View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0608_low_11 (Length: 367)

Name: NF0608_low_11
Description: NF0608
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0608_low_11
NF0608_low_11
[»] chr6 (86 HSPs)
chr6 (11-326)||(27284177-27284492)
chr6 (11-326)||(27623522-27623839)
chr6 (11-326)||(13518009-13518324)
chr6 (11-326)||(4763831-4764146)
chr6 (11-326)||(27355926-27356241)
chr6 (11-326)||(16755888-16756204)
chr6 (11-326)||(28166562-28166878)
chr6 (11-326)||(8899514-8899829)
chr6 (11-326)||(27063550-27063864)
chr6 (11-326)||(34458323-34458636)
chr6 (11-326)||(27491201-27491516)
chr6 (11-326)||(33370246-33370561)
chr6 (11-326)||(26110226-26110540)
chr6 (11-326)||(16680207-16680523)
chr6 (11-326)||(4539573-4539888)
chr6 (11-326)||(29507484-29507801)
chr6 (11-326)||(26772444-26772758)
chr6 (11-326)||(28213523-28213838)
chr6 (11-326)||(29555626-29555941)
chr6 (11-326)||(22928696-22929013)
chr6 (11-326)||(4778949-4779264)
chr6 (11-326)||(27200255-27200569)
chr6 (11-326)||(27248664-27248978)
chr6 (11-326)||(26791884-26792199)
chr6 (11-326)||(29579083-29579397)
chr6 (11-326)||(30551815-30552130)
chr6 (11-326)||(13292766-13293075)
chr6 (11-326)||(16937840-16938154)
chr6 (11-313)||(26666473-26666774)
chr6 (14-326)||(14139218-14139524)
chr6 (11-326)||(4531356-4531671)
chr6 (14-326)||(27013801-27014106)
chr6 (11-326)||(26926836-26927135)
chr6 (11-326)||(27208972-27209283)
chr6 (11-326)||(27239945-27240256)
chr6 (11-326)||(27031091-27031403)
chr6 (11-326)||(24869778-24870087)
chr6 (11-326)||(27025213-27025524)
chr6 (11-326)||(24299575-24299885)
chr6 (11-326)||(15406348-15406658)
chr6 (11-326)||(15418135-15418445)
chr6 (23-326)||(20174617-20174930)
chr6 (23-326)||(22161061-22161374)
chr6 (321-367)||(27623967-27624013)
chr6 (321-360)||(4531181-4531220)
chr6 (321-360)||(4540025-4540064)
chr6 (321-360)||(4763657-4763696)
chr6 (321-360)||(4778773-4778812)
chr6 (321-360)||(8899965-8900004)
chr6 (321-360)||(14139660-14139699)
chr6 (321-360)||(16755713-16755752)
chr6 (321-360)||(22929148-22929187)
chr6 (321-360)||(23851593-23851632)
chr6 (321-360)||(24300021-24300060)
chr6 (321-360)||(24869603-24869642)
chr6 (321-360)||(26110676-26110715)
chr6 (321-360)||(26791709-26791748)
chr6 (321-360)||(26926663-26926702)
chr6 (321-360)||(27013626-27013665)
chr6 (321-360)||(27025038-27025077)
chr6 (321-360)||(27030915-27030954)
chr6 (321-360)||(27184821-27184860)
chr6 (321-360)||(27200079-27200118)
chr6 (321-360)||(27249116-27249155)
chr6 (321-360)||(27264380-27264419)
chr6 (321-360)||(27284627-27284666)
chr6 (321-360)||(27356377-27356416)
chr6 (321-360)||(28166387-28166426)
chr6 (321-360)||(28213347-28213386)
chr6 (321-360)||(29578908-29578947)
chr6 (321-360)||(30552282-30552321)
chr6 (321-360)||(33370697-33370736)
chr6 (321-359)||(15406796-15406834)
chr6 (321-359)||(15418583-15418621)
chr6 (321-360)||(4718401-4718440)
chr6 (321-360)||(13293211-13293250)
chr6 (321-360)||(13518459-13518498)
chr6 (321-360)||(16938291-16938330)
chr6 (321-360)||(26772894-26772933)
chr6 (321-360)||(27491026-27491065)
chr6 (321-360)||(29507309-29507348)
chr6 (321-360)||(29555451-29555490)
chr6 (321-367)||(20174442-20174488)
chr6 (321-367)||(22161503-22161549)
chr6 (321-354)||(16680032-16680065)
chr6 (321-360)||(27063374-27063414)
[»] chr5 (98 HSPs)
chr5 (11-326)||(18369300-18369615)
chr5 (11-326)||(30174543-30174859)
chr5 (15-326)||(11555432-11555742)
chr5 (11-326)||(33881204-33881519)
chr5 (11-326)||(3795616-3795932)
chr5 (11-326)||(18494536-18494850)
chr5 (11-326)||(37352412-37352727)
chr5 (11-326)||(40467321-40467636)
chr5 (14-326)||(9544478-9544792)
chr5 (11-326)||(13180561-13180871)
chr5 (11-326)||(28655320-28655636)
chr5 (11-320)||(8659240-8659549)
chr5 (11-326)||(37746090-37746411)
chr5 (11-326)||(37761060-37761376)
chr5 (11-326)||(6880382-6880697)
chr5 (11-326)||(13436442-13436762)
chr5 (11-326)||(30158112-30158427)
chr5 (11-326)||(43084336-43084651)
chr5 (11-326)||(11329715-11330032)
chr5 (11-326)||(13318596-13318910)
chr5 (11-326)||(9323556-9323869)
chr5 (11-326)||(12138255-12138568)
chr5 (11-326)||(23632047-23632364)
chr5 (11-326)||(41680782-41681098)
chr5 (11-326)||(22894494-22894808)
chr5 (11-326)||(33298611-33298930)
chr5 (11-326)||(24730048-24730363)
chr5 (11-326)||(34622597-34622912)
chr5 (11-326)||(31820178-31820491)
chr5 (11-326)||(28953548-28953863)
chr5 (34-326)||(30035504-30035795)
chr5 (11-326)||(37665254-37665569)
chr5 (11-326)||(2517143-2517459)
chr5 (11-326)||(5643878-5644191)
chr5 (11-326)||(32590044-32590358)
chr5 (11-326)||(15752626-15752935)
chr5 (11-326)||(33522460-33522776)
chr5 (11-326)||(18122184-18122499)
chr5 (11-326)||(26486475-26486778)
chr5 (14-326)||(31437542-31437847)
chr5 (18-326)||(25206356-25206670)
chr5 (18-326)||(25270512-25270826)
chr5 (11-326)||(15652528-15652841)
chr5 (11-326)||(22992892-22993199)
chr5 (11-326)||(23897952-23898261)
chr5 (11-326)||(33783565-33783875)
chr5 (11-326)||(24608324-24608634)
chr5 (11-326)||(24975927-24976236)
chr5 (11-326)||(30940715-30941023)
chr5 (321-360)||(3795441-3795480)
chr5 (321-360)||(5643705-5643744)
chr5 (321-360)||(6880206-6880245)
chr5 (321-360)||(9544927-9544966)
chr5 (321-360)||(11555257-11555296)
chr5 (321-360)||(13319046-13319085)
chr5 (321-360)||(13436900-13436939)
chr5 (321-360)||(15652977-15653016)
chr5 (321-360)||(18122635-18122674)
chr5 (321-360)||(18369751-18369790)
chr5 (321-360)||(18494986-18495025)
chr5 (321-360)||(22894320-22894359)
chr5 (321-360)||(22993335-22993374)
chr5 (321-360)||(23631872-23631911)
chr5 (321-360)||(23897778-23897817)
chr5 (321-360)||(24608149-24608188)
chr5 (321-360)||(24729873-24729912)
chr5 (321-360)||(28655145-28655184)
chr5 (321-360)||(30940539-30940578)
chr5 (321-360)||(31437367-31437406)
chr5 (321-360)||(31820627-31820666)
chr5 (321-360)||(32590494-32590533)
chr5 (321-360)||(33298436-33298475)
chr5 (321-360)||(33522282-33522321)
chr5 (321-360)||(34622421-34622460)
chr5 (321-360)||(37352863-37352902)
chr5 (321-360)||(37665705-37665744)
chr5 (321-360)||(37746546-37746585)
chr5 (321-360)||(37760885-37760924)
chr5 (321-360)||(40467772-40467811)
chr5 (321-360)||(41680607-41680646)
chr5 (321-358)||(11329540-11329577)
chr5 (321-358)||(43084161-43084198)
chr5 (321-357)||(9323380-9323416)
chr5 (321-357)||(26486299-26486335)
chr5 (321-357)||(30157936-30157972)
chr5 (321-357)||(30174368-30174404)
chr5 (321-360)||(2516968-2517007)
chr5 (321-360)||(13181008-13181047)
chr5 (321-360)||(15753070-15753109)
chr5 (321-356)||(28954003-28954038)
chr5 (321-360)||(30035330-30035369)
chr5 (321-360)||(33783390-33783429)
chr5 (321-360)||(33881030-33881069)
chr5 (321-357)||(12138079-12138115)
chr5 (321-360)||(24975752-24975791)
chr5 (321-360)||(25206182-25206220)
chr5 (321-360)||(25270338-25270376)
chr5 (321-360)||(8659690-8659730)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (11-326)||(3647219-3647534)
chr1 (11-326)||(10968738-10969054)
chr1 (33-326)||(51644293-51644588)
chr1 (11-326)||(10951164-10951480)
chr1 (11-326)||(41787177-41787493)
chr1 (11-326)||(28591156-28591470)
chr1 (11-326)||(28155799-28156116)
chr1 (11-326)||(20334283-20334600)
chr1 (11-326)||(16201895-16202218)
chr1 (11-326)||(20466850-20467173)
chr1 (11-326)||(21891630-21891931)
chr1 (321-360)||(3647044-3647083)
chr1 (321-360)||(10950989-10951028)
chr1 (321-360)||(10968563-10968602)
chr1 (321-360)||(20334735-20334774)
chr1 (321-360)||(21892067-21892106)
chr1 (321-360)||(51644118-51644157)
chr1 (321-358)||(41787632-41787669)
chr1 (321-367)||(20466677-20466722)
chr1 (321-360)||(28590981-28591020)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (11-326)||(5717102-5717418)
chr3 (11-326)||(5728012-5728328)
chr3 (11-326)||(5764040-5764356)
chr3 (11-326)||(47029487-47029803)
chr3 (11-326)||(31958366-31958683)
chr3 (11-326)||(5603224-5603541)
chr3 (11-326)||(24334207-24334524)
chr3 (11-326)||(4790544-4790859)
chr3 (11-326)||(32296663-32296979)
chr3 (11-326)||(10649105-10649420)
chr3 (11-326)||(29658879-29659194)
chr3 (11-326)||(4340587-4340902)
chr3 (11-326)||(28109862-28110181)
chr3 (11-326)||(4422952-4423267)
chr3 (11-326)||(5473022-5473336)
chr3 (11-326)||(51788056-51788371)
chr3 (11-326)||(17970777-17971090)
chr3 (11-326)||(10402183-10402497)
chr3 (11-326)||(8217666-8217983)
chr3 (14-326)||(5590275-5590587)
chr3 (11-326)||(18248772-18249087)
chr3 (11-326)||(22381492-22381806)
chr3 (11-326)||(16422216-16422532)
chr3 (11-326)||(20072067-20072384)
chr3 (11-326)||(48471961-48472280)
chr3 (11-326)||(29142665-29142983)
chr3 (11-326)||(18286266-18286580)
chr3 (11-326)||(18301567-18301881)
chr3 (11-326)||(4629819-4630133)
chr3 (11-326)||(21680735-21681049)
chr3 (11-326)||(28345205-28345519)
chr3 (11-326)||(28027325-28027638)
chr3 (11-326)||(11104272-11104588)
chr3 (11-326)||(22864759-22865072)
chr3 (11-326)||(22879818-22880131)
chr3 (11-326)||(5019747-5020061)
chr3 (11-326)||(6536654-6536969)
chr3 (11-326)||(17978861-17979177)
chr3 (11-326)||(7079256-7079576)
chr3 (11-326)||(18231227-18231542)
chr3 (11-326)||(20570757-20571072)
chr3 (11-326)||(18057295-18057612)
chr3 (11-326)||(16618400-16618719)
chr3 (11-326)||(31030156-31030464)
chr3 (11-326)||(6207935-6208245)
chr3 (14-326)||(18336663-18336968)
chr3 (11-326)||(19700520-19700847)
chr3 (11-326)||(4727667-4727976)
chr3 (11-326)||(32445188-32445494)
chr3 (11-326)||(15735011-15735321)
chr3 (11-326)||(35886799-35887109)
chr3 (11-326)||(4689686-4689994)
chr3 (11-326)||(8283369-8283695)
chr3 (11-326)||(5658168-5658480)
chr3 (11-260)||(15886652-15886895)
chr3 (321-367)||(16618847-16618893)
chr3 (321-360)||(4422778-4422817)
chr3 (321-360)||(4629644-4629683)
chr3 (321-360)||(5590723-5590762)
chr3 (321-360)||(5716927-5716966)
chr3 (321-360)||(5727837-5727876)
chr3 (321-360)||(5764492-5764531)
chr3 (321-360)||(6207759-6207798)
chr3 (321-360)||(7079083-7079122)
chr3 (321-360)||(8217491-8217530)
chr3 (321-360)||(8283831-8283870)
chr3 (321-360)||(11104724-11104763)
chr3 (321-360)||(17971226-17971265)
chr3 (321-360)||(17979315-17979354)
chr3 (321-360)||(18231052-18231091)
chr3 (321-360)||(18248597-18248636)
chr3 (321-360)||(18286716-18286755)
chr3 (321-360)||(18302017-18302056)
chr3 (321-360)||(20071894-20071933)
chr3 (321-360)||(20571208-20571247)
chr3 (321-360)||(22381941-22381980)
chr3 (321-360)||(22865208-22865247)
chr3 (321-360)||(22880267-22880306)
chr3 (321-360)||(28027150-28027189)
chr3 (321-360)||(28110318-28110357)
chr3 (321-360)||(28345030-28345069)
chr3 (321-360)||(29143119-29143158)
chr3 (321-360)||(29659330-29659369)
chr3 (321-360)||(31030600-31030639)
chr3 (321-360)||(32296488-32296527)
chr3 (321-360)||(32445013-32445052)
chr3 (321-360)||(35886623-35886662)
chr3 (321-358)||(4790998-4791035)
chr3 (321-358)||(5019572-5019609)
chr3 (321-358)||(8002419-8002456)
chr3 (321-358)||(10648930-10648967)
chr3 (321-358)||(21680560-21680597)
chr3 (323-360)||(48471788-48471825)
chr3 (321-358)||(51787881-51787918)
chr3 (321-357)||(5657994-5658030)
chr3 (321-357)||(15735460-15735496)
chr3 (321-357)||(47029312-47029348)
chr3 (321-360)||(4341039-4341078)
chr3 (321-360)||(4689510-4689549)
chr3 (321-360)||(4727492-4727531)
chr3 (321-360)||(10402008-10402047)
chr3 (321-360)||(18336487-18336526)
chr3 (321-356)||(19700346-19700381)
chr3 (321-360)||(24334032-24334071)
chr3 (321-360)||(31958819-31958858)
chr3 (321-358)||(6537107-6537144)
chr3 (321-360)||(5472847-5472886)
chr3 (321-360)||(5603677-5603716)
chr3 (321-360)||(15887069-15887108)
chr3 (321-356)||(18057119-18057154)
chr3 (321-359)||(16422043-16422080)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (11-326)||(20332290-20332606)
chr4 (11-326)||(40099504-40099820)
chr4 (11-326)||(39856719-39857032)
chr4 (11-326)||(24586229-24586544)
chr4 (11-326)||(27157180-27157497)
chr4 (11-326)||(14104625-14104939)
chr4 (11-326)||(30759846-30760159)
chr4 (11-326)||(33667671-33667984)
chr4 (11-326)||(18794485-18794800)
chr4 (11-326)||(54839473-54839787)
chr4 (11-326)||(5700623-5700937)
chr4 (11-326)||(14753362-14753676)
chr4 (11-326)||(5011960-5012275)
chr4 (11-326)||(34182832-34183145)
chr4 (14-326)||(21975786-21976098)
chr4 (11-326)||(36338394-36338701)
chr4 (11-326)||(31120378-31120694)
chr4 (15-326)||(24118745-24119055)
chr4 (11-318)||(36324185-36324484)
chr4 (11-326)||(1906334-1906654)
chr4 (11-326)||(15233898-15234217)
chr4 (11-326)||(15380106-15380421)
chr4 (11-326)||(6575944-6576251)
chr4 (11-326)||(15276497-15276815)
chr4 (11-326)||(1673942-1674258)
chr4 (11-326)||(17019135-17019445)
chr4 (11-326)||(14671099-14671410)
chr4 (321-363)||(1906160-1906202)
chr4 (321-360)||(5011784-5011823)
chr4 (321-360)||(5700447-5700486)
chr4 (321-360)||(6575769-6575808)
chr4 (321-360)||(14670923-14670962)
chr4 (321-360)||(14753812-14753851)
chr4 (321-360)||(15233724-15233763)
chr4 (321-360)||(17018959-17018998)
chr4 (321-360)||(18794936-18794975)
chr4 (321-360)||(20332742-20332781)
chr4 (321-360)||(21975608-21975647)
chr4 (321-360)||(24586681-24586720)
chr4 (321-360)||(30759671-30759710)
chr4 (321-360)||(31120833-31120872)
chr4 (321-360)||(34183281-34183320)
chr4 (321-360)||(36338837-36338876)
chr4 (321-360)||(54839299-54839338)
chr4 (321-357)||(40099959-40099995)
chr4 (321-360)||(14104451-14104490)
chr4 (321-360)||(18311498-18311537)
chr4 (321-360)||(33668120-33668159)
chr4 (321-360)||(39856544-39856583)
chr4 (321-360)||(27157634-27157674)
chr4 (321-354)||(24118569-24118602)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (11-326)||(37945723-37946039)
chr2 (11-326)||(12661608-12661922)
chr2 (11-326)||(22922001-22922318)
chr2 (11-326)||(27809770-27810087)
chr2 (11-326)||(254510-254825)
chr2 (11-326)||(37383747-37384061)
chr2 (11-326)||(39896138-39896452)
chr2 (11-326)||(19410342-19410659)
chr2 (11-326)||(12592879-12593198)
chr2 (11-326)||(16167547-16167862)
chr2 (11-326)||(27122594-27122907)
chr2 (11-326)||(13930402-13930719)
chr2 (11-326)||(3788563-3788877)
chr2 (11-326)||(34867752-34868066)
chr2 (11-326)||(9343845-9344160)
chr2 (11-326)||(39045680-39045995)
chr2 (11-326)||(37931441-37931763)
chr2 (11-326)||(31868644-31868958)
chr2 (11-326)||(34160913-34161230)
chr2 (11-326)||(40239578-40239892)
chr2 (11-326)||(37679749-37680065)
chr2 (11-326)||(37695014-37695330)
chr2 (11-326)||(27782301-27782616)
chr2 (11-326)||(21671028-21671345)
chr2 (11-326)||(31882356-31882670)
chr2 (11-326)||(32055871-32056185)
chr2 (11-326)||(12710459-12710774)
chr2 (11-326)||(16823195-16823510)
chr2 (11-326)||(16897970-16898285)
chr2 (11-326)||(11629043-11629357)
chr2 (11-326)||(21697031-21697349)
chr2 (11-326)||(34297225-34297533)
chr2 (11-326)||(27396392-27396717)
chr2 (11-326)||(19450276-19450600)
chr2 (11-326)||(34268784-34269094)
chr2 (11-326)||(28888348-28888658)
chr2 (11-326)||(23122436-23122745)
chr2 (15-326)||(27428315-27428619)
chr2 (11-326)||(20843982-20844296)
chr2 (11-198)||(23116993-23117180)
chr2 (321-360)||(254961-255000)
chr2 (321-360)||(3788388-3788427)
chr2 (321-360)||(9344296-9344335)
chr2 (321-360)||(12592704-12592743)
chr2 (321-360)||(12661433-12661472)
chr2 (321-360)||(13930855-13930894)
chr2 (321-360)||(16823649-16823688)
chr2 (321-360)||(16897792-16897831)
chr2 (321-360)||(20843807-20843846)
chr2 (321-360)||(21671482-21671521)
chr2 (321-360)||(27122419-27122458)
chr2 (321-360)||(27782126-27782165)
chr2 (321-360)||(27809595-27809634)
chr2 (321-360)||(27821883-27821922)
chr2 (321-360)||(28888173-28888212)
chr2 (321-360)||(31887802-31887841)
chr2 (321-360)||(32055697-32055736)
chr2 (321-360)||(34160738-34160777)
chr2 (321-360)||(34867577-34867616)
chr2 (321-360)||(37680202-37680241)
chr2 (321-360)||(37695467-37695506)
chr2 (321-360)||(37946175-37946214)
chr2 (321-360)||(40239403-40239442)
chr2 (323-360)||(11629493-11629530)
chr2 (321-358)||(16167372-16167409)
chr2 (321-357)||(23122885-23122921)
chr2 (321-357)||(34269232-34269268)
chr2 (321-357)||(37931266-37931302)
chr2 (321-356)||(12710914-12710949)
chr2 (321-360)||(19410796-19410835)
chr2 (321-360)||(27428755-27428794)
chr2 (321-360)||(31882181-31882220)
chr2 (321-360)||(34297051-34297090)
chr2 (321-360)||(37383571-37383610)
chr2 (321-360)||(39046131-39046170)
chr2 (321-360)||(39895962-39896001)
chr2 (323-359)||(22922455-22922491)
chr2 (321-360)||(21697484-21697522)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (11-326)||(12107-12421)
scaffold0418 (321-360)||(11934-11973)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (11-326)||(9360693-9361007)
chr8 (11-326)||(28355780-28356097)
chr8 (11-326)||(18796778-18797093)
chr8 (11-326)||(31483700-31484017)
chr8 (11-326)||(31360599-31360914)
chr8 (11-326)||(33248437-33248751)
chr8 (11-326)||(19680520-19680833)
chr8 (11-326)||(29835394-29835708)
chr8 (11-326)||(44567052-44567369)
chr8 (11-326)||(15773645-15773960)
chr8 (11-326)||(21342000-21342315)
chr8 (11-326)||(18715551-18715868)
chr8 (11-326)||(12086553-12086868)
chr8 (11-324)||(19910992-19911307)
chr8 (48-326)||(33264802-33265079)
chr8 (11-326)||(19202205-19202508)
chr8 (11-326)||(22074759-22075075)
chr8 (14-326)||(19655180-19655487)
chr8 (11-326)||(22138978-22139286)
chr8 (11-326)||(27602744-27603052)
chr8 (11-326)||(2131098-2131407)
chr8 (139-326)||(16260294-16260480)
chr8 (11-326)||(19694167-19694477)
chr8 (11-326)||(14569227-14569540)
chr8 (321-367)||(27603180-27603226)
chr8 (321-360)||(9360518-9360557)
chr8 (321-360)||(12087005-12087044)
chr8 (321-360)||(14569053-14569092)
chr8 (321-360)||(15773470-15773509)
chr8 (321-360)||(19655625-19655664)
chr8 (321-360)||(19693991-19694030)
chr8 (321-360)||(19911445-19911484)
chr8 (321-360)||(28356234-28356273)
chr8 (321-360)||(29835219-29835258)
chr8 (321-360)||(31360424-31360463)
chr8 (321-360)||(44566877-44566916)
chr8 (321-358)||(2131545-2131582)
chr8 (321-358)||(18796602-18796639)
chr8 (321-358)||(31484155-31484192)
chr8 (321-358)||(33248262-33248299)
chr8 (321-360)||(16260119-16260158)
chr8 (321-360)||(18715378-18715417)
chr8 (321-360)||(19680344-19680383)
chr8 (321-360)||(21342452-21342491)
chr8 (321-360)||(22138803-22138842)
chr8 (321-360)||(33264627-33264666)
chr8 (321-357)||(19202648-19202684)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (11-326)||(4138999-4139316)
chr7 (11-326)||(24586289-24586603)
chr7 (11-326)||(5164452-5164767)
chr7 (11-326)||(26678858-26679174)
chr7 (11-326)||(26441321-26441637)
chr7 (11-326)||(26663666-26663982)
chr7 (11-326)||(5141088-5141404)
chr7 (11-326)||(31558148-31558463)
chr7 (11-326)||(39206893-39207208)
chr7 (11-326)||(5154152-5154466)
chr7 (11-326)||(26518861-26519174)
chr7 (11-312)||(26595750-26596053)
chr7 (33-326)||(26509471-26509765)
chr7 (11-326)||(16745274-16745590)
chr7 (11-326)||(45737369-45737686)
chr7 (11-326)||(4205458-4205772)
chr7 (11-326)||(26268839-26269158)
chr7 (11-326)||(11418533-11418848)
chr7 (11-326)||(26313603-26313916)
chr7 (11-326)||(31084376-31084691)
chr7 (11-326)||(2160638-2160955)
chr7 (11-326)||(16443757-16444073)
chr7 (11-326)||(45393287-45393602)
chr7 (11-326)||(11446956-11447271)
chr7 (11-326)||(16047383-16047695)
chr7 (14-326)||(2779320-2779626)
chr7 (11-326)||(3451386-3451702)
chr7 (11-326)||(31129973-31130282)
chr7 (11-326)||(10847651-10847968)
chr7 (11-326)||(10910680-10910989)
chr7 (11-326)||(16512194-16512503)
chr7 (321-367)||(2104359-2104405)
chr7 (320-360)||(16444208-16444248)
chr7 (321-360)||(2779145-2779184)
chr7 (321-360)||(4205282-4205321)
chr7 (321-360)||(5141540-5141579)
chr7 (321-360)||(5153977-5154016)
chr7 (321-360)||(5164277-5164316)
chr7 (321-360)||(10911125-10911164)
chr7 (321-360)||(11446781-11446820)
chr7 (321-360)||(16732735-16732774)
chr7 (321-360)||(16745726-16745765)
chr7 (321-360)||(24586740-24586779)
chr7 (321-360)||(26441146-26441185)
chr7 (321-360)||(26518686-26518725)
chr7 (321-360)||(26532075-26532114)
chr7 (321-360)||(31084828-31084867)
chr7 (321-360)||(31129798-31129837)
chr7 (321-360)||(31558598-31558637)
chr7 (321-360)||(45737196-45737235)
chr7 (321-358)||(26269296-26269333)
chr7 (321-358)||(39207346-39207383)
chr7 (321-357)||(26314056-26314092)
chr7 (321-357)||(26664121-26664157)
chr7 (321-357)||(26679313-26679349)
chr7 (321-360)||(4139452-4139491)
chr7 (321-360)||(11418984-11419023)
chr7 (321-360)||(45393111-45393150)
chr7 (321-357)||(2160464-2160500)
chr7 (321-360)||(16512639-16512678)
chr7 (321-360)||(26509902-26509941)
chr7 (321-359)||(16047210-16047247)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (11-326)||(9510-9824)
scaffold0547 (321-360)||(9959-9998)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (11-326)||(3047-3364)
scaffold0159 (11-254)||(17949-18194)
scaffold0159 (321-360)||(3500-3539)
[»] scaffold0792 (2 HSPs)
scaffold0792 (11-326)||(4471-4787)
scaffold0792 (321-360)||(4925-4965)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (11-326)||(18657-18973)
scaffold0254 (321-358)||(18481-18518)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (11-326)||(8797-9111)
scaffold0237 (321-360)||(9247-9286)
[»] scaffold0143 (4 HSPs)
scaffold0143 (11-326)||(9985-10299)
scaffold0143 (11-326)||(33369-33680)
scaffold0143 (321-360)||(33193-33232)
scaffold0143 (321-360)||(9810-9849)
[»] scaffold0322 (4 HSPs)
scaffold0322 (11-326)||(1729-2043)
scaffold0322 (11-326)||(12117-12443)
scaffold0322 (321-360)||(1553-1592)
scaffold0322 (321-360)||(11943-11982)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (11-326)||(14021-14336)
scaffold0038 (321-360)||(13845-13884)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (11-326)||(15640-15962)
scaffold0336 (321-360)||(15465-15504)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-326)||(25186-25509)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (11-326)||(6138-6449)
scaffold0089 (321-360)||(5962-6001)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (11-326)||(24774-25084)
scaffold0240 (321-360)||(25221-25260)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-183)||(1-173)
[»] scaffold0288 (2 HSPs)
scaffold0288 (237-326)||(448-537)
scaffold0288 (321-360)||(273-312)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (253-326)||(26243-26316)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (11-118)||(40497-40606)
scaffold0099 (232-324)||(40729-40827)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 86)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284492
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27284376  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284377 ctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27284475  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  27284476 acaaagcttggaaaatg 27284492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27623839
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatata 27623721  T
Q  210 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27623722 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27623821  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27623822 cacaaagcttggaaaatg 27623839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518324
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13518208  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13518209 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 13518308  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  13518309 caaagcttggaaaatg 13518324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763831
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4763947  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4763946 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4763848  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4763847 acaaagcttggaaaatg 4763831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356241
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27356125  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27356126 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27356224  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  27356225 acaaagcttggaaaatg 27356241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755888
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa--atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16756005  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756004 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16755906  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16755905 cacaaagcttggaaaatg 16755888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166562
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 28166679  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166678 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28166580  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28166579 cacaaagcttggaaaatg 28166562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8899829
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 8899713  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8899714 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 8899812  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  8899813 acaaagcttggaaaatg 8899829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063550
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 27063665  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063664 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 27063567  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  27063566 acaaagcttggaaaatg 27063550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458636
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34458521  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34458522 cttagaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 34458620  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  34458621 caaagcttggaaaatg 34458636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27491201
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 27491317  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27491316 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 27491218  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  27491217 acaaagcttggaaaatg 27491201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370561
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatata 33370445  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33370446 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33370544  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  33370545 acaaagcttggaaaatg 33370561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110540
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 26110425  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110426 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26110524  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  26110525 caaagcttggaaaatg 26110540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16680207
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16680324  T
Q  210 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16680323 actttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggatt 16680225  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
      ||||||||||||||||    
T  16680224 ttcaaagcttggaaaatg 16680207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4539888
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4539772  T
Q  211 ctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4539773 ctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4539871  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4539872 acaaagcttggaaaatg 4539888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507484
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 29507602  T
Q  210 gctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507601 gctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 29507503  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  29507502 ttacaaagcttggaaaatg 29507484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26772758
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26772643  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26772644 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26772741  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26772742 acaaagcttggaaaatg 26772758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213523
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 28213639  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28213638 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28213540  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  28213539 acaaagcttggaaaatg 28213523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555626
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29555742  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29555741 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggattt 29555643  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  29555642 acaaagcttggaaaatg 29555626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929013
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 22928994  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22928995 ttacaaagcttggaaaatg 22929013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtataca 4779066  T
Q  210 gcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4779065 gcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 4778967  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4778966 cacaaagcttggaaaatg 4778949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200255
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27200371  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200370 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27200273  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27200272 cacaaagcttggaaaatg 27200255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27248978
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27248862  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248863 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27248960  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27248961 cacaaagcttggaaaatg 27248978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791884
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26792000  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  26791999 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggattt 26791901  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26791900 acaaagcttggaaaatg 26791884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29579083
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatata 29579198  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29579197 gctttgaaaatagaag-aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 29579100  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  29579099 acaaagcttggaaaatg 29579083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552130
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 30552014  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30552015 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 30552113  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  30552114 acaaagcttggaaaatg 30552130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293075
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13292960  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292961 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 13293059  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  13293060 caaagcttggaaaatg 13293075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938154
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatata 16938039  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16938040 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattc 16938137  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  16938138 acaaagcttggaaaatg 16938154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26666672  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26666673 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26666770  T
Q  310 acaa 313  Q
    ||||    
T  26666771 acaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139524
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 14139412  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139413 tgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 14139511  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  14139512 agcttggaaaatg 14139524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531356
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatac 4531473  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4531472 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggatt 4531374  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4531373 cacaaagcttggaaaatg 4531356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013801
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 27013913  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27013912 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 27013814  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  27013813 agcttggaaaatg 27013801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926836
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctc---------------atttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 26926951  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26926950 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 26926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208972
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27209092  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209091 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27208993  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27208992 atttacaaagcttggaaaatg 27208972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240256
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27240136  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240137 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27240235  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27240236 atttacaaagcttggaaaatg 27240256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27031091
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 207  Q
    |||||||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  27031304 caggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtaca 27031209  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031208 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27031110  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  27031109 ttacaaagcttggaaaatg 27031091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869778
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24869896  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869895 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24869797  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24869796 ttacaaagcttggaaaatg 24869778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27025213
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtat 206  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||     
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27025332  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025331 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27025233  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  27025232 tttacaaagcttggaaaatg 27025213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24299885
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| ||    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacat 24299768  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    | |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299769 aactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24299867  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  24299868 tacaaagcttggaaaatg 24299885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406658
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15406540  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406541 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15406639  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15406640 ttacaaagcttggaaaatg 15406658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418445
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15418327  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418328 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15418426  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15418427 ttacaaagcttggaaaatg 15418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174617
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  123 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 213  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  214 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 311  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  312 aaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatg 20174617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 326
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161374
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  123 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 213  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  214 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 311  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  312 aaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatg 22161374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27624013 - 27623967
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27624013 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 27623967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4531181 - 4531220
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531181 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4531220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4540064 - 4540025
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4540064 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4540025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4763657 - 4763696
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763657 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4763696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4778773 - 4778812
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778773 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4778812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8900004 - 8899965
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8900004 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 8899965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14139699 - 14139660
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139699 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 14139660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 16755713 - 16755752
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755713 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16755752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22929187 - 22929148
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929187 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22929148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23851632 - 23851593
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851632 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 23851593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24300060 - 24300021
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24300060 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24300021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 24869603 - 24869642
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869603 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24869642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26110715 - 26110676
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110715 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26110676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 26791709 - 26791748
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791709 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26791748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 26926663 - 26926702
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926663 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26926702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27013626 - 27013665
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013626 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27013665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27025038 - 27025077
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025038 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27025077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27030915 - 27030954
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27030915 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27030954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27184821 - 27184860
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184821 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27184860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27200079 - 27200118
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200079 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27200118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27249155 - 27249116
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249155 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27249116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27264419 - 27264380
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264419 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27264380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27284666 - 27284627
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284666 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27284627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27356416 - 27356377
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356416 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27356377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28166387 - 28166426
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166387 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28166426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28213347 - 28213386
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213347 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28213386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 29578908 - 29578947
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578908 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 29578947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30552321 - 30552282
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 30552282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33370736 - 33370697
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370736 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 33370697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15406834 - 15406796
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406834 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 15406796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15418621 - 15418583
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418621 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 15418583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4718440 - 4718401
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718440 aaaataagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4718401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13293250 - 13293211
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293250 aaaaggagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 13293211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13518498 - 13518459
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13518498 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggc 13518459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16938330 - 16938291
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16938330 aaaatgagattgaaataaaaggcaagtaactatatctggc 16938291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26772933 - 26772894
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26772933 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 26772894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27491026 - 27491065
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27491026 aaaatgagattgaaacagaaggcaagtaactatatctggc 27491065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 29507309 - 29507348
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29507309 aaaatgagattgaaacaaaaggcaaataactatatctggc 29507348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 29555451 - 29555490
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29555451 aaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggc 29555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Original strand, 20174442 - 20174488
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  20174442 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatttctagcaagtcac 20174488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22161549 - 22161503
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22161549 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatttctagcaagtcac 22161503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 354
Target Start/End: Original strand, 16680032 - 16680065
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactata 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680032 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactata 16680065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27063374 - 27063414
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27063374 aaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatatctggc 27063414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 98)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369615
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 18369499  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18369500 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 18369599  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  18369600 caaagcttggaaaatg 18369615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174543
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 30174660  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30174659 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 30174560  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  30174559 acaaagcttggaaaatg 30174543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555432
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 11555543  T
Q  215 gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555542 gaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaa 11555444  T
Q  315 gcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||    
T  11555443 gcttggaaaatg 11555432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33881204
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33881320  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33881319 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 33881220  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  33881219 caaagcttggaaaatg 33881204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795616
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3795733  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3795732 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 3795633  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  3795632 acaaagcttggaaaatg 3795616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18494850
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatag 18494735  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18494736 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattca 18494834  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  18494835 caaagcttggaaaatg 18494850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352727
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 37352611  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37352612 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 37352710  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  37352711 acaaagcttggaaaatg 37352727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467636
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 40467520  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40467521 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 40467619  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  40467620 ataaagcttggaaaatg 40467636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9544792
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 9544677  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9544678 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9544775  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  9544776 acaaagcttggaaaatg 9544792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13180871
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13180755  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13180756 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13180855  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  13180856 caaagcttggaaaatg 13180871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655320
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 28655339  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28655338 tcacaaagcttggaaaatg 28655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 320
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659549
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 8659439  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8659440 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 8659538  T
Q  310 acaaagcttgg 320  Q
    |||||||||||    
T  8659539 acaaagcttgg 8659549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746411
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaaca------tactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 104  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  105 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 37746289  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746290 atatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 37746389  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37746390 gatttacaaagcttggaaaatg 37746411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37761060
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  111 caggtttgcttttc-aaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37761177  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37761176 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatt 37761078  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  37761077 tacaaagcttggaaaatg 37761060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880382
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 6880498  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880497 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 6880399  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  6880398 acaaagcttggaaaatg 6880382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13436762
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgta 13436641  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436642 tatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 13436740  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13436741 gattcacaaagcttggaaaatg 13436762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30158112
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 30158228  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30158227 gctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 30158129  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  30158128 acaaagcttggaaaatg 30158112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084336
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 43084452  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43084451 actttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 43084353  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  43084352 acaaagcttggaaaatg 43084336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329715
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata-- 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||      
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11329833  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329832 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11329734  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11329733 tcacaaagcttggaaaatg 11329715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13318910
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13318795  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13318796 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13318894  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  13318895 caaagcttggaaaatg 13318910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323556
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 9323670  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323669 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 9323572  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  9323571 caaagcttggaaaatg 9323556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138255
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 12138369  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138368 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12138271  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  12138270 caaagcttggaaaatg 12138255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23632047
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 23632066  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23632065 tcacgaagcttggaaaatg 23632047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680782
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 41680900  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  41680899 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggatt 41680800  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41680799 cacaaagcttggaaaatg 41680782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894494
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22894511  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  22894510 acaaagcttggaaaatg 22894494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298611
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 33298731  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33298730 tagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 33298631  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33298630 ttcacaaagcttggaaaatg 33298611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24730048
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatat 24730164  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730163 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24730066  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24730065 cacaaagcttggaaaatg 24730048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622597
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34622713  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34622712 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 34622614  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||| |||||||||||    
T  34622613 acaaaacttggaaaatg 34622597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820491
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 31820377  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820378 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 31820475  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  31820476 caaagcttggaaaatg 31820491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28953863
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 28953746  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28953747 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28953845  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  28953846 tacaaagcttggaaaatg 28953863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035504
Alignment:
Q  34 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  134 aaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaata 232  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30035695 aaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaata 30035597  T
Q  233 gagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30035596 gaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatg 30035504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665569
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 37665452  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665453 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 37665551  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  37665552 tacaaagcttggaaaatg 37665569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2517143
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 2517260  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2517259 tagctttgaaagtagaag-aaaataga-atctcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggat 2517162  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2517161 tcacaaagcttggaaaatg 2517143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643878
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 5643993  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643992 gctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5643895  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5643894 acaaaacttggaaaatg 5643878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590358
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatata 32590243  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  32590244 gctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattc 32590341  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  32590342 acaaagcttggaaaatg 32590358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15752935
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatca----agaaagaaaatgttttgtatatag 15752821  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15752822 ctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 15752919  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  15752920 caaagcttggaaaatg 15752935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522460
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 33522577  T
Q  210 gctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522576 gctttgaaagtaaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 33522478  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33522477 cacaaagcttggaaaatg 33522460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122499
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 18122382  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122383 gctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18122481  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  18122482 tacaaagcttggaaaatg 18122499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486475
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26486579  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486578 ctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26486491  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  26486490 caaagcttggaaaatg 26486475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437542
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 31437654  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31437653 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 31437555  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  31437554 agcttggaaaatg 31437542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206356
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 209  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25206373  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  25206372 acaaagcttggaaaatg 25206356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270512
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 209  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25270529  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  25270528 acaaagcttggaaaatg 25270512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15652841
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 15652726  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15652727 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 15652825  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  15652826 caaagcttggaaaatg 15652841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993199
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22993084  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22993085 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 22993183  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  22993184 caaagcttggaaaatg 22993199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gta 205  Q
    ||||||||||||          |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  23898161 caggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgta 23898072  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23898071 catagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatga 23897973  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  23897972 atttacaaagcttggaaaatg 23897952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783565
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    | ||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||     
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 33783684  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783683 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 33783585  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  33783584 tttacaaagcttggaaaatg 33783565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608324
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24608442  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608441 taactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24608343  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24608342 ttacaaagcttggaaaatg 24608324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975927
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24976045  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976044 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24975946  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24975945 ttacaaagcttggaaaatg 24975927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940715
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||        |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 30940833  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940832 taactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 30940734  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | || ||||||||||||||    
T  30940733 ttacgaagcttggaaaatg 30940715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 3795441 - 3795480
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795441 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 3795480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5643705 - 5643744
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643705 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5643744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 6880206 - 6880245
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880206 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 6880245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9544966 - 9544927
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544966 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 9544927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 11555257 - 11555296
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555257 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11555296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13319085 - 13319046
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319085 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 13319046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13436939 - 13436900
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436939 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 13436900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15653016 - 15652977
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653016 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 15652977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18122674 - 18122635
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122674 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18122635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18369790 - 18369751
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369790 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18369751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18495025 - 18494986
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495025 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18494986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 22894320 - 22894359
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894320 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22894359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22993374 - 22993335
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993374 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22993335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 23631872 - 23631911
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631872 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 23631911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 23897778 - 23897817
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897778 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 23897817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 24608149 - 24608188
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608149 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24608188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 24729873 - 24729912
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729873 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24729912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28655145 - 28655184
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655145 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28655184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 30940539 - 30940578
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940539 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 30940578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 31437367 - 31437406
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437367 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31437406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31820666 - 31820627
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820666 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31820627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32590533 - 32590494
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590533 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 32590494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33298436 - 33298475
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298436 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 33298475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33522282 - 33522321
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522282 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 33522321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 34622421 - 34622460
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622421 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 34622460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37352902 - 37352863
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352902 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37352863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37665744 - 37665705
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665744 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37665705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37746585 - 37746546
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746585 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37746546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 37760885 - 37760924
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760885 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37760924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40467811 - 40467772
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467811 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 40467772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 41680607 - 41680646
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680607 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 41680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 11329540 - 11329577
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329540 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 11329577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 43084161 - 43084198
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084161 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 43084198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 9323380 - 9323416
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323380 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 9323416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 26486299 - 26486335
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486299 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 26486335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 30157936 - 30157972
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30157936 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 30157972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174404
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174368 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 30174404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 2516968 - 2517007
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2516968 aaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggc 2517007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13181047 - 13181008
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13181047 aaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggc 13181008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15753109 - 15753070
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15753109 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggc 15753070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28954038 - 28954003
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28954038 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 28954003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 30035330 - 30035369
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30035330 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggc 30035369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33783390 - 33783429
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33783390 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 33783429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33881030 - 33881069
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33881030 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggc 33881069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 12138079 - 12138115
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12138079 aaaatgagattgaaacaaaagacaagtaactatatct 12138115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 24975752 - 24975791
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24975752 aaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggc 24975791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 25206182 - 25206220
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25206182 aaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggc 25206220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 25270338 - 25270376
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25270338 aaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggc 25270376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8659730 - 8659690
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaagg-caagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8659730 aaaatgagattgaaacaagagggcaagtaactatatctggc 8659690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3647219
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3647335  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3647334 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 3647235  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  3647234 caaagcttggaaaatg 3647219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968738
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 10968855  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10968854 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10968755  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  10968754 acaaagcttggaaaatg 10968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644293
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  133 caaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaa 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  231 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatg 51644293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10951164
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatag 10951281  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10951280 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattc 10951181  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  10951180 acaaagcttggaaaatg 10951164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787493
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 41787376  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41787377 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 41787474  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41787475 tcacaaagcttggaaaatg 41787493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28591156
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 28591271  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28591270 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 28591172  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  28591171 caaagcttggaaaatg 28591156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155799
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 28155917  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155916 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 28155819  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  28155818 tttacaaagcttggaaaatg 28155799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334600
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg---ttttgtat 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  20334383 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 20334580  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  20334581 tttacaaggcttggaaaatg 20334600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202218
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 202  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  203 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 300  Q
      ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16202192  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  16202193 cacggatttacaaagcttggaaaatg 16202218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466850
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  201 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 20466876  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20466875 cacggatttacaaagcttggaaaatg 20466850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21891931
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||          
T  21891729 caggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt------ 21891818  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
         ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891819 -----tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 21891912  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21891913 tcacaaagcttggaaaatg 21891931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 3647044 - 3647083
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647044 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 3647083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 10950989 - 10951028
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10950989 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 10951028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 10968563 - 10968602
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968563 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 10968602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20334774 - 20334735
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334774 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 20334735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21892106 - 21892067
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892106 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 21892067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 51644118 - 51644157
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644118 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 51644157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41787669 - 41787632
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787669 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 41787632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Original strand, 20466677 - 20466722
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20466677 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaac-atatttggcaaatcac 20466722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28590981 - 28591020
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28590981 aaaatgagattgaaataaaaggcaagtagctatatctggc 28591020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5717102
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5717219  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5717218 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5717119  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5717118 acaaagcttggaaaatg 5717102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5728012
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5728129  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5728128 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5728029  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5728028 acaaagcttggaaaatg 5728012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764356
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5764239  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5764240 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5764339  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5764340 acaaagcttggaaaatg 5764356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029487
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 47029604  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  47029603 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 47029504  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  47029503 acaaagcttggaaaatg 47029487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958683
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31958565  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958566 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31958665  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31958666 cacaaagcttggaaaatg 31958683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603541
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5603423  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603424 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5603523  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5603524 cacaaagcttggaaaatg 5603541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24334207
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 24334325  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334324 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24334225  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24334224 cacaaagcttggaaaatg 24334207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4790859
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 4790743  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4790744 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggattt 4790842  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4790843 acaaagcttggaaaatg 4790859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296663
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 32296780  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  32296779 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattc 32296680  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  32296679 acaaagcttggaaaatg 32296663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10649105
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 10649221  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10649220 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10649122  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  10649121 acaaagcttggaaaatg 10649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659194
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29659078  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29659079 actttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 29659177  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  29659178 acaaagcttggaaaatg 29659194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4340902
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 4340786  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4340787 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4340885  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4340886 acaaagcttggaaaatg 4340902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110181
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 28110061  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28110062 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgga 28110161  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28110162 ttcataaagcttggaaaatg 28110181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4423068  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4423067 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4422969  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4422968 acaaagcttggaaaatg 4422952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5473022
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 5473138  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5473137 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5473039  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5473038 acaaagcttggaaaatg 5473022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51788056
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 51788172  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51788171 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 51788073  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  51788072 acaaagcttggaaaatg 51788056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971090
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 17970976  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970977 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 17971074  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  17971075 caaagcttggaaaatg 17971090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10402183
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 10402298  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10402297 gctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggattt 10402200  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  10402199 acaaagcttggaaaatg 10402183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217666
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 8217784  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8217783 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 8217685  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
     ||||||||||||||||||    
T  8217684 ccacaaagcttggaaaatg 8217666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590587
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagct 5590474  T
Q  213 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 312  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5590475 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 5590573  T
Q  313 aagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||    
T  5590574 aagcttggaaaatg 5590587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248772
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgta 18248888  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18248887 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-ttccaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18248789  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||| ||||||||    
T  18248788 acaaagctcggaaaatg 18248772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22381806
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22381690  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381691 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 22381789  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  22381790 acaaagcttggaaaatg 22381806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422216
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 207  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16422432 caggtttgc-tttcaaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16422235  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16422234 ttacaaagcttggaaaatg 16422216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20072067
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 20072185  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20072184 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacgga 20072087  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  20072086 tttacaaagcttggaaaatg 20072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471961
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 48472081  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48472080 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatgg 48471982  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  48471981 atttacaaagcttggaaaatg 48471961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29142983
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 29142864  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29142865 tagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 29142964  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29142965 tcacaaagcttggaaaatg 29142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286580
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18286464  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286465 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18286562  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  18286563 tacaaagcttggaaaatg 18286580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18301881
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18301765  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301766 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18301863  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  18301864 tacaaagcttggaaaatg 18301881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629819
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 4629935  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4629934 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatta 4629836  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4629835 acaaagcttggaaaatg 4629819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680735
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 21680851  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21680850 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 21680752  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  21680751 acaaagcttggaaaatg 21680735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28345205
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 28345320  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345319 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 28345222  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  28345221 acaaagcttggaaaatg 28345205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027325
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 28027439  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28027438 ctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattca 28027341  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  28027340 caaagcttggaaaatg 28027325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104588
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata--t 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |    
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatattt 11104471  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11104472 agctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggatt 11104570  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11104571 cacaaagcttggaaaatg 11104588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865072
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22864958  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22864959 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22865055  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  22865056 acaaagcttggaaaatg 22865072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880131
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22880017  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22880018 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22880114  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  22880115 acaaagcttggaaaatg 22880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019747
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 5019862  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5019861 gctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattt 5019764  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5019763 acaaagcttggaaaatg 5019747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6536969
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6536853  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6536854 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6536952  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  6536953 acaaagcttggaaaatg 6536969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979177
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 17979060  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17979061 agctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 17979159  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17979160 cacaaagcttggaaaatg 17979177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079256
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttg----t 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 7079278  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  7079277 gatttacaaagcttggaaaatg 7079256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18231227
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18231343  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18231342 gctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18231244  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||| |||||||||||    
T  18231243 gcaaatcttggaaaatg 18231227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571072
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 20570956  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20570957 gctttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20571055  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  20571056 acaaagcttggaaaatg 20571072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057295
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18057314  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  18057313 ttacaaagcttggaaaatg 18057295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618719
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa---gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg---ttttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  16618500 caggtttgc-tttcaaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 16618697  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16618698 gatttacaaagcttggaaaatg 16618719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030464
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31030349  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31030350 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31030448  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  31030449 caaagcttggaaaatg 31030464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207935
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 6208053  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208052 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6207953  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  6207952 tacaaagcttggaaaatg 6207935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336663
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 18336775  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18336774 tgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 18336676  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  18336675 agcttggaaaatg 18336663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700520
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--------- 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             
T  19700747 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  199 --ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 296  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 19700550  T
Q  297 actccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19700549 actccacggatttacaaagcttggaaaatg 19700520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727667
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4727784  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727783 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4727685  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  4727684 tacaaagcttggaaaatg 4727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32445188
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataa 32445303  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32445302 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 32445204  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  32445203 caaagcttggaaaatg 32445188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735321
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| |    
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtaca 15735204  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735205 taactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15735302  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15735303 tcacaaagcttggaaaatg 15735321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886799
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 35886917  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886916 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 35886818  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  35886817 ttacaaagcttggaaaatg 35886799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689686
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 4689803  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689802 taacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4689705  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | || ||||||||||||||    
T  4689704 ttacgaagcttggaaaatg 4689686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283695
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg- 198  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  199 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 298  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 8283667  T
Q  299 tccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283668 tccacggattcacaaagcttggaaaatg 8283695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5658168
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
     |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 5658288  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658287 taacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacgg 5658189  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5658188 atttacaaagcttggaaaatg 5658168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||| |    
T  15886751 caggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtaca 15886843  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 260  Q
    || ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886844 taactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16618893 - 16618847
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618893 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 16618847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4422778 - 4422817
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422778 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4422817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4629644 - 4629683
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629644 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4629683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5590762 - 5590723
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590762 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5590723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5716927 - 5716966
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716927 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5716966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5727837 - 5727876
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727837 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5727876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5764531 - 5764492
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764531 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5764492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 6207759 - 6207798
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207759 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 6207798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 7079083 - 7079122
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079083 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 7079122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 8217491 - 8217530
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217491 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 8217530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8283870 - 8283831
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283870 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 8283831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11104763 - 11104724
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104763 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11104724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17971265 - 17971226
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971265 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 17971226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17979354 - 17979315
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979354 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 17979315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 18231052 - 18231091
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231052 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18231091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 18248597 - 18248636
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248597 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18248636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18286755 - 18286716
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286755 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18286716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18302056 - 18302017
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302056 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18302017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 20071894 - 20071933
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071894 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 20071933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20571247 - 20571208
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571247 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 20571208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22381980 - 22381941
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381980 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22381941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22865247 - 22865208
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865247 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22865208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22880306 - 22880267
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880306 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 22880267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28027150 - 28027189
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027150 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28027189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28110357 - 28110318
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110357 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28110318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28345030 - 28345069
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345030 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28345069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29143158 - 29143119
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143158 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 29143119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29659369 - 29659330
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659369 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 29659330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31030639 - 31030600
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030639 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31030600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 32296488 - 32296527
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296488 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 32296527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 32445013 - 32445052
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445013 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 32445052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 35886623 - 35886662
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886623 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 35886662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4791035 - 4790998
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4791035 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 4790998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 5019572 - 5019609
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019572 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 5019609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 8002419 - 8002456
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002419 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 8002456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 10648930 - 10648967
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648930 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 10648967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 21680560 - 21680597
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680560 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 21680597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 360
Target Start/End: Original strand, 48471788 - 48471825
Alignment:
Q  323 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471788 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 48471825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 51787881 - 51787918
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787881 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 51787918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 5657994 - 5658030
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657994 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 5658030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15735496 - 15735460
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735496 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 15735460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 47029312 - 47029348
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029312 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 47029348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4341078 - 4341039
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4341078 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 4341039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4689510 - 4689549
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4689510 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 4689549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4727492 - 4727531
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727492 aaaatgggattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4727531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 10402008 - 10402047
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10402008 aaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggc 10402047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 18336487 - 18336526
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18336487 aaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggc 18336526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 356
Target Start/End: Original strand, 19700346 - 19700381
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700346 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 19700381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 24334032 - 24334071
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334032 aaaatgagaatgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24334071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31958858 - 31958819
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31958858 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtgactatatctggc 31958819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6537144 - 6537107
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6537144 aaaatgagatcgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 6537107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5472847 - 5472886
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5472847 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtagctatacctggc 5472886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5603716 - 5603677
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5603716 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtgactatatctggc 5603677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15887108 - 15887069
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15887108 aaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggc 15887069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 356
Target Start/End: Original strand, 18057119 - 18057154
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18057119 aaaatgagattaaaacaaaaggcaagtaactatatc 18057154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Original strand, 16422043 - 16422080
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16422043 aaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctgg 16422080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332606
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 20332489  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20332490 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20332589  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  20332590 acaaagcttggaaaatg 20332606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40099820
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 40099703  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40099704 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40099803  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  40099804 acaaagcttggaaaatg 40099820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856719
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39856833  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39856832 ctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 39856735  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  39856734 caaagcttggaaaatg 39856719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586544
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 24586428  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24586429 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 24586528  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  24586529 caaagcttggaaaatg 24586544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157497
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 27157379  T
Q  210 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27157380 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27157479  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27157480 cacaaagcttggaaaatg 27157497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104625
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 14104740  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14104739 ctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 14104641  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  14104640 caaagcttggaaaatg 14104625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759846
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 30759960  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759959 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 30759862  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  30759861 caaagcttggaaaatg 30759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33667984
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 33667870  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667871 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33667968  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  33667969 caaagcttggaaaatg 33667984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18794800
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 18794684  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18794685 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18794783  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  18794784 acaaagcttggaaaatg 18794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839473
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 54839588  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54839587 gctttgaaagtagaag-aaaatagag-tttcaagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 54839490  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  54839489 acaaagcttggaaaatg 54839473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700623
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5700738  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5700737 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 5700640  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5700639 acaaagcttggaaaatg 5700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753676
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14753560  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753561 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 14753658  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  14753659 tacaaagcttggaaaatg 14753676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011960
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatata 5012076  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012075 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5011977  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5011976 acaaagcttggaaaatg 5011960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183145
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34183029  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34183030 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 34183128  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  34183129 acaaagcttggaaaatg 34183145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975786
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagct 21975899  T
Q  213 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 312  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21975898 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcaca 21975800  T
Q  313 aagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||    
T  21975799 aagcttggaaaatg 21975786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338701
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36338586  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338587 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36338685  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  36338686 caaagcttggaaaatg 36338701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120694
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  111 caggtttgcttttc-aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 31120577  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120578 agctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 31120676  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31120677 cacaaagcttgaaaaatg 31120694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118745
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 24118857  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24118856 tgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 24118758  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  24118757 agcttggaaaatg 24118745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36324377  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324378 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36324476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906334
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg----ttttg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  1906554 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 303  Q
    || || |||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 1906357  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||  |||||||||||||||||    
T  1906356 agatatacaaagcttggaaaatg 1906334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233898
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacg 15233920  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15233919 gatttacaaagcttggaaaatg 15233898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380421
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtatat 208  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  15380206 caggcttgc-tttcaaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacat 15380304  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380305 agctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15380403  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  15380404 tacaaagcttggaaaatg 15380421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575944
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 6576059  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6576058 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 6575960  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  6575959 caaagcttggaaaatg 6575944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15276815
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    || |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15276794  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  15276795 atttacaaagcttggaaaatg 15276815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673942
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgg 1673963  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  1673962 atttacaaagcttggaaaatg 1673942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17019135
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 17019253  T
Q  209 agcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019252 agcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 17019154  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17019153 ttacaaagcttggaaaatg 17019135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14671099
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtaca 14671217  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14671216 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggat 14671118  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14671117 ttacaaagcttggaaaatg 14671099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 363
Target Start/End: Original strand, 1906160 - 1906202
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906160 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaa 1906202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5011784 - 5011823
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011784 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5011823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5700447 - 5700486
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700447 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5700486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 6575769 - 6575808
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575769 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 6575808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 14670923 - 14670962
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670923 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 14670962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14753851 - 14753812
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753851 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 14753812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 15233724 - 15233763
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233724 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 15233763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 17018959 - 17018998
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17018959 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 17018998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18794975 - 18794936
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794975 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18794936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20332781 - 20332742
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332781 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 20332742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 21975608 - 21975647
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975608 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 21975647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24586720 - 24586681
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586720 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24586681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 30759671 - 30759710
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759671 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 30759710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31120872 - 31120833
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120872 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31120833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34183320 - 34183281
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183320 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 34183281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36338876 - 36338837
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338876 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 36338837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 54839299 - 54839338
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839299 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 54839338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40099995 - 40099959
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099995 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 40099959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 14104451 - 14104490
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14104451 aaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggc 14104490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18311537 - 18311498
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18311537 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 18311498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33668159 - 33668120
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33668159 aaaatgagattgaaacaaaaggcaaggaactatatctggc 33668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 39856544 - 39856583
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39856544 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactgtatctggc 39856583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27157674 - 27157634
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27157674 aaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatatctggc 27157634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 354
Target Start/End: Original strand, 24118569 - 24118602
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactata 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24118569 aaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactata 24118602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946039
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37945922  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37945923 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 37946022  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  37946023 acaaagcttggaaaatg 37946039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661608
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 12661723  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661722 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12661624  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  12661623 caaagcttggaaaatg 12661608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922318
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22922200  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922201 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22922300  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22922301 cacaaagcttggaaaatg 22922318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809770
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27809888  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27809887 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27809788  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27809787 cacaaagcttggaaaatg 27809770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 254510 - 254825
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 254708  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  254709 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 254808  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  254809 acaaagcttggaaaatg 254825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383747
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37383862  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37383861 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 37383763  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  37383762 caaagcttggaaaatg 37383747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39896138
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39896253  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39896252 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 39896154  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||| ||||||||    
T  39896153 caaagctcggaaaatg 39896138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410659
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 19410541  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410542 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19410641  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19410642 cacaaagcttggaaaatg 19410659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592879
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 12592999  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12592998 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 12592899  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12592898 ttcacaaagcttggaaaatg 12592879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167547
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16167663  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16167662 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 16167564  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  16167563 acaaagcttggaaaatg 16167547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122594
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 27122708  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27122707 ctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27122610  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  27122609 caaagcttggaaaatg 27122594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930719
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 13930601  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  13930602 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 13930701  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13930702 cacaaagcttggaaaatg 13930719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788563
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3788678  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  3788677 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattta 3788579  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||    
T  3788578 taaagcttggaaaatg 3788563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867752
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 34867867  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34867866 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattc 34867769  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  34867768 acaaagcttggaaaatg 34867752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344160
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 9344044  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9344045 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9344143  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  9344144 acaaagcttggaaaatg 9344160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39045995
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 39045879  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39045880 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 39045978  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  39045979 acaaagcttggaaaatg 39045995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931441
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37931564  T
Q  210 gctttgaaagtagaag------aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 303  Q
    ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37931563 gctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 37931464  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37931463 ggattcacaaagcttggaaaatg 37931441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868958
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31868843  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31868844 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31868941  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  31868942 acaatgcttgaaaaatg 31868958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160913
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 34161031  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161030 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34160932  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34160931 ttacaaagcttggaaaatg 34160913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239578
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 40239694  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40239693 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40239595  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  40239594 acaaagcttggaaaatg 40239578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680065
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37679948  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37679949 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37680046  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37680047 tcacaaagcttggaaaatg 37680065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695330
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37695213  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37695214 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37695311  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37695312 tcacaaagcttggaaaatg 37695330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782301
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 27782417  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27782416 gctttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27782318  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  27782317 acaaagcttggaaaatg 27782301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671345
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 21671325  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21671326 ttcacaaagcttggaaaatg 21671345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882356
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31882471  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31882470 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31882373  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  31882372 acaaagcttggaaaatg 31882356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055871
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32055986  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  32055985 gctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattt 32055888  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  32055887 acaaagcttggaaaatg 32055871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12710774
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 12710658  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12710659 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 12710756  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12710757 cacaaagcttggaaaatg 12710774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823510
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16823394  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16823395 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16823493  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  16823494 acaaagcttggaaaatg 16823510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897970
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16898086  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16898085 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16897987  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  16897986 acaaagcttggaaaatg 16897970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629357
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 11629241  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629242 agctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11629339  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11629340 cacaaagcttggaaaatg 11629357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697349
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgta 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21697131 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     |||||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21697328  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21697329 atttacaaagcttggaaaatg 21697349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34297225
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34297340  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297339 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattca 34297241  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  34297240 caaagcttggaaaatg 34297225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396392
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 200  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  201 tt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 298  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 27396420  T
Q  299 tccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27396419 tccacggatttacaaagcttggaaaatg 27396392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450600
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 202  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  203 ---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 299  Q
       ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgatt 19450573  T
Q  300 ccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19450574 ccacggatttacaaagcttggaaaatg 19450600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269094
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 34268976  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268977 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34269075  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  34269076 ttacaaagcttggagaatg 34269094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888348
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 28888466  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28888465 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 28888367  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  28888366 ttacaaagcttggaaaatg 28888348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122745
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 23122628  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    | ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23122629 aactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 23122727  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
      ||||||||||||||||    
T  23122728 tgcaaagcttggaaaatg 23122745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428619
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 211  Q
    ||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  27428414 tttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataac 27428505  T
Q  212 tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 311  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27428506 tttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 27428604  T
Q  312 aaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||    
T  27428605 aaagcttggaaaatg 27428619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843982
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |     
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 20844102  T
Q  207 atagc-tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
    ||| | |||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20844101 ataacttttgaaggtaaaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacgg 20844003  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20844002 atttacaaagcttggaaaatg 20843982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23116993
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaacgttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 255000 - 254961
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  255000 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 254961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 3788388 - 3788427
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788388 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 3788427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9344335 - 9344296
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344335 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 9344296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 12592704 - 12592743
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592704 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 12592743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 12661433 - 12661472
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661433 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 12661472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13930894 - 13930855
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930894 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 13930855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16823688 - 16823649
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823688 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16823649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 16897792 - 16897831
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897792 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16897831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 20843807 - 20843846
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843807 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 20843846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21671521 - 21671482
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671521 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 21671482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27122419 - 27122458
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122419 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27122458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27782126 - 27782165
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782126 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27782165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27809595 - 27809634
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809595 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 27821883 - 27821922
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821883 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27821922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 28888173 - 28888212
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888173 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28888212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31887841 - 31887802
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887841 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31887802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 32055697 - 32055736
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055697 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 32055736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 34160738 - 34160777
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160738 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 34160777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 34867577 - 34867616
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867577 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 34867616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37680241 - 37680202
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680241 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37680202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37695506 - 37695467
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695506 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37695467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37946214 - 37946175
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946214 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 37946175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 40239403 - 40239442
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239403 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 40239442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11629530 - 11629493
Alignment:
Q  323 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629530 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11629493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 16167372 - 16167409
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167372 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 16167409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23122921 - 23122885
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122921 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 23122885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34269268 - 34269232
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269268 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 34269232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 37931266 - 37931302
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931266 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 37931302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12710949 - 12710914
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710949 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatc 12710914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19410835 - 19410796
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410835 aaaatgagaatgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 19410796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27428794 - 27428755
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27428794 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 27428755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 31882181 - 31882220
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31882181 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggc 31882220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 34297051 - 34297090
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34297051 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaattatatctggc 34297090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 37383571 - 37383610
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37383571 aaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggc 37383610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39046170 - 39046131
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39046170 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactgtatctggc 39046131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 39895962 - 39896001
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39895962 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 39896001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22922491 - 22922455
Alignment:
Q  323 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22922491 aatgagattgaaacagaaggcaagtaactatatctgg 22922455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21697522 - 21697484
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21697522 aaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggc 21697484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 12107
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatag 12222  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12221 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 12123  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  12122 caaagcttggaaaatg 12107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 11934 - 11973
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11934 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360693
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9360808  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9360807 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 9360709  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  9360708 caaagcttggaaaatg 9360693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356097
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 28355979  T
Q  211 ctttgaaagtagaag--aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28355980 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28356079  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28356080 cacaaagcttggaaaatg 28356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796778
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 18796894  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18796893 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18796795  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  18796794 ataaagcttggaaaatg 18796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484017
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31483899  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483900 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31483999  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31484000 cacaaagcttggaaaatg 31484017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360599
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 31360715  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31360714 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 31360616  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  31360615 acaaagcttggaaaatg 31360599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248437
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33248552  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248551 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33248453  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  33248452 caaagcttggaaaatg 33248437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680520
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19680634  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680633 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19680536  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  19680535 caaagcttggaaaatg 19680520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835394
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 29835509  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29835508 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 29835410  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  29835409 caaagcttggaaaatg 29835394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44567052
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 44567170  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567169 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 44567072  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44567071 tttacaaagcttggaaaatg 44567052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773645
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 15773761  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||| |||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15773760 gctctgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15773662  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  15773661 acaaagcttggaaaatg 15773645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342315
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 21342199  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21342200 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 21342298  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  21342299 acaaagcttggaaaatg 21342315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715551
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 18715669  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715668 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18715571  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  18715570 tttacaaagcttggaaaatg 18715551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12086868
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 12086752  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12086753 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 12086851  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  12086852 acaaagcttggaaaatg 12086868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911307
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19911290  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaa 324  Q
    | |||||||||||||||    
T  19911291 ttacaaagcttggaaaa 19911307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264802
Alignment:
Q  48 tattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 147  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaat 33264980  T
Q  148 tttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaa 246  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  33264979 tttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaa 33264882  T
Q  247 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33264881 aagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatg 33264802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202508
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19202404  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202405 ctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19202492  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  19202493 caaagcttggaaaatg 19202508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075075
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg---ttttgtata 207  Q
    || | |||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  22074859 catgcttgc-tttcaaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtaca 22074957  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074958 tagctttgaaagtagaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22075056  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22075057 ttacaaagcttggaaaatg 22075075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655487
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 210  Q
    ||||||||| |||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  19655280 gtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataa 19655372  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19655373 ctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattta 19655471  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  19655472 caaagcttggaaaatg 19655487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138978
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    || ||||||||| |||||        |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  22139186 caagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 22139096  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139095 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22138997  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22138996 ttacaaagcttggaaaatg 22138978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603052
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 27602934  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27602935 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27603033  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27603034 tcacaaagcttggaaaatg 27603052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131407
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    |||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  2131197 caggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 2131289  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2131290 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 2131388  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  2131389 ttacaaagcttggaaaatg 2131407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 139 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260294
Alignment:
Q  139 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  239 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatg 16260294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19694167
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 19694285  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694284 taactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19694186  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19694185 ttacaaagcttggaaaatg 19694167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14569227
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat-- 206  Q
    ||||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |      
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttg 14569349  T
Q  207 ---atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 303  Q
       ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569348 aacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 14569250  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14569249 ggattcacaaagcttggaaaatg 14569227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27603226 - 27603180
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603226 aaaacgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 27603180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 9360518 - 9360557
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360518 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 9360557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12087044 - 12087005
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087044 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 12087005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 14569053 - 14569092
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569053 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 14569092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 15773470 - 15773509
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773470 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 15773509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19655664 - 19655625
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655664 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 19655625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 19693991 - 19694030
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19693991 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 19694030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19911484 - 19911445
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911484 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 19911445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28356273 - 28356234
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356273 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 28356234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 29835219 - 29835258
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835219 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 29835258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 31360424 - 31360463
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360424 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31360463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 44566877 - 44566916
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566877 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 44566916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2131582 - 2131545
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131582 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 2131545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 18796602 - 18796639
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796602 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 18796639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31484192 - 31484155
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484192 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 31484155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 33248262 - 33248299
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248262 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 33248299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 16260119 - 16260158
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16260119 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 16260158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 18715378 - 18715417
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715378 aaaatgaggttgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 18715417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 19680344 - 19680383
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19680344 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggc 19680383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21342491 - 21342452
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21342491 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtgactatatctggc 21342452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 22138803 - 22138842
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22138803 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggc 22138842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33264627 - 33264666
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33264627 aaaatgagattgaaacaaaaagcaagtaactatatctggc 33264666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19202684 - 19202648
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19202684 aaaatgagattgaaacacaaggcaagtaactatatct 19202648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139316
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4139198  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139199 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4139298  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4139299 cacaaagcttggaaaatg 4139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586603
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatag 24586488  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586489 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 24586587  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  24586588 caaagcttggaaaatg 24586603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164452
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata- 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5164568  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5164567 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattc 5164469  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  5164468 acaaagcttggaaaatg 5164452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679174
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26679057  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26679058 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26679157  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26679158 acaaagcttggaaaatg 26679174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441321
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 26441438  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26441437 ctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26441338  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26441337 acaaagcttggaaaatg 26441321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26663982
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26663865  T
Q  211 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26663866 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26663965  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26663966 acaaagcttggaaaatg 26663982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141404
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  111 caggtttgc-ttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatat 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 5141287  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5141288 aactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5141386  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5141387 cacaaagcttggaaaatg 5141404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558463
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31558347  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31558348 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31558446  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  31558447 acaaagcttggaaaatg 31558463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207208
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 39207092  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39207093 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39207191  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  39207192 acaaagcttggaaaatg 39207208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5154152
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5154267  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5154266 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 5154168  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  5154167 caaagcttggaaaatg 5154152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518861
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26518975  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518974 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26518877  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  26518876 caaagcttggaaaatg 26518861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatata 26595854  T
Q  210 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26595853 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26595754  T
Q  309 caca 312  Q
    ||||    
T  26595753 caca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 326
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509765
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  133 caaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  232 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatg 26509765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745590
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16745473  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16745474 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16745572  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16745573 cacaaagcttggaaaatg 16745590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737369
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 45737487  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737486 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 45737389  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  45737388 tttacaaagcttggaaaatg 45737369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205458
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4205573  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205572 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 4205475  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4205474 acaaagcttggaaaatg 4205458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269158
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 26269038  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269039 catagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 26269137  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26269138 atttacaaagcttggaaaatg 26269158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11418848
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 11418732  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11418733 gctttgaaagtaaaaagaaagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 11418831  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  11418832 acaaagcttggaaaatg 11418848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26313916
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26313802  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313803 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26313900  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  26313901 caaagcttggaaaatg 26313916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084691
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31084575  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31084576 gctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattc 31084674  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  31084675 acaaagcttggaaaatg 31084691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160638
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 2160657  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  2160656 ttacaaagcttggaaaatg 2160638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444073
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  16443857 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggat 16444054  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16444055 ttacaaagcttggaaaatg 16444073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393287
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtata 45393403  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45393402 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 45393304  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  45393303 acaaagcttggaaaatg 45393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446956
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt--caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 11447072  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11447071 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 11446974  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11446973 cacaaagcttggaaaatg 11446956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047383
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatag 16047498  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16047497 ctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 16047399  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  16047398 caaagcttggaaaatg 16047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779320
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 213  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 2779432  T
Q  214 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 313  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2779431 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 2779333  T
Q  314 agcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||    
T  2779332 agcttggaaaatg 2779320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451386
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 3451503  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3451502 tagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 3451405  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3451404 tcacaaaacttggaaaatg 3451386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129973
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31130088  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31130087 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31129989  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  31129988 caaagcttggaaaatg 31129973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847651
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 204  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 304  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 10847673  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10847672 gatttacaaagcttggaaaatg 10847651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10910989
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 10910871  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910872 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 10910970  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  10910971 ttacaaagcttggaaaatg 10910989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512503
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 16512385  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512386 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16512484  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16512485 ttacaaagcttggaaaatg 16512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2104405 - 2104359
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104405 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac 2104359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16444248 - 16444208
Alignment:
Q  320 gaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444248 gaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16444208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 2779145 - 2779184
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779145 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 2779184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 4205282 - 4205321
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205282 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 4205321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5141579 - 5141540
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141579 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5141540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5153977 - 5154016
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5153977 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5154016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5164277 - 5164316
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164277 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 5164316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10911164 - 10911125
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911164 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 10911125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 11446781 - 11446820
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446781 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11446820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16732774 - 16732735
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732774 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16732735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16745765 - 16745726
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745765 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 16745726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24586779 - 24586740
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586779 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 24586740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 26441146 - 26441185
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441146 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26441185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 26518686 - 26518725
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518686 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26518725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26532114 - 26532075
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532114 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 26532075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31084867 - 31084828
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084867 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31084828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 31129798 - 31129837
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129798 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31129837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31558637 - 31558598
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558637 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 31558598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 45737196 - 45737235
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737196 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 45737235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26269333 - 26269296
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269333 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 26269296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39207383 - 39207346
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207383 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 39207346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26314092 - 26314056
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314092 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 26314056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26664157 - 26664121
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664157 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 26664121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26679349 - 26679313
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679349 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 26679313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4139491 - 4139452
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4139491 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggc 4139452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11419023 - 11418984
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419023 aaaaagagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 11418984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 45393111 - 45393150
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45393111 aaaatgagattgaaacaaagggcaagtaactatatctggc 45393150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 2160464 - 2160500
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatct 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2160464 aaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatct 2160500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16512678 - 16512639
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16512678 aaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggc 16512639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26509941 - 26509902
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26509941 aaaacgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggc 26509902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Original strand, 16047210 - 16047247
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16047210 aaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctgg 16047247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 9510 - 9824
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9709  T
Q  211 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9710 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattta 9808  T
Q  311 caaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  9809 caaagcttggaaaatg 9824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9998 - 9959
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9998 aaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggc 9959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3364
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 3246  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3247 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 3346  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
     |||||||||||||||||    
T  3347 tacaaagcttggaaaatg 3364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 17995  T
Q  211 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 254  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17994 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3539 - 3500
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4787
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4769  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4770 cacaaagcttggaaaatg 4787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4925
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4965 aaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatgtctggc 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18657
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18774  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18773 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 18676  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18675 tcacaaagcttggaaaatg 18657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 18481 - 18518
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18481 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctg 18518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9111
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 8996  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8997 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 9094  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  9095 acaaagcttggaaaatg 9111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9286 - 9247
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9286 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 9247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9985
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 10100  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10099 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattc 10002  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  10001 acaaagcttggaaaatg 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33369
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 33388  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  33387 ttacaaagcttggaaaatg 33369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 33193 - 33232
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33193 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 33232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 9810 - 9849
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9810 aaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggc 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1729
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 1844  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1843 gctttgaaagtagaag-aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 1746  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  1745 acaaagcttggaaaatg 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12117
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg----------- 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  12343 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  199 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 297  Q
    |||| || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 12146  T
Q  298 ctccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12145 ctccatggatttacaaagcttggaaaatg 12117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 1553 - 1592
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1553 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 11943 - 11982
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11943 aaaatgagattgaaacaaaagacaagtaactatatctggc 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 14021
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 209  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 14137  T
Q  210 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14136 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14038  T
Q  310 acaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  14037 acaaagcttggaaaatg 14021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 13845 - 13884
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13845 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15640
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgtttt 15763  T
Q  203 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15762 gtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 15664  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15663 cggattcacaaagcttggaaaatg 15640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 15465 - 15504
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 15504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 25186
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 202  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  203 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 300  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactc 25212  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  25211 cacggatttacaaagcttggaaaatg 25186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 6138
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--at 206  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |     
T  6349 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 6257  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 306  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6256 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 6158  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6157 tttacaaagcttggaaaatg 6138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 5962 - 6001
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 6001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25084
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24873 caggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24966  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24967 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 25065  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    | |||||||||||||||||    
T  25066 ttacaaagcttggaaaatg 25084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25260 - 25221
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25260 aaaatgagatagaaacgaaaggcaagtaactatatctggc 25221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 448
Alignment:
Q  237 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 360
Target Start/End: Original strand, 273 - 312
Alignment:
Q  321 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  273 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26316
Alignment:
Q  253 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatg 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatg 26316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40606
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  109 ctcaggtttg 118  Q
    ||||||||||    
T  40597 ctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Original strand, 40729 - 40827
Alignment:
Q  232 agagttttcaaac--aaaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtgactcc-acggattcac-aaagcttggaaaa 324  Q
    ||||||||||||   ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  40729 agagttttcaaaacaaaaagcacagactcaaaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaa 40827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 166 times since January 2019
Visitors: 3833