View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0586-Insertion-4 (Length: 365)

Name: NF0586-Insertion-4
Description: NF0586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0586-Insertion-4
NF0586-Insertion-4
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (120-365)||(19696531-19696774)
chr6 (120-365)||(22857934-22858177)
chr6 (145-350)||(12186068-12186270)
chr6 (120-365)||(3027833-3028076)
chr6 (125-307)||(20526902-20527081)
chr6 (120-365)||(25078539-25078780)
chr6 (168-365)||(11262596-11262792)
chr6 (120-361)||(16455410-16455648)
chr6 (145-365)||(26945260-26945478)
chr6 (120-365)||(15719735-15719976)
chr6 (120-350)||(17012132-17012358)
chr6 (145-351)||(13039871-13040073)
chr6 (160-361)||(12911431-12911629)
chr6 (160-361)||(12937179-12937376)
chr6 (146-350)||(28037722-28037927)
chr6 (145-365)||(32280113-32280330)
chr6 (203-339)||(30445698-30445832)
chr6 (145-351)||(9020043-9020244)
chr6 (145-351)||(13057311-13057513)
chr6 (145-351)||(15532678-15532878)
chr6 (145-351)||(30967318-30967519)
chr6 (148-351)||(1069714-1069913)
chr6 (145-351)||(3390496-3390698)
chr6 (145-351)||(11983025-11983226)
chr6 (145-351)||(3631935-3632135)
chr6 (145-351)||(1230245-1230446)
chr6 (153-351)||(14458763-14458956)
chr6 (139-284)||(11138417-11138562)
chr6 (215-363)||(28078178-28078323)
chr6 (145-351)||(25477391-25477600)
chr6 (145-351)||(3629861-3630061)
chr6 (145-351)||(4816227-4816428)
chr6 (145-351)||(15541136-15541337)
chr6 (160-349)||(13883475-13883658)
chr6 (143-347)||(7542381-7542583)
chr6 (120-365)||(15367124-15367364)
chr6 (145-351)||(28241317-28241518)
chr6 (145-338)||(3233739-3233927)
chr6 (160-349)||(13878727-13878910)
chr6 (160-349)||(16785919-16786102)
chr6 (163-351)||(17694848-17695030)
chr6 (145-303)||(15530166-15530319)
chr6 (145-350)||(19704564-19704766)
chr6 (249-365)||(25465572-25465687)
chr6 (145-351)||(2628882-2629082)
chr6 (145-351)||(14507172-14507372)
chr6 (163-351)||(22342797-22342980)
chr6 (145-349)||(24338446-24338644)
chr6 (160-365)||(35201309-35201508)
chr6 (226-365)||(15346544-15346679)
chr6 (145-350)||(5273213-5273413)
chr6 (167-351)||(12166142-12166321)
chr6 (163-351)||(22351849-22352031)
chr6 (145-350)||(26932559-26932759)
chr6 (159-352)||(29754704-29754892)
chr6 (145-351)||(30034599-30034800)
chr6 (163-351)||(13467463-13467642)
chr6 (145-361)||(20915342-20915553)
chr6 (145-351)||(30728820-30729025)
chr6 (160-349)||(26887225-26887406)
chr6 (163-351)||(33215830-33216013)
chr6 (145-350)||(26065100-26065298)
chr6 (145-350)||(26085069-26085267)
chr6 (159-350)||(33308988-33309173)
chr6 (145-347)||(12195515-12195712)
chr6 (211-351)||(3577486-3577621)
chr6 (168-342)||(5165818-5165989)
chr6 (144-365)||(14466439-14466657)
chr6 (166-350)||(25465896-25466075)
chr6 (276-351)||(25941780-25941855)
chr6 (272-350)||(7294035-7294113)
chr6 (145-222)||(19227528-19227605)
chr6 (151-287)||(22490763-22490896)
chr6 (159-350)||(33311257-33311442)
chr6 (248-349)||(22870100-22870198)
chr6 (276-350)||(30443532-30443606)
chr6 (160-349)||(31248713-31248896)
chr6 (276-349)||(17038345-17038418)
chr6 (159-350)||(26066121-26066307)
chr6 (159-350)||(26068392-26068578)
chr6 (162-309)||(6843262-6843410)
chr6 (272-347)||(24501449-24501524)
chr6 (149-280)||(12161622-12161750)
chr6 (163-243)||(19701962-19702041)
chr6 (163-351)||(26643179-26643360)
chr6 (163-351)||(26749145-26749326)
chr6 (213-348)||(3833460-3833584)
chr6 (163-240)||(17036058-17036134)
chr6 (162-350)||(17904346-17904531)
chr6 (263-350)||(10584227-10584313)
chr6 (276-346)||(17065963-17066033)
chr6 (160-223)||(3577635-3577696)
chr6 (119-174)||(30443387-30443443)
chr6 (120-174)||(30445606-30445661)
chr6 (293-347)||(5757518-5757571)
chr6 (292-349)||(4641080-4641137)
chr6 (160-243)||(7293935-7294019)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (120-365)||(31578258-31578501)
chr8 (145-365)||(31035255-31035474)
chr8 (145-363)||(31162347-31162564)
chr8 (160-365)||(6376141-6376343)
chr8 (125-351)||(3005626-3005848)
chr8 (120-277)||(31573794-31573949)
chr8 (145-362)||(13858469-13858681)
chr8 (145-365)||(21480640-21480856)
chr8 (120-363)||(3895932-3896175)
chr8 (145-350)||(17847661-17847858)
chr8 (145-351)||(14419186-14419388)
chr8 (120-365)||(21482424-21482664)
chr8 (120-351)||(15956071-15956297)
chr8 (145-351)||(25952658-25952860)
chr8 (145-351)||(30480499-30480700)
chr8 (144-365)||(33838902-33839121)
chr8 (145-351)||(32339447-32339648)
chr8 (145-351)||(36865676-36865876)
chr8 (145-351)||(3874148-3874349)
chr8 (145-351)||(22684649-22684853)
chr8 (160-351)||(30423212-30423401)
chr8 (145-351)||(15809356-15809557)
chr8 (211-365)||(16833752-16833903)
chr8 (145-351)||(27911152-27911352)
chr8 (145-351)||(27957571-27957771)
chr8 (145-351)||(41384882-41385083)
chr8 (145-350)||(27106894-27107094)
chr8 (160-349)||(28327908-28328091)
chr8 (148-351)||(15068122-15068320)
chr8 (145-351)||(608872-609073)
chr8 (145-351)||(4424156-4424357)
chr8 (144-362)||(13985069-13985279)
chr8 (145-350)||(15072848-15073049)
chr8 (163-351)||(23179557-23179740)
chr8 (145-351)||(28251563-28251764)
chr8 (160-349)||(16757266-16757449)
chr8 (145-309)||(14807889-14808049)
chr8 (145-351)||(28283217-28283416)
chr8 (145-350)||(43079740-43079940)
chr8 (145-350)||(43082111-43082311)
chr8 (160-351)||(9021103-9021289)
chr8 (160-351)||(17799420-17799606)
chr8 (160-349)||(28332631-28332814)
chr8 (145-351)||(1225304-1225506)
chr8 (250-365)||(2468111-2468225)
chr8 (163-349)||(25684646-25684826)
chr8 (145-351)||(27829435-27829635)
chr8 (145-351)||(43530253-43530454)
chr8 (145-350)||(44720981-44721181)
chr8 (160-365)||(4812470-4812669)
chr8 (160-349)||(16752522-16752704)
chr8 (148-322)||(5372200-5372372)
chr8 (160-349)||(28895502-28895686)
chr8 (163-351)||(590797-590980)
chr8 (145-351)||(27827124-27827324)
chr8 (165-351)||(41382820-41383001)
chr8 (272-365)||(31566539-31566630)
chr8 (145-222)||(14477414-14477491)
chr8 (145-222)||(33541508-33541585)
chr8 (160-351)||(21033870-21034055)
chr8 (160-362)||(15949534-15949735)
chr8 (145-351)||(18810846-18811046)
chr8 (212-350)||(33020897-33021034)
chr8 (163-344)||(33032657-33032833)
chr8 (276-349)||(28890876-28890949)
chr8 (160-243)||(2267123-2267205)
chr8 (144-350)||(11700952-11701156)
chr8 (145-351)||(18813020-18813220)
chr8 (250-351)||(15185710-15185810)
chr8 (145-350)||(24873178-24873378)
chr8 (163-322)||(29554810-29554964)
chr8 (144-350)||(13985814-13986012)
chr8 (145-280)||(181637-181771)
chr8 (163-243)||(3276347-3276426)
chr8 (250-322)||(33541434-33541505)
chr8 (160-247)||(28228514-28228601)
chr8 (120-179)||(31035179-31035238)
chr8 (145-187)||(2468261-2468303)
chr8 (250-309)||(35872477-35872535)
chr8 (293-347)||(9765859-9765912)
chr8 (253-307)||(14419732-14419786)
chr8 (293-347)||(26403270-26403323)
chr8 (213-273)||(29013247-29013306)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (145-365)||(40699431-40699649)
chr2 (120-365)||(20146589-20146831)
chr2 (137-365)||(17897227-17897451)
chr2 (145-365)||(11578089-11578306)
chr2 (145-365)||(22874188-22874405)
chr2 (120-349)||(43139407-43139632)
chr2 (120-350)||(35028607-35028832)
chr2 (120-351)||(18800309-18800535)
chr2 (135-349)||(35107341-35107553)
chr2 (183-361)||(13828327-13828503)
chr2 (145-297)||(15693959-15694111)
chr2 (145-351)||(40032049-40032255)
chr2 (145-351)||(5375342-5375542)
chr2 (145-351)||(6258813-6259012)
chr2 (163-351)||(17943540-17943721)
chr2 (145-351)||(11739555-11739757)
chr2 (145-351)||(42452839-42453039)
chr2 (145-351)||(6264144-6264346)
chr2 (144-350)||(17921753-17921955)
chr2 (145-351)||(19007698-19007899)
chr2 (145-351)||(19502007-19502208)
chr2 (145-351)||(42923505-42923706)
chr2 (145-351)||(43623576-43623777)
chr2 (145-351)||(44289063-44289265)
chr2 (120-363)||(27136114-27136348)
chr2 (160-365)||(33603994-33604196)
chr2 (145-322)||(45239001-45239174)
chr2 (145-351)||(28196695-28196894)
chr2 (160-287)||(20589763-20589888)
chr2 (145-351)||(45279980-45280181)
chr2 (160-349)||(2736205-2736388)
chr2 (160-365)||(39680045-39680244)
chr2 (160-349)||(39686983-39687166)
chr2 (145-351)||(14837331-14837527)
chr2 (160-349)||(17462436-17462619)
chr2 (145-351)||(34979573-34979776)
chr2 (145-351)||(19504342-19504542)
chr2 (145-351)||(21520689-21520890)
chr2 (145-351)||(23452233-23452434)
chr2 (145-351)||(27104856-27105056)
chr2 (163-351)||(27517635-27517818)
chr2 (145-322)||(17849175-17849348)
chr2 (145-349)||(35217961-35218160)
chr2 (145-351)||(22287332-22287533)
chr2 (145-351)||(42064573-42064774)
chr2 (160-349)||(2740941-2741124)
chr2 (160-351)||(20054761-20054947)
chr2 (145-363)||(31732761-31732962)
chr2 (145-349)||(35215584-35215783)
chr2 (166-305)||(41303074-41303210)
chr2 (159-351)||(10942506-10942696)
chr2 (159-351)||(10948375-10948565)
chr2 (147-351)||(28459186-28459385)
chr2 (145-351)||(13910041-13910241)
chr2 (163-351)||(30478997-30479180)
chr2 (159-352)||(36558859-36559047)
chr2 (159-352)||(36561136-36561324)
chr2 (163-350)||(12781218-12781400)
chr2 (145-351)||(17848502-17848699)
chr2 (144-305)||(30720652-30720812)
chr2 (145-222)||(15539595-15539672)
chr2 (145-222)||(38414201-38414277)
chr2 (145-351)||(3022221-3022431)
chr2 (145-240)||(26345662-26345758)
chr2 (160-347)||(28458828-28459011)
chr2 (145-363)||(37962925-37963136)
chr2 (204-351)||(22407450-22407592)
chr2 (160-351)||(20050017-20050204)
chr2 (260-347)||(39287262-39287349)
chr2 (211-349)||(45679773-45679906)
chr2 (144-350)||(27247898-27248103)
chr2 (144-239)||(34575213-34575309)
chr2 (160-240)||(22712619-22712698)
chr2 (160-240)||(22717328-22717407)
chr2 (159-349)||(45332179-45332364)
chr2 (256-351)||(22163018-22163111)
chr2 (146-204)||(27583477-27583535)
chr2 (280-350)||(34575133-34575203)
chr2 (163-322)||(37170778-37170931)
chr2 (300-365)||(8173539-8173604)
chr2 (276-349)||(33670965-33671038)
chr2 (144-226)||(7502974-7503058)
chr2 (163-243)||(17932637-17932716)
chr2 (301-365)||(20592288-20592352)
chr2 (279-351)||(38191126-38191198)
chr2 (160-240)||(45567409-45567488)
chr2 (250-341)||(7462953-7463043)
chr2 (250-351)||(22707747-22707848)
chr2 (290-350)||(15697231-15697291)
chr2 (213-299)||(41304495-41304577)
chr2 (160-243)||(38190997-38191079)
chr2 (145-187)||(24162367-24162409)
chr2 (204-290)||(30261830-30261910)
chr2 (293-347)||(13569332-13569385)
chr2 (217-291)||(28568453-28568525)
chr2 (277-347)||(34682358-34682427)
chr2 (145-187)||(38020260-38020302)
chr2 (253-322)||(23870979-23871047)
chr2 (277-337)||(42039693-42039752)
[»] chr1 (118 HSPs)
chr1 (134-365)||(26613222-26613451)
chr1 (120-350)||(27916551-27916780)
chr1 (145-365)||(16561548-16561766)
chr1 (126-365)||(13125440-13125677)
chr1 (125-350)||(28279326-28279551)
chr1 (134-365)||(30738610-30738841)
chr1 (125-365)||(42922292-42922529)
chr1 (120-350)||(15669391-15669618)
chr1 (137-330)||(155780-155969)
chr1 (120-350)||(14183589-14183816)
chr1 (120-365)||(8349034-8349276)
chr1 (145-365)||(8347255-8347472)
chr1 (145-351)||(17324634-17324835)
chr1 (145-351)||(18839669-18839871)
chr1 (145-351)||(39462601-39462802)
chr1 (145-351)||(50076670-50076871)
chr1 (145-365)||(41647002-41647218)
chr1 (145-351)||(10399826-10400027)
chr1 (145-351)||(16428735-16428937)
chr1 (145-351)||(50078818-50079020)
chr1 (145-350)||(6115101-6115302)
chr1 (145-365)||(30790384-30790600)
chr1 (145-351)||(9241083-9241285)
chr1 (145-351)||(15823628-15823829)
chr1 (145-351)||(17186125-17186327)
chr1 (145-351)||(25127954-25128156)
chr1 (145-351)||(50307544-50307745)
chr1 (145-351)||(13215163-13215369)
chr1 (148-351)||(16429042-16429241)
chr1 (145-351)||(12302503-12302704)
chr1 (145-351)||(15294832-15295033)
chr1 (145-351)||(25248549-25248751)
chr1 (145-351)||(51750121-51750322)
chr1 (145-322)||(2617598-2617771)
chr1 (149-305)||(43104245-43104400)
chr1 (145-351)||(38925479-38925677)
chr1 (120-351)||(17318948-17319170)
chr1 (145-363)||(18800557-18800772)
chr1 (145-351)||(25251272-25251474)
chr1 (145-351)||(40134026-40134228)
chr1 (145-351)||(6756610-6756811)
chr1 (163-350)||(46783146-46783331)
chr1 (253-365)||(13127670-13127782)
chr1 (163-351)||(21353344-21353525)
chr1 (163-351)||(2401217-2401400)
chr1 (145-351)||(6823096-6823297)
chr1 (145-351)||(18307191-18307392)
chr1 (145-351)||(28840762-28840962)
chr1 (145-351)||(31735519-31735720)
chr1 (145-351)||(47906352-47906553)
chr1 (160-351)||(4144679-4144865)
chr1 (145-322)||(31489995-31490167)
chr1 (145-322)||(4131401-4131578)
chr1 (145-351)||(2510323-2510523)
chr1 (160-363)||(14997040-14997240)
chr1 (145-351)||(39932155-39932357)
chr1 (145-350)||(9459416-9459616)
chr1 (145-350)||(9463243-9463443)
chr1 (145-351)||(11457473-11457674)
chr1 (250-365)||(15916574-15916689)
chr1 (145-287)||(31422933-31423072)
chr1 (145-351)||(14097967-14098169)
chr1 (145-351)||(31425013-31425217)
chr1 (145-351)||(2949230-2949430)
chr1 (144-335)||(14353046-14353233)
chr1 (145-351)||(24325745-24325946)
chr1 (145-351)||(27336938-27337138)
chr1 (145-351)||(28998251-28998452)
chr1 (145-351)||(29003967-29004168)
chr1 (145-349)||(16226249-16226448)
chr1 (163-349)||(9526469-9526650)
chr1 (120-365)||(26520103-26520344)
chr1 (120-351)||(49495208-49495434)
chr1 (145-351)||(6995698-6995899)
chr1 (145-351)||(46431704-46431906)
chr1 (145-349)||(47179795-47179993)
chr1 (145-294)||(50248626-50248771)
chr1 (145-365)||(17324145-17324360)
chr1 (159-350)||(23785935-23786121)
chr1 (145-339)||(16231645-16231834)
chr1 (145-351)||(16432476-16432679)
chr1 (163-351)||(2393279-2393461)
chr1 (145-351)||(13761919-13762119)
chr1 (145-351)||(28842577-28842777)
chr1 (160-351)||(13785260-13785455)
chr1 (145-309)||(21948227-21948386)
chr1 (145-351)||(3579615-3579815)
chr1 (145-278)||(26332553-26332688)
chr1 (145-351)||(20291539-20291739)
chr1 (163-351)||(25134074-25134257)
chr1 (145-351)||(27339129-27339329)
chr1 (145-351)||(51752447-51752646)
chr1 (148-351)||(28207066-28207262)
chr1 (145-349)||(47177444-47177642)
chr1 (160-349)||(2232597-2232774)
chr1 (163-349)||(9521718-9521899)
chr1 (145-291)||(48665259-48665402)
chr1 (169-351)||(3091101-3091279)
chr1 (145-351)||(20302541-20302741)
chr1 (155-351)||(51757623-51757813)
chr1 (144-291)||(8213582-8213728)
chr1 (261-351)||(11693312-11693397)
chr1 (159-350)||(10115880-10116059)
chr1 (159-249)||(37990772-37990863)
chr1 (144-249)||(49959128-49959234)
chr1 (250-351)||(23816070-23816169)
chr1 (120-207)||(26332699-26332786)
chr1 (281-351)||(13358787-13358856)
chr1 (323-365)||(43104443-43104485)
chr1 (145-187)||(6823967-6824009)
chr1 (293-347)||(19072932-19072985)
chr1 (293-347)||(19120822-19120875)
chr1 (277-347)||(21536593-21536662)
chr1 (293-347)||(26644937-26644990)
chr1 (277-347)||(37069774-37069843)
chr1 (293-347)||(47703976-47704029)
chr1 (293-341)||(3281718-3281765)
chr1 (261-321)||(32261337-32261397)
[»] chr5 (108 HSPs)
chr5 (134-365)||(15143536-15143765)
chr5 (120-336)||(17413176-17413390)
chr5 (145-350)||(40221604-40221805)
chr5 (134-338)||(2144570-2144774)
chr5 (163-350)||(4897828-4898013)
chr5 (120-363)||(6661168-6661408)
chr5 (160-365)||(15445248-15445453)
chr5 (145-351)||(36208657-36208859)
chr5 (120-289)||(4754210-4754377)
chr5 (120-351)||(9020275-9020503)
chr5 (145-350)||(695960-696160)
chr5 (144-351)||(35430258-35430465)
chr5 (145-351)||(1189603-1189806)
chr5 (120-350)||(34033563-34033793)
chr5 (145-351)||(34479414-34479616)
chr5 (145-351)||(34477049-34477251)
chr5 (145-351)||(18511208-18511409)
chr5 (145-351)||(25921469-25921670)
chr5 (145-351)||(27912618-27912819)
chr5 (145-351)||(31472608-31472810)
chr5 (120-351)||(20053900-20054120)
chr5 (144-351)||(24126937-24127139)
chr5 (145-351)||(20505839-20506038)
chr5 (145-351)||(6745150-6745351)
chr5 (145-351)||(16092195-16092397)
chr5 (145-351)||(17072965-17073167)
chr5 (145-351)||(18596727-18596929)
chr5 (145-351)||(10529095-10529296)
chr5 (145-351)||(18466766-18466967)
chr5 (145-351)||(25804107-25804307)
chr5 (120-365)||(15224744-15224993)
chr5 (145-351)||(4410105-4410305)
chr5 (145-351)||(6747387-6747587)
chr5 (145-351)||(21948108-21948309)
chr5 (168-362)||(26406451-26406647)
chr5 (145-351)||(27910532-27910733)
chr5 (145-348)||(6756576-6756772)
chr5 (145-351)||(18509314-18509515)
chr5 (145-351)||(17818488-17818687)
chr5 (120-350)||(29748403-29748633)
chr5 (160-349)||(35385450-35385634)
chr5 (163-351)||(11962429-11962612)
chr5 (163-351)||(22672837-22673020)
chr5 (145-351)||(38882188-38882388)
chr5 (145-351)||(39854565-39854766)
chr5 (145-351)||(41585740-41585941)
chr5 (160-349)||(1170811-1170994)
chr5 (163-350)||(17841246-17841428)
chr5 (160-351)||(10627364-10627552)
chr5 (145-351)||(2175001-2175201)
chr5 (145-351)||(2954499-2954699)
chr5 (145-339)||(4236711-4236900)
chr5 (163-351)||(25452498-25452681)
chr5 (145-351)||(39798129-39798330)
chr5 (165-351)||(25445501-25445682)
chr5 (145-351)||(26097815-26098014)
chr5 (159-361)||(10749796-10749993)
chr5 (145-351)||(16776240-16776440)
chr5 (145-351)||(18469093-18469292)
chr5 (145-350)||(15552327-15552527)
chr5 (145-350)||(31179368-31179568)
chr5 (145-350)||(31545162-31545362)
chr5 (145-295)||(34530716-34530863)
chr5 (145-351)||(36402324-36402525)
chr5 (145-351)||(658352-658550)
chr5 (160-349)||(2297999-2298183)
chr5 (145-351)||(10586914-10587115)
chr5 (145-351)||(37705776-37705977)
chr5 (145-351)||(2818331-2818532)
chr5 (145-351)||(10474319-10474520)
chr5 (159-352)||(15354570-15354757)
chr5 (159-352)||(23665140-23665327)
chr5 (159-352)||(23793260-23793447)
chr5 (163-351)||(28786407-28786590)
chr5 (211-351)||(42238310-42238446)
chr5 (159-361)||(10757273-10757469)
chr5 (145-221)||(20043132-20043208)
chr5 (159-352)||(15356846-15357033)
chr5 (145-351)||(21684448-21684648)
chr5 (145-350)||(31542817-31543016)
chr5 (146-351)||(2723985-2724176)
chr5 (145-350)||(25904185-25904385)
chr5 (145-322)||(39398017-39398190)
chr5 (159-350)||(38960129-38960314)
chr5 (145-280)||(31466044-31466175)
chr5 (160-243)||(31782557-31782639)
chr5 (160-351)||(1240428-1240614)
chr5 (160-348)||(13295835-13296018)
chr5 (145-222)||(20045092-20045169)
chr5 (160-351)||(16093288-16093473)
chr5 (159-350)||(3373134-3373320)
chr5 (258-351)||(21288953-21289044)
chr5 (145-221)||(12556045-12556120)
chr5 (193-352)||(23741854-23742006)
chr5 (166-350)||(40222769-40222950)
chr5 (148-221)||(42770853-42770924)
chr5 (187-280)||(42770934-42771024)
chr5 (160-243)||(25562391-25562473)
chr5 (159-249)||(32520533-32520624)
chr5 (145-220)||(21288852-21288926)
chr5 (299-351)||(20043222-20043273)
chr5 (293-347)||(9353372-9353425)
chr5 (277-347)||(11916996-11917065)
chr5 (254-351)||(26098284-26098380)
chr5 (301-347)||(31300644-31300689)
chr5 (293-347)||(36932390-36932443)
chr5 (294-347)||(17004001-17004053)
chr5 (145-202)||(26098391-26098448)
[»] chr4 (133 HSPs)
chr4 (128-365)||(28453801-28454035)
chr4 (120-365)||(47150874-47151117)
chr4 (120-365)||(9863817-9864064)
chr4 (120-361)||(10112978-10113218)
chr4 (160-365)||(16185816-16186018)
chr4 (120-365)||(18537455-18537697)
chr4 (120-365)||(38890206-38890448)
chr4 (145-365)||(12102222-12102440)
chr4 (145-361)||(31983513-31983726)
chr4 (120-351)||(19322804-19323032)
chr4 (120-347)||(3982175-3982407)
chr4 (134-350)||(25357761-25357979)
chr4 (145-351)||(36380485-36380687)
chr4 (120-365)||(18534813-18535055)
chr4 (120-309)||(9022413-9022602)
chr4 (120-365)||(8756232-8756475)
chr4 (145-364)||(16455377-16455591)
chr4 (125-305)||(40998990-40999168)
chr4 (145-351)||(14633455-14633655)
chr4 (145-351)||(22800858-22801059)
chr4 (145-365)||(24879125-24879342)
chr4 (149-365)||(24880591-24880804)
chr4 (145-351)||(40637210-40637411)
chr4 (145-361)||(15032532-15032746)
chr4 (145-350)||(36378428-36378629)
chr4 (120-365)||(10114438-10114669)
chr4 (145-351)||(17662241-17662442)
chr4 (145-351)||(33415484-33415685)
chr4 (145-351)||(36919580-36919781)
chr4 (160-351)||(5336776-5336964)
chr4 (145-356)||(18409338-18409544)
chr4 (160-350)||(26557738-26557922)
chr4 (145-351)||(8631415-8631616)
chr4 (145-351)||(9148389-9148589)
chr4 (145-351)||(24888932-24889133)
chr4 (145-351)||(36921489-36921690)
chr4 (145-351)||(40091411-40091612)
chr4 (145-322)||(16453445-16453619)
chr4 (145-350)||(41997628-41997828)
chr4 (151-351)||(2891433-2891629)
chr4 (145-348)||(12395844-12396042)
chr4 (145-351)||(19096019-19096220)
chr4 (163-351)||(15316961-15317143)
chr4 (145-351)||(22046682-22046882)
chr4 (145-351)||(24348354-24348555)
chr4 (145-351)||(38928173-38928374)
chr4 (145-322)||(37313089-37313263)
chr4 (145-350)||(48486455-48486655)
chr4 (145-351)||(22802730-22802931)
chr4 (144-309)||(54906721-54906886)
chr4 (225-356)||(3578662-3578789)
chr4 (145-348)||(12400806-12401004)
chr4 (120-322)||(13544069-13544268)
chr4 (145-351)||(6764980-6765181)
chr4 (145-351)||(7941459-7941660)
chr4 (144-351)||(14787425-14787629)
chr4 (145-351)||(37089368-37089568)
chr4 (145-351)||(47274862-47275062)
chr4 (157-322)||(13547302-13547463)
chr4 (160-351)||(36769479-36769665)
chr4 (120-351)||(30136660-30136887)
chr4 (163-351)||(8529270-8529453)
chr4 (160-349)||(16638827-16639011)
chr4 (163-351)||(16688936-16689119)
chr4 (145-351)||(22044387-22044587)
chr4 (145-351)||(38409341-38409541)
chr4 (145-351)||(47868537-47868738)
chr4 (160-349)||(11853549-11853732)
chr4 (145-350)||(18709161-18709360)
chr4 (146-365)||(22295294-22295517)
chr4 (145-349)||(22780371-22780570)
chr4 (163-351)||(4556056-4556238)
chr4 (163-351)||(4884877-4885060)
chr4 (144-340)||(5516243-5516445)
chr4 (145-350)||(9174143-9174343)
chr4 (145-350)||(16931786-16931986)
chr4 (145-350)||(16934140-16934340)
chr4 (145-351)||(26085973-26086173)
chr4 (145-351)||(51015382-51015582)
chr4 (160-351)||(4570094-4570279)
chr4 (160-335)||(7050269-7050439)
chr4 (163-350)||(16489352-16489533)
chr4 (163-350)||(31300427-31300608)
chr4 (145-349)||(44599836-44600035)
chr4 (160-349)||(55822265-55822447)
chr4 (145-351)||(31849595-31849795)
chr4 (145-352)||(2484868-2485069)
chr4 (163-351)||(4558314-4558496)
chr4 (145-351)||(5198556-5198757)
chr4 (145-322)||(9176498-9176671)
chr4 (145-351)||(11435091-11435291)
chr4 (163-351)||(18586969-18587152)
chr4 (145-349)||(22782736-22782935)
chr4 (160-351)||(36771396-36771582)
chr4 (163-349)||(15831144-15831325)
chr4 (192-351)||(4215489-4215643)
chr4 (145-351)||(11006233-11006434)
chr4 (145-351)||(18847289-18847489)
chr4 (120-350)||(38208669-38208907)
chr4 (163-351)||(15312319-15312502)
chr4 (145-350)||(22132389-22132588)
chr4 (145-280)||(5637530-5637662)
chr4 (192-365)||(54928636-54928800)
chr4 (145-289)||(3824627-3824767)
chr4 (145-222)||(6133008-6133085)
chr4 (145-222)||(56030580-56030657)
chr4 (163-242)||(25699752-25699830)
chr4 (159-305)||(29609511-29609654)
chr4 (145-350)||(619445-619644)
chr4 (145-223)||(3937328-3937406)
chr4 (145-351)||(11008564-11008763)
chr4 (145-350)||(22134615-22134813)
chr4 (250-351)||(5635472-5635571)
chr4 (155-318)||(47210780-47210939)
chr4 (160-351)||(4874475-4874661)
chr4 (163-351)||(47566496-47566678)
chr4 (145-351)||(53405265-53405470)
chr4 (166-249)||(3760105-3760189)
chr4 (163-243)||(13072081-13072160)
chr4 (145-351)||(27499181-27499379)
chr4 (276-351)||(25613952-25614027)
chr4 (144-187)||(52942601-52942644)
chr4 (261-351)||(11437611-11437699)
chr4 (250-351)||(5101167-5101265)
chr4 (193-349)||(16631214-16631367)
chr4 (200-269)||(32274014-32274081)
chr4 (205-249)||(2880972-2881016)
chr4 (250-309)||(24446678-24446736)
chr4 (260-351)||(47563009-47563098)
chr4 (258-364)||(49088816-49088921)
chr4 (293-346)||(36315269-36315321)
chr4 (293-346)||(36329478-36329530)
chr4 (283-347)||(36681763-36681827)
[»] chr7 (115 HSPs)
chr7 (138-365)||(16297002-16297229)
chr7 (120-365)||(11081573-11081818)
chr7 (120-365)||(6332286-6332529)
chr7 (120-365)||(13290455-13290698)
chr7 (145-365)||(24813479-24813696)
chr7 (145-361)||(24817338-24817551)
chr7 (145-351)||(31435042-31435244)
chr7 (169-351)||(6067194-6067373)
chr7 (145-351)||(11355350-11355551)
chr7 (145-351)||(20137105-20137306)
chr7 (120-365)||(6048936-6049181)
chr7 (134-365)||(40281364-40281586)
chr7 (145-351)||(13099470-13099673)
chr7 (145-351)||(4295930-4296131)
chr7 (145-351)||(20626130-20626331)
chr7 (145-351)||(20630021-20630222)
chr7 (145-351)||(20642440-20642641)
chr7 (145-351)||(27832633-27832830)
chr7 (145-351)||(44724671-44724872)
chr7 (120-363)||(7188606-7188846)
chr7 (204-350)||(6046644-6046787)
chr7 (145-351)||(21990242-21990443)
chr7 (145-322)||(24258555-24258732)
chr7 (145-291)||(25276233-25276376)
chr7 (129-350)||(26210615-26210836)
chr7 (145-351)||(38394078-38394279)
chr7 (145-322)||(9680912-9681085)
chr7 (145-351)||(42330993-42331196)
chr7 (120-309)||(20091584-20091767)
chr7 (148-351)||(48457748-48457946)
chr7 (145-351)||(7470018-7470219)
chr7 (145-351)||(20299552-20299753)
chr7 (145-351)||(24748686-24748888)
chr7 (160-351)||(25351353-25351537)
chr7 (145-351)||(43253513-43253714)
chr7 (160-351)||(25410130-25410316)
chr7 (120-351)||(9679125-9679352)
chr7 (145-365)||(27306213-27306427)
chr7 (145-351)||(443687-443889)
chr7 (145-320)||(21680119-21680290)
chr7 (145-339)||(37412133-37412324)
chr7 (145-351)||(44656-44857)
chr7 (145-351)||(3878669-3878870)
chr7 (145-351)||(7092209-7092409)
chr7 (145-351)||(20297454-20297655)
chr7 (145-351)||(21592139-21592340)
chr7 (145-351)||(28487645-28487846)
chr7 (145-351)||(40836739-40836939)
chr7 (145-350)||(35721-35921)
chr7 (160-365)||(3320033-3320232)
chr7 (160-365)||(3324781-3324980)
chr7 (120-356)||(24465605-24465835)
chr7 (145-351)||(2120882-2121085)
chr7 (145-351)||(1850073-1850274)
chr7 (145-351)||(7471976-7472177)
chr7 (145-351)||(18345633-18345834)
chr7 (160-351)||(25357047-25357231)
chr7 (160-349)||(25405393-25405576)
chr7 (145-351)||(7094456-7094657)
chr7 (159-352)||(22108173-22108360)
chr7 (160-306)||(22828672-22828815)
chr7 (159-352)||(40549933-40550120)
chr7 (163-351)||(44512522-44512704)
chr7 (160-349)||(7069780-7069963)
chr7 (145-351)||(39145982-39146184)
chr7 (145-351)||(3035813-3036017)
chr7 (145-351)||(1046921-1047121)
chr7 (145-351)||(1049292-1049492)
chr7 (145-350)||(7351649-7351849)
chr7 (159-352)||(22137184-22137371)
chr7 (145-350)||(31155908-31156108)
chr7 (159-352)||(40552211-40552398)
chr7 (145-351)||(40946420-40946621)
chr7 (145-351)||(42223250-42223451)
chr7 (160-349)||(7074787-7074970)
chr7 (163-350)||(30246973-30247155)
chr7 (160-351)||(42006663-42006849)
chr7 (159-350)||(2935374-2935560)
chr7 (120-225)||(11084442-11084547)
chr7 (145-365)||(21678158-21678372)
chr7 (145-323)||(7349296-7349470)
chr7 (160-349)||(8378502-8378686)
chr7 (145-351)||(25542622-25542821)
chr7 (145-351)||(28485658-28485858)
chr7 (145-351)||(38396727-38396927)
chr7 (160-349)||(15540994-15541177)
chr7 (159-350)||(9027191-9027376)
chr7 (145-289)||(11757322-11757462)
chr7 (192-351)||(26295586-26295741)
chr7 (276-351)||(34546876-34546951)
chr7 (163-351)||(44143863-44144045)
chr7 (160-348)||(2990627-2990813)
chr7 (160-347)||(21369642-21369824)
chr7 (159-350)||(1606486-1606671)
chr7 (250-351)||(22393916-22394016)
chr7 (276-351)||(2075226-2075301)
chr7 (276-351)||(7464515-7464590)
chr7 (276-350)||(44010747-44010821)
chr7 (145-222)||(26804664-26804741)
chr7 (120-200)||(22392529-22392608)
chr7 (125-238)||(12310119-12310234)
chr7 (169-289)||(22251602-22251723)
chr7 (275-351)||(44016657-44016733)
chr7 (183-291)||(6348912-6349017)
chr7 (250-326)||(22280359-22280434)
chr7 (306-365)||(20091138-20091196)
chr7 (276-350)||(6349021-6349093)
chr7 (293-347)||(9190048-9190101)
chr7 (293-347)||(28617265-28617318)
chr7 (160-242)||(8260584-8260667)
chr7 (293-347)||(2580394-2580447)
chr7 (293-347)||(21983288-21983341)
chr7 (249-351)||(45366673-45366774)
chr7 (211-244)||(7392850-7392883)
chr7 (299-351)||(11759369-11759420)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (125-365)||(1623-1860)
[»] chr3 (153 HSPs)
chr3 (144-365)||(36871280-36871498)
chr3 (125-344)||(13420186-13420400)
chr3 (120-365)||(561754-561997)
chr3 (134-364)||(1620441-1620668)
chr3 (136-350)||(14634435-14634647)
chr3 (120-364)||(53597273-53597514)
chr3 (120-365)||(31151382-31151623)
chr3 (120-363)||(25635418-25635657)
chr3 (145-351)||(28761421-28761624)
chr3 (145-351)||(53917658-53917859)
chr3 (145-351)||(1313471-1313672)
chr3 (145-351)||(43423457-43423658)
chr3 (145-351)||(36011889-36012090)
chr3 (120-365)||(17795296-17795537)
chr3 (120-365)||(19103736-19103977)
chr3 (120-351)||(23633493-23633716)
chr3 (145-351)||(45883001-45883203)
chr3 (145-351)||(3314746-3314948)
chr3 (145-351)||(4308275-4308476)
chr3 (120-365)||(27420686-27420929)
chr3 (144-351)||(11170465-11170667)
chr3 (120-316)||(13419916-13420110)
chr3 (145-351)||(1321541-1321742)
chr3 (145-363)||(5926746-5926959)
chr3 (145-351)||(6484422-6484623)
chr3 (145-351)||(9604601-9604802)
chr3 (145-351)||(10956021-10956222)
chr3 (145-351)||(27101175-27101376)
chr3 (145-351)||(38890102-38890303)
chr3 (145-351)||(53915490-53915691)
chr3 (144-350)||(18162724-18162925)
chr3 (145-365)||(43226147-43226361)
chr3 (145-351)||(10958317-10958518)
chr3 (145-351)||(18099164-18099365)
chr3 (145-351)||(43228353-43228554)
chr3 (145-351)||(51727001-51727202)
chr3 (137-365)||(7768624-7768849)
chr3 (163-351)||(29913951-29914132)
chr3 (145-350)||(746819-747019)
chr3 (144-364)||(11066651-11066867)
chr3 (145-351)||(18096894-18097095)
chr3 (145-351)||(25533504-25533705)
chr3 (145-351)||(42990366-42990567)
chr3 (145-351)||(43421409-43421610)
chr3 (163-351)||(47878167-47878350)
chr3 (144-351)||(53468447-53468652)
chr3 (145-351)||(4666576-4666777)
chr3 (145-350)||(10084384-10084584)
chr3 (145-321)||(32264060-32264234)
chr3 (120-365)||(1674009-1674242)
chr3 (163-365)||(10612761-10612957)
chr3 (145-303)||(6561872-6562028)
chr3 (160-351)||(16996875-16997063)
chr3 (145-351)||(1626677-1626878)
chr3 (145-351)||(48361665-48361866)
chr3 (160-349)||(10094073-10094256)
chr3 (145-350)||(10191305-10191504)
chr3 (145-351)||(15780933-15781142)
chr3 (145-341)||(25688164-25688356)
chr3 (160-349)||(27544273-27544456)
chr3 (145-349)||(38210432-38210631)
chr3 (145-309)||(28102037-28102197)
chr3 (168-351)||(13893470-13893649)
chr3 (186-365)||(24181483-24181659)
chr3 (145-351)||(4103890-4104090)
chr3 (145-351)||(5191715-5191914)
chr3 (145-351)||(5522621-5522821)
chr3 (145-351)||(6231863-6232063)
chr3 (163-351)||(10595030-10595213)
chr3 (145-350)||(10621525-10621725)
chr3 (163-351)||(10897008-10897191)
chr3 (145-351)||(30005903-30006104)
chr3 (204-350)||(46966645-46966787)
chr3 (160-349)||(10100090-10100273)
chr3 (160-349)||(10200953-10201136)
chr3 (160-349)||(10207999-10208182)
chr3 (145-349)||(50494061-50494260)
chr3 (145-365)||(51943433-51943648)
chr3 (147-351)||(11168165-11168364)
chr3 (163-349)||(54193229-54193410)
chr3 (145-351)||(24979769-24979971)
chr3 (145-280)||(39715531-39715663)
chr3 (145-351)||(880445-880646)
chr3 (145-339)||(889779-889967)
chr3 (145-351)||(3859590-3859790)
chr3 (168-351)||(4535622-4535801)
chr3 (160-351)||(5858546-5858729)
chr3 (145-350)||(6063441-6063641)
chr3 (145-351)||(7606582-7606782)
chr3 (145-350)||(25388968-25389167)
chr3 (163-351)||(27761982-27762165)
chr3 (145-351)||(51674760-51674961)
chr3 (145-349)||(458346-458545)
chr3 (160-351)||(38002869-38003055)
chr3 (145-322)||(47148917-47149089)
chr3 (172-327)||(11007540-11007683)
chr3 (145-365)||(26763021-26763244)
chr3 (123-351)||(32219122-32219348)
chr3 (163-349)||(54188512-54188692)
chr3 (160-349)||(22625982-22626166)
chr3 (145-308)||(29956748-29956907)
chr3 (145-316)||(35917971-35918138)
chr3 (145-351)||(5886262-5886461)
chr3 (145-351)||(5899735-5899934)
chr3 (213-351)||(15823643-15823778)
chr3 (145-350)||(28413027-28413227)
chr3 (145-291)||(54884217-54884359)
chr3 (145-349)||(455969-456168)
chr3 (145-351)||(12267969-12268159)
chr3 (160-351)||(47882878-47883064)
chr3 (145-350)||(6065791-6065991)
chr3 (160-351)||(11079517-11079704)
chr3 (228-364)||(25634031-25634164)
chr3 (160-349)||(6303310-6303493)
chr3 (164-351)||(10949256-10949438)
chr3 (208-351)||(48390298-48390437)
chr3 (160-362)||(7418064-7418259)
chr3 (163-351)||(20031313-20031497)
chr3 (145-280)||(22114368-22114500)
chr3 (217-365)||(31021142-31021286)
chr3 (145-351)||(26720610-26720810)
chr3 (145-222)||(35777483-35777561)
chr3 (250-351)||(27635652-27635751)
chr3 (160-240)||(16462203-16462282)
chr3 (163-351)||(3329896-3330078)
chr3 (144-222)||(28137424-28137502)
chr3 (145-322)||(53591246-53591418)
chr3 (212-306)||(42297699-42297793)
chr3 (145-322)||(54691596-54691769)
chr3 (161-351)||(3306839-3307023)
chr3 (145-222)||(28100159-28100236)
chr3 (145-222)||(28181084-28181161)
chr3 (125-201)||(31021284-31021361)
chr3 (270-351)||(41849243-41849322)
chr3 (250-351)||(47701665-47701764)
chr3 (120-192)||(24177313-24177385)
chr3 (183-350)||(23941862-23942027)
chr3 (192-298)||(53973725-53973830)
chr3 (120-222)||(23637060-23637162)
chr3 (120-190)||(25633957-25634027)
chr3 (181-337)||(27703178-27703331)
chr3 (281-351)||(35919109-35919178)
chr3 (145-222)||(4560402-4560479)
chr3 (250-350)||(42992434-42992532)
chr3 (145-187)||(42992348-42992390)
chr3 (297-352)||(53894050-53894104)
chr3 (293-347)||(8370516-8370569)
chr3 (293-347)||(21711227-21711280)
chr3 (293-347)||(27974982-27975035)
chr3 (293-347)||(27986476-27986529)
chr3 (134-178)||(1618824-1618868)
chr3 (311-351)||(16462336-16462376)
chr3 (211-275)||(21334820-21334883)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (125-365)||(15802-16039)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (120-365)||(16631-16873)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (160-365)||(57409-57613)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (145-351)||(183637-183837)
scaffold0005 (144-351)||(52101-52305)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (125-344)||(4881-5098)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (145-365)||(14365-14579)
scaffold0131 (145-365)||(15110-15324)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (145-351)||(69288-69488)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (145-350)||(79276-79476)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (163-349)||(16328-16509)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (145-351)||(4087-4287)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (153-351)||(11469-11662)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (145-351)||(1449-1649)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (145-351)||(41479-41680)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (145-350)||(6290-6490)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (145-350)||(132-332)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (159-352)||(22221-22408)
scaffold0140 (159-352)||(24496-24683)
scaffold0140 (293-347)||(8459-8512)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (145-351)||(79951-80151)
scaffold0004 (160-243)||(188342-188424)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (163-351)||(16982-17165)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (145-322)||(85321-85495)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (145-351)||(29262-29462)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (261-349)||(3068-3157)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (145-222)||(2132-2209)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (160-308)||(224819-224961)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (148-222)||(35733-35807)
scaffold0011 (280-350)||(35816-35885)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (145-222)||(2971-3048)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (200-279)||(10747-10822)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (292-349)||(6978-7035)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (213-347)||(5083-5214)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 19696531 - 19696774
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  19696531 ttggcaacaatcactagggttcaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaatt 19696630  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  19696631 aggtttgaagacttattcttgtaatccttt--gatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactagg 19696728  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19696729 tcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 19696774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22858177 - 22857934
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22858177 ttggtaacaaacactagggttgagattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagattt 22858078  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  22858077 aggtttgaagactaattcttgtaa-cccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagg 22857980  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22857979 tcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctct 22857934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12186270 - 12186068
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  12186270 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa- 12186172  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12186171 -ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtca--atttgaaccgaactgggtaa 12186075  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  12186074 acaaatt 12186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3028076 - 3027833
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3028076 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaatt 3027977  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactag 318  Q
    ||| | || || | ||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  3027976 aggctgga-gatttatttttgtaacccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccagactag 3027880  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3027879 gtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctct 3027833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 307
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtt 20527001  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctc 307  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20527002 tgaagactaattcttgtaa--ccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25078780 - 25078539
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||    
T  25078780 ttggcaacaaacattagggttgaaattgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaatt 25078682  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||| ||| || ||| |||||    
T  25078681 aggtttgaagacttattcttgtaaccc--tttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcc-cagtctagg 25078585  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25078584 tcagtattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 25078539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 365
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262792
Alignment:
Q  168 ttaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatc-ctttttgatatctcttttgta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctcttt-gta 11262693  T
Q  267 aagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||  ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11262694 aagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 11262792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16455648 - 16455410
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  16455648 ttggcaacgaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaatt 16455549  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   || || | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  16455548 aggcggga-gatttattcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactagg 16455452  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttct 361  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16455451 tcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttct 16455410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 26945260 - 26945478
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  26945260 ttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaa- 26945358  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||||| ||| |||| || |||||  || ||||||||||||||||    
T  26945359 -ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  26945458 caaatttcgtgtcttctctct 26945478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 15719735 - 15719976
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15719735 ttggcaacaaacactagggttgag-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaatt 15719833  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactag 318  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||    
T  15719834 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactag 15719930  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||| | || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15719931 gtcaat-ttggaccgaacttggtaaacaaatttcatgtgttctctct 15719976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Original strand, 17012132 - 17012358
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17012132 ttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaatt 17012231  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   || |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||    
T  17012232 aggcggga-gacttattcttgtaa--ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccagactagg 17012327  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17012328 tcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 17012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 13039871 - 13040073
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  13039871 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattagg-cggaagacttattcttgtaac 13039969  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  13039970 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 13040066  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  13040067 caaattc 13040073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911431
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||   |||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccattta--atatctc 12911532  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgtt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  12911531 ttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgtt 12911433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937179
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||| |||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaa--ccatttaatatctc 12937279  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgtt 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  12937278 -tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgtt 12937181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  146 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatc 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  246 ctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga---acagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||  |  ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  28037827 c--tttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggta 28037730  T
Q  343 aacaaatt 350  Q
    ||||||||    
T  28037729 aacaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 32280113 - 32280330
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  32280113 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 32280211  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  32280212 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 32280308  T
Q  345 caaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
     |||||| | ||||||||||||    
T  32280309 aaaattctcttgtgttctctct 32280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 339
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445832
Alignment:
Q  203 agacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgct 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgct 30445795  T
Q  303 ctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  30445796 ctctccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 9020043 - 9020244
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  9020043 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 9020141  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  9020142 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 9020237  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  9020238 caaattc 9020244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 13057311 - 13057513
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  13057311 ttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 13057409  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  13057410 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactcggtcaa 13057506  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  13057507 caaattc 13057513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15532878 - 15532678
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  15532878 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaac 15532780  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||    
T  15532779 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctatccct-agactaggtcaat-tttgactgaactaggtcaa 15532685  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  15532684 caaattc 15532678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 30967318 - 30967519
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| ||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  30967318 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 30967416  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  30967417 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 30967512  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  30967513 caaattc 30967519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069714
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||     
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc- 1069816  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| || || ||||||||| | || ||||||||||  | |||||    
T  1069815 -attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgaatcaacaa 1069718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3390496 - 3390698
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3390496 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3390594  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||| || ||||| ||    
T  3390595 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccaaattgggtcaa 3390691  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3390692 caaattc 3390698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11983226 - 11983025
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  11983226 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 11983128  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  11983127 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 11983032  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  11983031 caaattc 11983025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3632135 - 3631935
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3632135 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 3632037  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||  |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3632036 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtcc--cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3631942  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3631941 caaattc 3631935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1230446 - 1230245
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1230446 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1230348  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1230347 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1230252  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1230251 caaattc 1230245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14458956 - 14458763
Alignment:
Q  153 ccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   |||    
T  14458956 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attg 14458860  T
Q  253 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  14458859 atttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 14458763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 284
Target Start/End: Original strand, 11138417 - 11138562
Alignment:
Q  139 ttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattc 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  11138417 ttgagattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaattatgtttgaagactaatta 11138516  T
Q  238 ttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 284  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11138517 ttgtaacctcttttgatatctc-tttgtaaagttactcgtcattata 11138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28078323 - 28078178
Alignment:
Q  215 gaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcaga 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||| |    
T  28078323 gaattaggtttgaagacttattcttgtaacc---tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcata 28078227  T
Q  315 ctaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28078226 ctaggtcaattttagaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctct 28078178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25477391 - 25477600
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25477391 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 25477489  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaa-------agttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaact 337  Q
    ||   ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||| |    
T  25477490 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaaat 25477586  T
Q  338 gggtaaacaaattc 351  Q
    |||| |||||||||    
T  25477587 gggtcaacaaattc 25477600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3630061 - 3629861
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3630061 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaac 3629963  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3629962 cc--attgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctccc-catactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3629868  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3629867 caaattc 3629861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4816428 - 4816227
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4816428 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 4816330  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4816329 cc--attgatttctcttttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 4816234  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4816233 caaattc 4816227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15541337 - 15541136
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||   | ||||  ||||||||||     
T  15541337 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattagg-cgggagacgtattcttgtaac 15541239  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| | | || ||| ||||||||| ||    
T  15541238 cc--attgatatctcttttgtaaagttattcatca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaat-ttggactgaactgggtcaa 15541143  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  15541142 caaattc 15541136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883658
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||     |||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcatt-----atctc 13883568  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13883569 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7542583 - 7542381
Alignment:
Q  143 aattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagaga-ttgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7542583 aattgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgt 7542484  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactc-atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| ||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  7542483 aaccc--tttgatatctc-tttgtaaagttactcaaaaattacagtgaaacggaaagctgct-tcctcctcagagtaggtcagtatttgaccaaactagg 7542388  T
Q  341 taaacaa 347  Q
    |||||||    
T  7542387 taaacaa 7542381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 15367124 - 15367364
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15367124 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaatt 15367222  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctc-cctcagactag 318  Q
    |  |  | ||||| |||||||||| || ||   |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  15367223 aa-tcgggagacttattcttgtaacccatta--atatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactag 15367318  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15367319 gtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 15367364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28241518 - 28241317
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  28241518 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 28241420  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||| ||    
T  28241419 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaat-ttggaccgaactgggtcaa 28241324  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28241323 caaattc 28241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3233927 - 3233739
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  3233927 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaa- 3233830  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactg 338  Q
     ||  |||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  3233829 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaat-tttgaccgaactg 3233739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 13878820  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13878821 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 16786012  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16786013 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694848
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 17694937  T
Q  263 tgtaaagttactc-atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17694936 -gtaaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 17694848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15530319 - 15530166
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  15530319 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattagg-cgggagacttattcttgtaac 15530221  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctc 303  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15530220 c---attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19704766 - 19704564
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  19704766 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 19704668  T
Q  244 tcctttttgatatctct-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
     ||   ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||     
T  19704667 ccc--attgatttctctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 19704572  T
Q  343 aacaaatt 350  Q
    ||||||||    
T  19704571 aacaaatt 19704564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25465687 - 25465572
Alignment:
Q  249 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25465687 tttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 25465589  T
Q  349 ttccgtgtgttctctct 365  Q
    ||  |||||||||||||    
T  25465588 ttttgtgtgttctctct 25465572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2629082 - 2628882
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||  | | ||||||||||     
T  2629082 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggagaatttattcttgtaac 2628984  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||| ||    
T  2628983 cc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaa 2628889  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2628888 caaattc 2628882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14507372 - 14507172
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  14507372 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaac 14507274  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | |||| |||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  14507273 cc--attgatttctc-tttgtaacgatacttatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 14507179  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  14507178 caaattc 14507172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342797
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 22342887  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22342886 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 22342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24338644 - 24338446
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |  | |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||     
T  24338644 ttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattag-tcagaagacttattcttgtaac 24338546  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||||||| |||| | || ||||||||| ||||||    
T  24338545 ccatt--gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaat-ttggaccgaactaggtaaa 24338451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201309
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 35201415  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
    ||| | ||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||    
T  35201414 ttt-gaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 35201316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 365
Target Start/End: Original strand, 15346544 - 15346679
Alignment:
Q  226 gaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagta 325  Q
    ||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| |     
T  15346544 gaagacttattcttgtaacccatt--gatatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaat- 15346639  T
Q  326 tttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346640 ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 15346679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5273413 - 5273213
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  5273413 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 5273315  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  5273314 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 5273220  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  5273219 acaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166142
Alignment:
Q  167 attaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgta 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |      |||||||||| |||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattca-----atatctcttt-gta 12166229  T
Q  267 aagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||  ||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12166228 aagaaactcatatcattatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 12166142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351849
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||      |  ||||||| ||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaa-----ctcaatatctc-tt 22351939  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  22351938 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattaga-cgaactgggtaaacaaattc 22351849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26932759 - 26932559
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  26932759 ttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 26932661  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  26932660 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 26932566  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  26932565 acaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754704
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| || ||  ||| ||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccatt--gatttc 29754796  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29754795 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 29754704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30034800 - 30034599
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  30034800 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 30034702  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| ||    
T  30034701 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 30034606  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  30034605 caaattc 30034599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467463
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||   |    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatct---t 13467553  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13467552 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccc-cagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattc 13467463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20915553 - 20915342
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  20915553 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 20915455  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  20915454 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 20915360  T
Q  344 acaaattccgtgtgttct 361  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  20915359 acaaattctctgtgttct 20915342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30729025 - 30728820
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  || | |||| ||||||||||||   || |||| ||| ||||||     
T  30729025 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaa- 30728928  T
Q  245 cctttttgatatct----cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
     ||  |||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||    
T  30728927 -ctcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccaaactggg 30728831  T
Q  341 taaacaaattc 351  Q
    | |||||||||    
T  30728830 tcaacaaattc 30728820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887225
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 26887313  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  26887312 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 26887225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216013
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  || |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggacttg-gatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 33215923  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33215924 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 33216013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 26065100 - 26065298
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  26065100 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 26065198  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||  |||| ||||||| ||||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  26065199 cc--attgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 26065292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 26085069 - 26085267
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  26085069 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 26085167  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||  |||| ||||||| ||||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  26085168 cc--attgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 26085261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309173
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||| ||||||||| || ||  ||| ||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacta-ttcttgtaacccatt--gatttc 33309083  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33309084 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 33309173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12195712 - 12195515
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||  |  | ||||| ||||||||||    
T  12195712 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta-atcgggagacttattcttgtaa 12195614  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  12195613 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 12195519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3577621 - 3577486
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3577621 ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcc 3577528  T
Q  309 ctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3577527 c-cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 3577486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165818
Alignment:
Q  168 ttaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||   |  ||||||| |||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc---tgaatatctc-tttgtaa 5165895  T
Q  268 agttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  5165894 agaaactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggta 5165818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Original strand, 14466439 - 14466657
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| || |||  |||||||||||   | ||||  ||||||||||    
T  14466439 attgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattaggcgag-agacatattcttgtaa 14466537  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||   ||||| | |||| || ||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  14466538 --ctcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 14466634  T
Q  344 acaaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
     ||||||| | ||||||||||||    
T  14466635 gcaaattctcttgtgttctctct 14466657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25466075 - 25465896
Alignment:
Q  166 tattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgt 265  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| | |||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||||| ||    
T  25466075 tattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt-gt 25465983  T
Q  266 aaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25465982 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 25941780 - 25941855
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941780 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25941855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 350
Target Start/End: Original strand, 7294035 - 7294113
Alignment:
Q  272 actcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7294035 actcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaatt 7294113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19227605 - 19227528
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19227605 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 19227528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Original strand, 22490763 - 22490896
Alignment:
Q  151 caccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttt 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||| |   | ||||| |||||||||| ||   |    
T  22490763 caccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgag-agacttattcttgtaaccc--at 22490859  T
Q  251 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22490860 tgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311442
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||| ||||||||| || ||  ||| ||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacta-ttcttgtaacccatt--gatttc 33311352  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33311353 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 33311442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22870198 - 22870100
Alignment:
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22870198 ttttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaa 22870102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443606
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 30443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248713
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 31248803  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||  | |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  31248802 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtcatcattataccgaacttggtaaacaaat 31248713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 17038345 - 17038418
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17038345 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17038418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066121
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 26066211  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |||||| ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  26066210 tc-tttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 26066121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068392
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 26068482  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| ||| |||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  26068481 tc-tttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 26068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 309
Target Start/End: Original strand, 6843262 - 6843410
Alignment:
Q  162 acactattaggattgagtttcttggtcactg---gaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||  ||||| |      
T  6843262 acaccattaggattgagtctcttggtcacagcaggaagagattcgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaaccc--tttgaaa-- 6843357  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6843358 tcctttgtaaagttactcataaattatagtggaacagagagttactctctccc 6843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24501524 - 24501449
Alignment:
Q  272 actcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24501524 actcatcattatagtggaatagagagctgctctcttcccctgaataggtcagtattataccgaactgggtaaacaa 24501449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12161750 - 12161622
Alignment:
Q  149 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctt 248  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| | | | ||| | |||||||||| ||      
T  12161750 ttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaag-tgggagatttattcttgtaaccc-- 12161654  T
Q  249 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12161653 attgatatctcttttgtaaggttactcatcat 12161622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701962
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaa 19701962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643360
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |  ||||||| ||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggacttg-ggtagaattaggttggaagactaattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 26643271  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26643272 tgtaaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattc 26643360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749326
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |  ||||||| ||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggacttg-ggtagaattaggttggaagactaattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 26749237  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26749238 tgtaaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattc 26749326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 348
Target Start/End: Original strand, 3833460 - 3833584
Alignment:
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagtt-actcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc 311  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |          ||| |    
T  3833460 tagaattatgtttgaaaattgattcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacggaaa----------cccac 3833547  T
Q  312 agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaa 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3833548 agactaggttagtatttgaccgaactgagtaaacaaa 3833584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036134
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaatccttg 17036134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17904531 - 17904346
Alignment:
Q  162 acactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttgg-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctct 260  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||   |    |||    
T  17904531 acactattaggactgaatctcttggtcatgggaagagatttaggattttggctagaattaggtttaaacactgattcttgtaaccctttggaa----tct 17904436  T
Q  261 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| || | ||| || || | |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  17904435 tttgtaaagttactcaaaattatagtggaatggagagttgttatcttccccatagtaggtcagcataggacagaactaggtaaacaaatt 17904346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 350
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584313
Alignment:
Q  263 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaacaaatt 10584313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 346
Target Start/End: Original strand, 17065963 - 17066033
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 346  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  17065963 atcattatagtggaacggatagctgctctctcccccaaagtaggtcatcattagaccgaactggataaaca 17066033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577635
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggt 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac--ttggtagaattaggt 3577635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 30443387 - 30443443
Alignment:
Q  119 gttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttg-ggaaacactattaggat 174  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30443387 gttggcaacaaacactagggttgatattgattcaccttgaagaaacactattaggat 30443443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 174
Target Start/End: Original strand, 30445606 - 30445661
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggat 174  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445606 ttggcaacaaacactacggttgagattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 5757518 - 5757571
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5757518 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 349
Target Start/End: Original strand, 4641080 - 4641137
Alignment:
Q  292 agagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4641080 agagagctgctctctcctctagagtaggtcattattggaccgaactggataaacaaat 4641137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Original strand, 7293935 - 7294019
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattga-gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |||||||| | |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7293935 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgtaaagagattcaagacttagggtggaattaattttgaagactaattcttgtaa 7294019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31578501 - 31578258
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31578501 ttggtaacaaacactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaatt 31578402  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  31578401 aggtttgaagactaattcttgtaa--ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactagg 31578304  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  31578303 tcagtataggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgctctctct 31578258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 31035255 - 31035474
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31035255 ttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 31035354  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagac--taggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31035355 cc--tttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  343 aacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  31035452 aacaaatttcgtgtgttctctct 31035474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Original strand, 31162347 - 31162564
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  31162347 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattagg-tggaagacttattcttgtaa- 31162444  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct--ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31162445 -ctcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggta 31162543  T
Q  343 aacaaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  31162544 aacaaatttcgtgtgttctct 31162564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376343
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttacc--ttttgatatctc 6376238  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgtt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  6376239 ttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgtt 6376337  T
Q  360 ctctct 365  Q
    ||||||    
T  6376338 ctctct 6376343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3005848 - 3005626
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  3005848 aacaaacaatagggttgga-ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg 3005750  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
     || |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3005749 gga-gacttattcttgtaatccatt--gatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagt 3005653  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  3005652 tttggaccgaactgggtaaacaaattc 3005626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31573949 - 31573794
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31573949 ttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 31573850  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573849 aggtttgaagactaattcttgtaat--tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13858681 - 13858469
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||| |   || |||| ||||||| |      
T  13858681 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcggga-gacttattcttgcagc 13858583  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  13858582 ccatt---atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggacagaactgggtaaa 13858487  T
Q  345 caaattccgtgtgttctc 362  Q
    |||||||  |||||||||    
T  13858486 caaattctttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 21480640 - 21480856
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||     
T  21480640 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggt-gacttattcttgtaac 21480738  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  21480739 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaacgaactgggtaaa 21480835  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
     ||| | ||||||||||||||    
T  21480836 aaaaattcgtgtgttctctct 21480856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Original strand, 3895932 - 3896175
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||  ||| |||    
T  3895932 ttggcaacaaacaatagggttgggattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataat 3896031  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||| || | |||    
T  3896032 taggtttgaaaattaattcttgtaactcttat-gatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtag 3896130  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
     |||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  3896131 atcagtattggatcgaattgagtaaacaaatttcgtgtgttctct 3896175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847858
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    | |   ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  17847761 acc---tttgatatctcttttgtaaa-------atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaa 17847850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14419388 - 14419186
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  14419388 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 14419290  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  14419289 ccatta--atatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 14419193  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  14419192 caaattc 14419186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 21482424 - 21482664
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  21482424 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaatt 21482522  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   |  |||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21482523 aggcgagt-gacttattcttgtaacccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactagg 21482619  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21482620 tcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 21482664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 15956071 - 15956297
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15956071 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaatt 15956169  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||| ||||    
T  15956170 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctctccctcagattagg 15956266  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| | || ||| ||||||||| |||||||||    
T  15956267 tcaat-ttggactgaactgggtcaacaaattc 15956297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25952658 - 25952860
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  25952658 ttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggca-gaagacttattcttgtaa- 25952755  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||| ||| ||    
T  25952756 -ctcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactaggtcaa 25952853  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25952854 caaattc 25952860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30480700 - 30480499
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  30480700 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 30480602  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  30480601 cc--attgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 30480506  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  30480505 caaattc 30480499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33839121 - 33838902
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattga-gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839121 attgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 33839024  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || |||||   |    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||| || | || ||||||||| ||||||| ||||    
T  33839023 aaccctttggaa----tcttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattggg 33838928  T
Q  341 taaacaaa-ttccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  33838927 taaacaaattttcgtgtgttctctct 33838902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 32339447 - 32339648
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  32339447 ttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 32339545  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  32339546 cc--attgatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggttaa 32339641  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  32339642 caaattc 32339648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 36865676 - 36865876
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  36865676 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt---cacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 36865771  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  36865772 ccatta--atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaa 36865868  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  36865869 acaaattc 36865876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3874148 - 3874349
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3874148 ttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3874246  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3874247 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3874342  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3874343 caaattc 3874349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22684853 - 22684649
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22684853 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22684755  T
Q  245 cc-tttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||| |    
T  22684754 ccaatattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 22684657  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  22684656 acaaattc 22684649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423401
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||   || |  |||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa---ttctcaatatctc 30423308  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30423309 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctccagagtaggtcatcattagaccgaacagggtaaacaaattc 30423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 15809356 - 15809557
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  15809356 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 15809454  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  15809455 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 15809550  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  15809551 caaattc 15809557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Original strand, 16833752 - 16833903
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||     
T  16833752 ggtagaattaggtttgaagacttactcttgtaatcattt--gatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctccca 16833849  T
Q  311 cagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16833850 cagactaagtcact-tttggacgaactgggtaaacaaaattcgtgtgttctctct 16833903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27911152 - 27911352
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  27911152 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagagttattcttgtaa- 27911249  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  27911250 -ctcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctccc-cagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27911345  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  27911346 aaaattc 27911352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27957571 - 27957771
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  27957571 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagagttattcttgtaa- 27957668  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  27957669 -ctcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctccc-cagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27957764  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  27957765 aaaattc 27957771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 41384882 - 41385083
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   |||| |||||||||||||  || || |  |||||||||     
T  41384882 ttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtggga-gaatttttcttgtaa- 41384979  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  41384980 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 41385076  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  41385077 caaattc 41385083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27107094 - 27106894
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27107094 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27106996  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||  |||||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  27106995 cc--atagatatctcttttgtagggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaa 27106900  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  27106899 caaatt 27106894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328091
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 28328001  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28328002 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Original strand, 15068122 - 15068320
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||     
T  15068122 attcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc- 15068219  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||  |||||    
T  15068220 -attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggccaacaa 15068316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 608872 - 609073
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  608872 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 608970  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  608971 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 609066  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  609067 caaattc 609073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 4424156 - 4424357
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   |||| | ||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  4424156 ttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 4424254  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4424255 ccatt--gatttatcttttgtaacattactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 4424350  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4424351 caaattc 4424357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13985279 - 13985069
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13985279 attgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaa-actgattcttgt 13985181  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    || ||  ||||  |||||  || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  13985180 aaccc--tttggaatctc--ttataaagttacccctcattatagtggaacagagagttgctct---ccccagagtaggtcagta---gaccgaactgggt 13985091  T
Q  342 aaacaaa-ttccgtgtgttctc 362  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  13985090 aaacaaattttcgtgtgttctc 13985069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 15072848 - 15073049
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagaga-ttgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||| |||||| ||||||||||||   || || | ||||||||||    
T  15072848 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcggga-gatttattcttgtaa 15072946  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     || ||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  15072947 cccatt--gatatctcttttgtaacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtca 15073042  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  15073043 acaaatt 15073049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179557
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgacttt-ggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 23179647  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23179646 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 23179557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28251764 - 28251563
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| |||| |||||||   || |||| |||||| |||     
T  28251764 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcggga-gacttattcttataac 28251666  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28251665 ccatt--gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 28251570  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28251569 caaattc 28251563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757266
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 16757356  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16757355 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 309
Target Start/End: Original strand, 14807889 - 14808049
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14807889 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 14807987  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14807988 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 14808049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28283416 - 28283217
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||| ||     
T  28283416 ttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-tggtagacttattcttgcaac 28283318  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28283317 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 28283224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 43079740 - 43079940
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  43079740 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 43079838  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  43079839 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43079933  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  43079934 acaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 43082111 - 43082311
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  43082111 ttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaa 43082209  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  43082210 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43082304  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  43082305 acaaatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021103
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 9021196  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9021195 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 9021103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799420
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||| |||  |      |||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttgag-tataattaggtttgaagactgattcttataactca-----atatctc 17799513  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17799512 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 17799420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332814
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 28332724  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28332725 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 1225304 - 1225506
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  1225304 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaa- 1225401  T
Q  245 cctttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  || ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  1225402 -ctcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 1225498  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  1225499 acaaattc 1225506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2468225 - 2468111
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||||||    
T  2468225 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagattaggtcaat-ttggacagaactaggtaaacaaat 2468127  T
Q  350 tccgtgtgttctctct 365  Q
    | ||||||||||||||    
T  2468126 ttcgtgtgttctctct 2468111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684826
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     ||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctcttt 25684739  T
Q  263 tgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25684740 -gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27829435 - 27829635
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27829435 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27829533  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  27829534 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27829628  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27829629 caaattc 27829635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 43530253 - 43530454
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||| |||||     
T  43530253 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcctgtaac 43530351  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  43530352 cc--attgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 43530447  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  43530448 caaattc 43530454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 44720981 - 44721181
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  44720981 ttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 44721079  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  44721080 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 44721174  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  44721175 acaaatt 44721181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812470
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 4812576  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
    ||| ||||||  | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  | |||||    
T  4812575 ttt-gtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 4812477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752522
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 16752611  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16752610 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5372372 - 5372200
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||  ||| |||||||   | ||||| ||||||||||  ||    
T  5372372 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattagg-cggcagacttattcttgtaa--ct 5372276  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtca 322  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||| ||| ||||||||||||    
T  5372275 cattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtca 5372200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895686
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||     |  |  |||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt-----tactcaatatctc 28895595  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28895596 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590980
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     ||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctcttt 590890  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  590891 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactgggtaaataaattc 590980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27827124 - 27827324
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27827124 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27827222  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  27827223 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27827317  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27827318 caaattc 27827324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 351
Target Start/End: Original strand, 41382820 - 41383001
Alignment:
Q  165 ctattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttg 264  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  41382820 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaa--ctcattgacatctcttttg 41382916  T
Q  265 taaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||    
T  41382917 taacgttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattc 41383001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31566630 - 31566539
Alignment:
Q  272 actcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31566630 actcatcattataatggaacagagagctgctctccccc--atactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctct 31566539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 14477414 - 14477491
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14477414 ttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 14477491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33541585 - 33541508
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541585 ttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 33541508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034055
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |      |||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagggctgg-gacttg-ggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca-----atatctc 21033962  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| | || || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21033963 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 21034055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 362
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949735
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggacttg-ggtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaat--tctctgatatct 15949630  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtg 357  Q
    ||||   ||||  || |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| | |||| | ||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  15949631 ctttgtaaaagaaacccatcgttatattggaacagagagctactatctccccctagagtaggttaatattggcccgaagtggataaacaaattctttgtg 15949730  T
Q  358 ttctc 362  Q
    |||||    
T  15949731 ttctc 15949735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18810846 - 18811046
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18810846 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18810944  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  18810945 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca--atttgaaccgaactgggtca 18811038  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  18811039 acaaattc 18811046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33021034 - 33020897
Alignment:
Q  212 gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctctt-ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||     
T  33021034 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc--tttgatattttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaacgaaaagctgctctctccca 33020937  T
Q  311 cagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||    
T  33020936 cagagtaggtcagtattggacagaattggattaacaaatt 33020897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 344
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032833
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 33032749  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  33032750 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaa 33032833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 28890876 - 28890949
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28890876 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267123
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 2267123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11701156 - 11700952
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11701156 attgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga--------ctttaggtgaaattagatttgaagactaattcttgta 11701065  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagc--------tgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccga 334  Q
    | |||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||        ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  11701064 acccttttggaa---tcttttgtaaagttactcatagttatagtggaacggagagctgtagagttgctctctcccgcatagtagttcagtatttgaccga 11700968  T
Q  335 actgggtaaacaaatt 350  Q
    | ||  ||||||||||    
T  11700967 attgaataaacaaatt 11700952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18813020 - 18813220
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18813020 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18813118  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| || | ||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  18813119 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 18813213  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18813214 caaattc 18813220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15185810 - 15185710
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  15185810 ttgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 15185712  T
Q  350 tc 351  Q
    ||    
T  15185711 tc 15185710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24873378 - 24873178
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  24873378 ttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 24873280  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      |   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| || || |    
T  24873279 --ccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaattgagtca 24873185  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  24873184 acaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca-----atatctcttt 29554871  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29554870 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13986012 - 13985814
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13986012 attgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattagttttgaa-actgattcttgt 13985914  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || |||||   |    |||||||      || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| || |    
T  13985913 aaccctttggaa----tcttttg------tattcatcattataatggaacggagagcttctctctccccacagagtaagtcagtattggaccgaattgag 13985824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Original strand, 181637 - 181771
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacacta-ttaggattgagtttcttggt--cactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  | | |||||||| || |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  181637 ttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgt 181735  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    || ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  181736 aaccc--attgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276426
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 3276426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33541505 - 33541434
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33541505 ttgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtca 33541434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Original strand, 28228514 - 28228601
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||  |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28228514 aaacactattaggatagagactcttggtcacgagaagagattctggactttggtagaattaagtttgaaggctaattcttgtaatcct 28228601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 31035179 - 31035238
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 179  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035179 ttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2468303 - 2468261
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2468303 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35872535 - 35872477
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35872535 ttgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 9765859 - 9765912
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  9765859 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  253 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctc 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 26403270 - 26403323
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  26403270 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 29013247 - 29013306
Alignment:
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttac 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| || |||||||||||    
T  29013247 tagaattaggtttgaaaactaattcttgtaatatattttgaaatct-ttgtgtaaagttac 29013306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 40699431 - 40699649
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40699431 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaat 40699530  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40699531 ccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  40699629 caaatttcgtgtgttctctct 40699649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20146831 - 20146589
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  20146831 ttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaatt 20146732  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   || |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20146731 aggcggga-gacttattcttgtaa--ctctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaag 20146635  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20146634 tcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctct 20146589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 137 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17897451 - 17897227
Alignment:
Q  137 ggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaatt 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||  |||||||||||   | ||||| |||    
T  17897451 ggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattagg-cgggagacttatt 17897353  T
Q  237 cttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaac 336  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17897352 cttgtaaccc--tttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctccc-cagactaggtcagtattggtccgaac 17897256  T
Q  337 tgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17897255 tgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 17897227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11578306 - 11578089
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  11578306 ttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 11578209  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  11578208 -ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaa 11578110  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  11578109 caaatttcgtgtgttttctct 11578089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 22874188 - 22874405
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||     
T  22874188 ttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattagg-tgggagacttatttttgtaac 22874286  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  22874287 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaat-ttggaccgaattgggtaaa 22874383  T
Q  345 caaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  22874384 caaattctcttgtgttctctct 22874405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 349
Target Start/End: Original strand, 43139407 - 43139632
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43139407 ttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaatt 43139506  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||| | |||||||||| ||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||  | ||||||    
T  43139507 aggtctaaagactaattattgtaa--ccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggtacagaggactgttcttttccctatactagg 43139603  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43139604 tcagtattagaccgaact-ggtaaacaaat 43139632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Original strand, 35028607 - 35028832
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35028607 ttggtaacaaacactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatt 35028706  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  35028707 atgtttgaatactaattcttgtaa--ccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctctcccccttactagg 35028804  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||   | |||||||| ||||||||||    
T  35028805 tcagtat---atcgaactggctaaacaaatt 35028832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18800535 - 18800309
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  18800535 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaatt 18800437  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||    
T  18800436 agg-agggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctccc-cagaccagg 18800341  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  18800340 tcagttttggaccaaactgggtaaacaaattc 18800309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 349
Target Start/End: Original strand, 35107341 - 35107553
Alignment:
Q  135 agggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattag-gtttgaagacta 233  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||     
T  35107341 agggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagactt 35107440  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg 333  Q
    |||||||||| |   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  35107441 attcttgtaacc---tttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccg 35107537  T
Q  334 aactgggtaaacaaat 349  Q
    || | |||||||||||    
T  35107538 aaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828327
Alignment:
Q  183 ttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 282  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagcccttt--gatatctcttttgtaaaattactcataatta 13828406  T
Q  283 tagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttct 361  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13828405 tagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttct 13828327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Original strand, 15693959 - 15694111
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693959 ttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 15694058  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagag 297  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15694059 acc--ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaacggagag 15694111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40032255 - 40032049
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||     
T  40032255 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtga-gacttattcttgtaac 40032157  T
Q  245 cctttttgatatct----cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || ||  |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  40032156 ccatt--gatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 40032060  T
Q  341 taaacaaattc 351  Q
    | |||||||||    
T  40032059 tcaacaaattc 40032049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5375542 - 5375342
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5375542 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg--cggagacttattcttgtaac 5375445  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5375444 cc--attgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5375349  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  5375348 caaattc 5375342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6259012 - 6258813
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| | |||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||     
T  6259012 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtggga-gacttattcttgtaac 6258916  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6258915 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctccc-catactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6258820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943721
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |      ||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca-----atatctcttt 17943633  T
Q  263 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17943634 -gtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc 17943721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11739757 - 11739555
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || || | ||||||| |||    
T  11739757 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gaattattcttggaat 11739659  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  11739658 ccatt--gatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 11739562  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  11739561 caaattc 11739555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 42452839 - 42453039
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  42452839 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 42452937  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  42452938 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 42453032  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  42453033 caaattc 42453039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6264346 - 6264144
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   || |||||| | |||| | |||||||||    || |||| ||||||||||     
T  6264346 ttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacggga-gacttattcttgtaac 6264248  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6264247 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6264151  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6264150 caaattc 6264144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Original strand, 17921753 - 17921955
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  17921753 attgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgc 17921852  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    || |||||  |||   |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  17921853 aacccttt--gat---tctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacc-cagactaggtcagtatttgaccgaattaagt 17921946  T
Q  342 aaacaaatt 350  Q
    |||||||||    
T  17921947 aaacaaatt 17921955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 19007698 - 19007899
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  19007698 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 19007796  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  19007797 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 19007892  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  19007893 caaattc 19007899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19502208 - 19502007
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  19502208 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 19502110  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  19502109 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 19502014  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  19502013 caaattc 19502007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42923706 - 42923505
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  42923706 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 42923608  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  42923607 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 42923512  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  42923511 caaattc 42923505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43623777 - 43623576
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  43623777 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 43623679  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  43623678 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 43623583  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  43623582 caaattc 43623576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44289265 - 44289063
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||| | | ||| ||| ||||||||||     
T  44289265 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaag-tggaaaacttattcttgtaac 44289167  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  44289166 cc--gttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 44289070  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  44289069 caaattc 44289063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27136348 - 27136114
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||| ||||||  ||||||||    
T  27136348 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaatt 27136249  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||| | || ||||||||  | |||| |    
T  27136248 aggtttggagacttattcttgtaa--ctcattgatatctcttttgtaaagttactc-------tagtagaacagagggttgttctctccccaaaactaag 27136158  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  27136157 tcagtattggaccgaactgagtaaacaaattttatgtgttctct 27136114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604196
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaa--ccttttgatatatc 33604091  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgtt 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||   ||| || ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33604092 -tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccaagatagatcggtattggaacaaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 33604190  T
Q  360 ctctct 365  Q
     |||||    
T  33604191 atctct 33604196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45239174 - 45239001
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| |   | | ||| ||||||||||     
T  45239174 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaag-cgggatacttattcttgtaac 45239076  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45239075 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 28196695 - 28196894
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||     
T  28196695 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cggaagatttattcttgtaac 28196793  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||| ||    
T  28196794 cc--attgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtc---aattgaccgaactgggtcaa 28196887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589888
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||   ||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaaccc--attgatatctc 20589860  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtg 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20589861 ttttgtgaagttactcatcattatagtg 20589888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45280181 - 45279980
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  45280181 ttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 45280083  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  45280082 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaa 45279987  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  45279986 caaattc 45279980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 2736298  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2736299 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680244
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||  | ||     |||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttg-ggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatt-----atctc 39680138  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  | |||||    
T  39680139 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 39680237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687166
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 39687076  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39687077 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 14837331 - 14837527
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||| ||||||||||     
T  14837331 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggg-gacttattcttgtaa- 14837422  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  14837423 -ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaa 14837520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462619
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-tcctttttgatatct 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||      ||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcctt------atct 17462528  T
Q  259 cttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17462529 cttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34979776 - 34979573
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  34979776 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 34979678  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctct-ctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    || |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| | ||| || ||||||||| | || || |||||||||| |    
T  34979677 ccattt--atatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaat-ttggatcgaactgggtca 34979581  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  34979580 acaaattc 34979573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19504542 - 19504342
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  19504542 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 19504445  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  19504444 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 19504349  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  19504348 caaattc 19504342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21520890 - 21520689
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  21520890 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaac 21520792  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  || ||    
T  21520791 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactttgtcaa 21520696  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  21520695 caaattc 21520689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23452434 - 23452233
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| | |||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  23452434 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 23452336  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  23452335 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 23452240  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  23452239 caaattc 23452233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27104856 - 27105056
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27104856 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27104954  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  27104955 cc--attgatttctc-tttgtaacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27105049  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27105050 caaattc 27105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517635
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 27517725  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27517724 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattc 27517635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 17849175 - 17849348
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  17849175 ttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 17849273  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  17849274 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaac-gggggctgctctctcccacatactaggtca 17849348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35218160 - 35217961
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  35218160 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 35218062  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  35218061 ccc--gttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35217967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22287533 - 22287332
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||  ||||||||| ||   | ||||| ||||||||||     
T  22287533 ttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaatt-gggcgggagacttattcttgtaac 22287435  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22287434 cc--gttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22287339  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  22287338 caaattc 22287332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 42064573 - 42064774
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  42064573 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 42064671  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  42064672 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaa 42064767  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  42064768 caaattc 42064774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741124
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttg-ggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 2741034  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  2741035 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054761
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 20054854  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20054853 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 20054761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31732962 - 31732761
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||            ||| |||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||     
T  31732962 ttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtggga-gacttattcttgtaac 31732876  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  31732875 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtaaa 31732779  T
Q  345 caaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31732778 caaatt-cgtgtgttctct 31732761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35215783 - 35215584
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  35215783 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 35215685  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      ||  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  35215684 --ctcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303074
Alignment:
Q  166 tattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttg 264  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||    |||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaa-ccttttgga---atcttttg 41303115  T
Q  265 taaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41303114 taaagttactcatcattatagtggaacagagagctgttctc 41303074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942506
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||  ||       
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaat--- 10942600  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10942599 -cctttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattc 10942506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948375
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||  ||       
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaat--- 10948469  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10948468 -cctttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattc 10948375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28459385 - 28459186
Alignment:
Q  147 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcc 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  || |||| |||||||||| ||    
T  28459385 gattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtggga-gacttattcttgtaaccc 28459287  T
Q  247 tttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 346  Q
     ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||| | || || |||||| | ||||||    
T  28459286 att--gatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctctacct-agactaggtcaat-ttggatcgaactagataaaca 28459191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13910241 - 13910041
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  13910241 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 13910143  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  13910142 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 13910048  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  13910047 caaattc 13910041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479180
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca-----atatctcttt 30479090  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30479091 -gtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 30479180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558859
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 36558951  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36558950 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 36558859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561136
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 36561228  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36561227 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 36561136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781218
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca-----atatctcttt 12781307  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12781306 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 12781218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 17848502 - 17848699
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||    |   | ||||| ||||||||||     
T  17848502 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa----ggcgggagacttattcttgtaac 17848597  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| || ||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  17848598 c---attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 17848692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30720812 - 30720652
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30720812 attgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 30720713  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttact-catcattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
    || ||  ||||| |  |||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30720712 aaccc--tttgaaa--tcttttgtaaagttactaaaaaattatagtggaccagagagctactctc 30720652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15539672 - 15539595
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15539672 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 15539595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38414277 - 38414201
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38414277 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattagg 38414201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3022221 - 3022431
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3022221 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3022319  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca---------ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaa 335  Q
    ||   || ||||||| ||| |||||||||||||||         ||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  3022320 cc--attaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 3022415  T
Q  336 ctgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||| |||||||||    
T  3022416 ctgggtcaacaaattc 3022431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 240
Target Start/End: Original strand, 26345662 - 26345758
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26345662 ttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttg 26345758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458828
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  | || |||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc--tcggctacctc 28458914  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
     |||||||||  | |    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  28458913 -tttgtaaag-aaatgccaattatagtggaacagagagcttctctctcccctagagtaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaa 28458828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37963136 - 37962925
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    || |||| |||||||||||    
T  37963136 ttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgaga-gacttattcttgtaat 37963038  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| |   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| | || ||||||| | | || ||||||||||||||||    
T  37963037 ccatt--gattt---ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaat-ttggaccgaactgggtaaa 37962944  T
Q  345 caaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  37962943 caaatttcgtgtgttctct 37962925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407450
Alignment:
Q  204 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctc 303  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattagg-ggggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  304 tctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattc 22407450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050017
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  |  |||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggacttg-gatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 20050111  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20050110 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 20050017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287349
Alignment:
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| | |||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtcagtgttggaccaaacttgttaaacaa 39287349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Original strand, 45679773 - 45679906
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45679773 ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctcttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 45679866  T
Q  310 tcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  45679867 ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27248103 - 27247898
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactatta--ggattgagtttcttggtcactggaagagattgag-acttttggtagaattaggtttgaagactaattctt 239  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  27248103 attgattcactttggagaaacattattataggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattaggtttgaa-acagactctt 27248005  T
Q  240 gtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    ||||  || ||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| || || ||| |||    
T  27248004 gtaa--ctctttggaatct--tttgtaaagttacttatcattataatggatcagagagctgctctttcctccagagcaggtcagtaattaactgaaatgg 27247909  T
Q  340 gtaaacaaatt 350  Q
    ||||| |||||    
T  27247908 gtaaataaatt 27247898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34575309 - 34575213
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattctt 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575309 attgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattctt 34575213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712619
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 22712619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717328
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 22717328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||   || |||| ||| |||||| || ||  ||| ||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcggga-gacttattattgtaacccatt--gatttc 45332268  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  45332267 tcttt-gtaaaggtactcatcat-atagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163018
Alignment:
Q  256 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattc 22163018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583477
Alignment:
Q  146 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34575203 - 34575133
Alignment:
Q  280 ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  34575203 ttatagtggaacaaagagctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaatt 34575133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||      |  ||||||| ||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaa-----ctcaatatctc-tt 37170839  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37170838 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccc-cagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173604
Alignment:
Q  300 gctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcactct 8173604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33671038 - 33670965
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  33671038 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaat 33670965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 7502974 - 7503058
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagaga-ttgagacttttggtagaattaggtttg 226  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  7502974 attgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaattatgtttg 7503058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932716
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 17932716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 365
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592352
Alignment:
Q  301 ctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctct 20592352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 351
Target Start/End: Original strand, 38191126 - 38191198
Alignment:
Q  279 attatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38191126 attatagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 38191198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567488
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttg 45567488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7463043 - 7462953
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  7463043 ttgatttctcttttgtaacgttacccattat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgggt 7462953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22707848 - 22707747
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctc-cct-cagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||    
T  22707848 ttgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat-ttggactgaactaggtcaacaa 22707751  T
Q  348 attc 351  Q
    ||||    
T  22707750 attc 22707747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 15697231 - 15697291
Alignment:
Q  290 acagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  15697231 acagagagctgctctctcctctagactaggtcagtattcgaccgaagtgggtatacaaatt 15697291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41304577 - 41304495
Alignment:
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagct 299  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41304577 tagaattatgtttgaagactgattcttgtaa-ccttttgga---atcttttctaaagttactcatcgttatagtggaacggagagct 41304495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191079
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgagtagaattaagtttgaagactgattcttgtaa 38191079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24162409 - 24162367
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24162409 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 24162367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30261910 - 30261830
Alignment:
Q  204 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  30261910 gactttgggtagaattaggtttcaagactaattcttgtaa--ctctttgata----ttttgtaaagaaactcatcattgtagtggaa 30261830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13569385 - 13569332
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  13569385 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Original strand, 28568453 - 28568525
Alignment:
Q  217 attaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||    
T  28568453 attaggattgaagactgattcttgtaaccctttt-gatatctcttt-gtagagatacatatcattatagtggaac 28568525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 34682358 - 34682427
Alignment:
Q  277 tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  34682358 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 38020260 - 38020302
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38020260 ttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 322
Target Start/End: Original strand, 23870979 - 23871047
Alignment:
Q  253 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  23870979 atatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtca 23871047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Original strand, 42039693 - 42039752
Alignment:
Q  277 tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaact 337  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  42039693 tcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtca-tattggaccgaact 42039752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 118)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26613451 - 26613222
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagacta 233  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  26613451 tagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagactt 26613352  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg 333  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26613351 attcttgtaacccttt--gatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccg 26613254  T
Q  334 aactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26613253 aactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 26613222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Original strand, 27916551 - 27916780
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27916551 ttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaatt 27916650  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27916651 aggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactagg 27916749  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27916750 tcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 16561548 - 16561766
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  16561548 ttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaac 16561647  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16561648 ccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaa 16561745  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  16561746 caaatttcgtgtgttctctct 16561766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 126 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13125677 - 13125440
Alignment:
Q  126 acaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggttt 225  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13125677 acaaacactagggttgaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggttt 13125578  T
Q  226 gaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagta 325  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  13125577 gaagacttattcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagta 13125480  T
Q  326 tttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  13125479 taggaccgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctct 13125440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 125 - 350
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279551
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggt 223  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgggattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggt 28279425  T
Q  224 ttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtca 322  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||| | |||||||||||    
T  28279426 ttgaagactaattcttgtaa--ctcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtca 28279523  T
Q  323 gtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  28279524 gtattagatcgaactgggtaaacaaatt 28279551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30738841 - 30738610
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagacta 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||     
T  30738841 tagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagactt 30738742  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatc--attatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgac 331  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| | ||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  30738741 attcttgtaaccc--tttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggac 30738644  T
Q  332 cgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738643 caaacttggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 30738610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 125 - 365
Target Start/End: Original strand, 42922292 - 42922529
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  42922292 aacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 42922391  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
     | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| || | ||||||||||||    
T  42922392 ag-agacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagt 42922488  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
     || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42922489 gttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctct 42922529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15669618 - 15669391
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669618 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 15669519  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||    
T  15669518 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactagg 15669422  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  15669421 tcagttttagactgaactgtgtaaacaaatt 15669391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 330
Target Start/End: Original strand, 155780 - 155969
Alignment:
Q  137 ggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaatt 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  155780 ggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaatt 155879  T
Q  237 cttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttga 330  Q
    |||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  155880 cttgtaa--ccttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc-caaactaggtcaatatttga 155969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14183816 - 14183589
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttgg-tagaat 218  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  14183816 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagatt-agaattttgggtagaat 14183718  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    ||||   ||||||| ||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14183717 tagg-cggaagacttattcttgcaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactag 14183621  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14183620 gtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8349276 - 8349034
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8349276 ttggcaacaaacactagggttggggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaatt 8349177  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   |  |||| ||||||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||  |||||| |    
T  8349176 aggcgggt-gacttattcttgtaa--ctcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatg 8349080  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8349079 tcagttttagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 8349034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8347472 - 8347255
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  8347472 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 8347374  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||  || |||    
T  8347373 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaa 8347276  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  8347275 caaatttcgtgtgttctctct 8347255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17324835 - 17324634
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  17324835 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 17324738  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  17324737 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 17324641  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  17324640 caaattc 17324634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18839669 - 18839871
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18839669 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18839767  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  18839768 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 18839864  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18839865 caaattc 18839871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 39462601 - 39462802
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  39462601 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagaattattcttgtaac 39462699  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  39462700 cc--tttgatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 39462795  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  39462796 caaattc 39462802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50076871 - 50076670
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  50076871 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaa-acttattcttgtaat 50076773  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  50076772 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 50076677  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  50076676 caaattc 50076670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 41647002 - 41647218
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  41647002 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaa- 41647099  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  41647100 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 41647196  T
Q  345 caaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  41647197 caaattctcttgtgttctctct 41647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10400027 - 10399826
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  10400027 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 10399929  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10399928 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10399833  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  10399832 caaattc 10399826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 16428735 - 16428937
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  16428735 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 16428833  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  16428834 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaa 16428930  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  16428931 caaattc 16428937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50079020 - 50078818
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  50079020 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaac 50078922  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| | ||||||    
T  50078921 cc--attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaatttggtaaa 50078825  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  50078824 caaattc 50078818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6115302 - 6115101
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||| ||||||||||     
T  6115302 ttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggg-gacttattcttgtaac 6115204  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  6115203 caatt--gatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaa 6115107  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  6115106 caaatt 6115101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30790600 - 30790384
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  30790600 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 30790502  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  30790501 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 30790405  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||| | ||||||| ||||||    
T  30790404 caaaattcgtgtgtgctctct 30790384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9241285 - 9241083
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||    || |||| ||||||||||     
T  9241285 ttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacggga-gacttattcttgtaa- 9241188  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||| |||    
T  9241187 -ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactggggaaa 9241090  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  9241089 caaattc 9241083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 15823628 - 15823829
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  15823628 ttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 15823726  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  15823727 cc--attgatatctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 15823822  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  15823823 caaattc 15823829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17186327 - 17186125
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||   ||||| |||||||||||    || |||| ||||||||||     
T  17186327 ttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaaggga-gacttattcttgtaac 17186229  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  17186228 ccatta--atatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtaaa 17186132  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  17186131 caaattc 17186125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25127954 - 25128156
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  25127954 ttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 25128052  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
      |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| | || ||||||||| | |  ||||||||||||| ||    
T  25128053 --tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaat-taggaccgaactgggtcaa 25128149  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25128150 caaattc 25128156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50307745 - 50307544
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  50307745 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 50307648  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  50307647 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 50307551  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  50307550 caaattc 50307544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 13215163 - 13215369
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  13215163 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 13215261  T
Q  245 cctttttgatat----ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || ||  |||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| |    
T  13215262 ccatt--gatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgcg 13215358  T
Q  341 taaacaaattc 351  Q
    | |||||||||    
T  13215359 tcaacaaattc 13215369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429241
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||     
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaaccca 16429140  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||    
T  16429141 tt--gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaa 16429237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12302704 - 12302503
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| |||     
T  12302704 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttataa- 12302607  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  12302606 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 12302510  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  12302509 caaattc 12302503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15295033 - 15294832
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||||     
T  15295033 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-tgggagatttattcttgtaac 15294935  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  15294934 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 15294839  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  15294838 caaattc 15294832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25248751 - 25248549
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25248751 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 25248653  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  25248652 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 25248556  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25248555 caaattc 25248549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 51750121 - 51750322
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  51750121 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 51750219  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  51750220 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 51750315  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  51750316 caaattc 51750322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 2617598 - 2617771
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  2617598 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaac 2617696  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2617697 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca 2617771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  149 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaaga-ctaattcttgtaatcct 247  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccc- 43104343  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43104344 -tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38925677 - 38925479
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  38925677 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaac 38925579  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  38925578 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtaaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaa 38925486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 17318948 - 17319170
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaa 217  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||    
T  17318948 ttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaa 17319041  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagacta 317  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  17319042 ttaggcg-gaagacttattcttgtaa--cttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccct-agacta 17319137  T
Q  318 ggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  17319138 ggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 17319170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18800772 - 18800557
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||   ||||| ||||||||||||   ||  ||| |||||||||      
T  18800772 ttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggac-acttattcttgtatc 18800674  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |||| ||| |||||||    
T  18800673 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaa 18800576  T
Q  345 caaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  18800575 caaatttcgtgtgttctct 18800557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25251474 - 25251272
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||||     
T  25251474 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaaaacttattcttgtaac 25251376  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  25251375 cc--attgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 25251279  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25251278 caaattc 25251272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 40134026 - 40134228
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||     
T  40134026 ttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcggga-gacttattcttgtaac 40134124  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  40134125 acatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccggactaggtaaa 40134221  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  40134222 caaattc 40134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6756610 - 6756811
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6756610 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 6756705  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |    
T  6756706 -cctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagt-ttggaccgaactggatca 6756803  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  6756804 acaaattc 6756811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 46783146 - 46783331
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgaga-cttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctctt 261  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||    
T  46783146 cactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacccttt--gatatct-tt 46783242  T
Q  262 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| || |||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  46783243 ttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127670
Alignment:
Q  253 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T
Q  353 gtgtgttctctct 365  Q
     ||||||||||||    
T  13127682 atgtgttctctct 13127670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353344
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 21353432  T
Q  263 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  21353431 -gtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattc 21353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401217
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 2401307  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2401306 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 2401217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6823096 - 6823297
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6823096 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 6823193  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6823194 -ctcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6823290  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6823291 caaattc 6823297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18307191 - 18307392
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| |||||||| |     
T  18307191 ttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtga- 18307288  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | || ||    
T  18307289 -cgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaacggagtcaa 18307385  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18307386 caaattc 18307392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 28840762 - 28840962
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  28840762 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 28840860  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28840861 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 28840955  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28840956 caaattc 28840962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31735720 - 31735519
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31735720 ttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 31735622  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  31735621 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 31735526  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  31735525 caaattc 31735519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 47906352 - 47906553
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  47906352 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 47906450  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| ||    
T  47906451 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 47906546  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  47906547 caaattc 47906553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144679
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |  |   ||||||     
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttg-ggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactcaat---atatct- 4144771  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
      ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4144770 --ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4144679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 31489995 - 31490167
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  31489995 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattagg-cggaagacttattcttgtaa- 31490092  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
     ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31490093 -ctcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtca 31490167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4131578 - 4131401
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||||     
T  4131578 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaa-acttattcttgtaac 4131481  T
Q  245 cctttttgatatct----cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    || ||  |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4131480 ccatt--gatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 4131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2510523 - 2510323
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||     ||||| ||||||||||     
T  2510523 ttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcag--agacttattcttgtaac 2510426  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  2510425 ccatt--gatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 2510330  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2510329 caaattc 2510323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 363
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997240
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcc---taaatatctc 14997135  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtg 357  Q
     |||| |||   ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||   ||||    
T  14997136 -tttgcaaataaactcatatcattatagtggaacgaatagctgctctctcccccagaataggttatcattagaccgaactaggtaaacaaattatttgtg 14997234  T
Q  358 ttctct 363  Q
    ||||||    
T  14997235 ttctct 14997240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 39932155 - 39932357
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  39932155 ttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaac 39932253  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctc-tccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||| | || ||||||| ||||| |    
T  39932254 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaat-ttggaccgaattgggtca 39932349  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  39932350 acaaattc 39932357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9459616 - 9459416
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| || |||||||    
T  9459616 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgtaa 9459518  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  9459517 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 9459423  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  9459422 acaaatt 9459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9463443 - 9463243
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| || |||||||    
T  9463443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgtaa 9463345  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  9463344 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 9463250  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  9463249 acaaatt 9463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11457674 - 11457473
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  11457674 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 11457576  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  11457575 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 11457480  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  11457479 caaattc 11457473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 15916574 - 15916689
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  15916574 ttgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgggtaaacaaat 15916673  T
Q  350 tccgtgtgttctctct 365  Q
    |  ||| |||||||||    
T  15916674 tttgtgcgttctctct 15916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31423072 - 31422933
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31423072 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 31422974  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 287  Q
    ||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31422973 cc--attgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 31422933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14098169 - 14097967
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgaga-cttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||    || |||| ||||||||||    
T  14098169 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacggga-gacttattcttgtaa 14098072  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
     || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||     
T  14098071 cccatt--gatatctcttttgtaaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 14097976  T
Q  343 aacaaattc 351  Q
    |||||||||    
T  14097975 aacaaattc 14097967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31425217 - 31425013
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtt---tcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||||||   || | || ||||||||    
T  31425217 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagg-cttattcttgt 31425119  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||    
T  31425118 aa--ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccc-catactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 31425023  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
     |||||||||    
T  31425022 caacaaattc 31425013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2949430 - 2949230
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||     
T  2949430 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaa- 2949333  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  2949332 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc-ccgactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 2949237  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2949236 caaattc 2949230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 14353046 - 14353233
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14353046 attgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaa-act-attcttgt 14353143  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaa 335  Q
    || ||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| || | || ||||||| | |||||||    
T  14353144 aaccc--tttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctcccccaaagtatgtcagtaatggaccgaa 14353233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 24325745 - 24325946
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  24325745 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 24325843  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |  |  ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  24325844 cc--attgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaat-tttgaccgaactgggtcaa 24325939  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  24325940 caaattc 24325946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27337138 - 27336938
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||  || |||||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27337138 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27337040  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  27337039 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27336945  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27336944 caaattc 27336938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28998452 - 28998251
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | |||||  |||||||||     
T  28998452 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaa- 28998355  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||| | || |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28998354 -ctcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 28998258  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28998257 caaattc 28998251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29004168 - 29003967
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | |||||  |||||||||     
T  29004168 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaa- 29004071  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||| | || |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  29004070 -ctcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 29003974  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  29003973 caaattc 29003967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 16226249 - 16226448
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  16226249 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 16226347  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  16226348 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16226442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526650
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca-----atatctcttt 9526562  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9526563 -gtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26520344 - 26520103
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactg------gaagagattgagacttttggt 213  Q
    |||| |||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |      |||||||||| |||||| |||    
T  26520344 ttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggt 26520245  T
Q  214 agaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcag 313  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||  ||||        |||||||| || || ||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||     
T  26520244 agaattaggtttggaaacttattcttgtaacccatt--gata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaa 26520155  T
Q  314 actaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26520154 attaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctct 26520103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49495434 - 49495208
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||    
T  49495434 ttggcaacaaacactatggttgag-ttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaatt 49495336  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||  ||||||||  |||||| |    
T  49495335 agg-cgggagactcattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatg 49495239  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| | || ||||||||| |||||| ||||||    
T  49495238 tcaat-ttagaccgaactaggtaaagaaattc 49495208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6995899 - 6995698
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | | |||  |||||||||     
T  6995899 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggatactttttcttgtaa- 6995802  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  6995801 -ctcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 6995705  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6995704 caaattc 6995698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 46431906 - 46431704
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  46431906 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 46431808  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct--ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | || |||||||||||||     
T  46431807 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 46431713  T
Q  343 aacaaattc 351  Q
    |||||||||    
T  46431712 aacaaattc 46431704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 47179795 - 47179993
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  47179795 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 47179893  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  47179894 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 47179987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50248771 - 50248626
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  50248771 ttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaac 50248673  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacaga 294  Q
    ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50248672 cc--attgacatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacaga 50248626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 17324145 - 17324360
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  |||||||||||  ||||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  17324145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 17324243  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||   |||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  17324244 cc--attgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 17324340  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  17324341 caaatt-cttgtgttctctct 17324360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 23786031  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23786032 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Original strand, 16231645 - 16231834
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  16231645 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 16231743  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16231744 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 16231834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 16432476 - 16432679
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||| |   | | | | ||||||||||     
T  16432476 ttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatg-cgggacaattattcttgtaac 16432574  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  16432575 cc--attgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtca 16432671  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  16432672 acaaattc 16432679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393279
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  || |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggacttg-ggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 2393368  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2393367 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc 2393279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 13761919 - 13762119
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  13761919 ttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 13762017  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  13762018 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 13762112  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  13762113 caaattc 13762119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 28842577 - 28842777
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  28842577 ttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 28842675  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||| ||    
T  28842676 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaat-ttggacagaactaggtcaa 28842770  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28842771 caaattc 28842777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785260
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |    |    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataaccctttggaa----t 13785360  T
Q  259 cttttgtaaagttactc-atcattatagtggaacagagagctgctctct----ccctcag-ac-taggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||||     ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13785359 cttttgtaaagttactcaaaaattacagtggaacggagagctgctctctaacaaccaaagtacgtaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 13785260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21948386 - 21948227
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  21948386 ttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 21948289  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21948288 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 21948227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3579815 - 3579615
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | || | ||||||||| | |||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3579815 ttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3579717  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||    |||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3579716 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3579622  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3579621 caaattc 3579615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332553
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattag----gtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     |||||||||||||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaattaattaagtttgaagactaattcttg 26332589  T
Q  241 taatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatc 278  Q
    ||| ||||||   ||| || ||||||||||||||||||    
T  26332588 taa-ccttttgattatatc-tttgtaaagttactcatc 26332553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20291539 - 20291739
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  20291539 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 20291637  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | | ||||||| ||||||||| | ||| | || |||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||| ||    
T  20291638 cc--attgatttctc-tttgtaacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20291732  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20291733 caaattc 20291739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134257
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 25134166  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25134167 tgtaaagaaactcatataattatagtggaacggagagctgttctctcccccatactagatcatcattagaccgaagtgggtaaacaaattc 25134257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27339329 - 27339129
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   |  |||| ||||||||||     
T  27339329 ttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggcgacttattcttgtaac 27339231  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  27339230 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 27339136  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27339135 caaattc 27339129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 51752447 - 51752646
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  51752447 ttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 51752544  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | |||||| || |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  51752545 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 51752639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28207262 - 28207066
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | ||||   || ||||| |   || ||||  |||||||||  ||    
T  28207262 attcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcggga-gactttttcttgtaa--ct 28207166  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
      |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  28207165 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 28207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 47177444 - 47177642
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggat-tgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  47177444 ttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 47177542  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| |    
T  47177543 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcag-attggatcgaactgggtca 47177636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232774
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 2232690  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||||     | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2232691 -tttgtaaagaaactcat-----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521899
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca-----atatctcttt 9521811  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  9521812 -gtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaaat 9521899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Original strand, 48665259 - 48665402
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtca-ctggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  48665259 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 48665357  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48665358 ccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 48665402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3091279 - 3091101
Alignment:
Q  169 taggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaa 268  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||  |   |  ||||||| ||||||||    
T  3091279 taggattgagtctcttggtaacaggaagagattgagacttgag-tagaattaagtttgaagactaattcttgtaacac---tcaatatctc-tttgtaaa 3091185  T
Q  269 gttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |  ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  3091184 gaaactcatatcattatagtaaaacagagagctgctctc-cccccagagtaggtcatcattagaccgaactggataaacagattc 3091101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20302541 - 20302741
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  20302541 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 20302639  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | |||||||||  |||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  20302640 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 20302734  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20302735 caaattc 20302741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 351
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757813
Alignment:
Q  155 ttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | | | |||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa--cctatcgat 51757719  T
Q  255 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||| ||||||| | |||||| || |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||    
T  51757720 ttctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattc 51757813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8213728 - 8213582
Alignment:
Q  144 attgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| | ||||   | | |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8213728 attgattcaccttagacaaacactattaggatttagtctattggcaccagaaagagattcgggactttggatagaattaggtttgaagactaattcatgt 8213629  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    || ||| || ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213628 aaccctattgga---atcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 8213582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11693397 - 11693312
Alignment:
Q  261 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11693397 tttgaaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccct-----taggtcagtattgaactgaactgggtaaacaaattc 11693312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 10115880 - 10116059
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||       |||||||||||||||||||| | | ||||||| || | |||  |||||||    
T  10115880 gaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaaaagatt-------ttggtagaattaggtttgaacagtcattcttgaaaccattt--gatatct 10115970  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||| | |||  |||| |||   |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10115971 cttt-gtaaagttactcatcattactgtggaacggtgagttgctttttcc--cagagtagtcaagtattggaccgaacttggtaaacaaatt 10116059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Original strand, 37990772 - 37990863
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatccttt 249  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37990772 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattaggtttgtagaccgattcttgtaatccttt 37990863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 49959128 - 49959234
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||| |    
T  49959128 attgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaa-actgattctttt 49959226  T
Q  242 aatccttt 249  Q
    || |||||    
T  49959227 aacccttt 49959234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 23816070 - 23816169
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||| | ||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  23816070 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatggatcggagggatgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 23816167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26332786 - 26332699
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagact 207  Q
    |||| |||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   || |||||||||||    
T  26332786 ttggcaacaaacactaggtttgggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 351
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358856
Alignment:
Q  281 tatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 13358856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 365
Target Start/End: Original strand, 43104443 - 43104485
Alignment:
Q  323 gtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43104443 gtatttgatcgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 43104485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 6823967 - 6824009
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  6823967 ttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggt 6824009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19072985 - 19072932
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  19072985 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19120875 - 19120822
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  19120875 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 21536593 - 21536662
Alignment:
Q  277 tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  21536593 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtca-ttttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 26644937 - 26644990
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  26644937 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37069843 - 37069774
Alignment:
Q  277 tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37069843 tcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 47703976 - 47704029
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  47703976 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3281765 - 3281718
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  3281765 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggt 3281718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 32261337 - 32261397
Alignment:
Q  261 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtc 321  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||| |||| ||||||    
T  32261337 tttgtaaagttattcatcattttagtggaacggagagttgttctcccccccagagtaggtc 32261397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 108)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 134 - 365
Target Start/End: Original strand, 15143536 - 15143765
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagacta 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||     
T  15143536 tagggttgagattgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagactt 15143635  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg 333  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15143636 attcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccg 15143733  T
Q  334 aactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15143734 aaatgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 15143765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17413390 - 17413176
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17413390 ttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaatt 17413291  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  17413290 aggtttgaaaacttattcttgtaaccc--tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttgg 17413193  T
Q  320 tcagtatttgaccgaac 336  Q
    ||||| || ||||||||    
T  17413192 tcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 40221604 - 40221805
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  40221604 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaac 40221702  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40221703 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 40221799  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  40221800 caaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2144774 - 2144570
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgag-acttttggtagaattaggtttgaagac 231  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2144774 tagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagac 2144675  T
Q  232 taattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgac 331  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| |||    
T  2144674 taattcttgtaa-ccttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattggac 2144577  T
Q  332 cgaactg 338  Q
    |||||||    
T  2144576 cgaactg 2144570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898013
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||| |    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccattt--gatatctctat 4897925  T
Q  263 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4897926 tgtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt 4898013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6661408 - 6661168
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  6661408 ttggcaacaaacactagagttggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaatt 6661309  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  6661308 agg-caggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactagg 6661212  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
    ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6661211 tcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct 6661168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445248
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggt---cactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatat 256  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaacccttt--gatat 15445356  T
Q  257 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15445355 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttcc-cagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcgtgt 15445257  T
Q  357 gttctctct 365  Q
    ||| |||||    
T  15445256 gttttctct 15445248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 36208657 - 36208859
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  36208657 ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaac 36208756  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  36208757 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccc-catactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaa 36208852  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36208853 caaattc 36208859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Original strand, 4754210 - 4754377
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  4754210 ttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaatt 4754309  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4754310 aggtttgaaggctaattcttgtaa-ccttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcaatatagtgga 4754377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 9020275 - 9020503
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||    
T  9020275 ttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaatt 9020374  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||  || | ||||    
T  9020375 agg-cggaagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattagg 9020471  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  9020472 tctgttttggaccgaactggataaaccaattc 9020503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 695960 - 696160
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  695960 ttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 696057  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||| ||    
T  696058 cc--attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 696154  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  696155 caaatt 696160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Original strand, 35430258 - 35430465
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35430258 attgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 35430357  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  35430358 aattctttt-gatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggat 35430455  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
    ||||||||||    
T  35430456 aaacaaattc 35430465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1189806 - 1189603
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  1189806 ttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 1189708  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctcc-ctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  1189707 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 1189611  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  1189610 acaaattc 1189603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34033793 - 34033563
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttgg-tagaa 217  Q
    |||| |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||  |||||| |||||    
T  34033793 ttggcaacaaacactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaa 34033694  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagacta 317  Q
    ||| |||||||||||  || | |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | |||||    
T  34033693 ttaagtttgaagacttgttatggtaaccccttc-gatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctccc-ctgacta 34033596  T
Q  318 ggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34033595 ggtcagtattggatcgaactgggtaaacaaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34479616 - 34479414
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34479616 ttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 34479517  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  34479516 ccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 34479422  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  34479421 acaaattc 34479414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34477251 - 34477049
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34477251 ttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 34477152  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  34477151 ccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 34477057  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  34477056 acaaattc 34477049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18511409 - 18511208
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18511409 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18511311  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  18511310 cc--gttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 18511215  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18511214 caaattc 18511208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25921670 - 25921469
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  25921670 ttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaac 25921572  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  25921571 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 25921476  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25921475 caaattc 25921469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27912618 - 27912819
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27912618 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27912716  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  27912717 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27912812  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27912813 caaattc 27912819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31472810 - 31472608
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || | |   ||||| |||     
T  31472810 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatg-catcttcttctaac 31472712  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  31472711 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 31472615  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  31472614 caaattc 31472608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 20053900 - 20054120
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||   ||||| ||||||  ||||||||    
T  20053900 ttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--tgga---gattgggactttaagtagaatt 20053994  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||  || |||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||  || ||||||    
T  20053995 aggtggga-gacttattcttgtaaccc-----gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactagg 20054088  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  20054089 tcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Original strand, 24126937 - 24127139
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttga-agactaattcttgta 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  24126937 attgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc--gatagacttattcttgta 24127034  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    |  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||     
T  24127035 a--ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 24127130  T
Q  343 aacaaattc 351  Q
    |||||||||    
T  24127131 aacaaattc 24127139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20506038 - 20505839
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  20506038 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 20505941  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20505940 -cacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20505846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6745150 - 6745351
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6745150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 6745248  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6745249 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6745344  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6745345 caaattc 6745351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16092397 - 16092195
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  16092397 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 16092299  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||   ||||||||||| | || ||| ||||||| | ||    
T  16092298 cc--attgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaat-ttagactgaactggatcaa 16092202  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  16092201 caaattc 16092195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 17072965 - 17073167
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||| | |||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  17072965 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcg-gaagacttattcttgtaa- 17073062  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| ||    
T  17073063 -ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 17073160  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  17073161 caaattc 17073167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18596727 - 18596929
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||   || |||| ||| ||||||     
T  18596727 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttatttttgtaa- 18596824  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  18596825 -ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 18596922  T
Q  345 caaattc 351  Q
    || ||||    
T  18596923 cagattc 18596929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10529296 - 10529095
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  10529296 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 10529198  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10529197 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10529102  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  10529101 caaattc 10529095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18466766 - 18466967
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18466766 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18466864  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  18466865 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 18466960  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18466961 caaattc 18466967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25804107 - 25804307
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25804107 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 25804205  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  25804206 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 25804300  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  25804301 taaattc 25804307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15224993 - 15224744
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaa 217  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| | |||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15224993 ttggcaacaaacactagggttatgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaa 15224894  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttac---tcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcaga 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||  ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  15224893 ttaggtttgaagactaatttttgtaaccattt--gataattcttttgtaaacttacgactcatcattataatggaacagttagctgctctctgccccaga 15224796  T
Q  315 ctaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat-tccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  15224795 ctaggtcagtattgaaccgaactaggtaaaccaatatatgtgtgttctctct 15224744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 4410105 - 4410305
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4410105 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 4410202  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | | ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  4410203 -cctattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 4410298  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4410299 caaattc 4410305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6747387 - 6747587
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6747387 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 6747484  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6747485 -ctcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6747580  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6747581 caaattc 6747587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 21948108 - 21948309
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  || |||||| ||| ||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  21948108 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattagg-cgggagacttattcttgtaac 21948206  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  21948207 cc--cttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 21948302  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  21948303 caaattc 21948309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26406647 - 26406451
Alignment:
Q  168 ttaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct---ttttgatatctcttttg 264  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |  ||||||||||      
T  26406647 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagacttgag-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcaatatcaatatctctttgt 26406549  T
Q  265 taaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctc 362  Q
     ||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  26406548 aaaagaaattcatcattatagtggaacgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaactaggtaaacaaattctttgtgttctc 26406451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27910532 - 27910733
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27910532 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27910630  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  27910631 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 27910726  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27910727 caaattc 27910733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 6756576 - 6756772
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6756576 ttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 6756673  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
         ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  6756674 ---cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaa 6756768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18509515 - 18509314
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  18509515 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaa- 18509418  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||| |    
T  18509417 -ctcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtca--atttgaaccgaactaggtca 18509322  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  18509321 acaaattc 18509314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17818687 - 17818488
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |   || |||| ||||||||||     
T  17818687 ttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcggga-gacttattcttgtaac 17818589  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  17818588 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 17818495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Original strand, 29748403 - 29748633
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaa 217  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||    
T  29748403 ttggcaacaaacagtagggttaggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagacta 317  Q
     ||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| || | ||    
T  29748503 ctaaatttgaagactaattcttgtaactctttt-gatatatcttt-gtaaaggaattcattattatggtggaacgaagagctgctctctcccccaaagta 29748600  T
Q  318 ggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  29748601 ggtcagtattggaccgaacttggtaaataaatt 29748633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385450
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 35385541  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  35385540 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962429
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 11962519  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11962518 -gtaaagaaactcatatcattataatggaacagagagctgctctcttcctcatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 11962429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673020
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 22672930  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22672931 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 22673020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 38882188 - 38882388
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  38882188 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 38882286  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38882287 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38882381  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38882382 caaattc 38882388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 39854565 - 39854766
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  39854565 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 39854663  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||| ||    
T  39854664 cc--attgatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaat-ttggaccgaactaggtcaa 39854759  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  39854760 caaattc 39854766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41585941 - 41585740
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   || |||| ||| ||||||     
T  41585941 ttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcagga-gacttatttttgtaag 41585843  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  41585842 tcatt--gatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 41585747  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  41585746 caaattc 41585740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 1170904  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1170905 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841246
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 17841335  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17841334 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627552
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc---tgaatatctc 10627459  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10627460 -tttgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcatcattagactgaactgggtaaacagattc 10627552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 2175001 - 2175201
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  2175001 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 2175099  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  2175100 cc--attgatttctc-tttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 2175194  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2175195 caaattc 2175201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 2954499 - 2954699
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  ||||||||||     
T  2954499 ttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacgtattcttgtaac 2954597  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  2954598 cc--attgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaat-tttgaccgaactgggtcaa 2954692  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2954693 caaattc 2954699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Original strand, 4236711 - 4236900
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4236711 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 4236809  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||    
T  4236810 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452681
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |      ||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca-----atatctcttt 25452591  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25452592 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25452681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 39798129 - 39798330
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  39798129 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 39798227  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || || |||||||||| ||    
T  39798228 cc--attgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggatcgaactgggtcaa 39798323  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  39798324 caaattc 39798330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 351
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445682
Alignment:
Q  165 ctattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttg 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |      |||||||||| |    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca-----atatctcttt-g 25445593  T
Q  265 taaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445594 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25445682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 26097815 - 26098014
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |   || |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  26097815 ttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 26097911  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  26097912 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagag-gctgctctctcctccagactaggtca--atttgaaccgaactgggtca 26098006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749993
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 10749892  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtg 357  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  10749893 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattctttgtg 10749989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 16776240 - 16776440
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  16776240 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 16776338  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||| | || | || ||||||||||||| ||    
T  16776339 c---attgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaat-ttggaccgaactgggtcaa 16776433  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  16776434 caaattc 16776440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18469093 - 18469292
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | |||||  |||||||||     
T  18469093 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 18469191  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  18469192 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctctcc--cagactaggtcaat-ttggaccgaactggattaa 18469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 15552327 - 15552527
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  15552327 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 15552425  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  15552426 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 15552520  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  15552521 acaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31179568 - 31179368
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31179568 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 31179470  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   || || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  31179469 ccc--attcatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31179375  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  31179374 acaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 31545162 - 31545362
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31545162 ttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 31545260  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  31545261 ccc--attgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31545355  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  31545356 acaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34530863 - 34530716
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||  ||||||  |||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  34530863 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattagg-cgggagatttattcttgtaa- 34530766  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagag 295  Q
     ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34530765 -ctcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaagagag 34530716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36402525 - 36402324
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||  ||||| |||| |||||||  || ||||| ||| |||||||    
T  36402525 ttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattagg-ctggagacttattattgtaat 36402427  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||| | || || |||||| ||| ||    
T  36402426 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagatcgaactaggtcaa 36402331  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36402330 caaattc 36402324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 658550 - 658352
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  658550 ttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 658452  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||   || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  658451 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 658359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2297999
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 2298090  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||| |||||  ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  2298089 -tttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2297999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 10586914 - 10587115
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| |||     
T  10586914 ttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttttaac 10587012  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  10587013 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 10587107  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  10587108 acaaattc 10587115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37705977 - 37705776
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttgg-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||  |||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  37705977 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 37705880  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |  |||  |||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  37705879 ccc--attgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 37705784  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  37705783 acaaattc 37705776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2818532 - 2818331
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||  || |||||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||     
T  2818532 ttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaa- 2818435  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  2818434 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 2818338  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  2818337 caaattc 2818331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10474520 - 10474319
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  10474520 ttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 10474422  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  10474421 cc--attgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 10474326  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  10474325 caaattc 10474319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354570
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||| || ||  ||| ||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacta-ttcttgtaacccatt--gatttc 15354662  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||||| |||| ||||||||| |  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15354661 tcttt-gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 15354570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665327
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 23665235  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23665236 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 23665327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793260
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 23793352  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23793351 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 23793260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786590
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||  |      ||||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca-----atatctcttt 28786500  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28786501 -gtaaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 28786590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 351
Target Start/End: Original strand, 42238310 - 42238446
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42238310 ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcc 42238403  T
Q  309 ctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42238404 cccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 42238446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757469
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||| || ||  ||| |     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccatt--gatttt 10757368  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtg 357  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  10757369 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attagaccgaactgggtcaacaaattctttgtg 10757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Original strand, 20043132 - 20043208
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20043132 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356846
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 15356938  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| ||||||||| |  |||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15356937 tc-tttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 15356846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21684648 - 21684448
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | ||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  21684648 ttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattcttgtaa- 21684551  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  21684550 -ctcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 21684455  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  21684454 caaattc 21684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 31542817 - 31543016
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||| | ||    
T  31542817 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctcg-aa 31542914  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  31542915 ccc--attgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31543009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724176
Alignment:
Q  146 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatc 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||         |||||||||||   |  || | |||||||||| |    
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcgggt-gatttattcttgtaacc 2724074  T
Q  246 ctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 345  Q
    | ||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||    
T  2724075 catt--gatatctcttttgtaagattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 2724170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 25904185 - 25904385
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||  ||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25904185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattagg-cgggagacttattcttgtaa- 25904282  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  25904283 -cacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 25904379  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  25904380 caaatt 25904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39398190 - 39398017
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||  ||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  39398190 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattagg-cagtagacttattcttgtaac 39398092  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||| | |||||  || | ||||||  ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39398091 cc--attgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtca 39398017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960129
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta-gacgggagact-attcttgtaaccc--attgatttc 38960219  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38960218 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 38960129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31466175 - 31466044
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31466175 ttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattagg-cgggagact-attcttgtaac 31466078  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466077 cc--attgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782557
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggaattg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31782557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240614
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 1240521  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||  |||  |||||||| |||||| ||||||    
T  1240522 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtcatcattaaaccgaactaggtaaataaattc 1240614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Original strand, 13295835 - 13296018
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |  |    
T  13295835 aaacacttttaggattgagtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaccc--tttgaaa--t 13295930  T
Q  259 cttttgtaaagttactc-atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaa 348  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||| ||||||   |||  ||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  13295931 cttttgtaaagttactcaaaaattatagtggaatggagaactgctc---ccccaagagtaggtcagtattgaaccgaactagataaacaaa 13296018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 20045092 - 20045169
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20045092 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093288
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  || ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattagatttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 16093380  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16093379 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaaaagctgctctcttcc-catactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc 16093288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373134
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattga-gtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 3373224  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3373223 tc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 3373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 351
Target Start/End: Original strand, 21288953 - 21289044
Alignment:
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  21288953 tcttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattc 21289044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12556120 - 12556045
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12556120 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattag 12556045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23742006 - 23741854
Alignment:
Q  193 gaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaaca 292  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |     
T  23742006 gaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcg 23741913  T
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23741912 gagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 23741854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222950
Alignment:
Q  166 tattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgt 265  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||  ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |      |||||||||| ||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaacttg-ggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt-gt 40222861  T
Q  266 aaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctct--ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40222862 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccatactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 40222950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Original strand, 42770853 - 42770924
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattag 221  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42770853 attcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Original strand, 42770934 - 42771024
Alignment:
Q  187 tcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770934 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaa--cctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25562473 - 25562391
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25562473 aaacactcttaggatttagtttctgggtcacgagaagagattgtaacttg-ggtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaa 25562391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520624
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattga-gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatccttt 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgtaacccttt 32520624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 21288852 - 21288926
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatta 220  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  21288852 ttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaatta 21288926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 351
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043273
Alignment:
Q  299 tgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaattc 20043273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 9353372 - 9353425
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  9353372 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 11916996 - 11917065
Alignment:
Q  277 tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  11916996 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098284
Alignment:
Q  254 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||| | || |||||||||| || |||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaattc 26098284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 347
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  301 ctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 36932390 - 36932443
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  36932390 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 17004001 - 17004053
Alignment:
Q  294 agagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  17004001 agagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26098448 - 26098391
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattg 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  26098448 ttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 133)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 365
Target Start/End: Original strand, 28453801 - 28454035
Alignment:
Q  128 aaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttga 227  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||    
T  28453801 aaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggtt-ga 28453899  T
Q  228 agactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatt 327  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28453900 agactaattcttgtaaac--ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtatt 28453997  T
Q  328 tgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28453998 ggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 28454035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47151117 - 47150874
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47151117 ttggtaaccaacactagggttgaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaatt 47151018  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||  ||||||||    
T  47151017 aggtttgaagacttattcttgtaaccc--tttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactagg 47150920  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  47150919 tcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctct 47150874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 9863817 - 9864064
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| || |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9863817 ttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 9863916  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttac---tcatcattatagtggaacagagagctgctctct--ccctcaga 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||    
T  9863917 aagtttgaagactaattcttgtaa--ccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccaga 9864013  T
Q  315 ctaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9864014 ctaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 9864064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Original strand, 10112978 - 10113218
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactgg-aagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  10112978 ttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaat 10113077  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  10113078 tagatttgaagactaattcttgtaa-cctttttgatatctcttt-gtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactag 10113175  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttct 361  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||    
T  10113176 gttagtattggaccgaactgggtaaaaaaaattcatgtgttct 10113218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185816
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaacccttt--gatatatc 16185921  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgtt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185920 ttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 16185822  T
Q  360 ctctct 365  Q
    ||||||    
T  16185821 ctctct 16185816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18537697 - 18537455
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537697 ttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaatt 18537598  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||    
T  18537597 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataatagg 18537501  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18537500 tcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctct 18537455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38890448 - 38890206
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38890448 ttggcaacaaacattagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 38890349  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||    || |||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  38890348 agaaggga-gacttattcttgtaacccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccaagattagg 38890252  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38890251 tcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 38890206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 12102222 - 12102440
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  12102222 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 12102321  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  12102322 cc--actgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaa 12102419  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||| || |||||||    
T  12102420 caaatttcgtatgctctctct 12102440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31983726 - 31983513
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  31983726 ttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaac 31983627  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  31983626 cc--tttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc-aatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaa 31983530  T
Q  345 caaattccgtgtgttct 361  Q
    |||||| ||||||||||    
T  31983529 caaatttcgtgtgttct 31983513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 19322804 - 19323032
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19322804 ttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 19322903  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   || |||| ||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19322904 aggcggga-gacttatttttgtaacccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactagg 19323000  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19323001 tcagttttggaccgaactggataaacaaattc 19323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3982407 - 3982175
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattg-----attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttgg 212  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  3982407 ttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttggg 3982308  T
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctca 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3982307 tagaattaagtttgaagactgattcttgtaacacttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctca 3982210  T
Q  313 gactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
     ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  3982209 tactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 350
Target Start/End: Original strand, 25357761 - 25357979
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggta----gaattaggtttgaag 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| | ||    |||||| ||||||||    
T  25357761 tagggttgtgattgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaag 25357860  T
Q  230 actaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg 329  Q
    ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  25357861 acttattcttgtaacccttt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattgg 25357958  T
Q  330 accgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25357959 acctaactgggtaaacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 36380485 - 36380687
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  36380485 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 36380582  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  36380583 -ctcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggagcgaactgggtaaa 36380680  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36380681 caaattc 36380687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18535055 - 18534813
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18535055 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaatt 18534956  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  18534955 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactagg 18534859  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18534858 taagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 18534813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Original strand, 9022413 - 9022602
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9022413 ttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaat 9022512  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9022513 taggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccc 9022602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8756475 - 8756232
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttctt-ggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  8756475 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaat 8756376  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    |||    || |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||    
T  8756375 tagacggga-gacttattcttgtaa--ctcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactag 8756279  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8756278 gtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 8756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 364
Target Start/End: Original strand, 16455377 - 16455591
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  16455377 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 16455474  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  16455475 -ctcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 16455572  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctc 364  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  16455573 caaatt-cttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40999168 - 40998990
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40999168 aacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtt 40999069  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
    || |||||   | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  40999068 tggagactgtgttttgtaaccc--tttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 14633455 - 14633655
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14633455 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 14633552  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  14633553 cc--attgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 14633648  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  14633649 caaattc 14633655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22801059 - 22800858
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22801059 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22800961  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22800960 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22800865  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  22800864 caaattc 22800858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 24879125 - 24879342
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  24879125 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 24879223  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  24879224 cc--attgatatctcttttgtaaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 24879319  T
Q  344 acaaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  24879320 acaaattctcttgtgttctctct 24879342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 24880591 - 24880804
Alignment:
Q  149 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||      
T  24880591 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-- 24880687  T
Q  249 tttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  24880688 attgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 24880785  T
Q  348 attc-cgtgtgttctctct 365  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  24880786 attctcttgtgttctctct 24880804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 40637210 - 40637411
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  40637210 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 40637308  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40637309 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 40637404  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  40637405 caaattc 40637411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15032746 - 15032532
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||   || || | ||||||||||     
T  15032746 ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcggga-gatttattcttgtaac 15032648  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaact-gggtaa 343  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  15032647 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagggtat 15032550  T
Q  344 acaaattccgtgtgttct 361  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15032549 acaaatttcgtgtgttct 15032532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 36378428 - 36378629
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |   || |||| ||||||||||     
T  36378428 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcggga-gacttattcttgtaa- 36378525  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  36378526 -ctcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaa 36378623  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  36378624 caaatt 36378629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 10114438 - 10114669
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||    
T  10114438 ttggcaacaaacactagggttgggattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattgag--------tagaatt 10114529  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| ||||    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  10114530 atgtttaaagactaattcatgtaa-cctt----atatctcttt-gtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactagg 10114623  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  10114624 tcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctct 10114669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17662442 - 17662241
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  17662442 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 17662344  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  17662343 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 17662248  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  17662247 caaattc 17662241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33415685 - 33415484
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  33415685 ttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 33415587  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  33415586 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 33415491  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  33415490 taaattc 33415484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36919781 - 36919580
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  36919781 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 36919683  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  36919682 cc--attgatatctcttttgtaacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 36919587  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36919586 caaattc 36919580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336776
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctt--atatctc 5336868  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||   ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  5336867 tttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattc 5336776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18409544 - 18409338
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||     
T  18409544 ttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcggga-gatttattcttgtaac 18409446  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||    
T  18409445 ccatt--gatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaat-ttggattgaactgggtaaa 18409350  T
Q  345 caaattccgtgt 356  Q
    |||||| |||||    
T  18409349 caaatttcgtgt 18409338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 26557738 - 26557922
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattga-gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||      | |||||||||||    
T  26557738 aaacactattaggatatagtctcatggtcacgggaaaagattcaagactttgggtggaattaggtttgaaaactaattctt------ccttttgatatct 26557831  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26557832 cttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8631616 - 8631415
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  8631616 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 8631518  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  8631517 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 8631422  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  8631421 caaattc 8631415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 9148389 - 9148589
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  9148389 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 9148487  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  9148488 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 9148582  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  9148583 caaattc 9148589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 24888932 - 24889133
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||     
T  24888932 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcatgtaac 24889030  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  24889031 ccatt--gatatctcttttgtaacgttacttatcat-atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 24889126  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  24889127 caaattc 24889133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36921690 - 36921489
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  36921690 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 36921592  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | | | || ||||||||||||| ||    
T  36921591 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaat-ttggaccgaactgggtcaa 36921496  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36921495 caaattc 36921489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40091612 - 40091411
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  40091612 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 40091514  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40091513 cc--attgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 40091418  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  40091417 caaattc 40091411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 16453445 - 16453619
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  16453445 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattagg-cgggagacttattcttgtaac 16453543  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16453544 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtca 16453619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 41997628 - 41997828
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  41997628 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 41997726  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||| ||||    
T  41997727 cc--tttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccc-cagactaggttaat-ttggaccgaactggataaa 41997822  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  41997823 caaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 351
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891629
Alignment:
Q  151 caccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||  ||||||||| ||   |    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttgttcttgtaaccc--at 2891529  T
Q  251 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||  ||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  2891530 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtaca-acttggaccgaactgggtcaacaaatt 2891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12396042 - 12395844
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  12396042 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgtaac 12395944  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  12395943 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacagggtcaa 12395848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 19096019 - 19096220
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19096019 ttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaa 19096116  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| |    
T  19096117 ccc--attgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtca 19096212  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  19096213 acaaattc 19096220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317143
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |      ||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca-----atatctcttt 15317054  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15317055 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 15317143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22046882 - 22046682
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22046882 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22046784  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22046783 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22046689  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  22046688 caaattc 22046682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 24348354 - 24348555
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  24348354 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaac 24348452  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  24348453 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 24348548  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  24348549 caaattc 24348555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38928374 - 38928173
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  38928374 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 38928277  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38928276 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38928180  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38928179 caaattc 38928173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37313263 - 37313089
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| || ||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  37313263 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 37313165  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37313164 ccatta--atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtca 37313089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 48486455 - 48486655
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  48486455 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 48486552  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  48486553 -cacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 48486649  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  48486650 caaatt 48486655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22802931 - 22802730
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22802931 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22802833  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |    
T  22802832 cc--attgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtca--atttgaaccgaactaggtca 22802738  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  22802737 acaaattc 22802730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Original strand, 54906721 - 54906886
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54906721 attgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 54906820  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  54906821 aa--ctctttgatatctc-tttgtaaagttactcaaaagttataatggaacggaaagctgctctctccc 54906886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3578789 - 3578662
Alignment:
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  3578789 tgaagactaattcttgtaa--cattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagt 3578694  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgt 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3578693 attagaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 3578662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12401004 - 12400806
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  12401004 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgtaac 12400906  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  12400905 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacagggtcaa 12400810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 322
Target Start/End: Original strand, 13544069 - 13544268
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaa-attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  13544069 ttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaat 13544168  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    ||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||  | ||||||||    
T  13544169 tagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactag 13544264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6764980 - 6765181
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||  || |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  6764980 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 6765078  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6765079 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6765174  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6765175 caaattc 6765181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 7941459 - 7941660
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 7941557  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  7941558 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 7941653  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  7941654 caaattc 7941660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14787629 - 14787425
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||| | | |||||  |||||||||    
T  14787629 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaa 14787531  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctg--ctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
      ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||    
T  14787530 --ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggt 14787435  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
     |||||||||    
T  14787434 caacaaattc 14787425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37089568 - 37089368
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  37089568 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 37089470  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  37089469 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 37089375  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  37089374 caaattc 37089368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 47274862 - 47275062
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  47274862 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 47274960  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  47274961 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaa 47275055  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  47275056 caaattc 47275062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 322
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547463
Alignment:
Q  157 gggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||  |||||||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa--ctcattgatat 13547398  T
Q  257 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13547399 atcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 13547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769665
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagacttg-ggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 36769572  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36769573 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc 36769665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 30136660 - 30136887
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  30136660 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaatt 30136759  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||| |  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||   | ||||||    
T  30136760 agg-cggaagacttattcttgtga--ctcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactagg 30136856  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| | || ||||||| ||| |||||||||||    
T  30136857 tcaat-ttggaccgaattggataaacaaattc 30136887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529453
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca-----atatctcttt 8529363  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8529364 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 8529453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16639011
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc---tcaatatctc 16638922  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16638923 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcc--cagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaat 16639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688936
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 16689026  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16689025 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 16688936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22044587 - 22044387
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   || |||| ||| ||||||     
T  22044587 ttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 22044489  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22044488 ccatt--gatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22044394  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  22044393 caaattc 22044387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 38409341 - 38409541
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  38409341 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaac 38409439  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38409440 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38409534  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38409535 caaattc 38409541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 47868537 - 47868738
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  47868537 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 47868635  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  47868636 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 47868731  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  47868732 caaattc 47868738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853732
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 11853642  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11853643 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18709360 - 18709161
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  18709360 ttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 18709262  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  18709261 cc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 18709167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 365
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295517
Alignment:
Q  146 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatc 245  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaacc 22295393  T
Q  246 ctttttg----atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||||  |    ||     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22295394 ctttgagtagaattaggattttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggt 22295493  T
Q  342 aaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  22295494 aaacaaatttcatgtgttctctct 22295517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22780570 - 22780371
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  22780570 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 22780472  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  22780471 ccc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 22780377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556056
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 4556145  T
Q  263 tgtaaagttactcatc--attatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4556144 -gtaaaga-actcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc 4556056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885060
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttg-ggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 4884970  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4884971 -gtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4885060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5516445 - 5516243
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5516445 attgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaattaagtttgaagactaactcttgt 5516346  T
Q  242 aatcctttttgatatc--tct-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctc-cctcagactaggtcagtatttgaccgaact 337  Q
    ||  ||||||  |||   ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  5516345 aactcttttttttatacatctctttgtaaagttacccatcattattgtggaacagagaactgctctctctccctagactagatcagtattggaccgaact 5516246  T
Q  338 ggg 340  Q
    |||    
T  5516245 ggg 5516243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9174343 - 9174143
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  9174343 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 9174245  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      ||  ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| |||| ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  9174244 --ctcattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 9174150  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  9174149 acaaatt 9174143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16931986 - 16931786
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  16931986 ttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 16931888  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  16931887 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16931793  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  16931792 acaaatt 16931786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16934340 - 16934140
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  16934340 ttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 16934242  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  16934241 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16934147  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  16934146 acaaatt 16934140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26086173 - 26085973
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  26086173 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 26086075  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||| | |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  26086074 cc--attgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaa 26085980  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  26085979 caaattc 26085973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 51015382 - 51015582
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  51015382 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 51015480  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  51015481 cc--attgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 51015575  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  51015576 caaattc 51015582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570279
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 4570187  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4570188 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaaattc 4570279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050269
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 7050346  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaa 335  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  7050345 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaa 7050269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489533
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 16489444  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||  ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16489445 tgtaaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccct-agactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 31300520  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31300521 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44600035 - 44599836
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  44600035 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 44599937  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      ||  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  44599936 --ctcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 44599842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822447
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 55822358  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  55822359 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc-catactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 55822447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31849795 - 31849595
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  31849795 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaac 31849697  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  31849696 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca--atttgaaccgaactgggtca 31849603  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  31849602 acaaattc 31849595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2485069 - 2484868
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||  ||||   | ||||| ||||||||||     
T  2485069 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagatagg-cgggagacttattcttgtaac 2484971  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  2484970 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 2484876  T
Q  345 caaattcc 352  Q
    ||||||||    
T  2484875 caaattcc 2484868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558496
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 4558406  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4558407 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4558496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 5198556 - 5198757
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| | ||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5198556 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 5198654  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| || ||    
T  5198655 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaa 5198750  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  5198751 caaattc 5198757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9176671 - 9176498
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  9176671 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 9176573  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9176572 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 9176498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 11435091 - 11435291
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  11435091 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 11435189  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  11435190 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 11435284  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  11435285 caaattc 11435291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587152
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |      ||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca-----atatctcttt 18587062  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18587063 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 18587152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22782935 - 22782736
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  22782935 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 22782837  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |    
T  22782836 ccc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggatca 22782742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771582
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 36771489  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36771490 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc 36771582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831325
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |      ||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgcg-tagaattaggtttgaagactgattcttggaactca-----atatctcttt 15831237  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  15831238 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaat 15831325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 351
Target Start/End: Original strand, 4215489 - 4215643
Alignment:
Q  192 ggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4215489 ggaagaggttgtgacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 4215584  T
Q  292 agagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  4215585 ggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 4215643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11006434 - 11006233
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  11006434 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 11006336  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  11006335 ccc--attgatttctc-tttgtaatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtta 11006241  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  11006240 acaaattc 11006233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18847289 - 18847489
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  18847289 ttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 18847387  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  18847388 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 18847481  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  18847482 acaaattc 18847489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38208907 - 38208669
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaa 217  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||     
T  38208907 ttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgagactttaggtagat 38208808  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt--------tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||||| ||  |||||||| | |||        | ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38208807 ttaagtttgaagattgattattgtaaccc--tttgatatttttttttttattatttaaagttactcattattacagttgaacggagagctgctttctccc 38208710  T
Q  310 tcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
      ||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  38208709 gtagagtaggtcactattaaaccgaactgggtgaacaaatt 38208669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312502
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 15312412  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15312413 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc 15312502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22132588 - 22132389
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22132588 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22132490  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22132489 cc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22132395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5637662 - 5637530
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5637662 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 5637564  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5637563 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54928800 - 54928636
Alignment:
Q  192 ggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    |||||||||| ||  ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54928800 ggaagagatttaggatttaggtaaaattaagtttgaagactgattcttgtaa--cattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaac 54928703  T
Q  292 agagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa-attccgtgtgttctctct 365  Q
     |||||||         |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  54928702 ggagagct--------actcagactaggtcactattagaccgaattggataaacaagtttccatgtgttctctct 54928636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3824767 - 3824627
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3824767 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3824669  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 289  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3824668 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 6133008 - 6133085
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6133008 ttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 6133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 56030580 - 56030657
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  56030580 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagg 56030657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699830
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-tttggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25699830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609511
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| || ||||||  | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattaggtttgtagactatttattgtaa--ccttttgatatct 29609557  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
     |||| |||| ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  29609556 -ttttataaaattacttatcattacagtggaaggaagagctgctctc 29609511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 619644 - 619445
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||| | |||| ||||||||||||   ||| | | |||||| |||     
T  619644 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaa-aattattcttataac 619546  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |  ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  619545 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctccc-ctaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 619451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3937406 - 3937328
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3937406 ttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggt 3937328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11008763 - 11008564
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  11008763 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 11008665  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| ||   ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  11008664 ccc--attgatttc---tttgtaatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 11008572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22134813 - 22134615
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||  || ||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22134813 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22134715  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  22134714 cc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 22134621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5635571 - 5635472
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  5635571 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 5635474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47210939 - 47210780
Alignment:
Q  155 ttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||    
T  47210939 ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgat 47210843  T
Q  255 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
     |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||    
T  47210842 ttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactag 47210780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874475
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||     
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagattcgtaactttgggt-gaattatatttgaagactaattcttgtaacccttct--atatca 4874565  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  4874564 c-tttgtaaagaaactcatcgttataatgtaac-gggagctgcgctctccc-cagagtaggtcaatattgaactgaactgggtaaacaaattc 4874475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566678
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||      |  ||||||| ||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttttaa-----ctcaatatctc-tt 47566588  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  47566589 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgatctctccccccagactaggtcatcattagaccgaac--ggtaaacaaattc 47566678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 53405265 - 53405470
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttga-----agactaattctt 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||  ||||||||| |||||||||| |   ||     |  || ||||||    
T  53405265 ttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattctt 53405364  T
Q  240 gtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    |||| ||   ||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  53405365 gtaaccc--attgatttctcttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 53405458  T
Q  340 gtaaacaaattc 351  Q
     | |||||||||    
T  53405459 atcaacaaattc 53405470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760189
Alignment:
Q  166 tattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgag-acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatccttt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattagttttgaaggctaattcttgcaatccttt 3760189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072081
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 13072081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 27499181 - 27499379
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||| |||| |||| |||||||   || |||| ||| ||||||     
T  27499181 ttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctttgggtataattaggcggga-gacttatttttgtaac 27499279  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |     | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  27499280 c-----taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgctctttccc-cagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaa 27499372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25614027 - 25613952
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25614027 atcattataatggaaaggagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc 25613952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52942644 - 52942601
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942644 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 52942601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Original strand, 11437611 - 11437699
Alignment:
Q  261 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  11437611 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 11437699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 5101167 - 5101265
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  5101167 ttgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 5101263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 349
Target Start/End: Original strand, 16631214 - 16631367
Alignment:
Q  193 gaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaa 290  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| || |||||||||| |||     |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  16631214 gaagagattgagacttgag-tagaatgaggtttgaaggctgattcttgtaaccctca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaa 16631308  T
Q  291 cagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||| |||  |||||||||| |||||    
T  16631309 cggagagctactctctcccccagagtaggtcataattagactaaactgggtaatcaaat 16631367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32274081 - 32274014
Alignment:
Q  200 ttgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaag 269  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  32274081 ttgagactttgagtaaaattaggtttaaagactaattcttgtaa--ctctttcatatctcttttgtaaag 32274014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Original strand, 2880972 - 2881016
Alignment:
Q  205 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatccttt 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2880972 actttcggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaacccttt 2881016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24446736 - 24446678
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  24446736 ttgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 351
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563098
Alignment:
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattc 47563098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Original strand, 49088816 - 49088921
Alignment:
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgt 356  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||  ||     
T  49088816 tcttttgtaatgttagtcatcat-atagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaat-ttgggccgaactgggtcaacaaattctttgc 49088913  T
Q  357 gttctctc 364  Q
    ||||||||    
T  49088914 gttctctc 49088921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Original strand, 36315269 - 36315321
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 346  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  36315269 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Original strand, 36329478 - 36329530
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 346  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  36329478 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 347
Target Start/End: Original strand, 36681763 - 36681827
Alignment:
Q  283 tagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||  || |||| |||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36681763 tagtggaaatgatagcttctctttcccccaaagtaggtcattatttgaccgaactgggtaaacaa 36681827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 115)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16297229 - 16297002
Alignment:
Q  138 gttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattc 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16297229 gttggaattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattc 16297130  T
Q  238 ttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaact 337  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16297129 ttgtaa-cccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaact 16297031  T
Q  338 gggtaaacaaa-ttccgtgtgttctctct 365  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16297030 gtgtaaacaaatttccgtgtgttctctct 16297002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 11081573 - 11081818
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  || |||  ||| ||||    
T  11081573 ttggcaacaaacactagggttgagattgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaatt 11081672  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  11081673 aggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactagg 11081772  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11081773 tcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 11081818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 6332286 - 6332529
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6332286 ttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaatt 6332385  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||  ||||||||    
T  6332386 aggcttgaagacttattcttgtaacccttta--atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactagg 6332483  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6332484 tcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 6332529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13290698 - 13290455
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| |||| |||  | ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||   ||| | ||||||||    
T  13290698 ttggcaacaaacactaggcttgggagtgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaat 13290599  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  13290598 taggtttgaagaataattcttgtaacc--ttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttg 13290502  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13290501 gtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 13290455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24813696 - 24813479
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  24813696 ttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 24813598  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24813597 ccattt--atatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaa 24813500  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  24813499 caaattttgtgtgttctctct 24813479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24817551 - 24817338
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  24817551 ttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 24817454  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  24817453 -ctcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaacttggtaaa 24817355  T
Q  345 caaattccgtgtgttct 361  Q
    | | || ||||||||||    
T  24817354 cgagtttcgtgtgttct 24817338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31435244 - 31435042
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||  ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  31435244 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtg-gaagacttattcttgtaac 31435146  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  31435145 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca--atttgtaccgaactgggtca 31435050  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  31435049 acaaattc 31435042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067194
Alignment:
Q  169 taggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaa 268  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   |||    
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctct--gatatctctttgtaaaa 6067277  T
Q  269 gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6067276 ggaactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattc 6067194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 11355350 - 11355551
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  11355350 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 11355447  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  11355448 -ctcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 11355544  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  11355545 caaattc 11355551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20137306 - 20137105
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  20137306 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 20137208  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20137207 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20137112  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20137111 caaattc 20137105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 6048936 - 6049181
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  6048936 ttggcaacaaacactaggtttgggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaat 6049035  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tatagtggaacagagagctgctctctccctcagact 316  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||  ||| || |||    
T  6049036 taggtttgaagacgtattcttataaccc--tttgatatc-cctttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatact 6049132  T
Q  317 aggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6049133 agctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattccgtgtgttctctct 6049181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40281586 - 40281364
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagacta 233  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40281586 tagggttgggattaattcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagactt 40281487  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg 333  Q
    |||||||||| ||  |||||       |||||||||||||||||| || | |||||||  || | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  40281486 attcttgtaaccc--tttga-------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacag 40281396  T
Q  334 aactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  40281395 aactgtgtaaacaaattttgtgtgttctctct 40281364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13099673 - 13099470
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   || || | ||||||||||     
T  13099673 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gatttattcttgtaac 13099575  T
Q  245 cctttttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  13099574 ccatt--gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 13099478  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  13099477 acaaattc 13099470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4296131 - 4295930
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4296131 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 4296034  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4296033 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtgaa 4295937  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4295936 caaattc 4295930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20626130 - 20626331
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  20626130 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaac 20626228  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20626229 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20626324  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20626325 caaattc 20626331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20630021 - 20630222
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  20630021 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaac 20630119  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20630120 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20630215  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20630216 caaattc 20630222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20642440 - 20642641
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  20642440 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaac 20642538  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20642539 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20642634  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20642635 caaattc 20642641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27832830 - 27832633
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  27832830 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27832732  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||    ||||||||||||    
T  27832731 cc--attgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtca--attt----gaactgggtaaa 27832640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 44724671 - 44724872
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  44724671 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 44724769  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  44724770 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 44724865  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  44724866 caaattc 44724872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Original strand, 7188606 - 7188846
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7188606 ttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaatt 7188705  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    | |   | ||||| ||| || ||| ||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| ||| |    
T  7188706 aag-cgggagacttatttttataaccc--attgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatg 7188802  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  7188803 tcagttttggactgaactaggtaaacaaattttgcgtgttctct 7188846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 350
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046787
Alignment:
Q  204 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctc 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaaccttt--gatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  304 tctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggatagacaaatt 6046787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 21990242 - 21990443
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||   || ||||  |||||||||     
T  21990242 ttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcggga-gactttttcttgtaa- 21990339  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  21990340 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 21990436  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  21990437 caaattc 21990443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 24258555 - 24258732
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||   ||| ||| ||||||||||     
T  24258555 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattagg-cggaaaacttattcttgtaac 24258653  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatc---attatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  24258654 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtca 24258732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Original strand, 25276233 - 25276376
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25276233 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaa 25276331  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276332 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 25276376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 350
Target Start/End: Original strand, 26210615 - 26210836
Alignment:
Q  129 aacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttg 226  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  26210615 aacactagggttgtgattgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttg 26210714  T
Q  227 aagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtat 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||  | ||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||   || ||||| |||||    
T  26210715 aagactgattcttgtaaccctttt-gatacatgtttgg-aaagttactcatcattataatagaacggagagcttctctctcccctggagtaggttagtat 26210812  T
Q  327 ttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  26210813 tggactgaactgggtaaacaaatt 26210836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 38394078 - 38394279
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  38394078 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 38394176  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38394177 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38394272  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38394273 caaattc 38394279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 9680912 - 9681085
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  9680912 ttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa- 9681009  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
     ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9681010 -ctcattgatatatcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 9681085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42331196 - 42330993
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt--cactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  42331196 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 42331098  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||  |||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||     
T  42331097 accc--attgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 42331002  T
Q  343 aacaaattc 351  Q
    |||||||||    
T  42331001 aacaaattc 42330993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20091767 - 20091584
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20091767 ttggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 20091668  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20091667 agg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctctccc 20091584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Original strand, 48457748 - 48457946
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcct 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||     
T  48457748 attcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc- 48457845  T
Q  248 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
      ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  48457846 -attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 48457942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7470219 - 7470018
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  7470219 ttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 7470121  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  7470120 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 7470025  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  7470024 caaattc 7470018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20299552 - 20299753
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 20299650  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20299651 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20299746  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  20299747 caaattc 20299753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 24748686 - 24748888
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  24748686 ttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 24748784  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||| | || |||||||||| || ||    
T  24748785 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaa 24748881  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  24748882 caaattc 24748888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351537
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 25351446  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25351447 ttt-gtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25351537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43253714 - 43253513
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||  ||||||||| | ||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  43253714 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 43253617  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  43253616 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 43253520  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  43253519 taaattc 43253513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410316
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 25410223  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25410224 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 9679125 - 9679352
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaa-attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaat 218  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  9679125 ttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaat 9679224  T
Q  219 taggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactag 318  Q
    ||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||  | ||||||||    
T  9679225 tagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactag 9679320  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||| | || ||||  ||||||| |||||||||    
T  9679321 gtcaat-ttggaccagactgggtcaacaaattc 9679352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27306427 - 27306213
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| |||| |||||||   || |||| ||||||| ||     
T  27306427 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcggga-gacttattcttgcaac 27306329  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  27306328 ccatt--gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaa 27306233  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  27306232 caaatt-cttgtgttctctct 27306213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 443687 - 443889
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  443687 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaat 443785  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  443786 cc--attgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 443881  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  443882 acaaattc 443889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 320
Target Start/End: Original strand, 21680119 - 21680290
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |   | ||| | ||||||||||     
T  21680119 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaatta-gacgggagatttattcttgtaac 21680217  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggt 320  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21680218 cc--aatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggt 21680290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37412324 - 37412133
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  37412324 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 37412227  T
Q  245 cctttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
     ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||||    
T  37412226 -ctcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaat-ttggaccgaactgg 37412133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44857
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||| | | | ||||| ||||||||||     
T  44656 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatg-tgggagacttattcttgtaac 44754  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  44755 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 44850  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  44851 caaattc 44857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3878669 - 3878870
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3878669 ttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3878767  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| || | | || ||||||||||||| ||    
T  3878768 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaat-ttggaccgaactgggtcaa 3878863  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3878864 caaattc 3878870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7092409 - 7092209
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  7092409 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 7092311  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  7092310 cc--attgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 7092216  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  7092215 caaattc 7092209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 20297454 - 20297655
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||||||     
T  20297454 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaatagg-tgggagacttattcttgtaac 20297552  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  20297553 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 20297648  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  20297649 taaattc 20297655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21592340 - 21592139
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  21592340 ttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa- 21592243  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  21592242 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 21592146  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  21592145 caaattc 21592139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 28487645 - 28487846
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  28487645 ttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 28487743  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  28487744 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 28487839  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28487840 caaattc 28487846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40836939 - 40836739
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  40836939 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 40836841  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40836840 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 40836746  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  40836745 caaattc 40836739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 35721 - 35921
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  35721 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 35819  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  35820 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 35915  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  35916 caaatt 35921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320033
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 3320139  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  | |||||    
T  3320138 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 3320040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324781
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 3324887  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  | |||||    
T  3324886 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 3324788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 356
Target Start/End: Original strand, 24465605 - 24465835
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24465605 ttggcaacaaacactagggttgaa-ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaatt 24465703  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||| | | ||| | |||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |    |||||||||||| ||||||||     
T  24465704 agg-tgggagatttattcttttaa--ctcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactaga 24465799  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgt 356  Q
    ||| || |  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24465800 tcaata-tgaaccgaactgagtaaacaaatttcgtgt 24465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 2120882 - 2121085
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2120882 ttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 2120980  T
Q  243 atcctttttgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    |      |  ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  2120981 a-----ctcaatatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattggg 2121074  T
Q  341 taaacaaattc 351  Q
    |||||||||||    
T  2121075 taaacaaattc 2121085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 1850073 - 1850274
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  || ||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1850073 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1850171  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1850172 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1850267  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1850268 caaattc 1850274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7472177 - 7471976
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||  ||||| ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||     
T  7472177 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggac-acttattcttgtaac 7472079  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  7472078 ccatt--gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 7471983  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  7471982 caaattc 7471976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 18345633 - 18345834
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18345633 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18345731  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||| ||    
T  18345732 cc--attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtcaa 18345827  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18345828 caaattc 18345834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357231
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  |||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc 25357140  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||| |  |||| || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25357141 -tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25357231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 25405486  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25405487 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7094657 - 7094456
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  7094657 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 7094559  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  7094558 cc--attgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 7094463  T
Q  345 caaattc 351  Q
     ||||||    
T  7094462 taaattc 7094456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108360
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 22108268  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22108269 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 22108360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22828815 - 22828672
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||    
T  22828815 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctc 22828719  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct 306  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22828718 ttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550120
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 40550028  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40550029 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 40550120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512522
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 44512611  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44512610 -gtaaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccct-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 44512522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069963
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 7069873  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7069874 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 7069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39146184 - 39145982
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  39146184 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 39146087  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttg-accgaactgggtaa 343  Q
     |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| | ||  | |||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  39146086 -cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtca--atttgtaccgaactgggtca 39145990  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  39145989 acaaattc 39145982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3035813 - 3036017
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaaga---gattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |  || |||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  3035813 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtggga-gacttattcttgt 3035911  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    || || ||  ||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  3035912 aacccatt--gatttctcttttgcaacgatactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 3036007  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
     |||||||||    
T  3036008 caacaaattc 3036017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1047121 - 1046921
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1047121 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1047023  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1047022 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1046928  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1046927 caaattc 1046921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1049492 - 1049292
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1049492 ttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1049394  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1049393 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1049299  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1049298 caaattc 1049292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7351849 - 7351649
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  7351849 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 7351751  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  7351750 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 7351656  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  7351655 acaaatt 7351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137371
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 22137279  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22137280 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 22137371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31156108 - 31155908
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31156108 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 31156010  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  31156009 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31155915  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  31155914 acaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552398
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagact-attcttgtaaccc--attgatttc 40552306  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40552307 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 40552398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 40946420 - 40946621
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  40946420 ttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 40946517  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40946518 -cctattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 40946614  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  40946615 caaattc 40946621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 42223250 - 42223451
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   |||| | ||||||||||   ||| ||| ||||||| ||     
T  42223250 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattagg-cggaaaacttattcttgaaa- 42223347  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  42223348 -cctattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-tttgatcgaactgggtcaa 42223444  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  42223445 caaattc 42223451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074970
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 7074880  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7074881 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaat 7074970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247155
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |      ||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca-----atatctcttt 30247066  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30247067 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatt 30247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006849
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||      |  |||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaa-----ctcaatatctc 42006756  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42006757 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc 42006849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttc 2935470  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2935471 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Original strand, 11084442 - 11084547
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   ||||| |||| ||||    
T  11084442 ttggcaacaaacaatagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaatt 11084541  T
Q  220 aggttt 225  Q
    ||||||    
T  11084542 aggttt 11084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 21678158 - 21678372
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||| |||||| ||||| ||||||   | ||||  ||||||||||     
T  21678158 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattagg-cgggagacgtattcttgtaac 21678256  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||| | | || ||||||||||||  ||    
T  21678257 cc--attgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaat-ttggaccgaactgggacaa 21678352  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  21678353 caaatt-cttgtgttctctct 21678372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7349470 - 7349296
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  7349470 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 7349372  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcag 323  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7349371 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 7349296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378502
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 8378593  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8378592 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25542622 - 25542821
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  25542622 ttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaac 25542719  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| | | || ||||||||||||| ||    
T  25542720 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaat-ttggaccgaactgggtcaa 25542814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 28485658 - 28485858
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | ||||  ||| |||||||   || || | |||||||||||    
T  28485658 ttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcggga-gatttattcttgtaat 28485756  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28485757 ccatt--gatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 28485851  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28485852 caaattc 28485858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 38396727 - 38396927
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  38396727 ttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 38396825  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38396826 cc--attgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38396920  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38396921 caaattc 38396927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540994
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 15541084  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  15541083 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 15540994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagact-attcttgtaaccc--attgatttc 9027281  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9027280 tc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Original strand, 11757322 - 11757462
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  11757322 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 11757420  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 289  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757421 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 351
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295741
Alignment:
Q  192 ggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaac 26295682  T
Q  292 agagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||   |||||||||||  |||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||    
T  26295683 agatgactgctctctcctccagactaggtcaat-ttggactgaactggataaacaaattc 26295741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546876
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 34546876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143863
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggcagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 44143953  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||   ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  44143952 tgtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagttgctctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaattggataaacaaattc 44143863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2990813 - 2990627
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||   ||    |    
T  2990813 aaacactgttaggattgagtatcttggtcacatgaagagattcgggattttggtagaaataggtttgaagcctgattcttgtcaccctttggaat----c 2990718  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatca--ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2990717 ttttgtaaagttactcaaaaaattagagtagaacggagagttgctccctcccccagagtaggtcggtattggaccgaactgggtaaacaaa 2990627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 347
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||      |  |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaa-----ctcaatatctc 21369735  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
     |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21369736 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||| ||||||||| || ||  ||| ||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacta-ttcttgtaacccatt--gatttc 1606581  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1606582 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 22393916 - 22394016
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||  ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  22393916 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccctagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtaaacaaat 22394014  T
Q  350 tc 351  Q
    ||    
T  22394015 tc 22394016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 2075226 - 2075301
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2075226 atcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 2075301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7464590 - 7464515
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7464590 atcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 7464515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44010821 - 44010747
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44010821 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt 44010747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 26804664 - 26804741
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  26804664 ttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 26804741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Original strand, 22392529 - 22392608
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagat 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22392529 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310119
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgag-acttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||| |    
T  12310234 aacaaacactagggttgggattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttcgaactttgggtataattatg 12310135  T
Q  223 tttgaagactaattct 238  Q
    |||||||||| |||||    
T  12310134 tttgaagactgattct 12310119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22251723 - 22251602
Alignment:
Q  169 taggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct----cttttg 264  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||   || |||| |||||||||| || ||  |||||||    ||||||    
T  22251723 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccatt--gatatctttctcttttg 22251627  T
Q  265 taaagttactcatcattatagtgga 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22251626 taaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44016733 - 44016657
Alignment:
Q  275 catcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44016733 catcattataatggaacggcgagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaattc 44016657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349017
Alignment:
Q  183 ttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 282  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattattgtaacccatt--gatatctcttttgtaaaattactcatcatta 6349008  T
Q  283 tagtggaac 291  Q
     ||||||||    
T  6349009 cagtggaac 6349017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22280434 - 22280359
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  22280434 ttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaacagaaagctgctctc-accacagactagatcagtat 22280359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20091196 - 20091138
Alignment:
Q  306 tccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  20091196 tcccccagactaggtcagtattggaccgaactggataaataaatt-cgtgtgttctctct 20091138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 6349021 - 6349093
Alignment:
Q  276 atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  6349021 atcattacagtggaacggagagttgctctctccc-ca-actaggttagtattagatcgaactgggtaaacaaatt 6349093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 9190048 - 9190101
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  9190048 gagagctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 28617265 - 28617318
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28617265 gagagctgctctctcccccagagtaggtca-tattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Original strand, 8260584 - 8260667
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgta 242  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |  |||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8260584 aaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagattttggattttgtatagaattgggtttgaagattgattcttgta 8260667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2580447 - 2580394
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  2580447 gagagctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21983341 - 21983288
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  21983341 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 351
Target Start/End: Original strand, 45366673 - 45366774
Alignment:
Q  249 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  45366673 tttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcatcacattggaacatagagctgctatctccttcatagtaggtaaatattgaaccgaattggataaacaaa 45366771  T
Q  349 ttc 351  Q
    |||    
T  45366772 ttc 45366774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7392883 - 7392850
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7392883 ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaat 7392850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 351
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759420
Alignment:
Q  299 tgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 11759420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1623
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  1860 aacaaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 1761  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
     || || | |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||    
T  1760 gga-gagttattcttgtaacccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagt 1664  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1663 ttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 1623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 153)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36871498 - 36871280
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36871498 attgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaa 36871399  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36871398 ccctttgt--tatctcttt-gtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaa 36871302  T
Q  344 acaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  36871301 acgaatttcgtgtgttctctct 36871280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13420400 - 13420186
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  13420400 aacaaacactagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-c 13420303  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
     | ||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13420302 gggagacttattcttgtaa--ctcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctcac-cagactaggtcagt 13420206  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     || ||||||| ||||||||    
T  13420205 tttggaccgaaatgggtaaa 13420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 561997 - 561754
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  561997 ttggcaacaaacactagggttcaggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaatt 561898  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccct-cagactag 318  Q
    ||| | | ||||| ||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  561897 agg-tgggagacttattcttgtaa--gtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactag 561801  T
Q  319 gtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  561800 gtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttctctct 561754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1620668 - 1620441
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagacta 233  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1620668 tagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggcta 1620569  T
Q  234 attcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg 333  Q
     ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  1620568 gttcttgtaaccc--tttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggacca 1620472  T
Q  334 aactgggtaaacaaattccgtgtgttctctc 364  Q
    |||| ||| |||||| |  ||||||||||||    
T  1620471 aactaggtgaacaaactttgtgtgttctctc 1620441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14634647 - 14634435
Alignment:
Q  136 gggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  14634647 gggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgat 14634548  T
Q  236 tcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaa 335  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||  ||||  |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  14634547 tcttgtaaacc--tttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaa 14634450  T
Q  336 ctgggtaaacaaatt 350  Q
    || ||||||||||||    
T  14634449 ctaggtaaacaaatt 14634435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 120 - 364
Target Start/End: Original strand, 53597273 - 53597514
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  53597273 ttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaatt 53597372  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| || ||||||    
T  53597373 aggcaag-agacttattcttgtaaccc--gttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactagg 53597469  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctc 364  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  53597470 tcagtattggaccgaattgggtaagctaatttcgtgtgttctctc 53597514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 31151382 - 31151623
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31151382 ttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaatt 31151481  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   |  |||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31151482 aggcgggt-gacttattcttgtaaccct----gatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactagg 31151576  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    ||||| || | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31151577 tcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctct 31151623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Original strand, 25635418 - 25635657
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25635418 ttggcaacaaacactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 25635517  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||   | |||||    
T  25635518 agg-cggaagacttattcttgtaaccc--attgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctagg 25635614  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctct 363  Q
     || | || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25635615 ccaat-ttggaccaaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctct 25635657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28761624 - 28761421
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||     
T  28761624 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaac 28761526  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  28761525 ccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaa 28761428  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  28761427 caaattc 28761421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 53917859 - 53917658
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  53917859 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 53917761  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  53917760 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 53917665  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  53917664 caaattc 53917658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 1313471 - 1313672
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  1313471 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 1313569  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1313570 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1313665  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1313666 caaattc 1313672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43423658 - 43423457
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  43423658 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaa- 43423561  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  43423560 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 43423464  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  43423463 caaattc 43423457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 36011889 - 36012090
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||     
T  36011889 ttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaatta-gttgggagacttattcttgtaac 36011987  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  36011988 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 36012083  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  36012084 caaattc 36012090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 17795296 - 17795537
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  17795296 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaatt 17795394  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||  ||||||||    
T  17795395 agg-cggaagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactagg 17795491  T
Q  320 tcagtatttg-accgaactgggtaaacaaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    |||  ||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17795492 tca--atttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctct 17795537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 19103736 - 19103977
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  19103736 ttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaatt 19103834  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||  ||||||||    
T  19103835 agg-cggaagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactagg 19103931  T
Q  320 tcagtatttg-accgaactgggtaaacaaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    |||  ||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19103932 tca--atttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctct 19103977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 351
Target Start/End: Original strand, 23633493 - 23633716
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23633493 ttggcaacaaacactagggttggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 23633590  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23633591 agg-cggaagacttattcttgtaaccc--gatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctccc-cagactagg 23633685  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  23633686 tcaat-ttagaccgaaatgggtaaacaaattc 23633716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 45883001 - 45883203
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  45883001 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 45883098  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctc-agactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  45883099 -ctcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 45883195  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  45883196 acaaattc 45883203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3314746 - 3314948
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3314746 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 3314844  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3314845 cc--attgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3314941  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3314942 caaattc 3314948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4308476 - 4308275
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4308476 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 4308378  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4308377 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 4308282  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4308281 caaattc 4308275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 27420686 - 27420929
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaa 217  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||| | | ||| |||||||||| |||||||||| |||  ||| |||| ||    
T  27420686 ttggcaacaaacactatggttgggattgattcacgctggagaaatactattagaactcagtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataa 27420785  T
Q  218 ttaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagacta 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || | ||    
T  27420786 ttaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaat----cttttgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagta 27420881  T
Q  318 ggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27420882 ggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattccatgtgttctctct 27420929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Original strand, 11170465 - 11170667
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  11170465 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 11170563  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||| |    
T  11170564 ccc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgggccgaactgggtca 11170659  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  11170660 acaaattc 11170667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 316
Target Start/End: Original strand, 13419916 - 13420110
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| | | ||| |||||||||    
T  13419916 ttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagact 316  Q
     |||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||| ||||||    
T  13420016 tggttggaagaataatttttgtaa-catttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 1321541 - 1321742
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1321541 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1321639  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1321640 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1321735  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1321736 caaattc 1321742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5926959 - 5926746
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5926959 ttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 5926861  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || |||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||   |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5926860 ccattt--atatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5926765  T
Q  345 caaattccgtgtgttctct 363  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  5926764 caaattctttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6484422 - 6484623
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||||     
T  6484422 ttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaa-acttattcttgtaac 6484520  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6484521 cc--attgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6484616  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6484617 caaattc 6484623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9604802 - 9604601
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  9604802 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 9604704  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  9604703 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactaggtcaa 9604608  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  9604607 caaattc 9604601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10956222 - 10956021
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  10956222 ttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 10956125  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10956124 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10956028  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  10956027 caaattc 10956021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27101376 - 27101175
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||     
T  27101376 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 27101278  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  27101277 cc--attgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 27101182  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  27101181 caaattc 27101175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 38890102 - 38890303
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  38890102 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 38890200  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  38890201 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 38890296  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  38890297 caaattc 38890303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 53915691 - 53915490
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  53915691 ttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 53915593  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||    
T  53915592 cc--attgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-tttgactgaactgggtcaa 53915497  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  53915496 caaattc 53915490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Original strand, 18162724 - 18162925
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  18162724 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 18162822  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggta 342  Q
     ||   ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| ||     
T  18162823 ccc--attgatatttattttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca--atttggacgaactgtgtc 18162917  T
Q  343 aacaaatt 350  Q
    ||||||||    
T  18162918 aacaaatt 18162925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 43226147 - 43226361
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  43226147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 43226245  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  43226246 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 43226341  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  43226342 caaatt-cttgtgttctctct 43226361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10958518 - 10958317
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  10958518 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa- 10958421  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10958420 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcttcat-atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10958324  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  10958323 caaattc 10958317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18099365 - 18099164
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18099365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 18099267  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  18099266 cc--attgatttctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaata-tggaccgaactgggtcaa 18099171  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  18099170 caaattc 18099164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 43228353 - 43228554
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  43228353 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 43228451  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| | ||    
T  43228452 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 43228547  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  43228548 caaattc 43228554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51727202 - 51727001
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  51727202 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 51727104  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  51727103 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 51727008  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  51727007 caaattc 51727001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 365
Target Start/End: Original strand, 7768624 - 7768849
Alignment:
Q  137 ggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaatt 236  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||   | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7768624 ggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaatt 7768723  T
Q  237 cttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaac 336  Q
    |||||||  | |||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || | | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||     
T  7768724 cttgtaa--ccttttaatat-acctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaat 7768820  T
Q  337 tgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  7768821 tgggtaaaaaaaattcgtgtcttctctct 7768849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913951
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 29914039  T
Q  263 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29914038 -gtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 29913951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 746819 - 747019
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  746819 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 746917  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  746918 ccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 747012  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  747013 acaaatt 747019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 364
Target Start/End: Original strand, 11066651 - 11066867
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11066651 attgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaa-actgattcttgt 11066749  T
Q  242 aatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    || | |||   || |    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11066750 aaacatttggaatgt----tttgtatagttactcatcattatagtggaacatagagctgctctcttc--cagagtaggtcagtattgaaccgaactgggt 11066843  T
Q  342 aaacaaa-ttccgtgtgttctctc 364  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||    
T  11066844 aaacaaacttttgtgtgttctctc 11066867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18097095 - 18096894
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  18097095 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 18096998  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     | | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  18096997 -cctattgatttcccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 18096901  T
Q  345 caaattc 351  Q
    | |||||    
T  18096900 cgaattc 18096894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 25533504 - 25533705
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25533504 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 25533602  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  25533603 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaa 25533698  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  25533699 caaattc 25533705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 42990366 - 42990567
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  42990366 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 42990463  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  42990464 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 42990560  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  42990561 caaattc 42990567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43421610 - 43421409
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||||||||||    || |||| ||||||||||     
T  43421610 ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacggga-gacttattcttgtaac 43421512  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  43421511 ccatt--gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 43421416  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  43421415 caaattc 43421409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878167
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 47878257  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47878256 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattc 47878167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 53468652 - 53468447
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||    
T  53468652 attgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaa 53468554  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcag--actaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| |||  ||||||||| | || |||||||||||||    
T  53468553 ccc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 53468457  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
     |||||||||    
T  53468456 caacaaattc 53468447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 4666576 - 4666777
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttga-agactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |  || ||||||||||    
T  4666576 ttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaa 4666675  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
    |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   || |||||||||||| | || ||||||||||| | |    
T  4666676 tcc--attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatca 4666769  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  4666770 acaaattc 4666777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10084584 - 10084384
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  10084584 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaac 10084486  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10084485 cc--gttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10084390  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  10084389 caaatt 10084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32264234 - 32264060
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  ||  ||||| |||||||||| |   || |||| ||||||||||     
T  32264234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcggga-gacttattcttgtaac 32264136  T
Q  245 cctttttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtc 321  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32264135 ccatt--gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 32264060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 1674009 - 1674242
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  1674009 ttggcaacaaacactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaat 1674108  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    | |   | ||||| |||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||     ||    |||||| ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  1674109 a-gacgggagacttattcgtgtaaccc--tttgatatgtcttttgtaaagttact-----tt----tggaacggatggctgctctctccaccagactagg 1674196  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  1674197 tcagtattagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtattctctct 1674242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612761
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |      ||||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca-----atatctcttt 10612864  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttc 360  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10612863 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt-cttgtgttc 10612766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 303
Target Start/End: Original strand, 6561872 - 6562028
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  6561872 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 6561970  T
Q  245 cctttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctc 303  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6561971 cc--attgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997063
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataat--tctctaatatctc 16996971  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||   ||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16996972 tttgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattc 16997063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1626878 - 1626677
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  1626878 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaac 1626780  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |  || ||||||||| ||| ||    
T  1626779 cc--attgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtc-gatttggaccgaactaggtcaa 1626684  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1626683 caaattc 1626677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48361866 - 48361665
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||  |||||||||     
T  48361866 ttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattagg-cggaagactttttcttgtaa- 48361769  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||| ||    
T  48361768 -ctcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaa 48361672  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  48361671 caaattc 48361665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094073
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 10094163  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10094162 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10191504 - 10191305
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  10191504 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggaggga-gacttattcttgtaac 10191407  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||   || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  10191406 ccgttc--atttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 10191311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 15780933 - 15781142
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  15780933 ttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaac 15781031  T
Q  245 ccttt--ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagag---ctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    || ||  |  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |   |||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||    
T  15781032 ccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaat-ttggaccgaactgg 15781130  T
Q  340 gtaaacaaattc 351  Q
    || |||||||||    
T  15781131 gtcaacaaattc 15781142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25688356 - 25688164
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  25688356 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 25688258  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  25688257 cc--attgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 25688164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544456
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 27544366  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27544367 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 38210432 - 38210631
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  38210432 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 38210530  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
      ||  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  38210531 --ctcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 38210625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28102197 - 28102037
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  28102197 ttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 28102099  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccc 309  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  28102098 cc--attgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893649
Alignment:
Q  168 ttaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaa 267  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||   |  ||||||| |||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc---tcaatatctc-tttgtaa 13893564  T
Q  268 agttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  13893565 agaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtcattattaga-cgaactgggtaaacatattc 13893649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 24181483 - 24181659
Alignment:
Q  186 gtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 285  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    || |||| |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181483 gtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattagacggga-gacttattcttgtaacccatt--gatatttcttttgtaaagttactcatcattatag 24181579  T
Q  286 tggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| ||   |||||||||||  || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24181580 tggaacggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 24181659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4104090 - 4103890
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4104090 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 4103992  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4103991 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 4103897  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4103896 caaattc 4103890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 5191715 - 5191914
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5191715 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagactcattcttgtaac 5191813  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5191814 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5191907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5522821 - 5522621
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5522821 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 5522723  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5522722 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5522628  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  5522627 caaattc 5522621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 6231863 - 6232063
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  6231863 ttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 6231960  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||| |||||| | || ||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  6231961 cc--attgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 6232056  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  6232057 caaattc 6232063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595030
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |      ||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca-----atatctcttt 10595120  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10595119 -gtaaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 10595030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10621725 - 10621525
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  10621725 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 10621627  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  10621626 ccc--attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcag-attggaccgaactgggtca 10621532  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  10621531 acaaatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897191
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 10897101  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10897102 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 10897191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 30005903 - 30006104
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  30005903 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 30006000  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| ||| | || ||||||||||||| ||    
T  30006001 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaat-ttggaccgaactgggtcaa 30006097  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  30006098 caaattc 30006104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46966787 - 46966645
Alignment:
Q  204 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctc 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46966787 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccattt--gatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccc 46966691  T
Q  304 tctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  46966690 tctccc-cagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaatt 46966645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100090
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 10100180  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10100179 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200953
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 10201043  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| | ||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10201042 tttgg-aaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207999
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 10208089  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10208088 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 50494061 - 50494260
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  50494061 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaa 50494159  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  50494160 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 50494254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 51943433 - 51943648
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||   | |||||  |||||||||     
T  51943433 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-cgggagact-tttcttgtaa- 51943529  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  51943530 -ctcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 51943626  T
Q  345 caaattc-cgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  51943627 caaattctcttgtgttctctct 51943648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168364
Alignment:
Q  147 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || || ||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  247 tttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 346  Q
       ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||| ||| ||||    
T  11168264 --attgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaacttggtcaaca 11168359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193410
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 54193322  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  || |||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  54193323 -gtaaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 24979769 - 24979971
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  24979769 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa- 24979866  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     |   || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| | || || |||||||||| |    
T  24979867 -caaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggatcgaactgggtca 24979963  T
Q  344 acaaattc 351  Q
    ||||||||    
T  24979964 acaaattc 24979971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Original strand, 39715531 - 39715663
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||     
T  39715531 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgcaac 39715629  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715630 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 880646 - 880445
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||| | |||| |||||||||| |   | ||| | ||||||||||     
T  880646 ttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaatta-gacgggagagttattcttgtaac 880548  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||| ||    
T  880547 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtcaa 880452  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  880451 caaattc 880445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 889967 - 889779
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  889967 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattagg-caggagagttattcttgtaac 889870  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgg 339  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  889869 cc--actgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 3859590 - 3859790
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  3859590 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 3859687  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3859688 -cacattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 3859783  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  3859784 caaattc 3859790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535801
Alignment:
Q  168 ttaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaa 267  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||||| ||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggaattg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt-gtaa 4535714  T
Q  268 agttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctcc-ctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4535715 agaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4535801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858729
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagt--cttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 5858637  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5858638 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact-ggtaaacaaattc 5858729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6063641 - 6063441
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  6063641 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 6063543  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  6063542 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcc 6063448  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  6063447 acaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7606782 - 7606582
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  7606782 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 7606685  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     |   ||||| |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  7606684 -cacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 7606589  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  7606588 caaattc 7606582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 25388968 - 25389167
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||  ||||||||||    
T  25388968 ttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacatattcttgtaa 25389065  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  25389066 ccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 25389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761982
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  ||||||| ||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaatatctc-tt 27762073  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27762072 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 27761982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51674961 - 51674760
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  51674961 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaat 51674863  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||| ||||||||||||| || || |||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  51674862 cc--attgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 51674767  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  51674766 caaattc 51674760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 458346 - 458545
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  458346 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 458444  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  458445 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-gttggaccgaactgggtca 458539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38003055
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 38002962  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38002963 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc 38003055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 47149089 - 47148917
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  47149089 ttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 47148992  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  47148991 cc--attgatatctcttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtca 47148917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007540
Alignment:
Q  172 gattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagtt 271  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattaggttt----------tcttgtaa--ctctttgacatctcttttgtaaagtt 11007596  T
Q  272 actcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatt 327  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  11007595 actcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcagtatt 11007540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 26763021 - 26763244
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 241  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||  ||| ||||||| |  |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26763021 ttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattaggtttgaagtttaattattgt 26763120  T
Q  242 aatcc-tttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactggg 340  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || | ||||    ||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  26763121 aacccttttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattataatggaaaatagagttgttttctcatcgagactagatcattattggatcgaactggg 26763219  T
Q  341 taaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    || |||||||  |||||||||||||    
T  26763220 tagacaaattttgtgtgttctctct 26763244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 351
Target Start/End: Original strand, 32219122 - 32219348
Alignment:
Q  123 gtaacaaacaatagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatta 220  Q
    |||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  32219122 gtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaatta 32219221  T
Q  221 ggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    ||   ||||||| ||| |||||| ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||| | ||||||| |    
T  32219222 gg-cggaagacttatttttgtaaccc--attgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatg 32219317  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     || | || ||||||||||||| |||||||||    
T  32219318 ccaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 32219348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt 54188605  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  54188606 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccc-cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625982
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcatt-----atctc 22626073  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22626072 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 22625982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 29956748 - 29956907
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  29956748 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 29956845  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctcc 308  Q
     ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29956846 -ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35918138 - 35917971
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| ||||   | ||||| ||||||||||     
T  35918138 ttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaatagg-agggagacttattcttgtaac 35918040  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagact 316  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35918039 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgctctctccctcagact 35917971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 5886262 - 5886461
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  5886262 ttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| | || |||| || ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5886360 cc--attgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5886454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 5899735 - 5899934
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| | |||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||     
T  5899735 ttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 5899832  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    || ||  ||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  5899833 ccatt--gatttctcttt-gcaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 5899927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15823778 - 15823643
Alignment:
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |  |    
T  15823778 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaacccttt--gacatctcttt-gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaa 15823682  T
Q  313 gactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    || || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15823681 gagtaagtcaatattggaccgaattgggtaaacaaattc 15823643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28413227 - 28413027
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  28413227 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 28413129  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |    
T  28413128 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaattaggtca 28413034  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  28413033 acaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Original strand, 54884217 - 54884359
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||   ||||||||||   || |||| ||| |||||||    
T  54884217 ttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggaggga-gacttatt-ttgtaat 54884314  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 291  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54884315 c--tattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 54884359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Original strand, 455969 - 456168
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  455969 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 456067  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| |    
T  456068 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-gggttggaccgaactgggtca 456162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12268159 - 12267969
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  12268159 ttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa- 12268062  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
                ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||| ||    
T  12268061 ------------ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaat-ttggaccgaactgggtcaa 12267976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47882878
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |  | |||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ctcaaaatctc 47882971  T
Q  260 ttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  47882970 -tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacataaagctgctctctcccctagactaagtcatcattagatcgaactgggtaaacaaattc 47882878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6065991 - 6065791
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  6065991 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 6065893  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  6065892 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcag-attggacagaactgggtca 6065798  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  6065797 acaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079704
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      |||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggactta-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctc 11079610  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccg-aactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || | |||||||||||||    
T  11079611 ttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaaattaggtaaacaaattc 11079704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 364
Target Start/End: Original strand, 25634031 - 25634164
Alignment:
Q  228 agactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatt 327  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||  ||||||||| ||  |||    
T  25634031 agacttattcttgtaatccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggaca--att 25634126  T
Q  328 tg-accgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctc 364  Q
    || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25634127 tgcaccgaactaggtaaacaaattttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 349
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303493
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||     |||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatt-----atctc 6303403  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  6303404 ttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccaaactgggtaaacaaat 6303493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949256
Alignment:
Q  164 actattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctctttt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||     
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaacttg-ggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctcttt- 10949346  T
Q  264 gtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  10949345 gtaaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagactgaactggataaacaaattc 10949256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48390437 - 48390298
Alignment:
Q  208 tttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |      ||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48390437 tttggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctctttc-taaagagactcatatcattatagtggaacggagagctgctctc 48390344  T
Q  306 tccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  48390343 tcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc 48390298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 362
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418259
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||     | |  |||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggacttg-gctagagttaggtttgaagactgattcttgta-----tctcaatatctc 7418157  T
Q  260 ttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtg 357  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7418158 ttt-gtaaagaaactcatatcattagagtggaacagagagctgctctctccc-catagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tccttgtg 7418254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031313
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |      ||||||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca-----atatctcttt 20031404  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagt-ggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  20031403 -gtaaagaaactcatatcattatagttggaacggagagctgctctctccccaagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc 20031313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22114500 - 22114368
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || || ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  22114500 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 22114402  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 280  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22114401 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatcat 22114368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31021286 - 31021142
Alignment:
Q  217 attaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagact 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  31021286 attaggtttgaagactaattcttgtaa-cccttttaacatctc-tttgtaaagttactcatcattata-ttgaacggagggctgctctcaccc-cagact 31021191  T
Q  317 aggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||| ||| | |||||  |||||||    
T  31021190 aggtcagtataggatcgaactaggtaaaaaaaattcgtgttctctctct 31021142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 26720610 - 26720810
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| |||     
T  26720610 ttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttttaac 26720707  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||  |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||  ||| ||||||| | || ||||||||||||| |     
T  26720708 cc--tttgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcac 26720803  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  26720804 caaattc 26720810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 35777483 - 35777561
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35777483 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 35777561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27635751 - 27635652
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  27635751 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 27635654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462282
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 16462282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 3329896 - 3330078
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||  ||||||| ||    
T  3329896 cactattaggattcagttagttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa-----ttcaatatctc-tt 3329988  T
Q  263 tgtaaagttactc--atcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||  ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3329989 tgtaaagaaactcatatcattaaagtggaacggagagctgctctgtccccca-aataggtcatcattagaccgaactgggtacacaaattc 3330078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28137502 - 28137424
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  28137502 attgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 28137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 53591246 - 53591418
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  ||| |||||  || ||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||||    
T  53591246 ttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttctaat 53591344  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    ||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  53591345 cc--attgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctccc-cagactaggtca 53591418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 42297793 - 42297699
Alignment:
Q  212 gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctctt--ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctct 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||    
T  42297793 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc--tttgatatctttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaacgaagagctgctctct 42297699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54691769 - 54691596
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||  | ||||  || ||||||||   | ||||| ||||||||| |    
T  54691769 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattagg-cgggagacttattcttgtatt 54691671  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
      |  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  54691670 --tcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtca 54691596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 351
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307023
Alignment:
Q  161 aacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttgg-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||| || |||||| ||||||||||   || || | |||||||||| || ||  ||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattg-gagttttgggtagaattaggcggga-gagttattcttgtaacccatt--gatatctc 3306934  T
Q  260 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||||||||   ||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||    
T  3306935 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcc--tagactaggtcaat-ttggaccgaactaggttaacaaattc 3307023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28100236 - 28100159
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  28100236 ttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 28100159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 28181084 - 28181161
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  28181084 ttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg 28181161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021284
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt 201  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttgatcacatgaagagatt 31021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 351
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849322
Alignment:
Q  270 ttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 41849322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47701764 - 47701665
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || || |||||||| | |||||||    
T  47701764 ttgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggatcgaactggatcaacaaat 47701667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 24177313 - 24177385
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactg 192  Q
    |||| |||||||| || |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24177313 ttggcaacaaacactaaggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcactg 24177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 350
Target Start/End: Original strand, 23941862 - 23942027
Alignment:
Q  183 ttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 280  Q
    |||||||| |||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||    |||||||||||||||||||  | |    
T  23941862 ttggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattaggtttgaatacttattcttgtaa-ccgtttggaa---tcttttgtaaagttactcaaaaat 23941957  T
Q  281 tatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||  || | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23941958 tatagtggagcgaagagttgctctctcctccatagtaggtcagtattggaccaaactgggtaaataaatt 23942027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 53973830 - 53973725
Alignment:
Q  192 ggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53973830 ggaagagattcgagactttaggtagaattatgtttaaagaccgattcttgta-tccattta-atatcttttttgtaaagttactcatcaatgtagtggaa 53973733  T
Q  291 cagagagc 298  Q
    | ||||||    
T  53973732 cggagagc 53973725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 222
Target Start/End: Original strand, 23637060 - 23637162
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| |||||||    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||  |||||| |||||||||    
T  23637060 ttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaatt 23637159  T
Q  220 agg 222  Q
    |||    
T  23637160 agg 23637162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 190
Target Start/End: Original strand, 25633957 - 25634027
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcac 190  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25633957 ttggcaacaaacactagggctgggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcac 25634027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27703331 - 27703178
Alignment:
Q  181 tcttggtcactggaagagattgag-acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca 279  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||   |||||||||||||||| | | ||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  27703331 tcttggtcacggggagagattcaggactttgaatagaattaggtttgaa-attgatttttgtaa--ctctttgatatctcttt-gtaaagaaactcataa 27703236  T
Q  280 ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaact 337  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||    
T  27703235 ttatagtggaaaagagacatgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaact 27703178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919109
Alignment:
Q  281 tatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattc 35919109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4560479 - 4560402
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  4560479 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattagg 4560402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 42992434 - 42992532
Alignment:
Q  250 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| | | | | ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcat-atagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 42992531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 42992348 - 42992390
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42992348 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 42992390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 53894104 - 53894050
Alignment:
Q  297 gctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  53894104 gctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcc 53894050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 8370516 - 8370569
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  8370516 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21711280 - 21711227
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  21711280 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 27974982 - 27975035
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  27974982 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 27986476 - 27986529
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  27986476 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1618868 - 1618824
Alignment:
Q  134 tagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1618868 tagggttgggattgattcaccttggaaaacactattatgattgag 1618824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 351
Target Start/End: Original strand, 16462336 - 16462376
Alignment:
Q  311 cagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16462336 cagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 16462376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21334883 - 21334820
Alignment:
Q  211 ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||  |||| || |||||||||||||    
T  21334883 ggtagaattaggtttgaagactggttcttgtaattccttttggaatct-ttgtgtaaagttactc 21334820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 125 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16039 - 15802
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  16039 aacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 15940  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagt 324  Q
     | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| || | ||||||||||||    
T  15939 ag-agacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagt 15843  T
Q  325 atttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
     || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15842 gttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctct 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16873 - 16631
Alignment:
Q  120 ttggtaacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaatt 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16873 ttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaatt 16774  T
Q  220 aggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactagg 319  Q
    |||   | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |  |||||||| ||||| |||    
T  16773 aggccag-agacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccagg 16677  T
Q  320 tcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgttctctct 365  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16676 tcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctct 16631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57409
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagatt-gagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatct 258  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||  |||||||    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaacccttt--gatatct 57516  T
Q  259 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattccgtgtgt 358  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |   |||||||    
T  57515 attttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaactaggtaaaaacaaatcgtgtgt 57416  T
Q  359 tctctct 365  Q
    |||||||    
T  57415 tctctct 57409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 183837 - 183637
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  183837 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 183740  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  183739 cc--attgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 183644  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  183643 caaattc 183637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Original strand, 52101 - 52305
Alignment:
Q  144 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||| | | |||||  |||||||||    
T  52101 attgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaa 52199  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctg--ctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggt 341  Q
      ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||    
T  52200 --ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggt 52295  T
Q  342 aaacaaattc 351  Q
     |||||||||    
T  52296 caacaaattc 52305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 344
Target Start/End: Original strand, 4881 - 5098
Alignment:
Q  125 aacaaacaatagggttgaaattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtt 224  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||      
T  4881 aacaaacactagagttgagtttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcg 4980  T
Q  225 tgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcag 323  Q
     || |||| ||| |||||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  4981 gga-gacttatttttgtaacccatt--gatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcag 5077  T
Q  324 tatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  5078 tattggaccgaattgggtaaa 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14579 - 14365
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14579 ttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 14481  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  14480 cc--attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 14385  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  14384 caaatt-cttgtgttctctct 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 15110 - 15324
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  15110 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaac 15208  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||| ||  |||||||| | || ||||||||||  | ||    
T  15209 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaat-ttggaccgaactgactcaa 15304  T
Q  345 caaattccgtgtgttctctct 365  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  15305 caaatt-cttgtgttctctct 15324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 69488 - 69288
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  69488 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 69390  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  69389 cc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 69295  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  69294 caaattc 69288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 79276 - 79476
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  79276 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 79374  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  79375 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaa 79470  T
Q  345 caaatt 350  Q
    ||||||    
T  79471 caaatt 79476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16509
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |      ||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca-----atatctcttt 16421  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16422 -gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 4087 - 4287
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  4087 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 4185  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  4186 cc--attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaa 4280  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  4281 caaattc 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11662 - 11469
Alignment:
Q  153 ccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | | ||| |||||||||| ||   |||    
T  11662 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccc--attg 11566  T
Q  253 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| |||||||||    
T  11565 atttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaacaaattc 11469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1649 - 1449
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  1649 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 1551  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  1550 cc--attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 1456  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  1455 caaattc 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41680 - 41479
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||     
T  41680 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 41582  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||| ||    
T  41581 cc--attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaat-ttggaccgaactgggtcaa 41486  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  41485 caaattc 41479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 6290 - 6490
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  6290 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaa 6388  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |    
T  6389 ccc--attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgagtca 6483  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  6484 acaaatt 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 132 - 332
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||||    
T  132 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaa-acttattcttgtaa 230  T
Q  244 tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaa 343  Q
     ||   ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  231 ccc--attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 325  T
Q  344 acaaatt 350  Q
    |||||||    
T  326 acaaatt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22408
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||  ||  ||||| ||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacta-ttcttgtaa--ctcattgatttc 22316  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22317 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 22408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24683
Alignment:
Q  159 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatc 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||  ||  ||||| ||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacta-ttcttgtaa--ctcattgatttc 24591  T
Q  258 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattcc 352  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24592 tcttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcc 24683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8512
Alignment:
Q  293 gagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  8459 gagagctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 79951 - 80151
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||||| ||||||   | ||||| |||| |||||     
T  79951 ttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attagg-caggagacttattcctgtaa- 80047  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||  ||||||||| ||    
T  80048 -ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggattgaactgggtcaa 80144  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  80145 caaattc 80151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188342
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 188342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 16982
Alignment:
Q  163 cactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||   ||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaa--cttatt---atctcttt 17072  T
Q  263 tgtaaagttactcat--cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattc 351  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17071 -gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 16982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 85321 - 85495
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||    || |||| ||||||||||     
T  85321 ttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacggga-gacttattcttgtaac 85419  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtca 322  Q
    || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  85420 ccatt--gatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Original strand, 29262 - 29462
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 244  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | ||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  29262 ttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattcttgtaa- 29359  T
Q  245 cctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaa 344  Q
     ||  ||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  29360 -ctcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 29455  T
Q  345 caaattc 351  Q
    |||||||    
T  29456 caaattc 29462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3157 - 3068
Alignment:
Q  261 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  3157 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 2132 - 2209
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  || |||||| ||||||||||||    
T  2132 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattagg 2209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  160 aaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |     ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat-----tatctc 224912  T
Q  260 ttttgtaaagttactca-tcattatagtggaacagagagctgctctctcc 308  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  224913 -tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 35733 - 35807
Alignment:
Q  148 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  35733 attcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35885
Alignment:
Q  280 ttatagtggaacagagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 350  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaaatt 35885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 2971 - 3048
Alignment:
Q  145 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtcactggaagagattgagacttttggtagaattagg 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  |  |||||| ||||||||||||    
T  2971 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattagg 3048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 10747 - 10822
Alignment:
Q  200 ttgagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatca 279  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10747 ttgagactttgggtagacttaagtttaaagactaattcttgtaaccc--tttgaaa--tcttttgtaaagttactcatca 10822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7035 - 6978
Alignment:
Q  292 agagagctgctctctccctcagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaat 349  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  7035 agagagctgctctctcctctagagtaggtcattattggaccgaactggataaacaaat 6978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5214 - 5083
Alignment:
Q  213 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-tcctttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattat-agtggaacagagagctgctctctccct 310  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5214 tagaattagatttgaagacta-ttcttgtaactccttttgga-atct-ttgtgtaaagttagtc-tcatgattagtggaacgaagagctgctctctccat 5119  T
Q  311 cagactaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaa 347  Q
     ||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  5118 -agggtaggtcggtattggaccgaattgggtaaacaa 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2113 times since January 2019
Visitors: 3811