View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0618_low_2 (Length: 636)

Name: NF0618_low_2
Description: NF0618
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0618_low_2
NF0618_low_2
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (214-625)||(48600977-48601387)
chr4 (1-176)||(4268820-4268997)
chr4 (1-175)||(789529-789705)
chr4 (1-174)||(16536059-16536234)
chr4 (1-176)||(43944518-43944694)
chr4 (1-176)||(54897319-54897496)
chr4 (1-167)||(18067886-18068054)
chr4 (1-174)||(4089153-4089328)
chr4 (8-174)||(7768957-7769124)
chr4 (4-174)||(29591203-29591375)
chr4 (1-174)||(43202384-43202558)
chr4 (1-176)||(15186254-15186425)
chr4 (17-176)||(12356272-12356432)
chr4 (1-165)||(47231881-47232047)
chr4 (1-172)||(19503107-19503279)
chr4 (4-174)||(32217059-32217230)
chr4 (1-174)||(33108673-33108847)
chr4 (1-166)||(37987947-37988113)
chr4 (13-176)||(6164118-6164281)
chr4 (8-174)||(32202481-32202647)
chr4 (13-174)||(50619110-50619271)
chr4 (1-173)||(28755632-28755803)
chr4 (19-141)||(39843937-39844060)
chr4 (29-174)||(36395139-36395285)
chr4 (13-176)||(54945778-54945940)
chr4 (13-144)||(42898774-42898908)
chr4 (13-149)||(24679668-24679804)
chr4 (39-167)||(30387141-30387270)
chr4 (20-167)||(4220226-4220373)
chr4 (29-176)||(30154161-30154309)
chr4 (13-172)||(54655879-54656038)
chr4 (16-152)||(50603254-50603392)
chr4 (49-174)||(16820912-16821038)
chr4 (13-166)||(55882708-55882860)
chr4 (16-143)||(52533816-52533944)
chr4 (53-176)||(39877245-39877371)
chr4 (1-141)||(3783534-3783676)
chr4 (29-146)||(46148979-46149097)
chr4 (16-165)||(53655887-53656037)
chr4 (11-128)||(31680510-31680627)
chr4 (13-176)||(5091610-5091772)
chr4 (17-116)||(42815137-42815237)
chr4 (1-116)||(54054559-54054675)
chr4 (4-116)||(46688264-46688382)
chr4 (15-130)||(49915185-49915301)
chr4 (44-146)||(41265514-41265616)
chr4 (33-149)||(53268764-53268880)
chr4 (44-146)||(31517220-31517324)
chr4 (20-142)||(52697083-52697205)
chr4 (14-167)||(1432555-1432703)
chr4 (13-85)||(50167615-50167685)
chr4 (71-122)||(8133789-8133840)
chr4 (33-120)||(17344714-17344800)
chr4 (103-167)||(28119913-28119978)
chr4 (121-174)||(54054662-54054715)
chr4 (71-174)||(53003956-53004060)
chr4 (103-167)||(292229-292294)
chr4 (103-167)||(37402766-37402830)
chr4 (103-165)||(28120058-28120121)
chr4 (385-455)||(7277447-7277517)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-174)||(34650833-34651007)
chr5 (1-174)||(13661819-13661994)
chr5 (8-174)||(8787358-8787525)
chr5 (1-174)||(35504241-35504415)
chr5 (1-176)||(10054351-10054527)
chr5 (1-176)||(21547392-21547568)
chr5 (1-174)||(35132533-35132707)
chr5 (1-174)||(11957967-11958142)
chr5 (15-151)||(12506322-12506459)
chr5 (22-174)||(40564404-40564557)
chr5 (1-167)||(6283573-6283741)
chr5 (13-126)||(13470175-13470288)
chr5 (1-141)||(9721640-9721782)
chr5 (3-151)||(11846085-11846235)
chr5 (1-116)||(10069980-10070095)
chr5 (13-116)||(19647717-19647820)
chr5 (1-155)||(31909643-31909793)
chr5 (34-167)||(10955997-10956130)
chr5 (8-176)||(40057326-40057495)
chr5 (16-142)||(20175254-20175381)
chr5 (16-136)||(39066973-39067095)
chr5 (1-101)||(4837269-4837369)
chr5 (13-137)||(39069405-39069527)
chr5 (47-166)||(4268620-4268739)
chr5 (16-146)||(19436866-19436995)
chr5 (16-89)||(2619643-2619716)
chr5 (121-175)||(19647676-19647730)
chr5 (16-86)||(6284822-6284892)
chr5 (103-167)||(30889437-30889502)
chr5 (123-167)||(10955958-10956002)
chr5 (103-176)||(31467834-31467908)
chr5 (375-421)||(42069781-42069827)
chr5 (103-167)||(14214056-14214121)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (1-176)||(24438488-24438665)
chr7 (1-175)||(24798402-24798577)
chr7 (1-174)||(34333295-34333469)
chr7 (4-176)||(29993485-29993659)
chr7 (1-176)||(5239296-5239473)
chr7 (13-174)||(34606285-34606447)
chr7 (18-153)||(45045799-45045935)
chr7 (9-167)||(42044301-42044459)
chr7 (1-153)||(28587921-28588074)
chr7 (15-153)||(8754606-8754745)
chr7 (1-174)||(12218437-12218611)
chr7 (13-166)||(30810679-30810833)
chr7 (1-167)||(18485972-18486140)
chr7 (13-175)||(4628590-4628753)
chr7 (13-167)||(1737004-1737158)
chr7 (1-154)||(47839504-47839658)
chr7 (16-175)||(525075-525234)
chr7 (17-173)||(11686324-11686482)
chr7 (1-174)||(23363167-23363341)
chr7 (15-173)||(5729372-5729531)
chr7 (16-146)||(43594064-43594195)
chr7 (19-167)||(13064883-13065033)
chr7 (4-113)||(27456175-27456284)
chr7 (13-167)||(47657004-47657156)
chr7 (16-146)||(7689228-7689359)
chr7 (20-166)||(47083086-47083232)
chr7 (1-163)||(28262042-28262201)
chr7 (29-155)||(18117183-18117310)
chr7 (20-116)||(34546373-34546469)
chr7 (19-143)||(46716668-46716793)
chr7 (13-113)||(37631604-37631704)
chr7 (16-146)||(33636479-33636610)
chr7 (39-174)||(37674106-37674240)
chr7 (21-167)||(23357717-23357861)
chr7 (16-142)||(4087650-4087776)
chr7 (33-141)||(18220704-18220812)
chr7 (34-122)||(22739868-22739957)
chr7 (1-122)||(18469993-18470115)
chr7 (15-104)||(4100595-4100684)
chr7 (19-142)||(29835735-29835860)
chr7 (17-120)||(36437405-36437507)
chr7 (64-123)||(47118041-47118100)
chr7 (377-455)||(35985291-35985369)
chr7 (377-455)||(36006699-36006777)
chr7 (103-167)||(38128406-38128471)
chr7 (9-106)||(18220601-18220697)
chr7 (10-86)||(3021912-3021988)
chr7 (51-130)||(13556474-13556553)
chr7 (39-122)||(20116940-20117022)
chr7 (388-455)||(29229703-29229770)
chr7 (20-105)||(18220509-18220593)
chr7 (388-445)||(42927027-42927084)
chr7 (8-176)||(6097355-6097525)
chr7 (373-419)||(25778372-25778418)
chr7 (377-455)||(35985290-35985368)
chr7 (377-455)||(36006698-36006776)
chr7 (376-421)||(24283094-24283139)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (1-173)||(30675574-30675747)
chr8 (1-174)||(168477-168652)
chr8 (1-176)||(16888542-16888718)
chr8 (1-167)||(21595858-21596025)
chr8 (1-175)||(34228693-34228869)
chr8 (5-174)||(2805260-2805431)
chr8 (1-174)||(4537744-4537919)
chr8 (1-174)||(27988500-27988674)
chr8 (1-174)||(28045802-28045976)
chr8 (4-153)||(33357150-33357301)
chr8 (1-146)||(12203866-12204012)
chr8 (1-146)||(12448294-12448440)
chr8 (1-175)||(16394060-16394236)
chr8 (4-174)||(36730459-36730629)
chr8 (1-176)||(20831551-20831728)
chr8 (3-174)||(42034981-42035154)
chr8 (16-174)||(11112666-11112825)
chr8 (1-174)||(13643023-13643197)
chr8 (1-174)||(13743448-13743622)
chr8 (1-174)||(29444140-29444315)
chr8 (1-174)||(9063052-9063226)
chr8 (21-172)||(16890482-16890634)
chr8 (1-147)||(4648206-4648353)
chr8 (22-176)||(7304516-7304671)
chr8 (1-161)||(37373217-37373378)
chr8 (17-176)||(9537822-9537982)
chr8 (1-175)||(43119228-43119403)
chr8 (8-167)||(9253909-9254068)
chr8 (1-143)||(16785098-16785241)
chr8 (14-176)||(40831302-40831465)
chr8 (3-151)||(3930256-3930405)
chr8 (19-174)||(32113938-32114095)
chr8 (13-167)||(28626792-28626946)
chr8 (13-141)||(22956730-22956860)
chr8 (33-167)||(42433551-42433685)
chr8 (52-172)||(39406905-39407024)
chr8 (19-124)||(10870382-10870487)
chr8 (22-176)||(29235268-29235423)
chr8 (61-175)||(24843279-24843393)
chr8 (29-116)||(34192815-34192902)
chr8 (16-94)||(9278239-9278317)
chr8 (44-122)||(22451839-22451916)
chr8 (16-111)||(17467630-17467725)
chr8 (1-66)||(12652641-12652707)
chr8 (13-94)||(10618042-10618123)
chr8 (44-121)||(30933376-30933452)
chr8 (388-455)||(14578545-14578612)
chr8 (376-409)||(42662712-42662745)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-174)||(392107-392282)
chr6 (1-176)||(3515777-3515954)
chr6 (1-174)||(4215706-4215881)
chr6 (1-174)||(32929508-32929683)
chr6 (13-174)||(23402162-23402324)
chr6 (1-176)||(12145115-12145292)
chr6 (1-167)||(2350663-2350831)
chr6 (1-167)||(27433503-27433671)
chr6 (4-174)||(18276612-18276786)
chr6 (13-167)||(26467131-26467286)
chr6 (1-167)||(32985200-32985368)
chr6 (17-174)||(2580980-2581138)
chr6 (9-167)||(3026016-3026175)
chr6 (1-167)||(7851166-7851334)
chr6 (4-143)||(29451146-29451286)
chr6 (1-174)||(12525730-12525905)
chr6 (1-176)||(31280332-31280503)
chr6 (1-146)||(1391206-1391352)
chr6 (16-165)||(35043917-35044065)
chr6 (1-124)||(21878398-21878522)
chr6 (13-174)||(13416960-13417124)
chr6 (1-174)||(29978244-29978417)
chr6 (6-116)||(34477609-34477719)
chr6 (1-116)||(20897959-20898075)
chr6 (15-161)||(5323426-5323573)
chr6 (19-174)||(25165413-25165569)
chr6 (14-166)||(11115106-11115256)
chr6 (5-167)||(1840254-1840417)
chr6 (20-166)||(28225252-28225398)
chr6 (1-106)||(34396596-34396702)
chr6 (29-146)||(34851877-34851995)
chr6 (31-143)||(961051-961164)
chr6 (1-143)||(23629607-23629750)
chr6 (1-167)||(9660997-9661165)
chr6 (13-88)||(13529479-13529554)
chr6 (121-176)||(20898062-20898116)
chr6 (75-141)||(28564322-28564388)
chr6 (121-174)||(34477569-34477622)
chr6 (103-167)||(34706835-34706900)
chr6 (99-153)||(22417303-22417358)
chr6 (113-167)||(34494276-34494331)
chr6 (57-134)||(24227428-24227506)
chr6 (137-167)||(12525726-12525756)
chr6 (103-167)||(34712132-34712197)
chr6 (3-83)||(28562694-28562774)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-174)||(52520692-52520867)
chr3 (1-174)||(39074430-39074604)
chr3 (1-176)||(49893342-49893519)
chr3 (1-174)||(43786882-43787057)
chr3 (1-176)||(272231-272408)
chr3 (1-176)||(46352645-46352822)
chr3 (1-174)||(858600-858775)
chr3 (1-175)||(10617283-10617458)
chr3 (8-174)||(53489824-53489991)
chr3 (1-174)||(4168194-4168369)
chr3 (1-174)||(48725282-48725457)
chr3 (15-174)||(43269739-43269899)
chr3 (13-146)||(20924016-20924150)
chr3 (7-175)||(7468428-7468596)
chr3 (1-167)||(41304016-41304182)
chr3 (4-142)||(41553972-41554111)
chr3 (13-174)||(40362580-40362742)
chr3 (4-174)||(2938040-2938211)
chr3 (3-167)||(49529275-49529441)
chr3 (16-174)||(11308211-11308369)
chr3 (4-167)||(18014686-18014851)
chr3 (46-176)||(6842676-6842807)
chr3 (14-167)||(42548120-42548273)
chr3 (13-146)||(42964277-42964411)
chr3 (11-167)||(22248908-22249065)
chr3 (19-162)||(2505379-2505523)
chr3 (4-175)||(50359185-50359357)
chr3 (14-136)||(2119456-2119577)
chr3 (44-167)||(33140940-33141064)
chr3 (33-167)||(41993627-41993761)
chr3 (1-174)||(50395563-50395737)
chr3 (16-168)||(28139336-28139489)
chr3 (21-141)||(29241669-29241790)
chr3 (21-147)||(13159929-13160056)
chr3 (13-175)||(52246606-52246769)
chr3 (44-149)||(50298970-50299076)
chr3 (21-153)||(38852246-38852382)
chr3 (13-165)||(24488390-24488543)
chr3 (29-150)||(31514831-31514952)
chr3 (64-146)||(52552549-52552631)
chr3 (13-69)||(2391631-2391687)
chr3 (13-69)||(2393392-2393448)
chr3 (37-116)||(2362880-2362958)
chr3 (3-74)||(52718181-52718252)
chr3 (33-128)||(21010041-21010133)
chr3 (374-455)||(11534786-11534867)
chr3 (33-147)||(25743854-25743968)
chr3 (50-88)||(6842604-6842642)
chr3 (385-415)||(18093849-18093879)
chr3 (373-415)||(30122026-30122068)
chr3 (133-174)||(53163911-53163952)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-174)||(4381806-4381981)
chr2 (13-176)||(6580213-6580374)
chr2 (1-174)||(27856396-27856571)
chr2 (1-167)||(3668120-3668287)
chr2 (1-172)||(561520-561693)
chr2 (1-174)||(20552942-20553117)
chr2 (4-175)||(30486224-30486397)
chr2 (1-174)||(31438657-31438832)
chr2 (13-176)||(31390036-31390200)
chr2 (13-176)||(22887774-22887938)
chr2 (1-175)||(32360868-32361044)
chr2 (1-174)||(44587913-44588088)
chr2 (8-174)||(22068320-22068486)
chr2 (1-174)||(34442533-34442706)
chr2 (9-167)||(8969414-8969573)
chr2 (21-174)||(26387064-26387218)
chr2 (16-174)||(22567629-22567788)
chr2 (16-173)||(2898098-2898256)
chr2 (13-166)||(38590883-38591036)
chr2 (19-146)||(1859192-1859320)
chr2 (1-146)||(32860113-32860259)
chr2 (13-174)||(35851750-35851913)
chr2 (1-167)||(43637176-43637342)
chr2 (15-174)||(5093540-5093699)
chr2 (17-143)||(13574060-13574187)
chr2 (13-174)||(28600991-28601152)
chr2 (20-173)||(27584769-27584922)
chr2 (29-173)||(4022480-4022624)
chr2 (1-174)||(25782833-25783004)
chr2 (1-116)||(26891722-26891838)
chr2 (13-122)||(38296201-38296310)
chr2 (1-141)||(5881229-5881374)
chr2 (15-137)||(11021259-11021382)
chr2 (33-176)||(39531868-39532010)
chr2 (33-122)||(15079012-15079100)
chr2 (19-144)||(29102313-29102439)
chr2 (16-147)||(25772137-25772270)
chr2 (33-167)||(34123034-34123166)
chr2 (44-147)||(15146687-15146790)
chr2 (376-454)||(15492724-15492803)
chr2 (33-122)||(10820528-10820615)
chr2 (117-167)||(34123153-34123203)
chr2 (1-67)||(44854321-44854387)
chr2 (375-435)||(1220808-1220868)
chr2 (372-452)||(22352047-22352126)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (1-174)||(38701937-38702108)
chr1 (1-173)||(38162861-38163035)
chr1 (1-167)||(42769997-42770165)
chr1 (1-174)||(18043173-18043348)
chr1 (13-167)||(15227763-15227918)
chr1 (1-174)||(14350279-14350452)
chr1 (8-175)||(24178462-24178630)
chr1 (1-174)||(17333284-17333456)
chr1 (1-174)||(51065748-51065923)
chr1 (1-167)||(12072069-12072237)
chr1 (1-174)||(5694332-5694507)
chr1 (1-174)||(29657782-29657957)
chr1 (3-176)||(30294379-30294554)
chr1 (3-174)||(3784713-3784886)
chr1 (1-176)||(9266726-9266903)
chr1 (15-174)||(47010019-47010179)
chr1 (18-148)||(3097688-3097819)
chr1 (21-174)||(19031815-19031969)
chr1 (17-146)||(51368813-51368943)
chr1 (1-176)||(30657619-30657790)
chr1 (1-116)||(29210424-29210540)
chr1 (1-174)||(45431290-45431464)
chr1 (4-146)||(36446353-36446496)
chr1 (16-146)||(43286749-43286880)
chr1 (1-174)||(6770348-6770519)
chr1 (1-151)||(35985644-35985795)
chr1 (17-143)||(48071510-48071637)
chr1 (1-173)||(13961223-13961396)
chr1 (1-176)||(41730316-41730496)
chr1 (22-174)||(50128172-50128325)
chr1 (1-146)||(29683206-29683354)
chr1 (1-175)||(48383110-48383286)
chr1 (6-174)||(45449244-45449413)
chr1 (16-136)||(38335196-38335317)
chr1 (19-146)||(8472942-8473070)
chr1 (32-146)||(12306961-12307075)
chr1 (21-167)||(47532678-47532824)
chr1 (11-176)||(30217782-30217948)
chr1 (13-176)||(23473462-23473626)
chr1 (33-142)||(37315300-37315409)
chr1 (44-167)||(52431636-52431760)
chr1 (13-143)||(52749626-52749757)
chr1 (16-167)||(3838784-3838936)
chr1 (15-89)||(26228219-26228293)
chr1 (22-112)||(39497340-39497430)
chr1 (17-98)||(15282591-15282672)
chr1 (11-167)||(39081823-39081979)
chr1 (35-122)||(37503260-37503346)
chr1 (84-176)||(19010685-19010778)
chr1 (1-63)||(19011108-19011170)
chr1 (17-146)||(35700680-35700808)
chr1 (73-118)||(14881036-14881081)
chr1 (121-174)||(29210527-29210580)
chr1 (13-86)||(39912368-39912441)
chr1 (14-73)||(10976004-10976063)
chr1 (1-176)||(28725903-28726081)
chr1 (13-89)||(28481868-28481940)
chr1 (1-176)||(38595750-38595928)
chr1 (47-85)||(19011057-19011095)
chr1 (121-174)||(21112681-21112734)
chr1 (15-120)||(33644390-33644495)
chr1 (377-454)||(8174127-8174204)
chr1 (65-122)||(16590269-16590325)
chr1 (121-174)||(21117423-21117476)
chr1 (111-167)||(26228300-26228357)
chr1 (103-167)||(30664174-30664239)
chr1 (103-167)||(23822530-23822593)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-167)||(53692-53860)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (1-174)||(6110-6285)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (8-176)||(14915-15084)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (4-175)||(68289-68462)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-167)||(22972-23140)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (29-176)||(40959-41107)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (11-166)||(69248-69403)
scaffold0050 (15-122)||(33735-33841)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (15-146)||(851-983)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-143)||(116215-116359)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (50-176)||(10771-10898)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (3-175)||(691-864)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (6-116)||(7956-8066)
scaffold0674 (121-174)||(7916-7969)
[»] scaffold0549 (2 HSPs)
scaffold0549 (6-116)||(7305-7415)
scaffold0549 (121-174)||(7402-7455)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (1-176)||(304-480)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-166)||(95593-95759)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (20-166)||(25750-25896)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (21-147)||(146932-147059)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (1-176)||(19583-19759)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (1-159)||(50559-50719)
scaffold0045 (16-173)||(53358-53505)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (9-116)||(11029-11136)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (14-143)||(17502-17631)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (54-174)||(233918-234039)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (44-86)||(5094-5136)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 214 - 625
Target Start/End: Original strand, 48600977 - 48601387
Alignment:
Q  214 tatctttatttgcagaaatgtcgatttttaaaattattgaaattaattccctcaaaagaaaaactttaatcaaattagtttctatgtcaactatactcac 313  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48600977 tatccttatttgcagagatgtcgatttttaaaattattgaaattagttccctcaaaagaaaaactttaatcaaattagtttctatgtcaactatgctcac 48601076  T
Q  314 atgtgaatctaaacaattcatttgatagtttattcggttacatttataaacnnnnnnnctaattttttacatttattgaataattaatgtatctgaccta 413  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48601077 atgtgaatctaagcgatttatttgatagtttattcggtcacatttataaacaaaaaa-ctaattttttatatttattgaataactaatgtatctgaccta 48601175  T
Q  414 tatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaa-gnnnnnnnnnnnnnnnnataaatatgaacggagagagtgtttttcaaattttgtcgat 512  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |                ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48601176 tatgtaaatcgaataaattagttattcaatgaatctaaaaaagtttttctttttcttttataaatatgattggagagagtgtttctcaaattttgtcaat 48601275  T
Q  513 cttaaacctaataatccatgtagaatgaataatggagaactaaattgaaacaagagtatttgtttaaagctttcatcgtattaatctcttctttcatttc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48601276 cttaaacctaataatccatgtagaatgaata-tggagaactaaattgaaacaagagtatttgtttaaagctttcatcgtattaatctcttctttcatttc 48601374  T
Q  613 tcttccaccctat 625  Q
    |||||||||||||    
T  48601375 tcttccaccctat 48601387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4268997 - 4268820
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4268997 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 4268898  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4268897 agtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggacccat 4268820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 789705 - 789529
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  789705 accggtgcccccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 789606  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  789605 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggttagcgggaccca 789529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16536059 - 16536234
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536059 accggtgcccccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 16536158  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16536159 agtttccttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16536234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 43944518 - 43944694
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944518 accggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 43944617  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||  |||||||    
T  43944618 agtttccttttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagt-gcccgagggcaccggttagcaagacccat 43944694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 54897319 - 54897496
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54897319 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaac 54897418  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54897419 aatttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcaggacccat 54897496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18068054 - 18067886
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  18068054 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaat 18067955  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18067954 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagc 18067886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4089153 - 4089328
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4089153 accggtgcccctggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 4089252  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||    
T  4089253 agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcaccagttagcaggaccc 4089328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 7768957 - 7769124
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768957 ccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttcct 7769056  T
Q  108 tttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7769057 tttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 7769124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 29591203 - 29591375
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29591203 ggtgcccccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtcaaaaacagt 29591302  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29591303 ttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 29591375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43202558 - 43202384
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43202558 accggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 43202459  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43202458 agttttcttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 43202384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 15186254 - 15186425
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15186254 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 15186353  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15186354 agtttccttttatggtaataattccattttatgg------taaccagtgccccgggggcaccggttaacaggacccat 15186425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 12356272 - 12356432
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12356272 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgata 12356371  T
Q  117 ataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12356372 ataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcaggacccat 12356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47232047 - 47231881
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47232047 accggtgcccccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaac 47231948  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggtta 165  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47231947 agtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtta 47231881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19503279 - 19503107
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19503279 accggtgctcccgggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 19503180  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggac 172  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||| ||||    
T  19503179 gtttccttttattgtaataattcccttttatggtatgcttaactagtaccttgggggcatcggttagcgggac 19503107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 32217059 - 32217230
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32217059 ggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagt 32217158  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  32217159 tt-tttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttaacaggaccc 32217230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33108847 - 33108673
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33108847 accggtgcctccggggcactggttaaga-tatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataataaagtcaaaaac 33108749  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33108748 agtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 33108673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 37987947 - 37988113
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37987947 accggtgctccagggtaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaaca 37988046  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  37988047 gtttccttttattgtaataattctcttttatagtatgcttaaccaatcccccgaaagcaccggttag 37988113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 6164118 - 6164281
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6164118 gggcactggttaaggatatcaaaa-gaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagcaaaaaacagtttccttttat 6164216  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  6164217 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcaggacccat 6164281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32202647 - 32202481
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32202647 ccccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 32202548  T
Q  108 tttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||| |||||||| |||| | ||||||    
T  32202547 tttatgataataattccttttatgatatgcttaatcaatgtcccagaggcaccagttaacaggaccc 32202481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 50619110 - 50619271
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50619110 gggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtaaaaaacagtttccttttat 50619209  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  50619210 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccagg-ggcaccggttagcgggaccc 50619271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 28755632 - 28755803
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  28755632 accggtgtcccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagttagaaaca 28755731  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28755732 gtttccttttatgataatacttccttttatagtatgcttaacccatgcccc-gagacaccggttagcaggacc 28755803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 39843937 - 39844060
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843937 tggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 39844036  T
Q  119 aattcc-ttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  39844037 aattcctttttagggtatgcttaa 39844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 174
Target Start/End: Original strand, 36395139 - 36395285
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  36395139 tatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataataattcccttt 36395238  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||    
T  36395239 tatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccagttagcaggaccc 36395285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54945940 - 54945778
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  54945940 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgttttat 54945841  T
Q  113 ggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  54945840 ggt-ataattcctttttatggtatacttaaccagtgctccgga-acaccggttagcaggacccat 54945778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42898908 - 42898774
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttta- 111  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||     
T  42898908 gggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttctttttat 42898809  T
Q  112 -tggtaataattc-cttttatggtatgcttaacca 144  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42898808 gtggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 42898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24679804 - 24679668
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  24679804 gggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacaatttcc-tttat 24679706  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtacc 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24679705 ggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtacc 24679668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30387270 - 30387141
Alignment:
Q  39 gaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgc 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30387270 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatgc 30387171  T
Q  138 ttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||| || ||||| |||  |||||||||||    
T  30387170 ttaatcaataccctggaaacaccggttagc 30387141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 4220226 - 4220373
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  4220226 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttat-gtaata 4220324  T
Q  120 att-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||    
T  4220325 attcccttttatggtatgcttaacatgtgctccgtaggcaccggttagc 4220373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30154309 - 30154161
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30154309 tatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttccttatatgataataattctcttt 30154210  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  30154209 tatggtgtgcttaaccagtgccccgaaaacatcggttagcaggacccat 30154161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54656038 - 54655879
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  54656038 gggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttag 54655939  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggac 172  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  54655938 gataataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccgg-ggcaccggttagcaggac 54655879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Original strand, 50603254 - 50603392
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag-tttccttttatgg 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||     
T  50603254 cactggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatga 50603353  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccg 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50603354 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccg 50603392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 16820912 - 16821038
Alignment:
Q  49 agtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagta 147  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16820912 agtaattaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 16821011  T
Q  148 ccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16821012 ccccgggggcaccggttagcaggaccc 16821038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 55882708 - 55882860
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55882708 gggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 55882806  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||    
T  55882807 ggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcctcgggggcaccggttag 55882860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52533944 - 52533816
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52533944 cactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataattaattgataataaagtcgaaaacagtttccttttatggt 52533845  T
Q  116 aataatt-ccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52533844 aataattcccttttatggtatgtttaacc 52533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877245
Alignment:
Q  53 gttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatgg--tatgcttaaccagtacc 149  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  150 ccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39877271 ccggaggcacgggttagcaggacccat 39877245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3783676 - 3783534
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3783676 accggtgcctccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataataaagtcaaaaac 3783577  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3783576 agttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 3783534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 46148979 - 46149097
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttt 127  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46148979 tatgaaaaaggaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataattctcttt 46149078  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  46149079 tatggtatgtttaaccagt 46149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53656037 - 53655887
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||  |||||||||    
T  53656037 cacttgttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatggt 53655938  T
Q  116 aataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggtta 165  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  53655937 aataatttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtta 53655887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31680627 - 31680510
Alignment:
Q  11 ccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31680627 ccggacactggttaagggtatgaaaaagaaagttacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttcctttt 31680528  T
Q  111 atggtaataattcctttt 128  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  31680527 atggtaataattcatttt 31680510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5091772 - 5091610
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||| |||||| || |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5091772 gggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcataaacagtttccttttat 5091673  T
Q  113 ggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  5091672 agtaataattcccttttatg-tatgcttaaccagtgtccggga-gcaccggttagcaggacccat 5091610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 42815137 - 42815237
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc-cttttatggt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42815137 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctcttttatggt 42815236  T
Q  116 a 116  Q
    |    
T  42815237 a 42815237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 54054559 - 54054675
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54054559 accggtgccccgggggcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 54054658  T
Q  100 agtttccttttatggta 116  Q
    | |||||||||||||||    
T  54054659 aatttccttttatggta 54054675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 46688382 - 46688264
Alignment:
Q  4 ggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaa-----ggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaa 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||     | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46688382 ggtgcccccgaggcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaa 46688283  T
Q  98 acagtttccttttatggta 116  Q
     ||||||||||||||||||    
T  46688282 gcagtttccttttatggta 46688264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 49915185 - 49915301
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||      
T  49915185 gcactgattaaggatatgaaaaagaaatttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccttttataa 49915284  T
Q  115 taataa-ttccttttat 130  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49915285 taataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 41265514 - 41265616
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  41265514 tatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtttaac 41265612  T
Q  143 cagt 146  Q
    ||||    
T  41265613 cagt 41265616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268880
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatg 131  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||  |||||| || ||||| ||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttg 53268862  T
Q  132 gtatgcttaaccagtacc 149  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  53268863 gtatgcttaaccaatacc 53268880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 31517220 - 31517324
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt-ttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31517220 tatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgcttaa 31517319  T
Q  142 ccagt 146  Q
    |||||    
T  31517320 ccagt 31517324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 52697083 - 52697205
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||| ||||||    
T  52697083 ggttaaggatatgaaaaacaaaattatatagtagttaatacattaaaattatataa-taatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaata 52697181  T
Q  120 attc-cttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||| |||||||| |||| |||||    
T  52697182 attctcttttatgatatgtttaac 52697205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1432703 - 1432555
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      || ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  1432703 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatacattg------tg-aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatg 1432612  T
Q  114 gtaat--aattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
     ||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  1432611 ataataaaattctcttttataatatgcttaaccagtacctcagaagcaccggttagc 1432555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 50167615 - 50167685
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttata 85  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50167615 gggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 50167685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Original strand, 8133789 - 8133840
Alignment:
Q  71 tgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8133789 tgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataatt 8133840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17344800 - 17344714
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17344800 aaaaatgaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataaaaat-ttaaaaaaagtttctttttatggtaataa 17344714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28119978 - 28119913
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28119978 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggagacaccggttagc 28119913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Original strand, 54054662 - 54054715
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||    
T  54054662 ttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttggcaggaccc 54054715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53004060 - 53003956
Alignment:
Q  71 tgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccg 169  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| | | ||||||||||| |    
T  53004060 tgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccgggacaccggttagcag 53003961  T
Q  170 gaccc 174  Q
    |||||    
T  53003960 gaccc 53003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 292229 - 292294
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  292229 ttccttttatggtaaaaatttcctttttttgcatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 292294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37402830 - 37402766
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37402830 ttccttttatggtaagaatttccttttttgtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagc 37402766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28120121 - 28120058
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggtta 165  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  28120121 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggtta 28120058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7277517 - 7277447
Alignment:
Q  385 tttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| || ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7277517 tttattgaataactcatgtatctgatctatataaaagtcagatacattagttattcaatgaacctaaaaag 7277447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34651007 - 34650833
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34651007 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 34650908  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34650907 gtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34650833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13661819 - 13661994
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13661819 accggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaac 13661918  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13661919 agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 13661994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 8787358 - 8787525
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8787358 ccccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcct 8787457  T
Q  108 tttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8787458 tttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 8787525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35504415 - 35504241
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504415 accggtgcccccgggacactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 35504316  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||    
T  35504315 agttcccttttatggcaataattcccttttatggtatgcttaacccgt-gtccgggggcaccggttagcaggaccc 35504241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10054527 - 10054351
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10054527 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtc-aaaac 10054429  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  10054428 agtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggtaccggttagcaggacccat 10054351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21547568 - 21547392
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21547568 accggtgtccccgggcatcggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 21547469  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21547468 gtttcattttaagttaataattctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcaggacccat 21547392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 35132533 - 35132707
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35132533 accggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 35132632  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35132633 agttttc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 35132707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11958142 - 11957967
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11958142 accggtgcccccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 11958043  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  11958042 agtttccttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 11957967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 12506322 - 12506459
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12506322 gcactcgttaagagtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatag 12506421  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagtacccc 151  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12506422 taataattctcttttatggaatgcttaaccagtgcccc 12506459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40564557 - 40564404
Alignment:
Q  22 ttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 121  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40564557 ttaaggatttgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataat 40564458  T
Q  122 tc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  40564457 tctcttttatggtatgcttaaccaataccccaagggcaccggttagcaggaccc 40564404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 6283573 - 6283741
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6283573 accggtgcctccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 6283672  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  6283673 aattttcttttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccctaggggcaccggttagc 6283741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 13470175 - 13470288
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13470175 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 13470274  T
Q  113 ggtaataattcctt 126  Q
    ||||||||| ||||    
T  13470275 ggtaataatacctt 13470288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9721782 - 9721640
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggc-actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9721782 accggtgtcctcgggctactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaac 9721683  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaa 141  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9721682 agttttcttttatgataataattcccttttatggtatgtttaa 9721640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 11846085 - 11846235
Alignment:
Q  3 cggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 101  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  11846085 cggtgtccccgggacactagctaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagtag 11846184  T
Q  102 tttccttttatggtaat-aattccttttatggtatgcttaaccagtacccc 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11846185 tttccttttatggtaataaatcccttttatagtatgcttaaccagtgcccc 11846235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 10069980 - 10070095
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  10069980 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaac 10070078  T
Q  100 agtttccttttatggta 116  Q
    |||||| ||||||||||    
T  10070079 agtttctttttatggta 10070095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19647820 - 19647717
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19647820 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcataaacagtttccttttat 19647721  T
Q  113 ggta 116  Q
    ||||    
T  19647720 ggta 19647717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 31909643 - 31909793
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31909643 accggtgcctccggatactggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaaca 31909742  T
Q  101 gtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggag 155  Q
    ||||||     || |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31909743 gtttcc-----tgataataattttcttttatggtatgcttaaccagtatcccggag 31909793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Original strand, 10955997 - 10956130
Alignment:
Q  34 aaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatgg 132  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10955997 aaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttataacaaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatga 10956095  T
Q  133 tatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  10956096 tatgcttaaccagtaccccgaatgtaccggttagc 10956130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 40057326 - 40057495
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  40057326 ccccagggcaccgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttct 40057425  T
Q  108 tttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| | || |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  40057426 tttatagtaatatttcccttttatgatgtgtttaaccagtgacctcgaggcaccggttagcaggacccat 40057495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 20175254 - 20175381
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    ||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  20175254 cactggttaaaaatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgat 20175353  T
Q  116 aataatt-ccttttatggtatgcttaac 142  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  20175354 aataattcccttttataatatgcttaac 20175381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39067095 - 39066973
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagt-agttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  39067095 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatgg 39066996  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatg 136  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  39066995 taataattctcttttatgttatg 39066973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 4837269 - 4837369
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4837269 accggtgccccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaataca 4837368  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  4837369 g 4837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 39069405 - 39069527
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa-tgtcaaaaacagtttcctttta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  39069405 gggcactggttaagggtatgaaaa-ggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaatta---tataataattgtgaaaaacaatttcctttta 39069500  T
Q  112 tggtaataattc-cttttatggtatgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  39069501 tggtaataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Original strand, 4268620 - 4268739
Alignment:
Q  47 atagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccag 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  4268620 atagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaaataaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacccg 4268718  T
Q  146 taccccggaggcaccggttag 166  Q
    |  || || ||||||||||||    
T  4268719 tgtccagggggcaccggttag 4268739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19436995 - 19436866
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||    
T  19436995 cactcgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaagttaaaaatagttt-tttttatggt 19436898  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  19436897 aataattctcttttatggtatgtttcaccagt 19436866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2619716 - 2619643
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa 89  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2619716 cacttgttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 2619643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19647730 - 19647676
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19647730 ttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagccggaccca 19647676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 6284822 - 6284892
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 86  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  6284822 cactggttaaggatactaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30889502 - 30889437
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30889502 ttccttttatgataaaaatttcctttttttgtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagc 30889437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10956002 - 10955958
Alignment:
Q  123 ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10956002 ccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaacagttagc 10955958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Original strand, 31467834 - 31467908
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||  |||||||    
T  31467834 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccagggacaccggttagcaagacccat 31467908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 421
Target Start/End: Original strand, 42069781 - 42069827
Alignment:
Q  375 attttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaa 421  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  42069781 attttttaaatttattgaataattgatgtatttgatctatatataaa 42069827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14214121 - 14214056
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  14214121 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgtcccgggggcaccggttagc 14214056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 24438488 - 24438665
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24438488 accggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 24438587  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24438588 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccat 24438665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24798577 - 24798402
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24798577 accggtgcccccgggcacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 24798478  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  24798477 gtttccttttatggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcaggaccca 24798402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 34333295 - 34333469
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34333295 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtc-aaaac 34333393  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34333394 agtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34333469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29993659 - 29993485
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  29993659 ggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaat 29993560  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29993559 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggttagcaggacccat 29993485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 5239296 - 5239473
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5239296 accggtgcctccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 5239395  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  5239396 agtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacttgtgcccccggggcactggttagcaggacccat 5239473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 34606285 - 34606447
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34606285 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 34606384  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  34606385 ggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcaggaccc 34606447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 45045799 - 45045935
Alignment:
Q  18 ctggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45045799 ctggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataa 45045898  T
Q  118 taatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45045899 taattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgg 45045935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42044459 - 42044301
Alignment:
Q  9 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42044459 ccccgggcaccggttaaaggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttctt 42044360  T
Q  109 ttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42044359 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagc 42044301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 28587921 - 28588074
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28587921 accggtgcccccggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 28588020  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28588021 attttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccgg 28588074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8754745 - 8754606
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  8754745 gcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttgttttatgg 8754646  T
Q  115 taataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8754645 taataatttccttttatggtatgcttaactagtaccccgg 8754606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12218611 - 12218437
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||     
T  12218611 accggtgcccccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaaataaaaaat 12218512  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  12218511 agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgg-gacaccggttagcaggaccc 12218437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 30810679 - 30810833
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30810679 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 30810778  T
Q  113 ggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||| | || |||||||||    
T  30810779 ggtaataattttcttttatggtatgtttaaccaatgccccaggggtaccggttag 30810833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 18485972 - 18486140
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18485972 accggtgcccccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaac 18486071  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  18486072 agtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggttagc 18486140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 4628590 - 4628753
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4628590 gggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataataaagtcagaaacagtttacttttat 4628689  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||| |||||||    
T  4628690 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttaggggcaccggttagcaggaccca 4628753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 1737004 - 1737158
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  1737004 gggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagttaaaaacattttccatttat 1737103  T
Q  113 ggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1737104 gataataattcattttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagc 1737158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 47839504 - 47839658
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47839504 accggtgtcccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 47839603  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccgga 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  47839604 gtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgccccgga 47839658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 525234 - 525075
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  525234 cactggttaaagatatgaaaaagaaaagtatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggt 525135  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  525134 aataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccgga-gcaccggttagcaggaccca 525075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11686482 - 11686324
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag--tttccttttatgg 114  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||    
T  11686482 actggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttttatgg 11686383  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11686382 taataattctcttttatgatatgcttaacctgta-cccggaggcaccggttagcaggacc 11686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23363341 - 23363167
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23363341 accggtgtcccggagcactcgttaaggataagaaaaaggaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaaca 23363242  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||    
T  23363241 gtttccttttatggtaatatttctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgaaaacaccgattagcaggaccc 23363167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Original strand, 5729372 - 5729531
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||| |    
T  5729372 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaataattttcttttatag 5729471  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  5729472 taataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcctcggaggcacaggttagcaggacc 5729531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43594195 - 43594064
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  43594195 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctcttatgat 43594096  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43594095 aataattctcttttatggtatgcttaaccagt 43594064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13065033 - 13064883
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtc-aaaaacagtttccttttatggtaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13065033 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaacagtttccttttatggtaa 13064934  T
Q  118 taatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||    
T  13064933 taattcccttttatggtatgcttaaccagtgctctaggggcaccggttagc 13064883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27456284 - 27456175
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27456284 ggtgcccccgggcactggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtt 27456185  T
Q  104 tccttttatg 113  Q
    ||||||||||    
T  27456184 tccttttatg 27456175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 47657004 - 47657156
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||    
T  47657004 gggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagttt--ttttat 47657101  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  47657102 ggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgcctc-gaagcaccggttagc 47657156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7689359 - 7689228
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7689359 cactgattaaggatataaaaaaggaaattttacagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 7689260  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7689259 aataattctcttttatggtatacttaaccagt 7689228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 47083086 - 47083232
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47083086 ggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 47083185  T
Q  120 att-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  47083186 attcccttttatgatatgtttaaccaatgctccgg-ggcaccggttag 47083232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 28262042 - 28262201
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  28262042 accggtgcctccgggtcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataataaaatcaaaaac 28262136  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggt 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  28262137 agtttccttttatagtaataattcttttttatggtatgcttaaccaatgccctggaagcaccggt 28262201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Original strand, 18117183 - 18117310
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttt 127  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||    
T  18117183 tatgaaagaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttatagtaataatttcattt 18117282  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccccggag 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18117283 tatggtatgcttaaccagtgccctggag 18117310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34546469 - 34546373
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34546469 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagtaaagtcaaaaacagtttacttttatggta 34546373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 46716668 - 46716793
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  46716668 tggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatattttccttttatgataat 46716767  T
Q  119 aatt-ccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  46716768 aattcccttttatggtatgtttaacc 46716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37631704 - 37631604
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37631704 gggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttat 37631605  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  37631604 g 37631604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 33636479 - 33636610
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||    
T  33636479 cactagttaagaatatgaaaaagaaaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggt 33636578  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33636579 aataattctattttatggtatgcttaaccagt 33636610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674106
Alignment:
Q  39 gaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa--ttccttttatggtatg 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||  ||  ||||||||||||    
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat-ataattttttttttatggtatg 37674142  T
Q  137 cttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||  ||  | ||||||||||||| ||||||    
T  37674141 cttaaccagtgtcc--ggggcaccggttagcaggaccc 37674106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23357861 - 23357717
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  | |    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23357861 gttaaggatatgaaaaagaaaattgtatagtagttaatgcatttcagta---taattaatttataaaaaagtcaaaaacagtttccatttatgataataa 23357765  T
Q  121 ttc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23357764 ttctcttctatgatatgcttaaccagtgccccggagacaccgattagc 23357717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 4087650 - 4087776
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4087650 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa-agtttcaaaaacagttt-cttttatggt 4087747  T
Q  116 aat--aattccttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  4087748 aataaaattccttttttggtatgtttaac 4087776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220704
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat-aattccttttatg 131  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18220812 aaaaaggaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataaattccttttttg 18220714  T
Q  132 gtatgcttaa 141  Q
    |||| |||||    
T  18220713 gtatccttaa 18220704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 22739868 - 22739957
Alignment:
Q  34 aaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatg-tcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22739868 aaaaggaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatggtaataatt 22739957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18470115 - 18469993
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg--cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaa 98  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||    
T  18470115 accggtgcccccgggggcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga-aaagtcaaaaa 18470017  T
Q  99 cagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  18470016 cagttacattttatggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4100684 - 4100595
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttt 104  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4100684 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagttt 4100595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29835860 - 29835735
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag-tttccttttatggtaa 117  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||| || |||||||| |||  |||||||||||    
T  29835860 tggttaaagatatgaaaaaggaagttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaa 29835761  T
Q  118 taattc-cttttatggtatgcttaac 142  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||    
T  29835760 taattctattttatggtatgcttaac 29835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 36437405 - 36437507
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  36437405 actggttaaggatactaaaaaggtaattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttcttttatgata 36437503  T
Q  117 ataa 120  Q
    ||||    
T  36437504 ataa 36437507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118041
Alignment:
Q  64 gaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattc 47118041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Original strand, 35985291 - 35985369
Alignment:
Q  377 tttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  35985291 tttttagattaattgaataactaatgtatatgacctatatataagtcaaatacattagttattcaattaatctaaaaag 35985369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Original strand, 36006699 - 36006777
Alignment:
Q  377 tttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36006699 tttttagattaattgaataactaatgtatatgacctatatataagtcaaatacattagttattcaattaatctaaaaag 36006777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 38128406 - 38128471
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38128406 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagc 38128471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18220697 - 18220601
Alignment:
Q  9 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 106  Q
    |||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  18220697 ccccgggcgctggttaagaatactaaaaaggaaattatatagtaattactgtattgaaattgtgtaattaatttgtaa-attatcaaaaacagtttcc 18220601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 3021912 - 3021988
Alignment:
Q  10 cccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 86  Q
    |||||| || |||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  3021912 cccgggtacgggttaagcatattaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaatttataa 3021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 130
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  51 tagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttat 130  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 122
Target Start/End: Original strand, 20116940 - 20117022
Alignment:
Q  39 gaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20116940 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtagtaaatttttaa-aaggccaaaaacagttttcttttatgataataatt 20117022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 29229770 - 29229703
Alignment:
Q  388 attgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  29229770 attgaataactaatgtatctgacctatatatagaccaaatgcattagttgtttaatgaatctaaaaag 29229703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18220593 - 18220509
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||||||| ||  |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18220593 ggttaaggatactaaaaagaaaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa-attgtcaaaaacaatttc 18220509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 445
Target Start/End: Original strand, 42927027 - 42927084
Alignment:
Q  388 attgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatga 445  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  42927027 attgaataactaatgtatttgatctatatataaatcgaatacattatttattcaatga 42927084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 6097355 - 6097525
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaagg-aaactatatagtagttaatgcattgaaa-ttatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  | ||||| || | || |    
T  6097355 ccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattatttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-c 6097453  T
Q  106 cttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6097454 cttttatggtaagaatttcctttttttatatgcttaacccgtgccccggaggcactggttagcatgacccat 6097525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25778418 - 25778372
Alignment:
Q  373 taattttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatata 419  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25778418 taattttttcgatttattgaacaactaatgtatctgacctatatata 25778372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35985368 - 35985290
Alignment:
Q  377 tttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||  ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  35985368 tttttagattaattgaataactaatgtatttgacttatatataggtcatatacattagttattcaattaatctaaaaag 35985290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 36006776 - 36006698
Alignment:
Q  377 tttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||  ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36006776 tttttagattaattgaataactaatgtatttgacttatatataggtcatatacattagttattcaattaatctaaaaag 36006698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 421
Target Start/End: Original strand, 24283094 - 24283139
Alignment:
Q  376 ttttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaa 421  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24283094 ttttttaaattcattgaataactaatgtatctgacatatatataaa 24283139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30675747 - 30675574
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30675747 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 30675648  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  30675647 agtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacc 30675574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 168477 - 168652
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  168477 accggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 168576  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  168577 agtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 168652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16888718 - 16888542
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16888718 accggtgcccccgggcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 16888619  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16888618 gtttccttttatggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccat 16888542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 21595858 - 21596025
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21595858 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 21595957  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  21595958 gtttccttttatggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacactggttagc 21596025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 34228693 - 34228869
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34228693 accggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 34228792  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34228793 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccca 34228869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2805431 - 2805260
Alignment:
Q  5 gtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  2805431 gtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataataaagtcaaaagcagtt 2805332  T
Q  104 tccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2805331 tccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagccggaccc 2805260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4537919 - 4537744
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4537919 accggtgcctccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataataaagtcaaaaac 4537820  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4537819 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcaggaccc 4537744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27988674 - 27988500
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27988674 accggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 27988575  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27988574 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 27988500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28045976 - 28045802
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28045976 accggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 28045877  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28045876 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 28045802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33357301 - 33357150
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33357301 ggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagt 33357202  T
Q  103 ttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33357201 ttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccgg 33357150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 12203866 - 12204012
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203866 accggtgcccccgggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 12203965  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12203966 gtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagt 12204012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 12448294 - 12448440
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12448294 accggtgcccccgggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 12448393  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12448394 gtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagt 12448440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16394236 - 16394060
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16394236 accggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaac 16394137  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16394136 agtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccca 16394060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 36730459 - 36730629
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36730459 ggtgccccaggacactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtt 36730558  T
Q  104 tccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||    
T  36730559 tccttttatggtaataattctcttttatagtatgcttaacctgtgcccc-gtggcaccggttagccagaccc 36730629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20831728 - 20831551
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20831728 accggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaagtcaaaagc 20831629  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||||||||    
T  20831628 agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgctcccgggacaccggttagcaggacccat 20831551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42035154 - 42034981
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42035154 cggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaa 42035055  T
Q  102 tttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  42035054 ttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacacgtgccccagagacaccggttagcgggaccc 42034981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 11112666 - 11112825
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  11112666 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 11112765  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  11112766 aataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcaggaccc 11112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13643023 - 13643197
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13643023 accggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa- 13643121  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||| ||||||    
T  13643122 aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccc 13643197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13743448 - 13743622
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13743448 accggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa- 13743546  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||| ||||||    
T  13743547 aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccc 13743622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29444315 - 29444140
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29444315 accggtgctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 29444216  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  29444215 agttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccgattaacaggaccc 29444140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9063226 - 9063052
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9063226 accggtgtcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataataaagtcaaaaaca 9063127  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9063126 attttcttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaggaccc 9063052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16890634 - 16890482
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890634 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 16890535  T
Q  121 ttcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggac 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||| ||||    
T  16890534 ttcctttttatggtatgcttaaccggtgcctccggggcaccggttagcaggac 16890482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 4648206 - 4648353
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4648206 accggtgtcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 4648305  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagta 147  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4648306 gtttcttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagta 4648353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304516
Alignment:
Q  22 ttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 121  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataat 7304572  T
Q  122 tc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  7304571 tctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagtaggacccat 7304516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 37373217 - 37373378
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  37373217 accggtgcccccggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcgaaaaca 37373316  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  37373317 gttttcttttatggtaataattccctttcatggtatgcttaacccgtgtcccggagacaccg 37373378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9537982 - 9537822
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||| |||    
T  9537982 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatagta 9537883  T
Q  117 ataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9537882 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcaggacccat 9537822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 43119228 - 43119403
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43119228 accggtgccctcggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaac 43119327  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43119328 agttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccgg-ggcaccggttagcaggaccca 43119403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9254068 - 9253909
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  9254068 ccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaacagtttcct 9253970  T
Q  108 tttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||    
T  9253969 tttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagc 9253909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 16785098 - 16785241
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16785098 accggtgctccagggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 16785197  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaacc 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16785198 gtttccttttataataataattctcttttatggtatgattaacc 16785241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 40831302 - 40831465
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  40831302 ggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg 40831401  T
Q  114 gtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  40831402 gtaataattttcttttatagtatgcataatctgtaccctggagacaccggttagcaggacccat 40831465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3930405 - 3930256
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3930405 cggtgcccccgggcactagttaataatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagt 3930306  T
Q  103 ttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtacccc 151  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3930305 ttccttttttgataataatttccttttatgatatgcttaaccagtgcccc 3930256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 32113938 - 32114095
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttt-ccttttatggtaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  32113938 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtaaaaaacagtttcccttttatgataa 32114037  T
Q  118 taatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  32114038 taattcccttttatagtatgtttaaccagtgctccagagccaccggttagcaggaccc 32114095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 28626792 - 28626946
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28626792 gggcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 28626891  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||    
T  28626892 gataataattcccttttatggtatgcttaatcagtgtccggga-gcaccggttagc 28626946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Original strand, 22956730 - 22956860
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956730 gggcactggttaagagtataaaaaaggaatc-atatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 22956828  T
Q  113 ggtaataattcc---ttttatggtatgcttaa 141  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  22956829 ggtaaaaattcccttttttatggtatgtttaa 22956860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42433685 - 42433551
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatg 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42433685 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttttg 42433587  T
Q  132 gtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||| ||| |   || ||||||||||||||||||||    
T  42433586 gtatacttcatttgtgccccggaggcaccggttagc 42433551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 172
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407024
Alignment:
Q  52 agttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccc 150  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgccc 39407004  T
Q  151 cggaggcaccggttagccggac 172  Q
    ||  ||||||||||||| ||||    
T  39407005 cg--ggcaccggttagcaggac 39407024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Original strand, 10870382 - 10870487
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10870382 tggttaatgatataaaaaagaaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaat 10870481  T
Q  119 aattcc 124  Q
    ||||||    
T  10870482 aattcc 10870487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 29235268 - 29235423
Alignment:
Q  22 ttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa- 120  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||     
T  29235268 ttaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataataaaatcaaaaataggttccttttatgataataat 29235367  T
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||   |||||||||||  |||||||    
T  29235368 ttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcatgacccat 29235423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843279
Alignment:
Q  61 attgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcac 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtattcggga-gcac 24843295  T
Q  160 cggttagccggaccca 175  Q
    |||||||| |||||||    
T  24843294 cggttagcaggaccca 24843279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 34192815 - 34192902
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||    
T  34192815 tatgaaaaaggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattttattttatggta 34192902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 9278239 - 9278317
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtca 94  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9278239 cactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtca 9278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 22451839 - 22451916
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22451839 tatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatt 22451916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 17467630 - 17467725
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttta 111  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  17467630 cactagttaatgatatgaaaaaggaaattatgcagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaatcaaaaacaatttcctttta 17467725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 12652641 - 12652707
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaa 66  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12652641 accggtgcccctggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 10618042 - 10618123
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtca 94  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  10618042 gggcacaggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataaagtca 10618123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30933452 - 30933376
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  30933452 tatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 455
Target Start/End: Original strand, 14578545 - 14578612
Alignment:
Q  388 attgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  14578545 attgaataattaatgtatctgatctatatatagacccgatatattatttgttcaatgaatctaaaaag 14578612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 409
Target Start/End: Original strand, 42662712 - 42662745
Alignment:
Q  376 ttttttacatttattgaataattaatgtatctga 409  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42662712 ttttttaaatttattgaataattaatgtatctga 42662745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 392107 - 392282
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  392107 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 392206  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  392207 agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 392282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 3515777 - 3515954
Alignment:
Q  1 accggtgccccc-gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515777 accggtgcccccagggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 3515876  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  3515877 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcaggacccat 3515954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4215706 - 4215881
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215706 accggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 4215805  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  4215806 agtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccc 4215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32929683 - 32929508
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32929683 accggtgcccccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 32929584  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32929583 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 32929508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 23402162 - 23402324
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23402162 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 23402261  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23402262 ggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 23402324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12145292 - 12145115
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12145292 accggtgcccccagtgcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 12145193  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12145192 agtttccttttatgataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcaggacccat 12145115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 2350663 - 2350831
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2350663 accggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaat 2350762  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2350763 agtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagc 2350831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 27433503 - 27433671
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  27433503 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaat 27433602  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  27433603 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagc 27433671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18276786 - 18276612
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18276786 ggtgcccctgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtt 18276687  T
Q  104 tccttttatggtaataa-ttccttttatgg---tatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18276686 tccttttatggtaataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcaggaccc 18276612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26467286 - 26467131
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26467286 gggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttat 26467187  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26467186 ggtaataattcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagc 26467131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32985368 - 32985200
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32985368 accggtgccctcggggcattggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 32985269  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32985268 agtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 32985200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 2580980 - 2581138
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  2580980 actggttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatggta 2581079  T
Q  117 ataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  2581080 ataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcaggaccc 2581138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3026175 - 3026016
Alignment:
Q  9 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3026175 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaacagttttctt 3026076  T
Q  109 ttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  3026075 ttatcgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagc 3026016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7851334 - 7851166
Alignment:
Q  1 accggtgccccc-gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7851334 accggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 7851235  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||  ||| |||||||||||    
T  7851234 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaactcgtgccctagagacaccggttagc 7851166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29451286 - 29451146
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  29451286 ggtgcctccgggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataataaagtcaaacacagtt 29451187  T
Q  104 tccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29451186 tccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacc 29451146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 12525730 - 12525905
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggc-actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12525730 accggtgcctccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataataatgtcaaacac 12525829  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| | |  |||||||||| ||||||    
T  12525830 agtttcattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccccagggataccggttagcaggaccc 12525905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 31280332 - 31280503
Alignment:
Q  1 accggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31280332 accggtgctcccgaggcactgattaagagaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaac 31280431  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
     |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31280432 ggtttccttttatagtaataattc----tatggtatgcttaacgagt-gcccggaggcaccggttagcaggacccat 31280503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1391352 - 1391206
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1391352 accggtgctccggggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaaca 1391253  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1391252 gttttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagt 1391206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 35043917 - 35044065
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35043917 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 35044015  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggtta 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35044016 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggtta 35044065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21878522 - 21878398
Alignment:
Q  1 accggtgcc-cccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21878522 accggtgcctcccgggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaac 21878423  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  21878422 agtttctttttatggtaataattcc 21878398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13417124 - 13416960
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataat---gtcaaaaacagtttccttt 109  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  13417124 gggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttt 13417025  T
Q  110 tatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13417024 tatggtaataattctcttttataatatgcttaaccagt-gcccggaggcaccggttagctggaccc 13416960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 29978244 - 29978417
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  29978244 accggtgcctccggacactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataataaagtcaaaaaca 29978343  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  29978344 gtttaattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagcgccctgga-acaccggttagcaggaccc 29978417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34477719 - 34477609
Alignment:
Q  6 tgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34477719 tgcccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttc 34477620  T
Q  106 cttttatggta 116  Q
    |||||||||||    
T  34477619 cttttatggta 34477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 20897959 - 20898075
Alignment:
Q  1 accggtgccccc-gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20897959 accggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaac 20898058  T
Q  100 agtttccttttatggta 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  20898059 agtttccttttatggta 20898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 5323426 - 5323573
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5323426 gcactgattaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatgg 5323525  T
Q  115 taataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccg 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  5323526 taataattcccttttatggtatgcgtaaccggtgccctggaggcaccg 5323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25165569 - 25165413
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25165569 tggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 25165470  T
Q  119 aattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  25165469 aattctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggttagcaggaccc 25165413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11115256 - 11115106
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  11115256 ggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttatg 11115159  T
Q  114 gtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  11115158 gtaataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccccgg-gacaccggttag 11115106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1840417 - 1840254
Alignment:
Q  5 gtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1840417 gtgcccccgagcactggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagttt 1840318  T
Q  105 ccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||  |||||||||||    
T  1840317 cctttcatggtaataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccctagaaacaccggttagc 1840254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 28225252 - 28225398
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28225252 ggttaaggatatgaaaaaggaat-tatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaata 28225350  T
Q  120 att-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||||    
T  28225351 attcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttag 28225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 34396702 - 34396596
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34396702 accggtgcccccaggacacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 34396603  T
Q  100 agtttcc 106  Q
    |||||||    
T  34396602 agtttcc 34396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34851995 - 34851877
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34851995 tatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaataatttccttttatagtaataattctcttt 34851896  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  34851895 tataatatgcttaaccagt 34851877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961164
Alignment:
Q  31 tgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-ctttta 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctctttta 961150  T
Q  130 tggtatgcttaacc 143  Q
    ||||||||||||||    
T  961151 tggtatgcttaacc 961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23629750 - 23629607
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23629750 accgatgccccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataataaagtcaaaaaca 23629651  T
Q  101 gtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaacc 143  Q
     ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23629650 atttccttttatgacaataattttcttttatgttatacttaacc 23629607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 9660997 - 9661165
Alignment:
Q  1 accggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||| |    
T  9660997 accggtgccctcgtggcaccagttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaagttaaaagc 9661096  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  9661097 agtttccttttatggtaataattccattttataatatgtttaatcagtaccccagagtcatcggttagc 9661165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 13529479 - 13529554
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 88  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13529479 gggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Original strand, 20898062 - 20898116
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20898062 ttccttttatggtatgcttaacctgtgccccgg-ggcaccggttagccggacccat 20898116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Original strand, 28564322 - 28564388
Alignment:
Q  75 attaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat-aattccttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  28564322 attaatttataa-aatctcaaaaacagtttccttttatggtaataaattccttttttggtatccttaa 28564388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34477622 - 34477569
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34477622 ttccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccc 34477569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 34706835 - 34706900
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34706835 ttccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 34706900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417358
Alignment:
Q  99 cagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgccccgg 22417358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 167
Target Start/End: Original strand, 34494276 - 34494331
Alignment:
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34494276 ggtaataattctcttttgttgtatgcttaaccaataccccggaggcaccggttagc 34494331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24227506 - 24227428
Alignment:
Q  57 atgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtc-aaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  24227506 atgcattgaatttatgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaagttttcttttatgataataacttccttttttggta 24227428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12525756 - 12525726
Alignment:
Q  137 cttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525756 cttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 12525726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34712197 - 34712132
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  34712197 ttccttttatggtaagaatttccattttttgtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagc 34712132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 28562694 - 28562774
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattta 83  Q
    ||||||||| || ||| |||||| | ||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28562694 cggtgccccgggacaccggttaatgatattaaaatagaaactatatagtaattaacgtattaaaattctgtaattaattta 28562774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 52520692 - 52520867
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52520692 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 52520791  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52520792 agtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 52520867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 39074430 - 39074604
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39074430 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtc-aaaac 39074528  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  39074529 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 39074604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 49893342 - 49893519
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49893342 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaaac 49893441  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49893442 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagccggacccat 49893519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 43786882 - 43787057
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43786882 accggtgcctccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaac 43786981  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43786982 agtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 43787057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 272231 - 272408
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  272231 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaat 272330  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  272331 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcaggacccat 272408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 46352645 - 46352822
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  46352645 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaac 46352744  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46352745 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggacccat 46352822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 858600 - 858775
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  858600 accggtgcccccagtgcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 858699  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  858700 agtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagccggaccc 858775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10617458 - 10617283
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10617458 accggtgcccccggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 10617359  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10617358 atttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccca 10617283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53489991 - 53489824
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53489991 ccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 53489892  T
Q  108 tttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  53489891 tttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgccccggtggcaccagttaaccggaccc 53489824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4168194 - 4168369
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggca-ctggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4168194 accggtgcctccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 4168293  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4168294 agttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcaggaccc 4168369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 48725282 - 48725457
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48725282 accggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 48725381  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  48725382 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggaccacgggttagcaggaccc 48725457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43269899 - 43269739
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  43269899 gcactggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaacacagtttccttttatag 43269800  T
Q  115 taataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43269799 taataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 43269739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 20924016 - 20924150
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20924016 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttccttttaa 20924115  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20924116 ggtaataattctcttttatggtatacttaaccagt 20924150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 7468428 - 7468596
Alignment:
Q  7 gcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  7468428 gcccccgggacactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagtttt 7468527  T
Q  106 cttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7468528 cttttatgataataatcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgga-gcaccggttagcaggaccca 7468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 41304016 - 41304182
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41304016 accggtgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaatt--gtaattaattgataataaagtcaaaaac 41304113  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  41304114 agtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccccggagacaccggttagc 41304182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41554111 - 41553972
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41554111 ggtgccccggtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtt 41554012  T
Q  104 tccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41554011 tccttttatggtaataattattttttatggtatgcttaac 41553972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40362742 - 40362580
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40362742 gggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 40362643  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||    
T  40362642 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggtaccgattagcaggaccc 40362580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2938211 - 2938040
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2938211 ggtgcccctgggtactggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatt 2938112  T
Q  104 tccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  2938111 tcattttatggtaataattcacttttatggtatgcttaacgagtaccccgagggcaccggttagcaggaccc 2938040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49529441 - 49529275
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatata---gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49529441 cggtgccccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaac 49529342  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||    
T  49529341 attttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagt--gccgggggcaccggttagc 49529275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11308369 - 11308211
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11308369 cactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaaatcaaaaatagtttccttttatggt 11308270  T
Q  116 aataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  11308269 aataattccttttatggtatgcttaaccaatgccccaggggcaccgattagcaggaccc 11308211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 18014686 - 18014851
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  18014686 ggtgcccccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagt 18014785  T
Q  103 ttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  18014786 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagc 18014851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842807
Alignment:
Q  46 tatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaacca 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  145 gtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  6842776 gtgccccgggggcagcggttagcaggacccat 6842807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 42548120 - 42548273
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  42548120 ggcactgcttaaagatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatg 42548219  T
Q  114 gtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  42548220 gtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgg-gacaccggttagc 42548273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42964411 - 42964277
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42964411 gggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 42964312  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42964311 agtaataattcacttttatgatatgcttaaccagt 42964277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 22248908 - 22249065
Alignment:
Q  11 ccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttt 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22248908 ccgggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctttt 22249007  T
Q  111 atggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  22249008 atggtaataattcccttttatagtatgcttgaccaataccctagaagcaccggttagc 22249065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 2505379 - 2505523
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2505379 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaat 2505478  T
Q  119 aatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgg 162  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  2505479 aattcccttttatggtatgtttaaccagtgccctgggggcaccgg 2505523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 50359357 - 50359185
Alignment:
Q  4 ggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtt 103  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50359357 ggtgccccgtggcactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaagtcaaaaacagtt 50359258  T
Q  104 tccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    | ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  50359257 ttcttttgtggtaataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggttaaccggaccca 50359185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 2119456 - 2119577
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  2119456 ggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttat- 2119554  T
Q  114 gtaataattccttttatggtatg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2119555 gtaataattccttttatggtatg 2119577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Original strand, 33140940 - 33141064
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  33140940 tatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaat 33141039  T
Q  143 cagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  33141040 cagtaccccggaagcaccggttagc 33141064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41993761 - 41993627
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatg 131  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  41993761 aaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataattctcttttatg 41993663  T
Q  132 gtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  41993662 gtatgcttaactagtaccctaaaggcaccggttagc 41993627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50395737 - 50395563
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50395737 accggtgcccccgggacactggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaagtc-aaaac 50395639  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  50395638 aatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtacaccggagacaccgattagcaggaccc 50395563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 28139336 - 28139489
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28139336 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagattccttttatggt 28139435  T
Q  116 aataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagcc 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | | | || ||||||||||||    
T  28139436 aataattcccttttatggtatacttaaacagtgctctgaagacaccggttagcc 28139489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 29241669 - 29241790
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  29241669 gttaaggatatgaaaatggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataataa 29241768  T
Q  121 ttcc-ttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  29241769 ttccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 13159929 - 13160056
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  13159929 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaataa 13160028  T
Q  121 -ttccttttatggtatgcttaaccagta 147  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13160029 tttctttttatggtatgcttaatcagta 13160056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 52246606 - 52246769
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac-agtttcctttta 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||    
T  52246606 gggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttta 52246705  T
Q  112 tggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||| |||||| |||||||    
T  52246706 tagtaataatttccttttatggtatgcttaactagtgcccgaga-gcaccagttagcaggaccca 52246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50299076 - 50298970
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaac 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  50299076 tatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcactcttatggtatacttaac 50298977  T
Q  143 cagtacc 149  Q
    |||||||    
T  50298976 cagtacc 50298970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 38852246 - 38852382
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagt---taatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaa 117  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  38852246 gttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttattttatgataa 38852345  T
Q  118 taattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccgg 153  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  38852346 taattcacttttatggtatgtttaacccgtgccccgg 38852382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 24488390 - 24488543
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  24488390 gggcactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttat 24488489  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggtta 165  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| | ||||  ||||||||||    
T  24488490 ggtaataattctcttttatgatatgctgaactagtgctccgggagcaccggtta 24488543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 31514831 - 31514952
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttt 127  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||    
T  31514831 tatgaaaaataaaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaattt-tttttatagtaataatttccttt 31514929  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccc 150  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    
T  31514930 tatagtatacttaaccagtaccc 31514952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552631
Alignment:
Q  64 gaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtat-cttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagt 52552631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 2391631 - 2391687
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaatt 69  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2391631 gggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatt 2391687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 2393392 - 2393448
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaatt 69  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2393392 gggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatt 2393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Original strand, 2362880 - 2362958
Alignment:
Q  37 aggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  2362880 aggaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatggta 2362958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 52718181 - 52718252
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgta 74  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  52718181 cggtgctcccggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010133
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttcctttt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21010041 aaaaaggaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataacttcctttt 21010133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 11534867 - 11534786
Alignment:
Q  374 aattttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaag 455  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  11534867 aattttttagattcattgaatatttaatgtatctgacctatatatagaccatatacattaggtattcaatgaatcttaaaag 11534786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 25743854 - 25743968
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaa-ttatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttat 130  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| || ||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  25743854 aaaaaggaaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataaaaa-gtcaaaatc-gtttcattttttagtaataatttcctttttt 25743951  T
Q  131 ggtatgcttaaccagta 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  25743952 ggtatgcttaaccagta 25743968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Original strand, 6842604 - 6842642
Alignment:
Q  50 gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6842604 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18093879 - 18093849
Alignment:
Q  385 tttattgaataattaatgtatctgacctata 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093879 tttattgaataattaatgtatctgacctata 18093849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30122068 - 30122026
Alignment:
Q  373 taattttttacatttattgaataattaatgtatctgacctata 415  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30122068 taattttttaggtatattgaataattaatgtatctgacctata 30122026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 53163911 - 53163952
Alignment:
Q  133 tatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  53163911 tatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 53163952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4381806 - 4381981
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381806 accggtgcccccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 4381905  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  4381906 agtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgccccgggagcactggttagcaggaccc 4381981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 6580213 - 6580374
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6580213 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 6580312  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||||||    
T  6580313 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggg---cggttagcaggacccat 6580374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27856571 - 27856396
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27856571 accggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 27856472  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27856471 agtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccc 27856396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3668287 - 3668120
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3668287 accggtgcccccggacactggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 3668188  T
Q  101 gtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  3668187 gtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagc 3668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 561693 - 561520
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  561693 accggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatc 561594  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggac 172  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  561593 agtttccttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagcaggac 561520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20552942 - 20553117
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20552942 accggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 20553041  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20553042 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 20553117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 30486224 - 30486397
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  30486224 ggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagt 30486323  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30486324 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccca 30486397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 31438657 - 31438832
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31438657 accggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 31438756  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  31438757 agtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggaccc 31438832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 31390036 - 31390200
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31390036 gggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 31390135  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  31390136 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgctccgggggcaccgattagcaggacccat 31390200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 22887774 - 22887938
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22887774 gggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat 22887873  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||  |||||||    
T  22887874 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagcatgacccat 22887938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32361044 - 32360868
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32361044 accggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgataataaagtcaaaaac 32360945  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32360944 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccca 32360868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44587913 - 44588088
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44587913 accggtgcccccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaac 44588012  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  44588013 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 44588088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22068486 - 22068320
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22068486 ccccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 22068388  T
Q  108 tttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22068387 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcaggaccc 22068320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34442706 - 34442533
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34442706 accggtgccccggggcacatgttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 34442607  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  34442606 gttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt-gcccgggggcatcggttagcaggaccc 34442533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8969573 - 8969414
Alignment:
Q  9 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8969573 ccccgggcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 8969474  T
Q  109 ttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  8969473 ttatggtaataatttccttttatagtatgcttaactagtgcccctggggcaccggttagc 8969414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26387218 - 26387064
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26387218 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataa 26387119  T
Q  121 tt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| | ||||||    
T  26387118 ttcccttttatggtatgcttaaccagtgccttgggggcaccggttaacaggaccc 26387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 22567629 - 22567788
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  22567629 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatggt 22567728  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||| ||||||    
T  22567729 aataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccaggggcaccggttagcaggaccc 22567788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 2898098 - 2898256
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |    
T  2898098 cactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttctatcat 2898197  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  2898198 aataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcaggacc 2898256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38591036 - 38590883
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38591036 gggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 38590937  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38590936 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatacccc-gaggcaccggttag 38590883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 1859192 - 1859320
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859192 tggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaat 1859291  T
Q  119 aattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1859292 aattctcttttatggtatgcttaaccagt 1859320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 32860113 - 32860259
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32860113 accggtgccccgggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 32860212  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32860213 agtttccttttat-gtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 32860259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35851913 - 35851750
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35851913 gggcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttat 35851814  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtacc-ccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||    
T  35851813 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgcctcggggggcaccggttagcaggaccc 35851750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 43637176 - 43637342
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43637176 accggtgccccgagacactggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaca 43637275  T
Q  101 gtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||||    
T  43637276 atttctttttatggtaataatttccttttacagtatgtttaacccgtgctccgg-ggcaccggttagc 43637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5093699 - 5093540
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  5093699 gcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcaatttccttttatga 5093600  T
Q  115 taataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  5093599 taataatttccttttatggtatgtttaactagtgccccgg-ggcaccggttaacaggaccc 5093540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13574187 - 13574060
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13574187 actggttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatggta 13574088  T
Q  117 ataa-ttccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13574087 ataatttccttttatggtatgcttaacc 13574060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 28600991 - 28601152
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  28600991 gggcactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttctttttat 28601089  T
Q  113 ggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||    
T  28601090 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcactgggagcaccggttagcaggaccc 28601152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 27584769 - 27584922
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27584769 ggttaaggatatgaaaagggaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaata 27584868  T
Q  120 attc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    |||| | || ||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||    
T  27584869 attctcattcatggtatacttaaccagt-gcccggaagcagcggttagcaggacc 27584922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4022624 - 4022480
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttt 127  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4022624 tatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataataaagtcagaaacagtttccttttatgataataatttccttt 4022526  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  4022525 tatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcaggacc 4022480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25783004 - 25782833
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25783004 accggtgccccaagacactagttaagaatatgaaaaaggaaattatatagt---taatgcattgaaattgtgtaattattttataataaagtcaaaaaca 25782908  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||| ||||    
T  25782907 attttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggggacatcggttagccgaaccc 25782833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26891838 - 26891722
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26891838 accggtgcccccgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaat 26891739  T
Q  100 agtttccttttatggta 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  26891738 agtttccttttatggta 26891722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 38296201 - 38296310
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38296201 gggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 38296300  T
Q  113 ggtaataatt 122  Q
    ||||||||||    
T  38296301 ggtaataatt 38296310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 5881229 - 5881374
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgc----attgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaa 96  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5881229 accggtgtcccggagcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaa 5881328  T
Q  97 aacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaa 141  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5881329 aagagtttccttttatgataataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11021382 - 11021259
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  11021382 gcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgtgg 11021283  T
Q  115 taataatt-ccttttatggtatgc 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  11021282 taataattcccttttatggtatgc 11021259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Original strand, 39531868 - 39532010
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccttttatgg 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||  |     
T  39531868 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttttatggtaatattttctttttcga 39531966  T
Q  133 tatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||  |||||||    
T  39531967 tatgcttaaccagtgtctcagaggcaccggttagcatgacccat 39532010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29102439 - 29102313
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29102439 tggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatagtaat 29102340  T
Q  119 aatt-ccttttatggtatgcttaacca 144  Q
    ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  29102339 aattatcttttatgatatgtttaacca 29102313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Original strand, 25772137 - 25772270
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatag-tagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| |||| |  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||     
T  25772137 cactagttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaataattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccctttatga 25772236  T
Q  115 taataatt-ccttttatggtatgcttaaccagta 147  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  25772237 taataattcccttttatggtatacttaatcagta 25772270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34123166 - 34123034
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatg 131  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |     
T  34123166 aaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttctttttta 34123068  T
Q  132 gtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
     ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  34123067 atatgcttaa-cagtactccgga-gcaccggttagc 34123034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 15146687 - 15146790
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa--ttccttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15146687 tatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttt-tggtatgtttaa 15146784  T
Q  142 ccagta 147  Q
    ||||||    
T  15146785 ccagta 15146790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15492803 - 15492724
Alignment:
Q  376 ttttttacatttattgaataattaatgtatctgacctata-tataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaa 454  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15492803 ttttttaaatttattgaataatttatgtatctaacctatattatagatcaaataaatcagttattcaatcaatctaaaaa 15492724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 122
Target Start/End: Original strand, 10820528 - 10820615
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10820528 aaaaaagaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataaaaa-gttaaaaacagtttccttttatggtaataatt 10820615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 167
Target Start/End: Original strand, 34123153 - 34123203
Alignment:
Q  117 ataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34123153 ataatttcttttttagtatgctcaaccagtaccccggaggcaccggttagc 34123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 44854321 - 44854387
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaa 67  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  44854321 accggtgcccccgggtcctggttaaggataataaaaaggaaattatatattaattattgcattgaaa 44854387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 375 - 435
Target Start/End: Original strand, 1220808 - 1220868
Alignment:
Q  375 attttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagt 435  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  1220808 attttgtagattcattgaataactaatgtatttgacctatatatagaccgaataaattagt 1220868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 372 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22352126 - 22352047
Alignment:
Q  372 ctaattttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaa 452  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22352126 ctaatttttaaggtttattgaataactaatgtatctgatttatat-taggtcgaatacattagttattcaatgaatttaaa 22352047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38702108 - 38701937
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38702108 accggtgctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 38702009  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  38702008 agttttcttttatggtaataattc---ttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 38701937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 38162861 - 38163035
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38162861 accggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 38162960  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  38162961 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacc 38163035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42770165 - 42769997
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42770165 accggtgcccccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaac 42770066  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42770065 agtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 42769997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 18043173 - 18043348
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18043173 accggtgcctccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 18043272  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18043273 agttttcttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 18043348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 15227763 - 15227918
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15227763 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 15227862  T
Q  113 ggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227863 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagc 15227918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14350452 - 14350279
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350452 accggtgcccccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 14350353  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14350352 aatttccttttatggtaataattcccttaatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagcaggaccc 14350279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24178630 - 24178462
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24178630 ccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaagcagtttcct 24178531  T
Q  108 tttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24178530 tttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagccggaccca 24178462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17333456 - 17333284
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17333456 accggtgcccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaaca 17333357  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17333356 gtttccttttatgataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcaggaccc 17333284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51065923 - 51065748
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51065923 accggtgtccccgggacactggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 51065824  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  51065823 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 51065748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12072237 - 12072069
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12072237 accggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 12072138  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12072137 agttttcttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 12072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 5694332 - 5694507
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5694332 accggtgcctccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 5694431  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  5694432 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcaggaccc 5694507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 29657782 - 29657957
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29657782 accggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaac 29657881  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  29657882 agtttccttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcaggaccc 29657957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30294554 - 30294379
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 101  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30294554 cggtgtccccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 30294455  T
Q  102 tttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  30294454 tttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgctccggggacaccggttagcaggacccat 30294379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3784886 - 3784713
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 101  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  3784886 cggtgcccccagtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacaa 3784787  T
Q  102 tttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3784786 ttttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagccggaccc 3784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9266903 - 9266726
Alignment:
Q  1 accggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9266903 accggtgtccccgcggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaac 9266804  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||    
T  9266803 agtttccttttatggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggttagcaggacccat 9266726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 47010019 - 47010179
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47010019 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaacagtttccttttatgg 47010118  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||    
T  47010119 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccaggggcaccggttagcaggaccc 47010179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 3097688 - 3097819
Alignment:
Q  18 ctggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaa 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3097688 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa 3097787  T
Q  118 taa-ttccttttatggtatgcttaaccagtac 148  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097788 taatttccttttatggtatgcttaaccagtac 3097819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19031969 - 19031815
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19031969 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 19031870  T
Q  121 -ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19031869 tttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcaggaccc 19031815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 51368943 - 51368813
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51368943 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataataatgtcaaaaatagtttccttttatagta 51368844  T
Q  117 ataattcc-ttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51368843 ataattccattttatggtatgcttaaccagt 51368813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 30657619 - 30657790
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30657619 accggtgctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaac 30657718  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||      |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30657719 ag------tttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagcaggacccat 30657790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 29210424 - 29210540
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29210424 accggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaac 29210523  T
Q  100 agtttccttttatggta 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  29210524 agtttccttttatggta 29210540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 45431290 - 45431464
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45431290 accggtgcccccagggcctgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaata 45431389  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | ||||||| | ||||||    
T  45431390 gtttccttttatggtaataattctcttttatgatatacttaaccagtgccccagagactccggttatcaggaccc 45431464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36446496 - 36446353
Alignment:
Q  4 ggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36446496 ggtgcccccgaggcactggttaagaatat-aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagt 36446398  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36446397 ttccttttatagtaataattcccttttatggtatgtttaaccagt 36446353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 43286749 - 43286880
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  43286749 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatagt 43286848  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43286849 aataattctcttttatggtatgcttaaccagt 43286880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 6770348 - 6770519
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6770348 accggtgcctccggggcactaattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 6770447  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||    
T  6770448 agtttcattttatgataataattcccttttatgatatgcttaaccagtatccc----gcaccggttagcaggaccc 6770519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35985795 - 35985644
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35985795 accggtgccccggatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtgaaaaaca 35985696  T
Q  101 gtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtacccc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  35985695 gtttccttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagtgcccc 35985644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 48071510 - 48071637
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48071510 actggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 48071609  T
Q  117 ataatt-ccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  48071610 ataattatcttttatagtatgcttaacc 48071637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 13961223 - 13961396
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13961223 accggtgcccccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 13961321  T
Q  100 agtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||    
T  13961322 agtttcattttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtgctccaagggcaccggttagcaggacc 13961396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 41730316 - 41730496
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagt---taatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaa 96  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  41730316 accggtgccccaggggcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaa 41730415  T
Q  97 aacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  41730416 aacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccagaagcactggttagcaggacccat 41730496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128172
Alignment:
Q  22 ttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 121  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataat 50128226  T
Q  122 tc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  50128225 tctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggttagcaggaccc 50128172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 29683206 - 29683354
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaa-ggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaa 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29683206 accggtgcccccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataataaagtcaaaaa 29683305  T
Q  99 cagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29683306 cagtttcattttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagt 29683354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 48383286 - 48383110
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||   |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48383286 accggtgctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaac 48383187  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | | ||||| ||||||| |||||||    
T  48383186 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcctcaggggcactggttagcaggaccca 48383110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45449413 - 45449244
Alignment:
Q  6 tgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||||| ||| | ||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  45449413 tgccccggggtattggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttc 45449314  T
Q  106 cttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||    
T  45449313 cttttatggtaataattgccttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcatcggttagcaggaccc 45449244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 38335196 - 38335317
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  38335196 cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 38335295  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  38335296 aataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8473070 - 8472942
Alignment:
Q  19 tggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  8473070 tggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataat 8472971  T
Q  119 aattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8472970 aattctcttttatggtatacttaaccagt 8472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 12306961 - 12307075
Alignment:
Q  32 gaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttat 130  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12306961 gaaaaagaaaattatat-gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattccttttatggtaataattctcttttat 12307059  T
Q  131 ggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||||||||||    
T  12307060 ggtatgcttaaccagt 12307075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47532824 - 47532678
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  47532824 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaataatttccttttataataataa 47532726  T
Q  121 tt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  47532725 ttcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgaagacaccggttagc 47532678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 30217782 - 30217948
Alignment:
Q  11 ccgggcactggttaagggtatgaaaaa--ggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 108  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  || || || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  30217782 ccgggcactggctaaggatatgaaaaaaagggaattagagagtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaatagttttctt 30217881  T
Q  109 ttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  30217882 ttatggtaataatttctttttatggtatgcttaa-cagtgcccc-gaggcacctgttagcaggacccat 30217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23473626 - 23473462
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  23473626 gggcattggttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaagtttaaagcagtttccttttat 23473527  T
Q  113 ggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| || | |||  || |||||||||| ||||||||    
T  23473526 ggtaataatttctttttataatatgcttaacctgtgctccgagggtaccggttagcaggacccat 23473462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315300
Alignment:
Q  33 aaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatg 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  37315409 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttg 37315311  T
Q  132 gtatgcttaac 142  Q
    |||||||||||    
T  37315310 gtatgcttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Original strand, 52431636 - 52431760
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt--ccttttatggtatgcttaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  52431636 tatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttcctttttttggtatgcttaa 52431734  T
Q  142 ccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||| |||| | | |||||||||||    
T  52431735 ccagtgccccagggacaccggttagc 52431760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 52749626 - 52749757
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | || | |||||| ||||| || ||||||| |||  ||||||    
T  52749626 gggcattggttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttat 52749725  T
Q  113 ggtaataattcc-ttttatggtatgcttaacc 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  52749726 ggtaataattcctttttatggtatgtttaacc 52749757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3838936 - 3838784
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||     
T  3838936 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatggc 3838838  T
Q  116 aataatt--ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||  | |||| | |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3838837 aataatttcctttttttagtatgcttaatcagtaccccgagggcaccagttagc 3838784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 26228219 - 26228293
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa 89  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26228219 gcactggttaaggagataaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa 26228293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 39497340 - 39497430
Alignment:
Q  22 ttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 112  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  39497340 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaaataattttcttttat 39497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15282672 - 15282591
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15282672 actggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaa 15282591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 39081823 - 39081979
Alignment:
Q  11 ccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||    
T  39081823 ccgggcactggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-aatattaaaagcagtttcatttt 39081921  T
Q  111 atggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||| |||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  39081922 atgataataattttcttttttaatatgcttaatcagtacctcgggggtaccggttagc 39081979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 37503260 - 37503346
Alignment:
Q  35 aaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37503260 aaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaatt 37503346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010685
Alignment:
Q  84 taataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||||||||  ||||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccaggaacaccggttagtaggacccat 19010685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19011170 - 19011108
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcatt 63  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19011170 accggtgtcccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35700808 - 35700680
Alignment:
Q  17 actggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 116  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |  ||  ||||||| ||    
T  35700808 actggttaaggatactaaaaaggaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaaatt-tttttatgata 35700711  T
Q  117 ataa-ttccttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  35700710 ataacttccttttttgatatccttaaccagt 35700680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14881081 - 14881036
Alignment:
Q  73 taattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881081 taattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Original strand, 29210527 - 29210580
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29210527 ttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 29210580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39912441 - 39912368
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 86  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39912441 gggcactgattaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataa 39912368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 10976063 - 10976004
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgt 73  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10976063 ggcacttgttaaggatatgaaaaaggagattatatagtagttaatgcattaaaattatgt 10976004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28726081 - 28725903
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggta-tgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaa-ttatgtaattaatttataataatgtcaaaa 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||||  || ||| |||||||||| || | ||||||||  ||||  | ||||| |    
T  28726081 accggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaaca 28725982  T
Q  98 acagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    | | || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||    
T  28725981 aaactt-ccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaagacccat 28725903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 28481868 - 28481940
Alignment:
Q  13 gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa 89  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28481868 gggccctggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagta----atgcattaaaattgtgtaattaatttataataa 28481940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38595928 - 38595750
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaagg-aaactatatagtagttaatgcattgaaa-ttatgtaattaatttataataatgtcaaaa 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||| || | ||||||||  ||||  | ||||| |    
T  38595928 accggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaaca 38595829  T
Q  98 acagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    | | || ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38595828 aaactt-ccttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgacccat 38595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19011095 - 19011057
Alignment:
Q  47 atagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttata 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19011095 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 19011057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21112734 - 21112681
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21112734 ttccttttatggtatgcttaactagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 21112681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33644495 - 33644390
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaa-ttatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||  || ||||||||||||||    
T  33644495 gcacaggttaaggctataaaaaagaaaattatataataattattgcattgaaaattgtgtaattaattcataaatatgtcatcaa-agtttccttttatg 33644397  T
Q  114 gtaataa 120  Q
     ||||||    
T  33644396 ataataa 33644390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8174204 - 8174127
Alignment:
Q  377 tttttacatttattgaataattaatgtatctgacctatatataaatcgaattaattagttattcaatgaatctaaaaa 454  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| |||||||    
T  8174204 tttttatattcattgaatgattaatgtatctggtctatataaaaatcggatacaatagatattcaatgaacctaaaaa 8174127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16590325 - 16590269
Alignment:
Q  65 aaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16590325 aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcagaaacaattttcttttatgataataatt 16590269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21117476 - 21117423
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21117476 ttccttttatggtatgcttaacttgtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 21117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 167
Target Start/End: Original strand, 26228300 - 26228357
Alignment:
Q  111 atggtaataattcc-ttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||    
T  26228300 atggtaataattcccttttatggtatgcttaactggtactccggggacaccggttagc 26228357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30664239 - 30664174
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataattccttttatg-gtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30664239 ttccttttatggtaagaatttcttttttttgtatgcttaaccagtgccccgtgggcaccggttagc 30664174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23822593 - 23822530
Alignment:
Q  103 ttccttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  23822593 ttccttttatggtaagaattttttttttg-tatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagc 23822530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53860 - 53692
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  53860 accggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaat 53761  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  53760 agtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagc 53692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6285 - 6110
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6285 accggtgcccctggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataaagtcaaaaac 6186  T
Q  100 agtttccttttatggtaataat-tccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6185 agtttccttttatggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 6110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 14915 - 15084
Alignment:
Q  8 cccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14915 ccccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 15014  T
Q  108 tttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  15015 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcactggttaacaggacccat 15084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 68462 - 68289
Alignment:
Q  4 ggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| || |||| ||||    
T  68462 ggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataataaagttaaaatcagt 68363  T
Q  103 ttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  68362 ttccttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccgaaggcatcggttagcaggaccca 68289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 22972 - 23140
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22972 accggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaac 23071  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagc 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  23072 agtttccttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaaggacaccggttagc 23140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 40959 - 41107
Alignment:
Q  29 tatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttt 127  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40959 tatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttt 41058  T
Q  128 tatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  41059 tatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggacccat 41107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 69248 - 69403
Alignment:
Q  11 ccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttt 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||    
T  69248 ccgggcactcgttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttttttt 69347  T
Q  111 atggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  69348 aaggtaataatttcttttatggtatgcttaaccagtgcctcgggagcaccggttag 69403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33841 - 33735
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||     
T  33841 gcacttgttaagtatattaaaatggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aagataaaaaatagttttcttttatgc 33743  T
Q  115 taataatt 122  Q
    ||||||||    
T  33742 taataatt 33735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Original strand, 851 - 983
Alignment:
Q  15 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgg 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |    
T  851 gcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaatttccttttatag 950  T
Q  115 taataattc-cttttatggtatgcttaaccagt 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  951 taataattctcttttatggtatgcttaaccagt 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 116215 - 116359
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  116215 accggtgcccccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaac 116314  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaacc 143  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  116315 agtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacc 116359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10898
Alignment:
Q  50 gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  10771 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgc 10870  T
Q  149 cccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    | ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10871 ctcgggggcagcggttagcaggacccat 10898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 691 - 864
Alignment:
Q  3 cggtgcccccgg-gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacag 101  Q
    |||||||||| | |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  691 cggtgcccccagagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaactg 790  T
Q  102 tttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccca 175  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  791 ttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaactaatagcccgg-ggcaccggttagtaggaccca 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8066 - 7956
Alignment:
Q  6 tgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8066 tgcccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttc 7967  T
Q  106 cttttatggta 116  Q
    |||||||||||    
T  7966 cttttatggta 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7969 - 7916
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7969 ttccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccc 7916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Original strand, 7305 - 7415
Alignment:
Q  6 tgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7305 tgcccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttc 7404  T
Q  106 cttttatggta 116  Q
    |||||||||||    
T  7405 cttttatggta 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Original strand, 7402 - 7455
Alignment:
Q  121 ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7402 ttccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccc 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 304 - 480
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  304 accggtgccccagggcactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataataaagtcaaaaaca 403  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || |||  | | ||||||| ||||||||    
T  404 gtttccttctacggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtatcctggaaactctggttagcaggacccat 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 95759 - 95593
Alignment:
Q  1 accggtgcccccg-ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  95759 accggtgcccccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaagtc-aaaac 95661  T
Q  100 agtttccttttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  95660 agttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccggtatcccaggggctccggttag 95593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 25750 - 25896
Alignment:
Q  20 ggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaata 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25750 ggttaaggatatgaaaaaggaat-tatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaata 25848  T
Q  120 att-ccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttag 166  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||||    
T  25849 attcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttag 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 147059 - 146932
Alignment:
Q  21 gttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  147059 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaataa 146960  T
Q  121 -ttccttttatggtatgcttaaccagta 147  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  146959 tttctttttatggtatgcttaatcagta 146932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19759 - 19583
Alignment:
Q  1 accggtgcccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaaca 100  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19759 accggtgccccagggcatgggttaagcatatgaaaaaagaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaaca 19660  T
Q  101 gtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacccat 176  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||  ||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  19659 gtttccttttacgataatagttctcttttatgatatgattaatcagtgtcccggaaactccggttagcaggacccat 19583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 50559 - 50719
Alignment:
Q  1 accggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50559 accggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaatc 50658  T
Q  100 agtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcac 159  Q
    | ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  50659 aattttcttttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtgctccgggggcac 50719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 53505 - 53358
Alignment:
Q  16 cactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggt 115  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||           |    
T  53505 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatt-----------t 53417  T
Q  116 aataattc-cttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccggttagccggacc 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53416 aataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggaggcaccggttagcaggacc 53358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11136 - 11029
Alignment:
Q  9 ccccgggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11136 ccccggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagtttcatt 11037  T
Q  109 ttatggta 116  Q
    ||||||||    
T  11036 ttatggta 11029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17631 - 17502
Alignment:
Q  14 ggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 113  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17631 ggcactgtttacggatatgaaaaagaaaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 17533  T
Q  114 gtaataattcc-ttttatggtatgcttaacc 143  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17532 ataataattcctttttatggtatgtttaacc 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234039
Alignment:
Q  54 ttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtaccccg 152  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccg 234017  T
Q  153 gaggcaccggttagccggaccc 174  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  234018 ggggcaccggttagcaggaccc 234039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 86
Target Start/End: Original strand, 5094 - 5136
Alignment:
Q  44 tatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 86  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5094 tatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2519 times since January 2019
Visitors: 3821