View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0613_low_14 (Length: 332)

Name: NF0613_low_14
Description: NF0613
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0613_low_14
NF0613_low_14
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (39-312)||(40641632-40641905)
chr2 (41-309)||(9782252-9782536)
chr2 (41-255)||(24881224-24881456)
chr2 (41-277)||(25132782-25133036)
chr2 (193-261)||(19660949-19661017)
chr2 (59-188)||(24342740-24342873)
chr2 (39-132)||(6093584-6093678)
chr2 (59-140)||(19665390-19665471)
chr2 (63-132)||(20272134-20272203)
chr2 (193-288)||(20271955-20272051)
chr2 (193-260)||(34135779-34135849)
chr2 (193-307)||(6093395-6093510)
chr2 (59-100)||(24562229-24562270)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (39-312)||(17225256-17225529)
chr7 (39-312)||(16918151-16918424)
chr7 (39-312)||(9609809-9610093)
chr7 (39-312)||(9837381-9837665)
chr7 (39-312)||(16921265-16921549)
chr7 (39-312)||(48353903-48354192)
chr7 (40-312)||(34242454-34242738)
chr7 (39-281)||(14939377-14939629)
chr7 (39-281)||(15366970-15367222)
chr7 (39-281)||(33558291-33558547)
chr7 (39-281)||(4437447-4437707)
chr7 (39-281)||(4444848-4445108)
chr7 (39-273)||(31499812-31500064)
chr7 (59-132)||(16382290-16382363)
chr7 (193-307)||(45148132-45148248)
chr7 (59-109)||(19066374-19066424)
chr7 (39-132)||(45148322-45148416)
chr7 (193-261)||(16207029-16207098)
chr7 (255-307)||(12246523-12246575)
chr7 (59-122)||(3193398-3193461)
chr7 (239-304)||(14278051-14278116)
chr7 (48-113)||(21539521-21539586)
chr7 (255-306)||(4070000-4070051)
chr7 (193-232)||(8325332-8325371)
chr7 (193-231)||(16382178-16382216)
chr7 (58-98)||(20584239-20584279)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (39-312)||(17022133-17022406)
chr1 (41-312)||(17607513-17607785)
chr1 (39-261)||(46144386-46144626)
chr1 (39-281)||(49998658-49998918)
chr1 (70-307)||(33395889-33396140)
chr1 (52-139)||(52399377-52399464)
chr1 (39-145)||(40437612-40437717)
chr1 (202-281)||(40437793-40437872)
chr1 (58-98)||(41213022-41213062)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (41-312)||(12020525-12020796)
chr3 (39-312)||(15549092-15549365)
chr3 (39-312)||(17203240-17203513)
chr3 (39-312)||(34558434-34558718)
chr3 (39-284)||(18968684-18968946)
chr3 (39-261)||(4163525-4163765)
chr3 (39-281)||(4147018-4147278)
chr3 (41-281)||(14817039-14817297)
chr3 (39-258)||(21168062-21168295)
chr3 (39-281)||(6229974-6230240)
chr3 (70-307)||(17759807-17760058)
chr3 (39-281)||(43428876-43429138)
chr3 (39-281)||(17319918-17320178)
chr3 (193-307)||(19061263-19061378)
chr3 (39-145)||(25105300-25105406)
chr3 (207-281)||(4163743-4163817)
chr3 (193-281)||(25105478-25105566)
chr3 (39-132)||(8603432-8603525)
chr3 (70-132)||(19061127-19061189)
chr3 (239-307)||(8603223-8603291)
chr3 (76-143)||(17392074-17392141)
chr3 (193-260)||(27050327-27050397)
chr3 (38-99)||(17385633-17385694)
chr3 (204-236)||(8603425-8603457)
chr3 (40-132)||(27050478-27050569)
chr3 (58-98)||(41660382-41660422)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (39-308)||(21621705-21621974)
chr6 (39-312)||(22363533-22363806)
chr6 (39-312)||(25918254-25918527)
chr6 (39-253)||(18630955-18631184)
chr6 (43-261)||(29604178-29604408)
chr6 (39-199)||(25649840-25650002)
chr6 (39-281)||(32350671-32350933)
chr6 (39-307)||(11374192-11374475)
chr6 (193-307)||(4228795-4228910)
chr6 (245-312)||(33539752-33539819)
chr6 (59-307)||(29161872-29162134)
chr6 (70-259)||(15006020-15006230)
chr6 (40-122)||(16375134-16375216)
chr6 (193-307)||(4173186-4173301)
chr6 (59-122)||(17857744-17857807)
chr6 (48-122)||(31162234-31162308)
chr6 (193-261)||(17375261-17375330)
chr6 (40-102)||(22463452-22463514)
chr6 (40-132)||(5485673-5485764)
chr6 (193-232)||(5485847-5485886)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (39-312)||(17283834-17284107)
chr8 (39-312)||(15931892-15932176)
chr8 (43-309)||(29296466-29296747)
chr8 (39-312)||(26010010-26010286)
chr8 (39-281)||(38637005-38637248)
chr8 (39-280)||(24266598-24266857)
chr8 (39-308)||(17265456-17265729)
chr8 (59-308)||(19332987-19333252)
chr8 (39-281)||(24553915-24554176)
chr8 (59-248)||(23227381-23227585)
chr8 (39-278)||(7468845-7469104)
chr8 (244-312)||(23228849-23228916)
chr8 (215-307)||(25608691-25608784)
chr8 (39-132)||(25608770-25608860)
chr8 (39-98)||(33171031-33171090)
chr8 (39-103)||(24238309-24238374)
chr8 (193-260)||(18032943-18033013)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (39-312)||(5297-5570)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (39-291)||(21224048-21224299)
chr5 (42-281)||(29912649-29912906)
chr5 (39-281)||(24082706-24082966)
chr5 (39-281)||(26561133-26561389)
chr5 (39-258)||(5622775-5623008)
chr5 (39-281)||(6455271-6455530)
chr5 (39-132)||(14343102-14343195)
chr5 (39-132)||(33627730-33627823)
chr5 (59-188)||(18532161-18532294)
chr5 (59-188)||(22055125-22055258)
chr5 (239-307)||(14343432-14343500)
chr5 (39-128)||(21108292-21108382)
chr5 (193-235)||(21108173-21108215)
chr5 (204-281)||(33627798-33627875)
chr5 (263-307)||(11765001-11765045)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (39-312)||(68068-68342)
scaffold0009 (59-122)||(255780-255843)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (39-312)||(305-578)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (56-312)||(50137-50393)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (39-308)||(29676-29946)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (60-312)||(19823802-19824054)
chr4 (39-281)||(38763378-38763632)
chr4 (39-312)||(18275383-18275667)
chr4 (39-312)||(42707326-42707605)
chr4 (60-312)||(7187273-7187539)
chr4 (39-281)||(12732742-12733003)
chr4 (59-145)||(10105523-10105609)
chr4 (59-145)||(31114521-31114607)
chr4 (59-188)||(15676248-15676381)
chr4 (38-121)||(17213182-17213265)
chr4 (239-304)||(40902289-40902354)
chr4 (40-128)||(10115705-10115795)
chr4 (40-98)||(41257692-41257750)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (39-312)||(198700-198984)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (39-312)||(1417-1701)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (39-312)||(12004-12288)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (39-312)||(98502-98786)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (39-313)||(23379-23666)
scaffold0021 (39-312)||(19114-19400)
scaffold0021 (39-312)||(28690-28976)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (39-281)||(6330-6590)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (83-312)||(6543-6785)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (59-312)||(105968-106237)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (39-281)||(1177-1437)
scaffold0174 (193-288)||(21595-21691)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (193-312)||(63973-64091)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (41-176)||(52009-52144)
scaffold0025 (210-312)||(51903-52005)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (39-145)||(3304-3410)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (193-281)||(9947-10035)
scaffold0253 (193-281)||(19372-19460)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (39-124)||(2300-2385)
scaffold0387 (193-281)||(2451-2539)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (193-281)||(25452-25540)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (39-113)||(1136-1210)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (204-307)||(10880-10984)
scaffold0013 (39-132)||(10693-10787)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (193-293)||(11169-11270)
scaffold0017 (39-132)||(11353-11447)
scaffold0017 (204-236)||(11346-11378)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (193-307)||(1721-1837)
scaffold1204 (76-132)||(1591-1647)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (193-261)||(3989-4060)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (193-260)||(20479-20549)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (59-101)||(4711-4753)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (193-260)||(1499-1569)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (195-281)||(15406-15493)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (39-101)||(9552-9615)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (58-98)||(85189-85229)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 40641632 - 40641905
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40641632 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactttgt 40641731  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40641732 tgttgtaagttgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 40641831  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40641832 gtaagaggagatgtactcttacaagtgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcgtagacgttgttgtgctt 40641905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Original strand, 9782252 - 9782536
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaag------------gtgtacttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |            |||||||||    
T  9782252 tgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacattgtgttagacgcattgtgtggatgtgtacttt 9782351  T
Q  129 tacactgtgttgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttac 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9782352 tacattgtgttgttgtaagttgtgaagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttac 9782451  T
Q  229 atagttgtgcgtaagaggag----atgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtg 309  Q
    |||||| |||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9782452 atagttttgcgtaagaggaggtgtacgtactattacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtg 9782536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24881456 - 24881224
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24881456 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 24881357  T
Q  141 ------ttgtaaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattgtcata----------tgtgaaatgtaaaaggaggtgtac 222  Q
           ||||  ||| | |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||          || |||||||||||||||||||||    
T  24881356 gtgcatgtgtatgttgagtagttggcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgggtcatttgagaaatgtaaaaggaggtgtac 24881257  T
Q  223 ttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtact 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24881256 ttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtact 24881224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25133036 - 25132782
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25133036 tgaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 25132937  T
Q  141 ttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtac 222  Q
     || |   |  ||| |||    |||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25132936 gtgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtcttcgcttatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtac 25132837  T
Q  223 ttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttgg 277  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||    
T  25132836 ttttacatagttgtttgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttgg 25132782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19661017 - 19660949
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19661017 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagtggtgcgtaagaggaggtgtactcttaca 19660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342873
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg----ttgtaaattgtgga 154  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     ||||| ||| | |    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 24342839  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcat 188  Q
     ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24342840 attgcattgttaggtctttgctatgtccatgcat 24342873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6093678 - 6093584
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||    
T  6093678 attgaattatgacttgattgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 6093584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19665471 - 19665390
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  19665471 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttg 19665390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20272203 - 20272134
Alignment:
Q  63 gtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20272203 gtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtgtacttttaca 20272134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20272051 - 20271955
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggt 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||  |||||||||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  20272051 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgatttgtaagaggatgtgtactcttacataagatgttatgttggcatcttggggt 20271955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Original strand, 34135779 - 34135849
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttac 260  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  34135779 gtcatatgaggaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttac 34135849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6093510 - 6093395
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||| ||| | |||||| |     
T  6093510 gtcatatgagaaatgtaaaagggtttgtacttttacacagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgttgtttgcaacttggggtgac 6093411  T
Q  292 ggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||    
T  6093410 ggcctagacgttgttg 6093395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 24562229 - 24562270
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaag 100  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24562229 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaag 24562270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 17225256 - 17225529
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17225256 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 17225355  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17225356 tgttgtaagttgtagagttgcattatttggtctttgctttgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 17225455  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17225456 gtaagaggaggtgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 17225529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16918424 - 16918151
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16918424 attgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacattgtgt 16918325  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16918324 tgttgtaagttgtggagttgcattatttggtgtttgctacgtccatgcatcattgtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacacagttgtgc 16918225  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16918224 ataagagaagatgtactcttacatatgatgtgcggttgacatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 16918151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9610093 - 9609809
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9610093 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgt 9609994  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9609993 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtactttta 9609894  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9609893 catagttgtgtgtaagaggagatgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggtctagacgttgttgtgctt 9609809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9837665 - 9837381
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  9837665 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgtgtacttttacattgtgt 9837566  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||          |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9837565 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccattcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtactttta 9837466  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9837465 catagttgtgtgtaagaggagatgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggtctagacgttgttgtgctt 9837381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 16921265 - 16921549
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16921265 attgaataatgacatgttgatagtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 16921364  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16921365 tgttgtatgttgagtaattgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcataagagaaatgtaaaaggatgtgttctttta 16921464  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  16921465 catagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatacgatgtgtggttggcatcatggggtaacgacctagacattgttgtgctt 16921549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48354192 - 48353903
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48354192 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 48354093  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttt 226  Q
    |||||||  ||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||          |||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  48354092 tgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccatgtatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggatatgcactttt 48353993  T
Q  227 acatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttac----aaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353992 acatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatatatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 48353903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Original strand, 34242454 - 34242738
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgtt 139  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  34242454 ttgaataatgacatgttaattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgtt 34242553  T
Q  140 gttgtaaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34242554 gttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgtttatgtccatgcatctgtgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 34242653  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34242654 catatttatgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgctgttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 34242738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14939629 - 14939377
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  14939629 attgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 14939530  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttt 226  Q
     ||| ||  ||| | |||| |||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||||||||||    
T  14939529 -gtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgcccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttt 14939432  T
Q  227 acatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14939431 acatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 14939377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15367222 - 15366970
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  15367222 attgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 15367123  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttt 226  Q
     ||| ||  ||| | |||| |||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||||||||||    
T  15367122 -gtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgaccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttt 15367025  T
Q  227 acatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15367024 acatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 15366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33558547 - 33558291
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33558547 attgaataacgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 33558448  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatc--------att--gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactt 224  Q
    |  ||||  ||| | || |||||| |||  ||||||||   || |||||||||||        |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33558447 tcgtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatacgtccatgcatcgtggtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactt 33558348  T
Q  225 ttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  33558347 ttacacagttgtttgtaagagaaggtgtactcttacatgagatgtgcggttgacatc 33558291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4437707 - 4437447
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4437707 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 4437608  T
Q  139 ---tgttgtaaattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
       ||||||| | ||| |||    |||||| |||  |||| |||   ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||| |    
T  4437607 tgatgttgtata-tgttgagttgtttgcattattgagtctgtgcttatatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagat 4437509  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  4437508 gtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactcttacctaagatgtgtggttggcatc 4437447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4445108 - 4444848
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4445108 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 4445009  T
Q  139 ---tgttgtaaattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
       ||||||| | ||| |||    |||||| |||  |||| |||   ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||| |    
T  4445008 tgatgttgtata-tgttgagttgtttgcattattgagtctgtgcttatatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagat 4444910  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  4444909 gtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactcttacctaagatgtgtggttggcatc 4444848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31500064 - 31499812
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31500064 attgaatattgacatgttgattgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 31499965  T
Q  139 tgttgta----aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattgtc----------atatgtgaaatgtaaaaggaggtg 219  Q
    || ||||    |  ||| |||    |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||          ||||| | ||||||||||||||||    
T  31499964 tggtgtattgtatatgttgagtagtttgcattatttagtctttgcttatgtccattcatcatagtcatatcgagttatatgagtaatgtaaaaggaggtg 31499865  T
Q  220 tacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcgg 273  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  31499864 tacttttacatagttgt-tgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtgcgg 31499812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16382363 - 16382290
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||    
T  16382363 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 16382290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45148248 - 45148132
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcat-ggggtaa 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| | ||||||  |||| |||| | ||||| |    
T  45148248 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgatgttgacatcttgggggtga 45148149  T
Q  291 tggcctagacgttgttg 307  Q
      |||||||||||||||    
T  45148148 cagcctagacgttgttg 45148132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19066424 - 19066374
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaat 109  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19066424 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgttcaat 19066374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45148416 - 45148322
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||    
T  45148416 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtgtacttttaca 45148322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16207098 - 16207029
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  16207098 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtaattttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttaca 16207029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12246575 - 12246523
Alignment:
Q  255 tcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12246575 tcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtgacggcctagacgttgttg 12246523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 3193398 - 3193461
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtg 122  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  3193398 ttgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgttcaatatagttggaggtg 3193461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 14278051 - 14278116
Alignment:
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttg 304  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  14278051 gtaagaggaggtgtactcttgcatatgatgttctgttggcatcatggggtgacggcctaaacgttg 14278116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Original strand, 21539521 - 21539586
Alignment:
Q  48 tgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaa 113  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21539521 tgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaa 21539586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Original strand, 4070000 - 4070051
Alignment:
Q  255 tcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgtt 306  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  4070000 tcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtgacgacctagacgttgtt 4070051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Original strand, 8325332 - 8325371
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8325332 gtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatag 8325371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16382216 - 16382178
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacata 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16382216 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactcttacata 16382178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 20584239 - 20584279
Alignment:
Q  58 gttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20584239 gttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20584279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17022406 - 17022133
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  17022406 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggagatgtacttttacattgtgt 17022307  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17022306 tgttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 17022207  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17022206 gtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 17022133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17607785 - 17607513
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  17607785 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg 17607686  T
Q  141 ttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcg 239  Q
    | |||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17607685 tcgtatgttgcgtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatggttgtgcg 17607586  T
Q  240 taagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17607585 taagaggaagtgtgctcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagatgttgttgtgctt 17607513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46144626 - 46144386
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46144626 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 46144527  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattg----------tcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||   |  ||| |||    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| || |          ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46144526 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcattatcgtcatatcaaatcatatgagaaatgtaaaaggaggtgt 46144427  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46144426 acttttacatagttgtgcgtaataggaggtgtactcttaca 46144386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 49998658 - 49998918
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||    
T  49998658 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgt 49998757  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||   |  ||| |||    |||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||     
T  49998758 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatcgagtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgc 49998857  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  49998858 acttttacataactgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcatc 49998918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33396140 - 33395889
Alignment:
Q  70 taaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactg-tgttgttgtaaattgtggagttgcatcatttgg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| || ||||| || ||  | ||   |||||| |||       
T  33396140 taaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtg-aatgtatgattttgcattattgat 33396042  T
Q  169 tctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtac 254  Q
    |||||||   ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||    
T  33396041 tctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtac 33395942  T
Q  255 tcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  33395941 tcttacataagatgtgctattggcatcttggggtgacggcctagacgttgttg 33395889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52399464 - 52399377
Alignment:
Q  52 atgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgtt 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52399464 atgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgtt 52399377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Original strand, 40437612 - 40437717
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  40437612 attggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac-tttacattgtgt 40437710  T
Q  139 tgttgta 145  Q
    || ||||    
T  40437711 tgatgta 40437717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 281
Target Start/End: Original strand, 40437793 - 40437872
Alignment:
Q  202 gaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  40437793 gaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatagtttatcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtgattggcatc 40437872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 41213022 - 41213062
Alignment:
Q  58 gttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41213022 gttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41213062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12020796 - 12020525
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12020796 tgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 12020697  T
Q  141 ttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgt 240  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12020696 ttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgt 12020597  T
Q  241 aagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12020596 aagaagaggtgtactcttacatataatgtgcggttggcatcatggggtaacgacctagacgttgttgtgctt 12020525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15549365 - 15549092
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15549365 attgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 15549266  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15549265 tgttgtaatttgtagagttgcattatttgctctttgctatgtccatgcatcatagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgtgc 15549166  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15549165 gtaagaggaggtgtacttttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 15549092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17203513 - 17203240
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17203513 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 17203414  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17203413 tgttgtaagttgaggagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 17203314  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  17203313 gtaagaggaggtgtagtcatacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacgttctatacgttgttgtgctt 17203240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34558718 - 34558434
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  34558718 attgaataatgacatgttgagtgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgt 34558619  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34558618 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccactcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 34558519  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34558518 cataattatgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 34558434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18968946 - 18968684
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18968946 attgaataatgacatgttgattgtgtcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaatgtgtacttttacattgtgt 18968847  T
Q  139 tg----ttgtaaa--ttgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgta 221  Q
    ||     |||| |  ||| | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18968846 tggtatatgtatatgttgagtagttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgta 18968747  T
Q  222 cttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatg 284  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18968746 cttttacatagttgtgtataagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcatcatg 18968684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 4163525 - 4163765
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4163525 attgaataatgacatgttgattgggtggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 4163624  T
Q  139 tg--ttgtaaat-tgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    ||   |||  || ||| |||    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4163625 tggcatgtgtatatgtcgagtactttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgt 4163724  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4163725 acttttacatagttgtgcgtaaaaggaggtgtactgttaca 4163765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 4147018 - 4147278
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  4147018 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgttcttttacattgtgt 4147117  T
Q  139 tg----ttgtaaattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtg 219  Q
    ||     |||| | ||| |||    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4147118 tggcatatgtata-tgtcgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatttaaaaggaggtg 4147216  T
Q  220 tacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  4147217 tacttttacatagttgcgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttggcatc 4147278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Original strand, 14817039 - 14817297
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14817039 tgaataatgacatgttgatcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttg 14817138  T
Q  141 ttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtac 222  Q
     ||||   |  ||| |||    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  14817139 gtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatatat 14817238  T
Q  223 ttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  14817239 ttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcagttggcatc 14817297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Original strand, 21168062 - 21168295
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  21168062 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgt 21168161  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactt 224  Q
    || ||||  ||| | || |||||| |||  |||||||||   |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21168162 tggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgctcgaatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtattt 21168261  T
Q  225 ttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactctt 258  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  21168262 ttacataattgtttgtaagaggaggtgtactctt 21168295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 6229974 - 6230240
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  6229974 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtgtacttttatattgtgt 6230073  T
Q  139 tg----ttgtaaa--ttgtggag-ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggagg--- 217  Q
    ||     |||| |  ||  | || |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||       
T  6230074 tggcatatgtatatgtttagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtca 6230173  T
Q  218 tgtacttttacatagttgtgcgtaagaggag---atgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6230174 tgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggccgtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 6230240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 307
Target Start/End: Original strand, 17759807 - 17760058
Alignment:
Q  70 taaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgt-gttgttgtaaattgtggagttgcatcatttgg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| || ||  | ||   |||||| |||  |    
T  17759807 taaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtg-aatgtatgattttgcattattgag 17759905  T
Q  169 tctttgct---atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtac 254  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||    
T  17759906 tctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgaattgtaaaaggaggtgtac 17760005  T
Q  255 tcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17760006 tcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtgacggcctagacgttgttg 17760058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 43428876 - 43429138
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43428876 attgaataatgacatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 43428975  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
    || ||||   |   || |||    ||| || |||  |||||||||   |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||| ||    
T  43428976 tggtgtatgtatgcgttgagtagtttgtattattgagtctttgcttgcatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaagt 43429075  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  43429076 gtacttttacatagttgatcgtaagaggaggtgtactcttacgtaagatgtgtggttggcatc 43429138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 17319918 - 17320178
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||  ||| |||||    
T  17319918 attgaataatgacattttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtactt--acattgtgt 17320015  T
Q  139 tgttgtaaat---tgtggagt----tgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
    || ||||  |   ||| ||||    ||||| |||  |||||||||   ||| ||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||    
T  17320016 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttgtatgcccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggt 17320115  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17320116 gtacttttacatagttgattgtaagaagaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 17320178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 19061263 - 19061378
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |     
T  19061263 gtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacatagttgaattgtaaaaggaggtgtactcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtgac 19061362  T
Q  292 ggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||    
T  19061363 ggcctagacgttgttg 19061378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Original strand, 25105300 - 25105406
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  25105300 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggtgtacttttacattgtgt 25105399  T
Q  139 tgttgta 145  Q
    || ||||    
T  25105400 tggtgta 25105406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Original strand, 4163743 - 4163817
Alignment:
Q  207 gtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4163743 gtaaaaggaggtgtactgttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttgtcatc 4163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Original strand, 25105478 - 25105566
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  25105478 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgattgtaagaggacgtgtactcttacataagatgtgtggctggcatc 25105566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8603525 - 8603432
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||    
T  8603525 attgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgtacttttaca 8603432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 19061127 - 19061189
Alignment:
Q  70 taaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||    
T  19061127 taaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 19061189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8603291 - 8603223
Alignment:
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8603291 gtaagaggaggtgtactcttacatatgattttcagttggcatcatggggtgacggcctagacattgttg 8603223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17392141 - 17392074
Alignment:
Q  76 cttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||  || ||||| ||||||||||    
T  17392141 cttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatggaagtgatctcttacattgtgttgttg 17392074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27050397 - 27050327
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttac 260  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  27050397 gtcatatgagaaatgtaaaaagaggtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggatgtgtactcttac 27050327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17385694 - 17385633
Alignment:
Q  38 tattgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaa 99  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17385694 tattgaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttggtgaa 17385633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8603457 - 8603425
Alignment:
Q  204 aatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8603457 aatgtaaaaggaggtgtacttttacattgttgt 8603425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27050569 - 27050478
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| ||   |||||||| || ||| |||||||||||    
T  27050569 ttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggtgaa-ttactcaatgtaaatggaggggtacttttaca 27050478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41660422 - 41660382
Alignment:
Q  58 gttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41660422 gttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21621974 - 21621705
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  21621974 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaattgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacattgtgt 21621875  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21621874 tgttgtaaattgtagagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 21621775  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgt 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21621774 gtaagaggaggtgtactcttacaaatgatgtgcggttggaatcatggggtaacggcctagacgttgttgt 21621705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 22363533 - 22363806
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  22363533 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 22363632  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22363633 tgttgtaagttgtggagttgcattatttgatctttgttatgtccatgcatcattgtcatatgaaaaatgtaaaaggagatgttcttttacatagttgtgc 22363732  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22363733 gtaagaggaggtgtactcttatatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacgacctagacgttgttgtgctt 22363806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25918527 - 25918254
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  25918527 attgtataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctacttttacattgtgt 25918428  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25918427 tgttgtaagttgtagagttgcattatctaatctttgctatgtccatgcatcactgtcatttgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgtgt 25918328  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25918327 gtaagaagaggtgtactcttacaaatgatgttcggttagcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 25918254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 253
Target Start/End: Original strand, 18630955 - 18631184
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18630955 attgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgt 18631054  T
Q  139 tgttg----taaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    || ||    | | ||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18631055 tggtgtgtatgagttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgttct 18631154  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18631155 tttacatagttgtgcgtaagaggaggtgta 18631184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29604408 - 29604178
Alignment:
Q  43 aataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  29604408 aataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggt 29604309  T
Q  143 gtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat 230  Q
     ||  ||| | || || |||  ||   ||||||| ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29604308 atatgttgagtagttttcattgttgaatctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacat 29604209  T
Q  231 agttgtgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29604208 agttgtgcgtaagaggaggtgtactcttaca 29604178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25650002 - 25649840
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  25650002 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattcgaggtgtaattttacattgtgt 25649903  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattgtcatat 199  Q
    | |||||  ||| | || |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25649902 tcttgtatgttgagtagtttgcattattgggtcgttgcttatgtccatgcatcattgtcatat 25649840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32350933 - 32350671
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32350933 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 32350834  T
Q  139 tgttg------taaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
    || ||      ||  ||| | |||| |||| ||   ||||||||   ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||| |    
T  32350833 tggtgcacgtatatgttgagtagttggcattatcgagtctttgcttatatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggagat 32350734  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  32350733 gcacttttacatagttgtttgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgaggtaggcatc 32350671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 307
Target Start/End: Original strand, 11374192 - 11374475
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactg-t 136  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| || |    
T  11374192 attgaattatgacttgattgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtt 11374291  T
Q  137 gttgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    |||| || ||  | ||   |||||| |||   |||||||   ||||||||| ||||||           |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11374292 gttggtg-aatgtatgattttgcattattgaatctttgcttgtatgtccatacatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtcct 11374390  T
Q  224 tttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  11374391 tttacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgttgttggcatcttggggtgacggcctatacgttgttg 11374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 4228795 - 4228910
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |     
T  4228795 gtcatatgagaagtgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgttctattggcatcacggggtgac 4228894  T
Q  292 ggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||    
T  4228895 ggcctagacgttgttg 4228910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Original strand, 33539752 - 33539819
Alignment:
Q  245 ggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33539752 ggaggtgtactcttacatatgatgtgcagttggcataatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 33539819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 307
Target Start/End: Original strand, 29161872 - 29162134
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactg-tgttgttgtaaattgtggagtt 157  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||| || ||||| || ||  | ||   ||    
T  29161872 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtg-aatgtatgatttt 29161970  T
Q  158 gcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaag 243  Q
    |||| |||  ||||||||   ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    |||||    
T  29161971 gcattattaagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaagaagatgtacttttacatagttgaattgtaag 29162070  T
Q  244 aggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  29162071 aggaggtgtactcttacataagatgtgttgttggcatcttggggtgacggcctatacgttgttg 29162134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 259
Target Start/End: Original strand, 15006020 - 15006230
Alignment:
Q  70 taaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgtaaat---tgtggagt-----tgcat 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |   ||| ||||     |||||    
T  15006020 taaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattggtgtatgtatatgttgagtagttttgcat 15006119  T
Q  162 catttggtctttgct---atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggag 248  Q
     ||| ||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  15006120 tattgggtctttacttgtatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgattataagaggag 15006219  T
Q  249 atgtactctta 259  Q
     ||||||||||    
T  15006220 gtgtactctta 15006230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16375216 - 16375134
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtg 122  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16375216 ttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaaatgaaggtg 16375134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 4173186 - 4173301
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |  ||||||||| ||||| |     
T  4173186 gtcatatgagaagtgtaaaaggagatgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttgcatatgatgttctattggcatcacggggtgac 4173285  T
Q  292 ggcctagacgttgttg 307  Q
     |||||||||||||||    
T  4173286 tgcctagacgttgttg 4173301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 17857744 - 17857807
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtg 122  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17857744 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggaggtg 17857807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 31162234 - 31162308
Alignment:
Q  48 tgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtg 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  31162234 tgacttgttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 31162308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Original strand, 17375261 - 17375330
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  17375261 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtctacttttacatagttgaattgtaagaggagttgtactcttaca 17375330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Original strand, 22463452 - 22463514
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 102  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22463452 ttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 132
Target Start/End: Original strand, 5485673 - 5485764
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||| || | |||||||||||||    
T  5485673 ttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggtgaactaat-caatgtaaatggatgtgtacttttaca 5485764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Original strand, 5485847 - 5485886
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5485847 gtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatag 5485886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17284107 - 17283834
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  17284107 attgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattatgt 17284008  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17284007 tgttgtgagttgtggagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgt 17283908  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17283907 gtaagaggaggtgtattcttacaaatgatgtgcagttgacatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 17283834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15932176 - 15931892
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  15932176 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaaatgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 15932077  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15932076 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgttcatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 15931977  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| || ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15931976 catatttttgcttaagtggaggtgtacttttacatatgatgtgctgttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 15931892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29296747 - 29296466
Alignment:
Q  43 aataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgtt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  29296747 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggt 29296648  T
Q  143 gtaaat----tgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    ||  ||    || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29296647 gtgtatgagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 29296548  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29296547 catagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtg 29296466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26010286 - 26010010
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |    
T  26010286 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgt--------gataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtat 26010195  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26010194 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 26010095  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26010094 catagttgtgcataagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcagttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 26010010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 38637005 - 38637248
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  38637005 attgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 38637104  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagtt-gcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat-gtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 235  Q
     ||| ||  ||| | |||| |||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38637105 -gtt-tatgttgagtagtttgcattatggagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 38637202  T
Q  236 tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38637203 tgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 38637248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24266857 - 24266598
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24266857 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 24266758  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||   | ||||  ||    |||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24266757 tggtgtatgtatttgtttagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccgtgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgt 24266658  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24266657 acttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcat 24266598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17265729 - 17265456
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgt- 136  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||     
T  17265729 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtt 17265630  T
Q  137 gttgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagt 233  Q
    |||| || ||  | ||   |||||| |||  |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17265629 gttggtg-aatgtatgcttttgcattattgagtctttgcttgtatgtccatgcatcatagtcatatgagaaatgtaaaaagaggtgtacttttacatagt 17265531  T
Q  234 tgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgt 308  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  17265530 tgttcataagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcagttggcatcctggggtgacgacctagacgttgttgt 17265456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 308
Target Start/End: Original strand, 19332987 - 19333252
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgt-gttgttgtaaattgtggagtt 157  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| || |  || ||   ||    
T  19332987 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtgaatgtt-tgatttt 19333085  T
Q  158 gcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaa-- 242  Q
    |||| |||  |||||||||   ||||||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19333086 gcattattgagtctttgctcgtatgtccatgcatcatagtcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaaga 19333185  T
Q  243 -gaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgt 308  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19333186 ggaggaggtgtactcttacatatgatgtacagttggcatcatggggtgaaggcctagacgttgttgt 19333252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 24553915 - 24554176
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24553915 attgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 24554014  T
Q  139 tg----ttgtaaattgtg---gagttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
    ||     |||| || |||    | |||||| |||  ||||||||   ||||| ||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||    
T  24554015 tggtgtatgtatatggtgagtaatttgcattattgagtctttgcttgtatgttcatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggt 24554114  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  24554115 gtacttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttgacatc 24554176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 248
Target Start/End: Original strand, 23227381 - 23227585
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta----aattgtgga 154  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||     ||||| | |    
T  23227381 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattgagta 23227480  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaag 243  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23227481 gttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcattatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcataag 23227580  T
Q  244 aggag 248  Q
    |||||    
T  23227581 aggag 23227585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7469104 - 7468845
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  7469104 attgaataatgacatgttgattgtgtgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgt 7469005  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttg---ctatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggt 218  Q
    || ||||   |  ||| |||    |||||| |||  |||||||    ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||| |||||    
T  7469004 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgtttgtatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaacgaggt 7468905  T
Q  219 gtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggc 278  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7468904 atacttttacatagttgtttgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtggggttggc 7468845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Original strand, 23228849 - 23228916
Alignment:
Q  244 aggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23228849 aggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcat-gggtaacggcctagacgttgttgtgctt 23228916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25608784 - 25608691
Alignment:
Q  215 aggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  25608784 aggtgtacttttacatagttgaattgtaagaggaggtgtcctcttacatatgatgtgcatttggcatcatggagtgacggcatagacgttgttg 25608691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25608860 - 25608770
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||    
T  25608860 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttg-ataatgtaa---aaggtgtacttttaca 25608770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33171090 - 33171031
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33171090 attgaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 33171031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24238374 - 24238309
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttg 103  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24238374 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttg 24238309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18033013 - 18032943
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttac 260  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  18033013 gtcatatgaaaaatgtaaaatgaagtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttac 18032943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5570 - 5297
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  5570 attgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgt 5471  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5470 tgttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgcaaagtccatgcatcattgtcatttgtgacatgtaaaaagaggtgtacttttacatagttgtgc 5371  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5370 gtaacaggaggtctactcttacaaatgatgtgtgattggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 5297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Original strand, 21224048 - 21224299
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21224048 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgt 21224147  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21224148 tgttgtaagttatggagttgcgttatttggtttttgctatgtccatgcatcattatcatatg-aaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttttgc 21224246  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21224247 gtaataggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 21224299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29912906 - 29912649
Alignment:
Q  42 gaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgt 141  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  29912906 gaatgatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggtgtacttttacattgtgttgg 29912807  T
Q  142 tgtaaat---tgtggagt----tgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    ||||  |   ||| ||||    ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||||||||||    
T  29912806 tgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtact 29912707  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29912706 tttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 29912649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24082966 - 24082706
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24082966 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 24082867  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || || |   |  ||| |||    |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||          |||| |||||||||||||||||||    
T  24082866 tgatgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgggtctttacttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcgtatgagaaatgtaaaaggaggtgt 24082767  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  24082766 acttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgtggttgccatc 24082706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 26561133 - 26561389
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26561133 attgaataacgacatgttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 26561232  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc---tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactt 224  Q
    || ||||  ||| | || |||||| |||  || |||||   ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26561233 tggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtttttgcttgtatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactt 26561332  T
Q  225 ttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  26561333 ttacatagttgtttgtaagaggatgtgtacttttacataagatgtgcggttggcatc 26561389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Original strand, 5622775 - 5623008
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  5622775 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgt 5622874  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactt 224  Q
    || ||||  ||| | || |||||| |||  |||||||||   |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5622875 tggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgctcgaatgtccatgcatcataatcatattgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtattt 5622974  T
Q  225 ttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactctt 258  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  5622975 ttacataattgtttgtaagaggaggtgtactctt 5623008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6455530 - 6455271
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| || ||    
T  6455530 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtactcttacattgcgt 6455431  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||   |  ||| |||    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6455430 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatagtcataacgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgt 6455331  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||||  ||||||||    
T  6455330 acttttacatagttgt-tgtaagaggaggtgtactcttacctaagatgtgcaattggcatc 6455271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Original strand, 14343102 - 14343195
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||    
T  14343102 attgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgtacttttaca 14343195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Original strand, 33627730 - 33627823
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||    
T  33627730 attgaataatgacatgttgactgtgtggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532294
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg----ttgtaaattgtgga 154  Q
    |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     ||||| ||| | |    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 18532260  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcat 188  Q
     ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  18532261 attgcattgttgggtctttgctatgtccatgcat 18532294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055258
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg----ttgtaaattgtgga 154  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||     ||||| ||| | |    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatgtaagttgagta 22055224  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcat 188  Q
     ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  22055225 attgcattgttgggtctttgctatgtccatgcat 22055258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 307
Target Start/End: Original strand, 14343432 - 14343500
Alignment:
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14343432 gtaagaggaggtgtattcttacatatgatgttcagttggcatcatggggtgatggcctagacgttgttg 14343500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21108382 - 21108292
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttt 128  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  21108382 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttt 21108292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21108215 - 21108173
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108215 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg 21108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 281
Target Start/End: Original strand, 33627798 - 33627875
Alignment:
Q  204 aatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  33627798 aatgtaaatggaggtgtacttttacaaagttgattgtaagaggatgtgtactcttacataagatgtgtggttggcatc 33627875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 11765001 - 11765045
Alignment:
Q  263 atgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttg 307  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11765001 atgatgttcagttggcatcatggggtgacggcctagacgttgttg 11765045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 68342 - 68068
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  68342 attgattaatgacatgttgattgtgtggacgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 68243  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg 237  Q
    |||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68242 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtctatgcatcattgtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg 68143  T
Q  238 cgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  68142 cgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 68068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 255780 - 255843
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtg 122  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  255780 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttcttcaatgtagttggaggtg 255843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 578 - 305
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  578 attgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgcaattgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttttacattgtgt 479  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  478 tgttgtaagttgtagagttgcattatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgcgaaatgtaaacggaggtgtacttttacatagttttgc 379  T
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  378 gtaagaggaggtatactcttacaaatgatgtgcagttggcatcatgaggtaacgacctagacgttgttgtgctt 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50393 - 50137
Alignment:
Q  56 tggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgtaaattgtggag 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50393 tggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgtaagttgtggag 50294  T
Q  156 ttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtact 255  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  50293 ttgcattatttggtctttgcaaagtccatgcatcattgtcatttgtgacatgtaaaaagaggtgtacttttacatagttgtgcgtaacaggaggtctact 50194  T
Q  256 cttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50193 cttacaaatgatgtgtgattggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 50137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29946 - 29676
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29946 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 29847  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg 237  Q
    |||||||  ||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29846 tgttgtatgttgagtatttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattatcatatgagaaatgtaaaatgaggtgtacttttacatagttgtg 29747  T
Q  238 cgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29746 cgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgtggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgt 29676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 60 - 312
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19824054
Alignment:
Q  60 tgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgtaaattgtggagttgc 159  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttgtagagttgc 19823901  T
Q  160 atcatttggtctttgctatgtccatgcatcattgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactctta 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19823902 attatttggtctttgctatgtccatgtatcattgtcatttgtgaaatataaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaagtgtactctta 19824001  T
Q  260 caaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19824002 caaatcatgtgcggttggcatcatggggtgacgtcctagacgttgttgtgctt 19824054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38763632 - 38763378
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38763632 attgaataatggcatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 38763533  T
Q  139 tgttgtaaattgtggag-ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttt 226  Q
    |||||||  ||| | || |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763532 tgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcatgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttt 38763433  T
Q  227 acatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38763432 acatagttgtgcgtaagatgaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 38763378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18275667 - 18275383
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  18275667 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 18275568  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    ||| |||  ||| | || | ||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||          ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18275567 tgtcgtatgttgagtaggtacattatttggtcttttcttatgtccatacattattgtcatatcgagtcatatgataaatggaaaaggaggtgtactttta 18275468  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18275467 catagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttgacatcatgttgtaacagcctagacgttgttgtgctt 18275383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42707605 - 42707326
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42707605 attgaataatgacatgctgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 42707506  T
Q  139 tgttg----taaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    || ||    ||| ||| | |||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||| |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42707505 tggtgtatataagttgagtagttgcattattcggtatttgcttatgtctatggatcatagtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 42707406  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||| |||||        |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  42707405 tttacat-gttgt-------cggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcat-gggtaacggactagacgttgttgtgctt 42707326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 312
Target Start/End: Original strand, 7187273 - 7187539
Alignment:
Q  60 tgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta----aattgtggag 155  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||     ||||| | ||    
T  7187273 tgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattgagtag 7187372  T
Q  156 ttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcat------catt----gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaaga 244  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||      |||     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7187373 ttgcattattcgttctttgcttatgtccatgcatattcgtcatatcgagtcatatgtgaaatggaaaaggagatgtacttttacatagttgcgcgtaaga 7187472  T
Q  245 ggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7187473 ggaggtgtactcttacatatgatgtgtggttgacatcat-gggtaacggcctagacattgttgtgctt 7187539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12733003 - 12732742
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12733003 attgaataatgacatgacgattgtgtggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgt 12732904  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtct--ttgctatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtg 219  Q
    || ||||   | | || |||    |||||| |||  ||||  ||  ||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||| |||||    
T  12732903 tggtgtatgtattcgttgagtagtttgcattattgagtcttgtttgtatgtccatgcatcatagtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaagaaggtg 12732804  T
Q  220 tacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||| ||||    
T  12732803 tacttttacatagttgatcgtaagaggaggtgtactcttatataagatgtgcagttgacatc 12732742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105609
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta 145  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta 10105609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114521
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta 145  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta 31114521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676381
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg----ttgtaaattgtgga 154  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||     ||||| ||| | |    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgtaagttgagta 15676347  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgctatgtccatgcat 188  Q
     ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  15676348 tttgcattgttgggtctttgctatgtccatgcat 15676381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 121
Target Start/End: Original strand, 17213182 - 17213265
Alignment:
Q  38 tattgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggt 121  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  17213182 tattgaattgtgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttgttcaatataaatgaaggt 17213265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 40902289 - 40902354
Alignment:
Q  239 gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttg 304  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  40902289 gtaagaggaggggtactcttacatatgatgttcagttggcatcatggggcgacggcctagacgttg 40902354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Original strand, 10115705 - 10115795
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt--tgtacaatgtaattgaaggtgtacttt 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||| |  || | |||||||||| |||||||||||    
T  10115705 ttgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaatttatgaagaatgtaattggaggtgtacttt 10115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 98
Target Start/End: Original strand, 41257692 - 41257750
Alignment:
Q  40 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41257692 ttgaattatgacttgattgttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 41257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 198700 - 198984
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  198700 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtat 198799  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    ||||| |  ||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||          |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  198800 tgttgaatgttgagtagttgcattatttggtatttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatataaaaggagatgtactttta 198899  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  198900 catagttttgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacgttgttgtgctt 198984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 1417 - 1701
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1417 attgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcatgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgt 1516  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcatt----------gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||  | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1517 tgttgtatgttaagtagttgcattatttggtctatacttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaagcaggtgtactttta 1616  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1617 catagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcaaggggtatcggcctagacgttgttgtgctt 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12288 - 12004
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  12288 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgt 12189  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||| ||  ||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12188 tgttatatgttgagtagttgtattatttggtctttgcttatgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 12089  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12088 catagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgtggttggcaacatggggtaacgacctagacgttgttgtgctt 12004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 98502 - 98786
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  98502 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgt 98601  T
Q  139 tgttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatcat----------tgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttta 227  Q
    |||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  98602 tgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactttta 98701  T
Q  228 catagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    |||| || ||| ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  98702 cataattatgcataaaaaaaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcatggggtaacagcctagacgttgttgtgctt 98786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 313
Target Start/End: Original strand, 23379 - 23666
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||    
T  23379 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttagattgtgt 23478  T
Q  139 tgttgt----aaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    || |||    || ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||||| |    
T  23479 tgctgtgtataagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtaat 23578  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctta 313  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23579 tttacat-gttgtgcgaaagaggaggtgtactcttacatatgatgtgcggttggcatcat-gggtaacggcctagacgttgttgtactta 23666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 19114 - 19400
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  19114 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgt 19213  T
Q  139 tgttgt----aaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    || |||    || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||          |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19214 tggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcatcatcgtcacatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtact 19313  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19314 tttacat-gttgtgcgtaagaggaggtgtacttttacatacgatgtgcggttagtatcat-gggtaacggcctagacgttgttgtgctt 19400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 28690 - 28976
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  28690 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgt 28789  T
Q  139 tgttgt----aaattgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgtact 223  Q
    || |||    || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||          |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28790 tggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccatgcatcatcgtcacatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtact 28889  T
Q  224 tttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28890 tttacat-gttgtgcgtaagaggaggtgtacttttacatacgatgtgcggttagtatcat-gggtaacggcctagacgttgttgtgctt 28976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6590 - 6330
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6590 attgaataatgacatgttgattgtatggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaagttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgt 6491  T
Q  139 tgttgtaaat---tgtggagt----tgcatcatttggtctttgct-atgtccatgcatcattgtcatat----------gtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||  |   ||| ||||    ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||          | |||||||||||||||||||    
T  6490 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgt 6391  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6390 acttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 312
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6785
Alignment:
Q  83 atgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta----aattgtggagttgcatcatttggtctttgct-a 177  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||     ||||| | |||||||| ||| |||||||||| |    
T  6543 atgcaattgttgtgga-gttgtacaatgtaactggaagtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctta 6641  T
Q  178 tgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgat 267  Q
    |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6642 tgtccatgcatcattgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtatttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgtactcttacatatgat 6741  T
Q  268 gtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6742 gtgcggttgacatcat-gggtaacggcctagacgttgttgtgctt 6785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 105968 - 106237
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttgttgta----aattgtgga 154  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||     ||||| | |    
T  105968 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttgatgtgtatgaattgagta 106067  T
Q  155 gttgcatcatttggtctttgct---atgtccatgcatcattgtca----------tatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgta 241  Q
    ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  106068 gttgcattattcggtctttgcttttatgtccatgcatcatcgtcatatcgagtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtactttaacatagttgtgcgta 106167  T
Q  242 agaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  106168 agaggaggtgtactcttacatatgatgtgtagttggcatcat-gggtaacgacctagacgttgttgtgctt 106237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1177
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  1437 attgaataatgacttcttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttgcattgtgt 1338  T
Q  139 tgttgta---aattgtggag----ttgcatcatttggtctttgc-tatgtccatgcatca----------ttgtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgt 220  Q
    || ||||   |  ||| |||    |||||| |||  |||||||| |||||||||||||||          | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1337 tggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccatgcatcatcgtcatatctagtcatatgagaaatgtaaaaggaggttt 1238  T
Q  221 acttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1237 acttttacatagttgtgcgttagaggaggtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 21595 - 21691
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtg-cgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggt 288  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||  |||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||    
T  21595 gtcatatgagaaatctaaaaggaggtgtaattttacataggtgagatgtaagaggatgtgtactcttacataagatgttctgttggcatcttggggt 21691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 312
Target Start/End: Original strand, 63973 - 64091
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  63973 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggaggtgaactcttacatatgatgtgcggttggcatcat-gggtaacg 64071  T
Q  293 gcctagacgttgttgtgctt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  64072 gcctagacgttgttgcgctt 64091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52144 - 52009
Alignment:
Q  41 tgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgttg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |    
T  52144 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttttacattgtgtag 52045  T
Q  141 ttgtaaattgtggagttgcatcatttggtctttgct 176  Q
    |||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  52044 ttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgct 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 52005 - 51903
Alignment:
Q  210 aaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgttgttgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52005 aaaggaggtgtacttttacatagttgtccataagaggaggtgtactcttacaactgatgtgcggttggcatcatggggtaacggcctagacattgttgtg 51906  T
Q  310 ctt 312  Q
    |||    
T  51905 ctt 51903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Original strand, 3304 - 3410
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactgtgt 138  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3304 attgaataatgacatgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgt 3403  T
Q  139 tgttgta 145  Q
    || ||||    
T  3404 tggtgta 3410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10035 - 9947
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10035 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgggtaagaggaggtgtactcttacataatatgtgcggttggcatc 9947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19460 - 19372
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19460 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgggtaagaggaggtgtactcttacataatatgtgcggttggcatc 19372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2385
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  2300 attgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaactggaggtgta 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Original strand, 2451 - 2539
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  2451 gtcatatgagaaatttaaaaggagatgtacttttacatagttgtgagtaagaggaggtgtactgttacataagatgtgtggttggcatc 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Original strand, 25452 - 25540
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25452 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtaattttacatagttgtgcataagaggatgtgtactcttacataagatgtgcggttggcatc 25540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 1136 - 1210
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatgttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1136 attgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Original strand, 10880 - 10984
Alignment:
Q  204 aatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaatggcctagacgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  10880 aatgtaaaaggaggtgtactttaacatagttgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgttcagttggcatcatggggtgacgacctagacat 10979  T
Q  303 tgttg 307  Q
    |||||    
T  10980 tgttg 10984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Original strand, 10693 - 10787
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||    
T  10693 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgtacttttaca 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11270 - 11169
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaat 291  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||    
T  11270 gtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacatagttgaattgtaagaagaggtgtactcttacatatgatgttcagttggcatcatagggtgat 11171  T
Q  292 gg 293  Q
    ||    
T  11170 gg 11169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11447 - 11353
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||    
T  11447 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgtacttttaca 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11378 - 11346
Alignment:
Q  204 aatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11378 aatgtaaaaggaggtgtacttttacattgttgt 11346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1837
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacata-gttgtgc-gtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatcatggggtaa 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  1721 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtactcttacatatgatgaattgtaagaggaggtgtactcttacatatgatgtacaattggcatcatggggtga 1820  T
Q  291 tggcctagacgttgttg 307  Q
     || ||||| |||||||    
T  1821 cggtctagatgttgttg 1837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1647
Alignment:
Q  76 cttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||    
T  1591 cttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtgtacttttaca 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Original strand, 3989 - 4060
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttaca 261  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3989 gtcatatgagaaatgtaaaaggatgtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggaggtgtactcttaca 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Original strand, 20479 - 20549
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttac 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| | |||||||||    
T  20479 gtcatatgagaaatgtaaaaggaggtgtacttttacataggtgaaatacgtaagaggagttttactcttac 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4753 - 4711
Alignment:
Q  59 ttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 101  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4753 ttgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Original strand, 1499 - 1569
Alignment:
Q  193 gtcatatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg---tgcgtaagaggagatgtactcttac 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | | ||||||||| |||||||||||    
T  1499 gtcatatgagaaatgtaaaaggagatgtacttttacataggtgaaatacttaagaggaggtgtactcttac 1569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Original strand, 15406 - 15493
Alignment:
Q  195 catatgtgaaatgtaaaaggaggtgtacttttacatagttg-tgcgtaagaggagatgtactcttacaaatgatgtgcggttggcatc 281  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||  | ||||| | |||||||||    
T  15406 catatgagaaatgtaaaagggggtgtacttttacataggtgaattgtaagaggaggtgtactcttacttaagatgttctgttggcatc 15493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9552
Alignment:
Q  39 attgaataatgacatg-ttggttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 101  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9615 attgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 9552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 85229 - 85189
Alignment:
Q  58 gttgtgtggatataaatgcttgataatgcaattgttgttga 98  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  85229 gttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 85189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2026 times since January 2019
Visitors: 3811