View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0598-INSERTION-8 (Length: 367)

Name: NF0598-INSERTION-8
Description: NF0598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0598-INSERTION-8
NF0598-INSERTION-8
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (110-365)||(47329199-47329454)
chr3 (110-367)||(38446338-38446595)
chr3 (110-352)||(20086351-20086594)
chr3 (110-367)||(21656379-21656637)
chr3 (110-366)||(20813464-20813721)
chr3 (110-367)||(36314994-36315252)
chr3 (110-367)||(37247817-37248075)
chr3 (110-367)||(19664402-19664660)
chr3 (110-367)||(33473261-33473519)
chr3 (110-366)||(48651109-48651366)
chr3 (120-366)||(51562033-51562280)
chr3 (110-364)||(21890032-21890286)
chr3 (110-367)||(53195875-53196133)
chr3 (147-367)||(12748290-12748510)
chr3 (120-367)||(31122533-31122781)
chr3 (139-353)||(1448768-1448983)
chr3 (110-364)||(32650845-32651100)
chr3 (148-367)||(41250786-41251005)
chr3 (144-367)||(42016769-42016992)
chr3 (110-361)||(19268382-19268634)
chr3 (120-367)||(20760093-20760341)
chr3 (147-367)||(50364909-50365129)
chr3 (148-367)||(1687551-1687770)
chr3 (146-367)||(21564394-21564615)
chr3 (120-348)||(45380302-45380530)
chr3 (147-367)||(1016943-1017163)
chr3 (120-367)||(55164137-55164385)
chr3 (120-367)||(22851867-22852115)
chr3 (120-367)||(27070761-27071009)
chr3 (120-367)||(40922187-40922435)
chr3 (120-367)||(50287437-50287685)
chr3 (147-367)||(50977763-50977983)
chr3 (147-367)||(51080895-51081115)
chr3 (110-367)||(3697007-3697265)
chr3 (110-367)||(20913776-20914034)
chr3 (110-367)||(20921894-20922152)
chr3 (120-325)||(44152571-44152777)
chr3 (128-367)||(26455461-26455701)
chr3 (110-367)||(35346493-35346744)
chr3 (120-367)||(52821071-52821331)
chr3 (147-348)||(28699584-28699785)
chr3 (146-367)||(42107121-42107342)
chr3 (147-367)||(10618502-10618722)
chr3 (147-367)||(35608153-35608372)
chr3 (147-367)||(51475268-51475490)
chr3 (148-367)||(53926001-53926220)
chr3 (147-353)||(39069626-39069831)
chr3 (146-367)||(44798165-44798386)
chr3 (210-367)||(33151658-33151815)
chr3 (147-312)||(47473129-47473294)
chr3 (196-365)||(29677424-29677593)
chr3 (197-367)||(34019409-34019579)
chr3 (146-246)||(42641295-42641395)
chr3 (120-208)||(33151817-33151906)
chr3 (147-206)||(20760030-20760089)
chr3 (147-206)||(27070698-27070757)
chr3 (147-206)||(39069849-39069908)
chr3 (148-206)||(40922125-40922183)
chr3 (147-208)||(20086273-20086334)
chr3 (148-205)||(20913714-20913771)
chr3 (148-205)||(20921832-20921889)
chr3 (147-208)||(21656639-21656700)
chr3 (147-208)||(37248077-37248138)
chr3 (147-208)||(42107058-42107119)
chr3 (147-206)||(26455705-26455764)
chr3 (147-206)||(31122785-31122844)
chr3 (147-206)||(35346430-35346489)
chr3 (147-208)||(1687772-1687833)
chr3 (147-208)||(21564617-21564678)
chr3 (147-208)||(21890291-21890352)
chr3 (148-205)||(33473199-33473256)
chr3 (289-353)||(42641214-42641278)
chr3 (147-208)||(44798388-44798449)
chr3 (147-208)||(50287687-50287748)
chr3 (230-365)||(38924022-38924157)
chr3 (146-206)||(44152796-44152856)
chr3 (148-208)||(48651369-48651429)
chr3 (147-206)||(20813400-20813459)
chr3 (147-206)||(47329134-47329193)
chr3 (147-205)||(45380219-45380277)
chr3 (147-208)||(1017165-1017226)
chr3 (147-208)||(3697267-3697328)
chr3 (145-206)||(42016996-42017057)
chr3 (148-208)||(10618440-10618500)
chr3 (148-208)||(38923958-38924018)
chr3 (148-199)||(28775436-28775487)
chr3 (147-205)||(32650779-32650837)
chr3 (147-205)||(51562286-51562344)
chr3 (147-208)||(1448694-1448755)
chr3 (147-208)||(19268648-19268709)
chr3 (147-208)||(29677597-29677658)
chr3 (147-208)||(52821008-52821069)
chr3 (148-208)||(35608091-35608151)
chr3 (147-206)||(41251009-41251068)
chr3 (147-206)||(53196137-53196195)
chr3 (147-206)||(55164074-55164133)
chr3 (147-206)||(38446599-38446658)
chr3 (147-208)||(36314930-36314992)
chr3 (147-201)||(50010082-50010136)
chr3 (148-206)||(53925939-53925997)
chr3 (147-208)||(19664662-19664722)
chr3 (146-183)||(42641156-42641193)
chr3 (147-183)||(51475225-51475261)
chr3 (147-198)||(19228939-19228990)
chr3 (147-198)||(28193300-28193351)
chr3 (147-185)||(33151869-33151907)
chr3 (149-183)||(34019586-34019620)
chr3 (144-185)||(3087116-3087157)
chr3 (110-150)||(45380210-45380250)
chr3 (148-180)||(50364867-50364899)
chr3 (147-183)||(50977990-50978026)
chr3 (147-183)||(51081122-51081158)
chr3 (110-150)||(52820999-52821039)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (110-367)||(2056788-2057045)
chr2 (147-367)||(771997-772217)
chr2 (120-367)||(8899553-8899801)
chr2 (110-364)||(36210907-36211162)
chr2 (110-367)||(1106581-1106839)
chr2 (120-349)||(41178059-41178289)
chr2 (120-367)||(9276445-9276693)
chr2 (120-367)||(16246215-16246463)
chr2 (120-367)||(2314997-2315245)
chr2 (120-366)||(7378834-7379081)
chr2 (120-367)||(920893-921141)
chr2 (160-367)||(41500524-41500731)
chr2 (110-367)||(3430646-3430904)
chr2 (110-367)||(33865289-33865547)
chr2 (120-367)||(12759772-12760019)
chr2 (120-367)||(28650448-28650698)
chr2 (110-367)||(17134090-17134348)
chr2 (110-367)||(17484572-17484830)
chr2 (110-367)||(29737609-29737867)
chr2 (146-367)||(25087818-25088039)
chr2 (120-367)||(2455881-2456129)
chr2 (147-367)||(8396573-8396793)
chr2 (120-367)||(33106991-33107239)
chr2 (111-366)||(38750910-38751166)
chr2 (124-367)||(34253018-34253261)
chr2 (147-367)||(27328486-27328703)
chr2 (120-365)||(36444252-36444498)
chr2 (154-362)||(43249439-43249647)
chr2 (148-367)||(40854509-40854728)
chr2 (120-367)||(7297256-7297502)
chr2 (120-367)||(19180293-19180540)
chr2 (147-367)||(11949448-11949671)
chr2 (148-364)||(37654008-37654224)
chr2 (147-367)||(45124018-45124238)
chr2 (148-367)||(2094432-2094651)
chr2 (147-348)||(42629855-42630062)
chr2 (148-367)||(37732215-37732434)
chr2 (147-367)||(19916009-19916228)
chr2 (120-304)||(23672958-23673143)
chr2 (110-367)||(37838141-37838416)
chr2 (147-208)||(28650385-28650446)
chr2 (120-219)||(19511493-19511593)
chr2 (147-208)||(2094369-2094430)
chr2 (147-208)||(12759709-12759770)
chr2 (147-208)||(27328705-27328766)
chr2 (297-367)||(14630663-14630733)
chr2 (299-364)||(23671836-23671901)
chr2 (148-206)||(37732153-37732211)
chr2 (147-208)||(2456131-2456192)
chr2 (147-208)||(9276695-9276756)
chr2 (147-208)||(9331877-9331938)
chr2 (147-208)||(16246152-16246213)
chr2 (147-208)||(17484509-17484570)
chr2 (147-208)||(33106928-33106989)
chr2 (147-208)||(36444187-36444248)
chr2 (147-208)||(37838418-37838479)
chr2 (147-208)||(41177994-41178055)
chr2 (147-208)||(41500461-41500522)
chr2 (147-208)||(42630083-42630144)
chr2 (148-208)||(11949386-11949446)
chr2 (147-203)||(45124245-45124301)
chr2 (147-206)||(7297193-7297252)
chr2 (145-206)||(7379086-7379147)
chr2 (148-208)||(921143-921203)
chr2 (146-206)||(28216922-28216982)
chr2 (148-206)||(2057049-2057107)
chr2 (147-208)||(771935-771995)
chr2 (147-208)||(29737869-29737930)
chr2 (147-208)||(40854730-40854791)
chr2 (147-199)||(8899811-8899863)
chr2 (148-208)||(34253263-34253323)
chr2 (148-208)||(38751169-38751229)
chr2 (148-208)||(43249372-43249432)
chr2 (249-367)||(9331757-9331875)
chr2 (147-206)||(14630737-14630796)
chr2 (147-206)||(19180544-19180603)
chr2 (148-206)||(23671772-23671829)
chr2 (147-196)||(3358109-3358158)
chr2 (120-200)||(3358147-3358227)
chr2 (147-206)||(2314934-2314993)
chr2 (150-208)||(17134350-17134407)
chr2 (147-208)||(36211167-36211229)
chr2 (147-208)||(1106518-1106579)
chr2 (120-188)||(9331636-9331705)
chr2 (145-208)||(3430581-3430644)
chr2 (152-206)||(25087760-25087814)
chr2 (147-185)||(37654237-37654275)
chr2 (147-183)||(19915966-19916002)
chr2 (147-185)||(19180292-19180330)
chr2 (165-206)||(33865244-33865285)
chr2 (147-191)||(4824492-4824536)
[»] chr1 (130 HSPs)
chr1 (120-367)||(23767436-23767684)
chr1 (150-353)||(6711342-6711545)
chr1 (110-367)||(38473648-38473906)
chr1 (110-367)||(49094733-49094991)
chr1 (110-364)||(50533244-50533499)
chr1 (110-347)||(36157719-36157957)
chr1 (110-364)||(49814161-49814416)
chr1 (110-367)||(5400732-5400989)
chr1 (110-367)||(23228216-23228474)
chr1 (120-367)||(25988293-25988542)
chr1 (120-367)||(19274430-19274678)
chr1 (147-367)||(19315539-19315759)
chr1 (117-367)||(7553038-7553289)
chr1 (148-363)||(28425389-28425604)
chr1 (110-367)||(9974703-9974961)
chr1 (120-367)||(24204493-24204740)
chr1 (147-367)||(36781194-36781414)
chr1 (120-367)||(37216767-37217015)
chr1 (147-367)||(46051349-46051569)
chr1 (120-367)||(46095097-46095345)
chr1 (148-367)||(18892229-18892448)
chr1 (117-367)||(26069760-26070011)
chr1 (146-367)||(12142963-12143191)
chr1 (120-367)||(8141508-8141756)
chr1 (120-367)||(26549259-26549507)
chr1 (147-367)||(33325626-33325846)
chr1 (147-367)||(33673916-33674136)
chr1 (147-367)||(50689843-50690062)
chr1 (110-364)||(7608791-7609046)
chr1 (110-364)||(18782114-18782369)
chr1 (147-366)||(43396574-43396793)
chr1 (165-367)||(46825448-46825650)
chr1 (120-352)||(12964517-12964750)
chr1 (146-367)||(7651558-7651781)
chr1 (148-364)||(16705770-16705986)
chr1 (147-367)||(33194673-33194893)
chr1 (150-366)||(34970982-34971198)
chr1 (148-367)||(45670508-45670727)
chr1 (120-367)||(45350737-45350985)
chr1 (120-367)||(41982257-41982506)
chr1 (147-367)||(9878806-9879026)
chr1 (120-367)||(41105887-41106135)
chr1 (110-348)||(18917386-18917624)
chr1 (147-367)||(48669418-48669638)
chr1 (145-367)||(48319068-48319290)
chr1 (110-326)||(50099081-50099298)
chr1 (147-367)||(52146892-52147112)
chr1 (120-367)||(52349946-52350194)
chr1 (148-367)||(30281531-30281750)
chr1 (120-367)||(48802353-48802593)
chr1 (120-349)||(52067691-52067924)
chr1 (120-367)||(21929392-21929645)
chr1 (146-367)||(9962658-9962870)
chr1 (120-367)||(25800514-25800760)
chr1 (148-367)||(21964965-21965184)
chr1 (120-262)||(49973813-49973956)
chr1 (148-367)||(33714383-33714600)
chr1 (214-367)||(16506810-16506963)
chr1 (147-367)||(40721250-40721462)
chr1 (147-296)||(44979281-44979430)
chr1 (110-292)||(32373650-32373832)
chr1 (197-366)||(17983921-17984090)
chr1 (120-292)||(17989864-17990037)
chr1 (6-70)||(6709601-6709665)
chr1 (145-208)||(12143193-12143256)
chr1 (147-208)||(33325848-33325909)
chr1 (147-208)||(38473585-38473646)
chr1 (147-206)||(26070015-26070074)
chr1 (147-206)||(36781131-36781190)
chr1 (147-206)||(50690066-50690125)
chr1 (146-208)||(33674138-33674200)
chr1 (147-208)||(21965186-21965247)
chr1 (147-208)||(26549509-26549570)
chr1 (147-208)||(28425322-28425383)
chr1 (147-208)||(36157637-36157698)
chr1 (147-208)||(40721464-40721525)
chr1 (147-208)||(43396796-43396857)
chr1 (147-208)||(46051571-46051632)
chr1 (147-212)||(46825399-46825464)
chr1 (147-208)||(49094670-49094731)
chr1 (147-206)||(7651785-7651844)
chr1 (147-206)||(19315763-19315822)
chr1 (147-206)||(23767374-23767432)
chr1 (147-206)||(25800764-25800823)
chr1 (147-206)||(44978727-44978786)
chr1 (147-206)||(48802290-48802349)
chr1 (147-205)||(9962875-9962933)
chr1 (147-205)||(21929650-21929708)
chr1 (146-208)||(24204429-24204491)
chr1 (148-206)||(52067611-52067669)
chr1 (147-208)||(5400991-5401052)
chr1 (147-208)||(25988230-25988291)
chr1 (147-208)||(37217017-37217078)
chr1 (147-208)||(45670445-45670506)
chr1 (147-208)||(46825652-46825713)
chr1 (147-203)||(45350676-45350732)
chr1 (150-206)||(49814423-49814479)
chr1 (147-206)||(6711563-6711622)
chr1 (145-208)||(7608723-7608786)
chr1 (147-206)||(16705993-16706052)
chr1 (145-208)||(18892450-18892513)
chr1 (149-208)||(19274680-19274739)
chr1 (148-206)||(7552976-7553034)
chr1 (148-205)||(23228154-23228211)
chr1 (147-208)||(46095034-46095095)
chr1 (148-208)||(12964753-12964813)
chr1 (146-206)||(18782047-18782107)
chr1 (147-203)||(18917650-18917706)
chr1 (147-206)||(52147116-52147175)
chr1 (148-206)||(9878744-9878802)
chr1 (147-201)||(22351084-22351138)
chr1 (148-206)||(41982195-41982253)
chr1 (148-208)||(17983858-17983918)
chr1 (150-201)||(16505199-16505250)
chr1 (288-366)||(44978791-44978868)
chr1 (160-208)||(48669368-48669416)
chr1 (147-191)||(49973972-49974016)
chr1 (160-208)||(50533504-50533552)
chr1 (147-190)||(24036660-24036703)
chr1 (147-201)||(16508117-16508170)
chr1 (174-208)||(52349910-52349944)
chr1 (151-208)||(8141450-8141506)
chr1 (148-208)||(33714321-33714381)
chr1 (146-185)||(12964515-12964554)
chr1 (177-208)||(41106137-41106168)
chr1 (147-198)||(49594921-49594972)
chr1 (147-181)||(25988509-25988543)
chr1 (148-210)||(34868518-34868579)
chr1 (146-179)||(52067893-52067926)
chr1 (147-179)||(17990006-17990038)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (110-367)||(30378878-30379136)
chr6 (110-367)||(12626497-12626755)
chr6 (110-367)||(29050133-29050391)
chr6 (120-367)||(6503589-6503837)
chr6 (120-367)||(8178271-8178520)
chr6 (120-367)||(1915365-1915613)
chr6 (110-363)||(16193170-16193425)
chr6 (147-367)||(26393031-26393251)
chr6 (139-367)||(3408079-3408308)
chr6 (110-366)||(17942899-17943154)
chr6 (110-366)||(26230955-26231212)
chr6 (110-352)||(3258845-3259087)
chr6 (147-367)||(2707358-2707578)
chr6 (147-366)||(9382416-9382637)
chr6 (110-345)||(6785142-6785378)
chr6 (147-367)||(26936506-26936726)
chr6 (148-367)||(17428294-17428513)
chr6 (110-367)||(10256098-10256356)
chr6 (147-367)||(2390164-2390384)
chr6 (110-367)||(1077095-1077356)
chr6 (147-349)||(10931187-10931393)
chr6 (166-367)||(35223921-35224122)
chr6 (110-365)||(11133734-11133991)
chr6 (147-367)||(26196343-26196563)
chr6 (200-367)||(2598121-2598290)
chr6 (147-262)||(17515006-17515121)
chr6 (119-365)||(25820573-25820820)
chr6 (146-208)||(2390386-2390448)
chr6 (147-208)||(2707580-2707641)
chr6 (147-208)||(31376038-31376099)
chr6 (145-208)||(26230889-26230952)
chr6 (147-208)||(6503839-6503900)
chr6 (147-208)||(12612807-12612868)
chr6 (147-208)||(12626757-12626818)
chr6 (147-208)||(29050393-29050454)
chr6 (148-208)||(30379138-30379198)
chr6 (147-206)||(3408312-3408371)
chr6 (148-206)||(1077360-1077418)
chr6 (147-205)||(16193434-16193492)
chr6 (145-206)||(2598056-2598117)
chr6 (147-208)||(6785060-6785121)
chr6 (147-208)||(9382640-9382701)
chr6 (147-208)||(10256358-10256419)
chr6 (147-208)||(17943157-17943218)
chr6 (148-208)||(26196281-26196341)
chr6 (110-184)||(12613026-12613101)
chr6 (147-205)||(3258766-3258824)
chr6 (147-208)||(1915302-1915363)
chr6 (147-208)||(8178208-8178269)
chr6 (147-208)||(10931107-10931168)
chr6 (147-208)||(12612930-12612991)
chr6 (147-208)||(17428231-17428292)
chr6 (148-208)||(11133995-11134055)
chr6 (150-200)||(26392971-26393021)
chr6 (302-367)||(31375971-31376036)
chr6 (147-208)||(25820508-25820569)
[»] chr5 (95 HSPs)
chr5 (110-367)||(6600158-6600416)
chr5 (110-367)||(11000750-11001008)
chr5 (110-367)||(30297771-30298029)
chr5 (110-366)||(8689433-8689690)
chr5 (110-367)||(6739977-6740235)
chr5 (110-367)||(42993379-42993637)
chr5 (110-366)||(31710143-31710400)
chr5 (120-367)||(41282213-41282461)
chr5 (120-367)||(39824427-39824675)
chr5 (110-367)||(20408394-20408652)
chr5 (110-367)||(40074811-40075069)
chr5 (120-367)||(3352024-3352271)
chr5 (147-367)||(14717504-14717724)
chr5 (147-367)||(14952223-14952443)
chr5 (120-367)||(16095982-16096229)
chr5 (113-363)||(11692173-11692424)
chr5 (120-367)||(4015896-4016143)
chr5 (120-367)||(8215771-8216019)
chr5 (110-366)||(20079281-20079537)
chr5 (120-367)||(19398215-19398463)
chr5 (110-365)||(23128937-23129193)
chr5 (147-366)||(30863152-30863371)
chr5 (120-367)||(33760492-33760740)
chr5 (147-367)||(38964136-38964355)
chr5 (120-350)||(6331248-6331479)
chr5 (148-367)||(16752016-16752235)
chr5 (120-367)||(26593302-26593550)
chr5 (147-367)||(35342079-35342299)
chr5 (110-366)||(28078428-28078685)
chr5 (120-367)||(43166291-43166530)
chr5 (147-367)||(1052435-1052652)
chr5 (147-367)||(26035368-26035588)
chr5 (120-367)||(30208424-30208667)
chr5 (110-367)||(8694727-8694985)
chr5 (110-367)||(27116121-27116374)
chr5 (196-367)||(27457219-27457389)
chr5 (197-367)||(39002047-39002217)
chr5 (120-297)||(27509849-27510027)
chr5 (117-367)||(6251861-6252091)
chr5 (147-367)||(444853-445073)
chr5 (120-267)||(20517029-20517177)
chr5 (197-367)||(11935395-11935564)
chr5 (120-251)||(19661769-19661901)
chr5 (120-241)||(37923546-37923668)
chr5 (244-367)||(19659523-19659646)
chr5 (110-202)||(17002343-17002436)
chr5 (147-208)||(6252093-6252154)
chr5 (147-208)||(11000687-11000748)
chr5 (147-208)||(11935566-11935627)
chr5 (146-206)||(26593238-26593298)
chr5 (148-208)||(30297709-30297769)
chr5 (147-206)||(27457156-27457215)
chr5 (147-206)||(31710405-31710464)
chr5 (147-208)||(6600095-6600156)
chr5 (147-208)||(6739914-6739975)
chr5 (147-208)||(20079217-20079278)
chr5 (147-208)||(20408654-20408715)
chr5 (147-208)||(28078364-28078425)
chr5 (148-205)||(30208362-30208419)
chr5 (147-208)||(40075071-40075132)
chr5 (148-208)||(1052654-1052714)
chr5 (148-208)||(39824677-39824737)
chr5 (148-208)||(43166229-43166289)
chr5 (147-205)||(19398152-19398210)
chr5 (145-206)||(8689695-8689756)
chr5 (147-208)||(8694987-8695048)
chr5 (147-208)||(16095919-16095980)
chr5 (147-208)||(19659460-19659521)
chr5 (148-208)||(3351962-3352022)
chr5 (148-208)||(4015834-4015894)
chr5 (148-208)||(27116059-27116119)
chr5 (148-208)||(33760430-33760490)
chr5 (147-206)||(35342303-35342362)
chr5 (148-203)||(39401952-39402007)
chr5 (147-208)||(8216021-8216082)
chr5 (145-206)||(14952447-14952508)
chr5 (147-208)||(41282463-41282524)
chr5 (147-206)||(23128871-23128931)
chr5 (148-208)||(27510092-27510152)
chr5 (147-206)||(38964073-38964132)
chr5 (147-205)||(6332900-6332958)
chr5 (148-206)||(39001985-39002043)
chr5 (148-206)||(30863376-30863433)
chr5 (147-200)||(9919241-9919294)
chr5 (147-208)||(42993639-42993700)
chr5 (166-208)||(14717726-14717768)
chr5 (147-200)||(9919734-9919787)
chr5 (146-183)||(16752242-16752279)
chr5 (145-198)||(42263047-42263100)
chr5 (120-187)||(567710-567778)
chr5 (315-353)||(27510038-27510076)
chr5 (147-198)||(33002931-33002982)
chr5 (147-198)||(35155363-35155414)
chr5 (147-198)||(42262805-42262856)
chr5 (176-206)||(11692135-11692165)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (110-367)||(35443171-35443430)
chr8 (120-367)||(43806555-43806803)
chr8 (110-367)||(1293348-1293605)
chr8 (148-367)||(35884452-35884671)
chr8 (110-366)||(39513362-39513619)
chr8 (147-365)||(37933541-37933759)
chr8 (110-366)||(38633733-38633984)
chr8 (147-367)||(22684010-22684230)
chr8 (147-367)||(28496377-28496596)
chr8 (120-367)||(28707468-28707715)
chr8 (117-367)||(440708-440959)
chr8 (120-367)||(9056360-9056607)
chr8 (110-367)||(4649011-4649269)
chr8 (120-367)||(513179-513426)
chr8 (147-367)||(2533171-2533391)
chr8 (120-367)||(38106971-38107218)
chr8 (148-367)||(29485187-29485405)
chr8 (147-367)||(7434785-7435005)
chr8 (117-367)||(40301915-40302165)
chr8 (120-367)||(24430593-24430842)
chr8 (149-365)||(12010450-12010666)
chr8 (148-367)||(23935133-23935352)
chr8 (120-367)||(38208623-38208872)
chr8 (147-367)||(259877-260096)
chr8 (147-367)||(655825-656044)
chr8 (147-367)||(841560-841779)
chr8 (147-365)||(33651740-33651958)
chr8 (148-367)||(23972317-23972538)
chr8 (120-366)||(36218804-36219049)
chr8 (120-367)||(42988248-42988496)
chr8 (148-367)||(13796989-13797207)
chr8 (117-367)||(41536549-41536800)
chr8 (147-367)||(6016104-6016324)
chr8 (196-367)||(3875856-3876027)
chr8 (110-326)||(24193356-24193563)
chr8 (147-313)||(8137072-8137239)
chr8 (235-367)||(36400092-36400224)
chr8 (253-367)||(15847117-15847231)
chr8 (120-231)||(9884727-9884839)
chr8 (110-227)||(15846999-15847118)
chr8 (120-258)||(39295288-39295421)
chr8 (147-206)||(37933765-37933824)
chr8 (147-208)||(440961-441022)
chr8 (147-208)||(513428-513489)
chr8 (148-208)||(41536487-41536547)
chr8 (147-206)||(260100-260159)
chr8 (147-206)||(655762-655821)
chr8 (147-206)||(841497-841556)
chr8 (148-207)||(4649272-4649331)
chr8 (147-206)||(36400029-36400088)
chr8 (147-206)||(43806492-43806551)
chr8 (147-208)||(3876029-3876090)
chr8 (147-208)||(13797209-13797270)
chr8 (148-205)||(38633670-38633727)
chr8 (148-208)||(28496315-28496375)
chr8 (148-208)||(33651962-33652022)
chr8 (148-200)||(42988187-42988239)
chr8 (147-206)||(1293609-1293668)
chr8 (149-208)||(9056299-9056358)
chr8 (147-206)||(22683947-22684006)
chr8 (147-206)||(23972254-23972313)
chr8 (147-206)||(38107222-38107281)
chr8 (148-206)||(2533395-2533453)
chr8 (147-205)||(35443435-35443493)
chr8 (147-208)||(12010673-12010734)
chr8 (147-208)||(24193089-24193150)
chr8 (148-208)||(24430531-24430591)
chr8 (152-206)||(35884394-35884448)
chr8 (147-208)||(15847233-15847294)
chr8 (151-208)||(28707410-28707466)
chr8 (147-183)||(23935359-23935395)
chr8 (324-367)||(24193152-24193195)
chr8 (146-206)||(38208876-38208935)
chr8 (147-198)||(21356654-21356705)
chr8 (148-198)||(18873944-18873994)
chr8 (148-206)||(36218741-36218799)
chr8 (148-183)||(6016331-6016366)
chr8 (110-172)||(9056583-9056646)
chr8 (147-198)||(18874173-18874224)
chr8 (147-185)||(9056599-9056637)
chr8 (120-200)||(27428406-27428492)
chr8 (148-206)||(40301853-40301911)
chr8 (147-200)||(43469202-43469255)
[»] chr4 (117 HSPs)
chr4 (110-367)||(10588442-10588699)
chr4 (110-367)||(28812309-28812566)
chr4 (110-367)||(32118575-32118833)
chr4 (120-367)||(39995189-39995437)
chr4 (120-367)||(17847118-17847365)
chr4 (147-367)||(26017322-26017542)
chr4 (148-367)||(24458653-24458872)
chr4 (139-367)||(28159975-28160204)
chr4 (110-364)||(8882038-8882293)
chr4 (110-364)||(11795179-11795434)
chr4 (120-367)||(42273671-42273921)
chr4 (110-367)||(14564657-14564915)
chr4 (117-366)||(48149367-48149617)
chr4 (110-367)||(50542376-50542634)
chr4 (147-367)||(4545007-4545227)
chr4 (110-367)||(2055146-2055397)
chr4 (147-367)||(23135028-23135248)
chr4 (147-367)||(33174042-33174262)
chr4 (120-367)||(33807802-33808050)
chr4 (147-367)||(35929939-35930158)
chr4 (117-367)||(25734245-25734496)
chr4 (147-367)||(50276160-50276377)
chr4 (147-367)||(9339145-9339368)
chr4 (146-367)||(28264541-28264762)
chr4 (120-367)||(31590948-31591194)
chr4 (147-367)||(48707755-48707975)
chr4 (120-367)||(31208619-31208863)
chr4 (148-367)||(40988533-40988752)
chr4 (148-367)||(19168817-19169036)
chr4 (147-367)||(30467025-30467249)
chr4 (110-367)||(37381707-37381965)
chr4 (110-367)||(23552923-23553183)
chr4 (147-367)||(49118510-49118730)
chr4 (110-367)||(22298380-22298637)
chr4 (110-367)||(33693355-33693614)
chr4 (147-364)||(15984909-15985126)
chr4 (120-367)||(12196349-12196588)
chr4 (122-367)||(25730113-25730359)
chr4 (120-367)||(17993039-17993287)
chr4 (148-367)||(42549644-42549862)
chr4 (161-367)||(44490232-44490438)
chr4 (185-367)||(55517207-55517389)
chr4 (147-367)||(24623047-24623267)
chr4 (190-367)||(31973533-31973710)
chr4 (147-364)||(39699944-39700161)
chr4 (122-367)||(51371069-51371317)
chr4 (165-367)||(19496124-19496338)
chr4 (147-329)||(56555200-56555385)
chr4 (147-367)||(48551786-48551988)
chr4 (160-367)||(32317857-32318072)
chr4 (147-367)||(30141130-30141348)
chr4 (196-367)||(5227338-5227509)
chr4 (120-262)||(44490081-44490224)
chr4 (120-212)||(19496322-19496415)
chr4 (110-208)||(20534286-20534385)
chr4 (145-208)||(33807737-33807800)
chr4 (147-208)||(23134965-23135026)
chr4 (147-208)||(28812246-28812307)
chr4 (147-206)||(25730363-25730422)
chr4 (147-205)||(30466962-30467020)
chr4 (146-208)||(48149620-48149682)
chr4 (147-208)||(8881972-8882033)
chr4 (147-208)||(17847055-17847116)
chr4 (147-204)||(22298643-22298700)
chr4 (147-208)||(28264764-28264825)
chr4 (147-208)||(42273923-42273984)
chr4 (147-208)||(44490440-44490501)
chr4 (147-208)||(49118732-49118793)
chr4 (120-211)||(31617613-31617705)
chr4 (110-200)||(1425269-1425360)
chr4 (147-206)||(9339082-9339141)
chr4 (147-206)||(11795113-11795172)
chr4 (147-206)||(15985133-15985192)
chr4 (147-206)||(23553187-23553246)
chr4 (147-206)||(48551723-48551782)
chr4 (147-206)||(55517144-55517203)
chr4 (146-208)||(5227511-5227573)
chr4 (146-208)||(14564917-14564979)
chr4 (147-205)||(32118838-32118896)
chr4 (150-208)||(50276100-50276158)
chr4 (110-212)||(51371255-51371356)
chr4 (147-208)||(26017544-26017605)
chr4 (147-208)||(31591196-31591257)
chr4 (148-208)||(31208865-31208925)
chr4 (147-203)||(50542313-50542369)
chr4 (147-206)||(10588703-10588762)
chr4 (147-205)||(31973715-31973773)
chr4 (148-206)||(33173980-33174038)
chr4 (147-205)||(35930163-35930221)
chr4 (147-205)||(39995126-39995184)
chr4 (147-208)||(4544944-4545005)
chr4 (147-208)||(12196590-12196651)
chr4 (147-208)||(48707692-48707753)
chr4 (147-206)||(28159912-28159971)
chr4 (154-205)||(51371013-51371064)
chr4 (152-206)||(24458595-24458649)
chr4 (146-208)||(33452367-33452429)
chr4 (148-206)||(37381969-37382027)
chr4 (147-208)||(19496061-19496122)
chr4 (168-212)||(8433824-8433868)
chr4 (308-367)||(20534225-20534284)
chr4 (148-208)||(30141068-30141128)
chr4 (148-208)||(56555125-56555185)
chr4 (145-208)||(25734180-25734243)
chr4 (146-208)||(32318074-32318135)
chr4 (147-208)||(33693292-33693353)
chr4 (147-191)||(9800377-9800421)
chr4 (110-185)||(17847328-17847404)
chr4 (147-208)||(40988754-40988811)
chr4 (147-198)||(33496132-33496183)
chr4 (148-206)||(2055401-2055459)
chr4 (174-208)||(17993003-17993037)
chr4 (147-213)||(20534312-20534376)
chr4 (146-212)||(31617643-31617707)
chr4 (147-185)||(44490080-44490118)
chr4 (110-147)||(31973745-31973782)
chr4 (147-183)||(19168774-19168810)
[»] chr7 (100 HSPs)
chr7 (120-367)||(44544280-44544528)
chr7 (110-367)||(35600144-35600402)
chr7 (110-367)||(11476578-11476836)
chr7 (110-367)||(30798390-30798648)
chr7 (147-367)||(31684156-31684376)
chr7 (122-367)||(4923089-4923335)
chr7 (110-367)||(27364361-27364619)
chr7 (120-367)||(47271852-47272100)
chr7 (120-367)||(47219016-47219264)
chr7 (147-367)||(1469515-1469735)
chr7 (120-367)||(11050283-11050531)
chr7 (120-366)||(42979361-42979608)
chr7 (110-367)||(44800432-44800690)
chr7 (110-367)||(47281146-47281406)
chr7 (110-367)||(8162734-8162992)
chr7 (120-364)||(38427588-38427832)
chr7 (110-365)||(18353005-18353261)
chr7 (147-367)||(23842204-23842424)
chr7 (147-367)||(30876158-30876378)
chr7 (120-367)||(48628676-48628924)
chr7 (117-367)||(7335928-7336179)
chr7 (110-367)||(37394020-37394277)
chr7 (120-353)||(41139448-41139682)
chr7 (147-353)||(47119890-47120096)
chr7 (147-367)||(29248241-29248461)
chr7 (120-367)||(45723513-45723761)
chr7 (147-367)||(43968281-43968501)
chr7 (147-367)||(47294313-47294533)
chr7 (147-367)||(33884224-33884438)
chr7 (148-367)||(30971963-30972182)
chr7 (147-353)||(40851182-40851379)
chr7 (147-345)||(47579131-47579329)
chr7 (148-367)||(37354285-37354501)
chr7 (165-345)||(40520835-40521015)
chr7 (146-367)||(3797545-3797756)
chr7 (147-367)||(43752798-43753018)
chr7 (120-306)||(39033932-39034120)
chr7 (120-367)||(221167-221394)
chr7 (220-367)||(41113349-41113496)
chr7 (214-367)||(27774074-27774227)
chr7 (119-291)||(43024982-43025155)
chr7 (147-273)||(42888774-42888900)
chr7 (147-261)||(45233586-45233700)
chr7 (178-297)||(29739711-29739829)
chr7 (268-367)||(2960662-2960761)
chr7 (147-250)||(44550938-44551041)
chr7 (110-207)||(2960767-2960865)
chr7 (147-208)||(48628926-48628987)
chr7 (148-208)||(23842426-23842486)
chr7 (147-202)||(5106168-5106223)
chr7 (197-292)||(29739619-29739713)
chr7 (147-208)||(221396-221457)
chr7 (147-208)||(11476515-11476576)
chr7 (147-208)||(31684093-31684154)
chr7 (147-208)||(37393957-37394018)
chr7 (147-212)||(40520786-40520851)
chr7 (147-208)||(43752735-43752796)
chr7 (147-208)||(47294250-47294311)
chr7 (148-208)||(38427523-38427583)
chr7 (148-208)||(47272102-47272162)
chr7 (147-206)||(35600081-35600140)
chr7 (147-205)||(30876383-30876441)
chr7 (146-224)||(41107268-41107346)
chr7 (147-208)||(1469452-1469513)
chr7 (147-208)||(2960599-2960660)
chr7 (147-208)||(11050220-11050281)
chr7 (147-208)||(41113498-41113559)
chr7 (146-203)||(45723449-45723506)
chr7 (147-208)||(47120114-47120175)
chr7 (147-208)||(47281083-47281144)
chr7 (148-208)||(43968219-43968279)
chr7 (145-208)||(8162669-8162732)
chr7 (147-202)||(27364298-27364353)
chr7 (145-208)||(30798325-30798388)
chr7 (145-208)||(18353265-18353330)
chr7 (110-186)||(31793822-31793899)
chr7 (147-208)||(40851395-40851456)
chr7 (147-208)||(41139368-41139428)
chr7 (147-208)||(42888970-42889031)
chr7 (147-208)||(44544530-44544591)
chr7 (147-208)||(47219266-47219327)
chr7 (148-208)||(44800370-44800430)
chr7 (147-195)||(34378567-34378615)
chr7 (148-208)||(42979299-42979358)
chr7 (147-208)||(47579046-47579106)
chr7 (147-195)||(25801525-25801573)
chr7 (146-206)||(33884442-33884502)
chr7 (147-187)||(43025170-43025210)
chr7 (147-202)||(7336186-7336241)
chr7 (145-200)||(27692011-27692066)
chr7 (147-201)||(27773035-27773089)
chr7 (120-181)||(29739572-29739634)
chr7 (148-206)||(30971902-30971959)
chr7 (174-212)||(42888903-42888941)
chr7 (110-164)||(39241836-39241891)
chr7 (147-185)||(39241844-39241882)
chr7 (110-147)||(23842195-23842232)
chr7 (148-206)||(29248465-29248519)
chr7 (110-150)||(37354471-37354511)
chr7 (145-185)||(47271849-47271889)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (110-367)||(252460-252718)
scaffold0005 (146-208)||(252396-252458)
[»] scaffold1986 (2 HSPs)
scaffold1986 (139-366)||(4-232)
scaffold1986 (174-208)||(235-269)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (147-367)||(1995-2215)
[»] scaffold0096 (3 HSPs)
scaffold0096 (110-367)||(47823-48081)
scaffold0096 (148-207)||(48084-48143)
scaffold0096 (110-147)||(48116-48153)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (147-367)||(218784-219005)
scaffold0004 (148-208)||(219007-219067)
[»] scaffold0693 (2 HSPs)
scaffold0693 (110-367)||(5049-5307)
scaffold0693 (147-206)||(4986-5045)
[»] scaffold0727 (2 HSPs)
scaffold0727 (110-367)||(5044-5304)
scaffold0727 (147-206)||(5308-5367)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (110-367)||(11226-11477)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (110-367)||(12956-13214)
scaffold0184 (148-206)||(13218-13276)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (110-367)||(59630-59888)
scaffold0078 (148-206)||(59568-59626)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (121-301)||(289-469)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (147-254)||(14548-14655)
[»] scaffold1562 (2 HSPs)
scaffold1562 (110-208)||(660-759)
scaffold1562 (308-353)||(599-644)
[»] scaffold1158 (2 HSPs)
scaffold1158 (110-208)||(1834-1933)
scaffold1158 (308-353)||(1949-1994)
[»] scaffold0717 (2 HSPs)
scaffold0717 (110-208)||(1938-2037)
scaffold0717 (308-362)||(1877-1931)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (225-298)||(19758-19831)
[»] scaffold0952 (2 HSPs)
scaffold0952 (308-362)||(3398-3452)
scaffold0952 (147-208)||(3331-3391)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (147-201)||(5728-5782)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (120-172)||(101218-101271)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47329454 - 47329199
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329454 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 47329355  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  47329354 ttaaaggatgatgatgatgattaagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 47329255  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  47329254 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 47329199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 38446338 - 38446595
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38446338 aaagtgattctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatt 38446437  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38446438 ttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 38446537  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38446538 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 38446595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 110 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20086594 - 20086351
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086594 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccagacaagtcctttgagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20086495  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20086494 tttagaggatggtggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 20086395  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20086394 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 20086351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 21656379 - 21656637
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21656379 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtctcaaacaagtcct 21656478  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  21656479 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttagga 21656578  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  21656579 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaa 21656637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20813721 - 20813464
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20813721 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcttttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 20813622  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20813621 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 20813522  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  20813521 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctaca 20813464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36315252 - 36314994
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315252 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 36315153  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  36315152 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaaga 36315053  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  36315052 gccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 36314994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 37247817 - 37248075
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37247817 aaagtggtcatttaagtttcaaaaatttcaaagaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37247916  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37247917 tttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 37248016  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37248017 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaa 37248075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 19664402 - 19664660
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19664402 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 19664501  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  19664502 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatga 19664601  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19664602 gtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 19664660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33473519 - 33473261
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33473519 aaagtggtcttttaggtttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 33473420  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33473419 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaa 33473320  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33473319 accagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaa 33473261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 48651109 - 48651366
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48651109 aaagtgatcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttcaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtcct 48651208  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  48651209 tttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaa 48651308  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  48651309 gccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctaca 48651366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 51562033 - 51562280
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  51562033 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtctttttagaggat 51562132  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51562133 gatgatgataattcagatgatagcaaaaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttg 51562232  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51562233 gtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgttatctaca 51562280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Original strand, 21890032 - 21890286
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21890032 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcttt 21890131  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21890132 ttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 21890231  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  21890232 ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaatatgttatcta 21890286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 53195875 - 53196133
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  53195875 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtccgaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtctt 53195974  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  53195975 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttagga 53196074  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53196075 gcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataattaccaactatgttatctacaa 53196133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 12748290 - 12748510
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| ||||    
T  12748290 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgacggtgatgatttagatgatagtaaca 12748389  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12748390 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 12748489  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  12748490 taccaactatgctatctacaa 12748510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 31122533 - 31122781
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  31122533 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggat 31122632  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  31122633 gatagtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttg 31122732  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  31122733 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 31122781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1448983 - 1448768
Alignment:
Q  139 aaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatg 237  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  1448983 aaacaagtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatg 1448884  T
Q  238 atagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1448883 atagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaa 1448784  T
Q  338 ggaancaattaccaac 353  Q
    |||| |||||||||||    
T  1448783 ggaagcaattaccaac 1448768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32651100 - 32650845
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32651100 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtttt 32651001  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32651000 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 32650901  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  32650900 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 32650845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 41250786 - 41251005
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  41250786 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttcaaggatgatgatgatgatttacatgataacaacaa 41250885  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaa 41251005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 367
Target Start/End: Original strand, 42016769 - 42016992
Alignment:
Q  144 agtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  42016769 agtctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgataaca 42016868  T
Q  244 acaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanc 343  Q
    ||||| || |||||||| | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42016869 acaaaaagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagc 42016968  T
Q  344 aattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  42016969 aattaccaactatgttatctacaa 42016992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 361
Target Start/End: Original strand, 19268382 - 19268634
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268382 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 19268481  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    ||||  |||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19268482 tttagtggatgatggtgatgactcggatgataacaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 19268581  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  19268582 gccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttat 19268634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20760341 - 20760093
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  20760341 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaaatccttttagaggat 20760242  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20760241 aatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttg 20760142  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20760141 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 20760093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50365129 - 50364909
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  50365129 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagattatagcaaca 50365030  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50365029 aagagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 50364930  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  50364929 taccaactatgttatctacaa 50364909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 1687551 - 1687770
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  1687551 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatatagatgatagcaacaa 1687650  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1687651 agatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1687750  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  1687751 accaactatgctatctacaa 1687770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 21564394 - 21564615
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  21564394 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaat 21564493  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21564494 aaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaa 21564593  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  21564594 ttaccaactatgctatctacaa 21564615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45380530 - 45380302
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45380530 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 45380431  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  45380430 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttg 45380332  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaatta 348  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  45380331 gtaccaaagatgagtttaaagaagcaatta 45380302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 1016943 - 1017163
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1016943 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 1017042  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1017043 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 1017142  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  1017143 taccaactatgctatctacaa 1017163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55164385 - 55164137
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  55164385 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacgagtcattttaaaggat 55164286  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55164285 gatggtgatgatttagataatagcaacaaagagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttg 55164186  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  55164185 atatcaaagatgagttcaaggaagcaattagcaactatgctatctacaa 55164137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 22851867 - 22852115
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22851867 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttttaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 22851966  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  22851967 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatattta 22852066  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22852067 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 22852115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27071009 - 27070761
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27071009 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 27070910  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  27070909 gatggtgatgacttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttg 27070810  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27070809 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 27070761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40922435 - 40922187
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40922435 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtcattttagtttttgactcgtttcaaacaagtcattttaaaggat 40922336  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40922335 gatggtgatgattcacatgacagcaacaaagaacattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttg 40922236  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  40922235 gtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatctacaa 40922187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 50287437 - 50287685
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50287437 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 50287536  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50287537 gatggtgatgatttagatgatagcaataaagatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttg 50287636  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  50287637 gtaccaaatatgagtttaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 50287685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 50977763 - 50977983
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50977763 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 50977862  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50977863 aaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaac 50977962  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  50977963 taccaactatgctatctacaa 50977983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 51080895 - 51081115
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51080895 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 51080994  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51080995 aaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaac 51081094  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  51081095 taccaactatgctatctacaa 51081115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 3697007 - 3697265
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  3697007 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagttccaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaaatcat 3697106  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3697107 tttagaggaagatgatgatgattcagatgatagcaacaaatagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 3697206  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  3697207 gcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattaccaactatactatctacaa 3697265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20914034 - 20913776
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20914034 aaagtggtcctttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtcct 20913935  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  20913934 tttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaatagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagga 20913835  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  20913834 gccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaa 20913776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20922152 - 20921894
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20922152 aaagtggtcctttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtcct 20922053  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  20922052 tttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaatagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagga 20921953  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  20921952 gccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaa 20921894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 325
Target Start/End: Original strand, 44152571 - 44152777
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44152571 tttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 44152670  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44152671 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 44152770  T
Q  319 gtaccaa 325  Q
    |||||||    
T  44152771 gtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Original strand, 26455461 - 26455701
Alignment:
Q  128 tcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatga 226  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||    
T  26455461 tcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggataatggtga 26455560  T
Q  227 tgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaa 326  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  26455561 tgattcagatggtagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaa 26455660  T
Q  327 gatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26455661 gatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 26455701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35346744 - 35346493
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35346744 aaagtggtcatttaagttt-aaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcat 35346646  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||      |||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35346645 tttaaaggatgatggtgatgat------gataacaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 35346552  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  35346551 gccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 35346493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52821331 - 52821071
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52821331 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 52821232  T
Q  219 ------------gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttag 306  Q
                |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52821231 cttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 52821132  T
Q  307 aagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  52821131 gagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaa 52821071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 28699584 - 28699785
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  28699584 ctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagccctttaagaggatgatggtgatgattaagatgatagcaaca 28699683  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28699684 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaat 28699783  T
Q  347 ta 348  Q
    ||    
T  28699784 ta 28699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42107342 - 42107121
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42107342 tctttaagattcaaaagtctcagacaagccgttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaac 42107243  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  42107242 aaagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaa 42107143  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||  |||||||||    
T  42107142 ttaccaactatactatctacaa 42107121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10618722 - 10618502
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10618722 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtctttttagagaataatggtgatgattcagatgatagcaaca 10618623  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10618622 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaat 10618523  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  10618522 taccaattatgtcatctacaa 10618502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35608372 - 35608153
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  35608372 ctttaagtttcaaaattcccaaacaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggattatgatgatgatttagatgatagcaaca 35608274  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35608273 aagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaat 35608174  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||  ||| |||||||||    
T  35608173 taccaattatgctatctacaa 35608153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51475490 - 51475268
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgat--tcaaatgatagcaa 244  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  51475490 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatgatcagatgatagcaa 51475391  T
Q  245 caaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanca 344  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  51475390 caaagaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagca 51475291  T
Q  345 attaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  51475290 attaccaactatgctatctacaa 51475268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53926220 - 53926001
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53926220 tttaagtttcaaaagtctaaaacaaatctttttagtttttgaaccgtttcaaacaaatctttctagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaacaa 53926121  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||  |||||||||    
T  53926020 accaactatactatctacaa 53926001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Original strand, 39069626 - 39069831
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||  |||||||||| ||||||||||||    
T  39069626 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagatga-gatagtgatgattcagatgatagcaaca 39069724  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  39069725 aagagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaat 39069824  T
Q  347 taccaac 353  Q
    || ||||    
T  39069825 tatcaac 39069831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 44798165 - 44798386
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttt-agtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaa 244  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  44798165 tctttaagtttcaaaagtcctaaacatgtcctttttagtttttgaatcgtttcaaacacgtccttttagaggataacggtgatgattcatatgatagcaa 44798264  T
Q  245 caaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanca 344  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  44798265 caaagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagca 44798363  T
Q  345 attaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  44798364 attaccaactatgctatctacaa 44798386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 367
Target Start/End: Original strand, 33151658 - 33151815
Alignment:
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33151658 ttaaaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 33151757  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33151758 ccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 33151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 312
Target Start/End: Original strand, 47473129 - 47473294
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||| ||||||||||||    
T  47473129 ctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggataacggggatgattcagatgatagcaaca 47473228  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagcca 312  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47473229 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 365
Target Start/End: Original strand, 29677424 - 29677593
Alignment:
Q  196 tcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaa 295  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  29677424 tcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgatttagattatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaa 29677523  T
Q  296 gtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  29677524 atgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacaaactatgatatctac 29677593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 367
Target Start/End: Original strand, 34019409 - 34019579
Alignment:
Q  197 caaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaag 296  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  34019409 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaag 34019508  T
Q  297 tgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||    
T  34019509 tgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattatcaactatgctatctacaa 34019579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42641395 - 42641295
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  42641395 tctttaagtttcaaaagtcccaaataaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatggtgataattcagatgatagcaac 42641296  T
Q  246 a 246  Q
    |    
T  42641295 a 42641295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33151906 - 33151817
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151906 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33151817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 20760030 - 20760089
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760030 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20760089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 27070698 - 27070757
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070698 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27070757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39069908 - 39069849
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39069908 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 39069849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 40922125 - 40922183
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922125 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 40922183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 20086273 - 20086334
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086273 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20086334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 20913714 - 20913771
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20913771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 20921832 - 20921889
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20921832 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20921889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21656700 - 21656639
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656700 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 21656639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37248138 - 37248077
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248138 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtacttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37248077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 42107058 - 42107119
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107058 ctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 42107119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26455764 - 26455705
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455764 ctttaagtttcaaaagtctcaaccaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26455705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31122844 - 31122785
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122844 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31122785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 35346430 - 35346489
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346430 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35346489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1687833 - 1687772
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1687833 ctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 1687772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21564678 - 21564617
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564678 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 21564617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21890352 - 21890291
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890352 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 21890291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 33473199 - 33473256
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473199 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 33473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42641278 - 42641214
Alignment:
Q  289 attttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42641278 attttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 42641214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44798449 - 44798388
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798449 ctttaagtttcaaaattctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 44798388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50287748 - 50287687
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287748 ctttaagtttcaaaagtctcatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 50287687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38924157 - 38924022
Alignment:
Q  230 ttcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagat 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||   |||  ||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  38924157 ttcatatgatagcaacaaagagcgttattcattatttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagat 38924058  T
Q  330 gagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  38924057 aagttcaacgaagcaattaccaactattttatctac 38924022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44152856 - 44152796
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152856 tctttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44152796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48651429 - 48651369
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48651429 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 48651369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 20813400 - 20813459
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813400 ctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20813459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 47329134 - 47329193
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47329134 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttccaacaagtc 47329193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 45380219 - 45380277
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380219 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 45380277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1017226 - 1017165
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017226 ctttaagtttcaaaagtcccatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 1017165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3697328 - 3697267
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3697328 ctttaagttttaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtcct 3697267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42017057 - 42016996
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42017057 gtctttaaatttcaaaagtttcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42016996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 10618440 - 10618500
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618440 tttatgtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 10618500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 38923958 - 38924018
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38923958 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 38924018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 28775436 - 28775487
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28775436 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaa 28775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 32650779 - 32650837
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32650779 ctttaagtttcaaaagtttcaaacaattctttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 32650837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51562344 - 51562286
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51562344 ctttgagtttcaaaagtctcaagcaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51562286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 1448694 - 1448755
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1448694 ctttaagtttcaaaagtaccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcct 1448755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19268709 - 19268648
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19268709 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtcct 19268648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29677658 - 29677597
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29677658 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccgtttagtttttcaatcgtttcaaacaggtcct 29677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 52821008 - 52821069
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52821008 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtctttttagtttttgaatcgttttaaacaagtcct 52821069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 35608091 - 35608151
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35608091 tttaagtttcaaaaatgtcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtcct 35608151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41251068 - 41251009
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41251068 ctttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 41251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53196195 - 53196137
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53196195 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttag-ttttgaatcgtttcaaagaagtc 53196137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 55164074 - 55164133
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  55164074 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttaatttttgaattgtttcaaataagtc 55164133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38446658 - 38446599
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||| ||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446658 ctttaagttttaaaagttccaaagaagtgcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38446599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 36314930 - 36314992
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttag-tttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314930 ctttaagtttcaaaatttccaaacaaatccttttcgttttttgaattgtttcaaacaagtcct 36314992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 50010082 - 50010136
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50010082 ctttaaattttaaaagtcccaaacaaatccttttcgtttttgaattgtttcaaac 50010136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 53925939 - 53925997
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53925939 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaataagtc 53925997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19664722 - 19664662
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19664722 ctttaagtttcaaaaatttcaaataagtctttttagtttttgaat-gtttcaaacaagtcct 19664662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 183
Target Start/End: Original strand, 42641156 - 42641193
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42641156 tctttaagttttaaaagtctcaaacaaatccttttagt 42641193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 51475225 - 51475261
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51475225 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 51475261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 19228939 - 19228990
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19228939 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtgatcattttagtttttgaatcgtttca 19228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 28193300 - 28193351
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28193300 ctttaagttttaaaagtctcaaagtgatccttttaatttttgaatcgtttca 28193351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33151907 - 33151869
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33151907 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 33151869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34019620 - 34019586
Alignment:
Q  149 ttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34019620 ttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 34019586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 3087116 - 3087157
Alignment:
Q  144 agtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3087116 agtctttaagtttcaaaagttttaaataaatccttttagttt 3087157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Original strand, 45380210 - 45380250
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45380210 aaagtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttt 45380250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 180
Target Start/End: Original strand, 50364867 - 50364899
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50364867 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttt 50364899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50978026 - 50977990
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50978026 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagt 50977990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51081158 - 51081122
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51081158 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagt 51081122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Original strand, 52820999 - 52821039
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt 150  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52820999 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcttt 52821039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 2056788 - 2057045
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| || ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056788 aaagtggtcctttaagtttcaaatgtcccaaacaaatctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 2056887  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2056888 ttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagtgcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggag 2056987  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2056988 ctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 2057045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 772217 - 771997
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  772217 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 772118  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  772117 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 772018  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  772017 taccaactatgctatctacaa 771997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 8899553 - 8899801
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctt-taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899553 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 8899652  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899653 gattgtgatgatttaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttg 8899752  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8899753 gtaccaaagatgagttcatggaagcaattaccaactatgctatctacaa 8899801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Original strand, 36210907 - 36211162
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36210907 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 36211006  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36211007 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 36211106  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  36211107 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatcta 36211162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1106839 - 1106581
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1106839 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 1106740  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1106739 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 1106640  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  1106639 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaa 1106581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 120 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41178289 - 41178059
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41178289 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagccatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggat 41178190  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41178189 gatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 41178090  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41178089 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 9276445 - 9276693
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9276445 tttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 9276544  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9276545 gatggtgatgattcaaatgaaagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttg 9276644  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  9276645 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 9276693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16246463 - 16246215
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16246463 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 16246364  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16246363 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 16246264  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16246263 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 16246215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2315245 - 2314997
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2315245 tttaagtttcaaaagtcccaaaatggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttcgaggat 2315146  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2315145 gatgatgatgatttacatgataacaacaaatagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttg 2315046  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2315045 gtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaa 2314997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 7378834 - 7379081
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7378834 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcacacaagtccttttagaggat 7378933  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7378934 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 7379033  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  7379034 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattctatctaca 7379081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 920893 - 921141
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  920893 tttaagtttcaaacgtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttaagaggat 920992  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  920993 gatggtgatgatttagatgatggcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 921092  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  921093 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaa 921141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41500731 - 41500524
Alignment:
Q  160 aagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatcc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41500731 aagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatcc 41500632  T
Q  260 accgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgtt 359  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  41500631 accatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgct 41500532  T
Q  360 atctacaa 367  Q
    || |||||    
T  41500531 atgtacaa 41500524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3430904 - 3430646
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430904 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 3430805  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  3430804 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatga 3430705  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3430704 gccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 3430646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33865547 - 33865289
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||| |||||  | |||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33865547 aaagtggtcctttaagttttaaaagccccaaacaaattctttatgtttcaaaagtcccaaccaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 33865448  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33865447 tttagaggatgatggtgaagattcaaatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttagga 33865348  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33865347 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 33865289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12760019 - 12759772
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12760019 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaacagtctcaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 12759920  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  12759919 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-aggcaaatttg 12759821  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12759820 gtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 12759772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28650698 - 28650448
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28650698 tttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 28650599  T
Q  219 gatgatg--atgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatt 316  Q
    |||| ||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28650598 gatggtgtgatgatttagatgataacaacaaagagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatt 28650499  T
Q  317 tggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  28650498 tggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattaccaactatgctatctacaa 28650448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 17134090 - 17134348
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134090 aaagtggtcctttaagttttaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaagttccaaacaggtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17134189  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  17134190 tttagaggatgatggttatgattcacatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttagga 17134289  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17134290 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 17134348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17484830 - 17484572
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  17484830 aaagtggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattctg 17484731  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  17484730 tttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttagga 17484631  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17484630 gtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaa 17484572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 29737609 - 29737867
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29737609 aaagtgttcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 29737708  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||| | |||| |    
T  29737709 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttagga 29737808  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||    
T  29737809 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatcgacaa 29737867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25088039 - 25087818
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25088039 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaac 25087940  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  25087939 aaagaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaa 25087840  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    
T  25087839 ttatcaactatgttatatacaa 25087818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 2455881 - 2456129
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2455881 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaagcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 2455980  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  2455981 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttg 2456080  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2456081 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 2456129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8396793 - 8396573
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8396793 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 8396694  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8396693 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 8396594  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||| ||| |||||||||    
T  8396593 tatcaactatgctatctacaa 8396573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33107239 - 33106991
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33107239 tttaagtttcaaaagttccaaagttgtcctttaagtttcaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttagaggat 33107140  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33107139 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttg 33107040  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33107039 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaa 33106991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 366
Target Start/End: Original strand, 38750910 - 38751166
Alignment:
Q  111 aagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    ||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38750910 aagtggtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 38751009  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  38751010 ttagaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggag 38751109  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  38751110 ccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatactatctaca 38751166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 34253018 - 34253261
Alignment:
Q  124 agtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatga 223  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34253018 agtttcaaaagtcccaaagtggtctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatgg 34253117  T
Q  224 tgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtacc 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34253118 tgatcattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgatacc 34253217  T
Q  324 aaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  34253218 aaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaa 34253261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 27328486 - 27328703
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||| |||||    
T  27328486 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaagtccttttagaggatg---atgatgattcagatgataacaaca 27328582  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27328583 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 27328682  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  27328683 taccaactatgctatctacaa 27328703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36444498 - 36444252
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttta-agtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36444498 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttcagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgttacaaacaagtcattttaaaggat 36444399  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36444398 gatggtgataatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttg 36444299  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  36444298 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 36444252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43249647 - 43249439
Alignment:
Q  154 tttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagca 253  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249647 tttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagca 43249548  T
Q  254 ttatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43249547 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaattaccaac 43249448  T
Q  354 catgttatc 362  Q
     ||| ||||    
T  43249447 tatgctatc 43249439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 40854509 - 40854728
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40854509 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttaaagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 40854608  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaa 40854728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7297502 - 7297256
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7297502 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 7297403  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7297402 gatggtgataatttagatgataacaacaaag--cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttg 7297305  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7297304 gtaccaaagatgagttcaagaagacaattaccaactatgctatctacaa 7297256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 19180293 - 19180540
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19180293 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttagaggat 19180392  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19180393 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttg 19180491  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||    
T  19180492 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattactaactatactatctacaa 19180540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11949671 - 11949448
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaa---ggatgatgatgatgattcaaatgatagca 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11949671 ctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagatcaggatgatggtgatgattcagatgatagca 11949572  T
Q  244 acaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanc 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11949571 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaac 11949472  T
Q  344 aattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  11949471 aattaccaactatgctatctacaa 11949448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 148 - 364
Target Start/End: Original strand, 37654008 - 37654224
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  37654008 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagcaacaa 37654107  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||| |||||| || | |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37654108 agaacattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 37654207  T
Q  348 accaaccatgttatcta 364  Q
    |||||| ||||||||||    
T  37654208 accaactatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 45124018 - 45124238
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45124018 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 45124117  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45124118 aggagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaat 45124217  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  45124218 taccaactatgctatctacaa 45124238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2094651 - 2094432
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  2094651 tttaagtttgaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcctttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 2094552  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaa 2094432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 42629855 - 42630062
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatg------atgatgatgattcaaatgata 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      |||||||||||||| ||||||    
T  42629855 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatgatgatgatgatgattcagatgata 42629954  T
Q  241 gcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagga 340  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42629955 acaacaaagagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaa 42630054  T
Q  341 ancaatta 348  Q
    | ||||||    
T  42630055 agcaatta 42630062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37732434 - 37732215
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  37732434 tttaaatttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 37732335  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaa 37732215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19916228 - 19916009
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||     
T  19916228 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc-ttttagagggtgatggtgatgattcagacaatagcaacc 19916130  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||  |||  || || ||||||||||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19916129 aagagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaat 19916030  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  19916029 taccaactatgctatctacaa 19916009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23673143 - 23672958
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  23673143 tttaagtttcaaaaattccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggag 23673044  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgtt 304  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23673043 gatgataatgatttagatgatagcaacaaagagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 37838141 - 37838416
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37838141 aaagtcatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcatt 37838240  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatga------------------tagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaatt 291  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||                  |||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  37838241 ttagaggatgatggtgatgatttagatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 37838340  T
Q  292 ttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  37838341 ttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaa 37838416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 28650385 - 28650446
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650385 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28650446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Original strand, 19511493 - 19511593
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19511493 tttaagttttaaaagtttcaaacaaattctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttaaattgtttcaaacaaatccttttaaaggat 19511592  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  19511593 g 19511593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 2094369 - 2094430
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094369 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 2094430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 12759709 - 12759770
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759709 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 12759770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27328766 - 27328705
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328766 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 27328705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630733
Alignment:
Q  297 tgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 14630733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671836
Alignment:
Q  299 ggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatcta 23671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 37732153 - 37732211
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37732153 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37732211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2456192 - 2456131
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2456192 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 2456131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9276756 - 9276695
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276756 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 9276695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9331938 - 9331877
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331938 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 9331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 16246152 - 16246213
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246152 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 16246213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 17484509 - 17484570
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484509 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17484570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 33106928 - 33106989
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33106928 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtcct 33106989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 36444187 - 36444248
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36444187 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 36444248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37838479 - 37838418
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37838479 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37838418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 41177994 - 41178055
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177994 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 41178055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 41500461 - 41500522
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500461 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttctagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 41500522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42630144 - 42630083
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630144 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 42630083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 11949386 - 11949446
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949386 tttaagtttcaaatgtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11949446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45124301 - 45124245
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124301 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 45124245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 7297193 - 7297252
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7297193 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagattttgaatcgtttcaaacaagtc 7297252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7379147 - 7379086
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379147 gtctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 7379086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 921203 - 921143
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921203 tttaagtttcaaaagtcttaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 921143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Original strand, 28216922 - 28216982
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28216922 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 28216982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2057107 - 2057049
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057107 tttaagtttcaaaagtcccagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2057049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 771935 - 771995
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  771935 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatc-tttcaaacaagtcct 771995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29737930 - 29737869
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29737930 ctttaaatttcaaaaggcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 29737869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40854791 - 40854730
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40854791 ctttaagtttcaaaagtcccaaactagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 40854730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8899863 - 8899811
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8899863 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaa 8899811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34253323 - 34253263
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253323 tttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 34253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38751229 - 38751169
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38751229 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtcct 38751169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 43249372 - 43249432
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43249372 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcgaacaagtcct 43249432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331875
Alignment:
Q  249 gagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatta 348  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |  ||  |||| ||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  349 ccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||| ||  |||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaa 9331875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14630796 - 14630737
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630796 ctttaagttttaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14630737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19180603 - 19180544
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180603 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 19180544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 23671772 - 23671829
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23671772 tttaagtttcaaaagtctcaa-caaatcattttagattttgaatcgtttcaaacaagtc 23671829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 196
Target Start/End: Original strand, 3358109 - 3358158
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgttt 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3358109 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgttt 3358158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3358227 - 3358147
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||    
T  3358227 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttaatttttaaaacgattcaaa 3358147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 2314934 - 2314993
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2314934 ctttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 2314993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17134407 - 17134350
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17134407 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttaaatcgtttcaaacaagtcct 17134350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36211229 - 36211167
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaag-tctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36211229 ctttaagtttcaaaaggtctcaaacaagtccttttaatttttaaattgtttcaaacaagtcct 36211167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 1106518 - 1106579
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1106518 ctttaaatttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaataagtcct 1106579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 188
Target Start/End: Original strand, 9331636 - 9331705
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttg 188  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9331636 tttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttg 9331705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 3430581 - 3430644
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3430581 gtctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctactagtttttgaataagttcaaacaagtcct 3430644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Original strand, 25087760 - 25087814
Alignment:
Q  152 agtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25087760 agtttcaaaagtcccaaacaagtcatttttgtttttgaattgtttcaaacaagtc 25087814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37654275 - 37654237
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37654275 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 37654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 19915966 - 19916002
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19915966 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 19916002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Original strand, 19180292 - 19180330
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19180292 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 19180330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Original strand, 33865244 - 33865285
Alignment:
Q  165 tcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33865244 tcaaacaagtcattctagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33865285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Original strand, 4824492 - 4824536
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaat 191  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4824492 ctttaagtttcataagtttcaaataaatccttttagtttatgaat 4824536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 130)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23767684 - 23767436
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23767684 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 23767585  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23767584 gatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 23767485  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23767484 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 23767436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 150 - 353
Target Start/End: Original strand, 6711342 - 6711545
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaag 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6711342 taagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaag 6711441  T
Q  250 agcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattac 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6711442 agcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6711541  T
Q  350 caac 353  Q
    ||||    
T  6711542 caac 6711545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38473906 - 38473648
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38473906 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcat 38473807  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38473806 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 38473707  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38473706 accagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaa 38473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49094991 - 49094733
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49094991 aaagtgatcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttct 49094892  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49094891 tttagaggatgatggtgatgattctgatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 49094792  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  49094791 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 49094733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Original strand, 50533244 - 50533499
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  50533244 aaagtggtcatttaagttacaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaaaagtcat 50533343  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50533344 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 50533443  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50533444 gccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatcta 50533499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36157957 - 36157719
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaa-caaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36157957 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttaagtttcaaaagtcccaaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 36157858  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36157857 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 36157758  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36157757 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Original strand, 49814161 - 49814416
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814161 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 49814260  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49814261 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 49814360  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  49814361 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 49814416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 5400732 - 5400989
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5400732 aaagtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaagaagtcct 5400831  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5400832 tttagaggatgatggtgattattcagatgatagcaacaaatagtattatccaccattt-gcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaa 5400930  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  5400931 accagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 5400989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23228474 - 23228216
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228474 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 23228375  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| |    
T  23228374 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttagga 23228275  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23228274 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 23228216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25988542 - 25988293
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25988542 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaa 25988443  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25988442 tgatagtgatgatttagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagattt 25988343  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25988342 ggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaactatgctatctacaa 25988293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 19274430 - 19274678
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19274430 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttatgtttcaaaagtcccaaataagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtcgttttagaggat 19274529  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19274530 gatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 19274629  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  19274630 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccagctatgttatctacaa 19274678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 19315539 - 19315759
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19315539 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttctagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 19315638  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19315639 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 19315738  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  19315739 taccaactatgctatctacaa 19315759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7553289 - 7553038
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  7553289 tcatttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaattttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcttttcagag 7553190  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7553189 gatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 7553090  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7553089 ttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 7553038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28425604 - 28425389
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  28425604 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 28425505  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  348 accaaccatgttatct 363  Q
    |||||| ||| |||||    
T  28425404 accaactatgctatct 28425389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 9974703 - 9974961
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9974703 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcttttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 9974802  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9974803 tttagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacga 9974902  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  9974903 gccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 9974961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24204740 - 24204493
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24204740 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaa-gtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggat 24204642  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24204641 gatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttg 24204542  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24204541 gtaccaaagacgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 24204493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36781414 - 36781194
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36781414 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 36781315  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36781314 aaaagcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 36781215  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  36781214 taccaactatgatatctacaa 36781194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 37216767 - 37217015
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37216767 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtgcttttaaaggat 37216866  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||    
T  37216867 gatggtgatgatttagatgataccaacaaagaacattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttg 37216966  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  37216967 gtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaa 37217015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 46051349 - 46051569
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46051349 ctttaagtttcaaaagtcccaaataaggccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 46051448  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46051449 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 46051548  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  46051549 taccaactatgctatctacaa 46051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46095345 - 46095097
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46095345 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtcttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 46095246  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  46095245 gatggtgatgacttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttg 46095146  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  46095145 atatcaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaa 46095097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 18892229 - 18892448
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  18892229 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 18892328  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaa 18892448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Original strand, 26069760 - 26070011
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26069760 tcatttaagtttcaaaagtcacaaacaagtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagag 26069859  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26069860 gatgatggtgatgatttagatgataacaacaaagatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggat 26069959  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26069960 ttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattaccaactatgatatctacaa 26070011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 12142963 - 12143191
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttc-------aaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatga 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||    
T  12142963 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatga 12143062  T
Q  239 tagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143063 tagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaag 12143162  T
Q  339 gaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12143163 gaagcaattaccaactatgttatctacaa 12143191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8141756 - 8141508
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8141756 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgat 8141657  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8141656 gatggtgatgattcgaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttg 8141557  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||| |||||||||    
T  8141556 gtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaaattatgctatctacaa 8141508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 26549259 - 26549507
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  26549259 tttaagtttcaaaagccacaaacaagtcctttaaatttcaaaagccacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagagaat 26549358  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26549359 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttg 26549458  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26549459 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 26549507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 33325626 - 33325846
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | ||||  ||||||    
T  33325626 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatggtgatgatttagatgagtgcaaca 33325725  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33325726 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaat 33325825  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  33325826 taccaactatgttatctacaa 33325846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 33673916 - 33674136
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  33673916 ctttaagttttaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttagatgatagcaaca 33674015  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33674016 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaat 33674115  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||| | ||| |||||||||    
T  33674116 taccagctatgctatctacaa 33674136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 50689843 - 50690062
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  50689843 ctttaagtttcaaaagtcccaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 50689941  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50689942 aagagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaat 50690041  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  50690042 taccaactatgttatctacaa 50690062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7609046 - 7608791
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7609046 aaagtaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctt 7608947  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7608946 tttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttagga 7608847  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  7608846 ggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatcta 7608791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18782369 - 18782114
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782369 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagccctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 18782270  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| || ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  18782269 tttagagaatggtggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatga 18782170  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||    
T  18782169 accagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatcaactatgctatcta 18782114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 366
Target Start/End: Original strand, 43396574 - 43396793
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43396574 ctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 43396673  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43396674 aagagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 43396773  T
Q  347 taccaaccatgttatctaca 366  Q
    || ||||  || ||||||||    
T  43396774 tatcaactctgctatctaca 43396793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 46825448 - 46825650
Alignment:
Q  165 tcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgt 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46825448 tcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccat 46825547  T
Q  265 ttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  46825548 ttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatcta 46825647  T
Q  365 caa 367  Q
    |||    
T  46825648 caa 46825650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 352
Target Start/End: Original strand, 12964517 - 12964750
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  12964517 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttaatttttgaattgtttcaaacaagttcttttagaggat 12964616  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12964617 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 12964716  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12964717 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 7651558 - 7651781
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatg--atgattcaaatgatagca 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||| | |||||||||    
T  7651558 tctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttatagaggatgatggtgtgatgatttagatgatagca 7651657  T
Q  244 acaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanc 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7651658 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagc 7651757  T
Q  344 aattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||    
T  7651758 aattatcaactatgctatctacaa 7651781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 364
Target Start/End: Original strand, 16705770 - 16705986
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||| |||||    
T  16705770 tttaagtttcaaaagccacaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatgacgatgattcaggtgatagaaacaa 16705869  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  348 accaaccatgttatcta 364  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatcta 16705986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33194893 - 33194673
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33194893 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcatttgactttttgaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 33194794  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33194793 aagagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaac 33194694  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  33194693 taccaactatgctatctacaa 33194673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 366
Target Start/End: Original strand, 34970982 - 34971198
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaag 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34970982 taagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgacgatgattcagatgatagcaacaaag 34971081  T
Q  250 agcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattac 349  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  34971082 aacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattac 34971181  T
Q  350 caaccatgttatctaca 366  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34971182 caactatgttatctaca 34971198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45670727 - 45670508
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45670727 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 45670628  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45670627 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 45670529  T
Q  348 acc-aaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  45670528 accaaactatgttatctacaa 45670508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45350985 - 45350737
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  45350985 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttt-agagga 45350887  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45350886 tgatggtgataatttagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 45350787  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45350786 ggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 45350737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41982506 - 41982257
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaa-agga 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  41982506 tttaagtttcaaaagtccaaaacaaatcttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttttagagga 41982407  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  41982406 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagattt 41982307  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  41982306 ggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatcaactatgttatctacaa 41982257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9879026 - 9878806
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  9879026 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgacagcaaca 9878927  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9878926 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaat 9878827  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  9878826 taccaactattttatctacaa 9878806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 41105887 - 41106135
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  || ||||| |||||    
T  41105887 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttcaaaagttccaaaaaagtccttttaatttttgaaccgtttcaaacagatcattttataggat 41105986  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41105987 gatggtgatgatttaaataatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 41106086  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41106087 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 41106135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 348
Target Start/End: Original strand, 18917386 - 18917624
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18917386 aaagtgatcctttaagtttcaaaagccccaaacaagtcctttaag-ttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctt 18917484  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18917485 tttagaggatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 18917584  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatta 348  Q
    | || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18917585 gtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaatta 18917624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48669638 - 48669418
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48669638 ctttatgtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 48669539  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| |||||||||   |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48669538 aagaacattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 48669439  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||| ||| |||||||||    
T  48669438 caccaactatgctatctacaa 48669418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48319290 - 48319068
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaa 244  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48319290 gtctttaagtttcaattgtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgcttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 48319191  T
Q  245 caaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanca 344  Q
    |||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48319190 caaagaacattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagca 48319091  T
Q  345 attaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||    
T  48319090 attaccaactatgctatatacaa 48319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Original strand, 50099081 - 50099298
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50099081 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagaccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcat 50099180  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  50099181 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaaaa 50099280  T
Q  309 gccagatttggtaccaaa 326  Q
    | || |||||||||||||    
T  50099281 gtcatatttggtaccaaa 50099298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 52146892 - 52147112
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52146892 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 52146991  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52146992 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaat 52147091  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||    
T  52147092 tacaaactatgctatatacaa 52147112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52350194 - 52349946
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  52350194 tttaagtttcaaaagttccaaagtcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaat 52350095  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  52350094 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttg 52349995  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  52349994 atagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaa 52349946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 30281531 - 30281750
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30281531 tttaagtttcaaaagttccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatacttttagagaatgatggtgatgattcatatgatagcaacaa 30281630  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  30281731 accaactatgctatctacaa 30281750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48802593 - 48802353
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48802593 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcc--------tcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 48802502  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  48802501 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttg 48802402  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  48802401 ataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 48802353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52067924 - 52067691
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52067924 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagattcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 52067825  T
Q  219 gatgatgatgat---tcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  52067824 gatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagat 52067725  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattac 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52067724 ttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaattac 52067691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 21929392 - 21929645
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21929392 tttaagtttcaaaagtctcaatcaagtcatttaagtttcaaaagttccagacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggat 21929491  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21929492 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaagattatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttg 21929589  T
Q  319 gtacc-------aaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||       |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21929590 gtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 21929645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 9962658 - 9962870
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||         |||||||    
T  9962658 tctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtctttttagaggatgatggtgatga---------tagcaac 9962748  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9962749 aaagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 9962848  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  9962849 ttaccaactatgctatctacaa 9962870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 25800514 - 25800760
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttc-aaacaagtccttttaaagga 217  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  25800514 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttttaaacaagtccttttagagga 25800613  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||    
T  25800614 tgatggtgatgattaagatgaaagcaaaaaagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agattt 25800707  T
Q  318 ggtacca----aagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25800708 ggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaattaccaa-catgttatctacaa 25800760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 21964965 - 21965184
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  21964965 tttaagtttcaaaagtctcaatcaaatccttttagttttcgaatcgtttcaaataagtctttttagagaatgatggtgataattcggatgatagcaacaa 21965064  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  21965065 agaacattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaatt 21965164  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||  |||| ||||||||    
T  21965165 accaattatgtcatctacaa 21965184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 49973813 - 49973956
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaa-gtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973813 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattaaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 49973912  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccacc 262  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973913 gatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccacc 49973956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33714600 - 33714383
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33714600 tttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33714501  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    |||  |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33714500 agaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaa-tgtaagt-ggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 33714403  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  33714402 atcaactatgttatctacaa 33714383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16506963 - 16506810
Alignment:
Q  214 aggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccag 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16506963 aggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagatcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccag 16506864  T
Q  314 atttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16506863 atttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 16506810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 40721250 - 40721462
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||| ||||||||||||    
T  40721250 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgat---------tcagatgatagcaaca 40721340  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagt-gggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||   |||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  40721341 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaa 40721440  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| |||| ||| |||||||||    
T  40721441 ttatcaactatgctatctacaa 40721462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44979430 - 44979281
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44979430 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttatgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 44979331  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaag 296  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44979330 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32373832 - 32373650
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32373832 aaagtggtcctttaagtttcaaaa-tcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcttttcaaacaagtcct 32373734  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattt 292  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  32373733 tttagaggatgatggtgatcattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17984090 - 17983921
Alignment:
Q  197 caaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaag 296  Q
    |||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17984090 caaacaagtccttttacagaatgatagtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 17983991  T
Q  297 tgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  17983990 tgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatttaca 17983921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17990037 - 17989864
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17990037 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaaatttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggat 17989938  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattt 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||  |||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  17989937 gatggtgatgatttaaatgatagtaacaaatagcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 6709601 - 6709665
Alignment:
Q  6 caaacacatactacaaggttttagtggtttgaaatattataactaatttattataatttataggt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6709601 caaacacatactacaaggttttagtggtttgaaatattataactaatttattataatttataggt 6709665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12143256 - 12143193
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143256 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 12143193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33325909 - 33325848
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325909 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33325848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 38473585 - 38473646
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473585 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 38473646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26070074 - 26070015
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070074 ctttaagtttcaaaagtctcaaagaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26070015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 36781131 - 36781190
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781131 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36781190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50690125 - 50690066
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690125 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 50690066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33674200 - 33674138
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33674200 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtgtcaaacaagtcct 33674138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21965247 - 21965186
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21965247 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 21965186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26549570 - 26549509
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26549570 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtcct 26549509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 28425322 - 28425383
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425322 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28425383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 36157637 - 36157698
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157637 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 36157698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40721525 - 40721464
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40721525 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttccaacaagtcct 40721464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43396857 - 43396796
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43396857 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 43396796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46051632 - 46051571
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051632 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 46051571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 46825399 - 46825464
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825399 ctttaagtttcaaaagactcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 46825464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 49094670 - 49094731
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094670 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 49094731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7651844 - 7651785
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651844 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 7651785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19315822 - 19315763
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315822 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 19315763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 23767374 - 23767432
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767374 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaa-tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23767432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25800823 - 25800764
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25800823 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25800764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 44978727 - 44978786
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44978727 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44978786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 48802290 - 48802349
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48802290 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48802349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9962933 - 9962875
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962933 ctttaagtttcaaaagtctcaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 9962875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21929708 - 21929650
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21929708 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 21929650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Original strand, 24204429 - 24204491
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24204429 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcct 24204491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 52067611 - 52067669
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52067611 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 52067669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5401052 - 5400991
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5401052 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcttttcaaacaagtcct 5400991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 25988230 - 25988291
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988230 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 25988291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37217078 - 37217017
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37217078 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37217017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 45670445 - 45670506
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670445 ctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 45670506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46825713 - 46825652
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825713 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 46825652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Original strand, 45350676 - 45350732
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45350676 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 45350732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49814479 - 49814423
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49814479 taagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 49814423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6711622 - 6711563
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6711622 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttatttttgaatcgtttcaaacaagtc 6711563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 7608723 - 7608786
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608723 gtctttaaatttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 7608786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16706052 - 16705993
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16706052 ctttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 16705993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18892513 - 18892450
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892513 gtctttaagtttcaaaagttccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 18892450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19274739 - 19274680
Alignment:
Q  149 ttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19274739 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 19274680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 7552976 - 7553034
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7552976 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 7553034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 23228154 - 23228211
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228154 tttaagtttcaaaagtccctaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 23228211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 46095034 - 46095095
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46095034 ctttaagtttcaaaaattccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 46095095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12964813 - 12964753
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12964813 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgattcaaacaagtcct 12964753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Original strand, 18782047 - 18782107
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18782047 tctttatgtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 18782107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18917706 - 18917650
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18917706 ctttaagtttcataagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaa 18917650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52147175 - 52147116
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52147175 ctttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 52147116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 9878744 - 9878802
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878744 tttaagtttcaaaagtcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9878802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 22351084 - 22351138
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22351084 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 22351138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 41982195 - 41982253
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41982195 tttaagtttcaaaagtctcatataagtccttttagtttttgcatcgtttcaaacaagtc 41982253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 17983858 - 17983918
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17983858 tttaaatttcaaaagtcttaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaccaagtcct 17983918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Original strand, 16505199 - 16505250
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16505199 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 16505250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978791
Alignment:
Q  288 aattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctaca 44978791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Original strand, 48669368 - 48669416
Alignment:
Q  160 aagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48669368 aagtttcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 48669416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49974016 - 49973972
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaat 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49974016 ctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaat 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50533552 - 50533504
Alignment:
Q  160 aagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50533552 aagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 50533504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 190
Target Start/End: Original strand, 24036660 - 24036703
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaa 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24036660 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaa 24036703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16508170 - 16508117
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16508170 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttgaattgtttcaaac 16508117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 208
Target Start/End: Original strand, 52349910 - 52349944
Alignment:
Q  174 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52349910 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 52349944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 8141450 - 8141506
Alignment:
Q  151 aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141450 aagtttcaaaagttccaaacaagtt-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 8141506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 33714321 - 33714381
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33714321 tttatgtttcaaatgtcccaaacaagtctttctagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 33714381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 185
Target Start/End: Original strand, 12964515 - 12964554
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12964515 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 12964554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41106168 - 41106137
Alignment:
Q  177 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106168 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 41106137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 49594921 - 49594972
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  49594921 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 49594972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25988543 - 25988509
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttta 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25988543 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttta 25988509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 34868518 - 34868579
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  34868518 tttaagtttcaaaagtc-caaacaaataattttagtttttaaatcgatccaaacaagtacttt 34868579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52067926 - 52067893
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52067926 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 52067893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17990038 - 17990006
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17990038 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttt 17990006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 30378878 - 30379136
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30378878 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttaaattttgaatcgtttcaaacaagtcct 30378977  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30378978 tttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaa 30379077  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  30379078 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 30379136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 12626497 - 12626755
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626497 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 12626596  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12626597 tttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 12626696  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  12626697 gccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacaa 12626755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 29050133 - 29050391
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050133 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 29050232  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29050233 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttagga 29050332  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29050333 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 29050391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 6503589 - 6503837
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6503589 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 6503688  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6503689 gatggtgatgatttatatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 6503788  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6503789 gtaccaaagatgggttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaa 6503837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8178520 - 8178271
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8178520 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaaagga 8178421  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8178420 tgacggtgatgatttgaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 8178321  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8178320 ggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 8178271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1915613 - 1915365
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1915613 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttccaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggat 1915514  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1915513 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 1915414  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  1915413 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 1915365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Original strand, 16193170 - 16193425
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193170 aaagtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaattcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 16193269  T
Q  208 ttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaga 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16193270 ttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 16193369  T
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatct 363  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16193370 agccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattttatct 16193425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26393251 - 26393031
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26393251 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 26393152  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26393151 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 26393052  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  26393051 taccaactatgctatctacaa 26393031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 139 - 367
Target Start/End: Original strand, 3408079 - 3408308
Alignment:
Q  139 aaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatg 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  3408079 aaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatg 3408178  T
Q  238 atagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3408179 atagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaa 3408278  T
Q  338 ggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  3408279 ggaagcaattaccaactatactatctacaa 3408308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 17942899 - 17943154
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17942899 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa--cct 17942996  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17942997 tttagatgatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 17943096  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  17943097 gccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattaccaattatgctatctaca 17943154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26231212 - 26230955
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26231212 aaagtggtcctttaagtttcaagaatttcaaacaagtctttgaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtcat 26231113  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26231112 tttagaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaa 26231013  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||    
T  26231012 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaactaccaactatgttatttaca 26230955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3259087 - 3258845
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259087 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatactttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 3258988  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  3258987 tttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagga 3258889  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3258888 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 3258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 2707358 - 2707578
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  2707358 ctttaagttccaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 2707457  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2707458 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaat 2707557  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  2707558 taccaactatgatatctacaa 2707578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 366
Target Start/End: Original strand, 9382416 - 9382637
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatga--tgattcaaatgatagcaa 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||    
T  9382416 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagcccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgaattgattcagatgatagaaa 9382515  T
Q  245 caaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanca 344  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9382516 caaagagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagca 9382615  T
Q  345 attaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  9382616 attaccaactatgttatctaca 9382637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 110 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6785378 - 6785142
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785378 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 6785279  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6785278 tttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 6785179  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6785178 gccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaa 6785142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 26936506 - 26936726
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26936506 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 26936605  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26936606 aagagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaat 26936705  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||| ||| |||||||||    
T  26936706 tatcaactatgctatctacaa 26936726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17428513 - 17428294
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17428513 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtatttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaagatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17428414  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17428413 agaacattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17428314  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  17428313 accaactatgttatctacaa 17428294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 10256098 - 10256356
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaag-tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  10256098 aaagtggtcctttaagtttcaaaaatttcaaacaagctctttaagtttcaaaagccccaaacaagtctttttagttttcgaatcgttttaaacaagttct 10256197  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10256198 tttagaggatgacggtgatgattgagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 10256297  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10256298 accagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 10256356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 2390164 - 2390384
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  2390164 ctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttagatgatagcaaca 2390263  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2390264 aatagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 2390363  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  2390364 taccaactatgttatctacaa 2390384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 1077095 - 1077356
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1077095 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaaatttaaaaagtcatgaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcct 1077194  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcat---tatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgtta 305  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1077195 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcatcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgtta 1077294  T
Q  306 gaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  1077295 ggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 1077356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10931393 - 10931187
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |    
T  10931393 ctttaagtttcaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagataatagcaata 10931294  T
Q  247 aagagcattatccaccgttt----accatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaan 342  Q
    |||| ||||||||||| |||      ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  10931293 aagaacattatccaccatttctcatgcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaa 10931194  T
Q  343 caattac 349  Q
    |||||||    
T  10931193 caattac 10931187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35224122 - 35223921
Alignment:
Q  166 caaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||  ||    
T  35224122 caaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacaatatacacaatt 35224023  T
Q  266 taccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  35224022 tgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 35223923  T
Q  366 aa 367  Q
    ||    
T  35223922 aa 35223921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Original strand, 11133734 - 11133991
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctt-taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||   ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  11133734 aaagtcatcctttaagtttcaaaagtcctaaagtggtcctgtaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttaattttttaatcgtttcaaacaagtcat 11133833  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11133834 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 11133933  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttc-aaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  11133934 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaattaccatctatgctatctac 11133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26196563 - 26196343
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26196563 ctttaactttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 26196464  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || | ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26196463 aaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagt-gttgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaat 26196365  T
Q  347 tacc-aaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  26196364 taccaaactatgttatctacaa 26196343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2598290 - 2598121
Alignment:
Q  200 acaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccac--cgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  2598290 acaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaaaagcattatccacaccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagt 2598191  T
Q  298 gggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2598190 gggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatgatatctacaa 2598121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 17515006 - 17515121
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17515006 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 17515105  T
Q  247 aagagcattatccacc 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  17515106 aagagcattatccacc 17515121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25820820 - 25820573
Alignment:
Q  119 atttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    |||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||      
T  25820820 atttaatttacaaaagtcccaaacaagtcgtttaagtttcgaaagtccgaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttgaaacaactccttttagagat 25820721  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||   |||  ||||  |||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||    
T  25820720 tgatggtgatgatttagatgatagtaacaaataacattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagattt 25820621  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  25820620 ggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctac 25820573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2390448 - 2390386
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390448 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 2390386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2707641 - 2707580
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707641 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 2707580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31376099 - 31376038
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31376099 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 31376038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 26230889 - 26230952
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26230889 gtctttaagttttaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 26230952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6503900 - 6503839
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6503900 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 6503839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 12612807 - 12612868
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12612807 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 12612868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12626818 - 12626757
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626818 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 12626757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29050454 - 29050393
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050454 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 29050393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30379198 - 30379138
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379198 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 30379138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3408371 - 3408312
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408371 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 3408312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1077418 - 1077360
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1077418 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 1077360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16193492 - 16193434
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193492 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 16193434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 2598056 - 2598117
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598056 gtctttaagttttaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2598117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 6785060 - 6785121
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785060 ctttatgtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 6785121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9382701 - 9382640
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382701 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 9382640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10256419 - 10256358
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10256419 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttcgtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 10256358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17943218 - 17943157
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943218 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17943157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 26196281 - 26196341
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26196281 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcggttcaaccaagtcct 26196341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12613101 - 12613026
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12613101 aaagtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtt 12613026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 3258766 - 3258824
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258766 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 3258824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 1915302 - 1915363
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1915302 ctttaagtttccaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatagtttcaaacaagtcct 1915363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 8178208 - 8178269
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8178208 ctttaagttttaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacatgtcct 8178269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 10931107 - 10931168
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10931107 ctttaagtttcaaaagttccaaacaaatacttttagtttttgaatcgtatcaaacaagtcct 10931168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 12612930 - 12612991
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612930 ctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 12612991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 17428231 - 17428292
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428231 ctttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17428292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11134055 - 11133995
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134055 tttaagtttcaaaagtcctaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11133995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 26392971 - 26393021
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26392971 taagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 26393021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 367
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376036
Alignment:
Q  302 gttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaa 31376036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 25820508 - 25820569
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25820508 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttaattttttaatcgtttcaaacaattcct 25820569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 95)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6600416 - 6600158
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6600416 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 6600317  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
     ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6600316 cttagaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaa 6600217  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6600216 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 6600158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11001008 - 11000750
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11001008 aaagtggtcatttaattttcaaaagtcctaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11000909  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11000908 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 11000809  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  11000808 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 11000750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30298029 - 30297771
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30298029 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 30297930  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  30297929 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctagga 30297830  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  30297829 gccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 30297771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 8689433 - 8689690
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8689433 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctt 8689532  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8689533 tttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 8689632  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8689633 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgttatctaca 8689690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6740235 - 6739977
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6740235 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 6740136  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6740135 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 6740036  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6740035 ggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 6739977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 42993379 - 42993637
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42993379 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 42993478  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42993479 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 42993578  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  42993579 gccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 42993637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 31710143 - 31710400
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31710143 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttct 31710242  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  31710243 tttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagga 31710342  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31710343 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctaca 31710400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 41282213 - 41282461
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41282213 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 41282312  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41282313 aatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttg 41282412  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41282413 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 41282461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 39824427 - 39824675
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39824427 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagaggat 39824526  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39824527 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttg 39824626  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  39824627 gtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactatgtcatctacaa 39824675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 20408394 - 20408652
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408394 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20408493  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  20408494 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagga 20408593  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20408594 gctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 20408652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 40074811 - 40075069
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40074811 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgtttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 40074910  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40074911 tttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 40075010  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40075011 gccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaa 40075069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3352271 - 3352024
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3352271 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaa-gaat 3352173  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3352172 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttg 3352073  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3352072 gtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 3352024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 14717504 - 14717724
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14717504 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 14717603  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14717604 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 14717703  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  14717704 taccaactatgctatctacaa 14717724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 14952223 - 14952443
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14952223 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgttgattcagatgatagcaaca 14952322  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14952323 aagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaat 14952422  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  14952423 taccaactatgttatctacaa 14952443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16096229 - 16095982
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16096229 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 16096130  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16096129 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 16096030  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16096029 gtacc-aagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 16095982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11692424 - 11692173
Alignment:
Q  113 gtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11692424 gtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaaatcctttt 11692325  T
Q  212 aaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagcc 311  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  11692324 aaaggatgatggtggtgattcaaatgttagcaacaaagagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggc 11692225  T
Q  312 agatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatct 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  11692224 agatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatct 11692173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4016143 - 4015896
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4016143 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 4016044  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4016043 gatggtgatgatttagatgatagtaa-aaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttg 4015945  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4015944 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 4015896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 8215771 - 8216019
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8215771 tttaagtttcaaaagttccaaacaatttctttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 8215870  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8215871 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 8215970  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8215971 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 8216019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20079537 - 20079281
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20079537 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa-tcct 20079439  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20079438 tttagaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 20079339  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20079338 gtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctaca 20079281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19398463 - 19398215
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19398463 tttaagtttcaaaaatccaaaacaagttttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggat 19398364  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19398363 gatgatgatgattcagatgatagtaacaaagaacattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttg 19398264  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19398263 gtaccaaagatgagttcaaagaaacaattaccaactatgctatctacaa 19398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23129193 - 23128937
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23129193 aaagtggtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaaattctttaagtttcaaaagtctaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23129094  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  23129093 tttagaggataatggtgatgattcagatgatagcagcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttagga 23128994  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  23128993 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctac 23128937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 366
Target Start/End: Original strand, 30863152 - 30863371
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30863152 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggctgatggtgatgattcagatgatagcaaca 30863251  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30863252 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaat 30863351  T
Q  347 taccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  30863352 taccaactatgctatctaca 30863371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33760740 - 33760492
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33760740 tttaattttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttagaggat 33760641  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33760640 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 33760541  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  33760540 gtaccaaagatgagttcaaagaagtaattaccaactatgctatctacaa 33760492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38964355 - 38964136
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  38964355 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 38964256  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38964255 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 38964157  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  38964156 taccaactatgctatctacaa 38964136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Original strand, 6331248 - 6331479
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6331248 tttaagtttcaaaagtcccaagcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 6331347  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6331348 gatggtgatgatttagatgatagtaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 6331447  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattacc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6331448 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 16752016 - 16752235
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16752016 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 16752115  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaa 16752235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26593550 - 26593302
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26593550 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttggtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 26593451  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
     ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26593450 aatggtgatggtttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 26593351  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26593350 gtaccaaagataagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaa 26593302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 35342079 - 35342299
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  35342079 ctttaagtttcaaaagtcccaatcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaaagatgatggtgatgattcagttgatagcaaca 35342178  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35342179 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaat 35342278  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||| ||| |||||||||    
T  35342279 tatcaactatgctatctacaa 35342299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28078685 - 28078428
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28078685 aaagtggtcttttaagtttcaaaagccccaaacaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtctt 28078586  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||  || |  ||||||||||||||||||||| |    
T  28078585 tttagaggaagatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttagga 28078486  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28078485 gccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctaca 28078428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43166530 - 43166291
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43166530 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggat 43166431  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||         | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  43166430 gat---------ttaaatgatagaaacaaagagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttg 43166340  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  43166339 gtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaa 43166291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 1052435 - 1052652
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1052435 ctttaagtttcaaaagtctcaaataagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatacagatgatagcaaca 1052534  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1052535 aagagc---atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaat 1052631  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  1052632 taccaactatgctatctacaa 1052652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26035588 - 26035368
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  26035588 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagcaaca 26035489  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26035488 aagagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaat 26035389  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  26035388 taccaactatggtatctacaa 26035368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30208667 - 30208424
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| ||||| |||||    
T  30208667 tttaaatttcaaaagtcccaaacaaatcatttaagtttcaaaagtcccaaacaattccttttagtttttgaatc-----aaacaagtctttttagaggat 30208573  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  30208572 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttg 30208473  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30208472 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 30208424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 8694727 - 8694985
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||   ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  8694727 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtctaaaagtggtcatttaagtttcaaaagtaaaaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagcttt 8694826  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| || |||  |    
T  8694827 tttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatga 8694926  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||  ||| |||||||||    
T  8694927 gccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataattatcaattatgctatctacaa 8694985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27116374 - 27116121
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27116374 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaccaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 27116275  T
Q  208 ttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaga 307  Q
    ||||| ||||||||||| | |||      |||||||||||||| ||||||||||  |||   |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||     
T  27116274 ttttagaggatgatgattaagat------gatagcaacaaagaacattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttagg 27116181  T
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27116180 agccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 27116121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27457389 - 27457219
Alignment:
Q  196 tcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaa 295  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  27457389 tcaaacaagttcttttagaggatgatgatgatgattcaaatg-tggcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaa 27457291  T
Q  296 gtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27457290 gtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 27457219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 197 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39002217 - 39002047
Alignment:
Q  197 caaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaag 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39002217 caaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaatagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 39002118  T
Q  297 tgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  39002117 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 39002047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 297
Target Start/End: Original strand, 27509849 - 27510027
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  27509849 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttagaggat 27509948  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagt 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27509949 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 27510027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Original strand, 6251861 - 6252091
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6251861 tcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga- 6251959  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
                        |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6251960 --------------------tgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagat 6252039  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6252040 ttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 6252091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 444853 - 445073
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| |    
T  444853 ctttaaattttaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatgttgatgatccagatgataacaata 444952  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  444953 aagatcatgatccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaat 445052  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  445053 taccaactatgctatctacaa 445073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 20517029 - 20517177
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctt-taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20517029 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaattgtttcaaataagtccttttagaggat 20517128  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgttta 267  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20517129 gatgatgatgatttagattatagcaacaaaaagcattatccaccattta 20517177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 367
Target Start/End: Original strand, 11935395 - 11935564
Alignment:
Q  197 caaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaag 296  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11935395 caaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgataacaacaaagatcattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaag 11935494  T
Q  297 tgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11935495 tgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaa 11935564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19661901 - 19661769
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctt-taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19661901 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctataagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 19661802  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagag 251  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  19661801 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagag 19661769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37923668 - 37923546
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37923668 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtgtttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 37923569  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatag 241  Q
    |||| |||||||| | |||||||    
T  37923568 gatggtgatgatttagatgatag 37923546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19659646 - 19659523
Alignment:
Q  244 acaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaanc 343  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  19659646 acaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagc 19659547  T
Q  344 aattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  19659546 aattaccaactatgctatctacaa 19659523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17002436 - 17002343
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17002436 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcacagacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaaca 17002343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6252154 - 6252093
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6252154 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 6252093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 11000687 - 11000748
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000687 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11000748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11935627 - 11935566
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935627 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11935566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Original strand, 26593238 - 26593298
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593238 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26593298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 30297709 - 30297769
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297709 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 30297769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 27457156 - 27457215
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457156 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27457215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31710464 - 31710405
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710464 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31710405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 6600095 - 6600156
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600095 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 6600156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 6739914 - 6739975
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6739914 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 6739975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 20079217 - 20079278
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20079217 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20079278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20408715 - 20408654
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408715 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20408654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 28078364 - 28078425
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078364 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28078425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 30208362 - 30208419
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30208362 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 30208419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40075132 - 40075071
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40075132 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttttgtttttgaattgtttcaaacaagtcct 40075071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1052714 - 1052654
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1052714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 1052654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39824737 - 39824677
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824737 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 39824677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 43166229 - 43166289
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43166229 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 43166289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 19398152 - 19398210
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19398152 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 19398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8689756 - 8689695
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689756 gtctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8689695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8695048 - 8694987
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8695048 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 8694987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 16095919 - 16095980
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16095919 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaacccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 16095980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 19659460 - 19659521
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19659460 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtcct 19659521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 3351962 - 3352022
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3351962 tttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 3352022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 4015834 - 4015894
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4015834 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaagcaagtcct 4015894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 27116059 - 27116119
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27116059 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcattttaaacaagtcct 27116119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 33760430 - 33760490
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760430 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33760490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35342362 - 35342303
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342362 ctttaagtttcaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35342303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 39401952 - 39402007
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39401952 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 39402007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8216082 - 8216021
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216082 ctttaagttttaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 8216021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14952508 - 14952447
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952508 gtcttcaaatttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14952447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41282524 - 41282463
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41282524 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttaaatcatttcaaacaagtcct 41282463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 23128871 - 23128931
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaa-caaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128871 ctttaagtttcaaaagtctcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23128931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27510152 - 27510092
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510152 tttaagttttaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 27510092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 38964073 - 38964132
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38964073 ctttaagtttcaaaagtctcaaacgagtctttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtc 38964132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6332958 - 6332900
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6332958 ctttaagttttaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 6332900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 39001985 - 39002043
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39001985 tttaagtttcaaaagttccaaataaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 39002043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30863433 - 30863376
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30863433 tttaagtttcaaaagtc-caaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 30863376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 9919241 - 9919294
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  9919241 ctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42993700 - 42993639
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42993700 ctttaagtttcaaaagttccaaagaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaattcct 42993639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14717768 - 14717726
Alignment:
Q  166 caaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717768 caaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 14717726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9919787 - 9919734
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  9919787 ctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16752279 - 16752242
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16752279 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 16752242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42263100 - 42263047
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  42263100 gtctttaagtttcaaaagtcccaaaatggtccttttagtttttgaatcgtttca 42263047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 567778 - 567710
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttttt 187  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  567778 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtcctttaagtttcaaaagtctaaaacaagtcctttaagttttt 567710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 353
Target Start/End: Original strand, 27510038 - 27510076
Alignment:
Q  315 tttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27510038 tttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaac 27510076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 33002931 - 33002982
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  33002931 ctttaagtttcaaaagtcccaaaatggtccttttagtttttgaatcgtttca 33002982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35155414 - 35155363
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  35155414 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 35155363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 42262805 - 42262856
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42262805 ctttaaatttcaaaagtctcaaagtgatccttttagtttctgaatcgtttca 42262856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 206
Target Start/End: Original strand, 11692135 - 11692165
Alignment:
Q  176 cttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692135 cttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11692165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 35443171 - 35443430
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443171 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 35443270  T
Q  208 ttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaga 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  35443271 ttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttagg 35443370  T
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  35443371 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 35443430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43806803 - 43806555
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43806803 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 43806704  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  43806703 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagattta 43806604  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  43806603 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 43806555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 1293348 - 1293605
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1293348 aaagtgatc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaaatcacaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaactagtcct 1293446  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1293447 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaa 1293546  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1293547 accagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 1293605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35884671 - 35884452
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  35884671 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 35884572  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    | |||||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35884571 atagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35884472  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  35884471 accaactatgttatctacaa 35884452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39513619 - 39513362
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39513619 aaagtgattctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcct 39513520  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39513519 tttagaggatgacgatgatgattcagatgatagcaacaaagagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 39513420  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  39513419 gttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgttatctaca 39513362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 147 - 365
Target Start/End: Original strand, 37933541 - 37933759
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  37933541 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 37933640  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37933641 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 37933740  T
Q  347 taccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  37933741 taccaactatgctatctac 37933759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38633984 - 38633733
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633984 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 38633885  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||      ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38633884 tttagaggatgatggtgatgat------gatagtaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaa 38633791  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  38633790 atcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctaca 38633733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22684230 - 22684010
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22684230 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 22684131  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22684130 aagagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaat 22684031  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  22684030 taccaactatgatatctacaa 22684010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28496596 - 28496377
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28496596 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 28496497  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||| |||||||| | |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28496496 aagagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 28496398  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  28496397 taccaactatgttatctacaa 28496377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28707715 - 28707468
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28707715 tttaagttttaaaagttccaa-caagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttacaggat 28707617  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28707616 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttg 28707517  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  28707516 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgatatctacaa 28707468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Original strand, 440708 - 440959
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  440708 tcatttaagtttcaaaagttccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagag 440807  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  440808 gatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagat 440907  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  440908 ttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaa 440959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9056607 - 9056360
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatg 219  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  9056607 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatg 9056508  T
Q  220 atgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttgg 319  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  9056507 atggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgg 9056408  T
Q  320 taccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9056407 tatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaa 9056360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 4649011 - 4649269
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4649011 aaagtggttatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagttttcgaatcgtttcaaacaagtcct 4649110  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  4649111 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaa 4649210  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  4649211 gtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattaccaattatgctatctacaa 4649269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 513179 - 513426
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  513179 tttaagtttcaaaagtaccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggat 513278  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  513279 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 513377  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  513378 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 513426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 2533171 - 2533391
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  2533171 ctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 2533270  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2533271 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 2533370  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  2533371 taccaactatgatatctacaa 2533391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 38106971 - 38107218
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  38106971 tttaagttttaaaagtttcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagatgat 38107069  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38107070 gatggtgataatttaaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 38107169  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38107170 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 38107218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 29485187 - 29485405
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29485187 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 29485286  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29485386 accaactatgttatctacaa 29485405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 7434785 - 7435005
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7434785 ctttaaatttcgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgcttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 7434884  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7434885 aagagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 7434984  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7434985 taccaactatgttatctacaa 7435005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40302165 - 40301915
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagg 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  40302165 tcatttaagtttcaaaagtcctaaagtggtctttaagtttaaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatg 40302066  T
Q  217 atgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  40302065 atgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatt 40301966  T
Q  317 tggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  40301965 tggtaccaaagataaattcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 40301915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24430842 - 24430593
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagt-tcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24430842 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaagttctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagagga 24430743  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  24430742 tgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagattt 24430643  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||  |||||||||    
T  24430642 ggtaccaaagatgagttcaataaaacaattatcaactatactatctacaa 24430593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 12010450 - 12010666
Alignment:
Q  149 ttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  12010450 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaagatgatggcgatgattcagatgatagcaacaaa 12010549  T
Q  249 gagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatta 348  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12010550 gagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatta 12010649  T
Q  349 ccaaccatgttatctac 365  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  12010650 ccaactatgctatctac 12010666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 23935133 - 23935352
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| ||||||    
T  23935133 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattatgatgataacaacaa 23935232  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaa 23935352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 38208623 - 38208872
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38208623 tttaagtttcaaaagttctaaagtggtcttttaaatttcaaaagtctcagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 38208722  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaa-agatggctaattttaagtgggtgttagaagccagattt 317  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38208723 aatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaacattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 38208822  T
Q  318 ggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38208823 ggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaa 38208872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 259877 - 260096
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  259877 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaga 259976  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||  | |  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  259977 aagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 260075  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  260076 taccaactatgctatctacaa 260096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 656044 - 655825
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  656044 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaga 655945  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||  | |  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  655944 aagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 655846  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  655845 taccaactatgctatctacaa 655825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 841779 - 841560
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  841779 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaga 841680  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||  | |  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  841679 aagaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 841581  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  841580 taccaactatgctatctacaa 841560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 365
Target Start/End: Original strand, 33651740 - 33651958
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33651740 ctttaagttttaaaagtctgaaacatgtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 33651839  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  33651840 aagagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaat 33651939  T
Q  347 taccaaccatgttatctac 365  Q
    ||| ||| ||| |||||||    
T  33651940 tacaaactatgctatctac 33651958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23972538 - 23972317
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatga-tgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  23972538 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattggtgatgattcagatgatagcaaca 23972439  T
Q  247 aagagcattatcc-accgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||| ||||||| ||  |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23972438 aagagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaa 23972339  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  23972338 ttaccaactatgttatctacaa 23972317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36219049 - 36218804
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatg 219  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |  |||    
T  36219049 tttaactttcaaaagtcccaaacaagtttttaacttttaaaagtcttaaacaagtccttttagtttttgaattatttcaaacaaattcttttagataatg 36218950  T
Q  220 atgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttgg 319  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36218949 atgatgatgcttcagatgataacaacaaagaccattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttgg 36218850  T
Q  320 taccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||    
T  36218849 taccaaagatgagttcaa-gaagcaattatcaactatattatctaca 36218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42988496 - 42988248
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42988496 tttaaatttcaaaagtcccaaacaagttctctaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 42988397  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  42988396 gatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttg 42988297  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| || |||| || ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  42988296 gtaccaaatataagttaaatgaagcaattatcaactatattatctacaa 42988248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 13796989 - 13797207
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13796989 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 13797088  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    |||||||  |||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| ||| |||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaa 13797207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41536800 - 41536549
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  41536800 tcatttaagtttcaaaagtctcgaacaagttccttaggtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttgaaacaattcattttagag 41536701  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||| | |||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41536700 gatgatggtgatgatttagatgatagtaacaaagagtatttttcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagat 41536601  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41536600 ttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 41536549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 6016104 - 6016324
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  6016104 ctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagacgatagcaaca 6016203  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| || ||| ||||    
T  6016204 aaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaat 6016303  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  6016304 taccaactatgctatctacaa 6016324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 3875856 - 3876027
Alignment:
Q  196 tcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaa 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3875856 tcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgattgcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 3875955  T
Q  296 gtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3875956 gtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 3876027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24193563 - 24193356
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24193563 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatactttatgtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgattcgtttcaaacaagtcct 24193464  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    ||||         || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  24193463 ttta---------gaggatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagga 24193374  T
Q  309 gccagatttggtaccaaa 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24193373 gccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Original strand, 8137072 - 8137239
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8137072 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaactccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 8137171  T
Q  247 aagagca-ttatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccag 313  Q
    |||| || ||||||||| ||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8137172 aagaacatttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36400224 - 36400092
Alignment:
Q  235 atgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36400224 atgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagtt 36400125  T
Q  335 caaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  36400124 caaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 36400092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847231
Alignment:
Q  253 attatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaa 352  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  353 ccatgttatctacaa 367  Q
    | ||| |||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaa 15847231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Original strand, 9884727 - 9884839
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9884727 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttagaggat 9884826  T
Q  219 gatgatgatgatt 231  Q
    |||||||||||||    
T  9884827 gatgatgatgatt 9884839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 227
Target Start/End: Original strand, 15846999 - 15847118
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15846999 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtcc 15847098  T
Q  208 ttttaaaggatgatgatgat 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  15847099 ttttagaggatgatggtgat 15847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39295421 - 39295288
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||    
T  39295421 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc-----agaggat 39295327  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatc 258  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  39295326 gatggtgatgattcaga-gatagcaacaaagatcattatc 39295288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37933824 - 37933765
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933824 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37933765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 441022 - 440961
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441022 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 440961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 513489 - 513428
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513489 ctttaagtttcaaaagtctcaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 513428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 41536487 - 41536547
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536487 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 41536547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 260159 - 260100
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260159 ctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 260100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 655762 - 655821
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655762 ctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 655821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 841497 - 841556
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841497 ctttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 841556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4649331 - 4649272
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4649331 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 4649272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 36400029 - 36400088
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400029 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36400088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 43806492 - 43806551
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806492 ctttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 43806551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3876090 - 3876029
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876090 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 3876029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13797270 - 13797209
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13797270 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 13797209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 38633670 - 38633727
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633670 tttaagtttcaaaagtctcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 38633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 28496315 - 28496375
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496315 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28496375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33652022 - 33651962
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33652022 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33651962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 42988187 - 42988239
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42988187 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 42988239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1293668 - 1293609
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293668 ctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1293609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Original strand, 9056299 - 9056358
Alignment:
Q  149 ttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9056299 ttaagtttcaaaagtttcaaacaaatcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 9056358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 22683947 - 22684006
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22683947 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 22684006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 23972254 - 23972313
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23972254 ctttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23972313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38107281 - 38107222
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107281 ctttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38107222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2533453 - 2533395
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533453 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2533395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35443493 - 35443435
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35443493 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagt 35443435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12010734 - 12010673
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12010734 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 12010673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 24193089 - 24193150
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24193089 ctttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtcct 24193150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 24430531 - 24430591
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24430531 tttaagtttcaaaaatccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 24430591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Original strand, 35884394 - 35884448
Alignment:
Q  152 agtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884394 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35884448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15847294 - 15847233
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847294 ctttaagtttcaaaagctccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 15847233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 28707410 - 28707466
Alignment:
Q  151 aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28707410 aagtttcaaaagtctcaagcaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 28707466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23935395 - 23935359
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23935395 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 23935359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193152
Alignment:
Q  324 aaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 24193152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38208935 - 38208876
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208935 tctttaagtttcaaaggtcttaaacaagtt-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38208876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21356705 - 21356654
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21356705 ctttaagtttaaaaagtctcaaacaagttctttcagtttttgaatcgtttca 21356654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 18873944 - 18873994
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  18873944 tttaagtttcaaaagtctcaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 18873994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 36218741 - 36218799
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||| ||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36218741 tttaactttcaaaagttctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36218799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6016366 - 6016331
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6016366 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 6016331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9056646 - 9056583
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaa 172  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9056646 aaagtcatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcttttaagtttcaaaagtctcaaacaa 9056583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18874224 - 18874173
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  18874224 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 18874173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9056637 - 9056599
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9056637 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcttttaagttt 9056599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27428492 - 27428406
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttt-----tagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||    
T  27428492 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtcttttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctttaattttagtttttgaatcgtttcaaa 27428406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 40301853 - 40301911
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||| |||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40301853 tttaagtttcaaatgtcctaaataagtccttttagattttgaatcgtttcaaaaaagtc 40301911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43469255 - 43469202
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||    
T  43469255 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcgtttcaaa 43469202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 117)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 10588442 - 10588699
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| || |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10588442 aaagtggtcctttaagtttcaaaaatcccaaacaagtttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtcctt 10588541  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  10588542 ttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggag 10588641  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10588642 ccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 10588699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28812566 - 28812309
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812566 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28812467  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  28812466 tttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttagga 28812368  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  28812367 gccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 28812309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 32118575 - 32118833
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32118575 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttct 32118674  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  32118675 tttaaaggatgatgataatgattcagatgatagcaacaaagagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttagga 32118774  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  32118775 gccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 32118833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39995437 - 39995189
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39995437 tttaagtttcaaaagtcccaatcaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 39995338  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39995337 gatgataatgattcagatgatagcaacaaagaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttg 39995238  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39995237 gtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaa 39995189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17847365 - 17847118
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17847365 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggat 17847266  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17847265 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcct-aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 17847167  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  17847166 gtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaa 17847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 26017322 - 26017542
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26017322 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgatagcaaca 26017421  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26017422 aatagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 26017521  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  26017522 taccaactatgctatctacaa 26017542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24458872 - 24458653
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  24458872 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 24458773  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    | |||||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24458772 atagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24458673  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24458672 accaactatgttatctacaa 24458653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 139 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28160204 - 28159975
Alignment:
Q  139 aaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatg 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  28160204 aaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgattcagatg 28160105  T
Q  238 atagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28160104 atagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaa 28160005  T
Q  338 ggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  28160004 gaaagcaattaccaactatggtatctacaa 28159975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8882293 - 8882038
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8882293 aaagtggtcctttaagcttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaatcaagtcct 8882194  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8882193 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 8882094  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  8882093 gccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatcta 8882038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11795434 - 11795179
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795434 aaagtggtcctttaagtatcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11795335  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11795334 tttagaggatgatggtgatgattaaaatgaaagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 11795235  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  11795234 gccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatcta 11795179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 42273671 - 42273921
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42273671 tttaagttttaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 42273770  T
Q  219 gatgatg--atgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatt 316  Q
    |||| ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42273771 gatggtgtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatt 42273870  T
Q  317 tggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  42273871 tggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 42273921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 14564657 - 14564915
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14564657 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 14564756  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  14564757 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagga 14564856  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14564857 gccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaa 14564915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 117 - 366
Target Start/End: Original strand, 48149367 - 48149617
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48149367 tcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagag 48149466  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  48149467 gatgatgacgatgattcaaatgaaagcaacaaagtgcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagat 48149566  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48149567 ttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctaca 48149617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50542634 - 50542376
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  50542634 aaagtggtcctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcagcagtcccaaacaagttcttttattttttgaatcgtttcaaacaagtcat 50542535  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  50542534 tttaaaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttagga 50542435  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  50542434 gtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaa 50542376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4545227 - 4545007
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4545227 ctttaagttttaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 4545128  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  4545127 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaat 4545028  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  4545027 taccaactatgttatctacaa 4545007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 2055146 - 2055397
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||      |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055146 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaa------aagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 2055239  T
Q  210 ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaag 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  2055240 ttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggag 2055339  T
Q  310 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  2055340 ccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattatcaactatgttatctacaa 2055397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23135248 - 23135028
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  23135248 ctttaagtttaaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 23135149  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||| ||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23135148 aagaacattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 23135049  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23135048 taccaactatgttatctacaa 23135028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33174262 - 33174042
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  33174262 ctttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 33174163  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33174162 aggagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaat 33174063  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||  ||||||||    
T  33174062 taccaactatgaaatctacaa 33174042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33808050 - 33807802
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33808050 tttaattttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 33807951  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33807950 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttg 33807851  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33807850 gtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaa 33807802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 35929939 - 35930158
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  35929939 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcgttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaaca 35930038  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35930039 aagagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaat 35930137  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  35930138 taccaactatgctatctacaa 35930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25734496 - 25734245
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25734496 tcatttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 25734397  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25734396 gatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaataacattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagat 25734297  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25734296 ttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattaccaactatgttatctacaa 25734245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50276377 - 50276160
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  50276377 ctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagtaaca 50276278  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50276277 aatagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 50276181  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  50276180 taccaactatgctatctacaa 50276160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9339368 - 9339145
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||    
T  9339368 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcgaca 9339269  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaa---gatgagttcaaggaanc 343  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  9339268 aagagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagc 9339169  T
Q  344 aattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9339168 aattaccaactatgttatctacaa 9339145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 28264541 - 28264762
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28264541 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaac 28264640  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28264641 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 28264740  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  28264741 ttaccaactatgctatctacaa 28264762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 31590948 - 31591194
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31590948 tttaagtttcaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaa-caaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggat 31591046  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31591047 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 31591145  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  31591146 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 31591194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48707975 - 48707755
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  48707975 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttaaaggatgatggtgatgatttagatgataacaaca 48707876  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48707875 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 48707776  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  48707775 taccaactatgctatctacaa 48707755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 31208619 - 31208863
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31208619 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtatcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 31208718  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31208719 gatggtgatgatttagatgttagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgttt----agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttg 31208814  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  31208815 ataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 31208863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 40988533 - 40988752
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40988533 tttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 40988632  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaa 40988752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19169036 - 19168817
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19169036 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagatgatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 19168937  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaa 19168817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30467249 - 30467025
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt----ttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30467249 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagc 30467150  T
Q  243 aacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaan 342  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30467149 aacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 30467050  T
Q  343 caattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||| ||| |||||||||    
T  30467049 aaattaccaactatgctatctacaa 30467025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 37381707 - 37381965
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37381707 aaagtgatcttttaattttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 37381806  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37381807 ttcaaaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 37381906  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  37381907 accagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 37381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 23552923 - 23553183
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23552923 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 23553022  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaaga----gcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgtt 304  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23553023 tttataggatgatggtgatgattc-aatgatagcaacaaagatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgtt 23553120  T
Q  305 agaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||    
T  23553121 aggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaa 23553183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 49118510 - 49118730
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||| |    
T  49118510 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaaaa 49118609  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    || || |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49118610 aatagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaat 49118709  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  49118710 taccaactatgctatctacaa 49118730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 22298380 - 22298637
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22298380 aaagtgttcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 22298478  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaa-gatggctaattttaagtgggtgttaga 307  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  22298479 tttagaggatgatgatgaagat-cagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagg 22298577  T
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  22298578 agccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaattaccaattatgctatctacaa 22298637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33693614 - 33693355
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaa-tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33693614 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaagcaagttctttaagtttcaaaagtcccaagaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcc 33693515  T
Q  208 ttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaga 307  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  33693514 tttcagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttagg 33693415  T
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33693414 aatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 33693355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 364
Target Start/End: Original strand, 15984909 - 15985126
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  15984909 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaagatgatggtgatgatttagatgattgcaaca 15985008  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15985009 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaat 15985108  T
Q  347 taccaaccatgttatcta 364  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15985109 taccaactatgttatcta 15985126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 12196349 - 12196588
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196349 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 12196448  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||         | | ||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12196449 gat---------ttagatgaaggcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 12196539  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  12196540 gtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 12196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 25730113 - 25730359
Alignment:
Q  122 taagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatga 220  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25730113 taagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagcccttttagaggatga 25730212  T
Q  221 tgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggt 320  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||    
T  25730213 tggtgatgatttagataatagcaacaaagaacattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagt 25730312  T
Q  321 accaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25730313 gccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgctatctacaa 25730359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17993287 - 17993039
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17993287 tttaagtttcaaaagttccaaagtcgtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaat 17993188  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17993187 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttg 17993088  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17993087 atagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaa 17993039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42549862 - 42549644
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  42549862 tttaagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggagatgattcagatgatagcaacaa 42549763  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatctacaa 42549644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 367
Target Start/End: Original strand, 44490232 - 44490438
Alignment:
Q  161 agtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatcca 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||    
T  44490232 agtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaaatagtattatcca 44490331  T
Q  261 ccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgtta 360  Q
    || |||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  44490332 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgata 44490431  T
Q  361 tctacaa 367  Q
    |||||||    
T  44490432 tctacaa 44490438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55517389 - 55517207
Alignment:
Q  185 tttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  55517389 tttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatg 55517290  T
Q  285 gctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  55517289 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaa 55517207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 24623047 - 24623267
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| || ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24623047 ctttaagtttcaaaagtcctagacaagtcattttaatttttgaaccgtttcgaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcaggtgatagcaaca 24623146  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24623147 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 24623246  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  24623247 taccaactatgctatctacaa 24623267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Original strand, 31973533 - 31973710
Alignment:
Q  190 atcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  31973533 atcgtttcaaacaagtccttttcgaagatgatggtaatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaa 31973632  T
Q  290 ttttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  31973633 ttttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 31973710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 364
Target Start/End: Original strand, 39699944 - 39700161
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||    
T  39699944 ctttgagtttcaaaagtttcaaataaatccttttaatttttgaatcgtttcaaataagtctttttagaggatgatagtgatgattcagatgatattaaca 39700043  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39700044 aagagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaat 39700143  T
Q  347 taccaaccatgttatcta 364  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  39700144 taccaattatgttatcta 39700161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51371317 - 51371069
Alignment:
Q  122 taagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaa-gtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  51371317 taagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtttttttagaggat 51371218  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  51371217 gacggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttg 51371118  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  51371117 gtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 51371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19496338 - 19496124
Alignment:
Q  165 tcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat------------gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagc 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19496338 tcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagc 19496239  T
Q  253 attatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaa 352  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19496238 attatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 19496139  T
Q  353 ccatgttatctacaa 367  Q
    | ||| |||||||||    
T  19496138 ctatggtatctacaa 19496124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 56555385 - 56555200
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgat---tcaaatgatagca 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||| || ||||||    
T  56555385 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcattttagaggatgatgatgatgatgattcagataatagca 56555286  T
Q  244 acaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagat 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56555285 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48551988 - 48551786
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  ||    
T  48551988 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatga------------------ca 48551907  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  48551906 aagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaat 48551807  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  48551806 taccaaccatgctatctacaa 48551786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 367
Target Start/End: Original strand, 32317857 - 32318072
Alignment:
Q  160 aagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgat--------agcaacaaagag 251  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||        |||||||||||     
T  32317857 aagtctcaaataagtccttttactttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggatgatggtgattattcagatgataggctgatagcaacaaagaa 32317956  T
Q  252 cattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattacca 351  Q
    ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  352 accatgttatctacaa 367  Q
    || |||||||||||||    
T  32318057 actatgttatctacaa 32318072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30141348 - 30141130
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||   ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  30141348 ctttaagtttcaaaaatcacaaacaagtcctttaaatttc--aatagtttcaaacaattcgttttagaggatgatggtgatgctgcagatgatagcaaca 30141251  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30141250 aagagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaat 30141151  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||| ||||    
T  30141150 taccaactatgctatcaacaa 30141130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 5227338 - 5227509
Alignment:
Q  196 tcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaa 295  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5227338 tcaaacaagtctttttggaggaagattgtgatgattcagatgatagcaacgaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 5227437  T
Q  296 gtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  5227438 gtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 5227509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 44490081 - 44490224
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44490081 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggat 44490180  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccacc 262  Q
     ||| |||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  44490181 aatggtgatgatttagatgatagcaaaaaatagtattatccacc 44490224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19496415 - 19496322
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496415 tttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 19496322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20534385 - 20534286
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20534385 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaattcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 20534286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 33807737 - 33807800
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807737 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33807800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 23134965 - 23135026
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23134965 ctttaagtttcaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 23135026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 28812246 - 28812307
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812246 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28812307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25730422 - 25730363
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25730422 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25730363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 30466962 - 30467020
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466962 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30467020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48149682 - 48149620
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149682 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 48149620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 8881972 - 8882033
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8881972 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 8882033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 17847055 - 17847116
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847055 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttatagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17847116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22298700 - 22298643
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22298700 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaag 22298643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28264825 - 28264764
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264825 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 28264764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42273984 - 42273923
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273984 ctttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 42273923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44490501 - 44490440
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490501 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 44490440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49118793 - 49118732
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118793 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 49118732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31617705 - 31617613
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttt 211  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31617705 tttaagtttcaaaagtctcatacaagtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcttttt 31617613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1425360 - 1425269
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  1425360 aaagtgatcatttaagttttaaaagttccaaacaaatcctttaagtttcaaaaatcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaa 1425269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 9339082 - 9339141
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9339082 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaattccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 9339141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 11795113 - 11795172
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795113 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11795172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15985192 - 15985133
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985192 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 15985133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23553246 - 23553187
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553246 ctttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23553187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 48551723 - 48551782
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48551723 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48551782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 55517144 - 55517203
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517144 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 55517203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5227573 - 5227511
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227573 tctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 5227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14564979 - 14564917
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14564979 tctttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 14564917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32118896 - 32118838
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32118896 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagt 32118838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 50276100 - 50276158
Alignment:
Q  150 taagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276100 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 50276158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51371356 - 51371255
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51371356 aaagtggtcatttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcct-aagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagttctt 51371258  T
Q  210 tta 212  Q
    |||    
T  51371257 tta 51371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26017605 - 26017544
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017605 ctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttgtagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 26017544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31591257 - 31591196
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591257 ctttaagtttcaaaagtctcaaacgagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 31591196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31208925 - 31208865
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208925 tttaagtttcaaaagtccaaaacaactccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 31208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Original strand, 50542313 - 50542369
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50542313 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaa 50542369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10588762 - 10588703
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10588762 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttaatttttggatcgtttcaaacaagtc 10588703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31973773 - 31973715
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973773 ctttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 31973715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 33173980 - 33174038
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33173980 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttttcaaatcgtttcaaacaagtc 33174038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35930221 - 35930163
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930221 ctttaagtttcaaaggttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 35930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Original strand, 39995126 - 39995184
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39995126 ctttaagttttaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 39995184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 4544944 - 4545005
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544944 ctttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 4545005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12196651 - 12196590
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12196651 ctttaagcttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 12196590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 48707692 - 48707753
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48707692 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagattttgaatcttttcaaacaagtcct 48707753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 28159912 - 28159971
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28159912 ctttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 28159971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 51371013 - 51371064
Alignment:
Q  154 tttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51371013 tttcaaaagtctcaaataaatccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51371064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Original strand, 24458595 - 24458649
Alignment:
Q  152 agtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458595 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 24458649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Original strand, 33452367 - 33452429
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452367 tctttaagtttcaaaaattccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33452429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37382027 - 37381969
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  37382027 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttgtttttaaatcatttcaaacaagtc 37381969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 19496061 - 19496122
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19496061 ctttaaatttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 19496122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8433868 - 8433824
Alignment:
Q  168 aacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8433868 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 8433824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 367
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534284
Alignment:
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaa 20534284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 30141068 - 30141128
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141068 tttaagtttcaaaaattctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 30141128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 56555125 - 56555185
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555125 tttaagtttcaaagattccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 56555185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 25734180 - 25734243
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25734180 gtctttaagttttaaaagtctcaaacaactctagttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 25734243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32318135 - 32318074
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32318135 tctttaagtttcaaaagtaccaa-caagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 32318074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 33693292 - 33693353
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33693292 ctttaaatttcaaaagttccaaataagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 33693353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9800421 - 9800377
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaat 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9800421 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaat 9800377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17847404 - 17847328
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  17847404 aaagtggtcctttaggtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 17847328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40988811 - 40988754
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||||    
T  40988811 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatt----aatcgtttcaaacaagtcct 40988754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Original strand, 33496132 - 33496183
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33496132 ctttaagtttcaaaagtcccaaagtgatccttttagtttttgaatcgtttca 33496183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2055459 - 2055401
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2055459 tttaagttttaaaagttccaaacaagtcgtttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2055401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 208
Target Start/End: Original strand, 17993003 - 17993037
Alignment:
Q  174 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993003 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 17993037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20534376 - 20534312
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||  || ||||||||||||||||||    
T  20534376 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaattcctttaagtttcaaaa--gtctcaaacaagtccttttaa 20534312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31617707 - 31617643
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||   ||  ||||||||||||||||||||    
T  31617707 tctttaagtttcaaaagtctcatacaagtcctttaagtttcaaaa--gtttcaaacaagtcctttta 31617643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Original strand, 44490080 - 44490118
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44490080 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 44490118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31973782 - 31973745
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973782 aaagtgatcctttaagtttcaaaagttccaaacaagtc 31973745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 19168774 - 19168810
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagt 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19168774 ctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagt 19168810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 100)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 44544280 - 44544528
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44544280 tttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 44544379  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44544380 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttg 44544479  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44544480 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 44544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35600402 - 35600144
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600402 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 35600303  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  35600302 tttaaaggatgatggtaaagattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttagga 35600203  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  35600202 gccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 35600144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11476836 - 11476578
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476836 aaagtggtcctttaagttttaaaagtcccaaaaaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11476737  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11476736 tttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttagga 11476637  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  11476636 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 11476578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30798648 - 30798390
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798648 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaatagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 30798549  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30798548 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 30798449  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  30798448 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 30798390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31684376 - 31684156
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31684376 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 31684277  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31684276 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 31684177  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||  |||||||||    
T  31684176 taccaactattctatctacaa 31684156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 4923089 - 4923335
Alignment:
Q  122 taagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatga 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4923089 taagtttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaactagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatga 4923188  T
Q  221 tgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4923189 tggtgatgattcaaatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggt 4923288  T
Q  321 accaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||    
T  4923289 accaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatccacaa 4923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27364619 - 27364361
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364619 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 27364520  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27364519 tttagaggatgatgatgacgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 27364420  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27364419 gccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgttatctacaa 27364361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 47271852 - 47272100
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47271852 tttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 47271951  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47271952 gatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcg 47272051  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47272052 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 47272100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 47219016 - 47219264
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47219016 tttaagtttcaaacgtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 47219115  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  47219116 gatggtgatgatttagatgatagcaataaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagattta 47219215  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  47219216 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 47219264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1469735 - 1469515
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1469735 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagaatgatggtgatgattcatatgatagcaaca 1469636  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1469635 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaat 1469536  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  1469535 taccaactatgctatctacaa 1469515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11050531 - 11050283
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11050531 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaatgtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 11050432  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  11050431 gctggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttg 11050332  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  11050331 gtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaaatatgctatctacaa 11050283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42979608 - 42979361
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42979608 tttaagtttcaaaagttccaaataagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 42979509  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42979508 gatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttg 42979409  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
     || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42979408 atatcaaagatgagttcaacgaagcaattaccaactatgttatctaca 42979361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44800690 - 44800432
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44800690 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaactaatcct 44800591  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44800590 tttagtggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaggaacattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 44800491  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44800490 accatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattaccaactatgttatctacaa 44800432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47281406 - 47281146
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281406 aaagtggtcctttaagtttcaaaaatctcaatcaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 47281307  T
Q  209 tttaaaggatg--atgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttag 306  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47281306 tttagaggatgtgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag 47281207  T
Q  307 aagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  47281206 gagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggtatctacaa 47281146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8162992 - 8162734
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  8162992 aaagtggtcttttaagtttcaaaagccccaaacaagtcttttaagtttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttaaatcttttcaaacaaatcct 8162893  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8162892 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 8162793  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8162792 gccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 8162734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38427832 - 38427588
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  38427832 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagatgat 38427733  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38427732 gatgatg-tgatttagattatagcaacaaagagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 38427634  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatcta 364  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  38427633 ataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 38427588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Original strand, 18353005 - 18353261
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18353005 aaagtggtcatttaagtttcgaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 18353104  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  18353105 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttagga 18353204  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctac 365  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  18353205 gtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctac 18353261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 23842204 - 23842424
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23842204 ctttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 23842303  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23842304 aagagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 23842403  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  23842404 taccaactatgctatctacaa 23842424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 30876158 - 30876378
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30876158 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 30876257  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30876258 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaat 30876357  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  30876358 taccaactatgctatctacaa 30876378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 48628676 - 48628924
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48628676 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggat 48628775  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48628776 gatagtgatgatttagatgatagaaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttg 48628875  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48628876 gtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 48628924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Original strand, 7335928 - 7336179
Alignment:
Q  117 tcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7335928 tcatttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaag 7336027  T
Q  216 gatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagat 315  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7336028 gataatgatgatgatttagatgatagcaacaaatagtattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagat 7336127  T
Q  316 ttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  7336128 ttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaa 7336179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37394277 - 37394020
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37394277 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt-aaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37394179  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
     ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  37394178 cttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagga 37394079  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37394078 gtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaa 37394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41139682 - 41139448
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41139682 tttaagtttcaaaagccccaaacaaattctttaagtttcaaaagttccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggat 41139583  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  41139582 gatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagattta 41139483  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41139482 gtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 41139448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Original strand, 47119890 - 47120096
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47119890 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 47119989  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  47119990 aagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaat 47120089  T
Q  347 taccaac 353  Q
    |||||||    
T  47120090 taccaac 47120096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 29248241 - 29248461
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29248241 ctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 29248340  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29248341 aagagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaat 29248440  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  29248441 taccaactatgctatctacaa 29248461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45723761 - 45723513
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45723761 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttcaaaagtcccaaagaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 45723662  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45723661 gatggtgattatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 45723562  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||    
T  45723561 gtaccaaagatgagttcaagaaaacaattactaattatgctatctacaa 45723513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43968501 - 43968281
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43968501 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 43968402  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  43968401 aagagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaat 43968302  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| | | |||||||||    
T  43968301 taccaactacgctatctacaa 43968281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47294533 - 47294313
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| |    
T  47294533 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattttgatgatagcaata 47294434  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47294433 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 47294334  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  47294333 taccaacgatgctatctacaa 47294313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 33884224 - 33884438
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||      ||||||||||    
T  33884224 ctttaagtttcaaaagtaccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaggatgatggtgatgat------gatagcaaca 33884317  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33884318 aagaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 33884417  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  33884418 taccaactatgctatctacaa 33884438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30972182 - 30971963
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||    
T  30972182 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaacaa 30972083  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaa 30971963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Original strand, 40851182 - 40851379
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||         ||||||||    
T  40851182 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatga---------tagcaaca 40851272  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40851273 aagagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaat 40851372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47579329 - 47579131
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  47579329 ctttaagtttttaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 47579230  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47579229 aagagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 47579131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37354501 - 37354285
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaa 247  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  37354501 tttaagttacaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgat---tcagatgatagcaacaa 37354405  T
Q  248 agagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaatt 347  Q
    | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37354404 acaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37354305  T
Q  348 accaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  37354304 accaactatgctatctacaa 37354285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Original strand, 40520835 - 40521015
Alignment:
Q  165 tcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgt 264  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40520835 tcaaacaagtccttttagcttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccat 40520934  T
Q  265 ttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    || |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40520935 ttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaa 40521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3797756 - 3797545
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaac 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |          |||||||| |||||||||||    
T  3797756 tctttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttacacg----------atgattcagatgatagcaac 3797667  T
Q  246 aaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3797666 aaagagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 3797567  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||| |||| ||| |||||||||    
T  3797566 ttatcaactatgctatctacaa 3797545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43753018 - 43752798
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43753018 ctttaagtttcaaaagcccaaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttaaaacaaattcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 43752919  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43752918 aagagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 43752819  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||  ||| |||||||||    
T  43752818 taccaattatgctatctacaa 43752798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Original strand, 39033932 - 39034120
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc--tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39033932 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttaaagga 39034031  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttag 306  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39034032 tgatggtgatcatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttag 39034120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 221167 - 221394
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggat 218  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  221167 tttaactttcaaaagtcccaaacaattcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat 221266  T
Q  219 gatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttg 318  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||                     ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  221267 gatgttgatgatttagatgatagcaacaaag---------------------tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 221345  T
Q  319 gtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  221346 gtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaa 221394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 41113349 - 41113496
Alignment:
Q  220 atgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttgg 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41113349 atgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgg 41113448  T
Q  320 taccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41113449 taccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 41113496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 27774074 - 27774227
Alignment:
Q  214 aggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccag 313  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  27774074 aggatgatggtgataattcagataatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccag 27774173  T
Q  314 atttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27774174 atttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 27774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 43024982 - 43025155
Alignment:
Q  119 atttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaagga 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43024982 atttaagtttcaaaagtttcaaataagttctctaagattcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagga 43025081  T
Q  218 tgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaatt 291  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  43025082 tgatggttatgattcagatgatagcaacaaagagcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Original strand, 42888774 - 42888900
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||    
T  42888774 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagattatagcaaca 42888873  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgc 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42888874 aagagcattatccaccatttgccatgc 42888900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45233700 - 45233586
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  45233700 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgatttaaatgatagtaaca 45233601  T
Q  247 aagagcattatccac 261  Q
    || ||||||||||||    
T  45233600 aatagcattatccac 45233586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 297
Target Start/End: Original strand, 29739711 - 29739829
Alignment:
Q  178 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaa 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  29739711 tttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttagaggatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcct-a 29739809  T
Q  278 aaagatggctaattttaagt 297  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  29739810 aaagatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2960761 - 2960662
Alignment:
Q  268 ccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2960761 ccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaa 2960662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44551041 - 44550938
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44551041 ctttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctgtttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 44550942  T
Q  247 aaga 250  Q
    ||||    
T  44550941 aaga 44550938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2960865 - 2960767
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2960865 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtcctaaacaattcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttcaatcgtttcaaacaagtcc 2960767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48628987 - 48628926
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628987 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 48628926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23842486 - 23842426
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842486 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 23842426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5106223 - 5106168
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106223 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 5106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 292
Target Start/End: Original strand, 29739619 - 29739713
Alignment:
Q  197 caaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattt 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||    
T  29739619 caaacaagtcattttaaaggatgagaatgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattt 29739713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 221457 - 221396
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221457 ctttaagtttcaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 221396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 11476515 - 11476576
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476515 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11476576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 31684093 - 31684154
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684093 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 31684154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 37393957 - 37394018
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37393957 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 37394018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 40520786 - 40520851
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40520786 ctttaagtttcgaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcctttta 40520851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 43752735 - 43752796
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752735 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 43752796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 47294250 - 47294311
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294250 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 47294311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 38427523 - 38427583
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427523 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 38427583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47272162 - 47272102
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272162 tttaagtttcaaaattctaaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 47272102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 35600081 - 35600140
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600081 ctttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35600140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30876441 - 30876383
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876441 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30876383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 224
Target Start/End: Original strand, 41107268 - 41107346
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41107268 tctttaaatttcaaaagtctcaaataagtctttatagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgat 41107346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 1469452 - 1469513
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469452 ctttaagtttcaaaggtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 1469513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 2960599 - 2960660
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960599 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 2960660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 11050220 - 11050281
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050220 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttcagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41113559 - 41113498
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41113559 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcct 41113498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Original strand, 45723449 - 45723506
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45723449 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 45723506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47120175 - 47120114
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47120175 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 47120114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 47281083 - 47281144
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281083 ctttaagcttcaaaagactcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 47281144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 43968219 - 43968279
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968219 tttaagtttcaaaggtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 43968279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 8162669 - 8162732
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8162669 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaagttattttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 8162732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 27364298 - 27364353
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364298 ctttaagttttaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 27364353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 30798325 - 30798388
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30798325 gtctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttgttgaatcgtttcaaacaaatcct 30798388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18353330 - 18353265
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaa--agtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18353330 gtctttaagtttcaaatgagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 18353265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31793899 - 31793822
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttt 186  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31793899 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 31793822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40851456 - 40851395
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40851456 ctttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtcct 40851395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 41139368 - 41139428
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139368 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt-agtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 41139428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42889031 - 42888970
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42889031 ctttaagtttcaaaagtttcaaataagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 42888970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44544591 - 44544530
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44544591 ctttaagtttctaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 44544530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47219327 - 47219266
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47219327 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 47219266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 44800370 - 44800430
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44800370 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcct 44800430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 34378567 - 34378615
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtt 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34378567 ctttaaatttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtt 34378615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 42979299 - 42979358
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42979299 tttaagtttcaaaattct-aaacaagtccttttagtttgtgaatcgtttcaaacaagtcct 42979358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 47579046 - 47579106
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47579046 ctttaagtttcaaaagtc-caaacaagtcattttagtttttgaattgtttcagacaagtcct 47579106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 25801525 - 25801573
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25801525 ctttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtt 25801573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33884502 - 33884442
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33884502 tctttaagttttaaaagtttcaaccaagtccttttcgtttttaaatcgtttcaaacaagtc 33884442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 43025170 - 43025210
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttttt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43025170 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcgttttagttttt 43025210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7336241 - 7336186
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 202  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7336241 ctttaagtttcaaaaattccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaaca 7336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27692066 - 27692011
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  27692066 gtctttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 27692011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 27773035 - 27773089
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27773035 ctttaaatttcaaaagttccaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 27773089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 181
Target Start/End: Original strand, 29739572 - 29739634
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttta 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29739572 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaaatttcaaaagtcccaaacaagtcatttta 29739634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 30971902 - 30971959
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971902 tttaaatttcaaaatt-tcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30971959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42888941 - 42888903
Alignment:
Q  174 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42888941 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttta 42888903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39241891 - 39241836
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtc 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39241891 aaagtgatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtc 39241836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39241882 - 39241844
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39241882 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagttt 39241844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Original strand, 23842195 - 23842232
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc 147  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842195 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc 23842232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29248519 - 29248465
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||    
T  29248519 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatcattttagtt----aatcatttcaaacaagtc 29248465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37354511 - 37354471
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  37354511 aaagtgatcatttaagttacaaaagtcccaaacaagtcttt 37354471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 47271849 - 47271889
Alignment:
Q  145 gtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  47271849 gtctttaagtttcaaaagtctcaagcaagtcctttaagttt 47271889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 252718 - 252460
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  252718 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaagtggtcctttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcct 252619  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  252618 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttagga 252519  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  252518 gccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaa 252460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Original strand, 252396 - 252458
Alignment:
Q  146 tctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252396 tctttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 252458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 139 - 366
Target Start/End: Original strand, 4 - 232
Alignment:
Q  139 aaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatg 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  4 aaacaagtcctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaggatgatggtgatgattcatatg 103  T
Q  238 atagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104 atagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaa 203  T
Q  338 ggaancaattaccaaccatgttatctaca 366  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  204 ggaagcaattaccgactatgctatctaca 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 235
Alignment:
Q  174 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  269 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2215 - 1995
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2215 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 2116  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaat 346  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2115 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 2016  T
Q  347 taccaaccatgttatctacaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  2015 taccaactatgctatctacaa 1995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 47823 - 48081
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  47823 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtttcaaacaaatcctttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgagtcatttcaaacaagttct 47922  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  47923 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 48022  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  48023 accagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaactatgtgatatacaa 48081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48143 - 48084
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcc 207  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48143 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtcc 48084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48153 - 48116
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48153 aaagtggtcatttaagtttcaaaagtccaaaacaagtc 48116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 367
Target Start/End: Original strand, 218784 - 219005
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  218784 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatagtaatgattcagatgatagcaaca 218883  T
Q  247 aagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagt-gggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaa 345  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  218884 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaa 218983  T
Q  346 ttaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  218984 ttaccaactatgctatctacaa 219005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 219067 - 219007
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  219067 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaattttcgaatcgtttcaaacaagtcct 219007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5307 - 5049
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5307 aaagtggtcttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcatttaagtttcaaaaatctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 5208  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  5207 tttagaggatgatggtgataattcagatgttagcaacaaataacattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttagga 5108  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  5107 gccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctacaa 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 4986 - 5045
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4986 ctttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 5044 - 5304
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagt-ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5044 aaagtggtcctttaagtttcaaaagttccaaacaagttctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcct 5143  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaaga----gcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgtt 304  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5144 tttataggatgatggtgatgattc-aatgatagcaacaaagatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgtt 5241  T
Q  305 agaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||    
T  5242 aggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaa 5304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5367 - 5308
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5367 ctttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 5308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 11226 - 11477
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226 aaagtggtcctttaggttacaaaagtcccaaacaaatcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 11325  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||       ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11326 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa-------cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 11418  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  11419 gccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattaccaactatgctacctacaa 11477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 12956 - 13214
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12956 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctt 13055  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| |    
T  13056 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattagga 13155  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||    
T  13156 gctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaa 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 13218
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276 tttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 59888 - 59630
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcttt-aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59888 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctt 59789  T
Q  209 tttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaa 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| |    
T  59788 tttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattagga 59689  T
Q  309 gccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatctacaa 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||    
T  59688 gctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaa 59630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 59568 - 59626
Alignment:
Q  148 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 206  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59568 tttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 59626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 469 - 289
Alignment:
Q  121 ttaagtttcaaaagttcaaaacaagtctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatga 220  Q
    ||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  469 ttaagtttcaaaagtcctaaagtggtctttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaattcttttagaggatga 370  T
Q  221 tgatgatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtgggt 301  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  369 tggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 14548 - 14655
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattcaaatgatagcaaca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  14548 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaaaggatgatagtgatgatttggatgatagcaaca 14647  T
Q  247 aagagcat 254  Q
    ||||||||    
T  14648 aagagcat 14655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 660
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  759 aaagtggtccttttagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Original strand, 599 - 644
Alignment:
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Original strand, 1834 - 1933
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1834 aaagtggtccttttagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 1933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1949
Alignment:
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 1949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2037 - 1938
Alignment:
Q  110 aaagtgatcatttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||||   ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 aaagtggtcctttaagtttcaaaagtctcaaacatgtcctttatgtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 1938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 362
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1931
Alignment:
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatc 1931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 19758 - 19831
Alignment:
Q  225 gatgattcaaatgatagcaacaaagagcattatccaccgtttaccatgcgtaaaaagatggctaattttaagtg 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19758 gatgattcatatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3398
Alignment:
Q  308 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaancaattaccaaccatgttatc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 3398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 3331 - 3391
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcct 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3331 ctttaagtttcaaaaatc-caaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtcct 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5782 - 5728
Alignment:
Q  147 ctttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaac 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5782 ctttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgatttgtttcaaac 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 101271 - 101218
Alignment:
Q  120 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtc-tttaagtttcaaaagtctcaaacaa 172  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  101271 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaagtctcaaacaa 101218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2326 times since January 2019
Visitors: 3818