View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0599_low_46 (Length: 326)

Name: NF0599_low_46
Description: NF0599
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0599_low_46
NF0599_low_46
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (53-288)||(564-798)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (59-288)||(16368165-16368393)
chr1 (59-289)||(50613994-50614225)
chr1 (59-289)||(50621822-50622053)
chr1 (99-289)||(41049953-41050144)
chr1 (59-288)||(50686625-50686855)
chr1 (132-273)||(26064967-26065109)
chr1 (99-289)||(21896173-21896364)
chr1 (133-288)||(16758663-16758820)
chr1 (134-283)||(16093836-16093987)
chr1 (60-288)||(21861449-21861677)
chr1 (233-299)||(33681010-33681076)
chr1 (201-290)||(35261100-35261187)
chr1 (233-299)||(20248282-20248348)
chr1 (201-287)||(20454574-20454659)
chr1 (234-299)||(22237630-22237695)
chr1 (233-295)||(21754052-21754114)
chr1 (233-299)||(22921921-22921987)
chr1 (237-299)||(52928026-52928088)
chr1 (236-299)||(14295606-14295672)
chr1 (186-286)||(20918620-20918719)
chr1 (224-298)||(34509784-34509857)
chr1 (224-298)||(50210257-50210330)
chr1 (233-299)||(20847207-20847275)
chr1 (233-299)||(38801440-38801508)
chr1 (224-299)||(27250773-27250850)
chr1 (240-299)||(21161719-21161778)
chr1 (233-299)||(45574940-45575008)
chr1 (224-286)||(21026696-21026757)
chr1 (225-286)||(20958124-20958184)
chr1 (256-299)||(13212981-13213027)
chr1 (240-284)||(22123171-22123215)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (59-288)||(78336-78564)
scaffold0022 (53-288)||(128842-129077)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (59-295)||(37251046-37251283)
chr3 (58-289)||(22110229-22110460)
chr3 (157-288)||(606302-606433)
chr3 (139-288)||(43925972-43926123)
chr3 (133-283)||(52523678-52523831)
chr3 (148-283)||(12377940-12378077)
chr3 (134-299)||(15470927-15471092)
chr3 (233-299)||(12174311-12174377)
chr3 (233-299)||(9512923-9512989)
chr3 (233-299)||(9520898-9520964)
chr3 (233-299)||(16103783-16103849)
chr3 (233-295)||(32307684-32307746)
chr3 (233-299)||(49668128-49668194)
chr3 (234-299)||(16097331-16097396)
chr3 (225-287)||(28194705-28194767)
chr3 (233-299)||(13210379-13210448)
chr3 (133-240)||(2051150-2051260)
chr3 (224-298)||(20698479-20698552)
chr3 (224-298)||(26686891-26686964)
chr3 (221-298)||(11424800-11424876)
chr3 (224-299)||(12399209-12399286)
chr3 (59-144)||(43927291-43927375)
chr3 (224-298)||(13442278-13442351)
chr3 (221-287)||(14572604-14572669)
chr3 (224-298)||(14972858-14972931)
chr3 (224-298)||(18438538-18438611)
chr3 (224-298)||(23083405-23083478)
chr3 (237-287)||(27165262-27165312)
chr3 (236-281)||(13919350-13919394)
chr3 (233-299)||(14234487-14234556)
chr3 (233-284)||(23274705-23274756)
chr3 (233-284)||(24340775-24340826)
chr3 (256-298)||(17487860-17487902)
chr3 (256-298)||(17499342-17499384)
chr3 (240-298)||(25476445-25476502)
chr3 (237-287)||(53301607-53301657)
chr3 (231-288)||(15246032-15246088)
chr3 (224-284)||(42386428-42386487)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (59-288)||(23207291-23207520)
chr2 (99-288)||(23791287-23791478)
chr2 (62-288)||(25108901-25109128)
chr2 (132-288)||(20520143-20520300)
chr2 (132-288)||(22413086-22413245)
chr2 (132-288)||(24697556-24697714)
chr2 (148-288)||(23004762-23004904)
chr2 (99-272)||(7650-7824)
chr2 (99-288)||(18786820-18787010)
chr2 (157-287)||(7679600-7679729)
chr2 (233-297)||(28405981-28406045)
chr2 (224-287)||(298858-298921)
chr2 (133-299)||(23708570-23708738)
chr2 (133-284)||(19671848-19671999)
chr2 (233-299)||(25175853-25175919)
chr2 (201-281)||(23287384-23287463)
chr2 (221-299)||(38155-38235)
chr2 (233-299)||(20309108-20309177)
chr2 (224-298)||(23060517-23060590)
chr2 (224-298)||(23285869-23285942)
chr2 (224-299)||(23076442-23076519)
chr2 (233-281)||(26392403-26392450)
chr2 (233-299)||(23103448-23103516)
chr2 (220-298)||(8946661-8946738)
chr2 (233-287)||(22105424-22105477)
chr2 (224-298)||(22337119-22337192)
chr2 (233-298)||(22731287-22731351)
chr2 (230-283)||(32451978-32452031)
chr2 (238-298)||(23040247-23040306)
chr2 (233-299)||(23072001-23072070)
chr2 (229-299)||(23654435-23654507)
chr2 (233-298)||(22134259-22134323)
chr2 (233-298)||(23660027-23660091)
chr2 (256-299)||(22738254-22738300)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (59-288)||(53082030-53082259)
chr4 (53-288)||(46640328-46640563)
chr4 (60-288)||(12288089-12288317)
chr4 (133-288)||(52243145-52243303)
chr4 (233-299)||(12774010-12774076)
chr4 (133-288)||(13802-13958)
chr4 (233-299)||(15551817-15551886)
chr4 (233-299)||(8846359-8846425)
chr4 (236-299)||(17046487-17046553)
chr4 (233-299)||(39706340-39706409)
chr4 (237-288)||(43198611-43198662)
chr4 (224-298)||(7088881-7088954)
chr4 (224-298)||(7798778-7798851)
chr4 (224-298)||(52873411-52873484)
chr4 (230-283)||(6190481-6190534)
chr4 (224-299)||(3096293-3096370)
chr4 (224-299)||(12902757-12902834)
chr4 (233-287)||(16377574-16377627)
chr4 (222-298)||(6899895-6899970)
chr4 (201-273)||(17333306-17333377)
chr4 (240-287)||(3515019-3515065)
chr4 (224-298)||(7893707-7893780)
chr4 (256-298)||(22636439-22636481)
chr4 (224-286)||(23374403-23374464)
chr4 (134-283)||(26050428-26050576)
chr4 (221-298)||(16270276-16270352)
chr4 (231-283)||(26045344-26045395)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (99-288)||(24353034-24353224)
chr8 (59-288)||(17266871-17267101)
chr8 (59-288)||(37116361-37116591)
chr8 (132-288)||(17439456-17439614)
chr8 (99-229)||(22364734-22364865)
chr8 (99-288)||(983323-983513)
chr8 (233-299)||(23760896-23760962)
chr8 (133-288)||(20498576-20498732)
chr8 (222-288)||(19154928-19154994)
chr8 (233-299)||(26355750-26355816)
chr8 (186-299)||(5866280-5866395)
chr8 (233-299)||(6520368-6520437)
chr8 (233-299)||(17140916-17140985)
chr8 (233-299)||(21490995-21491064)
chr8 (233-299)||(38855303-38855372)
chr8 (222-298)||(22626740-22626815)
chr8 (237-299)||(16199700-16199765)
chr8 (233-299)||(21396032-21396101)
chr8 (233-299)||(21790525-21790594)
chr8 (224-298)||(7372782-7372855)
chr8 (224-298)||(18818453-18818526)
chr8 (224-298)||(18879275-18879348)
chr8 (148-287)||(21285612-21285751)
chr8 (224-298)||(23406383-23406456)
chr8 (222-299)||(31971257-31971336)
chr8 (233-298)||(21923981-21924045)
chr8 (233-298)||(28649097-28649161)
chr8 (133-284)||(13597568-13597720)
chr8 (133-284)||(17612061-17612213)
chr8 (236-299)||(21389505-21389571)
chr8 (236-299)||(21778831-21778897)
chr8 (224-299)||(21919044-21919121)
chr8 (233-299)||(45131049-45131117)
chr8 (224-298)||(6759262-6759335)
chr8 (234-284)||(13508138-13508188)
chr8 (224-298)||(16092386-16092459)
chr8 (224-298)||(20536212-20536285)
chr8 (234-299)||(21673707-21673772)
chr8 (233-299)||(21249384-21249454)
chr8 (233-299)||(21255222-21255292)
chr8 (201-281)||(22525579-22525658)
chr8 (253-287)||(4483293-4483327)
chr8 (134-180)||(14103177-14103223)
chr8 (225-283)||(20502146-20502203)
chr8 (256-298)||(26219718-26219760)
chr8 (161-229)||(40492831-40492901)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (59-288)||(19763-19992)
scaffold0080 (222-298)||(39917-39992)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (59-288)||(6161-6391)
scaffold0420 (236-288)||(13793-13845)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (99-288)||(267674-267864)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (59-288)||(22178098-22178328)
chr5 (99-288)||(20026858-20027048)
chr5 (148-299)||(26012002-26012154)
chr5 (233-299)||(21502208-21502277)
chr5 (233-299)||(22959584-22959650)
chr5 (148-249)||(29448055-29448158)
chr5 (233-299)||(21565545-21565611)
chr5 (135-288)||(22144063-22144217)
chr5 (233-299)||(19660887-19660956)
chr5 (233-299)||(21329549-21329618)
chr5 (236-299)||(36314577-36314643)
chr5 (224-298)||(8286887-8286960)
chr5 (201-283)||(15796438-15796519)
chr5 (224-298)||(21997578-21997651)
chr5 (201-271)||(41861475-41861544)
chr5 (233-286)||(26732885-26732937)
chr5 (224-299)||(21729108-21729185)
chr5 (224-299)||(21808433-21808510)
chr5 (237-288)||(26740702-26740752)
chr5 (224-298)||(23390540-23390613)
chr5 (225-283)||(23469822-23469879)
chr5 (224-298)||(24529224-24529297)
chr5 (224-298)||(25421536-25421609)
chr5 (221-298)||(13025315-13025391)
chr5 (221-298)||(13095499-13095575)
chr5 (237-298)||(19668902-19668963)
chr5 (221-298)||(24493573-24493649)
chr5 (233-299)||(21293022-21293090)
chr5 (249-288)||(27988997-27989036)
chr5 (224-299)||(25431395-25431471)
chr5 (233-283)||(37723922-37723972)
chr5 (233-298)||(9077956-9078020)
chr5 (231-288)||(21328266-21328322)
chr5 (256-288)||(20902128-20902160)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (99-289)||(1715-1906)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (60-288)||(7956-8181)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (132-288)||(25120-25277)
scaffold0123 (114-229)||(609-725)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (59-279)||(38339-38560)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (53-288)||(97019-97255)
scaffold0006 (53-288)||(106297-106533)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (132-288)||(1867945-1868102)
chr7 (59-288)||(20220068-20220295)
chr7 (132-290)||(15008449-15008608)
chr7 (148-288)||(14044760-14044902)
chr7 (148-288)||(14354790-14354932)
chr7 (99-288)||(12901337-12901527)
chr7 (133-299)||(2280070-2280238)
chr7 (167-273)||(14036283-14036391)
chr7 (167-273)||(14346313-14346421)
chr7 (134-299)||(67745-67911)
chr7 (233-299)||(811183-811249)
chr7 (233-299)||(16219769-16219835)
chr7 (233-299)||(18005649-18005715)
chr7 (233-299)||(44014181-44014247)
chr7 (186-299)||(34200786-34200901)
chr7 (133-273)||(12255742-12255885)
chr7 (222-273)||(48991209-48991260)
chr7 (233-298)||(28505350-28505415)
chr7 (222-298)||(12698835-12698910)
chr7 (186-299)||(16495402-16495517)
chr7 (233-299)||(11996079-11996148)
chr7 (224-298)||(3564408-3564481)
chr7 (224-299)||(16386291-16386369)
chr7 (233-299)||(27847882-27847951)
chr7 (221-299)||(38227481-38227561)
chr7 (237-299)||(47831807-47831872)
chr7 (233-298)||(9509193-9509257)
chr7 (233-297)||(40443393-40443460)
chr7 (239-299)||(15144096-15144154)
chr7 (233-299)||(13647325-13647393)
chr7 (237-288)||(16056342-16056393)
chr7 (201-288)||(18203826-18203912)
chr7 (241-287)||(17062019-17062065)
chr7 (234-299)||(22072913-22072981)
chr7 (235-284)||(10063872-10063921)
chr7 (222-287)||(18456454-18456518)
chr7 (224-299)||(10589039-10589116)
chr7 (256-299)||(18430709-18430755)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (59-252)||(54-248)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (148-288)||(60681-60823)
scaffold0010 (233-299)||(129908-129974)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (59-240)||(18116-18298)
scaffold0138 (233-299)||(12942-13008)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (148-288)||(19668385-19668526)
chr6 (132-249)||(18696539-18696657)
chr6 (59-283)||(23076749-23076974)
chr6 (114-250)||(18706356-18706493)
chr6 (59-283)||(35008167-35008392)
chr6 (201-299)||(20109140-20109237)
chr6 (157-288)||(9098489-9098621)
chr6 (134-299)||(23019408-23019574)
chr6 (233-299)||(19652198-19652264)
chr6 (99-283)||(18199333-18199519)
chr6 (201-281)||(33443068-33443147)
chr6 (233-299)||(27333270-27333339)
chr6 (233-299)||(27394010-27394079)
chr6 (233-299)||(35245586-35245655)
chr6 (99-173)||(28103816-28103890)
chr6 (99-283)||(18177589-18177775)
chr6 (99-283)||(18204096-18204282)
chr6 (233-288)||(25644334-25644389)
chr6 (234-299)||(22831503-22831571)
chr6 (233-298)||(20076704-20076768)
chr6 (224-299)||(16496244-16496321)
chr6 (186-299)||(28496477-28496592)
chr6 (186-299)||(29808888-29809003)
chr6 (233-299)||(16920682-16920751)
chr6 (224-287)||(20361004-20361066)
chr6 (233-299)||(4185873-4185939)
chr6 (224-298)||(29060544-29060617)
chr6 (236-299)||(17287852-17287917)
chr6 (225-283)||(18453201-18453258)
chr6 (224-298)||(20638327-20638400)
chr6 (256-298)||(25629430-25629472)
chr6 (237-287)||(25656641-25656690)
chr6 (233-298)||(18409880-18409944)
chr6 (239-283)||(11185524-11185568)
chr6 (256-299)||(25714417-25714463)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (148-288)||(136335-136476)
scaffold0021 (148-288)||(145043-145184)
scaffold0021 (233-283)||(174785-174835)
scaffold0021 (233-298)||(121770-121834)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (133-288)||(16051-16207)
scaffold0357 (133-289)||(13141-13299)
scaffold0357 (222-288)||(2675-2741)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (133-288)||(27700-27856)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (99-299)||(32538-32738)
scaffold0034 (230-283)||(51933-51985)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (201-288)||(2689-2776)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (201-288)||(103651-103738)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (233-299)||(19267-19333)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (233-299)||(23935-24001)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (233-299)||(100377-100443)
scaffold0023 (233-299)||(119875-119944)
scaffold0023 (233-299)||(40226-40292)
scaffold0023 (233-299)||(101502-101568)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (233-299)||(14749-14815)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (233-298)||(6539-6604)
scaffold0621 (201-288)||(8480-8565)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (148-299)||(132-283)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (233-299)||(10593-10659)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (233-299)||(2697-2763)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (233-299)||(160687-160753)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (233-298)||(62202-62267)
scaffold0028 (238-299)||(132661-132722)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (201-288)||(12582-12667)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (186-299)||(11292-11407)
scaffold0046 (186-299)||(1997-2112)
scaffold0046 (224-298)||(28418-28491)
scaffold0046 (246-299)||(4552-4608)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (233-299)||(10475-10544)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (186-287)||(15676-15776)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (233-299)||(1289-1358)
scaffold0106 (233-299)||(7266-7335)
scaffold0106 (231-287)||(15289-15344)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (233-299)||(2858-2924)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (233-299)||(45844-45910)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (237-299)||(22726-22788)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (221-298)||(32997-33073)
scaffold0120 (221-298)||(45932-46008)
scaffold0120 (224-298)||(16117-16190)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (201-288)||(1046-1131)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (222-298)||(3192-3267)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (186-299)||(1075-1190)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (133-272)||(53500-53640)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (233-299)||(1101-1170)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (233-299)||(16282-16351)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (233-299)||(6611-6680)
scaffold0333 (233-299)||(13991-14060)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (233-299)||(6175-6244)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (233-299)||(28821-28888)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (233-299)||(51582-51651)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (233-299)||(15829-15898)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (233-287)||(1097-1151)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (224-298)||(3230-3303)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (99-298)||(12770-12969)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (233-287)||(5658-5712)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (224-298)||(17261-17334)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (133-273)||(11493-11634)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (133-273)||(38207-38348)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (236-299)||(1089-1155)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (224-299)||(1952-2029)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (222-286)||(13513-13576)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (186-299)||(34123-34238)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (201-273)||(206545-206616)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (234-298)||(51917-51980)
scaffold0011 (224-299)||(168022-168099)
scaffold0011 (231-288)||(38202-38258)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (233-292)||(6822-6881)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (224-287)||(26109-26171)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (233-299)||(32067-32135)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (233-299)||(46995-47064)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (201-284)||(24324-24406)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (224-298)||(13215-13288)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (221-287)||(39492-39557)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (221-287)||(75255-75320)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (224-298)||(1855-1928)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (236-296)||(5183-5246)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (238-299)||(32101-32162)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (60-288)||(10541-10768)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (222-298)||(339990-340064)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (224-299)||(1092-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (224-299)||(4849-4926)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (224-299)||(4712-4789)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (225-288)||(7445-7507)
scaffold0111 (225-288)||(14564-14626)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (225-279)||(805-858)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (256-298)||(6199-6241)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (134-180)||(10595-10641)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (134-180)||(614-660)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (224-298)||(3474-3547)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (238-284)||(18084-18130)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (256-298)||(8604-8646)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (222-299)||(15505-15584)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (225-283)||(36199-36256)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (234-284)||(20928-20978)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (237-287)||(38758-38808)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (99-180)||(145-226)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (221-298)||(32946-33022)
scaffold0145 (221-298)||(38765-38841)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (133-195)||(225512-225576)


Alignment Details
Target: scaffold1403 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 798 - 564
Alignment:
Q  53 atcatagggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtat 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  798 atcatatggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtat 700  T
Q  153 atgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgt 252  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699 atgcattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgt 600  T
Q  253 ttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  599 ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 16368165 - 16368393
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16368165 gggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 16368263  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 258  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368264 tacatgaattataaacgatgttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 16368363  T
Q  259 actaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16368364 actaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 16368393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 289
Target Start/End: Original strand, 50613994 - 50614225
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||       ||||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  50613994 gggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttactt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcat 50614092  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50614093 tacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttat 50614192  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50614193 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 50614225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 289
Target Start/End: Original strand, 50621822 - 50622053
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||       ||||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  50621822 gggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttactt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcat 50621920  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50621921 tacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttat 50622020  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50622021 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 50622053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 289
Target Start/End: Original strand, 41049953 - 41050144
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  41049953 cagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgttgagatgttgttgatttgc 41050052  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
    | | |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41050053 atttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 41050144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50686855 - 50686625
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||  ||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  50686855 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 50686757  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| |||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  50686756 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttat 50686657  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  50686656 taactaaactgcatgagtcggtctaagatgaa 50686625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26065109 - 26064967
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | ||||||     
T  26065109 aataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattggtattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgag 26064967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 289
Target Start/End: Original strand, 21896173 - 21896364
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgattt 196  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  |  |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||    
T  21896173 cagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgactt 21896272  T
Q  197 acaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
     || | |||||| |||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21896273 gcatttgatattgttatatcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaag 21896364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16758820 - 16758663
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||  | | |||||| |||||| |||||||| |||  |    
T  16758820 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgca 16758721  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16758720 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaa 16758663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093987
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgtt-gatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatat 231  Q
    |||||||||||   |||||||  |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||| |||    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcattgatattgttatatcatgagctgttttctat 16093935  T
Q  232 gctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16093936 actgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 288
Target Start/End: Original strand, 21861449 - 21861677
Alignment:
Q  60 ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||       ||||||||||||||  |||||| |||| |  |  |||||||||||| | |||||||  |||    
T  21861449 ggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttt-cagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacatt 21861547  T
Q  160 acatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| || || | |||||| |||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21861548 acttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg--ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttat 21861645  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21861646 tagctaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 21861677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33681076 - 33681010
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33681076 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 290
Target Start/End: Original strand, 35261100 - 35261187
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaaga 290  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35261100 tgatattgttatatcatg--ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaga 35261187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20248348 - 20248282
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20248348 ctgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 287
Target Start/End: Original strand, 20454574 - 20454659
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20454574 tgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20454659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21754114 - 21754052
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21754114 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 22921921 - 22921987
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22921921 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 52928026 - 52928088
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52928026 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Original strand, 14295606 - 14295672
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  14295606 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20918622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34509857 - 34509784
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  34509857 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 50210257 - 50210330
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  50210257 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 20847207 - 20847275
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  20847207 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 38801440 - 38801508
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||    
T  38801440 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 27250773 - 27250850
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  27250773 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161719
Alignment:
Q  240 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatgt 21161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 45574940 - 45575008
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||    
T  45574940 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21026757 - 21026696
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg 286  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21026757 ttttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20958184 - 20958124
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  20958184 tttatgtgctgcctatgttgctg-ttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 13212981 - 13213027
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  13212981 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 284
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123215
Alignment:
Q  240 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 78564 - 78336
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  78564 gggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 78466  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 258  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78465 tacatgaattataaacgatgttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 78366  T
Q  259 actaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  78365 actaagctgcatgagtcggtccaagatgaa 78336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Original strand, 128842 - 129077
Alignment:
Q  53 atcatagggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtat 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||| ||| |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||    
T  128842 atcatggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtat 128940  T
Q  153 atgtattacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgttt 250  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  128941 atccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgttt 129040  T
Q  251 gtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  129041 g-ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 129077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 37251046 - 37251283
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37251046 gggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttc-cagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 37251144  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37251145 tacatgaattatttatgatgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttatt 37251244  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaag-ttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  37251245 aactaagctgcatgactcggtctaagatggaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 289
Target Start/End: Original strand, 22110229 - 22110460
Alignment:
Q  58 agggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgta 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||  |  | ||||||||||||| |||||||| | |    
T  22110229 agggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgca 22110327  T
Q  158 ttacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22110328 ttacatgaattctatatgatgttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttat 22110427  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22110428 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 22110460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 288
Target Start/End: Original strand, 606302 - 606433
Alignment:
Q  157 attacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  606302 attacatgaattctatatgatgttgagatgttgttgaattgcattgatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttat 606401  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  606402 taactaagctgcatgagtcggtataagatgaa 606433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925972
Alignment:
Q  139 tgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgc 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgc 43926024  T
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43926023 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 43925972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Original strand, 52523678 - 52523831
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||      
T  52523678 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgc 52523777  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12378077 - 12377940
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||   | |||||||||||| || | |||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12378077 tgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgc 12377978  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12377977 tgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15471092 - 15470927
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatat 231  Q
    |||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||| || || | |||||| |||||| ||||  || |||  ||    
T  15471092 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 15470995  T
Q  232 gctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15470994 actgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 12174311 - 12174377
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12174311 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9512989 - 9512923
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  9512989 ctgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9520964 - 9520898
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  9520964 ctgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16103849 - 16103783
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16103849 ctgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32307746 - 32307684
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32307746 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 49668128 - 49668194
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  49668128 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097331
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28194767 - 28194705
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194767 tttatgtgctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 28194705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 13210379 - 13210448
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  13210379 ctgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Original strand, 2051150 - 2051260
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatg-atg-ttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||      
T  2051150 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgc 2051249  T
Q  230 atgctgcctat 240  Q
    || ||||||||    
T  2051250 atactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 20698479 - 20698552
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20698479 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26686964 - 26686891
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26686964 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Original strand, 11424800 - 11424876
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  11424800 ctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12399286 - 12399209
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  12399286 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43927375 - 43927291
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatat 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  43927375 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13442351 - 13442278
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13442351 ttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14572669 - 14572604
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14572669 ctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14572604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14972931 - 14972858
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  14972931 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18438611 - 18438538
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  18438611 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 23083405 - 23083478
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23083405 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27165312 - 27165262
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27165312 ctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27165262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13919394 - 13919350
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtcta 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13919394 cctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14234556 - 14234487
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||||||    
T  14234556 ctgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23274756 - 23274705
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  23274756 ctgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Original strand, 24340775 - 24340826
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24340775 ctgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17487902 - 17487860
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  17487902 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17499384 - 17499342
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  17499384 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Original strand, 25476445 - 25476502
Alignment:
Q  240 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25476445 tgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Original strand, 53301607 - 53301657
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  53301607 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttga 53301657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15246088 - 15246032
Alignment:
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15246088 tgctgcctatgttgctg-ttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaa 15246032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42386487 - 42386428
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42386487 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23207520 - 23207291
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23207520 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttca-agtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 23207422  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23207421 tacatgaattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttatt 23207322  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23207321 aactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 23207291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23791478 - 23791287
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgattta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||     
T  23791478 cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttg 23791379  T
Q  198 caat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23791378 catttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaa 23791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25109128 - 25108901
Alignment:
Q  62 taagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattac 161  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  25109128 taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattac 25109030  T
Q  162 atgaattatatatgatg-ttgggatgttgttga-tttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaa 259  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |  ||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25109029 atgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaa 25108930  T
Q  260 ctaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  25108929 ctaagctacatgagtcggtctaagatgaa 25108901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 20520143 - 20520300
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  20520143 aataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttatg 20520242  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 20520300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 22413086 - 22413245
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat---gatatttttatattatgaactgtttta 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |    ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22413086 aataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgtttta 22413185  T
Q  229 tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 22413245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 24697556 - 24697714
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24697556 aataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgat 24697655  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
     | ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  24697656 gtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatgaa 24697714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23004904 - 23004762
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| ||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||    
T  23004904 tgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgc 23004805  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23004804 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 23004762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 7650 - 7824
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  |   ||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||    
T  7650 cagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgactt 7749  T
Q  197 acaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 272  Q
     || | |||||| |||||| |||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7750 gcatttgatattgttatatcatgt--tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Original strand, 18786820 - 18787010
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |  |  ||||||| ||||   |||||||  |||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || |    
T  18786820 cagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgc 18786919  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | | || ||| |||||| |||||||| |||  || || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18786920 atttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 18787010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7679729 - 7679600
Alignment:
Q  157 attacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgttta 255  Q
    |||||||||||||| | |||||||   ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||||||||||||      
T  7679729 attacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacattgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttat 7679632  T
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7679631 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 7679600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28406045 - 28405981
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgat 297  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28406045 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Original strand, 298858 - 298921
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  298858 ttttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 298921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 23708570 - 23708738
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||| | |||||| |||| |||||| |||||| |||   ||||||      
T  23708570 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgt--tgttttgc 23708667  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatgatgt 299  Q
    || |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19671999 - 19671848
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||| | || |  | |||||| |||||| ||||  ||||||  |    
T  19671999 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga--tgttttgca 19671902  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25175919 - 25175853
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  25175919 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23287463 - 23287384
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtcta 281  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23287463 tgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Original strand, 38155 - 38235
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  38155 ctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20309177 - 20309108
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  20309177 ctgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23060590 - 23060517
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23060590 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285869
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23076519 - 23076442
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  23076519 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26392450 - 26392403
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtcta 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26392450 ctgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 23103448 - 23103516
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  23103448 ctgcctatgttgctgtttttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8946738 - 8946661
Alignment:
Q  220 actgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  8946738 actgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22105477 - 22105424
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22105477 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22105424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22337192 - 22337119
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22337192 ttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 22731287 - 22731351
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  22731287 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 32451978 - 32452031
Alignment:
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32451978 atgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  238 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 23072001 - 23072070
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  23072001 ctgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 299
Target Start/End: Original strand, 23654435 - 23654507
Alignment:
Q  229 tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  23654435 tatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 22134259 - 22134323
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  22134259 ctgcctatgttgctgttgatat-ttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23660091 - 23660027
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23660091 ctgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 22738254 - 22738300
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  22738254 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 53082030 - 53082259
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  53082030 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 53082128  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  53082129 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttatt 53082228  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53082229 aactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 53082259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Original strand, 46640328 - 46640563
Alignment:
Q  53 atcatagggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtat 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| |||||||    
T  46640328 atcatggggtaagaaactaagttgcttatcttactgtt-attgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtat 46640426  T
Q  153 atgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttg 251  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  46640427 atgcattacatgaattatatatgatgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttg 46640526  T
Q  252 tttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46640527 tttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 46640563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 288
Target Start/End: Original strand, 12288089 - 12288317
Alignment:
Q  60 ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtatt 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||       |||||||||||||||||||||||| || |  |   |||||| ||||   |||||||  |||    
T  12288089 ggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacatt 12288187  T
Q  160 acatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 258  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || || | |||||| |||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||  |||    
T  12288188 acatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttattta 12288287  T
Q  259 actaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12288288 actaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 12288317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Original strand, 52243145 - 52243303
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||| || || | |||||| |||||| |||||||| |||      
T  52243145 ataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgc 52243244  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 52243303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12774076 - 12774010
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12774076 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Original strand, 13802 - 13958
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||    ||| ||||||| ||| || || | |||||| |||||| |||   ||||||      
T  13802 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgt--tgttttgc 13899  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15551886 - 15551817
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  15551886 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8846425 - 8846359
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  8846425 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17046553 - 17046487
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17046553 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 39706340 - 39706409
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  39706340 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 288
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198662
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 43198662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7088954 - 7088881
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  7088954 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7798851 - 7798778
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  7798851 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 52873411 - 52873484
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  52873411 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6190534 - 6190481
Alignment:
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6190534 atgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3096370 - 3096293
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  3096370 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12902834 - 12902757
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  12902834 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Original strand, 16377574 - 16377627
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16377574 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16377627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6899970 - 6899895
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  6899970 tgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17333377 - 17333306
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17333377 tgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgag 17333306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3515065 - 3515019
Alignment:
Q  240 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3515065 tgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3515019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7893780 - 7893707
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  7893780 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22636481 - 22636439
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22636481 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Original strand, 23374403 - 23374464
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg 286  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23374403 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Original strand, 26050428 - 26050576
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatg 232  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||  || |||||||| ||||||    |||||||||||| || | |||||| ||||||  |||  |||||| | ||    
T  26050428 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttt-tgtg 26050526  T
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26050527 ctgcctattttgctgtt-gtatattaactaagctgcatgatccggtctaag 26050576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Original strand, 16270276 - 16270352
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  16270276 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 26045344 - 26045395
Alignment:
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26045344 tgctgcctattttgctgtt-gtatattaactaagctgcatgatccggtctaag 26045395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24353224 - 24353034
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgattta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||     
T  24353224 cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttg 24353125  T
Q  198 caatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24353124 cattgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 24353034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 17266871 - 17267101
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17266871 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 17266969  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17266970 tacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttat 17267069  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17267070 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 17267101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37116591 - 37116361
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||| ||| |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||| ||    
T  37116591 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcat 37116493  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37116492 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttat 37116393  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37116392 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 37116361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 17439456 - 17439614
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17439456 aataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttat 17439555  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  17439556 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatgaa 17439614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22364865 - 22364734
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgattta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22364865 cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttt 22364766  T
Q  198 caatgatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |  ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22364765 ctttgatattgttatatcatgaactgttttat 22364734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Original strand, 983323 - 983513
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || |  |  ||||||| ||||   |||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |    
T  983323 cagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgc 983422  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | | || ||| |||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  983423 atttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 983513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 23760896 - 23760962
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23760896 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20498732 - 20498576
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| || || | |||||| |||||| |||  || |||||     
T  20498732 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg--ctattttac 20498635  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  20498634 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 20498576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 19154928 - 19154994
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19154928 tgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 19154994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 26355750 - 26355816
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26355750 ctgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5866377  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  5866378 tgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6520437 - 6520368
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  6520437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17140985 - 17140916
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17140985 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21491064 - 21490995
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21491064 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 38855303 - 38855372
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  38855303 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22626815 - 22626740
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22626815 tgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 16199700 - 16199765
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  16199700 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 21396032 - 21396101
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21396032 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 21790525 - 21790594
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21790525 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7372855 - 7372782
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  7372855 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 18818453 - 18818526
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  18818453 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879348
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21285751 - 21285612
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||  |||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||   ||||||  || ||||||||||||     
T  21285751 tgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgt--tgttttgcatactgcctatgttgt 21285654  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21285653 tgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttga 21285612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23406456 - 23406383
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23406456 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31971336 - 31971257
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  31971336 tgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 21923981 - 21924045
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  21923981 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 28649097 - 28649161
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  28649097 ctgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 13597568 - 13597720
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||    ||||||||||||| | || |  | |||||| |||||| ||||  ||||||      
T  13597568 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga--tgttttgc 13597665  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13597666 attctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 17612061 - 17612213
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||| ||||||||| | ||||    |||||| |||||| ||||  ||||||      
T  17612061 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga--tgttttgc 17612158  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Original strand, 21389505 - 21389571
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21389505 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Original strand, 21778831 - 21778897
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21778831 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 21919044 - 21919121
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21919044 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 45131049 - 45131117
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  45131049 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6759335 - 6759262
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  6759335 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 13508138 - 13508188
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13508138 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 16092386 - 16092459
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  16092386 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20536285 - 20536212
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20536285 ttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673707
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21249454 - 21249384
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttatt-aactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21249454 ctgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21255292 - 21255222
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttatt-aactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21255292 ctgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22525658 - 22525579
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtcta 281  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22525658 tgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctaagttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4483327 - 4483293
Alignment:
Q  253 ttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4483327 ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 4483293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Original strand, 14103177 - 14103223
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt 180  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14103177 taatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtt 14103223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 20502146 - 20502203
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20502146 tttatgtgctgcctatgttgctg-ttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26219760 - 26219718
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 40492831 - 40492901
Alignment:
Q  161 catgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40492831 catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttat 40492901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 19763 - 19992
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19763 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttc-cagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcat 19861  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| || || | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19862 tacatgagttatttatgatgctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttatt 19961  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19962 aattaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 19992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39992 - 39917
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  39992 tgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6391
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6161 gggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcat 6259  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6260 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcat 6359  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  6360 taactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 6391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13845
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 13845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 267864 - 267674
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  267864 cagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttgagatattgttgatttgc 267765  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  267764 atttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 22178098 - 22178328
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||| ||| |||||||||||| ||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22178098 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcat 22178196  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22178197 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttat 22178296  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22178297 taactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 22178328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Original strand, 20026858 - 20027048
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  |  ||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |    
T  20026858 cagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgc 20026957  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | | |||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20026958 atttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 20027048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 299
Target Start/End: Original strand, 26012002 - 26012154
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||| |||||| |||   || |||  || |||||||||||||    
T  26012002 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgt--tgctttgcatactgcctatgttgc 26012099  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26012100 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 21502208 - 21502277
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  21502208 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 22959584 - 22959650
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22959584 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29448158 - 29448055
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29448158 tgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgc 29448059  T
Q  246 tgtt 249  Q
    ||||    
T  29448058 tgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21565611 - 21565545
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21565611 ctgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144063
Alignment:
Q  135 aatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatat 231  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||   ||||||  ||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgt--tgttttgcat 22144120  T
Q  232 gctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
     || ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22144119 actacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 22144063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 19660887 - 19660956
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  19660887 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 21329549 - 21329618
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  21329549 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36314643 - 36314577
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  36314643 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 8286887 - 8286960
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  8286887 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15796519 - 15796438
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15796519 tgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgttt-attattgattaagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 21997578 - 21997651
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  21997578 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 271
Target Start/End: Original strand, 41861475 - 41861544
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 271  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  41861475 tgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtttg-atattaattaagctgcatg 41861544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 286
Target Start/End: Original strand, 26732885 - 26732937
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26732885 ctgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 21729108 - 21729185
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21729108 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 21808433 - 21808510
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21808433 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 288
Target Start/End: Original strand, 26740702 - 26740752
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26740702 ctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 26740752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 23390540 - 23390613
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23390540 ttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23469879 - 23469822
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23469879 tttatgtgctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24529297 - 24529224
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  24529297 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25421609 - 25421536
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25421609 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13025391 - 13025315
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13025391 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13095575 - 13095499
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13095575 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19668963 - 19668902
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19668963 ctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24493649 - 24493573
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  24493649 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 21293022 - 21293090
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21293022 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 288
Target Start/End: Original strand, 27988997 - 27989036
Alignment:
Q  249 ttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27988997 ttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 27989036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25431471 - 25431395
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt--tgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  25431471 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaatttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37723972 - 37723922
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  37723972 ctgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9078020 - 9077956
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||    
T  9078020 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 21328266 - 21328322
Alignment:
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21328266 tgctgcctatgttgctgct-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 21328322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 288
Target Start/End: Original strand, 20902128 - 20902160
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20902128 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 20902160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 289
Target Start/End: Original strand, 1715 - 1906
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1715 cagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatgttgagatgttgttgatttgc 1814  T
Q  199 a-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
    |  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1815 atttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 288
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8181
Alignment:
Q  60 ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||| ||||   |||||||  |||    
T  7956 ggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttt----cagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacatt 8051  T
Q  160 acatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatta 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  8052 acatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgtta 8151  T
Q  259 actaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8152 actaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25277 - 25120
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  25277 aataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcattgatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 25120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 609
Alignment:
Q  114 atatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttacaatgatatttttat 212  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||    
T  725 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 626  T
Q  213 attatgaactgttttat 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  625 atcatgaactgttttat 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38560 - 38339
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |    | |||||||||||  ||||||||| ||    
T  38560 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcat 38462  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || | |||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38461 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcat 38362  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtc 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  38361 taactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 97255 - 97019
Alignment:
Q  53 atcatagggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtat 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||       ||||||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||    
T  97255 atcatggggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgttt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtat 97157  T
Q  153 atgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgttt 250  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  97156 atgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 97057  T
Q  251 gtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  97056 atttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaa 97019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 106533 - 106297
Alignment:
Q  53 atcatagggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtat 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||       ||||||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||    
T  106533 atcatggggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgttt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtat 106435  T
Q  153 atgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgttt 250  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  106434 atgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 106335  T
Q  251 gtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  106334 atttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatgaa 106297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 1867945 - 1868102
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  1867945 aataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcattgatattgttatatcatgagctgttttata 1868044  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1868045 tactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 1868102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 288
Target Start/End: Original strand, 20220068 - 20220295
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||| ||| |||||||||| |  | ||||||||||||| | |||||||| ||    
T  20220068 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttc-cagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcat 20220166  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |   | ||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  20220167 tacatgaattatatatgatgtttga--gatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttatt 20220264  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20220265 aactaagctgtatgagtcggtctaagatgaa 20220295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 15008449 - 15008608
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15008449 aataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttata 15008548  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaaga 290  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15008549 tactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaaga 15008608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14044902 - 14044760
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttg-ttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||||| |||||| | || ||||||||| | |||||||||||||    
T  14044902 tgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgc 14044803  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14044802 tttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 14044760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14354932 - 14354790
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttg-ttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||||| |||||| | || ||||||||| | |||||||||||||    
T  14354932 tgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgc 14354833  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14354832 tttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 14354790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12901527 - 12901337
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttac 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |  |   |||||| ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |    
T  12901527 cagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgc 12901428  T
Q  199 aat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    | | |||||| |||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12901427 atttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttgaa 12901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 2280070 - 2280238
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||    ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||  |||||||      
T  2280070 ataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatg--ctgttttgc 2280167  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatgatgt 299  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2280168 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14036391 - 14036283
Alignment:
Q  167 ttatatatgatgttgg-gatgttg-ttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 264  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036391 ttatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 14036292  T
Q  265 ctgcatgag 273  Q
    |||||||||    
T  14036291 ctgcatgag 14036283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14346421 - 14346313
Alignment:
Q  167 ttatatatgatgttgg-gatgttg-ttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 264  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346421 ttatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 14346322  T
Q  265 ctgcatgag 273  Q
    |||||||||    
T  14346321 ctgcatgag 14346313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67745
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatg 232  Q
    |||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||  || |||  ||     
T  67911 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatattgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcata 67815  T
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  67814 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 811183 - 811249
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  811183 ctgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 16219769 - 16219835
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16219769 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18005715 - 18005649
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18005715 ctgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44014247 - 44014181
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44014247 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34200804  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  34200803 tgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Original strand, 12255742 - 12255885
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatg-atg-ttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| || || ||  ||||||| |||||| ||||| || |||      
T  12255742 ataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgc 12255841  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    || ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 12255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48991260 - 48991209
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48991260 tgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 48991209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 28505350 - 28505415
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  28505350 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12698910 - 12698835
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  12698910 tgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16495420  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  16495419 tgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 11996079 - 11996148
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  11996079 ctgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 3564408 - 3564481
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3564408 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 16386291 - 16386369
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  16386291 ttttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 27847882 - 27847951
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||    
T  27847882 ctgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38227561 - 38227481
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  38227561 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47831872 - 47831807
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  47831872 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9509257 - 9509193
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  9509257 ctgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40443460 - 40443393
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgat 297  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  40443460 ctgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144154
Alignment:
Q  239 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-agatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13647393 - 13647325
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||    
T  13647393 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16056393 - 16056342
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16056393 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttgaa 16056342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18203912 - 18203826
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  18203912 tgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatgaa 18203826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 287
Target Start/End: Original strand, 17062019 - 17062065
Alignment:
Q  241 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17062019 gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 17062065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||   |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 10063872 - 10063921
Alignment:
Q  235 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  10063872 gcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 287
Target Start/End: Original strand, 18456454 - 18456518
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18456454 tgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18456518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10589116 - 10589039
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagtt---gaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  10589116 ttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18430755 - 18430709
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  18430755 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 54
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||       |||||||||| ||||| |||||||||| |  | |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  248 gggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgttt-cagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcat 150  T
Q  159 tacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgt 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  149 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 60681 - 60823
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  60681 tgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattgatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgc 60780  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  60781 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 60823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 129974 - 129908
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  129974 ctgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 18116 - 18298
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||||||||| |||||| |  | | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  18116 gggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgttt-cagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcat 18214  T
Q  159 tacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctat 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18215 tacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctat 18298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13008 - 12942
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13008 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19668526 - 19668385
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgct 246  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||    
T  19668526 tgtatatacattacatgaattacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgct 19668427  T
Q  247 gtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19668426 gtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 19668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18696657 - 18696539
Alignment:
Q  132 aataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaatgatatttttatattatgaactgttttata 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  18696657 aataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatg 18696558  T
Q  231 tgctgcctatgttgctgtt 249  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  18696557 tattgcctatgttgctgtt 18696539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23076974 - 23076749
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||       ||||||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||| ||    
T  23076974 gggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgttt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcat 23076876  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||  || | |||||| ||||||   ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  23076875 tacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttat 23076776  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076775 taactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18706493 - 18706356
Alignment:
Q  114 atatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttacaatgatatttttat 212  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| ||||    
T  18706493 atatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgctttgatattgttat 18706394  T
Q  213 attatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgttt 250  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18706393 atcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35008392 - 35008167
Alignment:
Q  59 gggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtat 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||        ||||||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||  ||    
T  35008392 gggtaagaaactaagttgcttatcttactgtt-attgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcat 35008294  T
Q  159 tacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||  || | |||||| ||||||   ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  35008293 tacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttat 35008194  T
Q  257 taactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35008193 taactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20109237 - 20109140
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20109237 tgatattgttatattatgt--tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 288
Target Start/End: Original strand, 9098489 - 9098621
Alignment:
Q  157 attacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttaca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgttta 255  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||| |||||| ||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||      
T  9098489 attacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttat 9098588  T
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9098589 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 9098621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23019574 - 23019408
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatat 231  Q
    |||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| || || | |||||| |||||| |||   ||||||  ||    
T  23019574 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgt--tgttttgcat 23019477  T
Q  232 gctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatgatgt 299  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  23019476 actgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatgaaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19652264 - 19652198
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19652264 ctgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Original strand, 18199333 - 18199519
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttg--ggatgttgttgattt 196  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   |  || ||||||||     
T  18199333 cagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgatta 18199432  T
Q  197 acaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
     || | |||||| |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  18199433 tcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgttt-attattgattaagctgcatgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33443147 - 33443068
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtcta 281  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33443147 tgatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 27333270 - 27333339
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  27333270 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 27394010 - 27394079
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  27394010 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35245655 - 35245586
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  35245655 ctgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 173
Target Start/End: Original strand, 28103816 - 28103890
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatata 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28103816 cagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatata 28103890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Original strand, 18177589 - 18177775
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt--gggatgttgttgattt 196  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   |  || ||||||||     
T  18177589 cagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgatta 18177688  T
Q  197 aca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
     ||  ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  18177689 tcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgttt-attattgattaagctgcatgagtcggtctaag 18177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18204282 - 18204096
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt--gggatgttgttgattt 196  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   |  || ||||||||     
T  18204282 cagtaagtctgatgtaaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgatta 18204183  T
Q  197 aca-atgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
     ||  ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  18204182 tcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgttgttt-attattgattaagctgcatgagtcggtctaag 18204096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25644389 - 25644334
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25644389 ctgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 25644334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20076768 - 20076704
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20076768 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16496321 - 16496244
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  16496321 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag- 283  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||     
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28496574  T
Q  284 --ttgaagatgatgatgt 299  Q
      ||||||||||||||||    
T  28496575 ttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag- 283  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||     
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 29808985  T
Q  284 --ttgaagatgatgatgt 299  Q
      ||||||||||||||||    
T  29808986 ttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 16920682 - 16920751
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  16920682 ctgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Original strand, 20361004 - 20361066
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20361004 ttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttga 20361066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 4185873 - 4185939
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||    
T  4185873 ctgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4185939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29060617 - 29060544
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  29060617 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Original strand, 17287852 - 17287917
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  17287852 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18453258 - 18453201
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18453258 tttatgtgctgcctatgttgctg-ttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 20638327 - 20638400
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  20638327 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 25629430 - 25629472
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25629430 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25656690 - 25656641
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25656641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 18409880 - 18409944
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  18409880 ctgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  239 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25714463 - 25714417
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  25714463 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 136335 - 136476
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgct 246  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||    
T  136335 tgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgct 136434  T
Q  247 gtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  136435 gtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 136476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 145043 - 145184
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgct 246  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||    
T  145043 tgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgct 145142  T
Q  247 gtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  145143 gtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 145184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 174835 - 174785
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  174835 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 121834 - 121770
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  121834 ctgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Original strand, 16051 - 16207
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||   ||||||      
T  16051 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgt--tgttttgc 16148  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 16207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 13141
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgtttta 228  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| || | |||||| |||||| |||  |||||||     
T  13299 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg--ctgttttg 13202  T
Q  229 tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaag 289  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13201 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2741 - 2675
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2741 tgttttatgtactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 2675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Original strand, 27700 - 27856
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatga-tgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||  |||||||      
T  27700 ataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatg--ctgttttgc 27797  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 27856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32738 - 32538
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgattta 197  Q
    ||||||||||||||||||| || | || | ||   |||||| ||||   |||||||  |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||      
T  32738 cagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgc 32639  T
Q  198 caatgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg-aagatgatga 296  Q
       ||||||| |||||| |||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32638 atttgatattgttatatcatgt--tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatga 32541  T
Q  297 tgt 299  Q
    |||    
T  32540 tgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 51933 - 51985
Alignment:
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51933 atgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2776 - 2689
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2776 tgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 2689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Original strand, 103651 - 103738
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  103651 tgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttgaa 103738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19333 - 19267
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19333 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 23935 - 24001
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23935 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 100443 - 100377
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  100443 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 119944 - 119875
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  119944 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 40226 - 40292
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  40226 ctgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 101568 - 101502
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  101568 ctgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 14749 - 14815
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14749 ctgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6604 - 6539
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6604 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8565 - 8480
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||  || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8565 tgatattgttatatcatg--ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 132
Alignment:
Q  148 tgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgc 245  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| || | |||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||  || |||  || ||||||||||||     
T  283 tgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgt 186  T
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  185 tgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 10593 - 10659
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  10593 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 2697 - 2763
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2697 ctgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 160753 - 160687
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  160753 ctgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 160687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 62267 - 62202
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  62267 ctgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132661
Alignment:
Q  238 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12667 - 12582
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  12667 tgatattgttatatcatg--ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaa 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 11310  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  11309 tgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 2015  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  2014 tgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28491 - 28418
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  28491 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  246 tgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 10475 - 10544
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  10475 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15676
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagt 15679  T
Q  285 tga 287  Q
    |||    
T  15678 tga 15676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1358 - 1289
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1358 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7335 - 7266
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  7335 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Original strand, 15289 - 15344
Alignment:
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15289 tgctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttga 15344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 2858 - 2924
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  2858 ctgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 45844 - 45910
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45844 ctgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 22726 - 22788
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22726 ctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Original strand, 32997 - 33073
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  32997 ctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46008 - 45932
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  46008 ctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16190 - 16117
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  16190 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1131 - 1046
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1131 tgatattgttatatcatg--ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 3192 - 3267
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3192 tgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||      
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 1172  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  1173 tgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 272
Target Start/End: Original strand, 53500 - 53640
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||    ||| ||||||| ||| || || | |||||| |||||| |||   ||||||      
T  53500 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgt--tgttttgc 53597  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 1101 - 1170
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1101 ctgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16351 - 16282
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  16351 ctgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6680 - 6611
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  6680 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14060 - 13991
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  14060 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 6175 - 6244
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  6175 ctgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 28821 - 28888
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtt-tgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28821 ctgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51651 - 51582
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||    
T  51651 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 15829 - 15898
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  15829 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1097
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1151 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3303
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3230 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12969 - 12770
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgattta 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |  | | |||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | |||||||   ||||||| ||| ||     
T  12969 cagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttg 12870  T
Q  198 caat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatga 296  Q
    || | |||||| |||||| ||||  || |||  ||  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  12869 cattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatga 12772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5712 - 5658
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5712 ctgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttga 5658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 17261 - 17334
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  17261 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11634 - 11493
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||| ||||||||| | ||||    |||||| |||||| ||||  ||||||      
T  11634 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga--tgttttgc 11537  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 11493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Original strand, 38207 - 38348
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatg--ttgggatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttat 229  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||| ||||||||| | ||||    |||||| |||||| ||||  ||||||      
T  38207 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga--tgttttgc 38304  T
Q  230 atgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 38348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1155
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg---aagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  1089 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2029 - 1952
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  2029 ttttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13576 - 13513
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttg 286  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13576 tgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  186 gttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa-- 282  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||   ||| ||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||      
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtata--ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagt 34141  T
Q  283 -gttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||||||||    
T  34140 tgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 206545 - 206616
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 273  Q
    ||||||| ||||||  |||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  206545 tgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgag 206616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51980 - 51917
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  51980 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 168022 - 168099
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  168022 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 38202 - 38258
Alignment:
Q  231 tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  38202 tgctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgaa 38258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6881 - 6822
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatg 292  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6881 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Original strand, 26109 - 26171
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26109 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32135 - 32067
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  32135 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47064 - 46995
Alignment:
Q  233 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  47064 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 284
Target Start/End: Original strand, 24324 - 24406
Alignment:
Q  201 tgatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||| | |||   |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24324 tgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13288 - 13215
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  13288 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39557 - 39492
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39557 ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 39492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Original strand, 75255 - 75320
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  75255 ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 75320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1928 - 1855
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  1928 ttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5246
Alignment:
Q  236 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32101
Alignment:
Q  238 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10768 - 10541
Alignment:
Q  60 ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgnnnnnnncagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||||| || | || |  |   |||||| |||| | |||||||  |||    
T  10768 ggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttt-cagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacatt 10670  T
Q  160 acatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttacaat-gatatttttatattatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttatt 257  Q
    ||||||||||| |  |||||| | ||||||| ||| || || | |||||| |||||| ||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  ||    
T  10669 acatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttattt 10572  T
Q  258 aactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10571 aaaaaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 339990 - 340064
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  339990 tgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1169
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1092 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4926 - 4849
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  4926 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4712
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  4789 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7507 - 7445
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  7507 tttatgtgctgcctatgttgctg-ttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaa 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14626 - 14564
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaa 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  14626 tttatgtgctgcctatgttgctg-ttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatgaa 14564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Original strand, 805 - 858
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtc 279  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  805 tttatatgctgcctatgttgttg-ttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 6199 - 6241
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  6199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10641 - 10595
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt 180  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 taatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtt 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Original strand, 614 - 660
Alignment:
Q  134 taatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt 180  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  614 taatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtt 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3547 - 3474
Alignment:
Q  224 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3547 ttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Original strand, 18084 - 18130
Alignment:
Q  238 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18084 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 8604 - 8646
Alignment:
Q  256 ttaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  8604 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Original strand, 15505 - 15584
Alignment:
Q  222 tgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||    
T  15505 tgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36256 - 36199
Alignment:
Q  225 tttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaag 283  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36256 tttatgtgctgcctatgttgttgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20978 - 20928
Alignment:
Q  234 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagt 284  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20978 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Original strand, 38758 - 38808
Alignment:
Q  237 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttga 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  38758 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttga 38808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 226 - 145
Alignment:
Q  99 cagtaagcctgaattatatgatttgatctattaaataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatgatgtt 180  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  226 cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtt 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33022 - 32946
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  33022 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38841 - 38765
Alignment:
Q  221 ctgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaggcggtctaagttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  38841 ctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 225576 - 225512
Alignment:
Q  133 ataatgtgatattaatgtatatgtattacatgaattatatatg-atg-ttgggatgttgttgatt 195  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  225576 ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt 225512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 822 times since January 2019
Visitors: 3837