| |      |||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  25507078 tttcatctcctcttttcagatcacaatcatcaa------tgtgaattcccttgtcatatagagccgtgtagagat 25507146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Original strand, 28297772 - 28297859
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 166  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28297772 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28514301 - 28514214
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 166  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28514301 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29826048 - 29825957
Alignment:
Q  186 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaacca 277  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||    ||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29826048 tgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacca 29825957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26848809 - 26848701
Alignment:
Q  61 acccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagac 157  Q
    |||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  |||| || ||| ||||| ||||||| ||     
T  26848809 acccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgag 26848710  T
Q  158 tcttcaatg 166  Q
    |||||||||    
T  26848709 tcttcaatg 26848701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2184416 - 2184327
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggc 168  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  2184416 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggc 2184327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 330
Target Start/End: Original strand, 26893528 - 26893781
Alignment:
Q  77 ttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcga 176  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| |  || |||||| | ||| ||||||||||||| || | |   |    
T  26893528 ttaatgattttgacgagttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataa 26893627  T
Q  177 gtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaacc 276  Q
    ||||| ||  |||||| || ||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  | |||  |||||| || || ||||  || ||||||||    
T  26893628 gtgatggtgagatttcgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaacc 26893727  T
Q  277 ataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccata 330  Q
    | | |||||||||   ||||| ||| ||||||| || | |||  ||||||||||    
T  26893728 aaaacgagtgtcagagcctctaaaattgaggaagacatcgtaggtgaatccata 26893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Original strand, 27665312 - 27665385
Alignment:
Q  215 tcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtc 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||    
T  27665312 tcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaaccaaatcgagtgtc 27665385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 28098428 - 28098517
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggc 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||   ||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28098428 aatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggc 28098517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26937215 - 26937160
Alignment:
Q  86 tggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacagg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||    
T  26937215 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacagg 26937160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26975185 - 26975134
Alignment:
Q  74 caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagt 125  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26975185 caatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29467859 - 29467756
Alignment:
Q  175 gagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaa 274  Q
    ||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || || ||  | ||||||||||| |||    
T  29467859 gagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaagttcttcatcatccatgaaggtgtgaattcctctgtcactcagtgctttccaaagattgccggtgaaa 29467760  T
Q  275 ccat 278  Q
    ||||    
T  29467759 ccat 29467756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2185026 - 2184980
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagt 125  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2185026 aatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 369
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018836
Alignment:
Q  303 tgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccat 26018836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 369
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139540
Alignment:
Q  303 tgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 26139540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2184235 - 2184186
Alignment:
Q  260 agattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  2184235 agattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaa 2184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 126
Target Start/End: Original strand, 27665170 - 27665223
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagtt 126  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  27665170 gcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 288
Target Start/End: Original strand, 28098596 - 28098637
Alignment:
Q  247 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtc 288  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28098596 aagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtc 28098637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 374
Target Start/End: Original strand, 268403 - 268698
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268403 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 268502  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  268503 gatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccct 268602  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaa 374  Q
      ||||||||||  ||||||||  ||||||| || |||||    |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  268603 cacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaa 268698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Original strand, 28164367 - 28164706
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  ||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28164367 aaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataaca 28164466  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||| | ||| | ||||||||| | |  || |||  || ||||||| || ||||| | ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28164467 caggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcc 28164566  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||   ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  28164567 cttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaatt 28164666  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    |||||||||||| || | ||| | |||||||| |||||||    
T  28164667 gaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattg 28164706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 346
Target Start/End: Original strand, 28127684 - 28127993
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  ||||   || | |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |    
T  28127684 aaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaata 28127783  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcc-cctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattc 236  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |     |||||  || ||||||  | | ||||| | ||| | || |||||| ||||| ||||| ||||    
T  28127784 caggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattc 28127883  T
Q  237 ccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaat 336  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28127884 ccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaat 28127983  T
Q  337 ggaagaggaa 346  Q
     |||||||||    
T  28127984 tgaagaggaa 28127993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 377
Target Start/End: Original strand, 18724132 - 18724429
Alignment:
Q  80 atgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtg 179  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18724132 atgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtg 18724231  T
Q  180 atcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccata 279  Q
    || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |     
T  18724232 atggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgtt 18724331  T
Q  280 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18724332 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 18724429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 18731551 - 18731840
Alignment:
Q  80 atgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtg 179  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18731551 atgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtg 18731650  T
Q  180 atcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccata 279  Q
    || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |     
T  18731651 atggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtc 18731750  T
Q  280 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18731751 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccat 18731840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Original strand, 18679613 - 18679903
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18679613 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 18679712  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18679713 gatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgt 18679812  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  18679813 tacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccat 18679903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 377
Target Start/End: Original strand, 18699446 - 18699744
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18699446 aatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 18699545  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18699546 gatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgt 18699645  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
      ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18699646 cacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 18699744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 369
Target Start/End: Original strand, 18655531 - 18655813
Alignment:
Q  87 ggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgttt 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18655531 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggttt 18655630  T
Q  187 gatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtg 286  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |  ||||||    
T  18655631 gatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtg 18655730  T
Q  287 tcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  18655731 tcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccat 18655813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 387
Target Start/End: Original strand, 17989248 - 17989404
Alignment:
Q  231 gaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccata 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||  |  || ||||||| || | |||  ||||| ||||    
T  17989248 gaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcata 17989347  T
Q  331 ggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaataa 387  Q
    |||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  17989348 ggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataa 17989404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18073741 - 18073585
Alignment:
Q  231 gaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccata 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||  |  || ||||||| || | |||  ||||| ||||    
T  18073741 gaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcata 18073642  T
Q  331 ggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaataa 387  Q
    |||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  18073641 ggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataa 18073585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Original strand, 29273829 - 29274119
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29273829 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagt 29273928  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |    
T  29273929 gatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgt 29274028  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
      ||||||||||  ||||| ||  ||||||| || |||||  |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29274029 cacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31903970 - 31903770
Alignment:
Q  88 gacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttg 187  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||   ||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| || ||    |||||| || ||    
T  31903970 gacaagttcatgtaagcaaaatgaagaagaagcatagtttttagagagcacaataatggcaatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtg 31903871  T
Q  188 atttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgt 287  Q
    |||||||  ||||||||||||||   ||| || || |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  31903870 atttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgt 31903771  T
Q  288 c 288  Q
    |    
T  31903770 c 31903770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 3439 - 3788
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatag-ttgacagaaaac 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  3439 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaac 3538  T
Q  137 acaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattc 236  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||    
T  3539 acaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattc 3638  T
Q  237 ccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  3639 ccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaa 3738  T
Q  337 ggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaata 386  Q
     |||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||| || |||||    
T  3739 tgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaata 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 14374 - 14721
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  14374 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaaca 14472  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||    
T  14473 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 14572  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  14573 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 14672  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaata 386  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  14673 gaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaata 14721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8167
Alignment:
Q  280 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattggg 379  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  8061 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 8160  T
Q  380 ataaata 386  Q
    | |||||    
T  8161 agaaata 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Original strand, 4689 - 5028
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  || ||||||||    
T  4689 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaaca 4788  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  4789 caggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 4888  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  4889 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaat 4988  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  4989 gaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Original strand, 13650 - 13981
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||   |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  13650 aaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaaca 13749  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  13750 caggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 13849  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||      
T  13850 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaat 13949  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13950 gaagaggaagaggaaggtaattgcatagccat 13981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7694 - 7355
Alignment:
Q  41 aaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---caattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  ||||   |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7694 aaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaaca 7595  T
Q  138 caggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcc 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||    
T  7594 caggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcc 7495  T
Q  238 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||      
T  7494 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaat 7395  T
Q  338 gaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  7394 gaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattg 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 377
Target Start/End: Original strand, 10 - 274
Alignment:
Q  113 gaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcac 212  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||     
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  213 gatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatac 312  Q
      ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||| ||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  313 ttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 377  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattg 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34853 - 34623
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||    
T  34853 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 34754  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || | |||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||    
T  34753 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccat 34654  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34653 agcgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 34623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 43094 - 42864
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||    
T  43094 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 42995  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  42994 gatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccat 42895  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  42894 aacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27582 - 27346
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  27582 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttg 27483  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaa 272  Q
       ||||||  | | |||||||| |||| |||||| || | |||||| | ||| |||||||||||||| | |  |||| |  |||||||||| || ||||    
T  27482 aaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaa 27383  T
Q  273 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  27382 aaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaa 27346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 116917 - 116658
Alignment:
Q  86 tggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagtgatcgtt 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||  ||     
T  116917 tggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtg 116818  T
Q  186 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagt 285  Q
    | ||||| || |||| |||||| ||    ||||| ||||||||  |||||| |||   |  |||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  116817 ttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagt 116718  T
Q  286 gtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagagga 345  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  116717 gtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 345
Target Start/End: Original strand, 58341 - 58607
Alignment:
Q  79 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcgtcgagt 178  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| | |   |||    
T  58341 aatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagt 58440  T
Q  179 gatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccat 278  Q
    ||| || | ||||| || |||| |||||| || |  ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  58441 gatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaaccat 58540  T
Q  279 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagagga 345  Q
    | ||||||||||  ||||| || || ||||| || || ||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  58541 agcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 59549 - 59393
Alignment:
Q  231 gaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccata 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||  |  || ||||||| || | |||  ||||| ||||    
T  59549 gaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcata 59450  T
Q  331 ggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattgggataaataa 387  Q
    |||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  59449 ggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataa 59393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3279822 - 3279666
Alignment:
Q  73 gcaattaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttgacagaaaacacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcatcg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||||| | |    
T  3279822 gcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggccttg 3279723  T
Q  173 tcgagtgatcgtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtg 229  Q
     | |||||| || |||||||||| ||||  ||||| || | |||||| |||||||||    
T  3279722 acaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtg 3279666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 374
Target Start/End: Original strand, 17993850 - 17994038
Alignment:
Q  186 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccataccgagt 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  17993850 tgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggtgaaaccatatcgagt 17993949  T
Q  286 gtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaa 374  Q
     ||  | || |||||||| | ||| || | | |  |||| ||||| || | ||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17993950 atcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagctgaaaccataagataaggaggaagaggaggaaggtgattgcatagccataagaa 17994038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5916
Alignment:
Q  303 tgaggaatacttggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 369  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0781 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0781
Description:

Target: scaffold0781; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 91 - 140
Alignment:
Q  260 agattgccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 309  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  91 agattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaa 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1280 times since January 2019
Visitors: 3667