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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0559_low_37 (Length: 263)

Name: NF0559_low_37
Description: NF0559
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0559_low_37
NF0559_low_37
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (4-250)||(5004640-5004885)
chr3 (51-250)||(46404538-46404727)
chr3 (139-250)||(16975339-16975450)
chr3 (56-248)||(11967862-11968053)
chr3 (4-112)||(16975453-16975569)
chr3 (4-55)||(11937787-11937838)
chr3 (168-220)||(8730913-8730966)
chr3 (168-220)||(9082800-9082853)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (4-250)||(23260490-23260743)
chr6 (4-250)||(32450174-32450428)
chr6 (51-250)||(25005229-25005428)
chr6 (51-250)||(34636272-34636456)
chr6 (4-162)||(10751480-10751637)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (51-250)||(8925-9124)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (4-250)||(35761961-35762217)
chr1 (4-178)||(37667098-37667271)
chr1 (106-246)||(9537377-9537517)
chr1 (168-246)||(16074800-16074879)
chr1 (200-250)||(37667265-37667315)
chr1 (126-162)||(16074874-16074910)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (51-250)||(536899-537089)
chr5 (6-246)||(4557883-4558133)
chr5 (174-250)||(536815-536891)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (51-250)||(15873912-15874102)
chr7 (4-248)||(21491405-21491659)
chr7 (106-246)||(22077720-22077860)
chr7 (51-238)||(18367294-18367476)
chr7 (125-238)||(48576426-48576540)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (4-256)||(49499091-49499351)
chr4 (106-246)||(28969204-28969344)
[»] scaffold1838 (1 HSPs)
scaffold1838 (112-238)||(271-397)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (184-250)||(32735391-32735457)
chr2 (176-246)||(29270722-29270792)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 5004640 - 5004885
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaatacc 103  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5004640 acatcatcatccacatggaccaaactgaaatattttcgtaaaactcgtattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caatacc 5004738  T
Q  104 acaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttata 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5004739 acaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttata 5004838  T
Q  204 aaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5004839 aaaggttaaatttcaccatataaattcatattttagttgttttgttc 5004885  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 46404538 - 46404727
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||     
T  46404538 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaat---------gccattccacaa 46404627  T
Q  151 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46404628 aacattatcatacagatatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 46404727  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16975450 - 16975339
Alignment:
Q  139 gtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatatttta 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16975450 gtcattccacataaaattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatatttta 16975351  T
Q  239 gttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||    
T  16975350 gttgttttgttc 16975339  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 248
Target Start/End: Original strand, 11967862 - 11968053
Alignment:
Q  56 tcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaa--catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataac 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  11967862 tcatttctttagtttatcaacaaaat--aacacttctttcccaataccacaaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacggaac 11967959  T
Q  154 attatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgt 248  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11967960 atttt-atacacacatcgtataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatattttagattttttgt 11968053  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16975569 - 16975453
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattt--------tcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16975569 acatcatcatccacatgaaccaaactgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta 16975470  T
Q  96 acaataccacaaaaaca 112  Q
    |||||||||||||||||    
T  16975469 acaataccacaaaaaca 16975453  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 11937787 - 11937838
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattt 55  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11937787 acatcatcatccacatgaaccaaaataaaatattttcataaaactcatattt 11937838  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8730966 - 8730913
Alignment:
Q  168 atcatataaaatataatta-aactaataacttttataaaaggttaaattttacc 220  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8730966 atcatataaaacataatgagaattaataacttttataaaagattaaattttacc 8730913  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9082853 - 9082800
Alignment:
Q  168 atcatataaaatataatta-aactaataacttttataaaaggttaaattttacc 220  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9082853 atcatataaaacataatgagaattaataacttttataaaagattaaattttacc 9082800  T

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Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 23260490 - 23260743
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattt--------tcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23260490 acatcatcatccacatgaaccaaactgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcagcaaa-tctaacacttcttta 23260588  T
Q  96 acaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23260589 acaataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacaaacatcatataaaatataattaaactaataa 23260688  T
Q  196 cttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23260689 cttttataaaaggctaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 23260743  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 32450174 - 32450428
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtatt--------ttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32450174 acatcatcatgcacatgaaccaaaatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttcttta 32450273  T
Q  96 acaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32450274 acaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataa 32450373  T
Q  196 cttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32450374 cttttataaaaagttaaaatttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 32450428  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25005428 - 25005229
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25005428 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctttaacaataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 25005329  T
Q  151 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25005328 aaaattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcttattttagttgttttgttc 25005229  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34636456 - 34636272
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||||||    
T  34636456 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacactt-------aataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgtcatgccacat 34636372  T
Q  151 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34636371 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 34636272  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 10751480 - 10751637
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaatacc 103  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10751480 acatcatcatccacatggaccaaactgaaatattttcgtaaaactcgtattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttct-ttacaatacc 10751578  T
Q  104 acaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcata 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751579 acaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcata 10751637  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9124 - 8925
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaa-taaaataaatgtcattccaca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9124 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaaataaaataaatgtcattccaca 9026  T
Q  150 taacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9025 taacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataactgttataaaaggttaaattttaccatgtgaattcatattttagttgttttgtt 8926  T

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Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 35761961 - 35762217
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtatt--------ttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||        |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  35761961 acatcatcatccacatgaaccaaaatgaaatattttcataaaacacatatttctatattttcatttatttagtttatctacaaagtctaacacttcatta 35762060  T
Q  96 acaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35762061 acaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatatagttaaactaataa 35762160  T
Q  196 c--ttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35762161 cttttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatattttagttgttttgttc 35762217  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 37667098 - 37667271
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaatacc 103  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37667098 acatcatcatccacatggaccaaactgaaatattttcataaaactcatattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caatacc 37667196  T
Q  104 acaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaa 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667197 acaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaaagtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaa 37667271  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 9537377 - 9537517
Alignment:
Q  106 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 205  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537377 aaaaacatatacgcatagcaacatgaaataaatgtcattctacataacattatcatacaaacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 9537476  T
Q  206 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  9537477 aggttaaattttacaatataaatttatattttacttgtttt 9537517  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16074879 - 16074800
Alignment:
Q  168 atcatataaaatataattaaa-ctaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16074879 atcatataaaatataattaaatctaataacttttataaaagattaaattttaacatatgaattcatattttaattgtttt 16074800  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 250
Target Start/End: Original strand, 37667265 - 37667315
Alignment:
Q  200 tataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667265 tataaaaggttaaattttatcatatgaattcatattttagttgttttgttc 37667315  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16074910 - 16074874
Alignment:
Q  126 aaataaaataaatgtcattccacataacattatcata 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16074910 aaataaaataaatgtcattctacattacattatcata 16074874  T

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Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 537089 - 536899
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||    
T  537089 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgccattccacat 536999  T
Q  151 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  536998 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 536899  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Original strand, 4557883 - 4558133
Alignment:
Q  6 atcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattt--------tcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaac 97  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||        |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |  |    
T  4557883 atcatcatccacatgaaccaaaatgaaatattttcataaaactcatatttatatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttctc 4557982  T
Q  98 aataccacaaaa--acatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataa 195  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4557983 aataccacaaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaaagtcattctacgtaacattattatacacacattatataaaatatgattaaactaataa 4558082  T
Q  196 cttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4558083 cttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatattttagttttttt 4558133  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 536891 - 536815
Alignment:
Q  174 taaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  536891 taaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 536815  T

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Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 15873912 - 15874102
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||     
T  15873912 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgccattccacaa 15874002  T
Q  151 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15874003 aacattatcatacagatatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 15874102  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 21491405 - 21491659
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtatt--------ttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |     
T  21491405 acatcatcatccacatgaaccaaaatgaaatattttcataaaactcatattactatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttc 21491504  T
Q  96 acaataccacaaaaa---catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaa 192  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21491505 ccaataccacaaaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacataacatttt-atgcacacatcatataaaatataattaaactaa 21491603  T
Q  193 taacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21491604 taacttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatattttagtttttttgt 21491659  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22077860 - 22077720
Alignment:
Q  106 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22077860 aaaaacatatatgcataggaaaataaagcaaatgtcattctacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataactttttgaaa 22077761  T
Q  206 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22077760 tggttaaattttaccatataaatttatattttagttgtttt 22077720  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 238
Target Start/End: Original strand, 18367294 - 18367476
Alignment:
Q  51 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctctaacaataccacaaaaa--catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccac 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  18367294 tattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttcccaataccacaaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctac 18367393  T
Q  149 ataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatatttta 238  Q
     ||||||| | ||| |      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18367394 gtaacattttaatata------at-taaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatatttta 18367476  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48576540 - 48576426
Alignment:
Q  125 aaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataatt-aaactaataacttttataaaaggttaaattttaccata 223  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  48576540 aaaatagaataaatgtcattctgcatcacattatcatacacacatcatataatatataattaaaactaataactttaataagatattaaattttaccata 48576441  T
Q  224 tgaattcatatttta 238  Q
    | |||||||||||||    
T  48576440 taaattcatatttta 48576426  T

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Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49499351 - 49499091
Alignment:
Q  4 acatcatcatccacgtgaaccgaactgaaatattttcataaaactcgtattt--------tcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctcta 95  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||        |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |     
T  49499351 acatcatcatccacatgaaccaaaatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttc 49499252  T
Q  96 acaataccacaaaaa-catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaata 194  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49499251 ccaataccacaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacgtaacatctt-atacacacattatataaaatataattaaactaata 49499153  T
Q  195 acttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttcatctca 256  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  49499152 atttttataaaaggttaaattttactatataaattcatattttagttttttttttcttctca 49499091  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 28969204 - 28969344
Alignment:
Q  106 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28969204 aaaaacatatatgcatagcaaaataaaataaatgtcattctacataaaattatcatacacacatcatatagaatataattaaactaataacttttataaa 28969303  T
Q  206 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28969304 atgttaaattttaccatataaattaatattttagttgtttt 28969344  T

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Target: scaffold1838 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1838
Description:

Target: scaffold1838; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 397 - 271
Alignment:
Q  112 atatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 211  Q
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T  397 atatatgcatggcaaaataaaataaatggcattctacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 298  T
Q  212 aattttaccatatgaattcatatttta 238  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  297 aattttaccatatagatttatatttta 271  T

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Target: chr2 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Original strand, 32735391 - 32735457
Alignment:
Q  184 ttaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32735391 ttaaactaatatcttttataaaaggttaaatttcaccatatgaatgcatattttagttgttttgttc 32735457  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29270792 - 29270722
Alignment:
Q  176 aaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 246  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| || | | | ||||||||| |||||||    
T  29270792 aaatataattaaaataataatttttataaaatattaaattttactatgtaactacatattttaattgtttt 29270722  T

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