View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0593_high_6 (Length: 558)

Name: NF0593_high_6
Description: NF0593
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0593_high_6
NF0593_high_6
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (28-412)||(3572705-3573089)
chr6 (33-411)||(3575990-3576368)
chr6 (32-412)||(3584849-3585229)
chr6 (28-411)||(3564011-3564394)
chr6 (23-411)||(3569659-3570047)
chr6 (32-361)||(3577896-3578225)
chr6 (30-379)||(13275969-13276318)
chr6 (419-552)||(3572404-3572537)
chr6 (419-552)||(3585397-3585530)
chr6 (419-552)||(3575688-3575821)
chr6 (421-520)||(3563741-3563840)
chr6 (421-520)||(3569389-3569488)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (39-411)||(38357026-38357398)
chr4 (419-469)||(38356807-38356857)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (41-136)||(33992644-33992739)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (69-169)||(42603065-42603165)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 28 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3573089 - 3572705
Alignment:
Q  28 caaggtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgag 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3573089 caaggtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgag 3572990  T
Q  128 ttctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  3572989 ttctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcatcagctaggcctaatgggtcaaaactaccacctgggtagagtgggtcgacaacctcaccgaga 3572890  T
Q  228 ggtccaccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttac 327  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  3572889 ggtccacctgcaatacgataaccctcaacagcacccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcatggactagacttggatttc 3572790  T
Q  328 ccaagtagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgagc 412  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3572789 ccaagtagtcaagtccaccctcactaaagatttgagatcctgccttgaaccacacggcctcaccgaatttaacaccattgcgagc 3572705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 33 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3576368 - 3575990
Alignment:
Q  33 tggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttctt 132  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  3576368 tggtcggcaaggttctctagaggtccctttccggttacaatggcctgaacgaagaatccaaacatagagaacatagctagcctaccattcttaagttctt 3576269  T
Q  133 tcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaagaggtcc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3576268 tcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagcgaggcccaatgggtcaaagcttccacctgggtagagtgggtcgactacctcaccaagaggtcc 3576169  T
Q  233 accggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttacccaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3576168 accggcaatacggtaaccctcaacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatactttgtgcgtggactaggcttgggttacccaag 3576069  T
Q  333 tagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgag 411  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3576068 tagtcaagtcctccctcactaaagatttgagatcctgccttgaaccacacagcctcgccgaatttcacaccattgcgag 3575990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 412
Target Start/End: Original strand, 3584849 - 3585229
Alignment:
Q  32 gtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttct 131  Q
    |||||||||||| || | || |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3584849 gtggtcagcaaggttttttaaaggtccctttccggtcacgatggcttgaacaaagaatccaaacatagagaacatcgctaacctaccattcttgagttct 3584948  T
Q  132 ttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaagaggtc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3584949 ttaacctttaactctgcaaaagcctcggggtcctcagcaaggcccaatgggtcaaagcttccacctggatagagtgggtcgactacctcaccaagaggtc 3585048  T
Q  232 caccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttacccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3585049 caccggcaatacggtaaccttcaacagctcccattaagataacttggacagcccaaatagcaaggatgctttgtgcatggactaggcttgggttacccaa 3585148  T
Q  332 gtagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgagc 412  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3585149 gtagtcaagtccaccctcactaaagatttgagatcctgccttaaaccacacagcctcaccgaatttcacaccattgcgagc 3585229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3564394 - 3564011
Alignment:
Q  28 caaggtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgag 127  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3564394 caaggtggtcggcgaggttctcgataggtccctttccagtcacaatggcttgaacgaaaaatccaaacatagagaacatagctaacctaccattttttag 3564295  T
Q  128 ttctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaaga 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  3564294 ttctttcaccttcaactctgcaaaagcctcgggatcttcggcaaggcccaaggggtcaaagctgccacctgggtagagtgggtcaaccacctcaccgaga 3564195  T
Q  228 ggtccaccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttac 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3564194 ggtccaccagcaatacggtaaccctcaacagcacccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcatggactagacttgggttac 3564095  T
Q  328 ccaagtagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgag 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3564094 ccaagtagtcaagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccatacagcctcgccgaatttgacaccattgcgag 3564011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3570047 - 3569659
Alignment:
Q  23 atcatcaaggtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccattt 122  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  3570047 atcagcaaggtggtcagcgaggttctcaataggtccctttccggtgacaatggcctgaacgaagaatccaaacatagagaacatagctaacctaccattt 3569948  T
Q  123 ttgagttctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcac 222  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3569947 tttagttctttcaccttcaactctgcaaaagcctcgggatcttcggcaaggcccaaggggtcaaagctgccacctgggtagagtggatcgactacctcgc 3569848  T
Q  223 caagaggtccaccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgg 322  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3569847 ctagaggtccaccagcaatacggtaaccctccacggcgcccattaagataacttggactgcccatatagcaaggatgctttgtgcatggactagacttgg 3569748  T
Q  323 gttacccaagtagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgag 411  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||    
T  3569747 gttacccaagtagtcaagtccaccctcactaaagatttgggatcctgccttgaaccacacggcctcaccgaattgtacaccattgcgag 3569659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3578225 - 3577896
Alignment:
Q  32 gtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttct 131  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3578225 gtggtcagcaaggttctctagtggtcccttttcggttacaatggcctgaacgaaaaatccaaacatcgagaacatagctaacctgccattcttgagttct 3578126  T
Q  132 ttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaagaggtc 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3578125 ttaacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtctgcgaggcccaatgggtcaaagcttccaccggggtagagtggatcgactacctcaccaagaggtc 3578026  T
Q  232 caccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttacccaa 331  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3578025 catcggcaatacggtaaccctcaacagctcccattaagatagctaggacaacccaaatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttacccaa 3577926  T
Q  332 gtagtcgagcccaccctcactaaaaatttg 361  Q
    |||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  3577925 gtagtcaagccctccatcactaaagatttg 3577896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13276318 - 13275969
Alignment:
Q  30 aggtggtcagcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagtt 129  Q
    |||||||||||||| || || | |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |  |    
T  13276318 aggtggtcagcaaggttttccaaaggtccctttccggtcacaatggcttgaacgaagaatccaaacatagaaaacatggctaacctaccattcttaatct 13276219  T
Q  130 ctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaagagg 229  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  13276218 ctttcactttcaactctacaaaagcttctgggtcatcggcgagacccaatgggtcgaagctaccacctgggtagagtgggtcaatcacctcaccaagagg 13276119  T
Q  230 tccaccggcaatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttaccc 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||    
T  13276118 tccaccagcaatacggtaaccctcaacagcacccatcaagataacttggcaggcccatatggcaaggatgctttgtgcatgtacaagacttgggttgccc 13276019  T
Q  330 aagtagtcgagcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaacca 379  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  13276018 aaatagtctagcccaccctcactaaagatttgggacctggccttgaacca 13275969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3572537 - 3572404
Alignment:
Q  419 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttcgagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttcc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572537 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccatgggcttccagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttcc 3572438  T
Q  519 catgacaaggtctggagtagagggggaaagcttg 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572437 catgacaaggtctggagtagagggggaaagcttg 3572404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Original strand, 3585397 - 3585530
Alignment:
Q  419 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttcgagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3585397 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccactggcttccagaaggagcagtcttcttggtggttgttttcctcatggtgattcttcc 3585496  T
Q  519 catgacaaggtctggagtagagggggaaagcttg 552  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3585497 catcacaaggtctggagtcgaaggggaaagcttg 3585530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3575821 - 3575688
Alignment:
Q  419 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttcgagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttcc 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3575821 cagagaatggacccaagtatttgacacgatctggaccgtaccacgggcttccagaagggacgttcttcttgttggttgttttcctcatggtgattcttcc 3575722  T
Q  519 catgacaaggtctggagtagagggggaaagcttg 552  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3575721 catcacaaggtctggagtggaaggggaaagcttg 3575688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 421 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3563840 - 3563741
Alignment:
Q  421 gagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttcgagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttccca 520  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  3563840 gagaatgggcccaagtacttgacacggtctggaccgtaccaaggacttccagaaggaacagacttcttggtggttgctttcctcattgtgactcttccca 3563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3569488 - 3569389
Alignment:
Q  421 gagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttcgagaaggaacattcttcttggtggttgttttcctcatggtaattcttccca 520  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  3569488 gagaatgggcccaagtacttcacacggtctggaccgtaccatgggcttccagacggaacggacttcttggtggttgttttcctcattgtgactcttccca 3569389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38357398 - 38357026
Alignment:
Q  39 gcaagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttctttcacct 138  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||    
T  38357398 gcaaggttctccaaaggtccctttccggtcacaatagcctgaacaaagaatccgaacatagagaacatggctaatctaccgttcttgagttccttaacct 38357299  T
Q  139 ttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcagctaggcctaatgggtcaaagcttccacctggatagagtggatcgactacctcaccaagaggtccaccggc 238  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  38357298 tcaactctgcgaaagcctctgggtcgtcagctaggcccaatgggtcaaagctgcctcctgggtatagtgggtcaacaacctcaccaagaggaccaccagc 38357199  T
Q  239 aatacggtaaccctcgacagctcccattaagataacttggacagcccatatagcaaggatgctttgtgcgtggactaggcttgggttacccaagtagtcg 338  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  38357198 aatacggtaaccttcaacagcgcccatcaagataacttgggtagcccagatggcaagaatgctctgagcatggaccaaacttgggttacccaagtagtca 38357099  T
Q  339 agcccaccctcactaaaaatttgggatcctgccttgaaccaaacagcctcaccgaatttgacgccattgcgag 411  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38357098 agtccaccctcgctaaagatctgggatccggccttgaaccatacagcctcaccgaatttaacaccattgcgag 38357026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 38356857 - 38356807
Alignment:
Q  419 cagagaatggacccaagtacttgacacggtctggaccgtaccacgggcttc 469  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38356857 cagagaatgggcctaagtacttaacacggtctgggccgtaccatgggcttc 38356807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Original strand, 33992644 - 33992739
Alignment:
Q  41 aagattctctataggtccttttccggttacaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttctttcac 136  Q
    ||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  33992644 aagattctccaaaggtcctttaccagtaacaatagcttgaacaaagaaaccaaacattgaaaacatagccaatcttccatttttgatttccttcac 33992739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42603165 - 42603065
Alignment:
Q  69 acaatagcttgaacaaagaatccaaacatggaaaacatagctaaccttccatttttgagttctttcacctttaactctgcaaaagcctctgggtcgtcag 168  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||    
T  42603165 acaatggcttgaacaaagaaaccaaacatggagaacatagccaatcggccgttcttgagttccttgaccttcaactctgcgaatgcatcggggtcatcag 42603066  T
Q  169 c 169  Q
    |    
T  42603065 c 42603065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 638 times since January 2019
Visitors: 3837